3SIZA

Crystal structure of the mutant s127a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMAHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant S127A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 84
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3sizA00
2QUVA 3LERA 2CLMA 3AO0A 3R2GA 2E68A 5HUOA 3BW3A 1I2QA 5AHLA 3LHTA 2A6NA 2NLIA 3RMJA 3OVPA 4OV9A 2ZRUA 3UZJA 3EKZA 3EWXA 1IXPA 4GUHA 1W54A 3I65A 5FF4A 1DBTA 3G8RA 4QISA 5I3IA 5K7JA 4P61A 4A29A 1UJPA 4DF2A 1RZMA 3DAQA 2ABAA 2C15A 1OVDA 2IQTA 3LCXA 1QPRA 3IGSA 3NOEA 5FEXA 5LGXA 2WOQA 2ZRXA 2A7RA 3DZ1A 4R53A 3P60A 3SI9A 3A23A 1ME8A 5KTLA 4LVBA 2CZDA 1SSGA 2Z0IA 4IWWA 1FWNA 1YLVA 1KFEA 1DJNA 1ZHAA 4UIOA 3S5NA 1EP1A 1QR7A 2QEZA 3PSVA 4JTSA 5BW6A 3TMLA 1R2TA 4UFMA 3PB0A 2Z6JA 4FF7A 3A9IA 1JVNA 5T26A 2GPTA 2X1RA 5I3KA 3G1SA 3CWNA 3N9RA 3LBCA 2OMAA 1GVRA 5CG7A 2A4AA 2E5CA 5LGZA 4ZQOA 2A7NA 3MP5A 1VYSX 1SPQA 4FB7A 1I45A 1LRNA 4XBKA 3BG3A 4E2BA 1HFBA 3W73A 2C18A 3THAA 1VC4A 3RK8A 4EWND 3G1XA 2O7SA 2QCFA 2VELA 4OV4A 3L5MA 3H53A 1TPWA 4QSHA 2LLEA 1EPXA 3CEPA 4JYFA 4HNUA 3GNDA 4HSOA 4O18A 5CZJA 1XUZA 4Z08A 4ALDA 3E96A 4BI7A 3OG3A 4JTHA 3W07A 2OCZA 3C4UA 4YLWA 2QDGA 3W23A 3M0ZA 3NXFA 3NZ1A 4JICA 1FCUA 2ALDA 2V82A 1M7PA 3W1NA 3N19B 3S8HA 4E38A 4AEOA 1EA0A 3QMSA 4XZ9A 3BK0A 3CQ0A 1X7FA 2J9YA 5LHEA 2NXIA 4AWTA 1Q6OA 1J2WA 4X2RA 1N55A 5EY5A 4HNTA 5AHNA 1SZEA 3LOTA 3ATYA 3MI2A 3W1UA 1SO3A 1OJXA 3Q37A 2Y88A 3Q94A 5D05A 3E12A 1AW1A 4QQ3A 4FX6M 4O0ZA 2H8XA 3IIVA 3LXCA 2YGYA 1ME9A 3MHGA 4AF0A 5I3JA 5D2WA 1JULA 2EGZA 3QQ0A 1DQWA 1O95A 3NO5A 4O57A 5BNKA 1F6PA 1SU5A 4YWIA 1A5BA 5EL1A 3NEVA 2E6DA 4ZQMA 2JKPA 3QMRA 4UNKA 4UTJA 2V5LA 1QO5A 1OYAA 3TIMA 4OBTA 2QJHA 5HUPA 4XKYB 3NVTA 1FY6A 5DELA 1ZALA 3NQFA 1YTEA 3EX4A 1UCWA 1PV8A 1OFDA 5G4EA 1W5MA 4UR7A 3A22A 1KV8A 3VNDA 1YPFA 4DO4A 2ISSA 3WFAA 3GIYA 3MW7A 1OX4B 2JBMA 5G2WA 5DN1A 3MI6A 3G18A 3OEXA 4FEZA 1OYBA 3BGJA 2GQ9A 1TRDA 4CCCA 4A3UA 1XBYA 4NJJA 3ABOA 4RLIA 1W56A 1IXQA 2ZQ0A 5HWMA 1VR6A 5KZDA 5AB3A 3R5EA 1OF6A 5DBTA 4YMZA 3HPZA 3W7DA 4NJIA 1OHLA 5CPNA 4BFAA 2WSRA 1GTEA 2CU0A 3GNNA 3M7WA 1TV7A 3V75A 5LNWA 3M44A 5AC8A 4WOZA 1HL2A 5CZ0A 3BLIA 2A5HA 1YADA 1Q45A 1KM1A 5AN7A 4MFDA 3SFKA 3FOKA 3NPXA 4CQ8A 1OK4A 3W7HA 2QJIA 3LHYA 4WUIA 3I6RA 3CC1A 3LHVA 4NU7A 4UTLA 1LRQA 3W2LA 4HIBA 3DI0A 3GDRA 4HPXA 3TQ0A 4O11A 3STFA 1VJIA 4ZZ9A 3NL6A 3KHJA 4N9CA 3A5VA 1H50A 4WJEA 3MYPA 1K8XA 1LOLA 3TSMA 2ZRVA 2ZA1A 1B3OA 3EWWA 2HMCA 4N9EA 3P7YA 2I1OA 2FPYA 2QAPA 3HO8A 1L6YA 5FI8A 3GX9A 5CKSA 1C8VA 1GYLA 2VOMA 2ISWA 1PHQA 4UTWA 3T44A 4N2YA 3W1XA 2GVLA 3DBPA 3PUDA 2VEKA 3WK0A 4W9TA 4MLJA 1OFPA 4ORMA 4UTWC 1EIXA 1JQXA 1KTBA 5DBUA 1G4SA 1I8JA 4JS3A 4Z1DA 3S0CA 3NZRA 4NJKA 1H7PA 2R94A 4E2DA 5HJLA 1TPDA 3HQ1A 3AJXA 3QYQA 3O16A 1VCGA 5LNUA 2FTPA 1RR2A 2Y61A 1XL9A 3C56A 3G22A 3P61A 5TQLA 5A5WA 5SWUA 4HKPA 3G0UA 1LBMA 2P10A 2PC4A 1TV5A 1M5WA 3T7VA 4O15A 5FF3A 2GQAA 4ZVJA 2CLEA 4AB4A 4QITA 3NA8A 1F5ZA 4D2JA 4JTLA 2FFCA 3TCEA 1LM1A 1VH7A 1KLYA 3L0GA 1H7RA 3FEMA 2PRLA 1TSIA 2YW4A 3S6DA 1JUKA 6TIMA 4MZ8A 4UMAA 1TPB1 3DFNA 3PR2A 1SZGA 3OA3A 4Z1CA 2WNZA 1H1YA 3TC6A 3B8DA 1SQ7A 3UWQA 4UTMA 3PC0A 5F2MA 3HJZA 1XCFA 4NZJA 2DZWA 3E02A 3N73A 3W1RA 5I3HA 4HPJA 1PCWA 4WD0A 1QOPA 1SR9A 2EHHA 5BMXA 4BWLC 1GQNA 1BKSA 2HS8A 4Y9AA 4O16A 4M7TA 5AC7A 1Q6RA 3W7QA 5D2VA 3HGRA 3HGSA 4ZQRA 3NL5A 3LCIA 4TR9A 1TJRA 2A1YA 1LROA 3W7CA 1VGAA 3W70A 3PVFA 3M6YA 3M1ZA 1SW3A 3MHFA 4OU1A 5CZTA 3HG5A 3EWYA 3CB8A 4WY0A 1PE1A 3TNOA 4GWEA 3L67A 1YTKA 4AXKA 2R91A 8TIMA 3C6CA 3SZ8A 3WJYA 3LV6A 2DZTA 1A5CA 1QPOA 3KRZA 2E5DA 5EPDA 1C9DA 4QM1A 5EMUA 2NX1A 4GUIA 4ADTA 4GUJA 3ZWSA 1P0KA 4S1FA 4LS2A 4O28A 5F4SA 3S5OA 3STCA 3S5ZA 4LS0A 2ATSA 3VCRA 4A2SA 1XM3A 1OF8A 1OFAA 1FQ0A 3OVQA 3W7NA 1W8SA 4UTUA 4LRSA 5H91A 4CNNA 2VFIA 5DLCA 1I2RA 4ADUA 1QCWA 3H55A 2C0AA 1RPXA 4AHOA 3BW4A 2Z6IA 4QNEA 4N4QA 4MOZA 2H3BA 4N6EA 3G1YA 3W88A 1YXYA 3LLDA 3G1AA 3OHIA 1VYPX 3EXRA 1BEUA 3VKJA 1FXPA 2WV8A 4M7SA 4O1DA 3SJ3A 4QJ1A 1D3HA 1HTIA 5AHEA 5HINA 3W83A 1P5BA 3C2VA 3HF3A 3UYCA 2B4GA 3BLFA 3INPA 5LNRA 1TTJA 2JKAA 2Z1BA 3EXSA 3GXPA 3HB9A 2CLKA 3SW6A 3W2NA 3YPIA 1K03A 2TSYA 3HIJA 3GDKA 3NL2A 3W1PA 1GOXA 5BOOA 3CM4A 1ZNNA 3C61A 5CPLA 1EWEA 1PIIA 3OIXA 2X1SA 3UNDA 3W7EA 3MP4A 5HULA 4JTFA 5LHFA 3UXAA 1M6JA 1DKWA 2ZZ7A 1XKYA 4O53A 2A2IA 4OQVA 2BXVA 1KV5A 2X30A 5HQEA 4O0KA 1HO1A 1GTHA 1CI1A 4E0CA 2VKZG 1JRCA 1GZGA 2Y62A 2BWGA 1U83A 3W1QA 3EKLA 3T4CA 4UFLA 4UTKA 3IV3A 2UV8G 3N3MA 3G1VA 1KFCA 3P8IA 3ZS4A 1N8FA 3L5LA 1IXOA 3IIOA 3TH6A 5TIMA 1W5NA 1H63A 1TB3A 5ABTA 3O1NA 4O10A 2B7QA 2J9ZA 4UTTA 2Y85A 3W87A 4Q33A 3DKLA 5K4XA 1HG3A 1H7WA 5D02A 3DXIA 2Y7FA 5E0KA 1QMLA 1KM3A 4X9SA 1FWTA 1TPUA 2Y7EA 5AHIA 2Y6ZA 4ADSA 4IGHA 1ZFJA 2NXHA 5CZSA 3MHUA 5I3GA 3NL3A 4IMGA 2YPIA 2A6LA 1S3HA 4FNRA 3GKAA 3B03A 3W7KA 1E51A 1LOQA 2ZFAA 2FB2A 2Y7GA 4QAIA 4JDYA 1V7YA 1VCFA 5D2XA 2RHGA 3DFOA 4K38A 5AC6A 1UBSA 2R8WA 4MZYA 3S9YA 2Y70A 2Y89A 4IQLA 2ZZ5A 4JTIA 1QPQA 4LWWA 3G24A 3DGRA 3KXQA 2V9DA 3N14A 1L2UA 5DY2A 3NQVA 4JYEA 2DJXA 4FIRA 2VEMA 4EF8A 4H4IA 3O6YX 4JNMA 3N2XA 3DHFA 3DHDA 4Y6GA 5F2LA 2QJGA 2VFGA 3W7IA 2ISVA 2QCHA 3O63A 1F6KA 3PSWA 3N2MA 3QF0A 3CU2A 1VS1A 3STGA 3QEZA 4XKYA 1VRDA 2ZZ3A 2H8ZA 3O06A 3G3MA 3LCFA 4ICNA 5DXYA 3EX1A 2H3DA 4JEQA 3LHZA 4JTKA 2CZEA 2NX3A 5F2IA 3TK7A 5MHBA 1DQXA 4JN6A 1H60A 1W5PA 3EX3A 1OX4A 4EOUA 4Z1AA 4NNCA 2QF7A 4UFHA 4MY8A 3PBYA 3EWZA 1XUUA 1WBHA 4Q4KA 4PL1A 4KFNA 3KVJA 4ML9A 4PTNA 3PM6A 4LOCA 1DL3A 2E6AA 3R89A 1K3UA 2YR1A 3DH7A 4K7VA 4LV4A 1TQXA 2ZRWA 3C2FA 2D73A 2A21A 1Z44A 1XFBA 3W9ZA 3PAJA 5KZMA 3FLUA 2VFHA 4HNVA 4RX0A 3FJLA 4RZ4A 3P5YA 2ZTJA 4ONVA 5KSWA 5HR7A 2QCLA 3LTSA 5D09A 4N9DA 2O7QA 2ZZ4A 5TBOA 4DEFA 3M41A 3PULA 2GJLA 4UTIA 4LU0A 1Z41A 1R2RA 2FB3A 4Y96A 3UWUA 1W3NA 1JCMP 2GVGA 3OVRA 5EYWA 3L2IA 3V1PA 3NQ2A 3WK3A 3QPYA 4UTHA 1G6CA 3TV8A 4JTGA 4RJEA 1OFRA 1H7OA 1A5SA 4XTDA 1IGSA 4JY9A 4LNYA 5LKYA 4PH6A 1V5XA 3ATZA 3GDMA 1KM4A 5FF2A 5AYYA 1AW5A 1EX5A 2FQIA 4TMBA 3L65A 4GNJA 1XBVA 1WDWA 2WO5A 4K36A 1SFLA 1OG0A 4NUWA 4POCA 1G67A 3MYOA 3LI0A 1FCQA 1WAUA 1OABA 4A2RA 4PCFA 1FDZA 5IBXA 5J5RA 1LP6A 3TFXA 1O5XA 1THFD 5IBXC 4O4VA 4IMDA 4O50A 1FWSA 3GB6A 1SO5A 3ABQA 3F03K 3S1XA 1ML1A 3R8RA 3LRMA 3LXAA 2P1FA 5HMSA 3M43A 3LRLA 3IVSA 4TX9A 3L68A 1VCVA 6ALDA 2F7FA 3P82A 1MXSA 3HOJA 4R33A 2W79A 3L5AA 3O6CA 4KWVA 4NZFA 1T99A 3W2UA 2RKXA 3C2OA 2YYTA 3UWZA 4YCPA 2JGQA 3P8JA 2OZ0A 5C2XA 1Q3NA 5D03A 1GJPA 2WQPA 3IEBA 1TMHA 1QAPA 3TAOA 3QC3A 4CCDA 4QNWA 1D3GA 1UUMA 1LLWA 3PY2A 4CLMA 1KBJA 2E5BA 4OGZA 4XBSA 3GDTA 3U6WA 3VE9A 1ZCOA 3S1UA 4ZMGA 4AH7A 2PRHA 1M7OA 5FEPA 3NQGA 3QW4B 3HG4A 1TPFA 1N7KA 4JR5A 4IUOA 1O94A 2XN1A 4I7WA 1R2SA 1KLZA 3QJAA 1KW1A 4JX6A 4YXGA 3NNTA 2JKEA 4K37A 3L0NA 3BO9A 4WY0F 1R46A 3M9YA 3L21A 4AHPA 3IIZA 4MYXA 3TW6A 5AFDA 4GUGA 5KITA 4BK9A 3NQ7A 4LRTA 5K2ZA 5EBUA 1YDNA 4NQ1A 3IGXA 1I2PA 2GQ8A 2QCDB 2YFOA 1W1ZA 1KM6A 3PB2A 2FDSA 4AWSA 3UQNA 1NSJA 2B0MA 1SFJA 4ZQNA 2GVJA 3W84A 2QCEA 4MUZA 3GAKA 1OK6A 3K30A 1WXJA 1B4KA 4PEKA 3PWAA 1ONRA 5FF0A 3HGOA 2YW3A 4DPQA 2G5WA 3KRUA 5C6MA 4LTSA 5F1VA 1JJKA 1GVFA 3W7OA 5F2GA 1I2NA 3W2KA 3CIXA 4XTIA 3WJWA 3DFQA 2NUYA 4JTJA 4AHQA 1PCKA 4LVDA 3N9SA 3R12A 4CQ9A 4HNNA 2CWNA 1GWJA 3B04A 1ZAJA 1FCBA 2W6RA 1O5KA 1OFQA 2RDUA 1OFOA 4JX5A 3TXVA 3RU6A 1WA3A 3MP3A 3BG5A 4PL2A 1BWLA 4JY8A 3L9CA 4AVFA 5H2ZA 2FIQA 3GXTA 2NZLA 1Q6LA 3S42A 4PODA 2C13A 4Z0JA 3C3NA 2E77A 2PCQA 4X22A 2C19A 1ZJIA 2X1UA 1O60A 3IVUA 3F4NA 2YCEA 2QCMA 1H51A 3ZR4A 3EB2A 1LORA 2DZSA 3TDFA 1K7EA 1TIMA 4FX8A 1KFLA 3LX9A 1X8FA 3IIPA 2WSYA 5E93A 3KVMA 5LNSA 3FKKA 4R7JA 5D33A 1RV8A 2W0UA 3DFTA 4O17A 2V30A 3CPRA 1F05A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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