2H8Z | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas putida
total genus	130
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h8zA00

2H8ZA 4X2RA 1EB3A 3G1VA 2QEZA 3M0ZA 4RR4A 3LCGA 3TE9A 4AMAA 4FXSA 1Q3NA 3FLUA 3E12A 4E0CA 2A1YA 4MLRA 4ICNA 2VEIA 4TX9A 3W2NA 4M6QA 3OVPA 3E0IA 5I3GA 5AHEA 4GE8A 4IX0A 5LNWA 3N73A 4PL1A 4UMAA 2CLIA 1EX5A 1A5SA 1S5TA 3RLVA 4IMEA 5K4XA 1XDMA 3UQNA 3U8GA 4N4PA 4O19A 1I4NA 1RZMA 3MI3A 4PEKA 3BK0A 4M6PA 1ICQA 1TSIA 1WOBA 4PTNA 2WV8A 1LBMA 1SO5A 4JDYA 4M7TA 4DBEA 3PBWA 1KFBA 1H1ZA 1W5QA 4O14A 3O6DA 3ANYA 1VHCA 2VEPA 3RFAA 3CU2A 4AH7A 1Z44A 1YYAA 5C5YA 3LHTA 5G5IA 3P74A 1J2WA 1SW3A 5FF7A 2Y88A 4A2RA 3W1QA 4NX0A 4UNLA 1A5AA 3EWXA 2V5BA 4O28A 5HR7A 3P81A 1SO3A 3RU6A 3HPSA 3P8IA 3W7JA 2WSQA 4ALDA 1DBTA 4GUGA 2GVGA 2A4AA 4UFLA 1EWEA 3TROA 5DY3A 1R30A 2GJLA 2CLHA 3CWNA 3LDVA 3GDTA 1YTKA 1EIXA 1O94A 2C1HA 1TIMA 1SO6A 1X1OA 1K7XA 4O4WA 3NPXA 2R91A 3LXAA 3G1FA 1YPFA 1LLZA 4P2VA 5K2ZA 4OE7A 4JTIA 1D9EA 4N6EA 5LNSA 3CEPA 3TXZA 1GYNA 1KM4A 3OBKA 4BFAA 3GXTA 5LGZA 3ZS4A 1AL7A 2NX3A 3HB9A 5IBXA 3DI1A 4XBSA 1M7OA 4HNTA 3WFAA 3GDMA 4KFPA 4CNNA 4IJBA 5LKYA 4O0ZA 4D2JA 3GKAA 2E5CA 2HS6A 3PC0A 1LRTA 3SGUA 1TTQA 4Q4KA 4LS2A 3W7LA 1DJQA 5A5WA 2G97A 4FB7A 3NPUA 3Q37A 4DF2A 5E93A 1LLWA 5EMUA 1JJKA 3W86A 4IXHA 2VXNA 1ZCOA 1YDOA 4HPXA 4XUGA 4FNPA 3PM6A 2J24A 3RF9A 1XC4A 1LP6A 2A7RA 1GVQA 1RV8A 5HMSA 2TPSA 3A9IA 1A50A 2CLKA 2H3DA 2YW3A 4FNRA 5TIMA 3W7OA 1UJPA 2Z0IA 3EEGA 4HNNA 3E9AA 4LY8A 5AHFA 1X7FA 3QZEA 4JN6A 2RFGA 3M9YA 1EP3A 1OJXA 2ZZ3A 1OFOA 1VYRA 2YFOA 3W75A 4OHQA 3UY7A 1TPH1 2J6XA 2GPTA 1H60A 5TQLA 3HG3A 2NUYA 4E38A 1ME8A 4O54A 4N2YA 3LHWA 3IRDA 1EA0A 3WK0A 5F4XA 3W87A 1OX6A 3O07A 3LCIA 4ORMA 4YMZA 5EA9A 2FDSA 2VFIA 3I7SA 1TRIA 1KW1A 7TIMA 1JCMP 2RKXA 2R14A 5CZ0A 1TYGA 3PULA 5DCBA 2X1UA 3O63A 2VOMA 1KM5A 3T55A 1F7BA 3L0KA 3BG3A 3DH7A 3NQCA 3LBMA 1QFEA 1R46A 3HOJA 3C4UA 1QCWA 2YPIA 4LT9A 1GOXA 2ZCGA 3DFPA 3KX6A 1AW5A 1G6CA 1TPFA 3BLIA 2V82A 1Z41A 1A5BA 3L5LA 4AHPA 4JX4A 4TIMA 5LNUA 2VC6A 2YX0A 4NZJA 2RH9A 4JGDA 3R12A 4GNJA 4JTSA 3NQ6A 2VEKA 4IMGA 4FNSA 5D09A 2VFEA 4N9DA 3O15A 3PG8A 3W3OA 4MFDA 4GC4A 4O11A 5J5DA 4RV8A 4GUFA 3ZR4A 1LRNA 2ZA3A 2ZTKA 2V81A 3DFOA 3OVQA 1GQNA 5F2IA 1W54A 3L67A 4UFMA 3TAOA 2RDUA 3THQA 4JD4A 2GVJA 4UC5A 4WY0F 3UZ5A 2Y70A 2ZZ1A 2YCEA 2NX1A 2AAMA 1H50A 2WOQA 3FYPA 1VCVA 2V0TA 1T99A 1ML1A 5BMWA 3LCFA 3NQDA 4JYEA 2J9XA 1ZAJA 3O05A 3QPYA 4IX2A 2OCZA 3TJLA 4YXGA 1NF7A 5LZLA 2NLIA 3W74A 1T8XA 3MHFA 3W1LA 1JULA 3TKFA 4P61A 3HBLA 2E5BA 4LW7A 3U2OA 3TFXA 1I45A 3NPWA 4ZVJA 3TU9A 2Z1BA 3SZ8A 4ADSA 3W1NA 1TQXA 4ZQCA 2TRSA 1DORA 2JKAA 4LV9A 1OFPA 2CZEA 4HIBA 4NNCA 1DHPA 4POCA 3PUDA 4N02A 2Q8LA 2IQTA 3MP3A 4TMCA 4W9TA 5FESA 2VENA 3G1YA 2CLFA 3SECA 1B57A 4KWWA 2A6LA 3CLMA 3UWUA 2OZ0A 2YSWA 3TSMA 5F2GA 3L2IA 2KZHA 1KTBA 5H2ZA 3W1RA 1WA3A 1R2RA 4FX6M 2E6FA 1WQ5A 3TW6A 1CX9A 5K9CA 5L9FA 1G7UA 1V7YA 2QUTA 3TQVA 3KHJA 3FKRA 4O18A 5AC8A 2V9DA 3QF0A 2GJNA 3B0VC 3GAKA 1QOPA 4A2SA 3IIVA 3NQVA 4O16A 1XBYA 5AHMA 2ZRUA 2J9ZA 1KFLA 4I9AA 4Q33A 1UUOA 1QO5A 3NL3A 3W7MA 4O4VA 2QCLA 3P62A 5I3HA 1HL2A 3VI2A 4WY0B 4A22A 2I14A 3TV8A 1K3UA 4BF9A 4H3DA 3EXRA 1TTJA 3Q2DA 3WJSA 5AHNA 3ZWSA 3UPBA 1OFEA 2ZZ7A 3GZ3A 1FBAA 4ADTA 4O0KA 1FDYA 5IBXC 4NZFA 1GG1A 1OFDA 5CG7A 2A21A 3G0UA 4JTEA 1ZENA 3NM1A 3S9YA 2VEMA 3O1NA 3N3MA 3QMTA 1PHWA 4FEZA 4Q32A 4XKYA 3PY2A 3LI0A 3ABOA 4YCOA 1J5TA 5LGXA 2CZ5A 3W23A 3WK2A 4MYAA 3W71A 4WOQA 3S5YA 3CIXA 2Y89A 3BW3A 4FIQA 4TMBA 5E0KA 1TTIA 3WJYA 3GKFA 4UMCA 4MFEA 2V2CA 3KOFA 3ELFA 1HO1A 2ZDRA 3LLFA 5AHLA 3YPIA 2NWSA 1O95A 4R7JA 3UWWA 2CW6A 1K02A 4IMDA 2F7FA 2OT1A 2ZA2A 3MJYA 2ABAA 3W7KA 1GT8A 4XWUA 4UR7A 4K37A 3RLUA 2DZVA 3UWQA 3OG3A 3BARA 4CNPA 3ATYA 3NM3A 3M44A 4NX5A 2V5LA 2CLEA 1MEHA 3IIXA 1RQHA 2A5HA 3HGJA 3W2UA 1OHLA 3LTSA 2YGYA 3H53A 1RQEA 2RDTA 2FPTA 1K7EA 2QJHA 1YXYA 3W7HA 5F1UA 3UXDA 4ZZ9A 1WX0A 4QNWA 3GDRA 1FCUA 4O17A 2GQAA 4YLWA 4JYFA 4RZ4A 1W8SA 1SFJA 4K7YA 3TDFA 1W3IA 4JTHA 3MMTA 1RVGA 3QJAA 2ATSA 1S3HA 3INPA 1W31A 3KXQA 2JKPA 1KV8A 1OYAA 1GVOA 1Z42A 1OFRA 2OT0A 3GB6A 2BZNA 3N9SA 4Z1CA 5CKSA 4PH6A 4DQWA 3BG5A 1C8VA 2B7PA 3HQ1A 3LBCA 1QO2A 3QQ1A 3NAVA 1R2SA 3OA3A 1H7PA 1FCQA 1TJPA 4MPQA 1QNVA 1W5PA 2I9EA 4Z1BA 4JX6A 1W56A 1Z48A 1K7FA 4O10A 5AHIA 1ICSA 1KFKA 2PE4A 4EF9A 2W79A 3WK1A 5C6MA 1FWNA 2TYSA 4MY1A 4K38A 2HMCA 3QM3A 5I3KA 1HTIA 1W5OA 4GRSA 2JK2A 3LCXA 1TCDA 5BMXA 1IF2A 1R47A 2C19A 4ZQMA 3MO7A 4WXZA 3SFKA 1X1ZA 2ZZ6A 1ZALA 3BVJA 4Z1AA 2EF9A 4ONVA 4Z1DA 4PCFA 1F6KA 4RLIA 4QISA 3TC7A 4UCGA 3N2MA 4A21A 2C6QA 2HTMA 3GK0A 5AYZA 4LVGA 3IEBA 4LRSA 1WBHA 3G3DA 5I3FA 1QPOA 2CU0A 1IIHA 2QF7A 3LGEA 3DFTA 1ZY9A 4N4QA 4WXYA 3MHGA 3DGRA 1ME9A 4FO4A 1SQ7A 1TPWA 1PL9A 2A7PA 1XCFA 3TFCA 3LTPA 2YDAA 3W83A 2V30A 4YL2A 1L6WA 1TJRA 5DCDA 3O06A 3TJXA 3B04A 4N9BA 1TV8A 2TSYA 3DENA 3OIXA 3VCRA 3QC3A 3C52A 5D2XA 4LVFA 3C6CA 1TV5A 3LRLA 3B0PA 4AWTA 4R33A 1QAPA 2AGKA 5HWNA 3P84A 3GVGA 3NNTA 3CHVA 2R94A 1WDWA 1W0MA 1I2PA 4MOZA 3Q58A 4JIPA 3W85A 3E02A 5G2WA 3S5OA 4X3ZA 2QUUA 3FOKA 3G22A 4HSOA 4AVFA 1ZNNA 3P5YA 2NXGA 1ZAIA 1K8ZA 1PCKA 1XI3A 1PCWA 5KITA 3MHUA 4AHOA 4MZ1A 3TW7A 1RR2A 1JRBA 1ME7A 2NXHA 1MEIA 8TIMA 2QCCA 4JTUA 3WJXA 4DO4A 1PE1A 1YLVA 2GQ9A 5J5RA 4IMFA 3NR0A 5KMYA 1VC4A 2QR6A 4A3UA 4O15A 1TV7A 4LRTA 3OHIA 3EB2A 4K6AA 4M6VA 4LS1A 4UFJA 5AC7A 5BOOA 1QDSA 3I68A 3DAQA 5HULA 3C2EA 3SI9A 4AB4A 1JCXA 1JUEA 2BX7A 2DORA 3M5YA 3PBYA 4U4MA 2ATMA 3S6DA 3S1XA 1K03A 5AB3A 1JVNA 4FNQA 2ISWA 1TPUA 1K8YA 4WX2A 1OVDA 1H63A 5F1VA 5CGQA 3LXCA 1VCGA 3GIYA 1WOAA 5K3VA 5I3IA 3UXAA 1Y0EA 1TO3A 3B0UX 1YADA 3LCLA 1DQWA 1TPC1 4GXMA 3CT7A 3TX9A 3USBA 5KZMA 1OK6A 2CFFA 1A53A 5FEWA 5U4NA 5HNRA 3PG9A 3GNNA 1T0OA 5LHEA 1AL8A 1L9WA 4AEOA 3HJZA 4RJEA 3E96A 3IIPA 1F76A 1OFQA 2NX9A 3VKJA 4MZYA 3M41A 6ALDA 3M5XA 3L0NA 3M16A 1OABA 1UBSA 1CI1A 3G1HA 5KZEA 2YZRA 1PVNA 2A85A 2CWNA 5AYXA 3UD6A 4GUJA 2QJGA 2RDWA 3P82A 4H4IA 3MP5A 4CLMA 1IIGA 3RMJA 4KFNA 4M5PA 4NJHA 2G5WA 1F5ZA 1JUKA 1VS1A 4L4LA 4LVBA 1I2OA 3CB8A 1FXQA 3C3NA 1VH7A 3NQEA 4LOCA 4PL2A 3EX2A 4K36A 1W3NA 1OX4A 1AG1O 3PBVA 3MW7A 4I7VA 4MZ8A 4NNAA 3GXPA 1PS9A 1XUUA 4BI7A 4O1BA 1LOQA 4LWWA 2GUUA 1FWSA 1XBXA 2JBMA 5D38A 1WBJA 3LLDA 3IGXA 4XZ9A 1LZOA 3BV4A 3FKKA 3T4CA 2B7OA 3UY8A 1ZAHA 3QH2A 3ABQA 4WD0A 3EWBX 4UTIA 1EWDA 3SSJA 3W1UA 3HPXA 3IGUA 1MSSA 1HO4A 1FQ0A 1X8FA 4GBUA 3EX4A 4UUIA 3PAJA 2E77A 3QW4B 5CPOA 2UV8G 2E09A 3HO8A 4EOUA 2PURA 4IPJA 3G1DA 4K8HA 1F2JA 1LCOA 3W7PA 4JX5A 4FXRA 3NQFA 1BTMA 3NO5A 3HGRA 2YXGA 3S42A 1EP1A 3R8RA 2FLIA 2XFWA 5BRBA 3EWZA 2QAPA 1DKWA 3GLCA 4I7UA 4XKYB 4FNTA 2CLOA 5FEPA 3V1PA 5EY5A 4HT3A 5FEZA 3W7NA 1P5BA 2NXIA 1LBLA 4JXCA 2PC4A 1SPQA 2OMAA 3W2LA 1S5VA 1VLIA 3NXFA 1LM1A 4NJJA 2TMDA 2WPBA 1H51A 3DKLA 4LUJA 2ISVA 4NJIA 2FB3A 1JRCA 4EVZA 2QKFA 4AF0A 3I65A 4GUHA 2VFDA 1EP2A 1Q6QA 3M1ZA 4LVAA 3VFLA 3CTLA 3FJLA 1BKSA 3O8AA 1H7NA 2YR1A 4MJMA 4ZQOA 4AHQA 2QCHA 5F2LA 5CZJA 1KA9F 5LNRA 1G4SA 2VFGA 4UTWA 1OFAA 3STEA 3LV6A 4DPPA 1I2NA 5U7SA 4BWLA 1H7WA 3B8DA 3BGGA 2I1OA 4NU7A 3W76A 3TXVA 5A8GA 1ZHAA 4HNUA 4CQ9A 1KM2A 1GVRA 4O52A 5EL1A 2FIQA 4FX7A 1VQTA 2FPYA 2Q3RA 3NVTA 4ZQRA 4K39A 2X16A 3HF3A 3B03A 1YDVA 5SWUA 3PVFA 1J4EA 4OBTA 1C9DA 3TIMA 1H61A 3LM7A 1P1XA 1F05A 1T96A 4OV9A 5GVJA 1A5CA 2JGQA 3F1QA 3V75A 4GFSA 3KFTA 3TSBA 3BLEA 3C8FA 4GJ1A 3E49A 3A22A 4UNKA 1JQVA 4BR1A 1TRDA 4Z0SA 2ZFAA 2BXVA 2VFHA 4UXDA 4FHAA 1JR1A 1TPVA 3L68A 4LTSA 2ZTJA 4Y8FA 4OT7A 3WJZA 4PFMA 5G2IA 1E51A 3FS2A 1TPEA 2W0UA 3W73A 3STGA 1SU5A 3H55A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H8ZA

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