3EX1 | Genus

Total Genus 98

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	98
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
publication title	Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	98
structure length	257
sequence length	257
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2008-10-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3ex1A00

1FWTA 1S3HA 2FPTA 4Y9AA 1K7EA 4X22A 1B9BA 4YWIA 5D04C 4E2DA 5BMXA 4K7YA 2DP3A 3T40A 1TQJA 2RHGA 4QSHA 3DFPA 1XL9A 2QCEA 1HL2A 5AB3A 4AF0B 2HS6A 3DAQA 3HJZA 3C2VA 3GDLA 4O19A 3LCHA 1WOBA 3TXVA 1ZAHA 3QH2A 1EWEA 4H6KA 3TFCA 3E02A 4KFNA 1PL9A 2GQ8A 2BTMA 3STCA 3U2OA 1P0KA 2E1DA 3LTSA 1KFCA 3KRSA 4N02A 1KFLA 4IX0A 4XQ6A 4ZQRA 3W2NA 5DY3A 2BXVA 3L65A 3OVQA 3QQ1A 2VFHA 1K7FA 1Z44A 1IF2A 3P5ZA 1SO6A 4QNEA 1T96A 2PURA 5KZDA 3KVMA 3NL3A 1TTPA 3VNDA 2CZDA 5DLCA 2QCDB 1YTEA 4DPQA 5CPOA 3ANYA 1ML1A 3MW7A 2Q8ZA 5IBXA 3I7QA 2VEMA 3NQVA 1KTCA 1ZENA 3W7HA 5G2HA 1YDNA 3PBVA 4XKYA 1O5XA 4UTTC 4BK9A 3S1WA 3LV6A 3ZS4A 2JKAA 4OHQA 3GDMA 5CZSA 5I3KA 1JCLA 2OZ0A 3IV3A 4Y6GA 3UY8A 1KTBA 5CSSA 4CQ9A 1PHQA 1A5CA 3F4WA 4OQVA 3H53A 4NXSA 4YLWA 3EX2A 3WJXA 2DZXA 1D9EA 2CLLA 4X2RA 3NPXA 1G4SA 4O12A 2QEZA 3CU2A 2QCGA 3I7RA 1OFOA 4UFLA 3EB2A 2OMAA 3EXSA 1RV8A 1K8XA 2YFOA 2Z6IA 3W9ZA 3GDTA 1DBTA 3PSVA 2A4AA 3IIVA 2Y7GA 4UTHA 3NAVA 4M7TA 5BRBA 3CB8A 1ADOA 1Z41A 1SW3A 3DFTA 2NV1A 3HPSA 4UCGA 1G7UA 1OK4A 2GQAA 4UFIA 3HPXA 3DENA 5D09A 2HS8A 3NDOA 4UFMA 4Q32A 4CNNA 5AN7A 4HNVA 4DF1A 4ONVA 3W2JA 5TQLA 1WA3A 3G18A 3HG4A 2A0NA 1IGSA 1ZAJA 4R34A 3M5ZA 3WFAA 1SO5A 4BWLC 1LOLA 3L0NA 4M6QA 1WYIA 4YMZA 2Y7FA 1HFBA 2XN1A 4B5NA 3SW6A 3T44A 3KHJA 3GIYA 2NUWA 3CWNA 3USBA 4LT9A 5EL1A 2YGYA 5FF0A 2WKJA 1H50A 3S42A 1OYBA 3M44A 2FB3A 4IWWA 4IX2A 3CWOX 4Y96A 2C19A 4FXRA 4FX8A 1A5BA 4UFJA 3FYOA 2VFIA 5BW6A 3C52A 3FKRA 4A21A 1GQNA 3ABRA 4HSNA 1GVFA 1Q45A 1EP1A 3UWUA 1G69A 4K8EA 4BI7A 1L9WA 4MLRA 1OHLA 4JTEA 4WQ6A 3EKLA 3LTYA 3OG3A 3P67A 4LY8A 1UUMA 4RK8A 4WX2A 5H2ZA 2NXIA 5EYWA 1I2RA 3LGEA 4PA8A 6TIMA 2C16A 3W1QA 5I3GA 3PULA 4IUOA 3DFNA 1VCVA 3NQFA 1KM0A 3V1PA 3RK8A 1FDJA 2FJKA 3W7CA 4M7SA 4L4LA 3QW4B 3MP4A 3W70A 1SZFA 4O57A 3BW4A 2WSQA 4OT7A 3W7RA 1R46A 3LCGA 5AC7A 4UFHA 3TUUA 1W3NA 3QMRA 4JEQA 5EY5A 2BZNA 4NJHA 3GAKA 4KKXA 2X30A 3W71A 4NX0A 3W2MA 3GR8A 3H55A 1K03A 2FQIA 1O94A 5FF7A 2E6YA 1K7XA 3GX9A 2QUTA 5F2IA 3OVPA 3TW6A 3UQNA 1THFD 3GXPA 4K39A 3RLVA 1SU5A 1IXQA 4NNAA 3ABSA 4NJGA 3N9RA 3O06A 1SZNA 5LNWA 2A5HA 3WJSA 4TX9A 4XBSA 1QPRA 1FWNA 4JTKA 4O14A 4N9BA 3A24A 4LTSA 1AG1O 2I9EA 4A29A 1M5WA 3MI6A 4WJEA 3RMJA 1J5TA 4AEOA 1JULA 3O05A 3UWZA 3MMTA 3M5YA 3W72A 2VXNA 1TV7A 4UMAA 3SI9A 2DJLA 2G95A 3MYPA 1FCBA 1ONRA 1KM5A 1YTDA 1K3UA 1XDLA 3E0IA 4UIOA 5MHBA 5KMYA 2A85A 3F1QA 4NJKA 4I9AA 3G1XA 3WJZA 3W84A 3A21A 4J9JA 3S5ZA 1FXPA 2A7NA 2QAFA 3LRMA 2RH9A 4RXFA 1JQVA 2QJGA 2G5WA 4DF2A 3GKFA 2H3BA 3UZJA 2ZRXA 3GNNA 4LUIA 2E6DA 5CSRA 1OX4A 3BW3A 1EUNA 1Z42A 1NSJA 4QNWA 2V2CA 3BV4A 3HO8A 1TIMA 3PS7A 3NQAA 3E12A 3HIJA 4I7VA 2ZZ6A 3W2KA 3R2GA 4EIVA 1U5JA 3O07A 3CEUA 3GDKA 1W3TA 2A6NA 1XBZA 3GLCA 5D03A 3N3MA 4NX5A 5AHLA 2AGKA 1KM4A 1QMLA 4BI5A 1RZMA 1DQWA 1X7FA 3B8DA 3VFLA 2V2DA 3W07A 4P61A 1QO5A 3P8IA 3NNTA 2X1RA 3NQCA 4Q4KA 1JUBA 4PL1A 4O0ZA 3G1DA 3IGSA 2ZA1A 2J6XA 1GWJA 3WK3A 3IVSA 3TJLA 3VKJA 2H8XA 5F1UA 4BFAA 1QWGA 1ICQA 3FJLA 5EBUA 2Y89A 3LOTA 3TXZA 3HOJA 3FFSA 2J9XA 2NV2A 4JIPA 3IIOA 4A22A 3W1TA 2RDUA 3I6RA 1TV5A 3TQ0A 1SR9A 3HMJG 4R7JA 1M6JA 3A5FA 3C2OA 1S5TA 4AH7A 1V5XA 2ZZ7A 1JUEA 2GJLA 4UMBA 3EWYA 1LZOA 3CIXA 4UUIA 2V30A 5LNSA 4AHPA 3BG5A 3LHZA 1IXNA 4EWND 3DKLA 3MHFA 3O6CA 3QZEA 4ZQMA 3R8RA 3W7OA 2C3ZA 4U28A 4UTUA 1TCDA 1SPQA 1FCUA 1H7XA 4N9DA 3W1UA 1O95A 1WQ5A 5EKYA 3CIWA 4UNKA 3PUDA 2QDGA 3KFTA 3SGZA 2EF9A 3G22A 5AHMA 3NQMA 4ICNA 2Q3OA 5CZ0A 1Q3NA 3ZFHA 5LGXA 1LORA 4JY8A 3IVTA 2ZZ2A 4K7VA 1VPXA 2Y7DA 1IXOA 3UZ5A 1KBIA 2FTPA 3MBFA 5F2GA 4AVFA 3HBLA 5FF4A 3NO5A 3W7EA 3P8JA 3PF3A 5LNVA 4RZ5A 5LHEA 4N4QA 1WBHA 4IPIA 1GYLA 1VLIA 3NZ1A 4MY9A 1GTEA 3DFSA 1M7OA 5I3IA 5C54A 1KFBA 2GJNA 3P5YA 3TJXA 1C29A 1QO2A 3HGSA 4GUIA 2ZRVA 4AHQA 1H5YA 1QOQA 5D38A 4AHOA 1F7BA 2ZQ0A 3TIMA 2RFGA 3PG8A 2ZRZA 3CLMA 1H60A 3SJ3A 3CTLA 3QYQA 4Z0SA 1U83A 1GJPA 1ALDA 2VEIA 1ZCOA 3LERA 2Y61A 5G5IA 4CQ8A 1WAUA 2GOUA 3LCXA 3BO9A 3WJYA 4DEFA 2BLEA 1I2PA 1XFBA 2VFFA 4UTIA 1YXCA 3PR2A 3IGUA 1TYGA 4QAIA 2VFGA 2Y6ZA 3WK2A 3LTPA 3QFEA 4O1DA 4MLJA 1VQTA 4JXCA 3THAA 4A3UA 4IXXA 1SSDA 3BG9A 2W6RA 1Y0EA 3G1AA 4FNUA 3MP5A 4UTMA 4TR9A 3BVJA 4FNSA 4JTFA 3U6WA 3ATZA 3W23A 3UPBA 2VENA 5G2WA 1CW2A 4UXDA 4HNUA 1J2WA 2YCEA 1R2SA 2ZA3A 3NG3A 1DVJA 4ZVJA 1Q6OA 3W74A 5D2TA 4TMCA 1EB3A 1DQXA 3NQ2A 4O28A 4G1KA 4DF0A 4XBKA 5CZJA 3NR0A 2QCFA 4LUJA 3T4CA 4NJJA 1PCKA 3B05A 1Q6QA 1TRDA 1LROA 1SSGA 1TPB1 4FHAA 1F76A 5TIMA 5HWNA 4ZMGA 2Y62A 4DBEA 4NQ1A 2FLIA 1DKWA 4K6AA 3FEMA 3S5YA 3VE7A 2QCNA 5AYZA 3NQEA 1WBJA 1GVSA 3B04A 1AK5A 5LGZA 3W73A 3LHUA 1F74A 2X2GA 1ZJIA 1W5MA 1JCNA 1MEWA 2A6LA 5DBTA 4N2YA 4UMCA 4MFEA 4GWEA 3I65A 5CZTA 3H54A 3B0VC 1WX0A 5TBOA 2G97A 2Z2UA 2DJXA 1JJKA 4TO8A 1XCFA 4D2JA 1RQHA 3SY5A 2V5LA 5DN1A 1LP6A 5D05A 1VS1A 3G1SA 4K37A 3LXCA 1L2UA 4XWUA 1FCQA 3MHUA 3G1VA 3TE9A 3MUXA 1TTIA 1G6CA 2DZTA 4ZQNA 2GUUA 4TIMA 1EX5A 1LBFA 1DORA 4FF7A 4NXKA 3NL5A 2PRMA 3C8FA 2XFWA 3STEA 2ABAA 4JY9A 1B4EA 2Y88A 1YPFA 1FX6A 1H62A 2WNNA 3C6CA 4K8HA 4O0KA 3UWQA 1VCGA 5SWUA 4IMCA 3TMQA 4LW7A 5GVJA 3UWWA 3QW3A 2ZFAA 2J9ZA 4MPQA 3TDFA 3DHDA 4DPPA 1G4EA 4Y90A 3P81A 3R12A 3A9IA 2FFCA 1X1OA 2Z0IA 1ZALA 1A5SA 1OFRA 3W3OA 3W2LA 2EGZA 2B4GA 2CLFA 3BPWA 1KM3A 3TCEA 3W1NA 4Y8FA 4QISA 4PL2A 4FX6M 5HR6A 4JGDA 3FLUA 1TO3A 3KXQA 3PC0A 3QPYA 5DCBA 1OFEA 4IMEA 4JYDA 4PODA 4LVAA 3LHYA 5DELA 1OABA 5LSMA 1GTHA 1W37A 3AO0A 1MSSA 4PH6A 4GBUA 3STGA 4MYAA 3A23A 2ZDRA 1LLZA 2ZZ1A 1RR2A 2W79A 1EUAA 5HULA 1NF7A 2Z1BA 3EXRA 2OT0A 3P80A 2DU2A 1H7OA 4KWWA 4O8RA 2TSYA 2J88A 1KBJA 1C8VA 3CHVA 2CZEA 2E68A 1I8JA 1F6PA 5HWJA 1TTJA 5BNKA 3L5LA 1LBLA 4DO6A 4MZ8A 2YYTA 1R30A 5FI8A 1HTIA 5LNUA 4O1BA 2E09A 3MWAA 1OF8A 5G2IA 3N19B 2D73A 3S1VA 4JTGA 4QM1A 1I4NA 1UCWA 4HNNA 2VEKA 1IXPA 1H7NA 1OF6A 2WV8A 4XKYB 2QCLA 3QSRA 3C56A 4ADUA 4AWUA 1XUUA 3BG3A 5L6UA 1J4EA 2NWSA 4MZYA 2X1TA 5C6MA 1UJPA 1W5PA 1BWKA 3UY7A 3DI0A 3GVGA 3QSTA 4MY1A 5J5DA 2GQ9A 1P4CA 1BEUA 2VEPA 4UTWC 1W54A 1XBXA 4FNRA 1G7VA 4DXVA 4M6VA 3NA8A 2G96A 2YR1A 4K36A 1SQ7A 3UD6A 3GAYA 4LVFA 2A1YA 3W7GA 3L5AA 1ZFJA 3EWXA 5E1QA 3UXAA 4QIUA 2O7SA 4UTLA 2R8WA 4LVGA 3EX6A 4MYXA 1R2RA 2AQWA 1UUOA 4EOUA 5A5WA 1W56A 2WNQA 3W76A 1JCXA 2QCHA 1X8FA 3DXIA 1RQEA 2GVLA 2B7QA 4PFMA 3QMTA 2NXGA 4RV8A 3B03A 6ALDA 3W83A 1LDCA 4QJ1A 3HGOA 3G1YA 4JIQA 4RLIA 3FA5A 2VELA 3JR2A 4LV9A 3BLEA 3K30A 4GXMA 1BTMA 4WUIA 3OEXA 3MO7A 2OX1A 3LCWA 3TA6A 4RR4A 4RXGA 1S5VA 1W5OA 1K02A 4YCPA 1T99A 2CLKA 4NT0A 4WY0F 3P84A 4WZHA 3PVFA 2X1SA 1F05A 4UFKA 3TQVA 3S9YA 1K8YA 1XC4A 5C5YA 2Q8LA 2Z6JA 5K9DA 3E96A 3W7LA 3M5VA 3W22A 5AC8A 2NX9A 5AYXA 1B57A 4IMFA 3LV5A 1NF0A 2GVGA 2C18A 3KOFA 3DI1A 3N9SA 1PCWA 1VH7A 5C2XA 4YL2A 3W7NA 2V82A 2I14A 1YXYA 2ZA2A 3O63A 4DBDA 1GZGA 1LCOA 4FEZA 3PB0A 3TK7A 5HNRA 1NEYA 4IMDA 1SFJA 1W1ZA 5K4ZA 2CLHA 2QR6A 5FEPA 3CPRA 1PVNA 4WY0A 1LRNA 3VE9A 2PCQA 4XTIA 4MUZA 1TREA 3LI1A 4HIBA 5K9CA 4L4MA 5I3JA 1TQXA 1UB3A 3HQ1A 3OBKA 3W7QA 4TMBA 3PBYA 5G4EA 1KM1A 1W3IA 1O4UA 3GZ3A 1H1YA 5AOUA 4E2BA 3E9AA 3TFXA 3W7JA 4GUHA 4PC8A 3TV8A 3DH7A 3W86A 2BWGA 4H4IA 3NQ7A 1SZGA 3DZ1A 2PC4A 3S1UA 3DKJA 3S5NA 3KX6A 4CCDA 3IIXA 3F03K 3HG2A 4LV4A 1SO4A 1VZWA 2ZRYA 5AHFA 5KSWA 1KV5A 3BGGA 5D37A 3G8EA 2CLMA 2PE4A 2C1HA 4FX7A 2QF7A 1KFJA 3W7MA 5CG7A 4O52A 4HKPA 3STFA 4OV4A 1VHCA 1JRBA 4LS0A 3NZRA 3LX9A 4I7WA 4H3DA 2FPVA 1ME8A 1XI3A 2ISWA 2QAPA 5IBXC 1EPXA 3C2EA 4TU1A 2YFNA 2DZWA 2H3DA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3EX1A

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