3W1A | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-halogenated orotate derivatives rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	108
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-11-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w1aA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w1aA01

3MJYA 1FWWA 3TFXA 3W2KA 3CPRA 1F76A 1GG0A 1EEPA 2ZYFA 1YXDA 3I6RA 4MY9A 3V75A 1J4EA 3PB2A 2LLEA 3EWZA 3A5VA 4GUFA 3TUUA 3I7RA 4EVZA 3PSVA 1GYNA 4GUIA 1HG3A 2JK2A 5K4XA 3LM7A 5FF7A 1KM3A 5BMWA 4ZQNA 5DN1A 4UFLA 3EKZA 3ABQA 3O05A 3W75A 1LCOA 4NU7A 3RU6A 3T55A 5IM51 4OV9A 2B7OA 2YDAA 2A6NA 3P81A 4R33A 2JBMA 2QUVA 2BWGA 4XBSA 4FXRA 4DBDA 5D37A 3TXZA 3MYOA 2I9EA 4C1LA 4JTGA 3E96A 1VQTA 3SI9A 3KVMA 5EY5A 3TQKA 2DORA 2WNZA 3NQ7A 4N9EA 1BWLA 3RMJA 1LBFA 1P0NA 2QUTA 1OX4A 3IIXA 3NEVA 2PC4A 1E51A 4M7TA 2VFEA 4UMBA 2Y62A 5F4SA 4U28A 3P60A 4GUHA 2GOUA 1TPEA 3JS3A 3O8AA 4KKXA 5U4NA 2NZLA 3CM4A 3P84A 5I3JA 3W7LA 3NZ1A 1G67A 2J24A 1FDZA 2R94A 4N4QA 3TMLA 3HPSA 1WQ5A 2C6QA 1YPFA 5EKYA 3TJLA 4IX0A 3C2FA 1PS9A 1ML1A 4IPIA 1QOQA 3DZ1A 4R7JA 5LGZA 5AYYA 3AO0A 1SFLA 3LCFA 1PCWA 3LLFA 2GJLA 3PWAA 3OG3A 2E68A 4LTSA 3UWQA 3NL5A 3W7QA 4LVAA 5LNVA 3A24A 1AL7A 3M5VA 3CB8A 1O4UA 2Y7DA 3EX6A 3G1YA 1IXOA 3G0UA 1TIMA 2BTMA 2QKFA 3P67A 1NSJA 4X2RA 4QJ1A 5G1YA 1D3GA 4UNKA 3KXQA 4WXYA 2PRMA 1FCVA 1RR2A 1QAPA 4ZVJA 2B4GA 3FA5A 1M7PA 3N73A 3N2MA 1KFEA 7TIMA 3CQ0A 1IXQA 1K8YA 1W5OA 3BO9A 3W7MA 4LOCA 4YMZA 4DO6A 4O54A 3W7OA 1OK6A 2A1YA 1EB3A 1TJRA 1P1XA 5KZDA 4MZ8A 2JKEA 3W72A 4WD0A 1KLYA 5FEXA 1XDLA 4LVBA 5A8GA 1DOSA 1SO6A 4N2YA 3LB0A 2DJXA 4PL1A 3W1MA 2DZPA 4WXZA 3A22A 1H61A 2X1SA 2YFNA 4OV4A 3G24A 1VJIA 3LCXA 3O06A 1KFBA 3USBA 4OWGA 1ME8A 3QJAA 1C9DA 4MIMA 2GUUA 3L9CA 3LI1A 3VCRA 3P82A 3RNDA 3QMSA 4AB4A 2A85A 1AL8A 2C18A 4BFAA 1XBVA 2ISSA 1A5BA 1KM5A 3FS2A 3P62A 1RV8A 5CPMA 2JGYA 4UTMA 1OFEA 1KFKA 2X1TA 4O1AA 4PC8A 1SU5A 1AW2A 1O5XA 1SZEA 3G1HA 1I2QA 1G4EA 4I7UA 1SFJA 2RKXA 3LLDA 4YCPA 3LV5A 4AHOA 3M44A 3C2OA 2FFCA 3DH7A 5FF3A 4DBEA 3TAOA 3W1RA 1XUUA 4BI5A 1HTIA 1BEUA 5D03A 4YXGA 4JX6A 5CPOA 2FPYA 2FLIA 3O1NA 5HINA 3TNOA 1W3TA 1KBIA 4JYDA 4BWLC 1QO2A 3GVGA 1IF2A 3GAKA 5TQLA 3FEMA 3A5FA 3WK3A 4DPQA 3FFSA 1EP3A 3LCWA 2PRHA 1W5NA 2QF7A 1FDJA 1K7EA 2YW4A 3F03K 5C6MA 1GVFA 3WJZA 1CI1A 3MMTA 1T96A 2WSQA 3TE9A 2QUUA 1LRQA 4FIQA 2RDTA 3O15A 5HULA 3MUXA 3CEPA 3LBCA 1H60A 3G18A 2YZRA 3HF3A 3KVKA 4IXHA 5K3VA 1W37A 1MZHA 4TO8A 1OFAA 3ABSA 4JTJA 1OFRA 4O52A 4ZL1A 1G7VA 1R30A 1CX9A 3B4UA 3K30A 1WXJA 4OQVA 2VFFA 2C3ZA 1QWGA 3QC3A 1I8JA 3S5OA 1M5WA 3TIMA 5AC8A 5BRBA 1I45A 3W7PA 3NL3A 1F6PA 4GXMA 5LNWA 2DZSA 3L2IA 4IMDA 1ICSA 1WV2A 3DGRA 1D9EA 2BSLA 3NGJA 5FF0A 3U6WA 1X1OA 5HUOA 2QCDB 2Y70A 2QJGA 4ORMA 1AW5A 5U7SA 3IVSA 2CLIA 1UCWA 2H8XA 4GWEA 3MI6A 2HMCA 2ALDA 2B7PA 4MZ1A 3DU0A 3M6YA 4MUZA 4UUIA 3PR2A 1S3HA 3WK1A 3PAJA 3W7KA 2H8ZA 3GDKA 2V5LA 4JY9A 3NQ8A 2B0MA 5EMUA 4ZQMA 3NM1A 4O57A 4O1BA 4A22A 4LRSA 2ATMA 1WBJA 3TK7A 5LNUA 5F1VA 2FB3A 2H90A 3GDRA 1TTQA 4JX5A 3PSWA 3T44A 3VE9A 1LDCA 3S9YA 4RJEA 3CHVA 3MP5A 1R46A 2X2GA 4QITA 4ALDA 3VI2A 1U83A 3NQAA 1QPQA 4UIOA 1TPUA 1G4PA 3B0PA 4X9SA 4JYFA 2WV8A 4H3DA 3NM3A 1HO4A 4MLJA 3GKAA 1IXPA 2YFOA 2C13A 6ALDA 1P5BA 2QAFA 5EA9A 5EBUA 4RKAA 4LVFA 2Q3RA 2IQTA 2CZEA 3UWZA 2A5HA 4NJJA 1LRTA 3W73A 3V1PA 1LRNA 3W87A 5D33A 1DVJA 1JQXA 5DCEA 5D2XA 3CWNA 2P10A 1SO5A 3B8DA 3C6CA 5EL1A 2NWRA 3GYEA 4O18A 3NYZA 4EWND 3TAKA 1B3OA 3C0JA 2BXVA 4O50A 2BLEA 3AJXA 1SO3A 3GKFA 3W1PA 1GG1A 3M43A 4HKPA 4CNNA 1SW7A 3LX9A 1GQNA 2R14A 5C5YA 2GQ8A 3F1QA 1MEWA 4YLWA 4NJIA 3EXRA 2EKCA 3DI1A 5G1TA 3S1UA 3IIZA 3KVLA 2ZA3A 1SR9A 4FNTA 2TYSA 3PY2A 2ZCGA 3LRKA 1GVRA 5IBXC 2AGKA 2YYTA 3GDLA 2ZZ4A 4GUJA 1TPFA 4GC4A 3ATZA 4CQ9A 1NF0A 3BG5A 3UY8A 3PBYA 1TV8A 1F05A 3ATYA 4ZQPA 3G1XA 4O15A 3B0UX 1H7NA 2YXGA 4BF9A 3PULA 3U8GA 1OFPA 4JX4A 4LUIA 2ZZ1A 5CG7A 3W7JA 1ZAIA 3SZ8A 3WJYA 4UTIA 1H7RA 5G5IA 2C1HA 1TRDA 2O7QA 1N55A 4IMCA 3Q58A 2VENA 3BLEA 4GBUA 3O6CA 4IJBA 5L6UA 1H50A 4WY0A 5DXXA 1EWEA 3LCLA 4AEOA 2FIQA 4MZYA 4EIVA 3B05A 5J5DA 1XM3A 3ZFHA 3W70A 2OT1A 2ZQ0A 5AYXA 1F5ZA 3FYPA 4PTNA 3I7SA 2FB2A 2E6DA 4NX5A 3NQ2A 2FQIA 5DELA 1DORA 1M7OA 1H1ZA 5H91A 4O1DA 3UPBA 4JTIA 3HPZA 4K8EA 3RFAA 1EP2A 2EHHA 4UTWC 2G5WA 4GRSA 2QJIA 4TX9A 1L9WA 2ZRYA 2J9ZA 4RR4A 2WO5A 1YADA 1KFCA 1WAUA 3TMQA 1EX5A 4GJ1A 1LP6A 3BGGA 4TR9A 1NEYA 4E0CA 3U2OA 4YL2A 1WX0A 1DJNA 3C56A 3M16A 4QSHA 1W1ZA 3T4CA 2YW3A 5K7JA 4NT0A 1RD5A 4NX0A 5E0KA 2Y61A 1WBHA 3H53A 2CLKA 5K4ZA 1XBYA 2Y7GA 1JUKA 1DJQA 5KINA 4GNJA 4K6AA 2ZZ3A 2GVGA 3BW4A 4IXXA 4LUJA 1MEHA 4IGHA 4AF0B 3I65A 3WFAA 4HHPA 5FF2A 1ADOA 1XL9A 3EWYA 3LCHA 1ZNNA 3BG3A 3PUEA 2V8ZA 4WJEA 4IQLA 4DXVA 1VR6A 4A2SA 3PB0A 5D05A 1LOLA 2EGZA 1W5MA 2F7FA 4UFHA 5K9DA 5C2XA 1F73A 4K7VA 2A4AA 1G6CA 3HIJA 4JD4A 4DELA 1JRBA 3TSDA 1S5WA 3GLCA 3KFTA 4FEZA 4Z1DA 1XBXA 3SW6A 3FJLA 4S2BA 4O19A 1QFEA 3QMTA 3G8RA 4UFJA 5G4WA 3HGSA 3PM6A 2JGQA 1VYSX 4GFSA 6TIMA 3C2VA 4M6PA 3MBFA 4WUIA 2G96A 3RLVA 4EF9A 4A21A 2GJNA 1YDVA 3PBWA 4KFOA 4A2RA 1SQ7A 4ADSA 5LHFA 2P1FA 2QCNA 3NL6A 3W7EA 3OVPA 4HNNA 3KOFA 2H3BA 3W2MA 2GVLA 3GIYA 3MP4A 3IGUA 5CPLA 4HNUA 3W1UA 3RF9A 1K8ZA 4I7VA 4AXKA 4NJGA 3DHFA 2ISVA 1EUAA 2XFWA 1TPVA 4UTUA 1K8XA 1X8FA 2CU0A 3I68A 3P80A 1H7PA 4Q33A 4JTHA 4DF0A 1TQJA 4E2DA 4ZZ9A 4JTKA 4HT3A 3PUDA 1FXPA 1VCVA 2TSYA 3LXCA 1P0KA 1TPH1 2H3DA 2C0AA 2P0OA 1QPRA 2YPIA 3W84A 4RX0A 1TB3A 4PFMA 4UTHA 3GAYA 3DFSA 4RV8A 1W5PA 3TJXA 1KM4A 3PG8A 3RK8A 2NXIA 1TO3A 3W1AA 4DO5A 4WX2A 5CZSA 1G4SA 2A0NA 4S1FA 3C2RA 5DXYA 2GQAA 5CZ0A 3W7RA 3L0KA 4BWLA 4WOQA 4WZHA 1V5XA 2VC6A 5DCBA 4ML9A 3VKJA 1U5JA 1SUXA 1IIHA 5K9CA 1D3HA 4FHAA 2GQ9A 4AHPA 1TV5A 4LU0A 5F2LA 2YYUA 5E93A 4JTTA 3ELFA 5HJLA 4Z0SA 3LTSA 2C15A 1H1YA 2R8WA 3QZEA 2NUWA 3G1AA 3T78A 3TFCA 1HFBA 3H55A 4O0ZA 1ZJIA 1UUMA 1FCBA 3L5MA 2Z1BA 4IWWA 1C29A 5CZJA 3MI3A 3I7QA 4WOZA 2ZZ6A 3PBUA 5LNSA 1TJPA 3OBKA 3L66A 4KWWA 2PCQA 4L4LA 3DKLA 3NQFA 1TTPA 4CLMA 2R91A 3EX3A 4M6QA 4H4IA 1WDWA 1A5CA 2V0TA 4K39A 2VEKA 2Z6JA 1H62A 2CLHA 4K8HA 2Y7FA 1XBZA 2Q3OA 4QNWA 1O60A 4FXSA 4PA8A 4DEFA 1L6YA 2WOQA 2CW6A 1IIGA 3MP3A 2NX3A 1ZCOA 1PHQA 1GVQA 3W74A 3QRHA 4M7SA 4E38A 4HPJA 4JICA 1JUEA 1W3IA 1SW0A 1I2OA 2HS8A 1G69A 3UWWA 3N9SA 3NL2A 1A50A 4JTSA 2QCHA 3QMRA 4O16A 3C8FA 3W2NA 3NQ6A 5KZEA 1XC4A 2FDSA 4LWWA 5K2ZA 1AG1O 5BMXA 3STGA 2YSWA 4NXKA 3FYOA 2VKZG 3VE7A 2H6RA 2J6XA 1H7XA 1ZENA 4TU1A 5BNKA 4IUOA 2DZVA 1ALDA 4JNMA 4O0KA 1ZAHA 3PG9A 4QISA 4O12A 2PE4A 2ZRWA 3LERA 4QNEA 5AHLA 4XTDA 3TV8A 3EXSA 1OJXA 4MY1A 1THFD 5GVJA 2A7PA 3NPUA 1VLIA 1I2RA 3NNTA 2DZXA 4O13A 3BW2A 2FJKA 4PODA 3TQVA 1KA9F 3LXAA 1Q6RA 1FY6A 4UFMA 2NV1A 4NNAA 2B7NA 3TU9A 4CNPA 1VZWA 4JEQA 3IGSA 1JR1A 1KFLA 2JKPA 1VLWA 3OVQA 1HO1A 4IPJA 1Z44A 4NQ1A 1QDSA 2OJPA 1XI3A 3UD6A 4LC8A 1TTJA 3PS7A 3NXFA 4LVDA 2ZRXA 5FF4A 3UWYA 1R2TA 4FX6M 4XQ6A 5CKSA 4YWIA 3W22A 3GNDA 3E0IA 1F2JA 4O4VA 1OX5A 1OFDA 2DZUA 3H54A 1X6UA 2NV2A 1YPIA 1KLZA 3LBMA 2Y85A 4UMCA 1R2SA 1F6KA 3GZ3A 5LHEA 4O8RA 3LV6A 1KFJA 2VFGA 5AHEA 2OCZA 1VC4A 4W9TA 3HOJA 1FWSA 4O17A 3HG4A 4GUGA 4XTIA 3W2JA 4M6VA 1RVGA 3NDOA 3PVFA 1ZFJA 2V2DA 5IBXA 3B04A 1BTMA 1ZAJA 5D02A 3JR2A 1EA0A 5L9FA 5G2HA 4JGDA 1OK4A 4RCXA 3QPZA 2YGYA 4NJHA 2A2IA 1J5TA 2V2HA 4OU1A 5G4EA 4CNOA 3BLFA 2QDHA 3M5YA 1S5TA 4I7WA 1I4NA 1QCWA 3GR7A 5EYWA 3G1DA 3KRUA 2NX1A 1W3NA 3QF0A 3A23A 4K37A 3B03A 4A29A 2I1OA 3C4UA 2V2CA 1NVMA 1LM1A 2Y89A 4FB7A 5LKYA 4M5PA 1LORA 1YDOA 1J2WA 4K38A 2J9XA 1W56A 4JYEA 5FI8A 4DO4A 3LTYA 5DBTA 3NQEA 5HNRA 1OG0A 1BWKA 2RHGA 2WJZA 4B5NA 3TA6A 3THAA 3LXBA 3W7IA 3SGZA 3SR7A 3DHDA 1SSGA 2FTPA 1UASA 3LRLA 3QSTA 1H5YA 1JUBA 3NO5A 1EIXA 1FDYA 2JKAA 2ZFAA 1FCUA 3PUOA 5HWNA 1GTHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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