4ML9A

Crystal structure of uncharacterized tim barrel protein with the conserved phosphate binding site fromsebaldella termitidis
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
283
structure length
276
Chain Sequence
NAMILGDSEQKRRKALKKVLDAVEEHGGTTILSTGITGDDARIARAAVAGGARLLEPNHPAVALARGHKGVITMHAAEQVRHEIPLDEMLKVTQGVRNVVGEDIYITVGVPGGFTEILPLELKEEDFFKIAMSGADGVHIHKSTLEDLKDVVKYAHKYGLLVDAYIGHPDDLHTFGISARTPEEVAEAAKEMEKIGVDMIGLMTGAGEIHPVIKERLSALVSSVKVPTLAEGGINDTNYVAFKDTGVNILVIGTSIDNVVSEAATNVVKKFLSLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Uncharacterized protein
publication title Crystal Structure of Uncharacterized TIM Barrel Protein with the Conserved Phosphate Binding Site fromSebaldella termitidis
rcsb
source organism Sebaldella termitidis
total genus 99
structure length 276
sequence length 283
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ml9A00
1AK5A 3DFQA 5HINA 3W86A 4GUHA 2ZRYA 4GUGA 3MI2A 4R34A 3C2RA 5IBXC 4MFEA 3W1LA 1I2QA 1E51A 1W37A 4LV9A 3BLEA 2GQAA 1J2WA 2WPBA 1TB3A 1YPFA 4JGDA 1MZHA 1LZOA 2DP3A 1TRIA 3FJLA 4S2CA 3C2EA 3R8RA 1JCYA 1WBJA 4GUFA 4JR5A 3HGJA 5FESA 1LROA 1SFJA 1XDLA 3THAA 1XBXA 3PM6A 5DCEA 4O4WA 2V30A 2Q8ZA 4H3DA 2ZZ4A 3G1HA 1G7VA 1HG3A 3NEVA 5D30A 3AO0A 1H7OA 3TNOA 5AHMA 3LM7A 4JIPA 2X16A 2OT0A 3FJ6A 4K36A 3TXVA 5CKSA 3Q2DA 1ZAIA 1F5ZA 1FX6A 1ME8A 2C0AA 1EEPA 3T40A 3UWVA 5C6MA 1GQNA 1KM3A 1KFEA 4XZ9A 1BTMA 4O10A 2Y85A 3NM1A 1JQVA 1M7PA 4IQLA 4Y8FA 3U6WA 3BLIA 2V5LA 5CG7A 1XFBA 1DORA 1H7XA 4IGHA 1JUKA 3LOTA 5MHBA 3A24A 2R91A 4LS1A 3TROA 4M7SA 2HMCA 2QJHA 3M44A 1NF0A 2BSLA 2CLKA 4LVGA 1DJQA 3W7RA 4ADTA 4HSOA 3PUEA 2BZNA 1IXQA 1AW1A 3TE9A 1EWEA 1K7XA 3C4UA 3EX1A 1Z48A 4AHOA 3E96A 5DY2A 2AGKA 4JDBA 3A23A 5CZ0A 1ALDA 3M0ZA 3B0UX 3BGJA 1OJXA 1OG0A 1R2RA 2PURA 1XC4A 2BX7A 3DFPA 3TDFA 3EWYA 3HPXA 3LLFA 1KFBA 5AYXA 2FPTA 4JIQA 4M5PA 1R2TA 1IIGA 2WSRA 3EWXA 3UZJA 2VOMA 2V0TA 1ZFJA 4UTTA 3WJYA 4K39A 3P7YA 3PG9A 2C13A 4O17A 3C2FA 4Q33A 2VXNA 3S42A 3GKFA 5KITA 3DFNA 3S1VA 1VLIA 1AMKA 4FX6M 2G96A 1CI1A 4WY0B 4UTJA 1W31A 4Z1DA 1LDCA 1ME7A 4UTWC 3QPYA 4IXXA 3RK8A 2GQ8A 3NQAA 3CU2A 2NX3A 4N9CA 4WD0A 3LHZA 5G2IA 1F74A 2VFFA 4UTIA 5H2ZA 2E6DA 3MJYA 5FEPA 4YWIA 3TK7A 5I3IA 3S5YA 2Y7EA 5G2WA 1KA9F 4RR4A 5EMUA 3YPIA 4H4IA 1TCDA 3QYQA 2BXVA 4K38A 3M16A 3A5VA 4O0KA 5BMWA 3TQKA 2YFOA 3RFAA 3EB2A 5D2VA 1YYAA 3LHUA 3P60A 5K7JA 3BG5A 2YSWA 4DF1A 4RZ4A 3RNDA 1L2UA 1M6JA 5FF4A 1W5QA 1Z42A 3P80A 4IWWA 3GXTA 5BOOA 3W7QA 1PCKA 1KM5A 1UUOA 2CFFA 1QWGA 3G18A 5AHLA 2DU2A 2GPTA 3LCLA 3JS3A 1WAUA 1JQXA 4A21A 2VKZG 2WSYA 1OYCA 2YPIA 3NL5A 2C1HA 1JRBA 1VH7A 1EPXA 3KOFA 2J88A 2ZA1A 1QDSA 3PWAA 2FPYA 2GJNA 4O50A 6TIMA 4WQ6A 3NDOA 5F2IA 1A5CA 4UTHA 1KV5A 1B4KA 4O12A 3NVTA 2B4GA 1UJPA 3KVKA 1PE1A 3EWZA 4PA8A 5CPOA 4JX6A 4MYAA 5U4NA 4DEFA 1KM0A 4BK9A 3QSTA 1DQWA 1G67A 4RZ6A 1XKYA 1C9DA 4ZZ9A 1O5XA 4GE8A 4LVBA 5A5WA 5HULA 1LM1A 1PS9A 2FDSA 4HIBA 4JTFA 2A7PA 2Y6ZA 3I7SA 3I68A 4UIOA 5EYWA 4BI6A 1C8VA 2WJZA 3FYPA 2H90A 2E6AA 4FIRA 4EVZA 4XTIA 5HJLA 3SIZA 3GAYA 3IRDA 4A2SA 3PULA 3QFEA 4NJJA 2ZRVA 3HG3A 3WK3A 4S1FA 3R13A 2A6NA 1MXSA 4I9AA 3HG4A 4K8EA 1P0KA 1G69A 4FX8A 2QR6A 4QSHA 3HOJA 1R30A 1W5OA 1L6WA 3C3NA 3S1WA 3FKRA 1LRNA 3HG5A 2A5HA 4DBDA 3EKLA 1D3GA 2GJLA 2X1TA 4BI7A 4FNRA 1X6UA 3OG3A 4X3ZA 4O15A 1JUBA 3L5MA 3BW4A 4LT9A 3N2XA 4FF7A 2FTPA 3QW3A 4AHQA 2CLHA 3TQ0A 2RH9A 4BR1A 4OE7A 1TO3A 3SFKA 3NQDA 3IEBA 2QF7A 2X30A 4NNCA 4AWTA 5D2XA 3RLUA 1DHPA 4UMBA 3OVQA 5CSRA 1OFBA 4PH6A 1VYPX 3SY5A 3G1FA 3TCEA 1LBMA 4QNWA 5KMYA 3S6DA 3L2IA 2Q3RA 1RV8A 5CZJA 4YMZA 7TIMA 3W07A 4WY0F 3HGRA 2QUTA 1KTCA 1Z41A 4MZYA 5CZTA 4W9TA 3NZRA 3PF3A 1IF2A 4ONVA 3N73A 3C56A 4CNPA 1FDJA 2DZSA 4NT0A 2DORA 3HGSA 4WZHA 4N9BA 3UWZA 4ORIA 3CWNA 4FO4A 3NG3A 1SO6A 3E49A 3OVRA 3O6CA 3LLDA 2NXHA 3M6YA 1HO1A 4Z1CA 3L66A 1WX0A 4UTLA 3MHGA 5C5YA 4L4MA 4UNLA 2ATMA 1YTEA 1OX5A 2BLEA 2OCZA 3KVLA 4GWEA 5G2HA 2CLFA 4EWND 3W7NA 3IVSA 3MMTA 4JTEA 3DI1A 2HSAA 1VR6A 3W6YA 4KFNA 2ZRXA 3TUUA 3EEGA 4MLJA 3PY2A 2Y62A 1GG0A 4RK8A 3UWQA 1VJIA 3O8AA 3G22A 3VFLA 4CLMA 3PBWA 2BTMA 1TPC1 5D04C 3THQA 3NL6A 1AW2A 3FEMA 1TJRA 1CX9A 3SSJA 3GIYA 2FQIA 3TW6A 1W3TA 1GOXA 1J4EA 5K4XA 2VEMA 4BF9A 4NZJA 4DQWA 2ZZ1A 4XBKA 5EA9A 1A50A 3W23A 2A7NA 4NJHA 3FLUA 1LLZA 1RQHA 1GPWA 5SWUA 4TMBA 4ZVJA 1GVSA 2AQWA 3MBDA 2DZVA 3W72A 2QDHA 2VEPA 5KZEA 3LHTA 3NA8A 1H7NA 3S9YA 1FY6A 4AXKA 5BW6A 1UCWA 1H7WA 4EF8A 3BW2A 3F4NA 5I3FA 3T44A 2Y89A 4Z1BA 1SU5A 3G1SA 1DOSA 4AWUA 2Y70A 3B05A 4OT7A 2J9ZA 4MY8A 3IIZA 4GUJA 4ZMGA 1KBIA 5C54A 2A2IA 3W1QA 1YXDA 2R14A 5LZLA 4LC6A 2P10A 3W7KA 2ZYFA 4ADSA 4EOUA 3O15A 4JTUA 2RDTA 1TPH1 3OBKA 4H6KA 4UTMA 3O16A 3UD6A 1ICQA 3QW4B 3U2OA 3LI0A 3NPXA 4LY8A 3W1RA 2HTMA 3NAVA 5HNRA 4ZQMA 3GK0A 5AYZA 5DCDA 4K6AA 4JX4A 1VHNA 3RMJA 1GVOA 1JRCA 5DELA 1IXNA 3E12A 1VRDA 1F6KA 4YCPA 3C61A 3ELFA 3T4CA 4WOZA 3L0NA 3B03A 1KM6A 3KAOA 5J5DA 3VCRA 5BNKA 3M41A 1FCUA 4O57A 3F03K 1OF6A 4IUOA 3PG8A 4O52A 3PSVA 5HR6A 2Z2UA 4LRSA 1OX6A 1TMHA 3TQVA 1G4TA 4AB4A 3DGRA 4DPPA 3FIGA 5AHEA 3R5EA 1W5NA 1FQ0A 3NYZA 1TYGA 1XBYA 4JTIA 5HQEA 3DAQA 3W71A 1P5BA 2VFDA 3GR7A 3GKAA 5CPMA 1VCGA 1QPRA 4J9JA 4UFMA 2EAWA 2XN1A 1FUYA 1KW1A 1VQTA 3EWWA 2NLIA 2CLIA 1WYIA 3I7RA 2JKEA 3B4UA 1FWRA 2ABAA 1KLYA 1LP6A 1SW7A 4JYEA 3KRUA 3BPWA 2E6FA 1QO2A 4JXCA 5D32A 3P82A 4ZQPA 4U28A 1WBHA 3TU9A 3HGOA 2TPSA 5DN1A 1QFEA 1QO5A 3S0CA 1H51A 3DI0A 3A9IA 4E0CA 1ICPA 2DZWA 2XN2A 4MY9A 2G97A 3DHDA 2E5DA 4MJMA 3O07A 2YDAA 1I4NA 2G95A 3FOKA 2C14A 4R33A 5KTLA 4IMDA 1TRDA 5DY3A 4HPXA 5J5RA 1H60A 3UYCA 2ZQ0A 3UXAA 1TPEA 3NGJA 4NX0A 3N9SA 1B4EA 4DO6A 1SPQA 2YGYA 4O8RA 3W88A 4NNBA 4UR7A 3CIWA 3L0GA 3RF9A 2WV8A 4G1KA 5HMSA 5G1YA 5DXYA 4M6VA 2FFCA 4TR9A 1FXQA 4Q4KA 5EL1A 1GVRA 3WJXA 1UASA 3HJZA 1T96A 2CZ5A 4DF2A 3OHIA 2YYTA 2QCDA 1LBFA 4UNKA 5D09A 4UCGA 2WQPA 1OABA 4UXDA 1Q6LA 1MO0A 2CZDA 2OJPA 5BMXA 3IVUA 1SO3A 1QPOA 4NXSA 1XL9A 2A0NA 3BLFA 1H7RA 3LCFA 2E1DA 1X1ZA 1RPXA 1KM1A 1GYLA 3IIOA 1S3HA 4Z0SA 4K7VA 4NZFA 3W1TA 2BWGA 2WNZA 2QCFA 4QM1A 3S1UA 3UQNA 1SZGA 3ABOA 2JBMA 3W2LA 3SGUA 2LLEA 1IIHA 2Z6IA 3ZR4A 5H91A 3T7VA 5E0KA 1OYBA 1RD5A 1KFJA 3NPUA 5BRBA 1SQ7A 3G1DA 3P74A 4MYXA 3O1NA 5F4SA 3AJXA 4Y90A 4RXFA 1HFBA 4XUGA 2X2GA 2F7FA 3W70A 1FWWA 2VENA 3H54A 3DHFA 1EP2A 2VELA 1OX4A 1F73A 3M7WA 4LVFA 1K02A 3MHFA 1EP1A 3G24A 4PTNA 4AWSA 2RKXA 1CW2A 4LWWA 1FDYA 1IGSA 2NX1A 3IGUA 3PC0A 2DZTA 4HPJA 2ZDRA 2V2DA 4JDYA 2V82A 1WA3A 4FEZA 1YDVA 3CT7A 5F4XA 2IQTA 3DKLA 4NXKA 1QOPA 3O63A 3LRLA 1B3OA 1W56A 5E1QA 3PUDA 3F1QA 1SSDA 2ZTJA 3EX3A 2J24A 5CSSA 3LBCA 5DLCA 4P2VA 4JD4A 5F2MA 4ZQOA 3LCIA 4MKNA 5HUPA 1QCWA 3NQ7A 4JTSA 3ZWTA 4B5NA 1DJNA 3BG3A 1XUZA 2E77A 2CLOA 2GVJA 1U5JA 4DELA 3L0KA 3L9CA 1QAPA 5D03A 5FEZA 3GVGA 4XKYA 1LOQA 4LVDA 2NWRA 3BARA 1OFQA 3B0VC 4DXVA 3PBUA 3C2VA 1VYSX 3SR7A 4NVTA 5F2GA 1W0MA 3L21A 2NZLA 4IPJA 2NXIA 4ICNA 4ML9A 3NQVA 4QISA 3HBLA 2VFHA 4O14A 1H1YA 2YZRA 1W5PA 3ANYA 1G4PA 1LYXA 3BV4A 5AOUA 1UUMA 5F4WA 3INPA 2YR1A 2YFNA 2ISSA 1OHLA 5LHEA 3LCXA 5DBUA 1K8ZA 1VPXA 3K30A 1LRQA 1XBZA 1H7PA 3TC7A 1U83A 3DFSA 3TXZA 3UZ5A 5I3JA 3LGEA 2A7RA 2EPHA 1QPQA 3LCGA 4GBUA 4RLIA 4RX0A 1L6YA 3LCHA 4BWLC 5IM51 1GZGA 4O1CA 1OFPA 1TV8A 4JTTA 3QZEA 1LCOA 3DKJA 5LNRA 5HR7A 1L9WA 1OFDA 1FWTA 2ALDA 2RFGA 1AL7A 4OV4A 4N9EA 5LNUA 1IXPA 3W7EA 1RR2A 3MUXA 4OHQA 1LBLA 3B06A 4UFIA 1S5TA 3QPZA 3KRSA 4LUJA 4UTKA 3CLMA 4GFSA 3BK0A 2VFEA 4XQ6A 4WOQA 5C2XA 3LERA 1Q6RA 1LOSA 2Z1BA 3NZ1A 2QCNA 2C6QA 3Q94A 4FIQA 1GYNA 4IXHA 5AB3A 2A6LA 1W8SA 1YXCA 1OFAA 1ZAJA 1A5SA 2HS6A 2TSYA 2YW3A 3STCA 3STEA 1H5YA 3RLVA 3N14A 1A53A 1D3HA 1HO4A 4JYDA 3G0SA 2I9EA 2ZZ2A 4KWWA 1TQXA 2ZA2A 2TMDA 4LW7A 5FEXA 3IVTA 2NV1A 3W85A 1TSIA 3QM3A 1GJPA 2NXGA 2OT1A 1X7FA 4Q32A 3IV3A 3NQGA 4LNYA 5G4EA 4JTLA 5IBXA 4S2BA 1OFEA 1YDNA 1PV8A 5LNSA 4AF0B 5LKYA 1TTJA 1TIMA 1VS1A 2QKFA 3JRKA 2RHGA 4TU1A 5D05A 3EWBX 1LOLA 3G8EA 3LV5A 3NQ8A 4OBTA 4ADUA 1DVJA 4X22A 1EX5A 3GLCA 3NM3A 3PUOA 1TPFA 2ZBTA 2VC6A 5HWNA 4A2RA 3W7LA 4O1BA 2J9YA 3GNNA 3T78A 4PC8A 1TPB1 4P61A 3ABRA 2Q8LA 1KFLA 4FXSA 3OVPA 2NV2A 4QNEA 1TQJA 1QNVA 3G1YA 3STGA 4LTSA 3L5LA 4O4VA 4OQVA 3U8GA 4RZ5A 1M5WA 4L4LA 2Y88A 1TTIA 4UFLA 1T8XA 1K3UA 2Y7DA 3NQEA 4M7TA 2GVGA 4TX9A 3N34A 2FJKA 3GXNA 1KTBA 4N6EA 4CQ8A 3S5OA 1OFOA 2YXGA 3QMRA 3NL3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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