1EPXA

Crystal structure analysis of aldolase from l. mexicana
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania mexicana
total genus 144
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1epxA00
4WXZA 4U4MA 1G6CA 3S42A 3MP5A 1PVNA 4FIQA 2WJZA 1J2WA 3LX9A 3P61A 5CZTA 4PFMA 4KWVA 3S8HA 3MO7A 5FEWA 5HUPA 3UQNA 4Y8FA 3E96A 5CSSA 4NUWA 2C6QA 5FF2A 3I7QA 4RR4A 3I7RA 1VJIA 3I68A 2OZ0A 4JGDA 5HMSA 3W83A 1OABA 3EXRA 5FEZA 4CQAA 1AW2A 5FF3A 2JKEA 3A23A 2BX7A 3N2MA 1OVDA 3QW3A 1K3UA 4FXSA 3F03K 1WA3A 1I2RA 1I8JA 1V7YA 1W0MA 1TREA 4ORIA 1GEQA 2WSRA 4M7SA 2ZZ3A 2VENA 3NNTA 1OFPA 1O94A 2Y62A 3B4UA 4POCA 4XBKA 4Z1DA 3BLIA 2G95A 3DAQA 4NX0A 4JTUA 3STFA 1U83A 1OFRA 5FI8A 4RJEA 3QH2A 3R13A 4LUIA 2CLKA 3SZ8A 3W1XA 1TQJA 1N8FA 4IMEA 2FPYA 3HPSA 4IX2A 1LOSA 2ZZ6A 1K8XA 5AHIA 3W2JA 4OV9A 5AC7A 1T99A 4JDYA 5I3FA 2GUUA 3BG3A 3C0JA 3E12A 2CLEA 3CWNA 4MY8A 3IVUA 5D05A 4EIVA 3EX3A 3N14A 3Q94A 4S2CA 1MXSA 3ANYA 1OFDA 1NF0A 1YDVA 3NQAA 3N19B 3PG8A 3OHIA 5DCDA 3KVMA 2ISWA 3DFSA 5G1YA 5HNRA 5TIMA 1ME8A 3O6DA 3TUUA 1K8ZA 3UY8A 1IIHA 3QQ0A 1ICPA 1TO3A 3W6YA 4JY9A 5BMXA 4N4PA 2FIQA 4UTMA 3PB2A 1H7PA 1LM1A 3QRHA 1G4EA 2JKAA 1L9WA 2TYSA 3PG9A 1TIMA 5SWUA 1K7EA 4N6EA 1YTDA 2X30A 5LHFA 3M5VA 2ABAA 4JTSA 1T0OA 2EPHA 1THFD 1LBFA 1ADOA 4FNSA 5EBUA 4UTHA 3R2GA 1Q3NA 3KX6A 1HO4A 1G4PA 1NVMA 4K7YA 2Y89A 2ZCGA 3UZJA 1VCVA 2EGZA 3LHTA 1JCJA 3LCFA 1R30A 3EX2A 3LDVA 3MHFA 3B8DA 4N9DA 3WJSA 1L6WA 3G1VA 1TQXA 3NAVA 3LV5A 1KV5A 4Y96A 1FWNA 3V1PA 1QR7A 3C2VA 3QF0A 4NJHA 5EL1A 1GT8A 2FFCA 2Y63A 1M5WA 4E2BA 3NXFA 2ZDRA 1QPNA 3L5AA 1SSGA 1YPIA 3FKKA 2R91A 3W70A 3IEBA 4FNUA 3G1YA 3W72A 1EB3A 2JK2A 3DHFA 2ZFAA 4UMBA 4H4IA 3HGJA 2Y70A 4RZ6A 4WUIA 2ZRXA 1W3IA 2WNQA 2VFHA 3PBWA 3ABSA 2A7NA 1F5ZA 1TPB1 3JR2A 2QDHA 3C8FA 2YCEA 4WJEA 2ISSA 3N2XA 3EX6A 3O63A 3OBKA 1HL2A 2W0UA 3DFQA 3STGA 4BI5A 1SO4A 2QUUA 2BZNA 1KM0A 1HO1A 5EY5A 4KKXA 4YMZA 5G4EA 3QM3A 3A21A 2QEZA 4JYDA 4UTTC 3H54A 3TA6A 1FDZA 4PL2A 3M5XA 1QPOA 2CLIA 4NX5A 1W5MA 3P74A 4FHAA 4JTJA 5D2VA 4I9AA 1EIXA 4CLMA 4HKPA 1VR6A 4YL2A 3I65A 1NFBA 2FLIA 3LHYA 1FCUA 5E0KA 3DZ1A 2CZEA 3S6DA 5AFDA 3E02A 2ISVA 4N9BA 3G1XA 4QNEA 4R33A 4X9SA 1YLVA 4IPIA 2XN2A 1H1YA 5D2YA 1YDNA 2E6AA 3WJWA 3LXAA 3P62A 4L4MA 1EWDA 1NF7A 2B7QA 4PL1A 3O06A 3BPWA 4O11A 1PCKA 4IGHA 1D3GA 2J9ZA 4NXKA 3KAOA 1CX9A 3LRKA 4WZHA 3IGSA 1NEYA 1H51A 2GQ8A 4ALDA 2BTMA 4JDBA 1B57A 5KZMA 3B06A 5FF0A 1KM6A 1JUEA 3TSDA 3VCRA 4EOUA 3CU2A 3JS3A 3DKLA 4Z08A 2QCNA 1P5BA 5HUOA 4GRSA 3W7HA 1L6YA 3U2OA 4FF7A 5F4XA 3TXZA 3NG3A 1GVSA 2ZRYA 4R53A 4JTEA 5G2HA 2O7QA 5AHNA 3S0CA 5J5DA 3LRLA 3MI2A 1NAL1 1DOSA 2CFFA 5D03A 4MVAA 2NX3A 1IXOA 4DBEA 1WQ5A 4ADUA 3G1SA 1Z44A 3FOKA 1LBLA 1KTCA 2ZZ5A 1TV8A 4WD0A 4MYAA 4A2SA 1PE1A 3W7IA 1FQ0A 3TDFA 2Z1BA 2X1SA 3SGZA 2D73A 2FJKA 3DHDA 2YFOA 3FJ6A 2VFDA 5CZSA 3JRKA 4FNRA 4TO8A 3PS7A 3T78A 3G22A 5CSRA 4UR7A 1WOBA 3IV3A 3BG9A 1WOAA 3M16A 1ZENA 4OQVA 4LUJA 2CLMA 2NXIA 3FLUA 3L21A 1RQBA 2C19A 2NX1A 4N02A 2NXHA 4O1DA 3PBVA 3P82A 1KW1A 3NQCA 4XBSA 2CWNA 3PVFA 4YCOA 1TPEA 1YXDA 2AGKA 5F2MA 3NPUA 3W75A 5HR7A 2CU0A 2E5DA 2NV2A 3EXTA 1HTIA 4A3UA 1SZNA 5I3IA 3L68A 3L5MA 1YXCA 2RH9A 3G0UA 1DKWA 3W9ZA 3AO0A 4HNVA 3LTYA 3KXQA 3S5OA 4DELA 3BK0A 1DHPA 3O8AA 2QJGA 3S9YA 4AAJA 1GVOA 1EPXA 4LT9A 5HWNA 2QAPA 2YW3A 3LTSA 5KMYA 4N4QA 1UUMA 4WY0B 1ZNNA 1Q6OA 3PUDA 1UB3A 1Z42A 3TQVA 4AHPA 4LVFA 1DQXA 5I3GA 1FCQA 4ADSA 1W5QA 3FA5A 2E77A 2Z0IA 3TNOA 3SW6A 5H2ZA 3HIJA 2O7SA 3WJZA 3NPVA 4JTKA 3O05A 1CW2A 3OVPA 4O8RA 4MLJA 1KM4A 1IXNA 1DL3A 3A5FA 2A21A 5HULA 4JEQA 3T7VA 4Q4KA 3NQ6A 1S5WA 2GVGA 3ZFHA 1IXPA 3VE7A 1I2QA 4HNUA 1MEWA 2DZPA 4WOQA 1T96A 2WOQA 4N6FA 3WJXA 2QCHA 1KTBA 3B04A 1AW1A 4GBUA 3G0SA 4N9CA 3UWYA 3W2UA 4O1CA 5EPDA 1JCYA 2A6NA 2DP3A 3L2IA 1SZGA 2A85A 2QCLA 2A5HA 2E6FA 2YW4A 3PSVA 4LVGA 3FYOA 3HPXA 3S5ZA 3EWBX 4QITA 3ZWSA 4GUFA 5LKYA 3W7LA 4XKYA 5I3KA 1A53A 4ZQCA 5D04C 2QCCA 1OFBA 3W1QA 3DGRA 1F73A 3HG3A 2F7FA 3NVTA 1EEPA 1BTMA 1Q45A 1TJPA 4CQ9A 3OVQA 1UUOA 4JR5A 3VNDA 1XKYA 3IIXA 4IMDA 4DO6A 3PBUA 1SSDA 3W7NA 3NL2A 3BLEA 3LLFA 3TCEA 4G1KA 3TMQA 3TV8A 4GUHA 2X16A 3HF3A 3M43A 3PBYA 4GUJA 4LV4A 1AK5A 4JTTA 3BLFA 4GNJA 1ALDA 4CNPA 1W37A 1LZOA 5DLCA 3ZR4A 2NUWA 4N2YA 4YCPA 1WBJA 5AHEA 5G2WA 1SU5A 3O1NA 2DZVA 2NWSA 3UXDA 1JULA 1OHLA 3S1UA 4HNTA 1V5XA 3TKFA 4IWWA 4UFJA 3C4UA 3E0IA 1W3NA 1H61A 3M5ZA 4MZYA 4MY9A 4WOZA 3NM1A 4FX6M 3O6YX 2A7RA 1C9DA 1EX5A 1H7XA 3MBFA 1FCVA 2FB2A 1TYGA 1P0NA 2Q8ZA 1TPVA 1LBMA 2A7PA 5H91A 1OX4A 4LV9A 3MP3A 1HG3A 3LLDA 5HQEA 4O0ZA 5DBTA 2C15A 1E51A 3Q2DA 1EUAA 3F1QA 3W1UA 2C0AA 3YPIA 1KM1A 1LRNA 1EWEA 1EA0A 1GQNA 3PY2A 2YSWA 4CNOA 3MW7A 2WPBA 5AHFA 3CHVA 4NQ1A 1XM3A 4H6KA 5D09A 3LI0A 4BI6A 1KBIA 3LBCA 3S5NA 2QCDA 2PRLA 1H7WA 3IIPA 3W1RA 2NLIA 3GNDA 3HGSA 1FX6A 3THQA 3MWAA 2J24A 2WSQA 4MZ1A 3L0GA 2RDTA 3TJXA 2ZA1A 3CB8A 1JRBA 4CCDA 3HPZA 3GX9A 4ZVJA 4Z1BA 1R2TA 4DF0A 3S1WA 1XBZA 2ZZ7A 4LVAA 5K4ZA 4JYEA 4AWUA 3ABQA 1I2NA 3LCXA 4O57A 4LVDA 1B9BA 1G4TA 1ICSA 1W31A 2E09A 3LOTA 2WNNA 2EKCA 3G3DA 4JS3A 2YFNA 3GKFA 1H1ZA 3E49A 4IJBA 1VCFA 1VH7A 1IF2A 3EKLA 3AJXA 4XQ6A 2F84A 3TSBA 1SR9A 3TAKA 1JCXA 1F74A 1M7OA 3TFCA 2FPVA 4JN6A 3W7CA 1N55A 3GNNA 2H3DA 2HSAA 4LNYA 4LTSA 1LOQA 2ZYFA 3W1TA 4MKNA 2Y6ZA 2A1YA 1X1OA 4B5NA 3SSJA 1PHWA 5LHEA 2FPTA 4GUGA 4DPQA 3PF3A 1GG0A 3RNDA 3CEPA 3GIYA 1VPXA 5G2IA 3W1AA 3TX9A 2J27A 1BEUA 2YYUA 4O12A 1TJRA 5KITA 1EP1A 2Q8LA 3O16A 4HN4A 4QNWA 5D02A 4IQLA 3NPXA 1PIIA 1J4EA 1WAUA 2DZXA 2VEKA 4NJIA 1YXYA 4LOCA 2OCZA 4GC4A 4JTIA 5EYWA 2P1FA 4NZJA 3BV4A 4UC5A 3MJYA 4BR1A 4NXSA 3UY7A 1S5TA 2V9DA 1IXQA 2FQIA 4A21A 3EWZA 4MFEA 5DCEA 1O60A 3G1HA 5AC8A 3VFLA 4Z1CA 3W07A 3LV6A 3TSMA 3QYQA 4O16A 4XTIA 1TPFA 1Z41A 3L0NA 5HWMA 1XDMA 3NL3A 2Y7GA 3ATYA 3TK7A 4FO4A 1VC4A 2NV1A 1KM3A 1OF8A 2ZZ1A 4AWSA 4UFKA 4L4LA 3LB0A 3C2OA 1KTNA 3GR8A 3TC7A 2A0NA 5K9DA 4FNQA 3MBDA 4AH7A 1W54A 2BXVA 3EWWA 1GVRA 4AMAA 4E2DA 3W76A 5EKYA 4JIPA 1R2RA 3C6CA 4R7JA 3NQ2A 5KZDA 2ZZ4A 1TSIA 1D9EA 1K8YA 2E5BA 5C5YA 3LHUA 2C3ZA 2QF7A 5C54A 3E9AA 4O50A 1TTJA 4Y9AA 1XL9A 4ZQOA 1KLYA 2J9YA 1SW7A 1ZALA 3LCGA 6ALDA 1X1ZA 3P67A 4IPJA 2QUVA 2E68A 2CLOA 4MUZA 4GXMA 2JGQA 1KFLA 4O19A 1ICQA 1UCWA 3T40A 2YYTA 1JQVA 3FKRA 3CLMA 3N3MA 4BWLA 3S5YA 3W74A 2OMAA 3NL6A 3SGUA 4IMCA 3NQGA 3RK8A 3LXCA 3G3MA 5F2IA 1KM2A 1NSJA 1RVGA 1OX6A 5AOUA 3CT7A 3K30A 2QUTA 5C55A 1G4SA 3F4NA 4RK8A 2PC4A 3N73A 5D2XA 1WX0A 2X1TA 1IIGA 4O28A 5I3HA 3M47A 3TFXA 4QSHA 1VS1A 4W9TA 4EF9A 4UUIA 3IGUA 2R14A 3PWAA 4FX7A 2YX0A 2Y61A 5D38A 1JVNA 3C2EA 2WSYA 3GVGA 4O0KA 1PL9A 3IIZA 5LGXA 1C8VA 1WXJA 3HG4A 4OGZA 2ZBTA 4N9EA 4HSNA 5HR6A 4GWEA 4Z0JA 4A2RA 4HT3A 5G1TA 4LS0A 3W86A 3OEXA 1XDLA 4O4VA 4FX8A 3MMTA 1TTIA 3U6WA 5T26A 1VRDA 1ML1A 4LRTA 1KFKA 3M44A 3BW3A 2AQWA 1XC4A 4KWWA 3GLCA 4AB4A 1XCFA 4LY8A 3NL5A 1DVJA 4JY8A 3F4WA 1F05A 4JTHA 1GZGA 1K02A 5BRBA 2X2GA 1UBSA 3HGOA 5HINA 2ZZ2A 4GJ1A 2QJIA 3KRZA 1Q6QA 2ATSA 2G96A 3SIZA 4PEKA 4ZQRA 5DCBA 1O5KA 4DBDA 4M6VA 3WK1A 4NNCA 1KM5A 3A22A 3Q58A 5AB3A 4UMCA 4DQWA 3S1XA 3QPYA 3M7WA 3BO9A 4MJZA 3OG3A 3CPRA 4ZL1A 5C6MA 3PB0A 1F2JA 1PS9A 1RV8A 1OFQA 2C16A 1G7VA 2I1OA 2WNZA 3CTLA 1KLZA 5CZ0A 3TQKA 4JTFA 1GOXA 4PCFA 5U4NA 1C29A 3NZ1A 4CNNA 3MI6A 4A22A 3DBPA 1VCGA 3LXBA 2CLLA 3BGJA 3MYPA 3W7JA 1XI3A 3M41A 1X7FA 2VC6A 3DFOA 3O6CA 3THAA 3A9IA 2UV8G 4AF0A 5AYZA 2PCQA 4UNLA 1OFOA 3C52A 1OFEA 3W85A 5D30A 1RR2A 2V82A 4GE8A 2J9XA 3W22A 2B7OA 3B0PA 3TIMA 2C14A 3MHUA 4RXFA 3DFPA 1H62A 3W2NA 1P1XA 3KOFA 1TV5A 3G8EA 4K7VA 3QSRA 1KV8A 4QISA 4O54A 4NJJA 3CIXA 4UTWA 4LS2A 1A5SA 5LNVA 5CKSA 4KFPA 1I2OA 4OU1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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