3O15A

Crystal structure of bacillus subtilis thiamin phosphate synthase complexed with a carboxylated thiazole phosphate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
TRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVSAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Thiamine-phosphate pyrophosphorylase
publication title Crystal Structure and Kinetic Characterization of Bacillus subtilis Thiamin Phosphate Synthase with a Carboxylated Thiazole Phosphate
rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 77
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3o15A00
2OT0A 3L9CA 4JYEA 3CU2A 1B9BA 1OFEA 3PSWA 3PG8A 2GVGA 2GQ9A 4B5NA 1D3GA 3QPYA 4EIVA 2WNQA 5LHFA 3B0VC 1F05A 1N7KA 1MZHA 2GOUA 2RDUA 3MMTA 3VCRA 3V1PA 3WK0A 1TPFA 2X30A 3GNNA 4DQWA 2VEIA 2YZRA 1S3HA 2Y62A 3PBVA 1RPXA 4BI7A 5AOUA 4DBEA 2J9YA 4NNAA 3TW7A 1RV8A 2BX7A 4MY8A 3G3MA 1KBJA 8TIMA 3UQNA 4IMGA 3S5NA 4QAIA 1TTQA 3CLMA 2HMCA 4YXGA 4UTTA 3W2LA 4KWVA 4MLRA 1KFBA 5CG7A 3NQGA 2QCCA 2CLIA 1I2OA 4R7JA 3CPRA 3ELFA 4NXSA 3QMTA 1K7FA 1WBJA 3EXRA 3TCEA 2Z1BA 3BW3A 3PUOA 1R46A 3CC1A 4NQ1A 1EX5A 1ICPA 4FF7A 1Q6QA 2P0OA 3I7RA 1P1XA 6ALDA 3UWZA 3SIZA 1DJNA 3G1XA 2H6RA 2ZA3A 4BK9A 4HPXA 2QR6A 1XCFA 3EWBX 1JVNA 1G7VA 5HUOA 3NL6A 2ZZ6A 4UTKA 1ZY9A 3EKZA 2FJKA 3W7OA 2ABBA 4E0CA 2ZRXA 3W83A 1KTBA 4MYAA 3G1AA 2ZZ3A 4GJ1A 5K7JA 3IVUA 1TO3A 3LERA 3C61A 1SFJA 4I9AA 5H2ZA 4DEFA 1OFQA 3M6YA 1W3IA 3L66A 1W3TA 3NM1A 2ZRVA 4TIMA 1BWLA 3ZWTA 3HG5A 3OEXA 1PVNA 1GOXA 3VI2A 1PHQA 3KRSA 4DELA 2O7QA 5K9CA 3B8DA 4JDBA 4DF0A 2E77A 1G69A 3WK2A 3KVMA 2QAPA 4NNCA 2FQIA 4QSHA 5HUPA 3EWZA 2F7FA 3TDFA 5AYYA 3UPBA 5G4WA 1KTNA 4UTIA 1H7WA 3UWWA 4WY0A 1EUAA 1EWDA 5EMUA 2V81A 3A24A 1YXCA 5DLCA 4W9TA 3P80A 4AH7A 3NQMA 4HHPA 4MZ8A 1W5MA 4IJBA 1S5WA 2DZUA 3DFNA 1TV7A 2JKEA 2YDAA 5DELA 1C9DA 1IXPA 4S1FA 2B7PA 1ICQA 4OGZA 3TFXA 4LV9A 1Z42A 4ALDA 3CIWA 5AYXA 3LHTA 3DZ1A 3LHZA 2EHHA 4LS1A 1B4EA 4UR7A 1P4CA 3S5ZA 4AHQA 2QAFA 3W7GA 3WK3A 2YSWA 1YDOA 3TSBA 1KTCA 1UJPA 1H1YA 3Q94A 4FNTA 5LNRA 4AWSA 2XN2A 5AC7A 1IXQA 5K4XA 1EP3A 1LCOA 5D05A 1W31A 2NXGA 1ALDA 3BGGA 2NXHA 3W6YA 1G4TA 2B7QA 2X1SA 2QCDB 2TSYA 4AWTA 4HNVA 1F6PA 1O4UA 4ORIA 4JX5A 3FFSA 2CFFA 3W1AA 2A21A 2CLEA 4Q4KA 2G97A 1KFLA 4HSOA 1KFKA 3TNOA 2LLEA 2F84A 2FPVA 1SZFA 2D73A 3NPWA 3B0UX 4FNQA 4YCPA 3TJXA 4OV9A 1OFAA 5C5YA 2V30A 1OFRA 3UY8A 1UCWA 4JY8A 1V5XA 3E02A 5CGQA 3W88A 3LBMA 1OFDA 4TMCA 1QPQA 1TREA 4K7VA 3W9ZA 4MFEA 3GDKA 1TSIA 3N2MA 3VNDA 3WJZA 1KV8A 3H55A 4N2YA 1W3NA 3SY5A 3KXQA 1G67A 4RR4A 1J5TA 1LTDA 2Y70A 4GUGA 2I14A 1PV8A 2I1OA 2R8WA 5EBUA 4JS3A 4JTSA 1X1OA 4LS0A 1OYAA 2QCNA 4KFOA 1KBIA 3LTSA 1VC4A 1DORA 3V75A 3PBYA 3KHJA 3ABQA 4E38A 2GPTA 5CPMA 1WV2A 3C2OA 3C2FA 3DH7A 3KRUA 2VFDA 1VHNA 3W7DA 3C6CA 3DFSA 3DENA 3W2UA 3PBUA 1OF8A 2NXIA 1SPQA 1TJPA 3UWUA 2J88A 3PAJA 3CTLA 1IIHA 1NVMA 3HO8A 4P2VA 4O18A 2NV1A 1KFCA 4KFPA 3CEUA 4RXFA 2A7NA 1D9EA 3QJAA 3HPSA 4FNUA 2DZVA 3IIVA 4H3DA 1FWTA 1Q6RA 4PH6A 5DCEA 3GDRA 3P81A 1Z48A 1EPXA 4DF2A 4DO6A 4UTJA 1OX4A 2YR1A 4GUIA 4IMCA 3NYZA 3DFQA 3GKFA 1RR2A 4IMDA 3TR2A 5FF0A 4LW7A 5KTLA 1H62A 1R2RA 5CSRA 3GK0A 2J24A 4LVBA 1YTEA 4PL2A 3TA6A 2YGYA 1F73A 2V5BA 3NQCA 1JULA 1UUOA 4UTUA 2VOMA 2EPHA 2A2IA 3GZ3A 1KLZA 3TUUA 1WBHA 4GXMA 3QRHA 5KZDA 5D2VA 4O53A 4MVAA 3W75A 4ADUA 3DFOA 3HPZA 5G1TA 5KSWA 4S2CA 2VEPA 1FXQA 2IQTA 2FPYA 1JCJA 2DORA 5HMSA 2P1FA 3SGZA 4JTJA 3L0GA 4FXRA 2Y6ZA 3QMSA 1TPH1 4ZMGA 1YPFA 2WJZA 3C2RA 2QKFA 1C29A 1Y0EA 2YW3A 3NQEA 1GG0A 1Q45A 1FCBA 3HGSA 4Z1AA 1R2TA 4WY0B 5LNUA 3LCWA 3FJLA 4AVFA 3I6RA 1H5YA 3MI2A 3DXIA 4MIMA 2A85A 4IGHA 4OE7A 4UFKA 3W74A 1AL8A 3NOEA 4O12A 2Z6IA 2E6AA 1SZGA 4Y6GA 5FESA 3RLVA 4NZJA 2WOQA 4PODA 5AC6A 2A7PA 3N9SA 4K39A 4RLIA 1OFPA 2A4AA 3QC3A 1YTDA 2NZLA 1L2UA 3WJYA 2KZHA 2CLKA 3NQ7A 4UFHA 4WZHA 1G4SA 1YXYA 1EP2A 4TU1A 2QDHA 3G1YA 5D37A 3BLFA 3MYPA 1SW7A 4I7WA 1XI3A 3INPA 2FDSA 3G1SA 3LHYA 3HOJA 3W71A 3W2MA 3BK0A 1LBLA 1VGAA 1WDWA 2H90A 3MO7A 1AW5A 3TAOA 4OU1A 3FLUA 1W0MA 5F2MA 1V7YA 3NEVA 4NJHA 5IM51 5DY2A 1BTMA 3TMQA 3BO9A 4Y96A 5BMWA 2B7NA 1PS9A 5DXYA 2RKXA 4XTDA 1E51A 3THAA 4A29A 1FY6A 3RU6A 3D0CA 3BW2A 3W7MA 3HG4A 3F1QA 3EX6A 4JGDA 2VXNA 5HWJA 2NX1A 3P5ZA 4RKAA 4U4MA 3TXZA 1FX6A 4BI6A 4NX5A 2JGQA 1YDNA 3IIXA 3GYEA 2FTPA 3C2VA 1PE1A 1IXOA 3UNDA 4LUIA 5G2IA 3SFKA 3UXDA 3JR2A 1Z44A 3UZJA 4FX7A 1GQNA 2PC4A 3G24A 4XZ9A 5LNWA 3M7WA 3NO5A 4O11A 3PVFA 5D38A 3G0XA 5D33A 2E1DA 1W8SA 1LLZA 3ATZA 3UZ5A 3W1XA 3TQ0A 3TQVA 3UWQA 3FKKA 5DY3A 2E6YA 4MPQA 3FIGA 1TCDA 1CX9A 3CB8A 3FKRA 4QQ3A 2Y88A 5E0KA 2DZTA 3TW6A 1KM2A 1R30A 2I9EA 5BW6A 2FB3A 2YFNA 3A5FA 1FUYA 1MO0A 1LZOA 1UB3A 5TQLA 4WJEA 1CI1A 3O15A 1XL9A 3W23A 4K36A 3NQ2A 4AF0A 4OHQA 3WJWA 2VFGA 5I3GA 5D32A 3GAKA 3UY7A 5AFDA 3P61A 3HMJG 4JICA 4DO4A 3G1HA 3FEMA 4O57A 2HTMA 3S42A 1ZJIA 3MHFA 5HR7A 1G4EA 1NAL1 1FDZA 5D09A 3LV6A 1FXPA 2PURA 1MEWA 3K30A 3MP3A 4ML9A 4MFDA 1CW2A 4WX2A 4UTWC 4IWWA 3W70A 3FYOA 4FHAA 2CLHA 1LYXA 1T0OA 1J4EA 3KFTA 3F4WA 1JCLA 3WFAA 3O6DA 3S0CA 3B04A 1TJRA 1QOQA 3EWYA 3LHVA 3NPXA 4MLJA 1GVRA 3W1PA 1VCVA 1WOBA 3W85A 7TIMA 4HNUA 1GWJA 3QFEA 4GBUA 1IXNA 1RVGA 2Y63A 3MI3A 5EY5A 1H7RA 1T8XA 5TIMA 5DN1A 5FEWA 4UMBA 5DBUA 3C8FA 1XBXA 4GNJA 3S5YA 4IXXA 3W2KA 4JTEA 4JTFA 3W7NA 3E96A 3SSJA 5LHEA 1HO1A 3B4UA 3TMLA 3S6DA 3BPWA 3P74A 2A0NA 3PSVA 1KFEA 3NZ1A 4BF9A 2FB2A 1DHPA 4IXHA 3NG3A 3TK7A 1H7XA 3M47A 1XM3A 3P60A 4QISA 2X1TA 3U8GA 4ZQMA 3G1VA 1A53A 2VEKA 1OYBA 4X3ZA 3RMJA 4N9BA 3VKJA 5G2HA 1H50A 2C14A 4JTIA 4MY1A 4XUGA 3M43A 4O54A 4M6VA 3ABSA 5LNSA 4QNEA 3B0PA 1LM1A 1FCVA 2V2HA 4M7TA 3TXVA 2JBMA 1VQTA 1G7UA 2VC6A 4HPJA 3GAYA 3WJXA 1FBAA 1I45A 1I4NA 3NQAA 1OX6A 1OK6A 3IV3A 4G1KA 1AG1O 3M16A 3O6CA 3PF3A 3W1LA 2NLIA 1VLWA 2PE4A 4WD0A 2WKJA 3KX6A 5AHLA 5K9XA 4A22A 5I3HA 4JTGA 3PUEA 1ONRA 2GUUA 1KLYA 4WY0F 3L0KA 4C1LA 4PTNA 1ADOA 4A2SA 1BKSA 3I68A 3NL2A 4N4PA 1OHLA 5DBTA 2PRMA 1QFEA 1W5PA 1SO4A 3LXCA 3M44A 4RX0A 4CCEA 1B3OA 5G4EA 2X1UA 5EKYA 2WPBA 3O63A 5HWNA 1F74A 3NL3A 4ZQRA 4MYXA 3PY2A 1WYIA 2AGKA 5CPLA 1JRCA 4QJ1A 2CLOA 1UBSA 3KVLA 3KRZA 3CM4A 4E2BA 3UYCA 4RCXA 3LBCA 3GB6A 2ZTJA 4WXZA 4H6KA 3QF0A 5HQEA 1WX0A 3USBA 1A5AA 4CQAA 5AHEA 1SFLA 1VR6A 2Y7DA 3L0NA 4PEKA 3G22A 1VS1A 1NF0A 5A8GA 1MSSA 1NSJA 1W1ZA 1ZFJA 4ZZ9A 3GVGA 1B57A 4WOQA 1KM6A 1SSGA 2V9DA 3IIZA 3IEBA 3SGUA 3TSMA 4ORMA 4O13A 1L9WA 2QCLA 3MWAA 3STEA 3BG3A 1LORA 2NUYA 4GRSA 3W22A 5T26A 4TX9A 1KM1A 4Q33A 3B06A 2O7SA 4LUJA 1DBTA 1QMLA 3FS2A 3KAOA 5LSMA 1M7PA 2J9ZA 1QO5A 1SSDA 5F2GA 1YADA 3QEZA 2ATSA 2G96A 1VLIA 4LVDA 3N14A 3TV8A 1EIXA 2NX3A 4JTTA 4GUHA 1YTKA 5K9DA 3OVQA 1QAPA 3LLFA 2VKZG 2PCQA 2GJLA 4MKNA 5BRBA 1GJPA 4ICNA 4LRSA 4RZ5A 1OG0A 2AQWA 2ZFAA 3TQKA 3CEPA 2OT1A 1LOQA 2PRLA 4Z0JA 3SR7A 3M5VA 4LU0A 2Q3RA 3OA3A 3P5YA 1IIGA 1TV5A 3PS7A 3O07A 5KZEA 1GPWA 4MUZA 1K03A 4O50A 3SW6A 3EWUA 1P5BA 1GTEA 3T4CA 3W2NA 1TTIA 2QF7A 4O52A 3L67A 3CQ0A 3QH2A 3QZEA 2EF9A 1L6SA 3A22A 1HTIA 3W7RA 4JXCA 4HKPA 3M5YA 5HR6A 4HNNA 2VENA 3HG3A 3G18A 3EEGA 1K3UA 4N6EA 1LDCA 1JCMP 2VFIA 3GXNA 2XFWA 2ZRWA 1XXXA 5E93A 5IBXC 1SUXA 3LRLA 1K8YA 2B7OA 2RHGA 5H91A 5CZTA 1PIIA 4FX8A 4M19A 4CCCA 2YX0A 3MP5A 4X2RA 1P0NA 3SZ8A 3NDOA 2Z6JA 3HF3A 4OQVA 1DJQA 2ZCGA 1F2JA 2QEZA 1VZWA 1UUMA 3C52A 2C0AA 1L6WA 3YPIA 5D03A 3MJYA 1OK4A 1TTJA 3NPUA 2Z2UA 1QNVA 2V2DA 3SI9A 2ZZ1A 3N9RA 1FDYA 1DL3A 1FCQA 2CLFA 3ATYA 1GVFA 4AHOA 4R34A 4GFSA 1XUUA 2HSAA 3ABOA 2YYUA 2WO5A 4XBKA 2QCGA 3TE9A 1OJXA 4YWIA 1ZHAA 2X16A 2J9XA 3U2OA 3W1RA 4Z1CA 3F4NA 4NU7A 2VFFA 4O0ZA 3UD6A 4IMEA 4MZ1A 3BV4A 2TYSA 4MY9A 1O60A 4CNOA 3O06A 1JRBA 5CPNA 1GVQA 3Q58A 1A50A 3LI1A 4S2BA 2C13A 3L5MA 1JJKA 2C15A 1O5XA 3M9YA 1EWEA 4YMZA 4JY9A 4JYDA 4NJIA 5I3FA 3L65A 1SQ7A 4LV4A 2FLIA 4UNLA 2W79A 2B4GA 1BEUA 3QYQA 3O8AA 4FNSA 5F4SA 2VFHA 2CZFA 2Y85A 2ZRUA 1WAUA 3W3OA 3RFAA 2GQ8A 3LCLA 3L68A 4Z08A 3RNDA 1YYAA 3CT7A 1WXJA 2A6NA 2QUUA 1GEQA 4WXYA 1TQJA 5C54A 2VELA 4IQLA 1QCWA 3DHDA 1SZNA 4DPPA 3LB0A 2QJHA 3PWAA 3W7EA 2WNNA 3QMRA 3FOKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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