2ISWA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
321
structure length
307
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 114
structure length 307
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iswA00
3NR0A 5F4XA 4UC5A 2FDSA 1F7BA 3G1DA 1PS9A 1H62A 1EP1A 2CW6A 1QO5A 2A7PA 2FIQA 3B03A 2XN1A 3LRKA 2J9XA 2NWSA 4JIQA 3KVMA 2Y7GA 1TV5A 4KFOA 3UY7A 3W87A 2DU2A 5CPLA 1VCGA 1I2PA 4OGZA 3MBDA 1T96A 3OG3A 3OEXA 2JBMA 3QW3A 3SY5A 3TV8A 2ZTKA 1HUVA 3NZ1A 2ZZ4A 4MJZA 5HWJA 2D73A 3GZ3A 1K03A 3C61A 5IBXA 2RKXA 1LORA 1YPFA 4UIOA 3QSTA 1TPWA 3G3DA 1UUOA 2Q3RA 3B0VC 3TR2A 4R34A 1U83A 1JCJA 5HWNA 3L68A 1BWKA 4LS0A 2J27A 3QRHA 1NVMA 2X1SA 3ZFHA 3VFLA 5DXYA 3WJWA 4WY0A 4RXGA 1H7PA 3P8JA 3QM3A 1IXNA 3SR7A 1KFBA 4UFJA 2TRSA 5DBUA 3KRUA 3O06A 4TR9A 4UMBA 4M7TA 3DI0A 3S5YA 3L66A 4UXDA 3TXVA 1LBFA 4M6PA 2CZFA 1WYIA 3PG9A 5L9FA 2E5DA 2NLIA 3GX9A 2Y7EA 3HGSA 3FOKA 3N14A 1XM3A 3TX9A 3NG3A 3BARA 1K8XA 1KM0A 2O7QA 5DY3A 2FB3A 5G2HA 3WJZA 2UV8G 4NJGA 4U4MA 2RDWA 3QC3A 3TCEA 3NPXA 3MHFA 1QWGA 2BTMA 2H8ZA 1K02A 3O05A 1X8FA 4IMFA 1EPXA 3VKJA 3W2KA 2E68A 4MYAA 3ABQA 3DKJA 5AYXA 3G1AA 5U7SA 1W31A 1LLWA 3I7SA 5LGZA 2E1DA 4ZQRA 3BV4A 4M5PA 1XCFA 2ISWA 1VYSX 3W7GA 3CU2A 4PFMA 3NXFA 4I7WA 2B4GA 3W7RA 2AAMA 1TPB1 4JTTA 5D05A 3M41A 3VE7A 1OF8A 1SFLA 2A6LA 3GXTA 2WOQA 4JTLA 1W8SA 4LTSA 3MBFA 4O19A 4QM1A 3MUXA 1S5VA 1G4EA 2VXNA 1QPQA 2NUWA 3L5AA 2R91A 5K9XA 4NVTA 4WZHA 3TAKA 3W7CA 4KWWA 5J5RA 3PM6A 3W7JA 2A0NA 1TV8A 2CZEA 1FWNA 3LHYA 2QCDA 2VEMA 1FUYA 2DJLA 2WSYA 4TMCA 1J5TA 3NDOA 4WX2A 1TRDA 1W5QA 5TQLA 3W1XA 2NUXA 3C2VA 1Z44A 4XWUA 3GYEA 1W1ZA 3O15A 5CGQA 2V8ZA 3TW6A 2I14A 3S5NA 2FPTA 4IPJA 4KFPA 3TC7A 2CLMA 8TIMA 4K36A 3B05A 3TU9A 1EP2A 3W3OA 1TV7A 3UWYA 2R94A 4FHAA 5DLCA 3W7OA 2FB2A 4DQWA 4OHQA 3N2MA 4JTEA 3C6CA 3KRSA 1H50A 3UQNA 4EF8A 2C16A 3I68A 4JX4A 1OJXA 1FWTA 3F03K 4M7SA 3W1PA 3WK3A 1GVRA 2HTMA 2CLFA 1D3GA 1VCVA 5HR7A 5LKYA 3GDRA 4GXMA 3P61A 1GZGA 2QUTA 1DORA 3OHIA 1KBJA 4UTIA 4FB7A 4FNQA 4YLWA 4NJIA 3TXZA 3LGEA 3O6DA 3ATYA 4GBUA 3O6YX 3W1NA 2X2GA 1SR9A 2YFNA 4ZQMA 3QYQA 2QCEA 3RFAA 4BWLC 3TSDA 1TPH1 2ZA1A 3G8RA 4NJKA 2YW4A 4C1LA 2NX1A 4O12A 4D2JA 1RVGA 2Y7FA 1AMKA 2PCQA 3CT7A 3OIXA 1H7NA 4CCDA 4LNYA 2H8XA 1GEQA 1EIXA 5G1YA 3TNOA 2PRLA 1S5TA 3W73A 4L4LA 2Y62A 4HKPA 2PRHA 1H63A 2R14A 3TMQA 2VKZG 4CNPA 2E5BA 2RFGA 3PBWA 4JR5A 1OYCA 5DCBA 2DZTA 3H54A 4X9SA 2C6QA 4AXKA 3W2MA 4RKAA 4MZYA 3NQCA 2E77A 4LS2A 4MUZA 3EWZA 2WNZA 3EKZA 1ICPA 3BO9A 1O5XA 4FO4A 1SW3A 5D30A 1JQVA 3HPXA 2DZXA 2ISVA 1EP3A 3HG3A 5AFDA 3MP3A 3DH7A 3EWWA 2JGYA 3GB6A 1CW2A 4WOQA 3LLFA 3ZR4A 4O0ZA 1F76A 3NQ8A 4HPJA 2A7RA 3LCFA 2CLKA 3IRDA 3DHDA 4AH7A 3WK0A 4JDBA 3DI1A 2F84A 4IUOA 1TPDA 4GRSA 4N9BA 3U8GA 4IWWA 5KMYA 3EWYA 1BWLA 1OYBA 3O8AA 3C2FA 5CZ0A 1F2JA 5DY2A 4RK8A 2QCHA 2Y6ZA 1DQWA 1LYXA 3NO5A 3DGRA 3W1TA 1DV7A 4TU1A 3GAKA 2CFFA 4IPIA 4BWLA 4O1DA 1OX6A 4FF7A 3KX6A 3LB0A 4LW7A 3MI6A 4DPPA 1H1YA 4LU0A 2ZRWA 3AO0A 1XDLA 1ME8A 2FTPA 3IIZA 5H91A 2A5HA 4JTKA 1I8JA 4ZL1A 5HUPA 1K7FA 1V5XA 3RU6A 3A24A 2WNQA 3PWAA 5K7JA 4PL2A 3NGJA 2X30A 3QJAA 5DXXA 4Z0SA 3IIPA 1HL2A 1XUZA 1I2QA 3L0KA 3NQDA 1WOAA 1K8YA 3SECA 3NL3A 5F2GA 3SI9A 3LM7A 1IIHA 2V82A 3FJLA 3SIZA 2BWGA 4HT3A 5DN1A 4EVZA 1TTQA 1LCOA 1Z48A 1D3HA 3Q58A 1I4NA 5D32A 4AHQA 4K8HA 4QAIA 1YTKA 2EKCA 4AEOA 4BI5A 1LBMA 4WY0B 4ML9A 1Q45A 5KITA 1M5WA 3IVSA 4Y96A 2V2HA 1DKWA 1CX9A 3LBCA 3YPIA 3KOFA 1GQNA 1ICQA 3GIYA 1AL7A 1PCKA 3W71A 2A2IA 2VFEA 1SO4A 1DQXA 1AW2A 1JRBA 3C52A 3ZS4A 5BRBA 1WA3A 3TDFA 3BVJA 4GWEA 5F2IA 2GVLA 3PUDA 2YZRA 3U6WA 3UPBA 1FWWA 3PS7A 3UZ5A 2GQ8A 2EPHA 3UY8A 2OJPA 2QAFA 1C8VA 3FKKA 2GVJA 5AC6A 1MO0A 2W79A 3HB9A 3PUEA 3RLVA 3NZRA 1LBLA 3RK8A 3F4WA 4JYEA 3DAQA 3R13A 1A50A 3GKFA 2E6DA 4BI7A 2GQ9A 3LHUA 1LOLA 3GDKA 5IBXC 4XZ9A 1THFD 3THAA 1K7XA 4IMGA 4YMZA 2DP3A 1W37A 1BTMA 5AHMA 2TPSA 1AL8A 4HNUA 1RD5A 1VYPX 4LC6A 3PSVA 4QNWA 1TPC1 1PCWA 5FI8A 4RX0A 5FESA 4U28A 1IGSA 3ZWTA 5KZDA 2ZA3A 3G0UA 1JUBA 3S1UA 5IM51 4O57A 3PG8A 1W5NA 1QPNA 3LXBA 4PC8A 4KKXA 4S2BA 1VLIA 1SW0A 4MLRA 5C5YA 3UXAA 3LXCA 2QCDB 4O18A 2ZZ3A 4FXSA 5KINA 3M7WA 3STCA 5G4WA 4C1KA 2QCFA 3LV6A 1JRCA 2OT1A 4Q4KA 3LCGA 2EHHA 4WXYA 3IVTA 3LHWA 3W7NA 5SWUA 3P80A 1MZHA 3HOJA 1R47A 3NYZA 1R30A 2QJGA 1IXQA 3DFNA 3NOEA 1KTBA 1V7YA 2VEIA 4UTHA 1ZY9A 2JKAA 2ZRZA 5AC7A 3HPZA 1FWSA 4AMAA 5I3JA 2A4AA 3WJYA 4DF0A 4ADUA 1EWDA 4X3ZA 4YCPA 3UWUA 4K38A 4X2RA 1TCDA 3FIGA 1KFEA 2A1YA 3CTLA 4K39A 1ZAJA 2WQPA 4OBTA 1H51A 1WQ5A 3KFTA 3LI0A 3W1MA 4QITA 1A5AA 3PF3A 1GVOA 1SW7A 1WBHA 4O54A 1AK5A 3BLEA 3S1WA 4IMCA 1W3TA 5D38A 4J9JA 1IXPA 4UR8A 2GPTA 4WD0A 3TQKA 2VEKA 3LHTA 3M0ZA 4IOTA 4Y90A 1ONRA 3L0NA 2XN2A 4DO4A 4A29A 4Y6GA 1XFBA 1ZALA 4ADSA 3EXRA 4UNLA 4JY9A 5AB3A 2KZHA 4PCFA 4O10A 4M6VA 4PH6A 4K7YA 1G4SA 2EAWA 4N4QA 2NX9A 4GJ1A 1ME9A 1O4UA 1OFDA 4LVFA 1XBVA 3M43A 5A8GA 2IQTA 2Y88A 2VFDA 3ANYA 3C3NA 2QJHA 3TSBA 2F7FA 3C2OA 4ORIA 2WKJA 1KTNA 3W75A 4LUJA 3HF3A 3VNDA 2ZZ7A 1TJPA 3GDLA 1W3IA 5EMUA 3M1ZA 4R53A 3H55A 1SFJA 5LNRA 4PTNA 3TA6A 3FJ6A 4M19A 3IGSA 2DZWA 1GVSA 1SSDA 2G97A 1N8FA 1ZENA 3HG4A 4GE8A 2DZUA 4E38A 1UCWA 2CLEA 1F73A 1SSGA 3W1AA 3UZJA 4DO6A 1H7RA 3LXAA 3CM4A 1TTPA 4NQ1A 1B9BA 4Y9AA 4WQ6A 2DJXA 3MJYA 3NQEA 1DOSA 4JGDA 3F4NA 3LTPA 4OWGA 1W54A 3MHUA 3MP5A 2QKFA 2FPVA 5A5WA 3DFPA 5TBOA 1IIGA 2PURA 2ZTJA 1YLVA 1OYAA 4FXRA 3C2EA 4ZQNA 3GXPA 3MMTA 5AHLA 4UR7A 1JUKA 3B04A 3KAOA 4LUIA 3W9ZA 1XKYA 1DHPA 3WK1A 2A21A 3TH6A 2JGQA 2Z1BA 1KM4A 3OVRA 4JTJA 3CB8A 3EX1A 2FQIA 2J88A 2H90A 3IVUA 3USBA 3CLMA 2QCMA 1S5WA 4DF2A 5D03A 1I2NA 1YADA 1UJPA 2ZRXA 1MSSA 3GDMA 3ABOA 1O60A 5CZJA 1GVQA 4LWWA 3S0CA 4MJMA 4OU1A 2W0UA 3NAVA 4ALDA 3ABSA 3HO8A 5F4SA 1R2TA 3P8IA 4JIPA 4QNEA 4CQAA 2CZDA 3M5XA 2DZVA 3CC1A 2Y85A 3GAYA 4ZQOA 3BGGA 2DORA 3NL6A 1FQ0A 5KZEA 2LLEA 3TSMA 1YXYA 4OV9A 2NXHA 3L0GA 4UTJA 3UNDA 5K4XA 4X22A 1TMHA 1ICSA 5CG7A 5EA9A 1G4TA 1SZGA 3U2OA 4JTHA 3WFAA 2A85A 2ABBA 4RCXA 5F4WA 3LV5A 1P0NA 3L5LA 5LHFA 4OQVA 5C2XA 4JX5A 1Q6LA 5CPMA 3NPUA 4QSHA 1FDYA 3QQ0A 4Z0JA 4UUIA 3N73A 5K2ZA 1W3NA 3B4UA 3BW2A 3BG3A 3MI3A 3G8EA 4EIVA 5K9CA 1QOPA 3W83A 1QPOA 1QOQA 4N9DA 3S6DA 3MYOA 1LOQA 4POCA 1H7OA 2ZZ2A 1DL3A 3T44A 3BW3A 4OT7A 4HHPA 1J2WA 3TAOA 3KRZA 4MFDA 1VH7A 2YW3A 5HNRA 3QPZA 3KHJA 1ZAIA 3IIVA 4NZJA 4FEZA 4GUHA 4LY8A 3HGOA 2E6YA 2HSAA 2B7OA 1OHLA 4JICA 4AWTA 3T7VA 5FEXA 1IF2A 4S2CA 3RLUA 3C56A 4WOZA 4JNMA 4DXVA 3RF9A 2A7NA 3L2IA 1ZJIA 3GVGA 5LSMA 3W7IA 4K7VA 4HIBA 4MIMA 3C0JA 3W70A 3OA3A 4O1CA 2AGKA 4QIUA 4YXGA 5D2WA 2CLHA 1NSJA 2Z2UA 3M6YA 1JR1A 1ZNNA 5AYYA 4UFIA 2QCCA 1TSIA 2C0AA 3FS2A 4UTKA 4N6FA 3T4CA 4JYDA 4MOZA 1L6YA 1L6SA 2TYSA 1FCVA 4O8RA 2C19A 2TSYA 3EWBX 1FXQA 1QFEA 1UBSA 3CIWA 4O15A 3FEMA 2CU0A 5J5DA 4JTUA 1KA9F 1YTDA 1O95A 2RH9A 3G22A 1WX0A 3CEPA 1WBJA 3N9RA 1ALDA 2JKPA 3NQGA 2ZRUA 1YYAA 1NFBA 4NXKA 1U5JA 1T8XA 3QMRA 1ZHAA 5D09A 1XBYA 1DBTA 5F1VA 2B0MA 1YXCA 3L5MA 3EX6A 3M44A 3C8FA 2VFFA 2V5LA 3LCHA 4IGHA 4LOCA 4AHOA 1H7XA 3HQ1A 2QUVA 1M7OA 3M16A 4JN6A 3O6CA 3TIMA 1VHNA 2BX7A 3NL5A 1JCMP 4A22A 1NAL1 5BMWA 1QPRA 3FKRA 3RMJA 5F2MA 3LTYA 5K4ZA 1DVJA 3DU0A 4H4IA 1QDSA 5C55A 4UTTA 4BI6A 1P1XA 5K3VA 5LNUA 3INPA 1F74A 2Q8LA 3GNNA 3G0SA 1B4KA 3NQAA 4NJJA 4FX6M 3TW7A 2OMAA 4HPXA 1A5BA 4NJHA 1B4EA 2J24A 2JKEA 2V2DA 1TPUA 3NQ6A 3S5OA 4O4VA 5HJLA 1RQEA 3W7LA 5EBUA 1W56A 2CLIA 1FCQA 1XI3A 1FBAA 1SO3A 1LRQA 1VHCA 3MO7A 4O14A 3P5ZA 4ICNA 2GUUA 2FJKA 4AWUA 3FFSA 3G1SA 1GWJA 2TMDA 1LOSA 3PBYA 4UFKA 4I7UA 1EA0A 1OFAA 5I3IA 1KBIA 2X1RA 2WSRA 2Y63A 1BKSA 1IXOA 2ZZ5A 4FX7A 1EEPA 4JYFA 4LRTA 3P82A 2NV1A 3NQ7A 1MXSA 1OFRA 3HG5A 5G5IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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