1H0IA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argifin from gliocladium
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords CHITINASE B
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0iA01
3MANA 3SCUA 3WQWA 1TZ7A 4OBRA 3GBDA 2D0FA 1Q6EA 2DDXA 3GM8A 3LPOA 2PWGA 3SUTA 3D5HA 2A3AA 3VIHA 2YLAA 1B31A 4PUEA 3WDPP 2IXUA 4F8XA 3L4ZA 3J7HA 4E8CA 1CLXA 1V02A 2ZE0A 2CYGA 4RE2A 4M80A 3F5LA 1D7FA 2X0HA 1JXJA 2J62A 1X1NA 1E40A 2XSBA 4PBGA 2Z1SA 1OT2A 1MW1A 1UHVA 1UD8A 1TA3B 1EDGA 4OOUA 1MQQA 1W9PA 1GQLA 2DGAA 1RH9A 1WKYA 2CPUA 2G4FA 4PMQA 2GFTA 1E6NA 3GH4A 2VVSA 1HX0A 3DC0A 1UD4A 3SCQA 2YL6A 1VFMA 4GKLA 1H0GA 3UR7A 2J7DA 2QMKA 2WWCA 1GHSA 2X1IA 1DP0A 1HP5A 4TVCA 3CZEA 1VEMA 4HZ7A 1W3HA 2BV9A 2J8GA 3BAYA 2XUCA 4BZYA 3MMWA 5DFAA 4HU0A 5EB8A 4CN6A 3W24A 1BF2A 1UA7A 4HZ8A 1JF5A 3PZTA 3VNZA 1TA3A 1TR1A 2F2HA 3U7BA 4XUYA 3CUFA 3A4XA 3VIPA 2MANA 5E9AA 2GVYA 2E8YA 2B31A 4HU8A 1E0WA 1SYTA 4DM2A 1K9FA 4MJ4A 1WDPA 2Z1KA 4JZ5A 3AMKA 5AYBA 3W28A 1PJ9A 4DWSB 1UD3A 4AYSA 1VF8A 1HJVA 3GTNA 4K68A 3BMWA 5A6BA 1RPKA 1BVNP 3IK2A 3VM7A 1UWQA 4HZ6A 1AIWA 5I79A 3WSUA 2YL8A 3M07A 1E6QM 4PCSA 2E9LA 3N15A 2VCBA 2BY2A 1HXJA 1QI3A 2OWWA 3WN6A 1CGUA 3UG3A 3WL1A 2VX6A 4R27A 2WXDM 2OSXA 4UZUA 1EQPA 3WD4A 2VL4A 2WVVB 1NARA 4AZ5A 1C93A 2J77A 3ZOAA 1W3JA 1UZ1A 3AYRA 1QNOA 1BHGA 3W25A 1EOMA 1K6AA 3T2QA 3M6DA 4DWSA 3ZIZA 2NT1A 2JF7A 3BMVA 2VX7A 1E6RA 2DSKA 2X2YA 1GONA 2Y8KA 3N12A 1J01A 1M7XA 2BHYA 2WBKA 1HJXA 1TMQA 1MQRA 4AIUA 1ISWA 4UQBA 4J7RA 4GXPA 3WMCA 2NT0A 4OIFA 2J25A 1S46A 2QF8A 3IJ9A 1U2YA 2WVVA 3NYDA 3SEPA 4AMCA 3LPPA 2WBGA 1C8QA 3D3AA 1FFRA 7CGTA 2VQTA 4AEEA 3OA5A 3BC9A 4AZ7A 2WSPA 1BAGA 4WSJA 1LLOA 2BXYA 4PMDA 3BXWA 4DUXA 3MMUA 5HDRA 3VGBA 5CLTA 2OWCA 2JE8A 3CHFA 2CBVA 3L4TA 1LWHA 3BCFA 2WKLA 3CZLA 1E4IA 4P7NA 3JUGA 1VENA 3RCNA 3VM5A 1EHAA 3T09A 1X6NA 3CIVA 4MTVA 3ECQA 2ZOXA 1B3YA 1US3A 3UCQA 1W2VA 5M5DA 3WMBA 6CGTA 5IHSA 3VMOA 1HNYA 4GI6A 4TVUA 2J7BA 4JKKA 2PI6A 1B3XA 2XJ7A 4JCLA 4YPJA 2A3HA 4BQ2A 1E9LA 3SUWA 1H2JA 1CTNA 4AC1X 1WB0A 1J0JA 2OYLA 1PX8A 2FH8A 5D9NA 2Y4SA 2E9BA 4D72A 5I78A 1M53A 3SCSA 4CU7A 4CGTA 2XIIA 1ISXA 1VBRA 1UA3A 3VD5A 2Q8XA 2E0PA 6A3HA 2VZTA 1SMDA 1NP0A 5CPSA 1E6XM 4CD7A 3BAXA 4H04A 2EXOA 1NH6A 4CVUA 2CHOA 4FLQA 4FLOA 1V02E 3CZKA 1X6LA 1GOOA 1G94A 1BYDA 3KL5A 4IPLA 3QHMA 1QHZA 2PBGA 5LA1A 3WDHA 1V6UA 3GDBA 4MB1A 1H3GA 3FY1A 1OWQA 6TAAA 3SCVA 4JFSA 2E9MA 1CXLA 4AZCB 1W9BM 2FGZA 4NF7A 4UOJA 1B90A 2UY3A 5I23A 5I5RA 1FFQA 4MNLA 2BXZA 4CD8A 1G01A 3NUKA 4UZSA 1ZBCA 1Q6GA 4P8UA 3CH9A 1CXHA 1TG7A 3WBAA 3IAPA 3VD3A 3WQVA 3BSGA 1GQJA 1SFSA 4WIWA 1GOIA 2VX4A 4WSKA 3U5UA 4OZOA 3O6AA 3SUSA 3GXDA 1CWYA 2PBOA 4Z2JA 1GOWA 1J11A 5LA0A 2WCSA 3CUIA 4AZCA 4QFUA 4CUCA 1UKPA 4V2XA 1V3MA 3WENA 3VIGA 3EYPA 4AZGA 4W5ZA 4OBSA 1GUVA 2OWXA 2E3ZA 3AHVA 2V5DA 2VZSA 1EDQA 1EQCA 2E40A 4CCDA 3VKKA 2JFEX 3O9NA 3DHPA 3MUAA 3AIQA 2YKKA 3AIWA 2FHFA 2CBUA 2XIBA 3RPMA 1KXTA 1LL4A 2WCAA 5A2BA 1GPFA 4Y7EA 1AQMA 1MVYA 3ARXA 4FF5A 5CXPA 2EPMX 1QW9A 3RM4A 2ZX5A 2ZUSA 1CBGA 5ABHA 5FCZA 3M46A 1KWGA 3CO4A 4YHGA 2DQXA 1NWRA 1ITCA 4W85A 1JNDA 2G3JA 3RIKA 3GXFA 5I6SA 1TFVA 1CNVA 4AD1A 1KGXA 3PZQA 2YOCA 4NI3A 1JZ7A 1J0YA 5E0CA 2GUYA 3L4UA 1V0KA 5CGMA 1V6VA 1JD7A 1RP8A 3IJ7A 1Q4NX 4TOQA 4WLCA 1WO2A 4MADA 2C7FA 2QV4A 3NCOA 3TTYA 5A6BD 1HJUA 4QCEA 5IFTA 2ZX9A 2ZUNA 1VRXA 2WAGA 1JAKA 3OGVA 4MNMA 1B9ZA 4WF7A 3GH7A 4M29A 4JFTA 1QNSA 1C7SA 3WF3A 2JIEA 3WDQA 1GOKA 4CKQA 5BRPA 1R7OA 1MW0A 1JAEA 1GW1A 4H41A 1XD0A 2VCCA 1CENA 1VJSA 1GJWA 2E8ZA 2WMIB 1PZ3A 4X9YA 2FHCA 3DHUA 3O2LA 1GQIA 3T2PA 4CVWA 1PEZA 2JEQA 3TA9A 4S3KA 1H1NA 4HMEA 1UH2A 1ISZA 1LJYA 4JL2A 5A1AA 1JI2A 1OSEA 4E2OA 1XRVA 2J7GA 4FMVA 3II1A 1EA9C 3CPUA 2DSZA 3ZT7A 5JIPA 2X09A 4H8VA 4H8UA 3PZUA 5CGTA 5FKYA 1IT0A 2D24A 1E4NA 1PZ2A 1VAHA 4UFMA 5A69A 1BG4A 1B3WA 3QOMA 5M17A 1I75A 3CTTA 5BXRA 1QNPA 1CDGA 5LA2A 1C8YA 2CKSA 1NWTA 4IPNB 2OYMA 3A4AA 3EMZA 1ECEA 3N13A 1R7AA 1KCKA 3IJ8A 3VNYA 4B3KA 1CGYA 2J7CA 2VR4A 1J0IA 2WC4A 4UNIA 2XWEA 4P8WA 2Y5EA 1V6YA 2WC7A 2VRKA 4D1IA 3PZVA 1EXPA 3VUPA 1EIBA 4AISA 2PWHA 3DYMA 1CXFA 1SR0A 2XG9A 3CZ8A 4U2YA 3B9EA 3CMJA 1WPCA 3AXXA 4PTMA 3AI0A 1E0XA 5AC5A 2DIJA 1CXKA 4MB5A 3ZO9A 2WPGA 4LXFA 2OSWA 1F4HA 2EEXA 4GIAA 4MAZA 1GZJA 4X0VA 4HMDA 3QHOA 4N42A 1DWJM 1W9VA 1W91A 2OSYA 1BPLB 5A6JA 1J12A 3AS3A 4YN5A 4A3HA 1UWTA 1CXEA 1EGZA 1C3FA 1E4MM 1KB3A 2DH3A 1EHNA 3W53A 3GXIA 4E4PA 4W8AA 3RM9A 4JHOA 5BCAA 3WQ4A 3VD7A 4UFHA 2DT0A 1KGUA 3FNDA 1XSJA 4KMQA 1D3CA 1KBBA 3QOKA 1XH2A 2XPKA 1HF6A 1XCXA 3VIMA 5C70A 4ZXOA 1CZ1A 1GNXA 3AHTA 2WMFA 2WANA 2PF0A 4RE4A 3RILA 2QPSA 1V3JA 3ARTA 3WNLA 1Q6CA 1JFHA 2EPLX 1E72M 2VOTA 1BTCA 4RE3A 7TAAA 1J0HA 2BY1A 1BYBA 3PZMA 1HIZA 4BCEA 2BS9A 1KBKA 2J7FA 4QCFA 3K4AA 3MO4A 1JZ2A 1GQKA 1MW3A 2J7EA 2ZX7A 4J27A 4D1JA 4W7VA 4M81A 2BHUA 3UG5A 1TVNA 3BSHA 1EOKA 4M56A 3TTOA 3T2OA 1DHKA 1W3LA 1KXHA 3CMGA 3WNKA 4V28A 1DWFM 5I24A 2XWDA 1BYAA 1DWIM 2ZXDA 1E5JA 2NSXA 2V3GA 1HL8A 2PC8A 3WUEA 5D9PA 2V3FA 3PZNA 4TTUA 2WSKA 4UR9A 1FOBA 4HPHA 2D22A 3AZRA 4AEFA 4A3YA 5DEZA 1LQ0A 2WW5A 1AQHA 3L4WA 4DWSC 1G9HA 1UD6A 4XV0A 2YJQA 4PMOA 3AXIA 4CCEA 4MJ2A 4Z2GA 4M82A 1MYRA 2CEQA 2QHAA 3OIHA 3UETA 2AMGA 4MDOA 2AOSA 2WMGA 2PB1A 2D0GA 1V6XA 5CSUA 1HKMA 3CUJA 4A4AA 1UR0A 2ZX6A 5HOSA 1C7TA 1B2YA 1JZ5A 2VX5A 1FHLA 5F7UA 1OIMA 4P7OA 4H2CA 2WVTA 1OGGA 3SCOA 1C91A 3WF4A 3GNPA 2X05A 3WH6A 3NSNA 5IFPA 3OB8A 3PZOA 5A95A 2VI0A 2ZXQA 4TX8A 1JZ8A 2DSVA 2UY2A 2A3BA 2D2OA 2Y24A 3L4XA 1NM9A 1V0MA 1DTUA 4R5EA 3VIOA 2DT2A 2WHLA 4DUWA 2XVKA 4FLSA 5GNXA 2VRJA 4PUDA 2GSJA 2CIPA 3LMYA 4LX4A 2W63A 3W37A 2VURA 3ARYA 1CPUA 1XSIA 4ZENA 5CJ5A 3NDZA 4B16A 1UKTA 3AS2A 3U5YA 5A6KA 4MNKA 5JBDA 3AS0A 4B15A 1W2PA 4HP5A 5D8WA 2DH2A 1DWGM 5M3WA 2D23A 3SCNA 5BROA 4H7VA 3QR3A 3VGGA 3ARUA 3APGA 3W27A 2G41A 4GZEA 2XYLA 1WDRA 1OIFA 1BVZA 1W1VA 2WB5A 2QPUA 4WKHA 1PPIA 1UR1A 5AYIA 1PBGA 3WQ6A 2BY0A 4U2ZA 1ZS2A 8CGTA 1UWSA 2OYKA 4Q22A 4GZJA 1V03A 5A8OA 1XCWA 1VB9A 1HJWA 2XGIA 1ODZA 4L4PA 3WQ8A 3VD9A 1HVQA 3K46A 2VZOA 5FOOA 2W5FA 4AIOA 4Z2IA 3GZAA 2G3MA 4HOWA 3AIBA 2FDMA 4JIEA 1LG1A 1KXVA 2GJRA 2W91A 3WUBA 3EDFA 4FLRA 4MB4A 1JDDA 3VMPA 1MXDA 4D6HA 3AIUA 3EMCA 4GI8A 3AIEA 4OKDA 4WKFA 2DSUA 3OGRA 5A8MA 2NW0A 3N04A 3AMCA 3ZJ8A 4PMYA 3RMEA 3W38A 1ZBVA 2GDVA 4Z2LA 2YDSA 1B3VA 5HPCA 1MW2A 4OOZA 1N82A 2WYSA 1HL9A 3OGSA 4AXNA 1JYNA 1H5VA 1BQCA 5KEZA 2DPEA 4MPKA 4UQCA 2ZUTA 2PWDA 3WD0A 3ZJ7A 5HXMA 3EDKA 4EKJA 4GPNA 1VJZA 4Z2HA 2A3CA 3AROA 4C7FA 2CXGA 4AZIA 1XC6A 3WDRA 3WH5A 1QNRA 1WZLA 4ACYA 1OGSA 5JUVA 5DT5A 4JFUA 4E8DA 1QVBA 1EO5A 2PWEA 4CN4A 4P8VA 4D6EA 5I0DA 5ECUA 2WLZA 1B30A 3I3EA 2C8NA 2GDUA 4HOZA 2BVDA 3CLWA 3KZSA 4PTVA 3S6TA 2VUYA 2CNCA 1KR0A 3W81A 4S3JA 2W67A 5JBFA 1R85A 2VVNA 3T0DA 3VO0A 2D49A 3ALFA 1OD8A 1NOWA 3UR8A 3WIJA 3K8MA 4CD6A 4JKLA 1L8NA 2FGLA 2VO5A 1ZB5A 2GJPA 2G3IA 1O6IA 1E3XA 4M8UA 2JIWA 3KE0A 3AFBA 3G6MA 1XV8A 4XZWA 4WJXA 5A6MA 3PTKA 3CHEA 4H8HA 3VDHA 3NJ3A 1E73M 4N0RA 5E6YA 1GVYA 3B9AA 2O9RA 1UD2A 1H4PA 4ZEPA 3ARQA 8A3HA 4W86A 3I3DA 2ZIDA 3KL0A 2VJXA 4ZE5A 1JI1A 3CGTA 2O9OA 4LQ1A 4PSPA 1GOQA 2BFGA 2GK1B 5A6SA 1JL8A 1UQZA 3VDBA 1JD9A 5E6ZA 2X8RA 4L4OA 1B3ZA 1CGXA 3KEHA 4W89A 3IANA 1WDQA 1OM0A 1ZJBA 2CCRA 1FH7A 1B0IA 4LYPA 3WH9A 1HKKA 1UZ4A 4KGJA 1D2KA 2WMJA 2J74A 2WKGA 3AHYA 4GO9A 3LPFA 2RGMA 2ZUWA 3MUIA 4UOQA 2GK1A 1VBUA 5A8NA 2VTFA 1NWUA 2CBIA 4DM1A 3THCA 1A47A 4AZ6A 1KGWA 4BQ4A 1V3IA 1K9TA 1WNOA 5DT7A 3EDDA 1MFUA 3PTQA 3FAXA 1PIGA 2WZIA 4FK9A 2G3NA 3MSDA 4U31A 1LL6A 1AVAA 3AMGA 2J75A 4W84A 2PWFA 3ZSSA 3WQ5A 3AYSA 3VIJA 3ZT5A 3POHA 1K9EA 1OB0A 1BLIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2OO0 A;  1MFV A;  1FHD A;  1UB3 A;  2POZ A;  1RVK A;  3GYC A;  5F2M A;  3HIJ A;  3DFY A;  3FYY A;  4MIM A;  2QUT A;  4B9Z A;  1NWS A;  4NRR A;  5ABG A;  3OA3 A;  2X1T A;  4UQ9 A;  1Q45 A;  3OVQ A;  5EBA A;  1XDJ A;  4FSA A;  5C71 A;  4A21 A;  3VX0 A;  3R11 A;  3V1P A;  4HNU A;  5FAJ A;  4QDM A;  3R0D A;  4XD4 A;  4HTB A;  2M08 A;  3CGN A;  1IZK A;  1UUQ A;  3E2S A;  2FHB A;  4F9J A;  3KWS A;  1P7T A;  3W6L A;  5LSM A;  3FKK A;  1P6B A;  2WO5 A;  4OJ5 A;  2EQD A;  4FS9 A;  1KM6 A;  4PL2 A;  1VGA A;  2D2H A;  3STF A;  1W1Z A;  3WK1 A;  3GX9 A;  4Q7N A;  3BUR A;  3VOJ A;  2OLA A;  3AQU A;  1AFS A;  2ETN A;  1VPY A;  3PC0 A;  4R7W A;  5KMY A;  3ZVH A;  3E3H A;  3CL7 A;  1JYV A;  2NSO A;  4PMV A;  2D1Z A;  3U57 A;  2QKF A;  3SCP A;  3W2U A;  4GY0 A;  3EOS A;  1E5N A;  4B2D A;  4F9D A;  1AA1 B;  4QIB A;  4IBB A;  1WKD A;  4JXC A;  2ZQS A;  1XG4 A;  1VKF A;  2VEL A;  2Y7D A;  3AML A;  4E2B A;  3RR1 A;  3UNT A;  2JBM A;  5CC6 A;  3JR2 A;  3RIT A;  1M03 A;  2ZRZ A;  1CGT A;  1QDS A;  4C6I A;  3V3W A;  1W1T A;  3GS6 A;  1HKV A;  3W70 A;  4MKS A;  4OBT A;  4R53 A;  3A3W A;  4I9M A;  3DXI A;  4S2B A;  3HQN A;  4LPC A;  3WK0 A;  1J4E A;  3HBL A;  3SJ3 A;  1QHP A;  1EJX C;  3JVA A;  3STE A;  4AD2 A;  2DP3 A;  4NAF B;  4MNJ A;  5C55 A;  3DGB A;  1ZGD A;  4F4R A;  4NZ5 A;  3R6I A;  3QLL A;  4A2R A;  1QFE A;  4GK8 A;  3FSU A;  4O1F A;  4ZOC A;  4UCF A;  2NV9 A;  2XIO A;  2FJU B;  3WDJ A;  4ZBC A;  3HG4 A;  5CPT A;  3F7J A;  4JD4 A;  1TWS A;  2Z2B A;  3OG2 A;  4AIE A;  3RRA A;  4IMG A;  3PZ9 A;  3SUR A;  2YXG A;  4QLK A;  2Y7G A;  4C6N A;  1J0K A;  4DJE C;  3OVP A;  5HWJ A;  4TNS A;  2QW5 A;  1UKO A;  2PN0 A;  1CB2 A;  3LHU A;  4XD5 A;  2W62 A;  2C13 A;  2IQ0 A;  4HZM A;  1V3K A;  1LBM A;  1Y7V A;  1AQF A;  3NSM A;  3MS8 A;  1X7I A;  1DID A;  5E0F A;  1QNQ A;  3RPD A;  2AL1 A;  1LDC A;  1L9W A;  2E5C A;  4GI4 A;  2V5B A;  1KRM A;  4GVI A;  3N2B A;  4Z2K A;  4DJF A;  2OVL A;  1KFW A;  1B54 A;  1EJ7 L;  3NZP A;  4H6Q A;  3E0L A;  2ZZ4 A;  5FD0 A;  2EPN A;  1WA3 A;  1TE1 A;  4GME A;  2WM0 A;  1KD0 A;  3PRD A;  1DVJ A;  3M16 A;  3N9K A;  1PDC A;  1P0K A;  1RBL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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