1I1X | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQANFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKKWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGASVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASSTDYVNVVNACLNVSSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQNLQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
publication title	Thermostable xylanase from Thermoascus aurantiacus at ultrahigh resolution (0.89 A) at 100 K and atomic resolution (1.11 A) at 293 K refined anisotropically to small-molecule accuracy. pubmed doi rcsb
total genus	120
structure length	302
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2001-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1i1xA00

3G6LA 2VO5A 1DWJM 4W8LA 4AZ6A 1WDSA 5I5RA 2WHJA 3VNYA 1FP9A 4MJ4A 4PMUA 3I3BA 4HPHA 3NDZA 1K9EA 1E73M 5IHSA 4UOZA 4LPCA 1QHPA 3K1DA 3WDPP 1CXLA 3GH4A 5A3HA 3WEOA 2BHYA 4W8AA 5CLTA 2YL5A 3VIFA 1JD9A 3VGEA 3TONA 4JKLA 2OYMA 2XHYA 4GO8A 3W6LA 4JIEA 1E1EA 4PRWA 3VGBA 1QNRA 2VRJA 3TTSA 1CTNA 1VEOA 3K8LA 1KBKA 4D72A 1UWQA 2D0GA 3KE0A 2BY1A 3LPOA 3W81A 5FOOA 1ODZA 1EOKA 2CNCA 1QI4A 2ZUWA 3ZT6A 3W6MA 3GYCA 4AY1A 1LJYA 3I3EA 4OOZA 2EPMX 1SFSA 3PZOA 2DPEA 4PN2A 3WY1A 2IXUA 2UY3A 1H11A 1S46A 2YA2A 1D3CA 3SUUA 1UZ1A 1WAWA 5D8WA 5F7UA 3SUSA 3WFZA 3OZOA 3QHMA 4W5UA 3WDQA 2ZX7A 4HMCA 1NWUA 5FCZA 2WKGA 4UQEA 2V38A 1JI2A 3WDJA 3S6TA 3CZEA 4U33A 1WKYA 1ZJBA 1EXPA 1CIUA 4ACZB 4HOZA 2HVMA 5EMYA 3CPUA 4H41A 4IUGA 3SCQA 1B1YA 2E3ZA 4IPLA 3I3DA 3AIUA 4TVCA 1BTCA 5JBDA 4W7VA 3THDA 1HF6A 4RE3A 1QW8A 5E0CA 5HOSA 3DYPA 1GPFA 4EKJA 3OBAA 3IANA 4KRUA 2BY2A 4DM2A 2DQXA 2ZICA 4QLJA 1B3YA 2W5FA 3N18A 5A6KA 2DH2A 1ISWA 3BSGA 4W5ZA 4HZ7A 4AMCA 2EJ1A 4BQ3A 3VIOA 1CBGA 4ACZA 1MFVA 3MU7A 4P8UA 1E6PA 3OLEA 3WNOA 2XGIA 2Y8KA 1UD3A 4N42A 4P7LA 3EDEA 1E6NA 1H49A 3U7VA 5A6LA 3WD0A 3AOFA 2XSBA 1JYVA 5ECUA 3SCRA 3RM4A 2CCRA 3RJXA 1WB0A 1BYBA 4P7OA 3AIQA 5BWFA 1OSEA 4V27A 2A3AA 1TE1A 4AIOA 4P8WA 1GW1A 1JAKA 3KL0A 4M81A 2ZWYA 3AIWA 3MMWA 3WD4A 1JXJA 1PX8A 1VFOA 2WMKA 1XSJA 1V3HA 2OLHA 2YIHA 1GHRA 2XVGA 4J3TA 1M01A 5HDRA 4UZSA 1KXVA 1LG1A 3WF4A 4C7DA 5CQ1A 1H4PA 4UQAA 1VJSA 3MSGA 1HJUA 1B9ZA 3L4ZA 2UWFA 3JUGA 1ITCA 1US2A 1J0HA 3T0DA 4HU8A 3AFBA 4KGLA 5E09A 1V6UA 2VZUA 2YKKA 4B15A 1FH8A 1NP2A 4H7VA 3PZNA 1QBAA 4C7GA 4AEFA 2YL9A 2ZXDA 1C92A 3QR3A 2YLLA 4OZOA 2RGLA 1GOKA 4W85A 3W25A 3GXIA 1VEPA 4FLSA 3AIBA 1JGIA 4ZXOA 1F4HA 4GZIA 3RM9A 1GCYA 4MADA 1GONA 4UOQA 1GQLA 3TTQA 2J75A 1QPKA 2PWFA 4CU6A 3IJ9A 4GO9A 1DHKA 4TTUA 2NSXA 2OWWA 4RE2A 1MQPA 3CUFA 2BNJA 3WBEA 3DYOA 5GPRA 5JIWA 1CWYA 4WKAA 2YDRA 1HKIA 1WZMA 1V0LA 1HXJA 4AZ5A 2WC7A 1ISZA 2WKLA 4TX8A 1V0MA 3W24A 2F61A 3WDHA 4V2XA 3BC9A 2QMKA 4D6IA 1ITXA 5BXRA 4ATLA 5A2CA 4F66A 1V02A 4GI9A 1TZ7A 4D71A 2ZUVA 4WK9A 4W86A 3VILA 1OGSA 3T0AA 1W9DM 1CLVA 4F9DA 1AQHA 3MUY1 3CUHA 5BROA 1LG2A 4MTVA 1V6YA 2CBUA 4NSBA 2G3NA 3MUIA 2J7GA 2ZXQA 3WUBA 1CLXA 4AZGA 1LQ0A 3L4XA 3UESA 1XC6A 4AD5A 3EMZA 1GJUA 3T2PA 5I2UA 2VRQA 1TA3B 6CGTA 1M04A 5D9PA 3VGFA 4KRTA 4QAWA 1V0KA 3IAQA 3IJ7A 4UQDA 4JFVA 2GDVA 3A47A 2XVPA 4XZBA 3AIRA 1UUQA 2CYGA 2XVNA 4CN4A 2AAAA 1SMAA 2XM2A 1UA3A 1AMYA 4DUWA 2DSUA 2MANA 1JZ4A 1OD0A 5DEZA 3GBDA 3ZSTA 4L4PA 3WQ6A 3W53A 3BCFA 3VGGA 4D1IA 2PF0A 1KR0A 3WMCA 1JIBA 1BVNP 4U2YA 1E6QM 1MWOA 1MXGA 3N11A 4WF7A 1EDTA 3AMGA 4LYPA 3RPMA 2GSJA 1TA3A 1HX0A 2XFRA 2WBGA 3WH7A 5CPSA 3OLGA 1EQPA 5I3DA 3SCOA 4CU7A 1PEZA 1JZ6A 1UWSA 1G0CA 1W2PA 5BCAA 2DSZA 4ATWA 3QOKA 2VNCA 2VR5A 1SMDA 5BXPA 4K68A 3QHNA 4GI8A 3WDIA 3VVGA 2J25A 4GQQA 2FGLA 3BAYA 1PZ2A 3NYDA 1C93A 2VX5A 4HMEA 2WPGA 3W37A 3AZSA 1F4AA 2V3GA 3OGVA 3N12A 4V28A 4LYQA 5IFTA 3WIJA 5A8NA 1GQKA 4AZCB 2W62A 3QGVA 3ZM8A 3VKKA 3SCPA 1JDDA 4BQ2A 1A3HA 1NOUA 5CGTA 3T2OA 2UY2A 1WDQA 1CYGA 1E4LA 3ARVA 1KXTA 1OD8A 3OZPA 2PWEA 4D6GA 3VDBA 3K8MA 3VD9A 1B90A 1P6WA 2Z1KA 3CMJA 3OGRA 5CXPA 5HPCA 3EMQA 1CENA 5D9OA 4P8XA 3WQ5A 5I77A 1VFUA 2VT0A 2XJ7A 3SCSA 2XFFA 4RE4A 4AZCA 1E4NA 2FH8A 2ZUUA 5KZ6A 2VR4A 2E8YA 4LX4A 1GNXA 3FY1A 4MB1A 3UR7A 2XVLA 2WM0A 2WMHA 1UR2A 2AOSA 1EH9A 4BQ5A 4FLRA 2VZOA 2WSKA 1V02E 1XYZA 4J3WA 3WL1A 2EBNA 2VX7A 2EPLX 5GNYA 5A95A 3ARPA 3K4AA 3WENA 4AZBA 3ARRA 5KEZA 1BYAA 1B3XA 3VGDA 2DT3A 3FN9A 1EOMA 1EDGA 1UYQA 3ZJ7A 3BSHA 1HL8A 1B31A 3AS3A 1E72M 3N13A 1CGVA 1FH7A 3VMPA 3O9NA 2VZTA 4J27A 3VIPA 1CXFA 1V03A 1TG7A 1SR0A 2GJPA 5IFPA 3AZTA 1G01A 3HU7A 5LYRA 4XX6A 2OYLA 3SEPA 2JEPA 2OSYA 4X9YA 1E55A 4C7FA 3J7HA 1A47A 4MPKA 1VBRA 2VCAA 1BSIA 4PCSA 2E0PA 5E6ZA 3CZ8A 4JL2A 2GJXA 1NM9A 3FAWA 5FKYA 1KGXA 3SUWA 4Z2HA 2WHLA 4X0NA 3HMCA 1QHOA 1UKTA 1XHGA 3CZKA 1C91A 4DUVA 9CGTA 1E71M 2VJXA 4FMVA 2J8GA 1GOWA 2WVUA 1KXHA 3APGA 2E40A 1X1NA 1JYXA 1BHGA 4HU0A 5I24A 1UR0A 1J9YA 4AXNA 1V3MA 4CKQA 4WSKA 5JIPA 1W9VA 1WNOA 3WDRA 3WF0A 1Q6CA 1K9FA 4J3SA 1HVQA 1E56A 2BFGA 5I0DA 4GINA 3ZOAA 3F5JA 1XD1A 4N0RA 2VRKA 4PMQA 4M8UA 3EDFA 1ODUA 4WIWA 4QLKA 3BAIA 1J12A 4CCCA 3HJEA 1WDPA 2WW5A 5A2AA 1QI5A 3SUTA 2A3EA 1CNVA 4MB4A 3BAKA 4AWEA 5ABEA 1JDCA 2WK2A 4J7RA 2EXOA 3CUJA 3GXDA 2WMJA 1B3WA 2NT1A 3FHQA 4WJXA 2FHFA 2O9PA 5AY7A 2C0HA 1E6SM 2WVTA 3L4VA 4UR9A 3VX0A 3N17A 2FDMA 3EDKA 3CMGA 1HVXA 1KXQA 2B31A 3RJYA 3AZRA 1LWJA 3WEMA 1QW9A 1E43A 3A3HA 5GNXA 4ACYA 4UOJA 1OIMA 1W3KA 2F2HA 2V3EA 1R85A 1RP9A 1J10A 2ZIDA 3KWXA 1XV8A 5E9AA 2CHOA 2F8QA 4J3VA 4HOXA 1PAMA 4JCMA 2BXZA 5A6AA 3VDCA 4W89A 4FK9A 4CCDA 1W1TA 4HOWA 2ZXAA 4PTVA 2Y8VA 5GNZA 2V5CA 5FIPA 4AD4A 4UNIA 4UCFA 4KMQA 5A69A 4GIAA 3PZGA 4OBRA 2JE8A 2J78A 5CLWA 4BA0A 4H8UA 3O2LA 3ZJKA 3FHAA 2VI0A 3WD1A 3OG2A 4YN5A 2VVNA 1G9HA 2G8ZA 1DP0A 4D6DA 1E0WA 3L2MA 1E3ZA 2ZWZA 3W28A 3SCWA 3ZO9A 3SCVA 2XVKA 3ZR6A 2X05A 2PBOA 4A3YA 1NWSA 5AC5A 3FW6A 8CGTA 2XWEA 4CN6A 2GJRA 4CD6A 3OA5A 4MAVA 1W1YA 4HZ8A 3FXYA 3MO4A 3DYMA 3G6MA 3NIYA 1MYRA 3W29A 4URIA 4WKHA 1J0ZA 2W61A 1V3IA 2E9BA 1CPUA 5D9NA 3TA9A 1BF2A 2CKRA 4OBSA 3BAXA 3VDHA 4BZYA 1XYFA 4GPNA 2E8ZA 2WXDM 3VD4A 5DFAA 3WMBA 1FA2A 2XWDA 5M3WA 2G3IA 4JL1A 2CITA 1LLOA 1QNQA 2NT0A 1DWIM 1XH0A 4R5EA 2AMGA 4AW7A 4QCFA 1KFWA 4A4AA 1R86A 7CGTA 1JZ5A 5ABGA 5A8QA 2CKSA 2QLYA 3BXWA 4MNJA 2DSKA 3VU2A 3SCTA 2DSWA 4QLLA 5D4YA 3AHVA 1K9DA 3CZGA 4LYRA 2GFTA 1OBAA 2QHAA 4AIEA 2FH6A 2YBUA 3WH9A 1BGGA 1PJ9A 4PMVA 1E40A 2CESA 4S3JA 4D6EA 4NI3A 1FH9A 3VMOA 1DWFM 1ESWA 1GVIA 4GZEA 1OB0A 3CHFA 1I75A 1H1NA 1KGWA 3DC0A 4XV0A 1W32A 3BH4A 4AIUA 2W4XA 3GH7A 4P7QA 2D22A 4M56A 4ML4A 4U5IA 2J8FA 4PMDA 1QI3A 1CGXA 1TVNA 4MDOA 1WO2A 1JAEA 2VZVA 3UCQA 2PBGA 3M6DA 2HISA 3K8KA 1C7TA 2Q8XA 3VMNA 7A3HA 2JFEX 3NSXA 4UQBA 2CBVA 2J62A 4M24A 1QNSA 1O7AA 4RL3A 2XIIA 2D23A 1X6NA 1HL9A 3SUVA 2CETA 3ALGA 4PMRA 2WZIA 1R8LA 2W92A 2FHCA 1ZBWA 3EDDA 2VX4A 3WH6A 1KQZA 1V08A 3NCOA 2OSWA 1WPCA 4Z2LA 1MVYA 1XH1A 2CHNA 3VIHA 1V3LA 3OLDA 3WQ8A 1BAGA 4U31A 3QOMA 1OT1A 1H41A 3W38A 4PYSA 1UWRA 1UKPA 5I79A 1CZ1A 1PX3A 1MW2A 4CUCA 1MW0A 3CZLA 4GKLA 1EA9C 1HJQA 1UD2A 5C70A 1DWHM 1MW3A 1TR1A 3CHDA 3W27A 3WNNA 2YJQA 1JG9A 4AEEA 3ARYA 4W7UA 1XGZA 2J74A 1UWIA 4YPJA 4D6HA 4U5KA 4PTXA 1SYTA 3WD3A 5JUVA 2BS9A 4H8HA 3GDBA 3GM8A 3AHTA 5EFFA 2C7FA 1OGBA 3RCNA 3THCA 3EDJA 2J7EA 3A4XA 4IM4A 4XZWA 2OWCA 4UQ9A 5HPOA 3U5YA 4HTYA 3U57A 4JKKA 2ZX5A 4Z2KA 1W9UA 1G94A 1JDAA 3AIEA 2XYLA 2WAGA 5CPQA 1H09A 2WBKA 3ZT7A 2G3MA 4HA3A 2IXVA 1Y7VA 1Q6FA 3CBWA 1V6VA 3ARSA 1ZS2A 3RM8A 1JZ2A 1PX4A 1FHDA 4UFKA 2J47A 2XGBA 2GVYA 3WMSA 2A3BA 4Z2IA 1UH4A 4W93A 1QI2A 1ZU8A 4PTMA 2WCAA 3BAWA 1XD0A 4TUFA 1E6ZA 1GVYA 4S3KA 1E6XM 4E4PA 1JF5A 1I1XA 4F79A 4CD4A 4FF5A 3W0KA 3WF2A 1IT0A 1J0KA 3W4RA 4Z2JA 4E8DA 1E1FA 3L2LA 3L4UA 1JI1A 4HA1A 3AS0A 4Q7NA 3WH8A 3ALFA 1VENA 1EIBA 1DWGM 3WL0A 2X1IA 5TD4A 1W91A 4UQCA 3VIMA 3AROA 4Q22A 1W3JA 1VBUA 3AICA 3BMVA 3S2CA 1J0JA 3WQWA 3NSMA 3B9EA 1FOBA 3AIVA 3GH5A 3VD3A 3CHEA 3OGSA 3IJ8A 4PTWA 4CD5A 1EO5A 2XPKA 1CGWA 2ESCA 5BXSA 3L4YA 5HNNA 2WCGA 3QHOA 3T08A 3B9DA 1HP4A 4L4OA 3BGAA 2WSPA 3N04A 2J7HA 1CGYA 4P7RA 4YHGA 3PZUA 1TFVA 3PBGA 1ZJAA 1R7AA 2WMGA 3WUGA 3AS1A 4BF7A 4DWSC 1W9XA 2QPSA 1E9LA 3GXFA 2VQTA 4LGXA 2W67A 4EAMA 1QI0A 1GOOA 1MQRA 1HJSA 4P7NA 4OKDA 3ARQA 1RP8A 3AMCA 4HP5A 1BPLB 1OIFA 4GQRA 2C8NA 4D1JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ARU A;  1JF6 A;  1RH9 A;  2ZUN A;  4UZU A;  1UR9 A;  3WUF A;  2FHB A;  2PWG A;  2YA1 A;  2Y4S A;  1QNO A;  2BVT A;  1ISV A;  3FND A;  1AVA A;  3UET A;  1JFH A;  2WVV B;  3TTY A;  1R87 A;  4TVD A;  1V3K A;  4W87 A;  4JHZ A;  2A3H A;  2CBJ A;  5IDI A;  4GXP A;  3CZJ A;  2WMI B;  3MMD A;  1CDG A;  1XRV A;  2G4F A;  3K4D A;  1XSI A;  3CIV A;  1JZ8 A;  1UWU A;  1M53 A;  2JEQ A;  4M29 A;  4F9J A;  3AHX A;  2GDU A;  2ZUT A;  3WQV A;  3ZJ8 A;  1GOQ A;  2O9T A;  2ZX6 A;  2ZUM A;  4QDM A;  2OYK A;  1UR4 A;  3GNR A;  4TXE A;  2VL4 A;  1ZBC A;  3PZT A;  1JYN A;  5IHR A;  2NW0 A;  3AYS A;  1W1V A;  2IUZ A;  1KQY A;  3WNM A;  1UOK A;  3N1A A;  5BRQ A;  4D6F A;  1W2V A;  2YLA A;  4M1R A;  2WVV A;  2V3D A;  4AYS A;  4CD8 A;  3WBA A;  1UKS A;  1H3G A;  1ZL1 A;  3SUR A;  3GNO A;  2WMI A;  1JL8 A;  2YL6 A;  1C7S A;  5ABH A;  4WSJ A;  3ARW A;  2VCC A;  2YBT A;  3CTT A;  4AZI A;  2VOT A;  5CSU A;  4HZ6 A;  3AHZ A;  2ZX9 A;  5D9M A;  2VZS A;  2Z1S A;  4D6J A;  2WCS A;  3VDA A;  4AZH A;  1KWK A;  4OUE A;  5HBF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1I1XA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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