4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
1E15A 3WDHA 3WD2A 2DDXA 2VT0A 4W5ZA 1C90A 1V3LA 2Y2WA 3AMDA 5CPSA 1W9PA 1WZLA 2YL8A 3VIHA 1W9XA 3AZRA 3SCSA 3WELA 4DWSA 4JFTA 3VDCA 2NSXA 4AD3A 1B9ZA 3BSGA 4BQ3A 1VBUA 2XJ7A 3FXYA 3IJ7A 3E1F1 4HA1A 2E3ZA 1JNEA 2D1ZA 4UFJA 3A4XA 4GI9A 1BVZA 2WC4A 3SCTA 3PZVA 4UFMA 2WANA 5I77A 3GM8A 1HJWA 3I3DA 4B3LA 4QP0A 5CLWA 3EBVA 1E72M 1R87A 3CUFA 3DC0A 3OZPA 2PBGA 1P6WA 3BCDA 5FKYA 2PWFA 1KQZA 4GO8A 2ZX6A 3GH4A 1A47A 4P8XA 1WE5A 1CPUA 2OYLA 3O6AA 3U5YA 3WH7A 3II1A 3KL5A 4W86A 3WUBA 3WH9A 2J78A 4DM1A 5JBFA 4F66A 5EMYA 5E09A 2BXYA 1TVNA 4GQQA 1GHRA 1B0IA 4XZWA 1J0IA 1QHOA 1EQPA 4CN1A 2XWDA 4W8LA 1OINA 1C7TA 1JGIA 3ZR6A 5A6LA 5A94A 1MW3A 1KXVA 5EBAA 4J3TA 2PC8A 4D6HA 3UR7A 3FAXA 2VZOA 1SR0A 3AQUA 4Z2IA 5A6AA 3ALGA 1XSJA 1E1FA 1PIGA 2QPUA 4OKDA 3PZMA 4PMRA 2IXVA 3QOKA 3MUAA 3RM9A 4CVWA 3GH7A 2BXZA 4JHZA 2FH6A 3CUHA 5A8OA 2Y24A 5HNNA 3VTRA 3VIGA 4UOQA 2WB5A 1SMAA 3WIJA 3MSGA 1UG6A 3LMYA 2D0FA 2X0HA 5LA1A 4NRRA 4AZIA 3RM8A 3WBAA 1ZS2A 1OWQA 1V0LA 3CTTA 3G6MA 4ZENA 1R7AA 4UQBA 2CXGA 1GOMA 1QI5A 2VR5A 2TAAA 3UEQA 3VDAA 4P7QA 3WD1A 3M6DA 5D9NA 1C93A 2J7GA 1W1YA 1HXJA 3VIJA 3VIKA 4Z2GA 1ZBWA 4CCEA 2A3AA 1KR1A 1B3XA 1LL7A 1C91A 4KRUA 1R7OA 2WNWA 3NDZA 4AMCA 1HF6A 4AWEA 3OLEA 1QI0A 3T0DA 1L0PA 1HJXA 4ACYA 4H41A 1ZJAA 1QNQA 3IK2A 3CZ8A 2WVUA 3PTKA 3T08A 4X9YA 4HTYA 5M5DA 2WW5A 5A8MA 1B3ZA 2XVPA 2BNJA 1QNOA 5HXMA 1IT0A 4CD5A 1VEPA 3BLPX 3WDIA 1JXJA 3N15A 2FHBA 3PBGA 1H5VA 1VJZA 4AD4A 3T09A 1E55A 1W1VA 4E8DA 3KL3A 3PTQA 3ARPA 3RILA 1TA3B 1MFUA 4ATLA 2X1IA 5HPOA 3AIEA 4PN2A 1EHNA 3SCRA 1UUQA 1DWHM 1Q6DA 2UY3A 1W9UA 2E9MA 3MMWA 1UZ4A 2WWDA 3W28A 5LYRA 2GDVA 4WIWA 3W37A 3VGBA 4DUXA 4D6CA 3NUKA 1X6LA 2CPUA 3MMUA 4FMVA 1D2KA 1PPIA 5CQ1A 2A3BA 1JAKA 4BF7A 4UCFA 1UR0A 2BVDA 3BAIA 2OWCA 1BFNA 4WSKA 4N42A 3VNYA 2PB1A 1KXQA 4U2ZA 2CBJA 2WHMA 3EDEA 1U33A 4B9ZA 4W7UA 5DMYA 1WNOA 4AD2A 2WMKA 4Z2LA 1H2JA 2WAGA 3UESA 3B9AA 1VFMA 5D9MA 2D2OA 1E70M 2XM2A 1V3MA 2DT3A 5BRQA 4AC1X 2CEQA 3ZJ7A 1DEDA 1BLIA 3VIFA 3SCUA 1V6VA 4AZGA 5C70A 2BVYA 4W89A 1ZB5A 4GPNA 2XSAA 4AIEA 4JL1A 1UKOA 2O92A 2BHYA 2Y8KA 4D71A 1HP4A 2EPMX 3F5KA 5CGTA 1EHAA 1HX0A 1B90A 4MNKA 4LGXA 5DF0A 2CBUA 2XTKA 5E0CA 4TUFA 4NZCA 2XVNA 4ZXOA 2GFTA 2VR4A 4KWUA 3A6OA 1W1PA 1SMDA 3SCNA 3CZJA 3WSUA 5EFDA 1B1YA 3VX0A 4MAVA 1WB0A 1WP6A 2XIIA 3AYRA 3BCFA 4AIOA 3W4RA 4TVCA 1J0HA 1VBRA 5A2CA 4H7VA 5DT7A 1CIUA 4U2YA 4YPJA 5M03A 3ZR5A 2QLYA 4QCEA 4TXEA 1UD3A 1LJYA 4MNJA 2YDSA 5IXEA 1WDRA 5I79A 4NRSA 4XV0A 3WD0A 2WWCA 5ABEA 1FFRA 1OSEA 1R86A 2QV4A 4GXPA 3VX1A 3MV01 4HOZA 1HT6A 1JDDA 3GNPA 1E4LA 4JCMA 3ZM8A 1JDAA 2QF8A 3TOPA 3DHPA 3WF3A 3VMOA 2EPOA 2ZIDA 1EH9A 3EMZA 1K9FA 3SUVA 5A6MA 2EO7A 1D7FA 1AMYA 4MNLA 2J79A 4H8HA 4AZBA 3CH9A 3AMKA 4V2XA 1VFUA 1WDPA 4QAWA 2J7DA 1OGGA 3PZTA 3W6MA 4RE2A 1J12A 4B3KA 5A1AA 4NF7A 4W87A 1QI2A 5JBDA 3BXWA 4W8BA 3CLWA 4KH2A 1E1EA 4W85A 1LF1A 3AYSA 1O7AA 2GJXB 4M81A 4CU8A 5KEZA 4UZSA 3SCPA 1W3JA 2WBKA 3T0BA 3QOMA 4Z2JA 2ZUTA 3EDKA 2DH3A 3VD3A 3HJEA 4X0NA 4W7VA 1C3FA 4L4OA 1UR8A 3ARVA 1DWGM 4WF7A 5IHSA 2WHJA 1FH9A 2YL9A 2CKRA 3ECQA 2J25A 1JDCA 1FHDA 5IHRA 1NH6A 3ARTA 3CZLA 3MUIA 1CXEA 1UR4A 2V3EA 4OJYA 1RP9A 1UOKA 1HKIA 2D22A 4HMEA 4MB4A 2XG9A 3W82A 5AY7A 4UFLA 3OIHA 1OIMA 4FLOA 4B16A 2JEQA 1Q6FA 5CZKA 1YQ2A 1GOQA 1AQHA 3DECA 1GJUA 3TTYA 1U2YA 2ZX7A 3S6TA 2UY5A 3OA5A 1PAMA 2CIPA 4AW7A 3UG4A 1EXPA 1RD6A 1G94A 3GBDA 3SUUA 2D3NA 4RL3A 3CHDA 3AISA 3ZJ6A 3HN3A 4JAWA 3UG3A 5D4YA 1GCYA 1XYZA 4WKHA 2O9OA 1FFQA 3BSHA 6TAAA 2EBNA 3ARXA 1V3HA 2C0HA 1BG9A 4S3JA 2IXUA 3AMCA 2XVGA 3ARRA 3AIQA 1C92A 1WPCA 3KZSA 3UETA 3LPGA 5E9AA 1JI1A 3AIBA 2GVYA 4AZCB 3BAWA 1W32A 1V6WA 1PZ2A 3D5HA 3NSXA 1UQZA 1QPKA 3O2LA 2VZVA 3WMBA 1VB9A 4F8XA 1NWUA 4UQAA 7A3HA 5IFTA 1ZL1A 5M17A 5ABFA 3OLIA 2J47A 3MSDA 3WDJA 2AAAA 1UWSA 3TTQA 1HVXA 3OG2A 1LG1A 3F4VA 2WZHA 3BAYA 1HL9A 4AEFA 3VGEA 4AISA 3W27A 2QMKA 1W3LA 4D72A 2DSWA 2JIEA 2XUCA 3CHCA 1BYCA 2G3NA 4D1JA 5D9PA 2DPEA 1DTUA 4ACZA 3WNKA 4X0VA 1JZ4A 4Q22A 1MVYA 2JEPA 1GOWA 2WYSA 1R8LA 2YIHA 4PMNA 2V5CA 4PCTA 1XRVA 1EO7A 4AZ5A 4F9DA 3J7HA 3WNPA 1DWAM 1W2PA 2W61A 3FHQA 1ESWA 2OLHA 2WSKA 2VCAA 3CO4A 3MU7A 3THDA 2VX5A 2G3MA 2FH8A 3WMSA 1UKTA 2VTFA 4C7FA 1JXKA 2WHLA 1OGSA 3MKKA 3PTMA 1DWJM 2E4TA 1UA7A 3B9EA 2D0HA 3VIIA 5JIWA 4MB1A 1FH8A 4HA4A 4PMXA 2CHOA 3CGTA 1J11A 2DT0A 4UQDA 5A2AA 1OM0A 1W9VA 4EE9A 2J7EA 2RGLA 1V6YA 2BY3A 4RE3A 4D6EA 3L4ZA 3EMCA 4CVUA 4GINA 1M53A 4BQ4A 4HMCA 5FIPA 1QI3A 3SEPA 2WVSA 2WM0A 5HBFA 5A6SA 4HU0A 2CNCA 4D6GA 2VRQA 4OOUA 3A47A 4PSPA 3K1DA 1HJUA 3EDFA 3RJYA 4U5KA 4H8UA 4J3XA 3NJ3A 4A3YA 5I23A 1UH3A 3NCOA 4S3KA 5BWFA 3ALFA 4MB3A 3LPFA 2VZTA 1V03A 3L4UA 2G3IA 4NI3A 3LPOA 1SYTA 1XCWA 3MV11 2GDUA 4MB5A 1US2A 3WNLA 1ISWA 1W1TA 1E71M 1UH4A 4W88A 4M24A 1ZBKA 3U57A 4EK7A 2PWHA 3OGVA 3BAKA 4HU8A 2YL5A 2EJ1A 1E0WA 1KBBA 4DUVA 3N11A 5M3WA 1WCGA 2F2HA 1CGWA 4MDOA 1OD8A 2BV9A 2WVVB 3ZT6A 2YL6A 3GZAA 1DHKA 1UD2A 4JKMA 3T2PA 4KGJA 3PZOA 4HZ8A 3IJ9A 4AEEA 4CD8A 3GXMA 3GXIA 4V27A 3SUTA 1CGUA 3VKKA 1XC6A 1GPFA 3KWXA 1E6QM 2Z1SA 4TX8A 2CHNA 4QLJA 3AHXA 2ZUNA 2DEPA 2BVTA 3APGA 2E8YA 3VMNA 3CUIA 9CGTA 5A6BA 3OGRA 4PMUA 3OLGA 4Z2HA 3UR8A 1KFWA 2XPKA 2W67A 2XGBA 1HP5A 2OYKA 3WUGA 3WENA 1C8QA 2XFFA 3CUJA 2ZOXA 3VPLA 3DYMA 1ITCA 3NSMA 1E5JA 3TTOA 3IAPA 1UWRA 3WMCA 1OIFA 2WC7A 1ODUA 2J7FA 2ZE0A 1Q4NX 4XZBA 2YA2A 4DM2A 1UHVA 3BMWA 5D8ZA 1JFXA 1BVNP 4D6IA 4MAZA 1U30A 4MDPA 1UZ1A 4BCEA 1GOIA 4DWSB 3WNNA 3B9DA 1UWTA 1V3KA 2C8NA 1VF8A 4HOWA 2VRJA 1CLXA 2NW0A 4QFUA 2WMHA 4UTFA 5A6JA 4PYSA 3ARZA 3WUFA 4L4PA 1AVAA 2J4GA 4M80A 1J0ZA 4IM4A 1HKKA 2D24A 3ARWA 4RE4A 1B31A 4AYSA 5CG0A 3RM4A 4H2CA 1J0YA 4GI8A 3UCQA 4AZHA 5I5RA 1LL4A 2O9RA 2XWEA 5AC4A 5DO8A 1X1NA 4MPKA 4HMDA 1H09A 1V0MA 2Q8XA 4UOJA 2B31A 1HJQA 3U7VA 3WL0A 3CMJA 3OLDA 3WBEA 1KBKA 2OSYA 4UFHA 4YHEA 3GH5A 2Y8VA 3GNOA 4PMDA 5A8NA 4JFUA 3NIYA 4OOZA 3U7BA 5GNZA 3SCOA 1QVBA 1NOWA 3VGDA 3FW6A 1CGVA 1UA3A 1CXLA 3WL1A 4U5IA 4GI6A 2EPKX 5CGMA 2ZUSA 1NP0A 1UWUA 1CXKA 5ABGA 4KGLA 3MANA 2D3LA 3W53A 4JIEA 2VJXA 1GZJA 1E3ZA 2YDQA 3RO8A 1KWGA 5DEZA 3CBWA 1HKJA 3FN9A 5LA0A 1G0CA 1BYDA 1EOKA 1UH2A 3ZT7A 1G5AA 3WF0A 1JZ5A 3PZUA 3VGFA 3WKZA 2JE8A 3WFLA 2IUZA 3CZGA 4F79A 2PWGA 1XH0A 3AMGA 3AZTA 5CLTA 1G9HA 1XSIA 5BXTA 2E8ZA 3VIPA 1UKQA 1XD1A 1GQIA 4XX6A 4IPLA 1Q6GA 1PX3A 4J28A 1XHGA 1D3CA 5A69A 3WD3A 3WEMA 3ZSTA 4XB3A 4K68A 1LWJA 1ZBCA 5JUVA 1UQYA 2JFEX 4P8VA 4HA3A 2WKGA 2YLAA 1EIBA 1WDSA 1B3VA 3F5JA 4E2OA 3ARUA 1EDQA 1MW2A 1UR2A 3UG5A 5JH8A 1JFHA 4MTVA 1J18A 1CGTA 2DSKA 4M82A 4PMYA 2W66A 4AZ6A 4ZFMA 1WZMA 1W3HA 1OCQA 1E4IA 1VENA 4J3SA 4MNMA 3AS0A 1JYWA 1NOUA 1CXHA 2DSUA 4JFSA 1NARA 3EDDA 4P7RA 4U3CA 1H0IA 1HJVA 1C8YA 4PSRA 4NSBA 1H4PA 4CU7A 1TVPA 3PN8A 3PZ9A 6CGTA 2WMIA 1W2VA 4PTXA 2VZUA 1W9BM 4PUDA 3WQ4A 2WXDM 3BC9A 3ZJKA 1CXFA 4BQ5A 1CEOA 1UWQA 4J3UA 4BZYA 1CDGA 1KXHA 3RMEA 3BAXA 1JAEA 3AOFA 3PHAA 1OBAA 1E0XA 2J74A 5AYIA 2BFGA 4OBSA 1WAWA 5BXSA 2GUYA 3FNDA 3SUSA 3NSNA 4CN4A 4FLRA 2VX6A 1J01A 2PWDA 1JZ6A 3QHOA 3VM5A 1Z32X 4CUCA 2WHKA 1GHSA 1GQKA 4HPHA 1VFOA 3VVGA 2CBVA 3VU2A 1MWOA 1BTCA 3ARQA 1KR0A 2BHUA 3AXHA 3L4VA 5EFFA 3SCVA 3MUZ1 1A3HA 2ZICA 1LL6A 5A8PA 1ITXA 2WC3A 1ZJBA 2CERA 3OGSA 1OT1A 1E6PA 4XUYA 2CKSA 5JBEA 1BGGA 5HOSA 1Q6EA 3GTNA 1JZ3A 1OB0A 8A3HA 1ISYA 1JIBA 3DHUA 1EDGA 4CD4A 4PTVA 3QHMA 1J0KA 4P7NA 2ZXAA 1E3XA 2DSVA 3VGHA 3TA9A 1CZ1A 3N12A 3KL0A 1PEZA 1JF6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1G1Y A;  4P7L A;  1CGY A;  2WVV A;  4JKK A;  1E6R A;  1E6X M;  2O9T A;  3WEO A;  1ECE A;  3WD4 A;  3BLK A;  3GNR A;  4PMZ A;  1QNP A;  1M01 A;  3SCW A;  2VOT A;  1XCX A;  4JFW A;  2A3E A;  3SUR A;  1VIW A;  4HPG A;  1PBG A;  1GVY A;  2ZX5 A;  5A2B A;  3K8M A;  3WY1 A;  3WQV A;  4GZJ A;  2VCC A;  3VD9 A;  1E5N A;  4R5E A;  4W5U A;  2VUR A;  2DIE A;  3PZG A;  3FY1 A;  3SCQ A;  2ZWZ A;  2DH2 A;  2VQU A;  2WSP A;  2VVN A;  4PMQ A;  4JCL A;  3PZQ A;  4PCS A;  1CBG A;  2WMF A;  1KWK A;  1H11 A;  3VDH A;  2YA1 A;  5A6B D;  2XHY A;  2F61 A;  3WQ5 A;  1JD9 A;  2J7C A;  4JL2 A;  4LXF A;  1VAH A;  5E0F A;  3WUE A;  1KXT A;  1MW0 A;  2EEX A;  1NM9 A;  4UQE A;  5D8W A;  2YLL A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2R6O A;  1Q6R A;  3GHS A;  1NWS A;  1RHC A;  3LGG A;  3KAH A;  4KRT A;  4KW2 A;  3WF2 A;  2VVS A;  3IKG A;  1LT8 A;  4F2B A;  1F8A B;  2GQ9 A;  1GJP A;  2RUS A;  2FB3 A;  4HB7 A;  4WK9 A;  4YS1 A;  2VD9 A;  4XD5 A;  4LPC A;  3APT A;  3H9R B;  3O7U A;  1QPN A;  2WCA A;  3VOC A;  4V1X A;  4R88 A;  2CZV A;  4E2V A;  1TEL A;  3N17 A;  1CB7 B;  3K30 A;  3A9B A;  4A05 A;  2XN2 A;  2E6F A;  1DWF M;  3F4C A;  1CEN A;  2XM1 A;  4ZXL A;  1JZ8 A;  3CQJ A;  4HYW A;  1GVI A;  1PTD A;  4UTU A;  2ESC A;  3USB A;  3RK8 A;  2ZKM X;  4GAC A;  4DLF A;  1VCG A;  4LTS A;  1MDL A;  2PDB A;  1QOX A;  4ERA A;  4UMB A;  4MOZ A;  1G01 A;  6XIM A;  5F4X A;  2B7N A;  1V0K A;  3T07 A;  4AEO A;  4XAP A;  1W6T A;  1TE6 A;  3SIM A;  2OSW A;  3NEV A;  3TEV A;  3LMZ A;  4POC A;  1WQ5 A;  1CEC A;  2VMF A;  3WH8 A;  1FBA A;  3PNZ A;  4FX7 A;  1HN1 A;  1TV2 A;  1CGY A;  4IME A;  5CBJ A;  1ME8 A;  3WEO A;  4TV5 A;  3WLP A;  3WD4 A;  4A2R A;  4J4K A;  3RYS A;  1MXS A;  1N55 A;  2QCL A;  3F03 K;  1TB3 A;  1G6C A;  4JFW A;  1VIW A;  3IIO A;  4HPG A;  1PBG A;  1REQ A;  1R3W A;  3W22 A;  1V51 A;  4E6M A;  4TYO A;  1E5N A;  1IXQ A;  3FY1 A;  3SCQ A;  2VQU A;  1KM5 A;  2WSP A;  2VVN A;  3QBU A;  2O55 A;  3C2E A;  1CBG A;  4GHR A;  1BRL B;  5A6B D;  3WBY A;  1WXJ A;  1FWC C;  3WQ5 A;  1O1H A;  3NQ8 A;  3KZP A;  3BK0 A;  4LXF A;  4XD3 A;  4GVI A;  3SGG A;  4ENL A;  3I7Q A;  1NM9 A;  4UQE A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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