3WSUA

Crystal structure of beta-mannanase from streptomyces thermolilacinus
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
GLHVQGGRLLEGNGNDFVMRGVNHAHTWYPGQTRSLADIKALGANTVRVVLSDGHRWTRNGPADVAAVIDRCKANRLICVLEVHDTTGYGEEPAAGTLDHAADYWISLMDVLAGQEDYVIVNIGNEPWGNTDPAGWTAPTIAAVKKLRAAGLAHTLMIDAPNWGQDWQGVMRADARSVYEADPTGNLLFSIHMYSVFDTAAEIDDYLEAFVDAGLPLVIGEFGGPPDQWGDPDEDTMLAAAERLRLGYLAWSWSGNTDPVLDLAIGFDPDRLSGWGQRVFHGVHGIGETSREATVFGKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-mannanase
publication title The loop structure of Actinomycete glycoside hydrolase family 5 mannanases governs substrate recognition
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces thermolilacinus
total genus 119
structure length 300
sequence length 300
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wsuA00
3QHOA 1W9VA 3DC0A 5E9AA 1UR9A 3M07A 4PCTA 4NRRA 3VKKA 4B3LA 4AC1X 2QLYA 3FHAA 4UQ9A 1FFRA 1V3KA 1CGTA 1VFMA 1XCXA 1MW1A 2VMFA 2XWDA 1UR1A 1WDRA 1X6NA 1H0GA 2WVVA 4W93A 3CUJA 1ZJAA 1WDPA 1OM0A 1D2KA 4MDPA 2D20A 2VJXA 2BXYA 5FKYA 1RPKA 4QCFA 2ZXDA 1JNDA 1BQCA 2X09A 3BSGA 5FOOA 2QMKA 1HN1A 3IAQA 1FFQA 1VJZA 2X0YA 1PAMA 5I79A 1BSIA 1R85A 4PSPA 1JYNA 4MPKA 1UYQA 5EFDA 3WH9A 2D1ZA 3TTSA 1E6SM 5CGTA 5ECUA 1CXHA 4U2ZA 2A3BA 2ZWYA 2W66A 1XSKA 3WH7A 1C92A 1OIFA 4HTYA 1G1YA 2J7CA 1HJQA 3VIHA 2CKRA 5CLWA 3PBGA 3WF3A 1H2JA 5IHSA 1VEPA 1UA7A 4UFJA 2Y8VA 1MFUA 4P7NA 2RGMA 1FH9A 4JHOA 4UQDA 4JHZA 1DEDA 4D6GA 3PTKA 1WZKA 1UH2A 1K9EA 3BAIA 3N1AA 3WQ4A 5BXRA 2DIEA 1OT1A 1VFOA 2UY5A 3VD4A 4W89A 1J11A 4AZBA 1E73M 4M82A 3EYPA 4FLRA 3G6LA 1ZB5A 3M7SA 3GNOA 1AMYA 3MUAA 1PX3A 1JGIA 1GQIA 2NW0A 4AIEA 4TOQA 5GNYA 2J75A 4HZ8A 2G3MA 5DFAA 2D3LA 3N9KA 3U7BA 3ARXA 4ACZB 4CN1A 3BSHA 2VVSA 2CHOA 2QMJA 1GPFA 1LWHA 4UOZA 5I5RA 4WJXA 1JYVA 2A3CA 2WHKA 1OSEA 4WK9A 1PIGA 4RE2A 3N18A 2XGBA 1WPCA 2F61A 5DEZA 5CXPA 2GJXA 1UR0A 1L0PA 1SMAA 3WBAA 1EQPA 3T2OA 4U33A 1PX4A 2YBUA 3VPLA 3WENA 3VGGA 4MNKA 2NT0A 2E8YA 1HVXA 4P7QA 1RP8A 3D3AA 4M1RA 2WMIA 3AHYA 1MW0A 5CZKA 3I3EA 3VGHA 3POHA 5A95A 4WKAA 3BH4A 1B90A 3BC9A 4CKQA 5HNNA 3AMCA 4C7GA 2YL6A 1TA3A 1QI2A 3CHFA 1PZ2A 2Y24A 3CLWA 3RJYA 1KGUA 2VCCA 3O9NA 2ZIDA 3ARUA 4HA4A 1QNQA 4LQ1A 4PMDA 1VFUA 1ZBKA 3NIYA 6TAAA 1BF2A 4L4PA 1UQYA 4D6JA 2G41A 1VB9A 3ARQA 4TUFA 3ZR5A 4QLKA 2J7EA 4QDMA 4V28A 2D0HA 4XX6A 5ABGA 2ZUWA 4M8UA 4DWSA 4HA1A 1G9HA 5AC4A 2BVYA 3SEPA 1MVYA 2YLLA 3A47A 3VILA 4PUEA 1M03A 4PMXA 4KGJA 4W5UA 1UWQA 3U57A 5BRQA 3CZJA 4UNIA 2J8FA 3WEOA 1E43A 2VX4A 3WUBA 1FP8A 4AZCA 1HNYA 3L4WA 1W2VA 3VIFA 3BLPX 4WSKA 1CECA 4UFHA 2D3NA 4PMOA 1HX0A 2TAAA 2JF6A 3ZIZA 4J3TA 4D6DA 5GPRA 2W4XA 2YA0A 3ZSTA 4AXNA 4GZEA 5A6LA 1K9TA 2OLHA 3EDKA 3RM8A 4XB3A 1UG6A 4EE9A 3MS8A 3AHVA 1UD2A 2XPKA 1Q6CA 1BYCA 2CBVA 2W62A 4J3XA 2WZHA 1E9LA 1UZ1A 2G3JA 3CGTA 3THCA 1FOBA 5CSYA 2VZSA 2VC9A 3DYPA 2ZOXA 4CGTA 1MQQA 3ZJ8A 1WNOA 2YLAA 3GXFA 4ZEPA 3GH5A 3WFLA 3W38A 1LL6A 4ZFMA 2XUCA 1JG9A 1VFFA 3VMPA 1C3FA 1NQ6A 4Y7EA 3VU2A 1B2YA 1KBBA 4U5KA 3AQUA 3S6TA 4BQ4A 1E0WA 2CITA 4EAMA 1CLVA 1CDGA 1UH4A 4JFWA 2BXZA 4KRUA 1B3ZA 1C7SA 3NSNA 4UQBA 3PZUA 3WD2A 1CZ1A 2X0HA 2XFRA 3OGVA 2CBJA 4M29A 5I2UA 2O9OA 2XM2A 1XH0A 2C7FA 2VQUA 1DP0A 3KZSA 1ZBVA 4AD2A 4AZIA 1JAKA 3EMZA 3CZEA 2JALA 1QPKA 2J79A 5IXEA 3GXMA 3QHMA 2QPUA 1OCQA 2X2YA 4BCEA 2GFTA 4HU8A 5ABFB 4K68A 3SCSA 3QHNA 2BV9A 2CXGA 4U31A 3L4ZA 1JYXA 1EHAA 1VJSA 2BS9A 1HF6A 3VDCA 5D4YA 3T0DA 1E3XA 1GW1A 4QLLA 4W87A 2Z1KA 1PJ9A 4FK9A 1HL8A 5M03A 4MADA 1A47A 3VIMA 1GONA 3J7HA 4MNMA 4P7LA 2B31A 2CEQA 4LYRA 4B9ZA 3T08A 1JDCA 2WKLA 3JUGA 4PTWA 3WNKA 3AS0A 4D6FA 2XM1A 3MV01 2G8ZA 1MW3A 1OINA 4GO9A 1WE5A 3AIVA 2G3IA 1JI1A 2Y8KA 2EBNA 3FXYA 1NOFA 1G0CA 1KQYA 4WKFA 1J0HA 3AMLA 5TD4A 1DWGM 3EMCA 1GOMA 4GI6A 1E6PA 1H11A 1GQLA 2XGIA 1J9YA 3WD3A 1CGWA 3VIKA 2O9PA 2XSBA 3AS2A 5A8OA 3U5UA 3LPPA 1QHZA 2CBIA 3VGBA 3N11A 4U5IA 4DUVA 1QNPA 2J78A 1KWKA 1A3HA 1E6NA 1ISWA 1XRVA 3WD4A 1XYZA 5A6AA 2WCSA 4ACZA 1LL4A 3IJ8A 2GK1B 1TG7A 3TA9A 1B31A 1UR2A 1J10A 3PTMA 4UZUA 3FAWA 2OSYA 2J77A 1AQMA 3W6MA 1ESWA 3LPOA 4AZGA 2JFEX 2XVKA 3LMYA 1ZBWA 2NT1A 2VX6A 2WCAA 2Y4SA 3EDEA 2CHNA 5CQ1A 3WKZA 4PBGA 3WNMA 5D8WA 1V0KA 4CVUA 2O9TA 1HP5A 1QI5A 5A6SA 1K9FA 1OD8A 1VAHA 3VM5A 3B9EA 3IANA 2WM0A 3ZM8A 3BGAA 2ZXAA 2GJRA 4H2CA 3SURA 4XV0A 2G3NA 3NSMA 3PZIA 2Y2WA 4CN6A 2WHLA 3W0KA 1BFNA 1XYFA 1C8YA 2DDXA 1WAWA 1TMQA 5BROA 1GQJA 1ITCA 1HIZA 3II1A 1J12A 2DSWA 5A3HA 1VENA 1R86A 3I3DA 4LYPA 1EQCA 4H8VA 1Q6DA 1B30A 1CXIA 3SCNA 2YKKA 2A3HA 4NZCA 4UOQA 2VNCA 1MFVA 4PMZA 5JIWA 2UWFA 2YBTA 2C8NA 1IZKA 1JF6A 4UFLA 3WN6A 2WVUA 1TR1A 2VQTA 4P8UA 4KWUA 3KWXA 3PZQA 2VCAA 1W32A 1TFVA 5HBFA 4X9YA 1TCMA 3SCPA 3FHQA 4PCSA 5D9OA 4CD4A 3A4WA 1C93A 1W3KA 3OGRA 3MKKA 3SUTA 1UD4A 4AY1A 4KMQA 1MXGA 5A6JA 2W92A 4Q22A 4W8AA 2WNWA 3WBEA 1V0NA 1XCWA 2ZUSA 5A6KA 1QBBA 2F2HA 3HN3A 3WNOA 5BXSA 5A8MA 2V5DA 2W67A 3WELA 1R8LA 1MW2A 1C8XA 3VMNA 3OZPA 1UWUA 1GNXA 2V5CA 2E9BA 5C71A 1E6ZA 1H1NA 3SUUA 3VOCA 3VD3A 3AISA 1UR8A 1H49A 5A1AA 2YL9A 4JFTA 2GJPA 1EDTA 3K46A 4U2YA 3TP4A 4HPGA 2BY3A 3GDBA 2WC7A 4MJ2A 1ZBCA 3NDYA 2DH3A 3ZJ7A 3ARZA 3N17A 1UD3A 1E3ZA 5HPOA 4S3JA 2VO5A 3OLIA 2W63A 3VGFA 2VX5A 1CENA 4IM4A 1JF5A 1EHNA 3MUIA 4YHGA 2J62A 3M46A 1QNRA 1V0MA 4AZHA 3KE0A 2PI6A 3WH6A 1E0XA 1NWUA 4H7VA 3CHDA 1CBGA 1I75A 2J7BA 2DT1A 3ZJ6A 3WF2A 1M04A 1HL9A 2QPSA 5E09A 3UCQA 2J7GA 2CESA 4RE3A 2ZUMA 4JKLA 3AXIA 1G5AA 3T2QA 3AIUA 4EANA 4MB1A 1HKJA 1W3HA 5AY7A 1J0IA 1PBGA 1Q4NX 4JL1A 4ATDA 1E5JA 1I1WA 2W61A 3CMGA 2XG9A 3BAWA 4ACYA 2V3GA 5A94A 1GUVA 3SCWA 2WC3A 2XVPA 5HPCA 3ZQ9A 3RMEA 1E6XM 4JZ5A 2Z1SA 5C8BB 1QW8A 3RJXA 4H04A 4CCDA 1JI2A 4OUEA 3ARRA 4CVWA 3MMWA 1EGZA 5BWFA 1NWRA 2G4FA 4BA0A 1XSIA 3OGSA 4DUXA 2WSPA 2WKGA 2XFYA 2WXDM 2VR4A 1NH6A 3KL3A 1VIWA 2ZX8A 5IFTA 1NARA 3QGVA 3OA5A 3AIRA 2VZUA 2WZEA 3CZ8A 2XWEA 4PYSA 3WDIA 3WFZA 5M3WA 4WSJA 3L4YA 1ITXA 3AMDA 2WHJA 3ARSA 3AI0A 4MJ4A 4V2XA 3K1DA 4GZIA 3A6OA 4J3WA 2AOSA 2VTFA 5JBFA 2E3ZA 2XIIA 5I6SA 3ZMRA 4IISA 3RDKA 2E9LA 2FGZA 3AXHA 1BGAA 2YJQA 3VD5A 3SUVA 1CXEA 5LYRA 1R7OA 4XZBA 4BZYA 4MNJA 1HKKA 3WQ8A 1EIBA 1DWHM 2ZICA 1M01A 3NUKA 1BYDA 1E4IA 1V08A 4Q7NA 4XUYA 4HMCA 1E55A 4F8XA 2DH2A 2WAGA 3W28A 1H09A 1Y7VA 3UG4A 3WMSA 1OGSA 3VM7A 3WDRA 3OLEA 3A3HA 2EQDA 4HP5A 1FA2A 4PSRA 4H8HA 2WVTA 3AICA 1D3CA 1ISZA 2F8QA 2QF8A 2FHBA 2GUYA 4XZWA 3W37A 5I77A 2XVNA 3VIPA 4C7DA 4DM1A 1KXHA 2ZXBA 2GVYA 1JZ8A 1E4NA 2VOTA 1VEOA 4HU0A 1R87A 4NRSA 4GO8A 5HDRA 4PTVA 2VRJA 1KCKA 3AIWA 1H41A 5E0FA 1VRXA 1X6LA 4U3CA 1E4MM 2ZX5A 3OBAA 3EMQA 4QP0A 3WNNA 1W3LA 1UHVA 1Q6EA 2UY4A 3GZAA 3AHZA 4AZ6A 1KWGA 1HJWA 2ZX7A 3WH8A 4W88A 4AD4A 3ZT7A 2PWGA 4PN2A 4W86A 2ZUUA 1UKQA 2XHYA 5DT5A 3AMGA 5CGMA 3L2LA 2PWFA 4Z2LA 3K4DA 2ZUNA 1LG1A 4UCFA 1ISVA 3WUFA 4LGXA 1EXPA 2E4TA 3GH7A 1US2A 1JL8A 2RGLA 1JDDA 3E1F1 4AZ5A 3BLKA 4AMCA 2EPKX 2PC8A 4UQCA 2FH8A 4CUCA 1EO7A 3W53A 3WIJA 2Y5EA 4D6CA 3VO0A 4AEFA 3CBWA 4E2OA 2XSAA 1Q6GA 3AROA 5I23A 1KXVA 8A3HA 5AYIA 3ARPA 3RIKA 3POCA 1G94A 1PZ3A 1ZJBA 2WMJA 4MB5A 2CBUA 1WZAA 3KL0A 4HMDA 4KGLA 3SCTA 4D1JA 5I78A 1WCGA 5BXTA 1AVAA 4IPNB 3RPMA 2W91A 3SUWA 5FIPA 1J0JA 3K8MA 3UR8A 2DPEA 3GH4A 3UR7A 1BVNP 3UEQA 2VRQA 1JZ6A 5AC5A 3NYDA 2FGLA 2HVMA 1UWIA 3L4XA 4D6HA 4TVUA 3VGDA 1UWSA 5A6MA 1VBUA 3PTQA 4UFKA 4CU8A 4P8VA 3TOPA 1JZ7A 4NSBA 4CCCA 4OOZA 1CEOA 4TXEA 4ZXLA 3HMCA 1CNVA 4JAWA 3RM4A 4D71A 1V3MA 1B3YA 1CIUA 3MSGA 3B9AA 1JIBA 3W29A 1J0YA 4IUGA 2WWDA 4AZ7A 2C0HA 3A4AA 3IJ9A 2OWCA 1DWIM 1NOWA 1WDSA 3U5YA 4PMUA 4TTUA 2YDRA 2VURA 3PZTA 1RP9A 4LYQA 1CWYA 4M56A 4F66A 3VD9A 3AZSA 1PPIA 3O2LA 2WVVB 2YA1A 3AZRA 1EOMA 1BTCA 3EDJA 4HOXA 1HVQA 1GORA 1KBKA 2WMKA 3UG5A 4CU6A 2Q8XA 1XD0A 2FDMA 3PZNA 4PEEA 1JXJA 1GOIA 3CZGA 1K9DA 1NP0A 3ZT5A 1W9XA 1JYWA 2WANA 5LA0A 5GNZA 1KR1A 4ZENA 3WD1A 1C7TA 1E0VA 4AIUA 3AMKA 4B3KA 2VRKA 1SMDA 3ARTA 5HOSA 2V38A 3LPFA 5M5DA 1JFHA 5IHRA 2BHZA 4M24A 3CHCA 1QI0A 3FN9A 4AD3A 2MANA 3EBVA 3MANA 2CPUA 3DYMA 2ZXQA 2WBKA 4WF7A 3N15A 1UA3A 2PBGA 2CCRA 1QHPA 2O9RA 4CD5A 1B1YA 3WH5A 2VZOA 5CPSA 3OLDA 1OGBA 4DUWA 1JDAA 1FP9A 5HXMA 2YL5A 2WHMA 3L4VA 1J18A 4E8DA 1W2PA 5EBAA 5CPQA 3WY1A 4OZOA 1E40A 4AWEA 1E6QM 3VVGA 3GXIA 4BQ5A 4FMVA 1CXLA 1UWTA 4E4PA 4RL3A 4W7UA 4WKHA 1GHRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QHO A;  1W9V A;  3DC0 A;  5E9A A;  1UR9 A;  3M07 A;  4PCT A;  4NRR A;  3VKK A;  4B3L A;  4AC1 X;  2QLY A;  3FHA A;  4UQ9 A;  1FFR A;  1V3K A;  1CGT A;  1VFM A;  1XCX A;  1MW1 A;  2VMF A;  2XWD A;  1UR1 A;  1WDR A;  1X6N A;  1H0G A;  2WVV A;  4W93 A;  3CUJ A;  1ZJA A;  1WDP A;  1OM0 A;  1D2K A;  4MDP A;  2D20 A;  2VJX A;  2BXY A;  5FKY A;  1RPK A;  4QCF A;  2ZXD A;  1JND A;  1BQC A;  2X09 A;  3BSG A;  5FOO A;  2QMK A;  1HN1 A;  3IAQ A;  1FFQ A;  1VJZ A;  2X0Y A;  1PAM A;  5I79 A;  1BSI A;  1R85 A;  4PSP A;  1JYN A;  4MPK A;  1UYQ A;  5EFD A;  3WH9 A;  2D1Z A;  3TTS A;  1E6S M;  5CGT A;  5ECU A;  1CXH A;  4U2Z A;  2A3B A;  2ZWY A;  2W66 A;  1XSK A;  3WH7 A;  1C92 A;  1OIF A;  4HTY A;  1G1Y A;  2J7C A;  1HJQ A;  3VIH A;  2CKR A;  5CLW A;  3PBG A;  3WF3 A;  1H2J A;  5IHS A;  1VEP A;  1UA7 A;  4UFJ A;  2Y8V A;  1MFU A;  4P7N A;  2RGM A;  1FH9 A;  4JHO A;  4UQD A;  4JHZ A;  1DED A;  4D6G A;  3PTK A;  1WZK A;  1UH2 A;  1K9E A;  3BAI A;  3N1A A;  3WQ4 A;  5BXR A;  2DIE A;  1OT1 A;  1VFO A;  2UY5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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