4R27 | Genus

Total Genus 168

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	168
sequence length	417
structure length	417
Chain Sequence	NPFPQDFLWGVATAGHQVEGNNVNSDVWFLEHLPGTIFAEPSGDAVDHYHRYREDIALIAGLGFTSYRFSVEWARIEPEEGHFSVAALDHYKRVLEACREHGLTPVVTFHHFASPLWLLRSGGWEGERTPELFARYCGRVMAHLGDLIGVACTLNEPNLPWLLESFGIGGEAPENRGKVPMWAAAAQRLGVDASTVAPFQFCSTEAGFNVKLAAHKAATEAIKAHRPDLRVGWTLANSDIQSVPGGEEIAAQVRRDVNERFLEASRGDDFVGIQTYGRTVYGPDGHAPAPEGVAVNQMGEEIYPQALEATIREAWRVAGIPVMVTENGLATEDDTQRVAYLRTAVDGVASCLADGIDVRGYIAWTAFDNFEWIFGYGPKFGLIAVDRSTQERTPKESARWLGNFARQQAPAEAPQPA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Glycoside hydrolase
publication title	Rational design of a beta-glycosidase with high regiospecificity for triterpenoid tailoring pubmed doi rcsb
source organism	Microbacterium sp. gsoil167
total genus	168
structure length	417
sequence length	417
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.-:
pdb deposition date	2014-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4r27A00

3ZIZA 4LYRA 2WMIA 2J7GA 4D6DA 4HZ8A 4RE4A 3MO4A 3AHYA 1XCXA 4OUEA 1OM0A 4KGJA 1KQYA 1KBKA 1C8XA 1ISZA 3ZT7A 3VGGA 1MFVA 5I24A 1JDCA 3L4XA 3WKZA 4DWSB 5BXPA 4MJ2A 4UZUA 1JYWA 4ATLA 3CZLA 5M03A 1K9EA 1TUXA 4AIOA 5DO8A 1CZ1A 5JBDA 3A4AA 2NSXA 2WCGA 4PEEA 2W92A 2ZX8A 3ZM8A 4GQQA 1XD1A 1I1WA 1UR9A 3AZRA 1US3A 3WD2A 3WIJA 1LF1A 1C91A 1Y7VA 4NF7A 1BLIA 1O6IA 1BYCA 2XTKA 2GJRA 3MV01 2J25A 2VZSA 1WDSA 5E09A 5IFPA 3BAYA 5ABEA 4U2ZA 4LPCA 2AAAA 5CSYA 4JCMA 1W91A 2ZE0A 3WUBA 4AIEA 1B3XA 2EO7A 1ZBCA 1ZB5A 3BAJA 1HVXA 3OGRA 2W91A 3BSHA 3RMEA 1BQCA 3ARQA 1CXIA 1UKSA 4PMVA 3QHMA 3IJ8A 4JAWA 3EDFA 3PZMA 4UQAA 4E8DA 3TONA 5DF0A 1W3HA 1UWIA 1EXPA 5CPTA 2ZX9A 1GQLA 2F61A 2ZX7A 4IPNB 4EKJA 4UQDA 5LA1A 4PMRA 1VF8A 2PI6A 2WKLA 3K46A 2YDSA 1UKTA 2E40A 2ZIDA 1C8QA 5E6YA 1C7SA 4WLCA 1E4NA 1W9DM 1CYGA 1RPKA 1CIUA 2CCRA 4AYSA 3D3AA 1HJSA 3OGSA 1QW8A 4M8UA 2V5CA 3RPMA 2V38A 1OGBA 1GCYA 2O9PA 3W6MA 1BAGA 4AW7A 4YN5A 2VNCA 2QLYA 2V3GA 3OB8A 3GBEA 4PCTA 1UH2A 4MAZA 4P8UA 5DEZA 2G3MA 2FHFA 3KEHA 1LG2A 2Y8KA 5ABFB 1XV8A 4DM1A 3WMSA 3PTKA 3F5JA 1WNOA 2GUYA 4QCFA 1W9PA 4MJ4A 1GNXA 1MW2A 3AXIA 4MB5A 5A6SA 1R87A 4X9YA 1GONA 5GQBA 4W88A 1FH7A 1HJVA 3PBGA 3MSGA 1KWKA 2OYLA 3VGBA 1BGGA 1EO5A 3HMCA 3WNNA 1NWRA 1X6LA 1CECA 3VGFA 1H11A 4JCLA 3HU7A 3DHUA 1CGYA 1OWQA 3BAIA 4TVUA 5HOSA 3N04A 3OLEA 1H0GA 1WAWA 2BS9A 4H41A 1GQKA 2DH2A 3ARYA 3ZJ7A 4Z2JA 5A6BA 1FH9A 4PCSA 4XUYA 4OOUA 4UOJA 4OOZA 3TA9A 4S3KA 1EQCA 2BVTA 2GJXB 1WO2A 3LMYA 1WE5A 1PZ3A 4UNIA 2W4XA 1D7FA 3CHCA 3SUVA 3ECQA 1QI3A 4GZIA 4W8AA 5EFDA 3VINA 5IDIA 3EMCA 2A3CA 3B8SA 3SCUA 4R27A 1SFSA 1V3MA 4BQ4A 2XVLA 2D22A 3U5YA 2DH3A 4HU0A 2PWGA 3VGDA 1J0ZA 3VPLA 3K8LA 3WF1A 3GXFA 3CUJA 2WB5A 4AD1A 4P8VA 4URIA 2ZUMA 4S3JA 4W85A 2D20A 3ARPA 3MMWA 1K6AA 4K68A 1AMYA 3BAWA 1FFRA 2QV4A 2EQDA 3GXMA 1PBGA 1LLOA 2WVVA 5CSUA 2OSXA 2GDUA 2FGLA 7CGTA 5BYWA 1UD8A 3WUEA 4AD2A 3FY1A 1CGTA 1FFQA 4CKQA 8A3HA 3FAXA 3U57A 2WWCA 1AQHA 3VUPA 1JL8A 2YDRA 4KMQA 5AYBA 1GORA 3BLPX 2NW0A 3W29A 4D6EA 4ACYA 2WMJA 4P7OA 3N15A 3L4ZA 1JXKA 2ZUUA 1JDDA 1W2VA 2X05A 4UQ9A 5C8BB 4JFVA 2JFEX 4TX8A 1UR4A 2VUYA 2WKGA 1KGWA 1JZ5A 4PTWA 1ESWA 3VVGA 4ZEPA 2BY1A 1DWGM 1UD6A 1JD9A 1GJUA 4JKLA 4V2XA 5FOOA 3VO0A 3AIBA 1UH3A 1O7AA 1C92A 3JUGA 4BA0A 5A6BD 4AZ5A 4CN6A 3M07A 3CPUA 1GOIA 1M03A 1MYRA 4CUCA 2EPMX 4AXNA 3PZ9A 2WHMA 3RILA 4D6GA 4IUGA 5HDRA 5ECUA 3IJ7A 4PMNA 1BG4A 2WCAA 5E0CA 3ARWA 3N13A 2TAAA 1GOWA 3RO8A 1V0NA 2G4FA 3WEOA 2E8YA 1ECEA 3AS1A 1EDGA 1GHRA 1Z32X 3RJYA 1E15A 1CBGA 2CBIA 4ZXOA 5E6ZA 4H7VA 4EK7A 3D5HA 2XPKA 1C8YA 2JEQA 1JZ3A 1UD5A 1ITCA 4QLJA 3WL0A 2G3NA 2YA1A 3CUIA 3F5LA 1UWSA 1H0IA 3GXDA 3I3EA 2GK1A 2JIWA 3VIKA 4Z2IA 3EMZA 1W2PA 4MDOA 2CIPA 2VR5A 1HKKA 1UR0A 3APGA 4TTUA 1V03A 1ZBVA 1UG6A 4CCEA 2EPKX 3TTSA 1JI1A 4QFUA 4B9ZA 5I2UA 4M80A 5ABFA 3RCNA 1ZBKA 4PMZA 3NDYA 2BHYA 4ZXLA 4EAMA 1A47A 3UR8A 1UOKA 4U31A 1C7TA 1QI0A 1S46A 1HL8A 1J11A 5HNNA 2EBNA 1UH4A 2CHNA 4HP5A 1FHLA 1W1VA 3FW6A 3VDHA 3WFZA 4WSJA 5ABHA 1Q6GA 2Y4SA 2WVUA 3ZT6A 4RE3A 3VIOA 4TUFA 4AEFA 3M46A 3A3HA 2IUZA 4PTMA 5EB8A 1HF6A 3FXYA 4FF5A 1WZKA 2VZTA 1CGUA 1J0JA 1JYVA 3ALFA 5A6LA 4A4AA 1MQPA 3ZO9A 2VX4A 3ZJ6A 1QI2A 4AD0A 1XRVA 3DYMA 1GJWA 1XH0A 4CD6A 1G9HA 5CPSA 4UFMA 3WQ4A 4NZCA 4HPGA 4AZGA 4BQ2A 2VJXA 3GXIA 3EDJA 3WDHA 2BV9A 3L2MA 2E0PA 1JYNA 1V6WA 1XYFA 5BXRA 2WVSA 4ML4A 3AMKA 4AWEA 1K9DA 1J12A 1QI5A 1B90A 2X09A 4GI9A 4AZCB 1E4IA 2VURA 3RIKA 5CLTA 4J28A 1KXHA 1DWFM 4D6CA 3MMUA 4CD4A 3BMWA 2RGLA 4M24A 1D3CA 4KH2A 3VMPA 5A3HA 2J7BA 1UWTA 3G6LA 1BVNP 5IXEA 2YDQA 4XB3A 4LYPA 1UD4A 3T0AA 2CITA 3VM5A 6A3HA 1VB9A 1E9LA 2YIHA 3L2LA 2GJPA 3WEZA 6CGTA 2DSWA 3AIRA 1FHDA 2YL8A 1UHVA 1V6XA 2FHBA 2WMGA 4AISA 2W63A 3BH4A 2FHCA 4PMOA 1HT6A 2E9LA 2ESCA 4WJXA 2XIIA 4JKKA 4BQ3A 2YOCA 5D9MA 2JALA 1QBAA 4D6JA 1KGUA 3AFBA 1V02E 3BC9A 3A4WA 1H3GA 1CLVA 1NWUA 3WNKA 2VCBA 1GOOA 3WDRA 3W0KA 7TAAA 4GZJA 1KWGA 4J3SA 3CUFA 3WH9A 2V3FA 2WCSA 3ARXA 1E5NA 3N18A 2WYSA 3VILA 2PWFA 3VX0A 4U3CA 1QBBA 1XSKA 2J62A 4CD5A 4ZE4A 1VAHA 2CBJA 4JFUA 4H2CA 1CPUA 4Z2HA 4NRSA 2DSUA 1MWOA 3ARRA 1H2JA 2JIEA 4MB1A 4EANA 3ZQ9A 4Z2GA 2BFGA 3T09A 2V3DA 3VD7A 3WBAA 3CHEA 1CENA 3TTOA 3DC0A 4CU6A 5FL1A 2C0HA 3WH5A 2PWEA 5D9OA 1E1EA 4MAVA 5I6SA 3CMJA 1OD8A 3QOMA 2OSYA 3WD4A 1H4PA 1VEPA 2D0HA 3AMLA 1VFUA 3UEQA 1QHPA 4A3YA 2YL5A 4J3UA 5IFTA 2J79A 1ISXA 1QNPA 1JF6A 1PX3A 1XSIA 3ARUA 3OZOA 4GO9A 2J78A 1R85A 2ZUSA 4TX6A 3L4YA 1KFWA 2EJ1A 1ZJAA 2FH6A 4W7WA 4ACZB 2WMFA 3T08A 1PIFA 2YA2A 1E40A 1HJXA 2WANA 1EQPA 2MANA 1GHSA 1V6UA 1XGZA 4QLLA 2WBGA 4W5UA 1U30A 3W25A 2HVMA 2WM0A 4Z2KA 3N12A 2WZEA 3FHAA 2G3IA 3M6DA 3WF3A 4C7FA 4PYSA 1C93A 3AYRA 1PJ9A 1NWTA 3KL5A 3L4WA 3ZJ8A 1VFMA 1UKOA 4PUDA 3N17A 1TMQA 3T2QA 4B3LA 1ZU8A 5A6MA 3CGTA 1GOMA 2ZX5A 3MUIA 2WPGA 3ZMRA 3GYCA 4LX4A 3WH8A 4UFKA 2PBOA 2WZIA 4CN1A 4D6FA 1M04A 4JFWA 4RL3A 3BAXA 2YL6A 1LL7A 4P7LA 3AZSA 5BXSA 2Z1KA 2XJ7A 4AD3A 3WNLA 3PZNA 5BRPA 3W53A 4CVWA 1N82A 3EYPA 5F7UA 2AOSA 1QNQA 1QVBA 3N11A 2WWDA 3SCVA 5A6AA 5DFAA 2XVPA 3PZUA 3L4VA 4W93A 1BHGA 1VEMA 4MB4A 1KBBA 2E4TA 4TVDA 4W8BA 3CBWA 2WAGA 4AZCA 1WP6A 2FH8A 2ZXBA 1TR1A 1NP0A 4GKLA 1UWQA 4IM4A 1NOWA 3EDEA 5TD4A 1GUVA 2D23A 4TXEA 3WQ8A 2VR4A 1LG1A 4W5ZA 3WSUA 3LPPA 5A8MA 3NDZA 4F8XA 1V3JA 3WDQA 1UD3A 3ZJKA 2NT0A 5CGTA 7A3HA 1KGXA 1OCQA 4FLQA 3AHXA 5DT5A 4X0VA 2XWEA 1XCWA 4LQ1A 1W3LA 1RD6A 1XD0A 1R86A 3ZT5A 1B3VA 3WL1A 3BXWA 2WC3A 1BTCA 4TOQA 4HTYA 4WKFA 1J0HA 3W37A 2O9OA 1E0VA 1NM9A 1J18A 4JHOA 2PWDA 1FP8A 2DSZA 3U5UA 4MPKA 4GI8A 2VRKA 2J7CA 5HPOA 4HMEA 4BZYA 4W86A 3VTRA 1QW9A 5LA2A 1RH9A 1CNVA 1B0IA 1MFUA 5FD0A 2VZVA 4P7RA 4M29A 1ISWA 1V6VA 2DIJA 3WF2A 1V3KA 4AZBA 3W26A 3WQ5A 3AJ7A 1UWRA 2OYMA 3RDKA 3WMBA 3M7SA 3WELA 4B9YA 1QNSA 2UY4A 4JL1A 3NSMA 1M53A 1TG7A 5BWFA 3RM9A 1HP4A 3VIIA 1ODZA 3SUWA 3OLDA 1EA9C 3CTTA 1Q6FA 2DEPA 3PZQA 3TTQA 3RM8A 4WKAA 4P8WA 3PZOA 2D2OA 3AIQA 4C7DA 4RE2A 1E55A 4DWSA 1VFFA 2E8ZA 3MKKA 4ZENA 2VOTA 4Q7NA 2F8QA 5JBEA 3I3DA 3A6OA 1KR0A 3CHDA 2O92A 3GH7A 1IZJA 4HA1A 4XX6A 1OIMA 3OLGA 1DP0A 1KCKA 1HJUA 2CEQA 2GVYA 1MW1A 4FLOA 4IPLA 2WMHA 4PN2A 1M7XA 2DT2A 1H09A 3VIJA 3OBAA 4JHZA 4GIAA 3CZKA 4ACZA 3LPGA 5I23A 2BY3A 4W89A 1JG9A 1NOUA 2XVKA 1KXQA 4HZ7A 3K8MA 1J0YA 1TA3B 1OT2A 3AIUA 4GO8A 3AOFA 4MNKA 3VMOA 1GOQA 2ZUNA 1OB0A 2V5DA 4J3WA 2VI0A 5A8PA 4CCCA 1CGWA 2X0HA 4HOXA 1OINA 2CESA 2X1IA 1KR1A 3IANA 1JNEA 2VZOA 2JE8A 3VU2A 1NARA 1QNOA 4JZ5A 1CDGA 4MB3A 2CKSA 4D6HA 1J10A 3WD3A 3AZTA 3AHZA 2VVNA 1OSEA 1J9YA 2UY5A 2YKKA 3BCFA 1HKJA 2WHJA 2QF8A 4JIEA 1RP8A 1UUQA 4D6IA 4MNLA 2WMIB 3FHQA 2VRJA 1MQQA 1CGXA 1ZBWA 1CXFA 5BRQA 4MADA 4UFLA 4UR9A 4ATWA 4TVCA 1V3IA 3NSNA 1E6PA 1AVAA 4ZE5A 5A8NA 4OKDA 1GQJA 2HISA 1JFXA 1BVZA 2ZX6A 5HPCA 1BYDA 1E56A 4AD4A 1WDPA 2F2HA 2X8RA 2A3BA 3WF4A 4UQEA 4U3AA 4DWSD 2VCAA 3UG4A 3PTQA 4CD8A 4KGLA 1EDQA 2WLYA 5FIPA 3BLKA 4Z2LA 3MANA 4YHGA 2WK2A 2EXOA 4A3HA 2J4GA 3WDIA 3AIWA 3IAPA 3SCPA 4UQCA 5C71A 3QHOA 5AC4A 1JFHA 1UWUA 2CHOA 4PSRA 1ISVA 4JFTA 1U2YA 3OGVA 1LL4A 3AHTA 1BFNA 2VZUA 5I79A 5KZ6A 3K1DA 2D0FA 3HJEA 4J7RA 3AMGA 4H04A 2DT0A 3TOPA 2WZHA 4U2YA 4UTFA 1C90A 1B9ZA 1JF5A 5A2CA 5JIWA 1IT0A 1VIWA 5LYRA 2QHAA 2YBTA 4B16A 2PF0A 5CG0A 5C70A 2CERA 3GDBA 3J7HA 3SCOA 1PEZA 3BSGA 3PN8A 3AROA 4BS0A 4MDPA 1J0IA 1R7OA 3ARVA 3KZSA 5D9PA 4OBRA 1VFOA 3AI0A 4WK9A 2QPUA 4HA4A 2VVSA 3MUAA 1HX0A 1UQZA 1DWHM 2XWDA 2E9MA 2XM1A 1P6WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4R27A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations