5CPQA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - apo form
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
518
structure length
512
Chain Sequence
ISVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVPSEAKVAMVGRWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 190
structure length 512
sequence length 518
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5cpqA01
3F5KA 3PZ9A 3CMGA 3ARYA 3CZKA 2XGBA 2XVLA 2VR4A 1RPKA 3APGA 1JD9A 4X9YA 4E4PA 5CPTA 4W7UA 1HNYA 1H11A 5GPRA 2WMKA 4EANA 1GQIA 3BH4A 1DEDA 2FDMA 4HOXA 1NP0A 1EOKA 3WL1A 1XC6A 2FHBA 2ZUVA 4JFVA 1JD7A 2V3GA 3WQWA 4M81A 3NCOA 1KGUA 4GIAA 1LLOA 2A3HA 4W88A 2XSBA 1CGWA 4M8UA 1X6LA 3SURA 2Y5EA 2J47A 2DSWA 5ABFA 3VTRA 4BCEA 1B3XA 4W87A 1NP2A 4H2CA 1BAGA 2VCCA 5FL1A 3AIEA 3AIVA 1E73M 1CXFA 3B9EA 5CSYA 1E0WA 2E8ZA 1GOOA 1DWHM 1KQZA 2WWCA 2JFEX 1J0ZA 4QCEA 2DIEA 1ISZA 1NM9A 1E0VA 4F79A 3CHCA 2E3ZA 1JYVA 1QHOA 1W3JA 3VGGA 1E4MM 2VTFA 2YDRA 3AHTA 3RPMA 3AXHA 2ZUNA 4S3JA 3A6OA 4YHEA 4AC1X 1E6XM 3AS0A 2OSWA 1ZBCA 2D2OA 2E40A 2DT1A 3PN8A 5E0CA 1BG4A 2XFRA 2BXYA 3L4XA 5AY7A 5DT5A 3ZSTA 1H5VA 4AZHA 3U57A 4CCEA 2XVKA 1BSIA 1R7OA 3M6DA 1PJ9A 2PC8A 5E70A 3N1AA 1FH8A 4GO9A 3VDBA 3VMPA 1QHZA 2CERA 4PCSA 1VEOA 3U7VA 3QGVA 1V0LA 3K8MA 2Z1KA 4HMEA 3VIPA 3BCFA 3W6MA 1UR8A 3MU7A 3DHPA 3GYCA 3RILA 1QVBA 5A1AA 2XIBA 3CGTA 5HXMA 1UKTA 3OGVA 1US3A 3WQ5A 3LPPA 1WZAA 2VCBA 4GI9A 4ZE4A 1GHSA 3NSXA 4UNIA 1EHAA 4URIA 4CD8A 1E1FA 1BG9A 4BQ4A 2GDUA 1GCYA 3VNYA 3T2QA 1UG6A 1SYTA 2J8GA 1C93A 2E9BA 1KBKA 3BAYA 2VQUA 4NRRA 1EO5A 1E6ZA 1HJUA 1K9EA 3AICA 4WK9A 1J0JA 4P7NA 3VX1A 4CU8A 3N13A 5IFPA 2BY1A 1GQJA 4U5KA 1UR4A 3AJ7A 3I3EA 1GZJA 2HISA 4DWSD 1MW3A 1M01A 4GZJA 4UCFA 2WCAA 3ZJ7A 3VMNA 1HXJA 1MFVA 3SCSA 1W2VA 3ARWA 4LXFA 1DWAM 2X1IA 2D24A 5I2UA 1BGGA 2VCAA 4DM1A 1W1VA 1QI3A 3QOKA 1UR0A 4MJ2A 3VIHA 3QHNA 1UWRA 4WKFA 4CD4A 5AC4A 3SUWA 1AQ0A 3RCNA 5DO8A 5A8NA 3GM8A 2VQTA 3PZGA 4C7GA 4NSBA 2J77A 3VUPA 1NOWA 2J62A 2ZUTA 2XPKA 3J7HA 4GXPA 5AC5A 2BV9A 1C92A 1J0HA 4TOQA 2WVVB 1TA3A 2PWEA 4TX8A 4M1RA 2YIHA 1VJZA 1JIBA 5CXPA 1WKYA 4UFKA 1C7SA 1KXQA 4JFTA 2WSPA 3NSNA 4HU0A 2UY3A 2VVNA 3WQVA 1JZ4A 3KL5A 4UZSA 4U5IA 3S6TA 1V3JA 4MAVA 3N15A 4IUGA 1XD1A 5C70A 1NOFA 3CO4A 4AEEA 4X0NA 3FAWA 3VIKA 1J12A 3FHAA 2Y8KA 1XD0A 3GBEA 4P7OA 4AW7A 2Y24A 1GQLA 4PSRA 1W9PA 1G5AA 4P7LA 2OYLA 3OGSA 2IXVA 1GORA 2BHUA 2VI0A 4E8DA 1WNOA 3VDAA 2BVYA 2X8RA 1Q6DA 2W61A 4P7RA 7A3HA 4HA4A 4NF7A 1XH2A 4PUDA 2GK1B 3LPOA 1TCMA 1VENA 4AMCA 4HZ8A 3VIFA 1CNVA 3GBDA 2XHYA 3WD2A 3VGHA 3LMYA 1K6AA 2WB5A 3BAWA 4R27A 2FH6A 4PMXA 1ISYA 3WSUA 4K68A 4GI6A 3QHMA 3VGFA 1ISWA 2O9TA 4HZ6A 5CPSA 3VGEA 1PBGA 1VF8A 5A8MA 3GH4A 4AD0A 1J0YA 4HZ7A 1CGUA 4ATWA 3SCRA 1QPKA 3QR3A 1OM0A 2Q8XA 4Z2GA 2O92A 1B3ZA 2ZXQA 4PMZA 2J25A 2QPSA 4JHZA 3RO8A 2GVYA 3VKKA 3WF0A 3IK2A 3ZIZA 3ZT7A 4HPHA 3G6LA 3ARQA 2NW0A 1OD0A 4ZFMA 3DYMA 3W6LA 3L4TA 3WD0A 2WMJA 2YL6A 8CGTA 4OIFA 3FXYA 3CZGA 2XM2A 1OGBA 5A8OA 4RL3A 3DECA 1UKQA 2ESCA 3B9DA 2VJXA 1WPCA 2WMIA 1CTNA 3ECQA 5CJ5A 2W62A 2PWDA 3W29A 3T08A 3PZMA 3RJXA 1WP6A 4J3XA 1G1YA 2WWDA 5LYRA 5BXTA 2JIWA 1ITCA 3NIYA 4U2YA 2OLHA 2IXUA 2YKKA 1G0CA 5E09A 1CLXA 4PMQA 4BQ3A 1WDRA 2WM0A 3AS3A 3BCDA 5GNXA 4GINA 4V27A 2ZWZA 3L4WA 3VDHA 2CPUA 1PPIA 4S3KA 2WK2A 4MNJA 5ABFB 6CGTA 4OOUA 3ZR5A 3WF2A 3CH9A 5BRPA 5A2BA 1DTUA 5HPOA 3ZJ8A 3VGBA 1TFVA 4TUFA 4AD3A 1VB9A 1BLIA 1M04A 3VDCA 2ZOXA 4DUWA 3AIUA 2J7FA 1RD6A 5A95A 3PZTA 2DSKA 1S46A 3THDA 5A6LA 4AD1A 1CECA 5DMYA 3WUGA 2XFFA 2VRKA 3CIVA 1PEZA 3CHFA 1JFXA 3QOMA 1OIMA 4MB3A 1E3XA 1OCQA 4PMNA 1XGZA 4GQQA 4D6CA 1RP9A 1M7XA 1DHKA 1VFFA 3K4DA 1XSJA 1VJSA 2CCRA 4AZ5A 4UFMA 4AY1A 1E56A 3NDYA 3VM5A 3K8LA 3PZIA 2JF6A 5FL0A 1H41A 1KR0A 1NARA 4H8HA 1HVXA 3OG2A 2D0HA 4B15A 1LG2A 4UFHA 4MTVA 3IAQA 5ABHA 5A6MA 4HA1A 2VZVA 4AZIA 1PZ3A 5E6ZA 3FHQA 3TONA 5IHRA 1JZ6A 2VL4A 4J3VA 3RM9A 1XYFA 5M17A 1OGGA 4PYSA 3AMDA 1V3KA 2ZUWA 4MAZA 1WDSA 4M82A 3MANA 3K8KA 4M56A 4P7QA 1E55A 2DPEA 2VVSA 1DWJM 3WBEA 3UERA 1PIGA 1QI0A 4EKJA 1MW0A 5CSUA 4C7DA 1E3ZA 2X05A 1V3LA 4UQEA 1GJWA 2G4FA 4WJXA 3KL0A 3K46A 2AOSA 7TAAA 3NUKA 2E9MA 2IUZA 2ZICA 2XVGA 2BNJA 3PZUA 3ZOAA 3ARVA 1PX3A 2XIIA 2GFTA 1G01A 4PMVA 3POHA 3T0AA 1US2A 1JFHA 2E8YA 1MXGA 4JIEA 4ML4A 3K1DA 3WUEA 1FHLA 2D20A 5BROA 1W9XA 3ARZA 1I1XA 1UR2A 4LGXA 5TD4A 2J79A 3HJEA 4UQCA 2WCGA 1IZKA 1PZ2A 1W3HA 5CLTA 4RE3A 4L4OA 5EB8A 1UWUA 2W67A 5LA1A 1V6WA 1EH9A 3CUIA 4GPNA 1E40A 4OBRA 4JFWA 5D8WA 2ZX8A 4V28A 1EQCA 1H49A 1QNPA 3AXIA 4HMCA 1TA3B 4PSPA 2XG9A 5F7UA 3TTQA 4CUCA 4AD5A 4MNKA 4BQ2A 1H0GA 1HJWA 1B3WA 1JXKA 1ZJBA 2WPGA 4OBSA 1FP9A 4JHOA 1TZ7A 2G41A 3VD7A 5I77A 1K9TA 2DGAA 3AXXA 1JAEA 1M53A 3W0KA 3VO0A 4HOWA 5A3HA 3SCNA 3ZJKA 1CZ1A 2CHOA 1B30A 2OWCA 3THCA 1OT1A 3CMJA 1KXTA 3VNZA 4CVUA 2EPNA 3UESA 1HT6A 5EBAA 1Z32X 2WAGA 5GNYA 4UQBA 1EDQA 1SMAA 5DEZA 2BS9A 4MADA 2WMGA 2PWGA 3W37A 5I79A 2EEXA 3T09A 4TVCA 4J28A 4UFLA 3SUSA 4P8UA 1F4HA 3MV11 4W8AA 2PBGA 2DH3A 2XVNA 3HN3A 4YN5A 2YOCA 1UWTA 2D0GA 2ZX9A 3WDPP 3AIQA 4UOJA 3EDJA 1E6SM 1Q4NX 2WKLA 2YDSA 2YL5A 1V0KA 4UFJA 1UH4A 2FGLA 2WMFA 3AYRA 3KEHA 2WHKA 1Y7VA 3F5LA 2X0HA 1JAKA 1KXHA 1LJYA 1U2YA 1QNRA 2BY3A 1IT0A 1MVYA 2CETA 3II1A 4DWSC 5GQBA 1MQRA 2AMGA 4XV0A 4XX6A 1GOQA 3WF3A 4Z2KA 2XUCA 3WDHA 3M46A 2ZUMA 3SCPA 2C8NA 5HDRA 3ZR6A 1JYXA 4MDPA 1R7AA 5ABEA 3GDBA 4IPNB 1E72M 4XUYA 3L4YA 2V3DA 2BVDA 2WC4A 1WCGA 4R5EA 3POCA 1KWGA 3LPFA 3W4RA 1HKIA 3D3AA 2NSXA 2YA1A 2YJQA 2HVMA 1OWQA 3VD5A 1AVAA 4OJYA 4CCDA 2EPLX 2WMIB 2DIJA 2B31A 1UR9A 1UZ4A 3GXMA 1C8YA 1VFOA 4FMVA 1CBGA 3AIRA 2XFYA 4QLJA 3N18A 1CENA 5ECUA 2UWFA 3I3DA 4J3TA 1KCLA 5JBFA 3WIJA 3GH5A 1J0KA 1TVPA 2BY0A 4P8WA 4P8XA 4PEEA 3F4VA 3RMEA 3AMLA 1MWOA 4PMRA 5BWFA 1XSKA 1Q6EA 1HN1A 4X0VA 2YLAA 5I6SA 4B3KA 3KZSA 3WDQA 1W3KA 4W84A 3PTQA 4ZE5A 4TVUA 4A4AA 3UG4A 1D2KA 3RJYA 4Q7NA 3WF1A 1XH1A 5A2CA 1CLVA 1J01A 2X0YA 3OLDA 1W1PA 3ARUA 3PTMA 1JYNA 1GPFA 1V6YA 1WZKA 5HNNA 3BC9A 1ODZA 1K9FA 3IJ7A 1KR1A 3ALFA 3GZAA 1EHNA 1R86A 3SIMA 3WMBA 1KXVA 3EYPA 1CXHA 4XZBA 3BXWA 4D1JA 2BHYA 2FHCA 1JZ8A 4W86A 1UD4A 1UD3A 5CGTA 3GXIA 4PN2A 4WF7A 1V08A 2WHJA 1EQPA 4OOZA 2W66A 4W5UA 1WDPA 3E1F1 2D0FA 3FY1A 2DT0A 1UQYA 2ZE0A 4ZXOA 1C8XA 3B8SA 4KRUA 2BFGA 1XRVA 4Z2JA 1QNOA 3WDIA 3AMKA 2VRJA 3WQ6A 3WEMA 2E9LA 2XM1A 4IISA 2OYKA 3WD4A 1R87A 3VPLA 3IANA 1JZ3A 1CDGA 3WBAA 4CKQA 2CITA 1V02E 5A6BD 1WDQA 3WNLA 2D23A 4H8VA 3SUUA 1LWHA 4IPLA 3WQ8A 5I23A 4QAWA 1V6XA 5M5DA 3RM8A 1MXDA 3GNOA 1BPLB 2YL9A 2J7EA 3OZOA 2ZIDA 2D22A 3VD9A 2GJPA 3CHEA 4D6EA 3VIIA 2Y4SA 1QBBA 1PAMA 3WKZA 2QMKA 1K9DA 4PTWA 2EQDA 3AOFA 5D9NA 2WVUA 5BYWA 3PZOA 4TX6A 1E6QM 2W5FA 3NJ3A 3WEOA 3CZ8A 2G3MA 1BYAA 4LYQA 4QFUA 2CNCA 4OUEA 5LA2A 3FW6A 1FHDA 4ACYA 2CBIA 1LL7A 4AXNA 1IZJA 1GUVA 3K4AA 1LL6A 3VMOA 3UR7A 3NYDA 1H1NA 2EPOA 2VRQA 1VEPA 4KWUA 5A6KA 2CXGA 1VBUA 2W91A 1CPUA 1H3GA 2VZSA 2WLZA 3PZVA 7CGTA 1E15A 3MMUA 5JBEA 3DHUA 1GOIA 2VZUA 3B9AA 1FA2A 3T2OA 3BAJA 1JF6A 2Z1SA 1WB0A 3WENA 2XGIA 1E1EA 2ZX7A 1VFUA 1ESWA 5A6SA 3I3BA 1GVYA 1I75A 3U5UA 3A4WA 3FNDA 3AIWA 1B0IA 2VX7A 4CN1A 1W1TA 3DC0A 3CPUA 1HP5A 3TTOA 1CXLA 2ZX6A 5M03A 1A3HA 4F66A 2PF0A 5D9OA 2OWWA 3KL3A 1G94A 3BLPX 1B90A 1HJQA 1EIBA 2JALA 4H41A 4OZOA 2DEPA 3W25A 2Y8VA 4TVDA 4D1IA 4H04A 2JEPA 2O9OA 2D3NA 2EPMX 1V3HA 4DWSA 1KWKA 1UWSA 1C3FA 1F4AA 3RIKA 1KQYA 3U5YA 3QHOA 1DP0A 1OINA 1UKOA 3PZNA 2VNCA 3CLWA 4EK7A 1SMDA 2FGZA 2BVTA 3PHAA 3GH7A 2EXOA 4B16A 4W7VA 4F9DA 2ZXBA 4A3YA 1ECEA 1HKKA 3SCOA 3SEPA 2DH2A 3VD4A 1CWYA 3GNPA 4HTYA 2YBTA 3AFBA 5KEZA 1VIWA 4W7WA 3UR8A 2W63A 4HOZA 4Z2LA 2D1ZA 2A3CA 1QW8A 4UTFA 3KE0A 2PWFA 3CZLA 1J9YA 4UQAA 4JZ5A 4AZCA 4QLLA 1QI5A 5JUVA 1QNSA 3WNMA 2A3EA 2XWDA 1FP8A 1JL8A 2W92A 4U31A 3SUVA 1JYWA 4AZ6A 4Z2IA 3CUHA 5IXEA 1UWIA 2DT3A 2J7CA 3ALGA 3ZMRA 4W8BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3F5K A;  3PZ9 A;  3CMG A;  3ARY A;  3CZK A;  2XGB A;  2XVL A;  2VR4 A;  1RPK A;  3APG A;  1JD9 A;  4X9Y A;  4E4P A;  5CPT A;  4W7U A;  1HNY A;  1H11 A;  5GPR A;  2WMK A;  4EAN A;  1GQI A;  3BH4 A;  1DED A;  2FDM A;  4HOX A;  1NP0 A;  1EOK A;  3WL1 A;  1XC6 A;  2FHB A;  2ZUV A;  4JFV A;  1JD7 A;  2V3G A;  3WQW A;  4M81 A;  3NCO A;  1KGU A;  4GIA A;  1LLO A;  2A3H A;  4W88 A;  2XSB A;  1CGW A;  4M8U A;  1X6L A;  3SUR A;  2Y5E A;  2J47 A;  2DSW A;  5ABF A;  3VTR A;  4BCE A;  1B3X A;  4W87 A;  1NP2 A;  4H2C A;  1BAG A;  2VCC A;  5FL1 A;  3AIE A;  3AIV A;  1E73 M;  1CXF A;  3B9E A;  5CSY A;  1E0W A;  2E8Z A;  1GOO A;  1DWH M;  1KQZ A;  2WWC A;  2JFE X;  1J0Z A;  4QCE A;  2DIE A;  1ISZ A;  1NM9 A;  1E0V A;  4F79 A;  3CHC A;  2E3Z A;  1JYV A;  1QHO A;  1W3J A;  3VGG A;  1E4M M;  2VTF A;  2YDR A;  3AHT A;  3RPM A;  3AXH A;  2ZUN A;  4S3J A;  3A6O A;  4YHE A;  4AC1 X;  1E6X M;  3AS0 A;  2OSW A;  1ZBC A;  2D2O A;  2E40 A;  2DT1 A;  3PN8 A;  5E0C A;  1BG4 A;  2XFR A;  2BXY A;  3L4X A;  5AY7 A;  5DT5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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