1I2RA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant s176a
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLIAPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords TRANSALDOLASE B
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 137
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2rA00
4ZQOA 4C1KA 3NQCA 3NR0A 1QPOA 1QOQA 3Q94A 1ZHAA 1TYGA 4GWEA 3R2GA 4IQLA 3D0CA 4MY9A 4IMCA 3E9AA 3MMTA 4PH6A 3O16A 4LW7A 1R2TA 3MP3A 4KFNA 2VOMA 1DOSA 1E51A 5F2LA 3PG9A 4K8EA 4NJGA 2Y7EA 4NXSA 4Z1AA 3ATYA 5DCDA 2BSLA 3TK7A 1OHLA 1OYCA 4C1LA 1A5SA 2QCLA 2QR6A 3C2VA 3G1HA 4KKXA 4TMBA 1DL3A 4ZL1A 2A6LA 3HB9A 3ZFHA 3S5OA 1XBVA 5K9XA 3TXVA 1OX4A 2A0NA 2JGYA 2GJLA 4N4PA 3U8GA 4AWTA 4DQWA 1TO3A 4RCXA 4S2BA 4UFMA 2Z0IA 5LNRA 4GC4A 4LVFA 3PAJA 3UXDA 3W1RA 4K6AA 4WJEA 1IIGA 2NX9A 2Y62A 3L2IA 1SQ7A 5I3JA 1GG0A 2WSQA 1KFCA 1LP6A 4JICA 1A5BA 1IGSA 2WV8A 4NJKA 5DCEA 2XFWA 1GVSA 1W31A 4FO4A 2ZZ5A 4PFMA 1IIHA 5A5WA 1XM3A 1TTIA 3QFEA 3N3MA 1OK4A 3GAKA 4ZQRA 1GQNA 4UUIA 1M5WA 1EPXA 2V8ZA 3O63A 4MLRA 3MO7A 3NG3A 3CHVA 3MYPA 4JX5A 3E96A 1KTBA 5G1TA 1YDVA 4N2YA 2QJHA 3THAA 1QO2A 2QCGA 1W5QA 1TRIA 5HWNA 4IUOA 1TPEA 2R14A 1KM1A 3EB2A 3TV8A 3M16A 1VYRA 2FQIA 4JTEA 4CNPA 1UBSA 2AGKA 3CWNA 4K37A 4LT9A 3W2JA 3R13A 3GR8A 3W7MA 3DKLA 4JTUA 1BTMA 1QPNA 1H7NA 2WPBA 3GZ3A 4IPIA 5LNSA 2ZZ4A 4XBSA 1KM6A 4CNNA 1H61A 1GTHA 3W86A 3W7KA 2RKXA 4Q32A 3TC7A 3EWYA 5EMUA 4YMZA 1H51A 2BTMA 3GXTA 3CIWA 1TJPA 4IX0A 5HJLA 2YW3A 1FWRA 2QCFA 4J9JA 3LBMA 2O7SA 5GVJA 3N14A 3W74A 1I2QA 3S9YA 2V5LA 2Z6JA 5AB3A 5FI8A 3LHTA 3BG9A 3QMSA 3SGUA 1SR9A 3W1MA 3SW6A 3STEA 1YDNA 1KFLA 3E0IA 1L6WA 3G3DA 4ZQNA 3R89A 2RFGA 4FNPA 1DJNA 3ZWSA 2CLOA 1KM4A 1I2RA 2C0AA 1ZFJA 3MI6A 2ZBTA 2E6DA 4MY8A 2GQAA 1H7WA 3EX1A 5SWUA 3WK1A 3TDFA 1KV5A 3SY5A 4E0CA 4JX4A 3L9CA 3HF3A 5C6MA 4WQ6A 1SO4A 4UMAA 3UWYA 3UD6A 4JN6A 1PE1A 4K7YA 4DO6A 2W79A 3W75A 3TROA 4OU1A 4D2JA 3G0XA 3TSDA 3M43A 1P1XA 1VRDA 4LTSA 5CKSA 4RR4A 1JVNA 3QW3A 2B7NA 3W3OA 2ZCGA 3MP5A 4ADSA 4NJJA 3YPIA 3MHUA 3GAYA 3KRSA 3LRMA 3GDMA 1TPVA 4JEQA 3TSBA 4DELA 2ZRWA 4HNTA 2A6NA 3H54A 3T7VA 3M6YA 1D3GA 2ABBA 5T26A 1G7VA 3FKKA 4NJHA 1VS1A 1JCLA 5K4XA 1AW5A 4GRSA 1B57A 1H1YA 2CLKA 3N19B 1TPFA 4HKPA 2WNZA 4LV9A 3LRLA 3W7IA 3L5AA 4NX0A 3W88A 4OE7A 5E93A 1WQ5A 5F1VA 3DENA 4O52A 3RU6A 3STCA 3LRKA 5K9CA 3L5LA 3HG3A 3IV3A 1FBAA 4RXGA 2TRSA 1B4EA 3DFSA 3PBYA 2IQTA 3DU0A 1DJQA 3TAOA 2Q8LA 4O54A 5H91A 2ZDRA 4IMEA 4R34A 1EA0A 3GNNA 3IVUA 3KVMA 3L66A 2UV8G 3N9SA 4GUFA 4QNWA 3W85A 2V2DA 4Z1DA 4O8RA 5HWJA 2V30A 1PCKA 2JGQA 4BFAA 3NAVA 3O8AA 5KMYA 1O5XA 4O16A 3LGEA 4IXXA 2Z2UA 3WJWA 3FYPA 5D2TA 3L67A 4JTFA 3OIXA 1DQXA 3EWWA 1VCGA 1VHNA 4RK8A 4HSOA 1K8YA 2Z6IA 3B0PA 3W73A 3NPUA 3LDVA 1JRBA 4DPQA 2A4AA 1X8FA 2YGYA 3OA3A 1QFEA 4LWWA 3NQEA 3P82A 1OFEA 2Y63A 5FF2A 2GQ9A 4DPPA 4DBEA 3JRKA 3C52A 3VKJA 5J5DA 1OX4B 3MI2A 3W22A 2C19A 3LI0A 1J2WA 5AHLA 3NQMA 3SECA 5TIMA 4MJMA 2QCDA 1WAUA 2Y61A 5AHMA 5CSSA 3NPXA 5L6UA 3T78A 1WBHA 3W87A 3FA5A 3CT7A 2I14A 4NVTA 3B0UX 3P8JA 3WJSA 5AFDA 1YADA 3EX2A 3QSRA 1LBMA 5U4NA 2WQPA 5LGZA 2ZZ7A 3W1PA 3A23A 1XKYA 5FEZA 2Z1BA 2F7FA 1OFBA 2GVGA 2FB2A 4GJ1A 1ZY9A 5LKYA 1TTPA 1SO6A 3PSWA 4LRSA 1J4EA 1ZAHA 3TSMA 1OF6A 3BO9A 3I7QA 5KINA 5HMSA 4E38A 4ZVJA 4M7SA 2PRHA 3NL6A 1VLWA 3HG2A 1TV7A 1X7FA 3W7DA 1SW7A 1OFDA 3A22A 1FQ0A 1FCQA 4MYAA 4NNCA 1LORA 3ABRA 2OJPA 3DHDA 4BK9A 4DO5A 5F2MA 3N9RA 2DJXA 1CX9A 2CWNA 4MUZA 3M47A 1NFBA 4DXVA 3MJYA 1TV8A 2H8ZA 1ME9A 2YCEA 1V7YA 1X1OA 3EX4A 3GYEA 1LLZA 3RMJA 4CQ8A 1A5AA 4I7UA 4W9TA 5CPMA 5AYZA 4WXZA 3EXRA 4UTKA 3QJAA 1H7RA 4A2SA 1GYLA 2QF7A 1KLZA 3NZ1A 3LCWA 3QRHA 4TO8A 4NNBA 4FXSA 3UWWA 4PCFA 2EHHA 2QCHA 4NUWA 5D32A 1H60A 3M41A 4BF9A 4LVDA 4UIOA 2WNQA 2P10A 3L0GA 2HSAA 3GDLA 1LBLA 3G1FA 4AVFA 5C55A 1EX5A 2WSYA 3PUOA 4M19A 1K7XA 2QCCA 1K8ZA 1HL2A 3SIZA 1P4CA 4X3ZA 5LNVA 4IMDA 3E49A 4FNTA 5HINA 4CQ9A 1G6CA 1K3UA 2A21A 5HQEA 4AHOA 3PB0A 1OFRA 1B9BA 5G4EA 3EXSA 3SFKA 1O4UA 3S1XA 4FF7A 1KBIA 1XFBA 1PIIA 3TE9A 2E6YA 1H62A 4N9CA 3BG5A 1BWLA 3HOJA 3L0NA 3W7PA 5F4WA 2XN1A 5EY5A 4Q33A 1B3OA 3LXBA 4UC5A 2NUXA 3T40A 2CZ5A 2ZYFA 3LHZA 1OVDA 3VI2A 1BEUA 3U6WA 1Q6RA 3BLFA 1LYXA 4HT3A 4ZQCA 3HGJA 1XUZA 3EX6A 2WKJA 4KWWA 3UPWA 3AO0A 5KZMA 4AWSA 3CEUA 3CQ0A 5BRBA 2ZZ2A 3BGJA 3TKFA 3ZS4A 1LCOA 4MIMA 3DI1A 1ICSA 4GUHA 5G5IA 4K8HA 5LZLA 4HPXA 1AW1A 2B4GA 4FEZA 3PUDA 5I3IA 3HGOA 4HNVA 4A22A 4AEOA 4FNRA 3WFAA 3KRUA 3DXIA 3PF3A 1WA3A 1KFEA 1Z42A 3C56A 2PURA 3M7WA 3U2OA 1OX6A 4AXKA 3B8DA 3FJLA 3UNDA 4O0ZA 1H7OA 1AL8A 4A21A 4LS2A 1FWNA 1VYSX 3G8EA 4DF0A 5G2WA 3HMJG 3EWXA 3KOFA 1S5TA 3HGSA 1WXJA 3W1XA 1R2SA 3Q58A 3TR2A 5KTLA 3QW4B 4O53A 1EUNA 1WOBA 1XBZA 1DQWA 3E12A 1K03A 1J5TA 2ZQ0A 5C54A 3W07A 3QF0A 2NXGA 3FYOA 3W76A 5D03A 3BLIA 5U7SA 3W7RA 4O1DA 4GNJA 1FX6A 1K7FA 1RZMA 3W23A 5C2XA 3HJZA 3Q2DA 5KZEA 2J9YA 3ZWTA 1NSJA 5IBXC 4Y96A 4QJ1A 1I4NA 3HO8A 4WOZA 1K02A 3DZ1A 4JS3A 3UWVA 1TPDA 3L21A 3TQVA 1MEHA 1ME8A 3B04A 2Y7GA 4MVAA 1K7EA 5D05A 4QQ3A 3F4NA 5EA9A 5HULA 2C3ZA 2YZRA 3CPRA 1JQXA 1AW2A 1SFJA 2A7NA 2GQ8A 3W1LA 2ZRUA 3M5ZA 4O57A 2DJLA 3DI0A 1IXNA 1UASA 4FXRA 1ICPA 2FTPA 4O13A 3PULA 3W2UA 3HPSA 3WJZA 5D2YA 2QCDB 2NWSA 2CFFA 1W1ZA 1Z41A 5A8GA 4JTKA 2WOQA 1SO5A 3LV6A 1TPH1 1GEQA 1VGAA 3RK8A 3TW6A 1XI3A 3G24A 1LLWA 3C3NA 4UTTC 3PR2A 4I9AA 2QDHA 1Q6LA 1KFBA 4CCCA 1PV8A 1Y0EA 3KXQA 1RR2A 5C5YA 2ZRZA 2E5CA 2X30A 2ZRXA 2FJKA 4IOTA 4TMCA 2RDWA 3LCGA 1VR6A 4DEFA 3CWOX 3S5YA 1HTIA 3IGSA 3IVSA 4Y6GA 2DZWA 4L4LA 3PSVA 1SW3A 5CPNA 4FIQA 4OBTA 5CGQA 3H53A 4TR9A 4BI5A 1OX5A 4UTJA 3M0ZA 2XN0A 3LTYA 4L4MA 2CZFA 3BGGA 3C61A 1XUUA 1GZGA 3NGJA 2DZXA 3L5MA 2YYTA 3M5VA 1OYBA 3GXNA 2A1YA 4OV9A 1QDSA 3G1DA 2E09A 2QAFA 4RJEA 4X22A 3IEBA 2CZDA 2FDSA 1G4EA 1OF8A 3W83A 3EKZA 3PBWA 2VFEA 5DCBA 3OVPA 4OHQA 4PC8A 3Q37A 4O4WA 1QOPA 3LCXA 3CLMA 3W1NA 2R8WA 3DGRA 1W3NA 3GDTA 3R5EA 4PA8A 2JBMA 4O0KA 3CU2A 2ATSA 3LXAA 3G0SA 4P2VA 2E77A 3S6DA 3SGZA 1HFBA 3M5YA 2ZZ1A 4O28A 5J5RA 4JD4A 3TU9A 3QPYA 2C6QA 1OFPA 3P80A 1H1ZA 2V82A 2GOUA 1DBTA 2VENA 5AHEA 3W1QA 2KZHA 3K30A 1Z44A 4AH7A 1R30A 4WD0A 4UCGA 3M9YA 4N02A 4JDBA 3W70A 1LTDA 1SSGA 5DBTA 1W54A 1YTEA 3UZ5A 4JX6A 3P5ZA 2J9XA 4HNNA 1EWDA 2NV1A 4HPJA 1VJIA 4JTSA 3C2FA 3EEGA 4OV4A 3L68A 2B7PA 3B05A 5AC8A 3EWZA 3FJ6A 4M7TA 1D3HA 3PBUA 3NVTA 3UWZA 5CZTA 5EBUA 4GE8A 3C6CA 1UCWA 3IGXA 2X1SA 1W3IA 3N73A 4BI7A 1VCVA 4LVGA 3HPZA 1QCWA 4R33A 3NDOA 2VFDA 1M6JA 4JTGA 3VCRA 2OZ0A 3NQ8A 3N2MA 1GVFA 3IGUA 3P5YA 4WY0A 3CC1A 4PEKA 3P61A 4N9EA 4XUGA 1JUBA 2PRLA 4CCEA 3KVKA 2Y7FA 3LCIA 5KSWA 1TPC1 2JK2A 4PODA 4KWVA 1FXQA 3FFSA 2CLHA 4M5PA 5DELA 2AQWA 2G95A 3TIMA 3USBA 1FDZA 1QR7A 3OBKA 3GDRA 4XWUA 1ZNNA 1O94A 4NU7A 1F5ZA 1QWGA 1GOXA 4G1KA 2YXGA 5FEPA 3W7HA 4UNLA 1ZCOA 1ZENA 3GNDA 2FB3A 4RV8A 3HGRA 1TMHA 2HMCA 4JXCA 3W6YA 3P81A 1AMKA 3TC6A 2WO5A 3STFA 4BWLA 1GPWA 2B0MA 4FNSA 4S2CA 3R12A 3GLCA 3EWUA 3O6CA 5L9FA 2DZPA 3R8RA 2VC6A 1DVJA 1XXXA 3RFAA 1RQEA 2YYUA 1PVNA 3O07A 3TXZA 1P5BA 1GWJA 5K2ZA 1RV8A 3UQNA 2BXVA 1MXSA 1KW1A 3KAOA 3QM3A 4YL2A 2V5BA 2I9EA 3IIZA 4O10A 2ABAA 1R46A 1S5WA 4MOZA 1HO1A 1JRCA 2B7QA 4N6FA 3MYOA 1T0OA 4K39A 2VFHA 3QQ1A 5D38A 2GJNA 3E02A 2ISVA 3WK2A 2H90A 1RPXA 2G5WA 2VFIA 4BI6A 4PL2A 1X1ZA 4GUGA 4LS0A 4BWLC 1RD5A 3LCLA 5E1QA 2H3DA 5H2ZA 5FESA 5HR7A 2XN2A 1NEYA 1ME7A 5F1UA 4FIRA 7TIMA 5AC6A 1WOAA 3DFPA 3WK3A 5BOOA 2C16A 2Y85A 1S5VA 3UWQA 3LXCA 1TQXA 4LC8A 2D73A 3PBVA 4LV4A 3JS3A 3VE9A 2W0UA 3W2NA 3TMLA 3ABQA 4POCA 5HWMA 1IXQA 2CLFA 3TCEA 1GJPA 5DLCA 1V5XA 2I1OA 2WJZA 4WZHA 1TV5A 3MWAA 4DBDA 1TPUA 2YFNA 2ZRVA 3KX6A 1EP3A 1SFLA 5G2HA 1UUOA 1WX0A 2OMAA 3NQ7A 3RF9A 4B5NA 5CPOA 2VEPA 5AHIA 1VH7A 4QISA 5BW6A 4LVBA 1YXYA 3LHVA 3NQAA 5EYWA 4H6KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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