2GUU | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	332
structure length	317
Chain Sequence	LKIKLQKRRDEVNTCLCIGLDPDEADIKSFMQSEKQNGYQSVKKNLSNSGELFAPQMGGQMLLAETPPKEAQEKDEFFYFFNHFCFYIINETKEYALAYKMNFAFYLPYGSLGVDVLKNVFDYLHHLNVPTILDIKMNDIGNTVKHYRKFIFDYLRSDSCTANIYMGTQMLRDICLDCKRYYSTFVLVKTTNADSHIFQNRLSLDGKEAYVVIAEEAQKMAKQLHLEENGEFVGFVVGANCYDEIKKIRELFPDCYILAPGVGAQKGDLRKMLCNGYSKNYEKVLINVGRAITKSGSPQQAAREYHQQIKEVLAELQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Structural genomics, unknown function
molecule keywords	ODcase
publication title	Crystal structure of Plasmodium vivax orotidine 5-monophosphate decarboxylase with 6-aza-UMP bound rcsb
source organism	Plasmodium vivax
total genus	126
structure length	317
sequence length	332
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-05-01

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2guuA00

1TRDA 3IIZA 4JYDA 3DHDA 5KITA 1M6JA 2GVLA 4CNOA 3HG3A 3UNDA 1ONRA 5D33A 1GZGA 3MBDA 1TTIA 4O14A 4B5NA 1O60A 4M19A 3T44A 2ZZ6A 2X1TA 4WX2A 2DZTA 2EAWA 1S5TA 2ZTKA 4JD4A 1WAUA 4UCGA 2ZZ3A 3STFA 3C2VA 4HT3A 3RLVA 2Y7EA 4JTJA 1XC4A 1BWKA 4EIVA 5DELA 1OYAA 4NNAA 5DY2A 2R14A 4M7TA 1JCNA 4AVFA 4M6QA 4AF0A 2NZLA 3ABSA 1O5KA 3F4WA 3TCEA 1QCWA 3LM7A 4AXKA 3CTLA 2NWRA 2FJKA 3GK0A 3NQCA 1YLVA 4NJJA 3W23A 3C2FA 2V9DA 3EWUA 4Z1DA 4UFIA 3GDTA 4ORIA 2EHHA 4UNKA 2VEMA 1JCLA 1XDMA 3SW6A 1FQ0A 3G1VA 5K9CA 2ZZ7A 1OFEA 1PL9A 1NSJA 1SO6A 3HBLA 1EX5A 3NYZA 6ALDA 4O50A 1LZOA 1FDJA 1QOQA 4CNPA 2OMAA 2JKAA 4NXKA 1HUVA 3IEBA 3U8GA 1VLIA 3QMTA 2V30A 4YCPA 1QOPA 1FWWA 2CU0A 4DXVA 2V8ZA 4MZ8A 4N2YA 4IGHA 2E77A 3JR2A 2YZRA 5BW6A 1BWLA 2ZRWA 4LVFA 3TFXA 1AG1O 2DJLA 3KVLA 2A7NA 2Q3RA 3B04A 2HTMA 3P62A 1XCFA 3GAKA 2HMCA 2BLEA 3DI0A 3G1XA 1K02A 1DKWA 1WYIA 2VFEA 2BXVA 4AHQA 5DLCA 1KM0A 3E9AA 3G1YA 5KZDA 5E93A 4IUOA 3E12A 4P2VA 4JX4A 4L4LA 2CLLA 2ZFAA 1OX5A 5I3FA 2FB2A 1Q6LA 1A53A 1ZY9A 3EX3A 1K7EA 2TYSA 3PBUA 1W3NA 1WBHA 3VKJA 4MOZA 3RFAA 2X16A 1B9BA 1UJPA 1G69A 4O16A 5FF3A 3W1TA 2I1OA 1H7RA 2QCNA 3A23A 3I7SA 1Q6OA 4XTDA 1ZHAA 3M47A 1AL8A 4H4IA 3G3DA 3HPZA 1WQ5A 1Z42A 3LRKA 4ZQPA 1FDYA 2BWGA 3O06A 2Q3OA 3W3OA 1GYLA 3QSRA 4FNUA 1NF0A 1J5TA 5E1QA 5HUPA 5I3HA 4CCEA 4ZL1A 3W2KA 3ATZA 4XUGA 3G1FA 4EF8A 4UTHA 1TREA 3NL5A 2Y6ZA 3TSDA 4QISA 3GAYA 4M5PA 2FLIA 4UFLA 1D9EA 1QNVA 4O1DA 5KZEA 4UTUA 3LI0A 3QC3A 4OWGA 4UUIA 5KINA 3OG3A 3CEUA 1WV2A 2HS8A 5LNVA 3A5VA 3SGUA 2WJZA 2ATSA 3P7YA 3OVRA 4Q33A 2H6RA 3CQ0A 2DJXA 4RCXA 1OX4A 5H91A 2P0OA 1T99A 2J27A 2B7PA 5D04C 3W07A 3S1UA 1TYGA 5EPDA 1BKSA 2VKZG 3JS3A 1V7YA 1GJPA 4A29A 3E02A 2PCQA 5C55A 1AW2A 1TV5A 3L9CA 5D38A 3HGJA 4LNYA 3DH7A 3MO7A 1T96A 2QCDA 1XDLA 1PE1A 4KWVA 3WFAA 2YFOA 4ZZ9A 3B4UA 3UQNA 3G18A 3P8JA 4UTWA 5DY3A 3W9ZA 7TIMA 1KTCA 3PG8A 1K7FA 1R2RA 1B4EA 4QSHA 1KM5A 2GPTA 3LV5A 4H6KA 4LRSA 1SPQA 4OBTA 1JJKA 2CLKA 2QUVA 3Q94A 4O53A 2RH9A 3W7IA 2Y88A 4CCCA 1H7WA 3VCRA 3VE9A 1EIXA 1FCUA 3PUOA 3IIVA 3TXVA 1QPNA 3C2RA 3GR7A 3R12A 3R2GA 3WJXA 1VPXA 3W88A 4K39A 4LWWA 1K8YA 2XFWA 1NVMA 2V2CA 4IOTA 1AK5A 4NJHA 1GTHA 1W3TA 1NF7A 3M43A 3W6YA 4TIMA 1GPWA 2HSAA 5AHEA 4PC8A 1G4PA 1JQVA 1SZFA 4CQ9A 2NXHA 1DORA 4WUIA 2WSRA 1F74A 1XM3A 1VH7A 2VELA 3LLFA 2CWNA 3SR7A 3OEXA 3VE7A 4CCDA 4GJ1A 1G4SA 3IGXA 3LCXA 5IM51 2H8ZA 1K3UA 4MYAA 3EWZA 3NQ2A 3NQEA 1N55A 5CSSA 4N4PA 3TAOA 4W9TA 3W7HA 3TC6A 3B03A 3M1ZA 4ICNA 2BX7A 1IXOA 1FX6A 2JKEA 4TX9A 1TJRA 1ZNNA 4Z1BA 1JCYA 3GKFA 4IXXA 2XN0A 2C19A 3W1RA 3DGRA 4JDYA 3P5YA 2RKXA 5CPMA 3AO0A 2NXIA 1N8FA 1TPUA 5D03A 3LTSA 1C9DA 1IIHA 1SU5A 1TPC1 3LBMA 4TU1A 2R8WA 3CEPA 2KZHA 1VYPX 5G2WA 3S0CA 4O18A 1A5CA 3PSVA 3GXTA 3A5FA 4Q32A 4WY0F 1LOQA 2VFGA 1Z48A 1G67A 3UY7A 2ISVA 2CFFA 4FF7A 3FJ6A 4O28A 2PRLA 3LHVA 5HUOA 4QQ3A 1W1ZA 1ML1A 1L6SA 2A85A 4XZ9A 1J4EA 3OIXA 1YTDA 1JULA 2CZDA 2JGYA 3P5ZA 4JYEA 3W2LA 3THQA 3MI6A 4NZFA 4O4VA 4QIUA 1OF6A 4UNLA 1TJPA 2FDSA 3G1DA 3IIXA 5IBXA 3PB0A 1R46A 4BWLA 5G1YA 1L6WA 1XXXA 1ZAJA 4IPJA 3TAKA 1C29A 2NX9A 4QNEA 1GT8A 1JVNA 2A4AA 5U4NA 5I3KA 1H1ZA 3EEGA 2C1HA 1LRNA 4OV9A 4ZQCA 4WY0B 2QEZA 4MKNA 3QSTA 4I7UA 5AOUA 3W83A 5HINA 5HWNA 1TIMA 2GUUA 3SY5A 3OA3A 3FLUA 4AWTA 3ZFHA 3CIXA 3NQ7A 1XFBA 3E96A 3L0NA 3EWXA 3B0VC 2QCGA 2ZCGA 4AB4A 4RLIA 4UFMA 2NUWA 4CQ8A 2ISWA 3O6YX 4QNWA 4N9BA 3GLCA 1G7VA 4O15A 4K36A 2B7OA 1UUMA 3C0JA 2G97A 5TQLA 1IXPA 4U28A 2VC6A 3RK8A 3LTYA 1QR7A 5C54A 3N19B 1RV8A 3HGRA 3LERA 2I9EA 2LLEA 3TK7A 3DFQA 4K8EA 2DU2A 3LXCA 1QMLA 2YYUA 1FCQA 3H54A 3O1NA 3ZR4A 2OT0A 4JEQA 8TIMA 1KLYA 2NXGA 4JNMA 5FEPA 3DBPA 4LW7A 4PH6A 1I8JA 1KM2A 4HNNA 2A5HA 2ZRYA 2CZFA 2AQWA 2J9YA 2GOUA 1QDSA 2DZXA 1W0MA 1M7OA 3W22A 4OQVA 3DAQA 2B4GA 4C1LA 5LNWA 4CLMA 3QFEA 1OF8A 2QJHA 1FXQA 3KRUA 4KFNA 5AC7A 3L0KA 3S5ZA 3NR0A 5DBTA 3WK1A 4YL2A 3NQDA 4JTEA 5CZSA 1SO3A 4FHAA 1TQJA 1GWJA 5D2TA 2GQ9A 3OHIA 1DV7A 4PA8A 2CLFA 1KM3A 3NPVA 3TW7A 4NJIA 4Z1AA 1QWGA 3PS7A 2Z1BA 1T0OA 1IF2A 3IGSA 2WO5A 5LGXA 3DU0A 3QQ0A 3ABQA 1HO1A 1O4UA 1XUUA 3LHZA 5I3GA 4Z1CA 1H7XA 1L6YA 3FKRA 4A22A 4ZQOA 5CPNA 4LV9A 3T7VA 4JXCA 1U5JA 5K4ZA 3N3MA 1JUEA 4JIPA 2A2IA 3INPA 5E0KA 1OFQA 2F84A 3UWWA 1FDZA 5D30A 1P5BA 4DELA 5DN1A 2NWSA 5BOOA 3CU2A 4R34A 1H51A 2ZZ1A 3ELFA 6TIMA 3TNOA 5D2YA 4JTFA 5KTLA 4JTKA 1DQXA 4C1KA 4MZYA 5CG7A 3MI3A 4LUIA 2YGYA 3G3MA 3KVMA 4O12A 1SZGA 4GUHA 3M16A 1GG0A 3FKKA 1PCWA 3IIPA 4O10A 3NQMA 1GG1A 3FOKA 4JTLA 4K6AA 4OE7A 1X8FA 3DFOA 5D09A 4M7SA 4FNTA 4NX0A 4XTIA 1VHCA 4UC5A 2E5CA 2Z6JA 1KLZA 2YPIA 2YFNA 3B05A 4LC8A 5FEXA 5DBUA 2JGQA 2OCZA 4O4WA 3WK0A 3FYPA 1VHNA 3G1HA 3UYCA 3FS2A 3W2UA 4Z0JA 3ZWSA 3NQVA 1DVJA 1K8XA 1VGAA 5G1TA 1LLWA 4UTWC 3MHFA 2Q8ZA 4PEKA 1RVGA 5DXYA 3SFKA 3DI1A 3RU6A 3P61A 5CSRA 3FA5A 3W2NA 1M5WA 3I65A 3E0IA 1TPEA 4A2RA 4ONVA 3HQ1A 4HPJA 4HHPA 3PVFA 4X2RA 4O1AA 1KFLA 4KKXA 4WY0A 5F1UA 4HIBA 4UTIA 1ZAIA 2O7SA 3QMRA 2WNQA 4WXYA 4MFDA 3KX6A 2B0MA 3PSWA 4WXZA 1G6CA 4RXFA 4FX8A 4IWWA 4U4MA 1L2UA 1OHLA 3IVTA 5H2ZA 3NPWA 4O17A 1W8SA 1H50A 4JY9A 3GKAA 1F05A 4CQAA 1ZJIA 5D02A 2ZDRA 3G0SA 3LHWA 3QM3A 3TUUA 3GZ3A 4GUIA 2QJGA 1R2SA 5AB3A 2DZSA 3SIZA 3GNNA 3O6DA 5EY5A 4LVDA 4UTLA 1TPH1 1ZAHA 2TSYA 1I45A 1ME9A 3VFLA 1Y0EA 2OT1A 4DPPA 3W7KA 4NJGA 4JTTA 1H7OA 1SO4A 1G4EA 2G5WA 4FNQA 2V82A 3C8FA 1YXCA 2WOQA 4L4MA 1DOSA 3LCHA 2TRSA 1K7XA 3QW3A 1DJQA 1DHPA 3WK3A 4PFMA 2QDHA 4UTJA 3TR2A 4BK9A 4DEFA 1OJXA 4JTUA 3BGJA 3LGEA 1GEQA 2ZA3A 5F2LA 4O57A 2PRMA 3I7RA 4XBSA 3EB2A 3IGUA 1D3HA 3UD6A 3CIWA 5LNRA 1FWSA 2A6NA 3T55A 3MP5A 3C3NA 1D3GA 3GIYA 3MMTA 4MLRA 1FWRA 3M6YA 1EWEA 3G1AA 3S5NA 1HO4A 4K37A 4LV4A 2J88A 1RQBA 1ICSA 4JIQA 5D37A 3UZ5A 4IMDA 2V2HA 1JR1A 3EWBX 2QCHA 1PVNA 4I7WA 1H7NA 1OFOA 1FBAA 3MUXA 3R89A 3L5AA 4N6FA 3UWZA 3BG5A 2QJIA 3DFSA 3RLUA 4I7VA 2PURA 4JTSA 4NVTA 1PCKA 5FESA 4YLWA 2GJNA 2G95A 1NFBA 3HGOA 1Q3NA 3W7DA 4ZQRA 1OK6A 1KV8A 4S2BA 1SSGA 2V0TA 3N2XA 4E2BA 5F1VA 1VCGA 2QF7A 3GDMA 1ZENA 2WNZA 4UMCA 2WSYA 2NV1A 3NAVA 4MLJA 3W73A 3HGSA 2C6QA 4JDBA 4DF1A 2QCCA 3LCIA 4FIRA 3W2MA 1B3OA 1XBZA 3W1MA 2HS6A 3UXAA 2QCMA 2J6XA 2AAMA 5HWMA 1EUAA 3KFTA 1QAPA 3TC7A 3DXIA 5F4XA 4LU0A 2YX0A 5F4SA 2VEIA 4WQ6A 4UR8A 4Y8FA 3W7NA 4DO4A 2FQIA 1KTBA 1QPQA 4LC6A 2ZA1A 1JUBA 4AH7A 1I2PA 4UIOA 3WK2A 3P8IA 1S5VA 2OZ0A 2A6LA 2VEPA 1F6PA 1TRIA 3KVJA 4LS2A 4QJ1A 3LHYA 4HNTA 3M5VA 2ATMA 4XQ6A 3PR2A 1XBXA 4N9CA 3IIOA 5HR7A 3U2OA 5I3IA 3S1WA 1XKYA 1F73A 4DBDA 3S42A 1QPOA 1LLZA 5FF4A 2NUYA 4LVBA 4ZVJA 3QZEA 4AWSA 1YXDA 5K3VA 4MY8A 4FIQA 1Z41A 3STGA 1HTIA 4IJBA 2VENA 5FI8A 4DF2A 2FFCA 2UV8G 3DFPA 3TXZA 3EXRA 3I7QA 5EMUA 1XBYA 4HSNA 3W72A 2YW4A 3NG3A 3P60A 5G4EA 4DBEA 2RDTA 1UASA 3I68A 5C5YA 4HSOA 4PL2A 1ICQA 2NV2A 3W7MA 2GVJA 3PBYA 4A21A 2NLIA 2W79A 3TDFA 5CPOA 1KTNA 4NU7A 3D0CA 3PWAA 5ABTA 1O5XA 4AEOA 3M5YA 5DCDA 2PE4A 5AC8A 3BG3A 4NJKA 1F2JA 5D2WA 3CHVA 5K9DA 1VS1A 3W1XA 4AAJA 1P0KA 5HWJA 3M5ZA 2E5BA 3V1PA 2EKCA 3KVKA 3MYOA 4NQ1A 4JYFA 2X1RA 1YPFA 1FWNA 2H3DA 2C16A 3LXAA 2CLMA 3CC1A 2YCEA 3O6CA 3U6WA 1A5AA 1EP1A 2WNNA 4ADSA 1WOBA 1SUXA 2Y63A 1H1YA 3MP4A 4UFHA 1YDNA 1O94A 2ZRZA 5CZTA 4PTNA 1AW1A 1A50A 3WJYA 1SO5A 3YPIA 3F03K 4LS1A 4N9EA 5CPLA 1TMHA 4POCA 1BEUA 2Z6IA 3KHJA 1ZALA 1QO2A 3OVPA 5HJLA 2Q8LA 2WPBA 1VCVA 1I4NA 2XN1A 4NZJA 1YPIA 3BW4A 1MXSA 1W5PA 4AWUA 4FB7A 3HG5A 1ME8A 1HFBA 3CM4A 3PUEA 3L68A 1GOXA 3JRKA 4Q4KA 2GJLA 3PG9A 4MIMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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