1WV2A

Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
243
structure length
230
Chain Sequence
TPFVIAGRTYGSRLLVGTGKYKDLDETRRAIEASGAEIVTVAVRRTNIPPDRYTILPNTAGCYDAVEAVRTCRLARELLDGHNLVKLEVLADQKTLFPNVVETLKAAEQLVKDGFDVMVYTSDDPIIARQLAEIGCIAVMPLAGLIGSGLGICNPYNLRIILEEAKVPVLVDAGVGTASDAAIAMELGCEAVLMNTAIAHAKDPVMMAEAMKHAIVAGRLAYLAGRMPRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Biosynthetic protein
molecule keywords Thiazole biosynthesis protein thiG
publication title Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from Pseudomonas Aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 63
structure length 230
sequence length 243
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wv2A00
4MPQA 1IGSA 3MP5A 3P7YA 5FF0A 1VHNA 3VKJA 5AC7A 2A6NA 1WDWA 3M1ZA 1KFKA 1R2RA 3MBDA 3UY8A 4HPXA 5KZMA 4AAJA 1LRNA 3UQNA 4ORMA 5HR6A 3QW4B 2GJLA 3EWBX 1F6PA 3AJXA 2LLEA 1D3GA 2VOMA 1K7XA 4LWWA 1NFBA 2CLKA 2QF7A 4RR4A 5EMUA 1JCLA 2DZTA 3BW2A 5EA9A 2FPTA 2J9ZA 1SW7A 3CEPA 4O0ZA 3G1SA 2Y70A 4YCOA 2VKZG 2Q3OA 1GVFA 3TW7A 4O50A 2HS6A 3RLVA 3W7IA 2YDAA 3QJAA 3WK2A 5KINA 5BRBA 4KFNA 3ATYA 3UY7A 4DPQA 3RMJA 3B0UX 5AHLA 2QCDB 2DZWA 3VE9A 3IVSA 3LXCA 1BTMA 1ADOA 1VR6A 2V5LA 5TBOA 3S5YA 1GQNA 1PIIA 4NX0A 2A7RA 4YLWA 3L21A 1TRIA 4FX6M 4EF8A 3LRLA 3UXAA 2QJHA 2PRMA 4LS0A 4ZL1A 3STEA 3DU0A 4KFPA 3D0CA 1PS9A 3MBFA 2VXNA 5E1QA 5HWNA 1RZMA 3SR7A 1AW5A 4BI7A 3MP4A 1M7PA 4Y6GA 2VEMA 2H8XA 2VEIA 1XXXA 4RXGA 3VCRA 2BLEA 3IVUA 4RCXA 1I2PA 1B9BA 4M6QA 1XUUA 1VQTA 3CB8A 3N9RA 1EB3A 4EIVA 1SW0A 3UZ5A 4O1BA 2G96A 3W1TA 3GDKA 4MLJA 3TSDA 1LOLA 2J27A 1TIMA 1GG0A 3A9IA 3NQ2A 1I4NA 4WZHA 1M7OA 4WOZA 3W9ZA 5K4ZA 5D09A 3LDVA 3UXDA 3G1DA 2RDTA 1LBFA 3P82A 5LSMA 2QCGA 4XUGA 1L2UA 3LB0A 4IGHA 5CPOA 4XZ9A 4A22A 2QCHA 4C1KA 3LCLA 4PL2A 1UB3A 3CPRA 3MI2A 4PEKA 3WK1A 1O94A 4EF9A 4IMGA 3G24A 2GUUA 4G1KA 2VEKA 3TAOA 4BFAA 1LBMA 1OF6A 1W3TA 2HTMA 4JTTA 1JUBA 3L9CA 3LBCA 3IV3A 1WX0A 2WJZA 2ZZ7A 4O14A 5H2ZA 3W7RA 1QPQA 1VPXA 3NQMA 4S2BA 3U8GA 4O4VA 1FWNA 4UFHA 3FIGA 5LNUA 2NUXA 4BF9A 1VLWA 2FFCA 4UTKA 3IVTA 4IX0A 4DF2A 1UUMA 3EWZA 4NNCA 3WFAA 3LHZA 3HGSA 1T0OA 1OYAA 2ZTJA 2TYSA 2GVLA 1EEPA 3KRUA 2QCDA 3LERA 3L65A 3KOFA 4MY9A 4O12A 1B3OA 3KAOA 1SZGA 3NM1A 4FX7A 1H7OA 1T8XA 1JUEA 4GNJA 2VC6A 4CLMA 1LTDA 3TROA 4UTMA 1SFJA 1TPFA 1AW1A 1H51A 4BK9A 2W0UA 2NXGA 4BWLA 5G1TA 1OFEA 3QMTA 3L0KA 4FNQA 2XFWA 3W1UA 4WD0A 4TO8A 1U5JA 3U6WA 1KLZA 1KLYA 3TFXA 4X9SA 5LKYA 1K03A 5AHNA 5C5YA 4EOUA 3FOKA 1QOPA 2C6QA 4OV4A 1LBLA 4ORIA 1BEUA 3DXIA 2A4AA 3ABRA 3O07A 1JCNA 4RV8A 3ZWSA 4XWUA 2QCEA 3KVMA 4PTNA 1JCMP 2WKJA 2P10A 3B06A 2JBMA 3O1NA 4IPJA 3L0NA 1G6CA 3ANYA 3E49A 1LORA 3EX6A 3GIYA 4U4MA 1P4CA 3T55A 5AB3A 4M7SA 1UCWA 4KFOA 4W9TA 4WX2A 4DO6A 2VFDA 3TSBA 1OFBA 1Q6RA 4Q32A 3S5NA 3E9AA 3TX9A 1TMHA 2TMDA 3HPSA 3C2VA 4JGDA 4QITA 1SZEA 3BW3A 4R53A 4LVFA 2QCMA 3HPXA 2Y61A 3W72A 2C1HA 3FEMA 4IXXA 3GXPA 4HKPA 4YMZA 4ALDA 2EPHA 2PRHA 3SIZA 3UNDA 1TV8A 3BG5A 1MSSA 2JKAA 5DY2A 1QFEA 4UR7A 4A2RA 2R14A 3NQ8A 5EY5A 5T26A 1LOQA 1MEHA 4GUFA 1TYGA 2YCEA 3LXBA 4UR8A 2CZ5A 4GUIA 1XFBA 3BARA 4OV9A 3W2UA 4JYEA 2VELA 5AHFA 4UTUA 3W2NA 1PV8A 3UD6A 3F4NA 4AMAA 2WPBA 5D03A 4NJGA 3TMQA 3KRSA 5FEZA 2E77A 3HQ1A 4UFJA 1EA0A 1WOAA 3NDOA 1LOSA 1H62A 5DELA 2NXHA 2A7NA 4UNKA 1VLIA 4IJBA 2FPYA 3GZ3A 5HULA 1J5TA 4LT9A 5HQEA 4BI5A 4IXHA 5D04C 2RHGA 1DV7A 2R8WA 1UUOA 1TPC1 3BO9A 5G2HA 4UC5A 1R2SA 4AF0B 3TFCA 4ADSA 5K7JA 1DL3A 1VC4A 5TIMA 3B8DA 5AN7A 3S1WA 3TUUA 4Y96A 3THQA 1OFRA 1QAPA 2KZHA 1Q6QA 4AHPA 2V30A 3N73A 3B04A 3USBA 5L9FA 4RLIA 3BGJA 3TDFA 2WOQA 1OYCA 4AVFA 4QNWA 5H91A 3NQGA 1XDLA 3B05A 5FF4A 5J5RA 2F7FA 1H61A 1ZALA 3NG3A 4P2VA 4AWUA 3GAYA 1U83A 2CLHA 4PH6A 5KZEA 4HIBA 4FNTA 4AWSA 2NX9A 4UTIA 1UBSA 2B7OA 2DZUA 2DZSA 3L67A 3NM3A 2ISWA 3P62A 3DFOA 1TPEA 4HSNA 1FDJA 1KM3A 4UMCA 3H55A 3NL5A 3F1QA 3LRMA 4ADTA 2ZZ6A 4FIRA 3GVGA 3W2JA 1YADA 2V5BA 2CLMA 1A5SA 5DCBA 1H1ZA 3TW6A 4LOCA 3P5YA 3IGXA 1LYXA 1SO6A 1SUXA 4XTDA 3EX2A 4H4IA 3W87A 2ALDA 1KTNA 3HG3A 3OHIA 2HSAA 4UCGA 5CSRA 5AOUA 3W2LA 2NZLA 3KVLA 5HWJA 1GPWA 1PHQA 3OVQA 4FNRA 3TQVA 4K38A 3O6CA 3QC3A 5AFDA 2GJNA 3W83A 3UWWA 2QEZA 1VYSX 2ZZ4A 1YLVA 3QZEA 3CWNA 3TE9A 4LNYA 5E93A 3WJXA 3TK7A 4FB7A 4S2CA 3W7GA 2Y7GA 5F2IA 3EX4A 4WXZA 1JRCA 3RU6A 3PBUA 5DXXA 2YSWA 4N9EA 4AF0A 1EWEA 7TIMA 4Z1BA 3G1XA 4UFLA 1H7XA 2AGKA 2DZXA 1SSGA 3S5OA 4TMCA 4LRSA 2G5WA 2BSLA 3DENA 4PC8A 2H3DA 3CQ0A 1J4EA 1FUYA 2A0NA 3G0XA 5MHBA 4MZYA 3DFQA 3A22A 3LCGA 5A8GA 4O4WA 1NSJA 2WSQA 1JR1A 5I3KA 2YFOA 3ABSA 1DVJA 4NNAA 1FWRA 4JD4A 3NPXA 4MVAA 2YZRA 1A5CA 2Z6IA 5HJLA 4A29A 3W1NA 3NVTA 5HMSA 1WAUA 2E5BA 5FEXA 3W7DA 4OBTA 3HG5A 3TMLA 6TIMA 3VFLA 4MIMA 4WY0F 2ZRWA 3OG3A 5CG7A 1GOXA 5TQLA 1IF2A 3MW7A 4TR9A 4DO5A 1IXPA 3S42A 1TV7A 2QDGA 3FYPA 4D2JA 1TB3A 2ZRVA 1X6UA 4JTEA 3M7WA 4Q33A 3W7EA 2VFIA 1LM1A 4CNNA 2YX0A 5CZSA 1RR2A 1TRDA 2GVGA 3A5VA 4WUIA 5CGQA 3G1HA 2Y89A 4M5PA 3W71A 5HNRA 2ZRZA 3CIWA 3SZ8A 4H3DA 1I45A 3P61A 1G4TA 3W22A 1M5WA 3P8IA 5LGZA 5FI8A 1TTJA 1G4EA 1DJNA 4OT7A 4MYXA 3IIXA 3O16A 2X1SA 2V2HA 5FESA 4YWIA 4CCCA 4MZ8A 2ZA1A 3W1PA 3MWAA 1OJXA 3OVRA 3BG9A 3C2OA 2ISSA 3B0VC 1GEQA 1MZHA 1S3HA 4JTLA 3V75A 1FWSA 1OFQA 3Q94A 4Z1AA 3NAVA 3QM3A 1TJRA 5C54A 1VS1A 4ZQNA 2NWSA 2AQWA 5HWMA 4FNPA 2ZDRA 3M0ZA 3NR0A 1BWLA 1EP2A 1Y0EA 5GVJA 5DXYA 2F84A 4O8RA 5D2WA 3WJSA 2R91A 3RNDA 4ZQMA 3E12A 1TPB1 3DHFA 4OQVA 3A21A 4NVTA 3P81A 5EKYA 3EXTA 2CZEA 2NUYA 1FWWA 1QWGA 3TQKA 3GYEA 3LHTA 4HT3A 3NQEA 3NL6A 3HF3A 1W5QA 1AK5A 2WSRA 1WYIA 3S1XA 4ZQPA 3W7CA 4AB4A 3L5AA 2ZRUA 4UTJA 4N4PA 4O16A 1ICPA 4ADUA 2QUVA 5CKSA 3Q37A 5AYXA 2V2DA 3P8JA 1GT8A 2VENA 5HINA 2FQIA 3HIJA 4L4MA 3G1FA 3M41A 4NZFA 4POCA 1QOQA 4OGZA 3W2KA 3Q58A 4MFEA 5FF2A 2J24A 2ISVA 5DCDA 5HUOA 4LW7A 3BPWA 4QM1A 5EPDA 5K3VA 4QIUA 3NO5A 1G69A 2G95A 3P80A 5CZTA 2Q8LA 4K36A 3GKFA 1F76A 3A5FA 1CI1A 1RVGA 2D73A 4O1CA 4LS1A 2YXGA 4RK8A 3QF0A 1R2TA 4PA8A 4JS3A 4DO4A 3TKFA 2W6RA 1ME8A 3QMSA 2Q8ZA 4FX8A 3LTPA 1NVMA 4JX5A 2EGZA 4GUJA 4CNOA 1I8JA 5D2TA 3W88A 3UWUA 1A53A 1TREA 4LC8A 1LRQA 3EKZA 3W70A 1TV5A 1H50A 2C14A 2X1TA 3LI0A 3FS2A 3LGEA 1YDVA 2NV2A 4DBDA 2A85A 1JCXA 1YPFA 3KRZA 1VGAA 1VHCA 1C29A 2P1FA 3M47A 4WOQA 3NZ1A 3PSWA 1I2OA 4AEOA 2ABAA 3QYQA 5D02A 1TPH1 4K37A 3QPZA 1X8FA 3G1AA 3SJ3A 3W85A 3KHJA 4ICNA 4JN6A 1HL2A 3N2XA 2H8ZA 2FB2A 3PB2A 3STFA 4N4QA 3HG2A 3LBMA 1SPQA 4HNNA 1R30A 3PWAA 2YYTA 1EWDA 2Y62A 5U7SA 3LTSA 3LI1A 3FLUA 1VCVA 3NYZA 3MP3A 3CWOX 3NL3A 3MJYA 4UTWC 1KFEA 5F4SA 3GLCA 1LCOA 1LROA 1ZAHA 3IIVA 1EP1A 3W1AA 1ME7A 1TPUA 2DZVA 3LLFA 4ONVA 1XCFA 1TSIA 2G97A 2PE4A 2I1OA 3T4CA 1O4UA 2ATSA 4Y90A 1QPNA 1QO5A 1F6KA 4UNLA 2NXIA 4O52A 1GTHA 1LLWA 3HGOA 3UWQA 1N8FA 2FDSA 4UTTC 4UFIA 3CT7A 4N2YA 3WJZA 1AG1O 2CU0A 2EAWA 3IGUA 3QW3A 2DORA 3EWXA 3NQDA 3SGZA 4IWWA 4JTGA 1W5PA 4C1LA 4BR1A 5C2XA 4RZ4A 4MY8A 4LUJA 3W75A 4LRTA 1JVNA 5LZLA 3TNOA 5IBXC 5CPLA 4AHQA 4FO4A 4TX9A 1L6WA 3O6DA 1FCVA 1OK4A 3B0PA 3GDMA 5LHFA 5I3JA 1V5XA 3P67A 4OHQA 5D2VA 5G2IA 2WQPA 2XN0A 2WNQA 1VYPX 2ATMA 2Z0IA 3O8AA 4I7WA 3SW6A 1ZNNA 3G3DA 3PSVA 4FF7A 3QQ1A 3S1UA 2C15A 1ZHAA 2J6XA 1DQWA 2XN1A 5IM51 1GVRA 3LCIA 2HS8A 2WSYA 5LGXA 1OABA 5KMYA 3UZJA 3GB6A 1XDMA 5DY3A 3TQ0A 1FDZA 2QJGA 2VFGA 3B03A 1YXYA 4QQ3A 1SFLA 5K4XA 4YXGA 1D3HA 1Q45A 4IMCA 3N2MA 4NU7A 4B5NA 4L4LA 1OFDA 2PRLA 1ZAIA 3LHWA 4ZMGA 3TJLA 1FWTA 1MEIA 2PCQA 2Z2UA 3TH6A 4PODA 3KXQA 4DXVA 4RZ5A 1KV5A 1QPRA 4WQ6A 2V9DA 3W23A 5D32A 4O11A 3ZR4A 3GK0A 1K7EA 2CLFA 1KTBA 4GUHA 1R46A 1SR9A 1VYRA 3L66A 1TTIA 2X1RA 1W5MA 1ZENA 3HO8A 2ABBA 3E02A 1KM5A 1AL7A 4FIQA 3NL2A 3O6YX 4NNBA 3LX9A 4LU0A 3QSTA 1I2NA 3LCFA 1W3NA 1DKWA 1K02A 3PM6A 2X2GA 3W7OA 3C8FA 4Z1DA 2NV1A 2Y85A 2ZRYA 5F4XA 4JDYA 2B7QA 3OIXA 1B57A 1XBZA 4CCDA 2QAPA 1WA3A 1AW2A 4HNUA 1XI3A 1XM3A 4JIPA 3HB9A 3L2IA 4YL2A 4NXSA 1YTDA 3N34A 3BVJA 3EXSA 4FHAA 4O54A 4JEQA 5D05A 3LHVA 1OG0A 3KFTA 1FBAA 2B7NA 2J9YA 3W7PA 1EIXA 3IEBA 5G4EA 1QPOA 1A5BA 4JIQA 1O60A 3NGJA 3DFSA 4JY8A 1W5NA 3PAJA 3M5VA 3CEUA 2PC4A 1NF0A 3PR2A 4AXKA 3HMJG 1F5ZA 4CNPA 1QR7A 4MLRA 4R34A 3L5LA 2Y63A 1PCKA 5C55A 3S1VA 4O28A 1JQXA 5D38A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IGS A;  2P3Z A;  3CQK A;  3VK5 A;  4UWM A;  3DG3 A;  1NOF A;  4H01 A;  1W9U A;  2IKG A;  1F3E A;  3M1Z A;  3WQW A;  4ORM A;  4XV0 A;  4B90 A;  3GUG A;  4GYK A;  2FVM A;  2PTZ A;  4A8N A;  3KBW A;  4HOW A;  4LWW A;  1D3G A;  1H4P A;  4IFK A;  2CLK A;  3OOQ A;  3O6A A;  1EBG A;  1OG6 A;  3R25 A;  3N25 A;  3KP0 A;  4DY1 A;  5EA9 A;  3CEP A;  4LGX A;  4G5D A;  4H7V A;  3G1S A;  4W8B A;  2Y70 A;  3UF9 A;  2VKZ G;  1GVF A;  4LAM A;  4LNC A;  4O50 A;  1I60 A;  2HS6 A;  1V6W A;  3TA9 A;  5A2C A;  1E0U A;  3V5C A;  1X6L A;  5KIN A;  4KFN A;  1JPK A;  3UY7 A;  1LL7 A;  5AHL A;  1BFN A;  4F0K A;  2DVX A;  2C71 A;  3APY A;  3IVS A;  4JQ2 A;  1BTM A;  2V5L A;  3S5Y A;  4NX0 A;  2PSN A;  1RAK A;  3UW6 A;  3LRL A;  3CHC A;  3UXA A;  1GW1 A;  4AD4 A;  2PRM A;  2VRJ A;  4LS0 A;  4ZL1 A;  3STE A;  5MF5 A;  4C91 A;  4D8L A;  3RHG A;  1RZM A;  2V3F A;  3S2C A;  4Y6G A;  3FA4 A;  2VEM A;  2H8X A;  3N1A A;  1XXX A;  5A6T C;  3P6L A;  3IVU A;  1I2P A;  4CQB A;  1EB3 A;  1SW0 A;  4QRN A;  1E3X A;  2G96 A;  4S3C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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