4LVA | Genus

Total Genus 171

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	171
sequence length	479
structure length	469
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT). pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	171
structure length	469
sequence length	479
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4lvaA02

1W3NA 1JUBA 3SI9A 3FYOA 3UZJA 3FLUA 3SJ3A 3CT7A 2B4GA 3TW7A 5FF3A 1GVRA 3PSWA 2NWSA 2A5HA 4NX0A 3KVMA 3UD6A 3N9RA 2BZNA 1KM4A 1DQWA 1A5BA 4KFPA 3BVJA 3BLIA 4IX0A 1OK4A 1PL9A 2QCGA 3M41A 3PC0A 2QAFA 1VRDA 1QO5A 2Q3RA 3FA5A 1ZJIA 3R13A 4AWTA 2J6XA 1XUZA 3W1PA 4HT3A 3UY7A 1XFBA 2VFFA 1TREA 5HWMA 3G0XA 3DAQA 1OF6A 5G5IA 1OX4B 1FWTA 3CTLA 3STCA 3W76A 1WXJA 2Z6IA 1YTEA 3PBYA 4CNOA 3TROA 3AO0A 1EUAA 3E0IA 3K30A 5D05A 1I2NA 3MI3A 1U5JA 2YX0A 1HTIA 4JX6A 4AAJA 2AGKA 2D73A 5FF7A 3N2MA 4AEOA 4CQAA 5AC8A 4UXDA 4AF0B 4NJGA 4PL2A 1K03A 2X16A 1F2JA 2I9EA 2NUYA 3UYCA 1W3TA 3STFA 1TSIA 2C16A 3GKFA 5T26A 3N2XA 3LM7A 4ZMGA 1YPIA 2VFGA 1TPVA 4MJZA 4NVTA 3LERA 2FTPA 3E12A 3TMQA 2E68A 2GQAA 4FNRA 4ZQPA 2WNZA 3W2MA 1FWWA 2J9ZA 3SZ8A 3NR0A 2VKZG 1O4UA 3LGEA 4FB7A 1B4EA 3CHVA 4YMZA 1UJPA 3SIZA 3LCLA 1K7FA 3W23A 4FNPA 2OX1A 1KW1A 1YTDA 1QAPA 1KA9F 5LSMA 3IIZA 4UMBA 4S2BA 4DF2A 5CZ0A 2EPHA 3O6CA 2CLIA 1BWKA 4WOQA 3LLDA 4NJHA 2QUUA 4FNQA 2F84A 3RNDA 5AC6A 3TKFA 3G1VA 4PL1A 4ZQRA 3JS3A 1K3UA 2H8XA 4N9BA 1G7VA 4XBSA 5K3VA 2ZRWA 1H50A 1QOPA 4O0KA 1FDYA 1HFBA 4O50A 3W7KA 2VFEA 5CZJA 1XUUA 2Y7FA 1KM2A 4QAIA 1RV8A 4X22A 4M7TA 1PIIA 1H7WA 3ABQA 3DFQA 5I3JA 2C6QA 2GOUA 1R2RA 3I65A 4MFDA 1G7UA 4FXRA 3PVFA 5BOOA 1G6CA 3S1VA 4ONVA 5EKYA 2ALDA 2R8WA 3PBWA 5CPLA 3ABOA 2W79A 1DV7A 5H2ZA 2R94A 3NZRA 5I3GA 3B0VC 2V30A 4IPJA 5HMSA 4IGHA 5E1QA 2C3ZA 4XTDA 1UBSA 1KFKA 1MZHA 1F6KA 3JR2A 4O1AA 5EBUA 4IMEA 2E5DA 3W7CA 3O07A 2R14A 2GPTA 3UXAA 3IIXA 5G2IA 3C3NA 3W73A 2QDGA 4OE7A 1C29A 1SO4A 3M5XA 3W7EA 2NXHA 1ME9A 2ZZ6A 2FPYA 3EWYA 2QF7A 5AN7A 3NA8A 5KTLA 2CLFA 3WJXA 3NQ7A 3MP3A 2BSLA 2X2GA 2C18A 3MUXA 4ZQOA 3L0KA 4NZJA 3TFCA 3NEVA 4LC6A 3TCEA 4Y90A 2KZHA 3QH2A 5I3IA 3IGSA 3L21A 4K7VA 3TE9A 3W7HA 5HWJA 3MHUA 3W70A 3NPXA 4LS0A 4M7SA 3R89A 5D32A 1PCWA 3L66A 5ABTA 1SFJA 4WOZA 3OIXA 2ISVA 4HSNA 5HWNA 4CNNA 1VS1A 4AHPA 1G4PA 3TIMA 4R34A 1H1ZA 3DENA 5HUPA 3LI1A 3TQVA 4CQ9A 2GVLA 2C19A 4O16A 4JICA 4Q32A 4WXZA 4KFNA 4WX2A 1JCMP 3C56A 1BWLA 3W88A 2PURA 1ME8A 5U7SA 3M5YA 3FJ6A 3W1MA 2OZ0A 5CZTA 4XBKA 2YPIA 4FHAA 2VEIA 1G67A 2WSRA 3W1UA 3I6RA 2E5BA 2B7PA 2CLHA 1H60A 3Q37A 2ZZ2A 3MI2A 2Y7EA 3PAJA 1OK6A 2FB2A 4JXCA 5F2LA 3C2FA 4O1DA 4O10A 2VFIA 2Z6JA 2Y63A 5CPMA 4IJBA 1OFOA 1SFLA 4LS2A 1TRIA 1G4TA 4LV4A 4Z1DA 2YFOA 1TPWA 4CNPA 5DY2A 1THFD 3LCHA 3B06A 1QWGA 1QCWA 1LP6A 3THAA 4EVZA 5AB3A 3U8GA 3EXRA 3TSDA 1TPEA 4GC4A 3G18A 5E0KA 1RD5A 1IXPA 2C0AA 2CWNA 1EB3A 2CLKA 5DXXA 3GDLA 3TX9A 3BW2A 4K38A 3EWUA 4UNKA 3N9SA 3N34A 5DBTA 2YDAA 4R33A 1TYGA 4O1BA 1AL8A 3TK7A 4RXFA 4Z1CA 3W1XA 1FWRA 1FCBA 1GYLA 5F2GA 1DOSA 1LM1A 4UC5A 4JS3A 4OWGA 3BO9A 1TIMA 1UB3A 4NQ1A 1WDWA 3W1AA 5D2TA 3G1YA 2V9DA 1XM3A 1YDVA 4JTIA 5G4EA 3HBLA 1TCDA 5CSSA 1GT8A 4WXYA 4GE8A 4U4MA 3GX9A 3O06A 3BW3A 4LVDA 3BK0A 1H61A 3GDTA 5CG7A 4O0ZA 4AHOA 3E96A 1N8FA 4JTSA 3OG3A 1KM0A 3BPWA 1RPXA 1EP3A 4HPJA 1Q6QA 2XN2A 3W87A 2E5CA 5I3HA 3LX9A 3GZ3A 1OFRA 2DZSA 2V5LA 2A6NA 4K6AA 3NAVA 3I68A 4KFOA 3VKJA 4AB4A 1RZMA 5IBXC 5LNVA 4ADSA 1Y0EA 1YDNA 4IOTA 4LVAA 3IIPA 3QSRA 3M0ZA 4O53A 3HGOA 3JRKA 4PH6A 5BRBA 4K8EA 3LCIA 3EX4A 3KVJA 5L9FA 1TPUA 2DJXA 2E77A 3ATYA 4E38A 1MO0A 1RQBA 1ZAJA 5G1YA 2BTMA 2Y89A 4GWEA 5LZLA 4PODA 4OBTA 5EA9A 1OFBA 4XKYA 2X1RA 1EEPA 1P0KA 3CWNA 4HNUA 1FXQA 3OVRA 3EWWA 5D02A 1OFQA 4GUJA 5AFDA 5C5YA 1OJXA 5F4XA 1L6YA 3LCWA 1EX5A 3OBKA 1D3HA 4JX4A 2AAMA 4MFEA 1KV8A 5EL1A 1K8YA 4JYDA 2Q8ZA 2GJNA 4GRSA 1KFCA 1FDJA 1B57A 3A23A 3FFSA 4BWLA 5DN1A 4UFLA 2ZTKA 2NLIA 3BG3A 2J9YA 4O52A 2GVJA 1FQ0A 1TPFA 3NOEA 1F6PA 4O11A 3P62A 1JVNA 3EKZA 1I2RA 1TTIA 3Q58A 3HOJA 4I7WA 5D2WA 3L0GA 2Y61A 5LNRA 3G8RA 3G0UA 1UASA 1VLWA 1OFEA 2JKPA 1OYAA 4LT9A 3LTPA 3L65A 3W74A 1SW7A 3SR7A 4IMGA 1TV7A 3FKRA 2CZ5A 1P5BA 3DGRA 3KRZA 3QQ0A 1S3HA 4UNLA 2HTMA 4AWSA 4FNTA 4OV9A 3S9YA 2BX7A 3LXCA 2Y88A 5G2HA 4ZQNA 5CZSA 2TPSA 3ZS4A 2ZYFA 1OABA 2A7NA 4GUIA 4U28A 1FWSA 5KMYA 3FYPA 1VHNA 3W1TA 1I4NA 3UWVA 1GYNA 4PTNA 4TIMA 5K9XA 4LS1A 2I14A 4BK9A 3BLEA 1GTEA 1Z41A 2DP3A 5DBUA 2QUVA 4XTIA 3DKJA 5DY3A 5LKYA 2HS8A 4RLIA 1TMHA 3S1XA 4GXMA 3R8RA 4L4LA 3O6DA 1W1ZA 4TMBA 5BMXA 2Z0IA 2DZXA 3USBA 3LV5A 3ZR4A 4WUIA 1IXNA 5AYYA 3H53A 3HGRA 4FIRA 3NQ8A 1RR2A 4MIMA 2ZRUA 5EMUA 5AC7A 2RDTA 3TU9A 3NNTA 4DELA 4I7UA 2OJPA 1H1YA 3EB2A 2JK2A 1ZHAA 6TIMA 2WNNA 3GNNA 3PG9A 1LLWA 4UTUA 3KHJA 4RZ6A 1M7OA 2NV2A 3N19B 4JIQA 3KAOA 3IVSA 1KFLA 2DORA 3NO5A 3LRMA 3LXAA 4LUJA 3KXQA 1Q3NA 4MPQA 2EHHA 1SW0A 1G4EA 3HG2A 1AW2A 1YYAA 3MMTA 1TV5A 2Y6ZA 2ATMA 3NQFA 3PUOA 1H7NA 3CEPA 5HJLA 1ALDA 3KX6A 5D30A 4UTWA 4OGZA 1MEIA 4UFMA 5CKSA 3NYZA 1XBXA 3P61A 4DEFA 1LDCA 1YLVA 1EWDA 4XQ6A 1G69A 4UTTA 4BWLC 1WA3A 5TBOA 3FOKA 1R30A 1MXSA 3LCGA 4DPQA 2V2DA 1B9BA 2F7FA 5G2WA 2WOQA 3GDKA 3ZWTA 3EWBX 3A5VA 1O5KA 1WBJA 1J4EA 2NXGA 4Z1AA 3G3DA 3TAOA 4JNMA 4MLJA 4JGDA 4NJIA 4JTJA 1GJPA 3GKAA 4Y6GA 1RQEA 4UFJA 4UTIA 1GEQA 4O12A 3KRSA 3BV4A 2JGYA 1VQTA 2QCFA 2DZWA 4O54A 1GTHA 3DFNA 3W7GA 1FUYA 3SECA 1VR6A 1V7YA 3MYPA 3OVQA 3GYEA 4ORIA 2Q8LA 3RK8A 4MZ1A 3G0SA 4A2RA 4XUGA 3BLFA 3GK0A 4FX7A 3T55A 1WBHA 2J9XA 3C4UA 3S8HA 1OF8A 3PUEA 3TSMA 3TJXA 4M5PA 1UUMA 2J88A 1SSDA 1W31A 4JTTA 2LLEA 4XKYB 2G97A 4K7YA 4BR1A 3W1NA 2YXGA 3MHGA 1PS9A 2HMCA 3PB2A 3V75A 1I45A 2JBMA 4N9DA 2ZBTA 2FLIA 2NUXA 2OMAA 5EPDA 3RFAA 1KM3A 2I1OA 1FDZA 4G1KA 3L0NA 4RCXA 3HF3A 5BW6A 1H7XA 1WOBA 1TQJA 3WJYA 2B7NA 4DF0A 1VCGA 3EX2A 1K7XA 1FCVA 4NNBA 5D2XA 1LRNA 3DFTA 3NQVA 1ICSA 3W7DA 1W37A 1CW2A 3UWUA 3UWWA 1VYRA 2B7OA 3EXSA 1XBVA 3G8EA 4JTGA 4K39A 4LVBA 1FXPA 2QDHA 1W5PA 3QPZA 3DFPA 4Z1BA 1PE1A 2ZZ3A 4WY0A 2VFDA 3NG3A 5C55A 3TV8A 4AHQA 3CC1A 2ZFAA 1A5SA 4QITA 3W7IA 4O8RA 2X1UA 1F74A 3B0UX 1NEYA 1OFDA 3IIVA 3LBCA 3SGZA 5EYWA 3CIXA 3S5ZA 4N02A 4AWUA 4Y96A 2GUUA 2E6FA 1TPH1 2YZRA 3HG5A 3RF9A 2EKCA 2H3BA 3QMRA 1VCVA 2ZTJA 2Y7DA 4UTWC 2V2HA 3GXTA 2QUTA 3HQ1A 3S6DA 1LOQA 1H62A 1NFBA 3NPWA 4UMAA 5C54A 1PVNA 5K9CA 4UTTC 4JD4A 2WPBA 3C2EA 3B4UA 4N6EA 4HSOA 1XDLA 4UR7A 5FEWA 4L4MA 4BI7A 1QPRA 3F4WA 3IGXA 4Z0SA 2QCCA 5LGXA 1JQXA 2W6RA 1JULA 1LTDA 4OHQA 2C13A 4S1FA 1KFJA 1H51A 5LHFA 3NM1A 5KINA 3C0JA 4K8HA 4NZFA 4O15A 1ZNNA 3M7WA 1KBIA 3W7QA 1BTMA 3R5EA 1QNVA 3W6YA 1KM1A 4YCOA 1CI1A 5GVJA 3LBMA 5CPOA 3TR2A 3W2LA 2RH9A 3S5YA 2WV8A 3DHFA 2WSQA 2PE4A 5CPNA 1T99A 2JGQA 1OX6A 2QJGA 5K4ZA 1V5XA 1M6JA 2H90A 1W5NA 2NXIA 2NX1A 3VE7A 1XKYA 3M43A 4H3DA 1YXDA 1AW1A 2VEPA 1S5VA 3NQ2A 2QCHA 3F4NA 2VELA 1X7FA 3EEGA 1JRCA 4JY8A 1L6SA 1JUKA 1VJIA 2YCEA 3UY8A 4LV9A 1X6UA 1Q6RA 2YYUA 4UFHA 3LHWA 3M5VA 4K36A 4KKXA 3FIGA 4NU7A 3RU6A 2WJZA 1LBMA 2A21A 5BNKA 4TU1A 4LOCA 4RZ5A 2B0MA 3UWYA 1VYSX 4GUHA 3FJLA 3MWAA 1R47A 3U2OA 2Q3OA 2ISWA 3LOTA 3RLVA 3HO8A 3HG4A 1TQXA 2WSYA 3P80A 1F76A 3B8DA 4RZ4A 1QPQA 1AMKA 4FNSA 2H6RA 3H54A 3P5YA 4MZYA 4UIOA 2GQ8A 3NQEA 4FX6M 4IMCA 2DZUA 3LHTA 3HIJA 1ZAHA 4NNCA 1QO2A 1KTNA 4W9TA 5J5DA 5KSWA 3GXPA 3ELFA 1VLIA 3W71A 2RKXA 2CLLA 4DPPA 4QQ3A 3R2GA 5HR7A 4PCFA 2Y85A 4UCGA 3F03K 3NQGA 4O28A 1SPQA 4CLMA 4N9EA 3TSBA 2ATSA 1GPWA 4IMDA 3W75A 4UR8A 4UTJA 4JN6A 1AK5A 2YW4A 3EXTA 3CM4A 4A29A 5K4XA 4OU1A 4ML9A 3TNOA 3P84A 3TXZA 3O15A 1GWJA 1JCXA 2BLEA 3QRHA 1GVFA 1IIHA 1TPB1 2WQPA 3B05A 1A5CA 1G4SA 3IRDA 2PRMA 1YTKA 1K8XA 3CIWA 3QZEA 1LZOA 2PRLA 3S0CA 4N6FA 3V1PA 4MYAA 3QJAA 1J2WA 3TFXA 2A6LA 1XL9A 3P60A 3QC3A 3G1SA 1N55A 1EIXA 4HHPA 1NF7A 1TRDA 3HPSA 2YSWA 2IQTA 3PSVA 1M7PA 2QCEA 2ZRVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4LVAA

Total Genus

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