3S83A

Eal domain of phosphodiesterase pdea
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
256
Chain Sequence
LALEADLRGAIGRGEITPYFQPIVRLSTGALSGFEALARWIHPRRGMLPPDEFLPLIEEMGLMSELGAHMMHAAAQQLSTWRAAHPAMGNLTVSVNLSTGEIDRPGLVADVAETLRVNRLPRGALKLEVTESDIMRDPERAAVILKTLRDAGAGLALDDFFSSLSYLTRLPFDTLKIDRYFVRTMGNNAGSAKIVRSVVKLGQDLDLEVVAEGVENAEMAHALQSLGCDYGQGFGYAPALSPQEAEVYLNEAYVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein
molecule keywords GGDEF family protein
publication title Crystal structure of EAL domain from Caulobacter crescentus CB15
rcsb
source organism Caulobacter crescentus
total genus 87
structure length 256
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 3s83A00
3SY8A 4FOKA 4LYKA 2W27A 4LJ3A 4Q6JA 5MF5A 4RNJA 3N3TA 5MKGA 4AFYA 3PFMA 3GFXA 4FOUA 4Y9PA 2BASA 3GG0A 4HJFA 4RNIA 3S83A 3TLQA 3HV9A 4F3HA 2R6OA 4Y8EA 4Y9OA 3KZPA 5M1TA 3GFYA 4F48A 4KIEA 3PJXA 3PJUA 3GFZA 4FOJA 3PJWA 4J40A 3PJTA 4ES4A 4RNFA 3HV8A 4AG0A 4HU3A 4Y9MA 5MKGB 3U2EA 4RNHA 3GG1A 4Y9NA 4HU4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1US2A 3M41A 3A6OA 3C5QA 3HA1A 2ASHA 3UPWA 3ARTA 2CZ5A 4O12A 4PBFA 1VGAA 4DO6A 3BGGA 1MWOA 5FAJA 1KM6A 1Y5VA 4W88A 3ZZ1A 4LYKA 3EB4A 3EMQA 4ZQMA 3SO7A 1DIDA 2GUBA 4CQAA 1CGTA 3LERA 3OYXA 2V38A 1H1NA 3LGEA 3KHDA 4ECLA 1JZ6A 1E9YB 5CGQA 3TW6A 4I9MA 4B2DD 2DH3A 3KOXA 2EO7A 4ALDA 5FL0A 4KESA 3DENA 4NZJA 3GXFA 3RPMA 1IR1A 3HGJA 3N6JA 1XGZA 4W87A 4CD5A 5FAGA 2VWTA 3AIUA 1A5MC 3AJ7A 5B7YA 3LG3A 2IQ0A 4QG6A 8TIMA 2VWSA 4NHVA 3QKZA 5CZKA 4CQ8A 1MZHA 4JYEA 2OX1A 3ZVHB 2X1SA 5J5DA 4Z2JA 1EUAA 4OZOA 4IUOA 1LWHA 3NOEA 4XZLX 5EBAA 2A4AA 1XH2A 1YTEA 1U30A 2WKLA 1GT8A 2P10A 2GYIA 1V3LA 3BW3A 3VCNA 1ESWA 2SFPA 2CXEA 2J66A 1DTNA 1XIMA 1EZWA 4D71A 1PUDA 2NV1A 3TYUA 4JTQA 4TX8A 4KRUA 2VZTA 3QJAA 1HNYA 2CHNA 4M6UA 3ISIX 2Y89A 2VDHA 5HK4A 4N9DA 1EF2A 4NRSA 3IGXA 3UZ5A 1Q6GA 5ABEA 1KFBA 4ONVA 2HK1A 5AC7A 4NZ1A 4FNTA 4KWVA 1ZS2A 3RCMA 5K9CA 5MKGA 2ALDA 3ZXWA 4AX7A 3UXKA 3WMBA 3DZ1A 5IHSA 4EWND 2A7PA 3C6CA 1K7XA 4H6RA 4S39A 4QX4A 5LIYX 4W8AA 3ABRA 1VFOA 2BHZA 4FA3A 3FNDA 2YSWA 1GZJA 3KM8A 5IXEA 2PPGA 3RRAA 1M7OA 3QC3A 3R11A 3CHVA 1G0CA 3W2JA 1EDGA 1OCBA 3AIWA 3C2OA 4H1ZA 1QHPA 4HA4A 2F84A 3TWBA 1UZ4A 3CV7A 1KFEA 2XIIA 3A5FA 2FMNA 1RY8A 1XRSA 3IJ7A 1JCLA 3O05A 4FK9A 4H01A 2VOTA 1UH3A 4NG3A 4XKYB 4FALA 3D5HA 5DT7A 1JNEA 1KCZA 2DZBA 3WD4A 3CQIA 4HA1A 4KERA 4M51A 1S2CA 3W1TA 4Y9MA 3RG6A 1QI3A 3P82A 1KV8A 3GYEA 2O4QA 3TYEA 3PZMA 4K8GA 4RV3A 1D3GA 2F61A 3TJ4A 5BZAA 1TWWA 2Z1SA 2PI6A 1IEVA 4G56A 4QCFA 2ZRVA 2TRSA 1XLDA 4FLOA 2R8WA 1HJQA 1TV4A 3CPGA 1KCXA 1FBAA 1V6VA 4H9YA 1OIFA 2W66A 4MB1A 5DMNA 1MO0A 5LNVA 3GDMA 2XFWA 4GX9A 7ODCA 4MLJA 2QS8A 1YDNA 3PZIA 3WNMA 1S5MA 1MQPA 4GVFA 2CU0A 4UNLA 4GGBA 2PF0A 1G01A 2DW6A 3PN8A 2J77A 4GY7A 1OYAA 4DWSB 3WBEA 2AMXA 4OV9A 2PWVA 4L61A 4JKLA 5KZEA 3TUUA 4P7OA 2Y4SA 4H6EA 1BWVA 3VE9A 1K9TA 1I1XA 3SZ8A 1BD0A 1EH9A 3EWWA 3TR2A 3FJ4A 1EB3A 2P0OA 4WSKA 1WDSA 4HCDA 1S2VA 3NTYA 1R5YA 4TV6A 3MKVA 1FTXA 3DG6A 4DZHA 2MNRA 3W73A 2ZUNA 2NV2A 4OBRA 3GBDA 4GQ0A 1T99A 1D8CA 5G4WA 3A21A 1FCBA 2G97A 3VI2A 3LCWA 1J0IA 4F0LA 2OU4A 4W86A 1Z69A 1M41A 4UWMA 2PDBA 3A13A 3KE0A 3UY8A 1XL9A 1IXNA 3RCNA 3GVVA 4ERAA 5J5RA 4DXVA 1W54A 1XW8A 5M3WA 4YJ5A 3MMDA 1XLGA 2E8ZA 2ZZ6A 3VNLA 4XTDA 1R2SA 3K5XA 5CCZA 3KOFA 3KDNA 3VX0A 1RCOB 3BW4A 2PDLA 2D2GA 1TA3A 3PJXA 3F2BA 2YDRA 2WSKA 3WJWA 3GG7A 3LTSA 4LPCA 4GXWA 4F0HA 1KGUA 1H51A 3LLDA 3TNOA 4HT3A 2RGMA 1HIZA 2I5GA 1U83A 2EF9A 3B9OA 3IIOA 1GOMA 2QUVA 1NQ6A 1KFCA 3DFSA 1NQKA 1Y65A 3VOCA 3UCDA 4LH8A 1IZJA 2WNNA 1OWQA 4L56A 2JE8A 1WX0A 5TF0A 2G5WA 1YADA 2DVUA 4IPLA 1HKMA 3WQEA 1FKWA 4FX8A 4MWAE 3USBA 4GO8A 1XLFA 3BARA 1PAMA 3PPCA 1FY6A 1XYAA 4PUDA 4H8VA 2G96A 1CGUA 4TX6A 3PC0A 2WJZA 1Q7MA 2YCIX 7ENLA 3CUJA 2VQTA 1SW3A 3RM9A 4F0MA 3FSUA 1B9BA 4MKVA 2I9EA 1GPFA 4E6MA 1ML1A 5EA9A 5HPOA 5LNUA 3AXKA 4QTGA 3ORWA 1EJTC 1VFMA 1W31A 4KCTA 4HHHA 1W3TA 3BC9A 3UESA 3LENA 2FGBA 3N2OA 1LQ0A 4N4PA 4ML4A 2XZ9A 2Z1WA 3UWEA 4ADSA 1AL8A 3TYDA 3W7LA 4TVCA 4TIMA 1VIZA 1U1HA 5I24A 3OG2A 4G8TA 5B80A 5I6SA 1OF8A 4KRTA 5C70A 4MJ2A 3QW3A 4W5ZA 4UZSA 1G67A 3B03A 3WUFA 3WEMA 2BP1A 3LQLA 3LGGA 4UTMA 5AHIA 4FNUA 1ECEA 4ORIA 1JCYA 1C3FA 4DF0A 1TG7A 3TNBA 2PDUA 1UUOA 2TODA 4IGSA 1DWAM 4MNMA 3EBVA 3QVQA 3HBLA 1E3ZA 1UW9A 3G5EA 5I07A 3L5LA 4WLCA 2D2OA 2EPKX 3QHNA 1AJ2A 2HEJA 2VURA 1AZ1A 2QJMA 5EFFA 1EP3A 5F1VA 3K1DA 4GXPA 5E0KA 4C1KA 1A3HA 5FJPA 2QAFA 2PTXA 2ZUVA 1UIPA 4HN8A 5XIMA 4Q7NA 4E8DA 1C8VA 1Q45A 1ITCA 5EU9A 2VCCA 4LUIA 2V67A 4LX4A 3CZLA 4PUMA 2BSLA 1CGVA 1D3HA 1W1A1 3T05A 4NYYA 5DY3A 3KCJA 1LZOA 3N2CA 4JIIX 4L4OA 1X39A 2ZXQA 3IJ9A 2WANA 5BXRA 1B3YA 4HIBA 4H8UA 2RJGA 2PDFA 3GNRA 2C7FA 2WQDA 1NDVA 5AB3A 3W01A 2FYMA 3GTXA 4N7QA 1WDWA 3WBWA 3BICA 4JKKA 1OFQA 4MF4A 4ACYA 3TJXA 3W28A 1HTIA 4H8HA 2YGYA 3DI1A 1P6BA 3I10A 3S6TA 1BTCA 4I7UA 1R3SA 1YPIA 1OCQA 4AG0A 3RR1A 2O7QA 2CLOA 2BLEA 2E9BA 3CWHA 3E02A 3ITXA 5HATA 2ZZ4A 3EWUA 3S5NA 1FHVA 3TSDA 3U3HA 3Q37A 3DCPA 3SR7A 1YNYA 1B4KA 1XBXA 1HXJA 4PUUA 1BVNP 1T8QA 2O9TA 3DFHA 1CECA 3MUZ1 5AHEA 3UXAA 5C9ZA 1GJWA 1VIWA 4DBDA 4NXKA 1XIEA 5FSDC 4FLSA 2ZXBA 4RE0A 2FDMA 3T78A 3UNDA 4YNGA 4AHQA 2EQDA 1D8WA 4Y9OA 3T6CA 3TK7A 3M0VA 1JIBA 4H2CA 1YE4A 3M44A 1TREA 1IIHA 1EJVC 1PS9A 2GDUA 2RAGA 3KUMA 1HUVA 1H62A 4HQVA 3UETA 2PF8A 1TTIA 1JYVA 5DXYA 5D37A 2GQAA 1Q2RA 1UG6A 2YL6A 3URQA 1F6YA 3VKDA 4GA8A 2OG9A 3CBWA 2RJHA 3WLNA 1RJRA 4HOZA 6REQA 4YTUA 2C1IA 2VEFA 3U48A 3KHJA 4MJZA 3U5YA 2VFDA 4PTMA 3EB3A 3C2RA 1XGEA 3MV11 1HJWA 3IAPA 3K8KA 5G2HA 3ZQ9A 2GGJA 2A85A 3GDKA 3G8EA 2XGZA 3E74A 5I06A 3GXDA 2XVNA 1XDMA 5HA7A 4KCUA 2D2JA 3SCSA 3K8MA 3CH9A 4X22A 5HJXA 4C6PA 3KFTA 3HQ1A 2HSAA 2WMHA 2P0IA 4UQBA 3Q67A 4MHBA 4KFOA 2C18A 4OV4A 3WK0A 2E1DA 5BRQA 2KAUC 3VNKA 5CPOA 2NUYA 5I78A 3W6MA 5CC6A 1U33A 3BAXA 1W3JA 4PUWA 2CBUA 3MCOA 1LTDA 1P6CA 1KW1A 2IUZA 3UWYA 2WJEA 1ISZA 3FJ6A 4G1NA 4ZB5A 5KZMA 1R3RA 2DH2A 1W1YA 2WSPA 1HP5A 2HWGA 3FDKA 1E40A 2BX7A 3Q65A 5G1YA 1OD0A 2ZADA 3P6LA 2VZUA 4FF5A 3VIPA 4UR9A 3VKAA 4JFUA 4XK2A 1BAGA 1H7NA 3CTTA 3G0UA 4ZE5A 3LMYA 2XZ7A 1WV2A 1W2VA 5H91A 2QDDA 1A4LA 4W7VA 5E6YA 4L6DA 2YL9A 2PD5A 3LXBA 1MW0A 3TAKA 1TMHA 1RQEA 3CMGA 1FX6A 4J3ZA 3BLFA 2P88A 3CT7A 1SJAA 1RBAA 1K9DA 3V4BA 2E1WA 3EWDA 5AC8A 1VFSA 3ZOAA 1F3EA 4QDWA 3SI9A 1XPYA 4MUPA 4WRHA 5TNVA 3L66A 3V16A 1OFEA 4A8NA 1M68A 1DJIA 4O1EA 2VGFA 3W9ZA 1XFCA 1Z9AA 2AL2B 3QPEA 3I7QA 4FXSA 1IT8A 1DBTA 4LUSB 3PUDA 1QU4A 2XGBA 1YQ2A 3VM7A 1XIGA 2Z2UA 3GYCA 3GH4A 2UY3A 1VPXA 1PL9A 4RV8A 3E12A 1HGWA 1VCVA 4DHGA 2W3ZA 2X09A 3BTNA 4JFSA 2PODA 4JDBA 3N2BA 4FB7A 5PTDA 4X63A 1RXOB 3TA6A 4HJWA 5DO8A 4Q8WA 1B3ZA 2E0PA 1FWSA 4B5WA 4N2YA 2GVJA 2DIEA 4X61A 1C8YA 3MO7A 4JTCA 3WD2A 7A3HA 1OC7A 2JF7A 3AS0A 3TOPA 4AWSA 3OG3A 1G9HA 1FWRA 2YLAA 3RX2A 5I00A 1FH8A 2UY5A 3NDOA 1CDGA 4WSJA 3OPSA 4RW3A 3T0AA 3WQOA 1MEIA 4MIMA 4TO8A 4NUWA 3PPFA 5F7UA 3D3FA 3VIFA 5I3HA 1P7TA 3RILA 4UNIA 1W5PA 4YTTA 3NM3A 2W4XA 1B3OA 2NSXA 4U33A 2D24A 4FR6A 3AMLA 4HHLA 1X8CA 3H12A 3VABA 1MXSA 3WN6A 4UTFA 4IIFA 5K4ZA 5HMFA 4PUKA 2PDMA 1RBOB 2QUUA 4DNMA 5AZ0A 1ME7A 4I7WA 3CT2A 4JYFA 1NF7A 1JF6A 1BKSA 3GVWA 2Z1XA 2PWHA 3CS2A 3WJXA 3EAUA 3TLLA 3A4AA 1K9FA 4D9PA 1GVFA 4A8RA 2D22A 4KEUA 2GL5A 1VJSA 1I2RA 3N11A 3IK2A 3RU6A 4KEVA 4S23A 1QPNA 1RY0A 4XD6A 2CLLA 1OFOA 3NDYA 4JTHA 5TBOA 5EMYA 3MDUA 1TRIA 4Q4QA 3C3NA 3E2RA 3ZT5A 5LKYA 4OBSA 2XFRA 2YJQA 1TQJA 4EVZA 1A49A 2QPUA 5HNUA 5G1MA 2RFGA 3T08A 1O5RA 4NJHA 1E0UA 3N6HA 2PDKA 3W1LA 1HL2A 5HMSA 3GC5A 1MZRA 3BAWA 4LEQA 1ITUA 2W9MA 1A80A 3N12A 3ARUA 3S2NA 3S42A 1UJPA 3TYZA 1BHGA 3TE9A 3W1RA 3KLKA 3PZQA 2YBTA 3GD6A 2DSUA 5C7VA 5CBJA 4Y7EA 4B92A 3A9BA 4H83A 1JZ3A 1XYLA 4KWOA 3WG6A 1M3UA 4B91A 3DHFA 2Y85A 4X9YA 3L4VA 3FGCA 3WFLA 2J8GA 1Z3NA 4AZCA 1TIMA 2WVVA 2DSVA 2Z7GA 1V7YA 1F3WA 3EKLA 5FF0A 2QXWA 2ZC1A 3N9KA 1T8XA 1XINA 3RO8A 4IQEA 4Q6JA 2VRJA 2DQXA 2DZAA 1F07A 4IGHA 3PUOA 3DESA 4L1XA 1NTHA 1ZJHA 3URBA 4ICMA 3H21A 3VKJA 1XLEA 2CESA 3TTOA 4TU1A 4M24A 1OD8A 1MQRA 4YWIA 4PTVA 4LF1A 1K8XA 4JHOA 4K7YA 1EGZA 3OA5A 2Y1HA 4XBSA 1SJDA 4JQ3A 3DUGA 2W67A 3VMOA 3BCDA 2OVLA 2ZVRA 2ZZ1A 4UZUA 2J7EA 1FDZA 2ISSA 2CFFA 1HG3A 2IKHA 5FEPA 3QY8A 2E6YA 4UTJA 4QCEA 4WKFA 3M7SA 3GNDA 4Y6GA 3B0VC 2WO5A 3SAZA 1CXFA 4BK9A 1VRDA 3CM4A 5A94A 3VAVA 1VEMA 4AF0B 1MFUA 1R7AA 3R79A 4TV5A 1UP2A 3OODA 4S3GA 1F2JA 3FYYA 3MJMA 1UKSA 3OZOA 5G4HC 1S2WA 5C9WA 3DI0A 4KBXA 4N02A 2WJDA 5FEXA 4CD8A 4L1GA 3TR9A 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