4ZE4 | Genus

Total Genus 192

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	192
sequence length	474
structure length	474
Chain Sequence	HLKPFPPEFLWGAASAAYQVEGAWNEDGKGLSVWDVFAKQPGRTFKGTNGDVAVDHYHRYQEDVALMAEMGLKAYRFSVSWSRVFPDGNGAVNEKGLDFYDRLIEELRNHGIEPIVTLYHWDVPQALMDAYGAWESRRIIDDFDRYAVTLFQRFGDRVKYWVTLNEQNIFISFGYRLGLHPPGVKDMKRMYEANHIANLANAKVIQSFRHYVPDGKIGPSFAYSPMYPYDSRPENVLAFENAEEFQNHWWMDVYAWGMYPQAAWNYLESQGLEPTVAPGDWELLQAAKPDFMGVNYYQTTTVEHNPPDGVGEGVMNTTGKKGTSTSSGIPGLFKTVRNPHVDTTNWDWAIDPVGLRIGLRRIANRYQLPILITENGLGEFDTLEPGDIVNDDYRIDYLRRHVQEIQRAITDGVDVLGYCAWSFTDLLSWLNGYQKRYGFVYVNRDDESEKDLRRIKKKSFYWYQRVIETNGAEL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Putative 6-phospho-beta-galactobiosidase
publication title	To be published rcsb
source organism	Geobacillus stearothermophilus
total genus	192
structure length	474
sequence length	474
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.85: 6-phospho-beta-galactosidase.
pdb deposition date	2015-04-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4ze4A00

4V2XA 3K8MA 1B2YA 1XCXA 4HU8A 1V3HA 1DWHM 2XYLA 3SUWA 2WC7A 3WQWA 2GK1A 3MUIA 4LPCA 1V0KA 2ZICA 1M53A 5BYWA 2YLAA 1HF6A 2CPUA 5CPTA 3AS3A 2VC9A 2VX5A 4AWEA 3AIWA 2OLHA 3VM5A 2VZOA 3W6MA 1DWJM 1NARA 3GH7A 4K68A 2Z1KA 5CGMA 2DPEA 2C7FA 3WFLA 3I3DA 1EIBA 5CSYA 5FIPA 3UEQA 2Y5EA 3VINA 4PUDA 5A95A 3CBWA 3RPMA 1AMYA 3SURA 4UFIA 1WZMA 3ZOAA 5DFAA 4AISA 1JDAA 2FH6A 1GONA 4H8HA 4B9YA 3K4DA 1JF6A 4CD4A 1H0IA 1E3XA 1WDRA 1C7SA 3A6OA 1KGWA 5M5DA 4IUGA 4CCDA 2W63A 2XFRA 1E43A 3GBDA 1HVQA 5I23A 5A6AA 2BS9A 3AMCA 1GOOA 4WK9A 5CPSA 4B15A 2GSJA 2WC4A 2XIIA 1JYVA 5E9AA 1EXPA 3UESA 3N17A 4UOJA 4D1IA 3RO8A 2Z1SA 4MNKA 4MNLA 1UD5A 4AIUA 3AROA 1W9VA 1EDGA 2Y24A 1E73M 3HMCA 4UQAA 4AD3A 1ESWA 4B3KA 1WE5A 3CUGA 3AMDA 4U2YA 3BLPX 2J4GA 5CLTA 4E8DA 1V08A 2OSYA 3VILA 3AOFA 1KCLA 1B0IA 1H2JA 4U33A 3DYOA 2D3NA 1M7XA 4PTVA 3LPGA 1EOKA 1B3YA 2FGZA 2Q8XA 3LMYA 1NWSA 2EPLX 5CZKA 2EO7A 2QF8A 5KEZA 1UR4A 4MJ4A 1CEOA 4RL3A 3WF4A 1WZAA 1HJQA 1CYGA 1WKYA 1ZJBA 4LGXA 4HOWA 2ZUVA 2E8ZA 2FDMA 4JL1A 1DWAM 3D3AA 1U30A 1ISVA 1W3HA 3GM8A 4J3UA 1FH9A 2CIPA 2WKGA 2WLZA 1QHZA 2WCAA 1BG4A 4PTWA 4TVUA 1UG6A 1A3HA 3MSDA 3WN6A 3BSGA 4AD2A 3BC9A 3WD3A 3CO4A 2G3MA 2D0FA 2XWEA 3WL0A 1UQZA 4D6EA 2ESCA 4W7WA 4XB3A 5A2CA 1GHSA 4L4OA 1E6PA 4AZGA 2CBIA 5A8MA 3QOMA 4WF7A 3QHNA 2X2YA 1VJSA 1C3FA 1MXDA 3W0KA 3MUAA 1P6WA 3UR7A 1E71M 1R86A 1US3A 1UD2A 1H1NA 1C8QA 1C90A 2DSWA 3FHQA 1PPIA 3VIPA 3VIKA 3WDHA 4JKKA 4AZIA 2YJQA 4MDPA 4KMQA 2YDRA 4W93A 1E56A 2VQTA 3EDFA 2E9BA 1BVZA 4NF7A 5A6BA 1M01A 1OGBA 5FD0A 3VD7A 1TMQA 5A94A 1XV8A 1TZ7A 3KEHA 2ZOXA 3VDBA 2WVVA 2UY4A 4AY1A 3AS1A 3W38A 1K9FA 3VO0A 1MW3A 4R5EA 4OKDA 3VDAA 2G3NA 4U5IA 1CGTA 1E1EA 1ITCA 1W1PA 4OZOA 5JBDA 4HU0A 5JBFA 3OLDA 1W9UA 1HKJA 4B9ZA 5ABGA 4CVWA 1UD4A 4GINA 3TTSA 1QBBA 1IZKA 1FOBA 1LG2A 2DSZA 3NSMA 4UNIA 3AISA 3CH9A 3ZQ9A 3VX0A 2EXOA 1JXKA 2F2HA 3WD2A 4S3JA 2PB1A 4GI8A 1V0MA 4LYQA 4AZ5A 3L4TA 1MXGA 1WZLA 4GQRA 2DEPA 5AYIA 2WW5A 5TD4A 2D1ZA 3MV01 2JALA 1KWKA 2VMFA 4AZCB 1DP0A 1AQHA 3B9EA 3AZRA 4GXPA 2ZX5A 5M03A 3WD4A 3AHTA 1QPKA 3ARPA 3A4AA 4M24A 4ZXOA 2GJRA 1UR8A 5DEZA 3RM9A 2X0HA 1XH1A 2OYMA 4Z2KA 2YA1A 4Y7EA 3AMLA 4HPGA 2QPUA 4W87A 1ZL1A 2WKLA 1CLVA 4W84A 3NSXA 4FLRA 1BGGA 4X9YA 3AFBA 3BAYA 2RGLA 4CU6A 3CTTA 3VD4A 5EBAA 3AIVA 4UR9A 1GZJA 2UY3A 4HA4A 1UD3A 3VD9A 4V28A 2X05A 3KL5A 2WB5A 1E72M 2J47A 1SFSA 5A3HA 5E6YA 4UOZA 1KR1A 2YLLA 1V0LA 2BY3A 1UWQA 2WK2A 2W92A 4ML4A 2ZX7A 3WF0A 5E70A 4AD4A 3GYCA 1UWUA 4XZWA 1BVNP 2G3JA 2JEPA 1MW2A 1H09A 1KGXA 4EE9A 5GPRA 3ALGA 2J78A 3SCNA 1JZ3A 3ARQA 7A3HA 4W7VA 3PZOA 1V0NA 4TVCA 2Y4SA 3M6DA 5JIWA 1UR0A 2WMHA 3PZMA 3MANA 4QCFA 2CHNA 1O6IA 3WUFA 2WVUA 2XPKA 2VUYA 2Y8VA 3WQ8A 4ATDA 2YA0A 3PZVA 3PZGA 2WBGA 1XGZA 1HJSA 4J7RA 3PTKA 2BNJA 4CU8A 3AHZA 1HXJA 4AW7A 4WKHA 3RMEA 2ZUUA 5FL1A 1ODZA 2CITA 3GNPA 4H8VA 4F66A 4JIEA 4IISA 1PZ3A 4P8XA 4UFLA 1Y7VA 1VEMA 2YL6A 3WELA 2WYSA 8A3HA 2XWDA 4DWSC 4V27A 5A6MA 2DIEA 2AAAA 2MANA 1Q6GA 4W5UA 1V6YA 2VZUA 3CZLA 2DH3A 2C0HA 3GNRA 4RE3A 4XV0A 1U2YA 2WMIA 2YA2A 4AZ6A 1KQZA 2ZXDA 3MO4A 1V3IA 1GW1A 1GQIA 1O7AA 5E0FA 1J0IA 2WAGA 2TAAA 5I0DA 2J79A 2PWGA 1D3CA 1HKKA 4OOUA 3VKKA 3WEZA 1XH0A 1CGXA 2WMFA 1NP0A 1XD1A 3SCVA 4UQBA 2VVNA 5D9MA 3ZJ8A 4UQ9A 1XC6A 4D6CA 1J0HA 2BVYA 2DSVA 2PWDA 1UWRA 1W3JA 5D9PA 3SUVA 2F61A 5M17A 4P7RA 2J7HA 1FHDA 2O92A 1HIZA 1SR0A 3KWXA 4XZBA 3ZMRA 3AIUA 3WEOA 3CUIA 1J9YA 3AS0A 3W28A 2WSPA 3WSUA 3WQ6A 6A3HA 2VT0A 3J7HA 4LYRA 2XFYA 4IPLA 3WEMA 4CN6A 1JD7A 2CXGA 4D71A 4MJ2A 1CPUA 1K9EA 1E4MM 4P7NA 4HMDA 4UFHA 1H41A 5EFFA 4D6FA 4D6HA 1B3ZA 2CESA 1S46A 3W27A 1W9DM 3L4VA 4HA3A 3WUGA 3UCQA 1J0JA 5AY7A 2G4FA 3SIMA 4DUWA 3WH5A 4GIAA 5ABEA 5CXPA 1E15A 2J7EA 2WHLA 2GVYA 3VGDA 1XSJA 1W1YA 1C92A 5IFTA 1JYXA 3MUY1 2D22A 1CDGA 1IV8A 1VJZA 3CIVA 3WNNA 3GXFA 3CHEA 3L4YA 1B30A 4OBSA 4QDMA 3T2PA 1CGYA 3A4XA 4PCSA 3CMGA 1WPCA 3MMDA 3ARSA 3B8SA 3VIJA 2GDVA 2BY1A 5FKYA 4F9DA 3B9AA 1GOQA 1JAKA 1QBAA 4F9JA 4HOXA 4A3YA 3WQ5A 2CBJA 3N18A 2JF7A 3FAXA 1BAGA 1OSEA 1V6VA 4HMEA 2O9OA 4AIEA 1E6NA 4X0NA 1UD6A 1LF1A 4AIOA 3F5LA 3SCWA 4KGLA 5HNNA 1ZBCA 2EPKX 1KXHA 3N13A 1ISWA 4NZCA 4TX8A 4IM4A 3VM7A 1M04A 1QI2A 4CN1A 3RM8A 3UG3A 1EA9C 2Y8KA 2GJXB 1H4PA 2J7BA 1GOKA 3T0BA 4D6JA 5A8QA 3U57A 3OG2A 1E5NA 3CGTA 4W89A 1TVPA 2ZUWA 3DHUA 3MSGA 3OGRA 4W85A 4H04A 4OBRA 2VR5A 1QI4A 3VUPA 3U7BA 2J75A 4J3VA 1H0GA 1EQCA 3AI0A 1HT6A 3UG4A 1UWTA 1ZBVA 2OSXA 4WSJA 4D72A 1MVYA 5HPCA 1JNDA 3NJ3A 5A1AA 4WSKA 4NRRA 2WNWA 1Q4NX 4YN5A 2XIBA 5HOSA 2ZX8A 4CGTA 2WMGA 4Z2HA 4HMCA 2ZUSA 5HBFA 1M03A 4WLCA 3CHFA 1CXHA 2ZUTA 1W1VA 1Q6CA 2VZVA 2WCSA 3PZQA 5ABFB 2B31A 1B90A 1NOWA 4X0VA 4FMVA 3M46A 1GOMA 4W8LA 1LL4A 3WFZA 2BY0A 1VIWA 1GORA 5I77A 2VCCA 3WNMA 1LWHA 4RE4A 3SCPA 2CYGA 1I1XA 3FAWA 1E0XA 2QMKA 4AEEA 5I24A 3L4XA 4C7GA 1GQLA 2PBOA 3AMKA 3PZUA 2CEQA 3VIHA 2QMJA 4AZCA 1XHGA 3AJ7A 4TTUA 4TTGA 2CETA 1LL6A 1ZBKA 5E0CA 3T2OA 5DMYA 3ZM8A 3WF3A 4OOZA 3MUZ1 4AD5A 5JIPA 2PC8A 2IXVA 2VZSA 1BQCA 1C8YA 3DHPA 2J25A 5D8ZA 2VCBA 5CLWA 5IHSA 1B31A 1UA7A 3RCNA 1W32A 5A2BA 3OLGA 4E2OA 2EPNA 2J7FA 1WO2A 2D24A 1TA3B 1XSIA 3PBGA 3T0DA 2J7GA 1AQ0A 2XGIA 3II1A 4U31A 1WNOA 4DUXA 1QW8A 3APGA 4PMDA 5E09A 3ARXA 1J12A 3BSHA 3OBAA 5FCZA 2EEXA 1UH2A 1R8LA 3UETA 3WD1A 3N04A 1UKQA 5LA2A 1V6XA 1CENA 2UY5A 4JFWA 1JGIA 4A4AA 4N42A 3WH6A 1U33A 3NCOA 2VOTA 1OGSA 2JIEA 4AEFA 3FHAA 2OYLA 1ISXA 1EQPA 2W5FA 3IJ8A 1JIBA 4M80A 1G1YA 2BY2A 1JG9A 3A47A 2PWHA 1YHTA 1J0KA 2QV4A 4OIFA 1V6UA 4HZ7A 2WWCA 3BH4A 5EMYA 1J18A 2DH2A 3FXYA 3FNDA 1EOMA 1PIGA 2PWEA 4HA1A 1I75A 2EQDA 4JHOA 1J10A 5EFDA 2E9MA 1GQJA 5AC4A 1UD8A 1G9HA 3RJYA 3THDA 4AC1X 1BTCA 4AD0A 2BVDA 2OWWA 1QHOA 2CNCA 5IFPA 3ECQA 3S2CA 1BYDA 1CBGA 4JCLA 2WZEA 1B3XA 5D9OA 4B3LA 3ARZA 3NIYA 5I5RA 4JZ5A 1BF2A 2ZXBA 3WH8A 3WNPA 4TX6A 1E6SM 1GUVA 1FP9A 3CHCA 3BGAA 1E4IA 2IXUA 4M1RA 2BFGA 4ZEPA 1PX3A 1WAWA 3AYRA 3AXXA 2D23A 2ZX9A 4W86A 1GVYA 1ZS2A 3F5JA 2DT1A 2CBUA 2WWDA 4DWSB 3JUGA 1TFVA 1E6ZA 3W24A 1L8NA 1KB3A 1E9LA 1E5JA 4GKLA 2J8FA 1K6AA 3SCTA 5EB8A 1VFFA 1OGGA 1V03A 4UQDA 1JYWA 1BYCA 1UA3A 2V3DA 1UH4A 1C8XA 3ZJKA 1CNVA 1CWYA 4MB1A 2XUCA 1UR9A 1QOXA 3WMCA 1KFWA 2XVPA 2FHCA 4FF5A 1FFQA 1MFUA 1HJWA 3RILA 1PEZA 2IUZA 3N15A 1FFRA 3WNOA 3W26A 2W61A 5IHRA 3L4ZA 2YKKA 1VFOA 1JAEA 2YBUA 2J8GA 2E0PA 2E40A 1UH3A 2A3AA 1BFNA 3L2MA 4J28A 3OZPA 3PZ9A 1G94A 4A3HA 3SCUA 3WQVA 1EO5A 2XM1A 3FN9A 2JFEX 1KR0A 4BZYA 1G01A 3OA5A 2PI6A 4J3TA 4CVUA 4KWUA 3PHAA 1UYQA 1XYFA 1B3WA 1J0ZA 3AXIA 3AMGA 4PCTA 3GTNA 4PMVA 3AXHA 1W2PA 4LX4A 5AC5A 2VRQA 3WMSA 2XVKA 3OIHA 3VU2A 2XHYA 2YL9A 1XSKA 4ZXLA 3ZO9A 4MB4A 1JFHA 4JFTA 5A6LA 1ZB5A 2XFFA 2WBKA 5LA0A 4CCCA 3QHOA 3QGVA 1W9PA 1QNRA 4XUYA 4URIA 3ZSTA 3U5UA 4H8UA 1W91A 4WKFA 1W3KA 1OD8A 4GO8A 3W37A 2JE8A 3CPUA 4AZBA 5C8BB 1X1NA 2YBTA 4P8UA 2WHKA 3M07A 1PX4A 5A6SA 2E4TA 2YL8A 3KE0A 1QW9A 3VMOA 3BAKA 5JBEA 2VR4A 1H3GA 1GPFA 4PMRA 4FLSA 1MW0A 1HL8A 1CLXA 2BHYA 2OWCA 3VGHA 4PBGA 1SMAA 1FH7A 4ZE4A 1VRXA 3OGSA 1OINA 3WBEA 3VIMA 3VD5A 4MAZA 3THCA 2WPGA 1R85A 2E3ZA 1C91A 4D6IA 1HNYA 1UZ4A 4OJYA 4KGJA 4L4PA 4ZFMA 5HXMA 3CHDA 3VX1A 2CHOA 3S6TA 1W1TA 5D8WA 1E6RA 1MQRA 3WDJA 1PIFA 2EPMX 2HISA 3QHMA 4YHGA 3LPPA 1NQ6A 3VNYA 1JZ4A 2VJXA 1EDQA 4WIWA 1QVBA 4U3CA 2W4XA 4BQ2A 1EH9A 1NWRA 2O9TA 1J01A 2GJXA 2ZWZA 4GI6A 3BCFA 1JYNA 4PMQA 3PN8A 2UWFA 1V3KA 1OT1A 1CIUA 1HL9A 3GXDA 1UR1A 4ACZB 5GNXA 4TUFA 5IXEA 3TONA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OWX A;  4NI3 A;  4CD8 A;  1JF5 A;  3A3H A;  5A6K A;  8CGT A;  3AHX A;  1PAM A;  1C7T A;  1GNX A;  5BXS A;  2VX4 A;  1JI2 A;  2YL5 A;  1DWF M;  3F4V A;  1XH2 A;  3W53 A;  4CD5 A;  2XSA A;  1OM0 A;  4LXF A;  3LPO A;  3ZR5 A;  3EDJ A;  1GVI A;  4D1J A;  1JFX A;  5CPQ A;  1GJU A;  3VDC A;  3OLE A;  4MPK A;  4MNM A;  2XVL A;  1L0P A;  1WDP A;  3K46 A;  3AIB A;  3RJX A;  1VEP A;  1C93 A;  3GDB A;  1KWG A;  2ZWY A;  2D20 A;  4J3W A;  4PSR A;  4BQ5 A;  1KXQ A;  2CER A;  1Q6D A;  2O9R A;  4NSB A;  4BQ4 A;  1VAH A;  2WLY A;  3EDD A;  2WHM A;  3WF1 A;  4FK9 A;  2VL4 A;  3FW6 A;  4KH2 A;  3VMP A;  1W9X A;  2XG9 A;  1DWG M;  3W29 A;  1KGU A;  4ZEN A;  3BXW A;  4ACZ A;  5HDR A;  4C7D A;  5DT7 A;  1WDQ A;  2PF0 A;  4P8W A;  3O2L A;  2WMK A;  3QOK A;  3ZIZ A;  3VII A;  4HP5 A;  2XTK A;  1UKO A;  2VNC A;  4CN4 A;  2BHU A;  1MWO A;  2V5D A;  5CG0 A;  4F8X A;  1VB9 A;  2J77 A;  1OD0 A;  4QAW A;  1CGW A;  1MQQ A;  2FGL A;  2YOC A;  1OIF A;  1MFV A;  5D9N A;  1FH8 A;  4CCE A;  5ECU A;  3CUF A;  1X6N A;  4EAM A; 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 1CTN A;  2G8Z A;  2PWF A;  5FL0 A;  4GI9 A;  3QR3 A;  1V3M A;  4AD1 A;  3F5K A;  4GQQ A;  2GDU A;  3TP4 A;  3ALF A;  1OT2 A;  4AYS A;  1NOF A;  4Z2J A;  4GZE A;  3SUU A;  1I1W A;  1HP4 A;  2EPO A;  2J7C A;  4DWS D;  1V6W A;  4TVD A;  1B3V A;  5CJ5 A;  3HN3 A;  4UFM A;  3VGF A;  4Q22 A;  3VDH A;  3L4W A;  3PZN A;  4AXN A;  2WXD M;  3BMV A;  1BPL B;  3W4R A;  3NUK A;  3CMJ A;  3GH4 A;  1R7O A;  3VIF A;  1QNP A;  4M82 A;  1US2 A;  4DUV A;  2XJ7 A;  3WD0 A;  1V02 E;  5FOO A;  4H41 A;  3N11 A;  3GNO A;  4TXE A;  1JI1 A;  3EDK A;  1DHK A;  3K4A A;  4FLQ A;  1BG9 A;  3HJE A;  2XVN A;  1E55 A;  4W7U A;  1V3J A;  3RIK A;  3AHV A;  5BRP A;  1JZ7 A;  3VOC A;  1KBB A;  5ABF A;  1TE1 A;  2X1I A;  3BMW A;  4QLL A;  3WUE A;  1B1Y A;  3AZT A;  3BCD A;  1JZ5 A;  1ECE A;  3O9N A;  4CD7 A;  3O6A A;  3AHY A;  3NYD A;  3VGB A;  4RE2 A;  3GH5 A;  1JZ2 A;  4FLO A;  3AIE A;  1NM9 A;  1UWI A;  4N0R A;  1E40 A;  3WDQ A;  1E70 M;  4CU7 A;  4D6G A;  3NSN A;  2J7D A;  9CGT A;  1BYB A;  1NH6 A;  3RDK A;  3K1D A;  4P7L A;  4UTF A;  4PUE A;  2D0H A;  1ISZ A;  2JEQ A;  3VMN A;  1GOW A;  2QLY A;  1FA2 A;  4CUC A;  1IT0 A;  1UKS A;  3AQU A;  2DQX A;  3PTQ A;  1R87 A;  2G3I A;  3MS8 A;  3IJ9 A;  6CGT A;  3WMB A;  1OB0 A;  1JZ6 A;  3GXM A;  1VBR A;  1W3L A;  3WH7 A;  2RGM A;  1QHP A;  4QCE A;  1W2V A;  4XX6 A;  5A6B D;  4H2C A;  4PMX A;  1ITX A;  3MU7 A;  4W88 A;  3U5Y A;  4D6D A;  2BXY A;  2W91 A;  3ARW A;  1JNE A;  2YDS A;  3EDE A;  4PTM A;  3UER A;  2AOS A;  3ZT5 A;  1DTU A;  4W8B A;  2EBN A;  3EYP A;  1H5V A;  4JL2 A;  4JKL A;  4YHE A;  2WZH A;  4DM2 A;  2JIW A;  3G6M A;  1ZBW A;  2A3C A;  1JDD A;  1ISY A;  3ZSS A;  3SUT A;  3TTY A;  4CD6 A;  3WBA A;  1RH9 A;  2YIH A;  5I79 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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4ZE4A

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