4WKAA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain at 0.95 a resolution
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 132
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkaA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkaA01
3M7SA 3L4TA 4P7OA 3WMCA 1KXQA 2JF7A 1XSJA 4BF7A 1Q6GA 3GYCA 2F8QA 1GUVA 4AD2A 4WKHA 2DH2A 1WB0A 1QI2A 3NDYA 1SR0A 1C7TA 1H2JA 3AQUA 1B30A 3PZNA 4PCTA 3SUSA 4HMCA 4PN2A 3VD5A 3WDIA 3IJ8A 4F8XA 3LPFA 4DM1A 2WAGA 1W3KA 2C7FA 1B3WA 5E6ZA 4W88A 3SUWA 1CGUA 1UA7A 2UWFA 2J7BA 1UD3A 3W53A 1C93A 1E6XM 2WHMA 2YLLA 5M17A 3CO4A 3MUIA 1JYVA 3HMCA 1OD0A 2CBUA 3VILA 2XVLA 5CLWA 2ZOXA 4FLSA 1BG4A 5M5DA 2QMKA 3UG5A 2WBKA 1M53A 4W86A 1WZKA 1JAEA 3GH4A 4Z2JA 1K9FA 1E4LA 1J0JA 1E6ZA 3E1F1 5BXPA 2XWDA 5IDIA 1Q6EA 1NOUA 3TONA 3W25A 1W1PA 3N1AA 4D6CA 3U5UA 2CKSA 1UKOA 4P7QA 3OG2A 2VZTA 4B9YA 3NSNA 1JIBA 1EO5A 4XX6A 3SCRA 2FH8A 2VC9A 1GPFA 4E8CA 1RP8A 2XVGA 5DMYA 2JF6A 2QMJA 3N18A 3O2LA 2XGBA 5I0DA 1VF8A 3SEPA 1VEPA 4H8UA 3CZLA 5DFAA 1ECEA 4GKLA 5BXSA 2Y8KA 3SCTA 4J3UA 3WD1A 4YHGA 4OJYA 3WQ6A 4UCFA 4ZEPA 5HPOA 1BHGA 3BAWA 2E8ZA 3BGAA 3OA5A 3ZT7A 4WLCA 3AIWA 4IPLA 1CBGA 1WCGA 1BF2A 2VVNA 2VOTA 4H41A 3VIKA 3RDKA 3VUPA 3AZTA 1NM9A 2QPSA 4PMOA 5FL1A 1EOMA 1E6PA 4P7RA 4J3SA 3PZUA 2XVPA 2FDMA 2PB1A 3M07A 3SCUA 4M1RA 3MV01 1BVNP 3CUHA 3GNOA 4OBRA 2WHKA 1F4HA 2D0HA 3WFLA 1B3VA 4J3WA 1GQKA 1QI4A 2YBTA 1CGVA 3BMVA 3ZOAA 4AY1A 2XGIA 1KBKA 4UQ9A 4HA3A 2VTFA 1ZBCA 1GVIA 1OT2A 3A3HA 4GZJA 5D9MA 4CU8A 2J8GA 3VIIA 2EPKX 3WIJA 1QNOA 5M03A 3RPMA 2YDQA 3A47A 4WKAA 2XPKA 3VIPA 3DECA 4CU7A 1TZ7A 4W7VA 1QHPA 1JG9A 1HJUA 1BSIA 5A8PA 1DTUA 3QHMA 3ZQ9A 2PWFA 4GZIA 4UQBA 3WEMA 1R87A 1VAHA 2CIPA 3EDKA 4MAZA 1ZBVA 5E70A 1CGTA 1WKYA 1WDSA 4ACYA 4PSRA 2QPUA 4WSKA 3CHEA 4TVCA 4F79A 3CUJA 5DO8A 2WZHA 1HX0A 1CENA 1KWKA 1HN1A 3CUGA 1HXJA 3WF2A 2BNJA 2VZUA 3CGTA 5I2UA 2W4XA 2PBOA 3MV11 1EDQA 1M01A 4H7VA 4V27A 3ECQA 4AD5A 3K8MA 4MADA 2V3DA 1JZ4A 1NP2A 1CXHA 1FFQA 3UERA 2VNCA 3PHAA 1XSIA 3F5KA 3RILA 1WPCA 1J10A 3VMOA 3O9NA 4PUEA 2OYMA 3OLDA 5A6BA 1E5JA 1FH9A 2VX7A 3NSXA 1E72M 1V3LA 2VCCA 4PTVA 3F5JA 2E9MA 3BCDA 3EMZA 2XTKA 2DEPA 3FHAA 5CSYA 2ZE0A 2EPOA 3II1A 1KGXA 4B16A 1AVAA 2WC7A 3W27A 2XWEA 4U5KA 3WDPP 4HU8A 1XCXA 2GSJA 3VD7A 4D6DA 1TFVA 4ZE4A 1L8NA 4EANA 4H04A 2VR4A 3W82A 4UOJA 2EEXA 1W1TA 3VNYA 4EE9A 4WF7A 2ZX6A 2BVDA 5E9AA 2Q8XA 3MMWA 3N13A 3VDAA 2YL9A 3MUZ1 1W3LA 2VRQA 1E9LA 1W1YA 5GNXA 2WVVB 3SCVA 2CITA 5ABGA 2IUZA 5ABFA 5EMYA 4CD4A 3F5LA 4EKJA 5JIWA 1MFVA 3AS0A 3SCOA 1NH6A 4TUFA 2V3GA 5A2BA 1NARA 3GH7A 2ZXQA 1K6AA 3BLPX 2DQXA 4UTFA 1W91A 1NWSA 1B2YA 3AROA 3KE0A 2DT1A 1G9HA 3CHDA 3THCA 2B31A 2DPEA 3GTNA 1EH9A 1ISZA 2ZUMA 2DDXA 2WWDA 4W5UA 1WAWA 3VIFA 1GCYA 5CPQA 4MJ2A 3NJ3A 3SURA 4BZYA 3UEQA 2V3FA 1GOKA 2W61A 2VZVA 4LYRA 2XFFA 2J78A 1V02E 4ZENA 3CZJA 1E71M 3PZTA 1QW8A 3CMGA 3GXDA 2Z1KA 5DT5A 3WQWA 2FH6A 3VM7A 4L4OA 4LYQA 2ZUVA 2FGLA 1V3MA 3FAXA 1HJQA 2ZWYA 1CLVA 3LMYA 1V03A 1VBRA 1V6WA 1B31A 1GHRA 4A3HA 1WNOA 4B3KA 1HKMA 3HN3A 1BYDA 1IZKA 1UD5A 4PTMA 4IISA 1JXJA 1XCWA 3AHZA 5LA1A 2DSWA 3T09A 2MANA 3AIEA 3POHA 1V0NA 4NZCA 2WMIB 4UFKA 1XGZA 1QNPA 1VENA 1UH2A 4WSJA 1QI3A 2CHNA 1E56A 1CXEA 4DUWA 2J7GA 2O9PA 2VCAA 1AQHA 5BCAA 4R27A 4JFWA 1GJUA 4PBGA 3T0AA 3UETA 3WH5A 2W5FA 2PI6A 3ZR5A 1I75A 2A3HA 3BAIA 2WKLA 3KL3A 4FF5A 2JFEX 4GI9A 1X6NA 5DT7A 2J74A 2YDSA 5E09A 1V0MA 5ABFB 6CGTA 2CNCA 1BQCA 2Y24A 4HZ8A 1JFHA 1ODZA 4JHOA 1JL8A 3WNLA 2O9TA 2V5DA 5D9PA 2JIWA 4PUDA 1UKPA 1E5NA 3AYSA 1UKSA 2HVMA 3PZIA 3RM4A 3AMGA 3K4AA 2D24A 2CXGA 4D6HA 1J12A 4X0NA 1GORA 3G6MA 3KL5A 4LPCA 4J7RA 1DWIM 3WF3A 3WL1A 3WD4A 1E0XA 2ZXDA 5A8QA 1E4NA 2ZUUA 1EIBA 3WNPA 1OM0A 1QBBA 1NOWA 2FHFA 2D23A 2WZIA 4S3KA 2EJ1A 3CZKA 1WE5A 5GPRA 2WMKA 3NUKA 5M3WA 4TVDA 4P8UA 4BQ2A 2Y8VA 3AHXA 5D4YA 4MDOA 1KXTA 4TVUA 1BYBA 5ABHA 3W29A 4OZOA 3AXHA 3G6LA 1D7FA 1WZMA 3U5YA 1ESWA 4X0VA 1ZB5A 2W92A 1PIFA 1DWFM 4MB3A 3EDFA 4QLLA 4NRRA 4CN1A 2X2YA 1JZ8A 1ZJBA 2ZXAA 2J75A 3EMQA 1ODUA 4NRSA 2G4FA 7CGTA 4OIFA 4MNJA 3OB8A 2UY5A 1EDGA 1GOWA 1H0GA 4CUCA 1E43A 3EYPA 3O6AA 1YHTA 3WF1A 3QOMA 3A6OA 3CUIA 3GBDA 2ZX7A 3AMKA 2V5CA 3BC9A 2VX6A 2GJRA 2XSAA 5AY7A 1C3FA 1DWAM 5AC5A 1UD2A 1UG6A 4OBSA 1E4IA 5A6SA 3IJ9A 2Y4SA 2OWWA 5IHSA 3FN9A 3S6TA 1ZBWA 3T2PA 2VZSA 3JUGA 4HU0A 2XJ7A 3VIGA 1EHAA 2VI0A 1CPUA 1ZU8A 1KGUA 3L4ZA 2WSPA 4RE2A 1KR0A 3AMCA 5F7UA 4J3XA 1N82A 1UHVA 2E8YA 4UFMA 2W91A 3EMCA 2XVKA 5A8NA 3IAQA 3BMWA 4UFJA 4CN4A 1XH0A 4MB1A 3KZSA 1TA3A 4Z2LA 1V0LA 1J0ZA 2J7HA 2EQDA 1GW1A 4C7FA 1EXPA 1LJYA 4HPGA 4ZFMA 2D22A 1M04A 2OSYA 5A3HA 4ZE5A 4JL2A 3FHQA 4U2YA 2DH3A 4DUVA 3J7HA 4NF7A 3AIUA 2YKKA 1XHGA 1PJ9A 1E73M 2X8RA 3ARSA 1CDGA 4DWSD 1VB9A 3WBAA 3AISA 4RE4A 1VFFA 4JHZA 3WH7A 4QAWA 4CCDA 1W1VA 3W28A 1DHKA 2EPMX 2VX5A 1UWIA 1US2A 1QNQA 2X09A 4WJXA 2DIJA 3T0DA 3ARTA 1PPIA 1W2PA 3OGRA 1V3IA 2Y5EA 1VFOA 2X0YA 3QHOA 4F9DA 3OLGA 3ZSTA 1ZS2A 3QGVA 1D2KA 1V6UA 2ZX9A 5IFTA 3PTKA 1MVYA 1FFRA 1R8LA 1E6SM 1FHDA 1A3HA 1OGSA 1IV8A 3WUBA 2YL5A 4JZ5A 1LL7A 4J28A 1Q6FA 5I6SA 3VDBA 4DWSC 5GNYA 2GJXB 3W24A 1MXDA 5BWFA 2CBJA 3DC0A 1OIFA 2VMFA 3OIHA 4ATLA 1XC6A 1PX8A 3ZO9A 1VEOA 2GFTA 1C92A 3BXWA 2C8NA 1HVQA 3AS1A 4E8DA 1DWHM 2WHJA 2VQUA 2DSUA 5JBFA 4AC1X 5HXMA 1E70M 1ITCA 4HA1A 1V6YA 4PMXA 1YQ2A 4AD1A 4C7DA 3L4VA 2EPLX 1TA3B 4UQEA 4J3VA 4AIEA 3OZPA 1QI0A 4BQ3A 1ISWA 4M82A 3UESA 1G01A 1UWSA 2J7EA 3VIMA 4AW7A 1M7XA 3VTRA 4EK7A 3ARZA 1SYTA 2BY3A 4PMNA 3FNDA 2WBGA 4CCEA 3I3EA 4Z2KA 1JI2A 3MANA 4GIAA 3TTQA 3T08A 5I78A 2BV9A 3AHVA 3RM8A 3CLWA 4OOUA 5BYWA 1E55A 1B9ZA 2J7CA 1WDQA 2D0GA 2RGMA 3CMJA 5FIPA 1MQRA 2XVNA 3RJYA 3ARPA 4AZ5A 2J7DA 3PZMA 2A3BA 4UZSA 4PMRA 2ZX8A 2XFRA 3CHCA 4TXEA 1UYQA 4ML4A 2CEQA 1SMDA 2VJXA 1G0CA 3ARQA 4YHEA 4BA0A 1G94A 4AZ7A 5IXEA 1EQCA 3VGEA 3T0BA 4FLQA 3B9EA 2WMHA 4PTWA 2WVTA 1E3XA 3WFZA 3L4UA 1K9TA 3WNOA 2O92A 1NWRA 1LL4A 1MYRA 2EPNA 3ARUA 4GXPA 1JZ3A 5JIPA 2ZWZA 1CWYA 1WZAA 4JL1A 3OGSA 1EHNA 2WMJA 3GBEA 1GQIA 3EDDA 3L2LA 5CJ5A 2BVTA 3RO8A 2BFGA 2DSKA 2JEQA 3GXFA 4PSPA 1H0IA 3DYPA 3VX0A 1C91A 1KR1A 1B3ZA 1QOXA 2G41A 4Z2GA 5E6YA 2GK1A 1C8XA 5JH8A 4UQAA 1JI1A 1XYZA 5I24A 4KMQA 1S46A 2PWGA 1CXFA 1QHOA 4M80A 2TAAA 4AYSA 1UQYA 4N0RA 4ATWA 1AQ0A 1DP0A 1HF6A 5CG0A 3L2MA 1PX4A 3SUVA 3FW6A 2WZEA 3BSGA 3KL0A 2G3IA 1CGWA 3PTQA 3WF4A 4W89A 5IFPA 2VL4A 4IUGA 4HMEA 4YN5A 3FY1A 3GNRA 4A3YA 1HJVA 5EFDA 1J18A 1D3CA 1MW1A 3WQ5A 5A6JA 5D9OA 4UFHA 1V08A 1QPKA 2WLYA 4GQRA 4D71A 1Q6DA 1X6LA 1XD0A 2C0HA 3WD3A 1PBGA 2VVSA 3APGA 2GDUA 2VT0A 1FOBA 1R86A 1CZ1A 3DHUA 4KH2A 1DWJM 2CCRA 2OYKA 4MDPA 2ZUNA 4NI3A 4XV0A 1US3A 1UKQA 5I79A 3BSHA 1AQMA 1V6XA 5BXRA 3RJXA 3ARWA 2AAAA 4S3JA 2WKGA 5A6LA 5HBFA 4CD8A 5HOSA 2WWCA 4GO8A 4CN6A 3A4WA 3AS3A 1I1WA 5CQ1A 3L4YA 2VCBA 3CHFA 3VDCA 5A69A 3VVGA 1BPLB 1MFUA 1NQ6A 3HU7A 1DWGM 4U31A 4LGXA 4MNKA 1V3JA 3GXMA 3VGBA 1JF6A 2GK1B 5FCZA 3AFBA 4AXNA 4QCFA 3ARXA 1ISVA 1WZLA 3LPGA 4D6IA 3WDRA 4AZCA 4UFLA 4JFTA 4XZBA 3MU7A 4AD0A 3POCA 3WSUA 3CUFA 3VINA 1OBAA 1UQZA 1CGYA 2DT0A 4OKDA 1G5AA 5CGMA 5CZKA 5KEZA 2XG9A 3WF0A 1H4PA 2NT0A 4F9JA 1BAGA 3TTSA 5GNZA 2WM0A 1WDRA 1PZ3A 2YIHA 1JZ7A 1KQYA 1CECA 3VIOA 2QV4A 1JYXA 1TUXA 4BQ5A 4AISA 4M24A 3NIYA 4PMUA 1TVNA 1U33A 4AZBA 2VRKA 5C71A 7A3HA 2GDVA 2XM1A 1EA9C 5A8MA 1BTCA 2ZUSA 4ZXOA 1EGZA 1V02A 4UNIA 1JDAA 3K8LA 4DWSA 4CD5A 5I77A 5BXTA 3CH9A 2NT1A 2QLYA 1CIUA 2CBIA 4QDMA 4FMVA 4KGLA 3BAXA 3B8SA 5HDRA 2E0PA 4PMVA 3AXIA 1C7SA 1VIWA 2G8ZA 4JFSA 2XSBA 3NYDA 2ZIDA 5JBDA 2PWHA 1JYWA 1P6WA 1UD6A 2IXVA 1JDDA 5EFFA 5FD0A 3WQVA 3B9DA 3VX1A 2AOSA 4PMZA 3VD9A 3PN8A 3WDHA 1FH7A 3CZ8A 1I1XA 2GJPA 2JALA 2AMGA 1Y7VA 2WCGA 5C70A 1QVBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SIM A;  3F2C A;  2WNW A;  4LSB A;  1FKI A;  3VDH A;  3FK4 A;  4C6P A;  2H6R A;  2P50 A;  4TV6 A;  2HXU A;  5K9X A;  1HUV A;  4RDW A;  3EBV A;  1NOF A;  1FWG C;  1SQ7 A;  1PV8 A;  1RCO B;  1K4H A;  2FGZ A;  3QR1 A;  4Y2W A;  1IIH A;  2A6N A;  2PBC A;  1LG1 A;  2XP7 A;  1RA5 A;  1VLI A;  2PN0 A;  3W0K A;  5D8W A;  1DIK A;  1HP5 A;  4PUJ A;  1EPV A;  1K70 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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