3N13A

Crystal stricture of d143a chitinase in complex with nag from bacillus cereus nctu2
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
LGSKLLVGYWHNFDNGTGIIKLKDVSPKWDVINVSFGETGGDRSTVEFSPVYGTDADFKSDISYLKSKGKKVVLSIGGQNGVVLLPDNAAKDRFINSIQSLIDKYGFDGIDIALESGIYLNGNDTNFKNPTTPQIVNLISAIRTISDHYGPDFLLSMAPETAYVQGGYSAYGSIWGAYLPIIYGVKDKLTYIHVQHYNAGSGIGMDGNNYNQGTADYEVAMADMLLHGFPVGGNANNIFPALRSDQVMIGLPAAPAAAPSGGYISPTEMKKALNYIIKGVPFGGKYKLSNQSGYPAFRGLMSWSINWDAKNNFEFSNNYRTYFDGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal structures of bacillus cereus NCTU2 chitinase complexes with chitooligomers reveal novel substrate binding for catalysis: a chitinase without chitin-binding and insertion domains
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus cereus
total genus 113
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3n13A00
1VJZA 1QNOA 2AMGA 2VQUA 2WM0A 5KEZA 1Q6FA 1B3ZA 1F4HA 3T09A 2CBIA 1HJQA 3VMPA 3GBDA 3WBEA 1UKQA 3EDJA 2ZXDA 3WDRA 1ISYA 3W82A 3NSMA 4FLQA 4P7OA 1CGYA 3EDFA 1B3WA 3WUGA 1U33A 4ZXLA 4KGJA 4QP0A 2IXVA 4ZE5A 1KB3A 2Y24A 3CZ8A 3ARWA 7A3HA 3AYSA 3FXYA 3EDDA 3WIJA 3DECA 3FW6A 5CPQA 3VDBA 2OWWA 2MANA 1B2YA 1ZBCA 2VR4A 2X05A 2VZTA 1Y7VA 1GOKA 2VQTA 4B16A 1JDDA 1CLXA 2OSWA 3PHAA 4PTXA 3O6AA 1HP4A 1UH4A 5E6ZA 2JALA 2ESCA 1L8NA 3SCOA 1W1YA 4HMCA 1DWGM 1HNYA 4CD6A 1JXJA 1G1YA 4XB3A 1E43A 2WBGA 4KRUA 4UNIA 4LPCA 1BYDA 2F8QA 1J01A 4W86A 1RP8A 1UWUA 5I23A 1W9PA 1W3LA 2PI6A 1JFHA 2J4GA 5LYRA 4AZ6A 1MXGA 1GQLA 1M7XA 3PTMA 3VM7A 4N0RA 3CUJA 1QNQA 5ABFA 5M17A 3CGTA 1O7AA 3T2QA 4J3SA 4LQ1A 2YL6A 2BHYA 3RIKA 1OD0A 1GQJA 5I78A 5ABEA 2WMGA 4BZYA 3L4XA 4WLCA 1TE1A 3THCA 2WMHA 4C7DA 2CCRA 2WCGA 2BVYA 1V6VA 1E0VA 1GZJA 2ZIDA 4UZUA 3WQWA 1R87A 5E6YA 4BF7A 1NH6A 1XD1A 2FGZA 4E2OA 5HNNA 1NM9A 2EQDA 3AIEA 3WH9A 3VO0A 1E1FA 4HZ8A 4PTMA 4GQQA 1HN1A 4Z2IA 4CU7A 5A1AA 4BA0A 1CXKA 3MV01 3TONA 1XHGA 2VZSA 1JYWA 1OGSA 2VVNA 3F5LA 4AW7A 4RL3A 5A6SA 4U2YA 2XSBA 2Y4SA 2G3NA 1NWRA 2DIEA 2OWCA 1JNEA 4AZIA 4A3YA 4WSKA 3A4AA 3WD3A 1G94A 2GVYA 1PAMA 3RILA 1E6RA 2WLYA 2JFEX 2CHNA 5KZ6A 3VIJA 3WNMA 1SMDA 2FHFA 4JZ5A 4F66A 3O9NA 3TTSA 2YL8A 4AIOA 3L4VA 4RE4A 3M07A 2E9MA 3WD2A 3ZSTA 3WD0A 4JHZA 5JUVA 5AYBA 3ZJKA 1Q6GA 4ZFMA 1MFUA 2WW5A 3MSDA 1UR4A 1U30A 2J25A 2GK1A 3MMDA 1GQKA 1BPLB 2E4TA 4DUWA 4JL1A 5A94A 3ARUA 4U2ZA 1GOWA 2XUCA 3GM8A 4EANA 1OD8A 3AHTA 3A4XA 3W26A 2XFRA 1JZ3A 1J18A 2PWDA 4PUDA 3NUKA 3UCQA 3VGFA 4MB4A 2HISA 2CXGA 4QFUA 2A3EA 3PZIA 4MB5A 1JZ6A 1ISZA 1X6LA 3OLGA 3ZJ6A 2J47A 1UZ1A 8CGTA 1V6YA 4GZJA 1NWTA 3RDKA 2BXYA 3N18A 1KXHA 5D9MA 3WDIA 3RO8A 3MMWA 2DH3A 4W8BA 1FHLA 1QOXA 1W1TA 4XZBA 3M7SA 2V5CA 5CJ5A 1W3HA 2DIJA 4LXFA 1ZU8A 1EQCA 3L2LA 3POCA 4EKJA 3MSGA 1JI2A 3ALFA 5DFAA 2XM1A 4MPKA 2OSXA 4YHEA 1Q6DA 2X09A 1GJWA 1E3ZA 5FKYA 2DH2A 1NOWA 3ZT6A 1E0XA 3W25A 1EH9A 3W27A 1V3LA 4AYSA 1ZB5A 4DUVA 3RJYA 7CGTA 4LYQA 3MU7A 2W5FA 1FOBA 1A3HA 3BCFA 2DPEA 5LA1A 3ARQA 3NJ3A 1WKYA 4HA3A 3WF2A 1DWJM 1J0IA 5HXMA 3ARRA 1JIBA 2E8ZA 3MMUA 3VGDA 3CUIA 1XYFA 3AZSA 3OG2A 4GPNA 5BYWA 1JDCA 1HVXA 3WQVA 3SCVA 1OT2A 3CUGA 2ZXBA 2YKKA 1CXIA 1CXFA 1E3XA 1OIMA 1JXKA 3GNPA 3RM8A 1E6PA 1W1VA 3D3AA 3MO4A 3O2LA 4IPLA 4E4PA 1V0NA 1H11A 3BH4A 2BY3A 2GDVA 3LMYA 1C8QA 2D20A 5EFDA 1PZ3A 4HPHA 1SR0A 3PTQA 3LPPA 2WVVB 4W84A 5BRQA 3W28A 4OOZA 3BAIA 4OZOA 1RH9A 2XGIA 2IUZA 3GBEA 4PSPA 3WUEA 4CGTA 4UTFA 2WB5A 3OA5A 2X2YA 1UD2A 2WHKA 2WNWA 3L4YA 4J7RA 1UD3A 1UQZA 3N1AA 3BAJA 4JKLA 4UOZA 1QHPA 1VAHA 3VDCA 4FLOA 2GUYA 1VEMA 3OGRA 2BV9A 3OLIA 1EO5A 4H7VA 2RGMA 2XIBA 3CTTA 3RM9A 1EA9C 3KZSA 3F5JA 5EBAA 6A3HA 2EO7A 1BAGA 3AISA 3OLDA 4NZCA 1TMQA 4R5EA 3L4WA 2JIEA 3ZOAA 2E0PA 1TA3B 5A6MA 1DWIM 2VNCA 4MJ4A 1HJVA 4U3AA 1D2KA 4GKLA 2YA1A 1GHRA 4NSBA 4W89A 4TOQA 1JZ4A 2CKRA 4JFUA 2FH8A 3L2MA 1LL7A 3PZUA 1CENA 3K4DA 2WZEA 3TTOA 2NW0A 4MTVA 3TOPA 3CHEA 4J28A 2EPNA 1ZBWA 2A3BA 4XZWA 2E9LA 4DUXA 1M01A 4UFMA 3U5YA 4MB3A 2ZXAA 3SURA 4WK9A 4PCSA 1VFUA 4MAVA 5GNYA 2W4XA 2V3EA 2WHLA 3VKKA 1WO2A 1JF6A 1KBKA 2W63A 4XUYA 8A3HA 1KWKA 3ZMRA 3WNPA 3QR3A 4D6DA 1JAKA 4PMVA 4AD3A 1V02E 2WPGA 2D23A 1RD6A 3ECQA 4H8HA 5EMYA 4UFJA 2V3GA 1Q6CA 1UD6A 3VGEA 2VX6A 4PMNA 1FFRA 4KH2A 1E72M 5D9PA 4CN1A 1IZJA 1UH2A 3U57A 2E3ZA 1XH2A 4C7GA 1E4NA 3W37A 3AIBA 4LYPA 3APGA 2J7EA 5CXPA 3NYDA 3LPFA 4UQCA 1H2JA 3WDJA 2A3HA 1O6IA 4P8WA 5CG0A 4ACZB 2VC9A 2B31A 5A8MA 3SCWA 2VO5A 1VFFA 3CMJA 1VENA 4ZENA 4WSJA 4JCMA 3SCQA 3AS0A 2W61A 3AFBA 4TUFA 2J77A 3POHA 1WDRA 1ZJAA 2WC3A 4KWUA 2ZOXA 2WVVA 1EGZA 4V27A 4CN6A 3JUGA 4M1RA 3ZM8A 3WELA 1BG9A 1G5AA 1AQ0A 2J7CA 4CUCA 3MUAA 1XSKA 2VCAA 2J75A 3GTNA 3WNNA 5FD0A 2XGBA 2EEXA 1B1YA 3UESA 4HZ6A 1WDSA 2EPMX 1EDTA 3RCNA 1NARA 2VX4A 4GO9A 4Z2KA 1HF6A 3CZKA 1UQYA 2ZUVA 4KMQA 1RPKA 2EXOA 3ZQ9A 1VRXA 5CSUA 1UR8A 5A95A 4MNJA 4DWSD 3PZ9A 5A6BA 3NSNA 5CLWA 1XCWA 3UR7A 3IJ9A 3W29A 3FN9A 1US2A 2PWFA 5A8PA 2AAAA 1LF1A 4QLJA 2VX5A 1QW8A 4Z2JA 1GPFA 4D1IA 2YDRA 1SYTA 3ARVA 1UYQA 3PN8A 2VX7A 4BQ3A 3PZVA 1MW2A 3DC0A 2OYLA 1TA3A 1XH0A 1I75A 3AMCA 1VEPA 4H41A 5I6SA 4S3KA 3WL0A 1KR0A 2F2HA 2J79A 1ZBVA 2ZXQA 1FH8A 3WEZA 2ZUWA 3AI0A 1W1PA 2XFFA 1HT6A 3UG5A 1MW3A 2WMJA 1MWOA 3VDHA 1OBAA 1OCQA 4CN4A 3VIMA 4DM1A 2W92A 4JFSA 4AZ7A 3MV11 2WBKA 3AHYA 2BFGA 1QHOA 1R86A 3AQUA 5E70A 4PYSA 2EPOA 1JZ8A 2WWDA 5A6LA 1KXTA 4TX8A 1LG1A 1OWQA 1UKTA 4PUEA 2QV4A 2GFTA 1UWSA 2J7GA 1UZ4A 2VR5A 1V3HA 1B3VA 5ECUA 4HPGA 3A47A 4HA1A 1ISVA 3E1F1 4D6JA 1KXQA 1VB9A 2F61A 3U7BA 1KR1A 4D6IA 1JI1A 2EJ1A 2X0YA 3ARYA 3WKZA 4HU8A 4ZXOA 4PSRA 4IM4A 4HMEA 3LPOA 1UA3A 2D0FA 1IZKA 1WZKA 1FA2A 4A3HA 4OBRA 1C91A 1E1EA 2VVSA 2WYSA 3ARZA 3MUZ1 3AZTA 1PIFA 3I3BA 3WUFA 3W6MA 2G3JA 2QHAA 4ACZA 5A69A 1R7AA 1W91A 2PWEA 3ZSSA 3GH4A 1KCKA 1UKSA 1L0PA 1XH1A 4HZ7A 4PMRA 5D8WA 4GIAA 4RE3A 3CMGA 1H0GA 2O9RA 4UQEA 1CEOA 2WVUA 1LG2A 3SUTA 1V02A 4JAWA 1HP5A 5I5RA 2G3IA 2UY5A 1QI4A 1FH7A 3AJ7A 3VGBA 5LA2A 3UEQA 1EHNA 1J10A 2FHCA 3EMCA 1DP0A 4GI6A 4AWEA 1BVNP 1UWQA 5BXSA 5I0DA 2DT3A 5ABGA 1GNXA 2WK2A 1RP9A 3BCDA 4W7WA 1J0JA 2XSAA 3WDPP 5CQ1A 5DT5A 3WF0A 3N11A 2IXUA 3OZOA 3WQ4A 1BGAA 4JFWA 1QBBA 1CXLA 4JCLA 3SCPA 1KXVA 1NOUA 1CGXA 2J74A 4IISA 4Z2GA 4D6HA 1UH3A 2WVSA 1CGWA 3FNDA 2DT0A 3VIHA 3AIQA 1MW1A 5A2BA 4AZHA 2Q8XA 4FK9A 2VURA 2XJ7A 3MKKA 4J3XA 2J7BA 3AS2A 3WMBA 4A4AA 1JYNA 1C8YA 3OGSA 3AOFA 1KFWA 3OBAA 1WCGA 4AD2A 4MDPA 2WMKA 3FHAA 1TUXA 1JNDA 3CZJA 1M53A 4CKQA 1ITXA 2ZX6A 1HKJA 1W32A 3T2PA 3N04A 4HOZA 1GORA 4QDMA 1EQPA 4ZEPA 1KQZA 3IANA 1PIGA 4CVWA 1LWJA 4W7VA 3BMWA 3GXDA 3AMKA 2JIWA 3BC9A 2ZE0A 5AYIA 3A4WA 2C0HA 3VUPA 1ISWA 3QHNA 5FCZA 3CHCA 1W3JA 2G3MA 1LL6A 1J0KA 2J7FA 3MS8A 1UR2A 3SEPA 2D3NA 1ITCA 3ZO9A 2JEPA 4W5ZA 4ZE4A 1H3GA 1HXJA 4PCTA 1X6NA 5D4YA 1NP0A 4TVUA 4IUGA 1R85A 2XTKA 1GVYA 4TX6A 5GNZA 3ZJ8A 3PZTA 1H09A 4J3UA 1MFVA 4W5UA 3L4TA 4Q22A 2DDXA 2GJPA 3W53A 4AZ5A 1K9FA 1V6XA 3VIOA 3BLKA 2XVKA 4UQAA 2WAGA 1CGUA 1B9ZA 3M6DA 1WAWA 1XGZA 4NF7A 2YL5A 2V3DA 3B9EA 4M56A 1TR1A 2ZUTA 4HU0A 2G4FA 3IJ8A 2WMIB 2NSXA 4UQ9A 3VGHA 4C7FA 1BHGA 1E73M 1NQ6A 4UFIA 4JKMA 4D6GA 2OSYA 3UR8A 5IHRA 1J0HA 4EK7A 5A2AA 2WC7A 4GZEA 5AY7A 5CGTA 2CBVA 4DWSB 3EDEA 4BQ4A 1HKIA 3VOCA 4BCEA 1JFXA 4FLSA 2VCBA 1EDQA 2D0GA 4B15A 2YDSA 3WF4A 3VMOA 5M5DA 2G8ZA 4U3CA 1J9YA 1J12A 1F4AA 1HKKA 4ML4A 6CGTA 1SMAA 2BHUA 3KWXA 1CBGA 9CGTA 3AXIA 1BSIA 2ZX8A 3BAXA 4TTGA 2DT2A 1KGXA 2O9PA 1TZ7A 4X9YA 1W2VA 3A6OA 1E4LA 1TCMA 1CYGA 3VIPA 1DWAM 3VPLA 3GDBA 1C7TA 2Y5EA 3NDZA 3VTRA 1G9HA 2X8RA 2CBUA 5A8NA 1GVIA 5DF0A 4YPJA 5IFTA 4JKKA 5BWFA 4AZCB 2W67A 4D71A 5A6KA 4PN2A 2PWGA 5HDRA 1UUQA 4CD7A 3W0KA 4AY1A 1W9UA 1KGWA 1KGUA 4K68A 1V08A 3RPMA 1K9DA 2VCCA 2VJXA 1VEOA 3RJXA 1N82A 4D72A 4HOWA 1KCLA 1B0IA 1JYVA 4U33A 1JF5A 3AS3A 4W8LA 2O9OA 4JFTA 3DYPA 4TXEA 1QI2A 1CIUA 1A47A 3WF3A 4AD0A 1DTUA 1CTNA 2BY0A 2A3AA 3CPUA 4H8UA 3QOKA 1BQCA 2FHBA 1JD7A 5CPSA 3IAPA 3J7HA 1UD5A 2YOCA 1X1NA 4U5IA 1EOMA 3ZR6A 1U2YA 3GXFA 1V3MA 1E6XM 3BGAA 3HN3A 1JYXA 4AISA 4WF7A 1C90A 2DSKA 1GCYA 3RM4A 5GPRA 4TTUA 3B8SA 2DSUA 1IT0A 3W6LA 3CH9A 3EMZA 1YHTA 3GXMA 1HVQA 1OGBA 1HIZA 4P7NA 5IDIA 2J8FA 5D8ZA 1GW1A 1XV8A 4HA4A 2EPLX 1CGVA 5F7UA 2FDMA 1H41A 4MDOA 3HU7A 1HJSA 4PMUA 4AIUA 3WEMA 2BY1A 3PZOA 2V3FA 2YLAA 1M04A 3M46A 4AEEA 2PF0A 5I2UA 1E6NA 2CEQA 3FY1A 3PZNA 3GZAA 2GDUA 2WMIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VJZ A;  1QNO A;  2AMG A;  2VQU A;  2WM0 A;  5KEZ A;  1Q6F A;  1B3Z A;  1F4H A;  3T09 A;  2CBI A;  1HJQ A;  3VMP A;  3GBD A;  3WBE A;  1UKQ A;  3EDJ A;  2ZXD A;  3WDR A;  1ISY A;  3W82 A;  3NSM A;  4FLQ A;  4P7O A;  1CGY A;  3EDF A;  1B3W A;  3WUG A;  1U33 A;  4ZXL A;  4KGJ A;  4QP0 A;  2IXV A;  4ZE5 A;  1KB3 A;  2Y24 A;  3CZ8 A;  3ARW A;  7A3H A;  3AYS A;  3FXY A;  3EDD A;  3WIJ A;  3DEC A;  3FW6 A;  5CPQ A;  3VDB A;  2OWW A;  2MAN A;  1B2Y A;  1ZBC A;  2VR4 A;  2X05 A;  2VZT A;  1Y7V A;  1GOK A;  2VQT A;  4B16 A;  1JDD A;  1CLX A;  2OSW A;  3PHA A;  4PTX A;  3O6A A;  1HP4 A;  1UH4 A;  5E6Z A;  2JAL A;  2ESC A;  1L8N A;  3SCO A;  1W1Y A;  4HMC A;  1DWG M;  1HNY A;  4CD6 A;  1JXJ A;  1G1Y A;  4XB3 A;  1E43 A;  2WBG A;  4KRU A;  4UNI A;  4LPC A;  1BYD A;  2F8Q A;  1J01 A;  4W86 A;  1RP8 A;  1UWU A;  5I23 A;  1W9P A;  1W3L A;  2PI6 A;  1JFH A;  2J4G A;  5LYR A;  4AZ6 A;  1MXG A;  1GQL A;  1M7X A;  3PTM A;  3VM7 A;  4N0R A;  3CUJ A;  1QNQ A;  5ABF A;  5M17 A;  3CGT A;  1O7A A;  3T2Q A;  4J3S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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