4Z08A

Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 1 ke07 design
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
259
structure length
253
Chain Sequence
LAKRIIAALIVKDGRVVKGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHGGAGKMEHFLEAFLAGADAAKANSVLHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags De novo protein, lyase
molecule keywords de novo designed kemp eliminase KE07
publication title Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 1 KE07 design
rcsb
total genus 92
structure length 253
sequence length 259
ec nomenclature ec 4.1.3.-:
pdb deposition date 2015-03-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4z08A00
5BW6A 2CLEA 3NNTA 2FPTA 2YFOA 2A7PA 3CM4A 1UBSA 3G1FA 4IWWA 3M41A 4AWTA 3H55A 5DBTA 3DH7A 4AHOA 2V0TA 2CLKA 1R2RA 4QJ1A 3ABSA 1GQNA 5LNSA 3W7OA 2J27A 1SPQA 3R2GA 1LDCA 4FIQA 3USBA 3P62A 5HQEA 4UFHA 2GJNA 5IM51 4LW7A 4XWUA 3W7JA 3M16A 3QH2A 3A9IA 1A5BA 5G2HA 3CEUA 3EX6A 4AH7A 4FEZA 2C18A 4MY9A 4JD4A 1GVSA 3W70A 1NFBA 4JS3A 1LOLA 2ZRZA 4XUGA 1R2SA 3IIPA 3PY2A 3M0ZA 5E0KA 3G0XA 3P82A 4ALDA 3CEPA 2EF9A 5T26A 1WBHA 3BW2A 4M6QA 2GVLA 3N73A 2X16A 4O4VA 4S1FA 5LGXA 3GKAA 3FKKA 2FIQA 3M5XA 1FCBA 4JDYA 2HS6A 3DI1A 5A5WA 4CQAA 4YXGA 2FPVA 1KFKA 2Y85A 3B4UA 4FX6M 4UMCA 2Z6JA 4NNCA 4M5PA 1GTHA 3HO8A 4Z08A 5I3HA 3INPA 3NQ8A 3SFKA 1JQVA 1QPRA 3O16A 3G22A 4GWEA 1DL3A 1M7PA 2V2HA 2TPSA 1QPOA 4KWVA 1EB3A 2E6DA 1VC4A 1O4UA 1QO2A 2CWNA 3TAOA 1XBZA 1FCQA 4Z1DA 1LP6A 1QCWA 1UUMA 4IMGA 4N9EA 4XBSA 3IEBA 2NLIA 3EWXA 3DKLA 3W1AA 5AN7A 3EWYA 2CLFA 4JXCA 3I65A 3TU9A 1P0KA 3CLMA 1TREA 4D2JA 1GYLA 3LCIA 1PCWA 5DXXA 3M9YA 4WXZA 4TR9A 1O5XA 4MY8A 1I8JA 2YYUA 3NQ6A 3OVQA 2A6NA 5CG7A 1KFLA 4OBTA 3JRKA 1KLZA 4HN4A 4JTHA 2ZZ1A 4NUWA 4O11A 5DY3A 1ICQA 1W37A 1VCGA 4TIMA 5AC6A 3JR2A 3LERA 3W75A 4O54A 2WNZA 4JYDA 2QUTA 5FEPA 4X22A 1ZALA 2QR6A 4PEKA 5HR7A 2X1RA 3R12A 1FDJA 1PHQA 1H7OA 3MI6A 1F6KA 1LOSA 5AHEA 5K4XA 3S6DA 1SO6A 3FEMA 3UYCA 1X1ZA 1B9BA 5D2VA 4FHAA 5C6MA 3ABRA 2I1OA 1ME7A 1XUUA 3NA8A 4JTUA 3PULA 3WJZA 2QEZA 1H60A 4MFEA 3BV4A 3F1QA 2NWRA 5D30A 3STGA 2ZBTA 5CPMA 3W1XA 1ICSA 3MYPA 2R91A 1K8ZA 1OYCA 2B7QA 3NPVA 2JKAA 3MP4A 3BW3A 3T7VA 2QKFA 3NM3A 3NG3A 3A24A 1GVOA 4A2SA 1QNVA 3L67A 3W7QA 1TTQA 4IJBA 3MI2A 3W76A 3BK0A 5LGZA 4JIQA 1N55A 4UUIA 3KOFA 4CCCA 4QSHA 3C0JA 4IGHA 3L2IA 4DO6A 4MLRA 4CQ8A 3LB0A 1M5WA 4M19A 5AFDA 5LNVA 5G4EA 5FF4A 3GZ3A 3LGEA 3S5NA 1V5XA 5DY2A 3KXQA 3SR7A 2OT0A 2WV8A 2Y7EA 3ABOA 2CZFA 5E93A 2Q8ZA 3E12A 4UTUA 1RPXA 3T40A 2PRHA 5CKSA 3IIOA 2BLEA 1KM4A 4HPJA 2FB2A 1YTKA 3MWAA 1D9EA 4RXFA 4UTIA 3FS2A 3G1HA 1GJPA 5LNUA 3NQVA 1LBFA 2RKXA 3SY5A 3W7RA 1ME9A 1H1ZA 4BWLC 4LUIA 4A29A 1OFRA 3C2VA 4LRTA 1W31A 4O1CA 3EXSA 3W1UA 4YCOA 3TC7A 1IXPA 1Z42A 4ZMGA 2YR1A 2H3BA 3W87A 1SUXA 3MBDA 3BLFA 2G96A 2JK2A 4UXDA 3RNDA 3MHUA 5K4ZA 1UUOA 3A5VA 2F84A 3B8DA 1JUBA 5C54A 1I45A 1IIHA 3LTPA 5E1QA 4LOCA 3U6WA 2RDWA 3UQNA 5AHMA 3GDTA 2EPHA 4PC8A 2W0UA 1JCMP 5HMSA 1TPB1 4AWUA 2WQPA 1L9WA 4QISA 1OABA 4M7TA 2WKJA 3IGUA 2E77A 5DLCA 3GB6A 1KW1A 4TMCA 1I2NA 1MZHA 3ATZA 1SZGA 5D33A 3R89A 2ZCGA 4IMEA 1KM5A 5K9XA 3O15A 1FCVA 1TQJA 4DPQA 3TNOA 2G95A 2EHHA 3DHDA 2YFNA 3UWZA 3NQEA 1H7PA 3TCEA 4X9SA 3TC6A 1W5MA 3VNDA 1SQ7A 4C1KA 1R47A 2VEKA 4Y6GA 2A0NA 1ZY9A 2WPBA 4RKAA 1H61A 1G7VA 3NQ7A 4UNKA 1LBMA 4S2BA 4CNPA 3MUXA 4AEOA 4ZQNA 2C1HA 1EP2A 4O50A 1W8SA 2C0AA 5LHEA 4FF7A 1GG1A 2FJKA 1M7OA 3GAKA 4JTGA 4K7VA 3UWWA 4NJGA 4LS0A 2DZTA 5BRBA 3PWAA 1IXOA 5I3KA 1MEHA 2Y89A 4H4IA 4WUIA 4RXGA 5F1UA 3BLIA 4HSNA 3MMTA 3FA5A 3U8GA 1VCFA 4AXKA 4QNEA 2ABBA 1ZAJA 3NM1A 3TR2A 3TX9A 3V75A 1SU5A 3GNNA 3SJ3A 4P61A 2QJHA 4RX0A 4WY0F 1Q6LA 4ADUA 4ADSA 4FNQA 3TQVA 3L5MA 1LROA 4GNJA 1F05A 5KTLA 5EPDA 3CB8A 4N9DA 4JTEA 2CU0A 3G8EA 3ATYA 4NNBA 3HIJA 4ZQRA 3CTLA 4MYXA 1KM2A 2DP3A 5TBOA 2DZUA 5CSRA 1YDVA 1H5YA 1KM1A 4LS1A 4O14A 4Z0SA 1MEIA 1JCXA 2Y6ZA 1TRIA 2JGQA 3HPZA 3NQAA 4FX7A 2NUXA 3R5EA 3N34A 3T55A 2YGYA 3PBWA 4OT7A 2WSQA 3CU2A 1IXNA 2NXGA 3GR7A 3L68A 3LBMA 1W5PA 4N4PA 4YLWA 3RMJA 1JQXA 2P10A 2H90A 2Y63A 5AHLA 1TPVA 4DXVA 4FO4A 1EWEA 2PURA 3I7QA 1OF8A 5I3GA 4NNAA 3O8AA 3LTSA 3W83A 4ORMA 4RZ6A 3EX1A 1TJRA 3PBVA 1G4PA 3FLUA 2VEPA 4TMBA 1KM3A 2Y61A 2JKPA 4FNRA 2ZTKA 1XXXA 2BSLA 1C9DA 1XL9A 3W1QA 3IIVA 4NXKA 1VGAA 1WXJA 3OEXA 3TJXA 3NZ1A 1TB3A 3W1LA 4IMFA 1ME8A 3LLFA 2Y7GA 2B0MA 4A3UA 2GQ8A 5KZEA 3TSBA 1GEQA 1W1ZA 4XKYA 1RR2A 1VYRA 3P81A 4IX0A 5CPOA 2GVJA 1CX9A 1PE1A 4N6EA 4X3ZA 1OHLA 4WD0A 4I9AA 3DFTA 4UNLA 3HQ1A 3QYQA 3LHVA 3M5ZA 5HUPA 3AO0A 4Z1AA 1T0OA 2VXNA 3NVTA 1VLIA 1XDLA 2O7QA 1PHWA 3FIGA 1OFAA 4AF0B 1M6JA 4YWIA 3T78A 3CWNA 3DXIA 1K7EA 4Y8FA 3W88A 3WFAA 1I2PA 1FXQA 2J9YA 5LNRA 2ZZ2A 1AK5A 1D3HA 1K02A 3SECA 4AAJA 3GK0A 1LZOA 1GVQA 1VHCA 2NUWA 1KFJA 1YPIA 4WXYA 1OJXA 1RD5A 2VKZG 5F2GA 3GIYA 4MJZA 3RK8A 3NZRA 3C2OA 1O60A 3S5OA 5KINA 3BG5A 1PVNA 1LM1A 1GOXA 3M7WA 3OBKA 3O06A 3PUDA 3LOTA 4X2RA 2V2CA 2FDSA 4KFOA 3QMRA 4MJMA 1GG0A 1VH7A 3MBFA 4IXHA 1VCVA 2VC6A 3CT7A 2E5DA 1KFCA 1TO3A 1Z41A 1SFJA 1JUEA 2VEIA 2CZDA 3KX6A 1R46A 1WQ5A 1ALDA 4KFNA 3M5YA 2ZTJA 3UZJA 1BWKA 1W56A 2EKCA 3UPBA 1G69A 1XBXA 1TJPA 4O0ZA 1FQ0A 3I68A 3OA3A 4FB7A 3BW4A 3EWWA 4JR5A 1FCUA 3PB0A 5HULA 3M5VA 5AC8A 4WZHA 4RCXA 3T4CA 2C13A 4A21A 4HT3A 3IVUA 4GUHA 4XBKA 1TTJA 6ALDA 4LRSA 4QITA 2CLLA 3HPXA 3L5LA 5D2WA 5C2XA 3NAVA 2NWSA 5AYXA 4LVGA 5LNWA 3B06A 4LV4A 1TMHA 3MI3A 3O07A 1RQEA 4IXXA 4GC4A 3FKRA 1A5SA 4U28A 1OX5A 1PCKA 2B7OA 2QCHA 4RK8A 4XQ6A 3P5ZA 3DI0A 5K9CA 4LU0A 4Y96A 4YCPA 1XC4A 4UFIA 3OIXA 3GLCA 4PCFA 4DELA 1KBIA 3PUOA 4EVZA 2ZZ3A 3PF3A 3LXCA 3E96A 4JTIA 2NV1A 1VYSX 4M6PA 1NEYA 2WOQA 3W7IA 3DBPA 2QCDA 3LDVA 2ZYFA 3PS7A 3NL2A 4BI7A 5KSWA 4UFJA 2TMDA 2CZ5A 3N3MA 2WSRA 5U7SA 3NDOA 3S1UA 1FWSA 3PUEA 2ZZ4A 5FF0A 3W6YA 1X1OA 5EL1A 4MZYA 2DJXA 4LVDA 5HUOA 1JCNA 3W2LA 4WX2A 4ZVJA 1WOBA 4E38A 4O15A 4JX6A 4RJEA 1LCOA 2GVGA 1TPDA 2HMCA 4O0KA 3P7YA 3G1XA 3RU6A 1F2JA 3NQGA 4O1AA 1JUKA 1KFEA 1ZENA 1MXSA 3TW6A 1OVDA 4UFKA 3IRDA 3VCRA 1QWGA 3FJLA 4O19A 3NL5A 1TQXA 1TYGA 2NZLA 3LX9A 3VE9A 2A1YA 2RFGA 4LY8A 3QRHA 1PS9A 3DHFA 4JIPA 4ZQCA 4WY0B 4B5NA 1OFEA 1X8FA 4OV9A 1OK6A 4RR4A 1BEUA 4UR7A 3F03K 1TCDA 3N19B 5C55A 3HGRA 4O16A 5EMUA 5FF3A 3H53A 1A50A 1G7UA 3EXRA 3SI9A 4NQ1A 2DORA 3E9AA 3W7MA 2E09A 1TPH1 5KMYA 2Y7FA 5G2IA 1H63A 1JJKA 1FDZA 1XBYA 1SR9A 5DELA 1EA0A 3QQ0A 1DQXA 1TV8A 3S1VA 3P61A 4MZ1A 1H62A 1KA9F 2ZDRA 3O6YX 2B4GA 3KHJA 4W9TA 5G1TA 4AF0A 5MHBA 2H8ZA 2RH9A 1DV7A 1B4EA 4ZQMA 1SZNA 3EWUA 3P60A 1UB3A 5F2LA 1K7FA 2VENA 4I7VA 5LKYA 3MO7A 5J5DA 1YYAA 3S1XA 4GUIA 3QPYA 4LVAA 5FEXA 4AHQA 2R8WA 5D2YA 3A23A 5J5RA 1EP1A 3FFSA 2YZRA 4Y90A 1GPWA 4CQ9A 4N4QA 2QF7A 2QCEA 1Q3NA 1XKYA 3TXZA 3QW3A 2VFFA 3W71A 3HG2A 5AHNA 3W3OA 1T96A 1AL7A 1QOPA 1QPQA 3UWVA 2ATSA 3OVPA 5KITA 2QAPA 3W23A 3ZWSA 2ZA3A 1L6WA 4FX8A 1S3HA 4MY1A 3C6CA 1LRTA 5I3FA 5ABTA 3IGXA 1W3IA 1OX4B 3R13A 1KBJA 3RFAA 4OQVA 5FESA 1TSIA 2AAMA 5F4SA 1SO3A 3N2MA 4XTDA 3LXAA 2J88A 2QDGA 3NPWA 4LV9A 3W1NA 2HSAA 1H7NA 3SGZA 1IGSA 3TMLA 3ZS4A 3HJZA 3SZ8A 5EYWA 4FNTA 2ZRVA 4UTMA 2BTMA 3GYEA 1RQBA 4XZ9A 3CC1A 1A5CA 1YDNA 3W1RA 4UTJA 2V2DA 1H1YA 2YCEA 3W7EA 2NX9A 5BNKA 3HOJA 1CW2A 3KVMA 3O6DA 4DF2A 4LTSA 4N2YA 3TROA 1OK4A 1P4CA 2GQAA 4I7WA 3TE9A 1OFDA 4LS2A 4GUFA 1KTCA 3C56A 3MP3A 1QPNA 2H3DA 3O1NA 1KTBA 3W2UA 3BPWA 3NYZA 1ZFJA 2Z1BA 1Q45A 2VEMA 3TFCA 4UC5A 2WSYA 2ZRUA 2TYSA 1UCWA 3LRMA 2NXIA 2QCGA 3I6RA 1WX0A 5A8GA 4H3DA 1W3NA 2X1TA 5D02A 1EX5A 3L0NA 4WQ6A 3TQ0A 4L4MA 1BWLA 4LNYA 1J4EA 2XN1A 4GBUA 4ZQPA 3OG3A 2ZQ0A 3MP5A 3A5FA 3LHYA 3L65A 3G3DA 5AHIA 3SGUA 1ZCOA 5FF7A 2C3ZA 3UWUA 7TIMA 5TIMA 5F4WA 3TW7A 2Y88A 2GOUA 3L21A 3IIXA 3WJYA 2R94A 2C16A 5CGQA 1C8VA 3WK1A 4UTKA 4NJJA 3DKJA 4HNVA 4MLJA 2RDUA 1WOAA 3PC0A 3C61A 4JYEA 1F6PA 3HBLA 3LCXA 1ADOA 4UTLA 1YXDA 4ZZ9A 1VQTA 3EB2A 4UMBA 4BR1A 1YLVA 1VJIA 4R53A 3G3MA 1AL8A 5EA9A 3V1PA 4CNNA 4CNOA 3G24A 1ZHAA 1AW1A 1VLWA 1W3TA 4OV4A 3S42A 3CIXA 3WJSA 1ZNNA 2VFDA 4WY0A 4GE8A 2C15A 1TTIA 4PL1A 3DFNA 6TIMA 4P2VA 1S5WA 1G4SA 4JTJA 4JICA 1P5BA 3ZR4A 1N8FA 2ZRYA 3KFTA 3S1WA 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 2OJP A;  1O94 A;  2OX1 A;  3R8R A;  1IXQ A;  3LHZ A;  2CLM A;  4JTL A;  4UIO A;  5CZT A;  4S2C A;  5BOO A;  1K8X A;  3UXA A;  4M7S A;  3C4U A;  5IBX C;  4JDB A;  4IUO A;  5G5I A;  1XM3 A;  3CPR A;  4JYF A;  3KVK A;  4BK9 A;  4LVB A;  1T99 A;  3LTY A;  3LI0 A;  1A53 A;  5HWM A;  4WOZ A;  1NF0 A;  2HTM A;  3VE7 A;  1V7Y A;  4MIM A;  2QCN A;  1W5Q A;  1DJN A;  5DCB A;  1QML A;  1YTD A;  2C14 A;  1DBT A;  1BTM A;  3I7R A;  3L0K A;  3DFQ A;  5DBU A;  3QMT A;  3GR8 A;  5CPN A;  1G4T A;  2JKE A;  1I2O A;  4GXM A;  2WJZ A;  1OX6 A;  3TUU A;  2W79 A;  1DKW A;  5LSM A;  1XCF A;  3OHI A;  4RZ4 A;  2CFF A;  4DQW A;  3GVG A;  3PBU A;  3NR0 A;  1FUY A;  2OCZ A;  2V82 A;  3W1P A;  1FDY A;  4UTW C;  1W0M A;  3TQK A;  1TV5 A;  3GAY A;  2NX1 A;  3P8I A;  3HG5 A;  4N02 A;  4CCD A;  1JRC A;  3LM7 A;  2GPT A;  4O1D A;  1H51 A;  5CSS A;  4JTK A;  3JS3 A;  4E0C A;  3HG4 A;  4AB4 A;  2QDH A;  2QUV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CLE A;  5C0Q A;  5ECU A;  2FPT A;  2GGG A;  1XKJ A;  2A7P A;  3G1F A;  1YMY A;  2ZUU A;  4AWT A;  3ZT6 A;  3DH7 A;  2PMQ A;  3CV1 A;  3G1R A;  1V79 A;  3ABS A;  2IW0 A;  4TVD A;  4QE5 A;  3EYP A;  2QS8 A;  3VC6 A;  2J27 A;  2YCI X;  3CPU A;  3W00 A;  3M0Y A;  4D6D A;  4QS6 A;  3VZZ A;  2ISF A;  4OVX A;  3RLG A;  3M16 A;  3ERP A;  3M0M A;  4CU7 A;  3A6O A;  2QJN A;  2GGH A;  1NWT A;  2ZRZ A;  5LIX X;  1R2S A;  4UQE A;  4KCU A;  5JVL A;  1G0C A;  3G0X A;  2EF9 A;  5T26 A;  3BW2 A;  2GVL A;  3DBN A;  3BCD A;  9XIA A;  5LGX A;  4PBF A;  2XWD A;  3CZG A;  1CGY A;  4C60 A;  1GQI A;  3VOH A;  3SQL A;  2O4Q A;  3UNT A;  4MNJ A;  1FHV A;  2OEJ A;  4S3J A;  4FX6 M;  2PPG A;  3GNR A;  2EO7 A;  4Z08 A;  2XH0 A;  3RCM A;  3CO4 A;  3NQ8 A;  3SFK A;  3HPA A;  1HKW A;  3O16 A;  1ONX A;  4MF4 A;  2AKM A;  1OGG A;  4NHV A;  3RJX A;  2D22 A;  4HNO A;  4QQU A;  3KTS A;  3GR4 A;  4LAM A;  2CWN A;  3IRS A;  3U48 A;  3KP1 A;  3TAO A;  2OEK A;  3QY8 A;  2QV5 A;  1UUM A;  4IMG A;  4N9E A;  1E9Z B;  4DIA A;  4X63 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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