2ABAA

Structure of reduced petn reductase in complex with progesterone
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Proton transfer in the oxidative half-reaction of pentaerythritol tetranitrate reductase
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.7.99.-:
pdb deposition date 2005-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2abaA00
1HG3A 2JKPA 5HR7A 4C1LA 5DBUA 2I14A 2BTMA 1R2RA 2YYTA 1KV8A 3MYPA 2QDGA 4JEQA 2Q3RA 1IIHA 2DZVA 2Y7FA 1SZEA 4GXMA 3EEGA 2A2IA 2KZHA 1ME8A 4S2BA 5D38A 4NJIA 4RX0A 3S5ZA 1LRNA 4QNWA 4K37A 3WJWA 3QW3A 5IBXA 3I6RA 4Z0JA 3W7CA 4OBTA 1KFEA 1U5JA 2C13A 1TREA 3QQ0A 1B4KA 4C1KA 1CI1A 3C52A 3Q58A 3G0UA 1W54A 5F4SA 1OFPA 4CCEA 3KVMA 3W73A 3IIZA 3SGZA 2OZ0A 2ZRWA 2C6QA 5F2IA 3G22A 1FQ0A 4UNKA 1PHWA 1Q6QA 3NEVA 4W9TA 2CLKA 3SSJA 4IMDA 4LVGA 2BZNA 1F7BA 2B7PA 1SUXA 2ZRYA 1K02A 3HG5A 1JVNA 1M7PA 3NQCA 3GAYA 3IIPA 4MIMA 3LHYA 4HSNA 4OV4A 5DLCA 1OFDA 4Z08A 5F4WA 3MBFA 2ZBTA 2CZDA 1PL9A 4IPIA 1J4EA 3ZR4A 4BFAA 4TO8A 4PCFA 1TMHA 3UNDA 5EMUA 1AL7A 1Q6OA 3ABQA 4N9BA 3T4CA 4JTIA 4N6EA 4NNBA 2YR1A 2NUWA 2YW4A 2W6RA 3STGA 1OABA 5CKSA 3QW4B 3GDLA 2F7FA 4Z1DA 3EKZA 3M7WA 4L4LA 2O7QA 4XKYB 1FXPA 4BWLC 3BPWA 1LOSA 3TXZA 4JY8A 2ZTJA 5FEXA 4NU7A 4FX6M 4GRSA 3UWYA 2O7SA 3G8RA 1R47A 4E0CA 2J9XA 1ZENA 4B5NA 3G3DA 4O53A 1FUYA 3KVKA 3S8HA 3HIJA 2V0TA 2NX9A 4CQ9A 3RK8A 2NX1A 4DEFA 4RR4A 4DXVA 5E1QA 3A22A 4PODA 3UWZA 2Z1BA 4MYAA 4UTUA 3NOEA 3AO0A 4KFNA 1IXOA 3PG8A 1JCXA 1S5VA 5EPDA 1FDYA 3EXRA 2Y88A 3DAQA 4CNOA 3WK0A 1GG1A 1RQHA 2ZYFA 1MEIA 1F6KA 4GFSA 4IXXA 1QPRA 1LBMA 1SSDA 2AQWA 1FCQA 4DBDA 1ZAJA 2VEMA 3GNDA 3WK1A 1OF8A 4A2RA 2A85A 1UASA 2TSYA 3HG2A 4N4PA 2CLLA 2ZCGA 2ISSA 5K9CA 3L66A 2CLOA 2OCZA 1WOAA 4UFHA 3MP4A 4EF8A 2FIQA 1F05A 2QCLA 1RZMA 3NVTA 4MZ8A 1TV8A 1TPDA 3KFTA 4FNRA 3P81A 1VH7A 3TE9A 3Q37A 3L2IA 2X1RA 1KFBA 1XKYA 2RDWA 2E6DA 5EKYA 1SW7A 1O5XA 3NQGA 2ZA3A 2WV8A 3HBLA 5H91A 3B0UX 1W5QA 3TSMA 3M6YA 4JTFA 1QO2A 3Q94A 3TJXA 4XWUA 4LS1A 3W2NA 4FNSA 5FESA 1YADA 1SQ7A 1A5SA 2CZEA 1V5XA 2FB2A 3R5EA 1SPQA 2ZZ4A 1NSJA 4MUZA 5DELA 3UQNA 1DHPA 1SW0A 3G3MA 5KZDA 5LGZA 4CQ8A 3L67A 5LNWA 4FX8A 3W2UA 3QRHA 2V9DA 1M7OA 4PA8A 2NXIA 3G18A 1TB3A 1ZFJA 1VLWA 3GZ3A 3M1ZA 1SU5A 4DQWA 1GJPA 1OG0A 2FJKA 1LBLA 1KLYA 3A21A 5AFDA 1LLWA 3N3MA 2D73A 2QUUA 1LZOA 4JTKA 3S6DA 1H7RA 4JDYA 3G1XA 2R91A 3U6WA 5CSRA 1F5ZA 1NAL1 2FQIA 2E5CA 1N55A 4ZMGA 4RLIA 5A5WA 4AB4A 4KFOA 2YXGA 1KV5A 5C2XA 2X1TA 4JNMA 2QCHA 3V75A 3S1XA 5J5RA 3GXTA 4OU1A 3BO9A 3NYZA 1OYBA 4JD4A 1DJNA 3S5OA 1MEWA 3FYOA 4PC8A 4NJHA 4DO4A 3R13A 2BSLA 1RV8A 3SR7A 2A5HA 1WBJA 1WX0A 2I9EA 1R2TA 1EUNA 1JRCA 2X30A 3NGJA 4WY0A 1H51A 3GVGA 3TXVA 4JTLA 2XN2A 3FFSA 4X9SA 1QO5A 4JYDA 3UYCA 4XZ9A 3IIOA 5DY2A 3B06A 1O4UA 3JR2A 1SO5A 4GE8A 1QOQA 3MUXA 3W74A 4IOTA 1ZHAA 2J27A 3PBYA 4Q4KA 3P82A 4Z1BA 1TJRA 3GDRA 1VZWA 4ML9A 3W88A 2Q3OA 4NZJA 2C3ZA 1P0NA 3N2XA 1TTQA 4S1FA 5KZEA 3DH7A 1KA9F 4HSOA 1TCDA 3NQ8A 5I3JA 3W2MA 3NQFA 5AC8A 3UWWA 4K7YA 4CLMA 1VR6A 2HTMA 3HQ1A 5DCDA 3P8IA 4H3DA 1WAUA 1YDNA 1QPNA 3L65A 1DOSA 1HO1A 2CU0A 1LYXA 2YGYA 2HMCA 4Z1AA 2FDSA 4NX5A 1FWNA 3IIXA 3PM6A 4IUOA 2CW6A 3C2VA 3Q2DA 1R46A 4GJ1A 2QAPA 4FXSA 1W5OA 1C8VA 3DFPA 1GVSA 1YXYA 3W7LA 1MZHA 3M5VA 3O15A 1KW1A 5AHFA 1KTCA 3G1FA 4A22A 3IV3A 2NWSA 1TV5A 5EY5A 3G1DA 3STEA 3SI9A 3T7VA 3MHUA 4JYEA 1W31A 4K8EA 1JCYA 3R12A 4JX5A 4O1BA 4UMCA 2ZZ2A 3BGJA 1A53A 5CZSA 3W7MA 3QMTA 3C4UA 3W1AA 1X8FA 3ABOA 3S5NA 3W23A 4AMAA 1I4NA 2QJHA 3WJZA 1TPEA 1PCKA 4D2JA 2ATMA 4BK9A 3TFXA 5BMWA 3PF3A 4R7JA 4NVTA 2WQPA 4NXSA 4EIVA 2E5DA 4MJZA 3S9YA 2FLIA 1YPFA 2CWNA 3UXDA 5K4XA 1O5KA 2PRLA 4NJKA 2OT1A 2PURA 5CZ0A 4ALDA 1OF6A 5AYYA 1VC4A 2WSRA 3TV8A 3NM3A 1BTMA 2QCMA 1QMLA 5DCEA 3TKFA 2E68A 1WQ5A 3UWVA 4DO5A 1EB3A 1ZCOA 4Y9AA 4JIPA 2QJGA 4LRTA 3M43A 4X3ZA 4O57A 4UIOA 3TAOA 4JTGA 1GOXA 3HJZA 4O52A 5L9FA 5FF4A 3CB8A 1IXQA 3LRKA 4LVBA 2E77A 3BLFA 1MXSA 4S2CA 2G95A 1XCFA 3O6YX 4JTEA 3FJ6A 2NX3A 1KTBA 1OJXA 1H7OA 3LERA 3C2FA 1VHNA 1JUBA 3BK0A 2QF7A 4AF0B 1F76A 1QDSA 5BOOA 3O8AA 1Q3NA 2Q8LA 3NZRA 3IVTA 2VFIA 3P61A 1F6PA 3DU0A 1QNVA 3W2LA 1ZAIA 2RHGA 3OBKA 4WOQA 3BG3A 3NA8A 5HJLA 3B04A 3M5YA 4IQLA 4WUIA 3HB9A 1C29A 2ABBA 3UPWA 3QSTA 4LT9A 5GVJA 4AHQA 3WK3A 3SZ8A 4UTTA 2BXVA 2HS8A 4GBUA 4TU1A 3WFAA 2P0OA 2V30A 2YX0A 4UFLA 5D2YA 1K8YA 3NL5A 3GNNA 2VXNA 4GUHA 1GG0A 4WJEA 4JN6A 4QITA 2V2DA 4MYXA 1GZGA 1K7EA 2BLEA 5HWMA 3I7SA 3RLUA 4IX0A 3O63A 2JKAA 1PCWA 3IGXA 4XBSA 1LBFA 1NF0A 4ZL1A 4PH6A 3QF0A 1UB3A 3T78A 1WXJA 3I68A 3NM1A 3W70A 5LNVA 3OHIA 3MHFA 3VE9A 2J6XA 5K2ZA 3C61A 1TPUA 3QEZA 2E1DA 2C16A 2CLIA 3EWYA 3G8EA 3DI1A 1VQTA 1R2SA 2E5BA 4GUIA 4O17A 1OX4A 3PBWA 3PULA 3QYQA 2CZ5A 3DI0A 3SW6A 1VLIA 4K6AA 3KX6A 4FF7A 3NPVA 2A7PA 4GC4A 2AGKA 4DF2A 7TIMA 3C2EA 5CPMA 3DFTA 4O50A 3W1LA 1XM3A 2VOMA 1EWEA 2JBMA 4PEKA 3DENA 3F1QA 5EA9A 5DXXA 2CFFA 2NZLA 3VE7A 1W5PA 1FXQA 3FKRA 4IMFA 3TMQA 1TYGA 5D2TA 3W1PA 3CEPA 2ISVA 2QEZA 4JTTA 2JKEA 1KBIA 4Z1CA 4ZVJA 2V8ZA 2LLEA 1H7XA 5G1TA 1LOQA 1AL8A 2IQTA 3UY7A 3W1NA 1BKSA 3S1UA 1WYIA 3QQ1A 3M0ZA 1ZY9A 2Y63A 5CPNA 4CCCA 3N9SA 2AAMA 2RKXA 3OG3A 4YXGA 1A50A 1LDCA 5HULA 1VCVA 3G1SA 1FWRA 6TIMA 1OYAA 4LUJA 4L4MA 3OIXA 1C9DA 1RPXA 1S5WA 3B0VC 3MI2A 3E96A 1IXPA 2H8XA 3CPRA 5KITA 2B0MA 5KTLA 2DJLA 1DKWA 1LOLA 3N9RA 1OFBA 1NVMA 1XBVA 5FF0A 3ATZA 1G4PA 2ISWA 3B8DA 3BVJA 5E0KA 4EOUA 3EB2A 3C2OA 2FTPA 2GPTA 4ZQNA 2NXGA 1VGAA 2V2HA 4LVAA 4JS3A 4MZYA 1SO6A 5E93A 2ZDRA 1FY6A 3O6DA 1W5MA 1VYPX 3QH2A 1KFKA 3W6YA 2BWGA 2Z2UA 3ELFA 3GDKA 1JCLA 3HPZA 3LRMA 1KFCA 3HMJG 1JUEA 2ALDA 1G4SA 3DKLA 2JK2A 3MO7A 1UCWA 2ZFAA 5D09A 2WOQA 3AJXA 2EHHA 2J9YA 3IGUA 4LWWA 1T8XA 1X1OA 1B3OA 4DPQA 5AHMA 3PUOA 4GUGA 3E0IA 3KVLA 3LCHA 4ICNA 4LVDA 1DQXA 3DBPA 4AEOA 4O11A 3TNOA 5BNKA 5A8GA 5IBXC 3PWAA 1YPIA 3EWUA 2Y70A 4KKXA 2DZWA 2E6AA 3HG4A 5ABTA 1RR2A 1I2NA 4KWWA 5D2XA 1TPVA 2GJNA 2Z6IA 3TSDA 5BW6A 2FPYA 1AG1O 5I3FA 4IJBA 2ZZ5A 3EXTA 1P1XA 1M5WA 4FNQA 3W7IA 3GLCA 1VPXA 2A1YA 4MOZA 2VEPA 4NX0A 4P61A 4LS2A 5LSMA 3VI2A 1VCFA 2QUVA 3OVQA 3CWOX 3SGUA 4M6PA 3W2KA 1KM3A 1W37A 2B7QA 5K3VA 3IRDA 3L5AA 2RFGA 1GEQA 3WJXA 2I1OA 1K03A 3ABRA 2B4GA 3BGGA 4HNTA 2CLMA 2DORA 4FO4A 1IXNA 2FFCA 3PUDA 4HKPA 3LCIA 4HPXA 1FDJA 1U83A 1PVNA 2QUTA 1OFRA 3SECA 4DELA 4WQ6A 3LBCA 2VEIA 4XTDA 2DZUA 1TSIA 4PFMA 2V5BA 2F84A 4O28A 4FEZA 5FEWA 4M5PA 4EVZA 1TPWA 5CZJA 4Y6GA 5D37A 3D0CA 2CLFA 1JRBA 2E09A 2DU2A 1TTJA 5G2HA 3GX9A 4O10A 1TTIA 5AHNA 1WOBA 4UFMA 1XBXA 3HF3A 2GOUA 3G0XA 2NXHA 3CQ0A 3A24A 1LLZA 4O1DA 4MLRA 3MMTA 4JYFA 1THFD 5EBUA 4O14A 3M47A 3W7JA 3NQDA 2YCEA 4QSHA 1KFJA 1I2PA 3O16A 4OGZA 3GDTA 5HWNA 3CTLA 1HL2A 4GNJA 4AWUA 3B05A 4GUJA 2ZA2A 3LHTA 5F2LA 3LGEA 4RJEA 3B4UA 3W7KA 4TMBA 2XN1A 1HFBA 5D02A 3IGSA 3DZ1A 1G7VA 2DZXA 4FX7A 5HUPA 1N7KA 1P0KA 2H90A 3LI1A 1LP6A 4FIQA 3W1MA 3EWBX 1KBJA 4NT0A 2DZTA 1TPFA 3V1PA 3I65A 5L6UA 4LU0A 5LNUA 4O16A 4UR7A 2YFOA 3TX9A 3IVSA 2H8ZA 1ICPA 3B03A 3TJLA 2VFDA 1W5NA 2V81A 3U8GA 3VKJA 2ZRXA 5I3GA 1PIIA 1ICSA 3TFCA 2Z0IA 1OHLA 3PSVA 2BX7A 3W7OA 5FF7A 4N9DA 1G4EA 3W84A 4WY0B 4O8RA 2EAWA 3TH6A 1F2JA 4ZQPA 5HNRA 1SR9A 2CLHA 3YPIA 3M5XA 1XUUA 3L0NA 2YW3A 3W76A 3M44A 4IMEA 1TRIA 3W72A 4CQAA 1K3UA 3S42A 5SWUA 3UWUA 3ATYA 2JGYA 1OX6A 4K8HA 1EPXA 3H53A 1S3HA 1XUZA 4O18A 4QM1A 1A5CA 2OX1A 4JDBA 1B4EA 1O95A 4I7VA 1F74A 3B0PA 3STFA 4ZQCA 4NZFA 5KMYA 3TC6A 1WBHA 3R8RA 3BV4A 3W3OA 3LXCA 2Y7GA 5AHIA 5HMSA 1P4CA 1KM1A 1XC4A 4M6VA 3G1VA 3TROA 1X7FA 2FPVA 3E02A 3C56A 4Y96A 3C3NA 3TW7A 2ZZ3A 3RNDA 4JTHA 3FJLA 3PR2A 3W22A 3EXSA 4M19A 4ZQOA 3DFNA 2XN0A 3KRUA 5I3HA 3TQVA 4HIBA 3PAJA 4CCDA 2Y62A 2PE4A 1EEPA 1I45A 2NWRA 3FIGA 1YTKA 1I8JA 2J9ZA 2TMDA 1HO4A 5BMXA 2G97A 1ZNNA 4RV8A 2QR6A 5AC7A 3IEBA 3E9AA 3BW4A 4RK8A 1SSGA 3T55A 3BLEA 5LHEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HG3 A;  1XRT A;  3WF1 A;  3UW6 A;  2IS7 A;  4C1L A;  2I14 A;  2PFH A;  2YYT A;  1IQ8 A;  3NZQ A;  1KV8 A;  4JFT A;  3MYP A;  2QDG A;  3L12 A;  4JEQ A;  1LG1 A;  5CPQ A;  4HP5 A;  1SZE A;  3EEG A;  2J47 A;  1BGG A;  2A2I A;  1ME8 A;  1LRN A;  3OJG A;  4QNW A;  3B9E A;  5IBX A;  5REQ B;  3VDH A;  3WO8 A;  1U5J A;  2C91 A;  2V69 A;  3RIL A;  1TRE A;  2Z2A A;  3QQ0 A;  1RK6 A;  5HNT A;  2SFP A;  5F4S A;  5B80 A;  3KVM A;  3BOL A;  3W73 A;  2XU2 A;  2EO7 A;  2ZRW A;  3CBW A;  1YDY A;  3NXL A;  3N29 A;  2CBU A;  4V28 A;  2PTX A;  1Q6Q A;  4HYR A;  4D9P A;  3BWW A;  4XD4 A;  3SSJ A;  1YW1 A;  3JVA A;  1F7B A;  3UES A;  2B7P A;  1J0K A;  5DEZ A;  1CBG A;  2ZRY A;  1UH3 A;  4CU7 A;  2PDX A;  4XO7 A;  1OFD A;  1TJ0 A;  3VX0 A;  1TFV A;  2ZBT A;  3K1D A;  1J4E A;  4JL2 A;  4J7R A;  1YNQ A;  4MHB A;  5EMU A;  3H7R A;  1AL7 A;  3ABQ A;  1KBL A;  3OYX A;  3WFZ A;  1YBQ B;  5MF5 A;  4IFK A;  1OD8 A;  2YW4 A;  3ENL A;  3TYB A;  1LUC B;  4GFI A;  4AMC A;  3GG7 A;  4L4L A;  3BPW A;  7A3H A;  1LOS A;  3TXZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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