2CYG | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	IGVCYGMLGNNLPPPSEVVSLYKSNNIARMRLYDPNQAALQALRNSNIQVLLDVPRSDVQSLASNPSAAGDWIRRNVVAYWPSVSFRYIAVGNELIPGSDLAQYILPAMRNIYNALSSAGLQNQIKVSTAVDTGVLGTSYPPSAGAFSSAAQAYLSPIVQFLASNGAPLLVNVYPYFSYTGNPGQISLPYALFTASGVVVQDGRFSYQNLFDAIVDAVFAALERVGGANVAVVVSESGWPSAGGGAEASTSNAQTYNQNLIRHVGGGTPRRPGKEIEAYIFEMFNENQKAGGIEQNFGLFYPNKQPVYQISF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	beta-1, 3-glucananse
publication title	Crystal structure at 1.45-A resolution of the major allergen endo-beta-1,3-glucanase of banana as a molecular basis for the latex-fruit syndrome pubmed doi rcsb
total genus	109
structure length	312
sequence length	312
ec nomenclature	ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date	2005-07-07

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00332	Glyco_hydro_17	Glycosyl hydrolases family 17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2cygA00

4WKHA 3L4VA 1UH3A 1J0HA 4ZENA 3B9DA 1V6VA 3IAQA 4PEEA 1W9VA 2J8GA 1L0PA 1B3YA 2CITA 1M03A 2VQTA 3SUVA 1UD3A 5EBAA 6A3HA 3AIBA 4RE4A 2D3LA 1RP9A 5ABGA 1V6XA 3VM5A 1HP5A 2QMJA 3WD1A 2ZUSA 3GM8A 1DWHM 1MVYA 1VENA 2VCAA 1XH0A 4PMXA 3D3AA 5D9NA 1CZ1A 4DUWA 2WVVA 1GQIA 2OSYA 5E0FA 3SEPA 3PN8A 2EPOA 2Q8XA 1AQ0A 5E0CA 1QI3A 2WPGA 2VQUA 1E71M 2CESA 4UTFA 4BQ4A 1WZKA 1HJWA 3VIKA 1J0YA 1C7TA 4QLLA 3WDPP 1E6PA 3ZOAA 1EOKA 3PZVA 4Z2GA 4KGJA 1ITXA 4D6GA 3EYPA 2FDMA 2XVNA 2XSAA 2EPMX 3A4WA 3T08A 3SUSA 2J25A 5A8QA 2DIEA 5HNNA 5CSYA 3ARXA 3CPUA 1GW1A 1CXEA 2AAAA 1IT0A 4CVWA 3OA5A 3KL3A 2OSXA 1VFFA 1LLOA 1B0IA 4KRTA 2FH6A 4P7QA 2CCRA 2WLYA 4AXNA 2JEPA 3AMDA 4JFWA 3VNYA 3ARPA 2NW0A 3WFZA 3WBEA 4TTUA 2X1IA 2WCGA 4GIAA 1GOMA 4BCEA 4ZE5A 3W26A 1XCXA 5BCAA 4OBSA 4H8UA 1JXJA 3N17A 3GYCA 2ZX6A 4IUGA 1WDPA 4BZYA 4QDMA 5M03A 2E40A 4WK9A 4AEFA 3PTKA 4P8WA 1JZ8A 3AHYA 4UQEA 2E9MA 3U7VA 4W93A 2WK2A 3K4AA 1E0XA 2VZSA 2A3HA 1IZJA 2VR4A 2Y8KA 2ZXBA 4ATDA 3BH4A 1JZ5A 3PTMA 4CGTA 4RE3A 6CGTA 2WKGA 4U31A 3IAPA 1BHGA 2RGLA 2DGAA 3AQUA 4Q7NA 1UQZA 1E5JA 1CLVA 3U57A 4HU0A 3CIVA 4JCLA 3IJ8A 3O2LA 2VJXA 1OGGA 4TOQA 2DH2A 3VD7A 4WSJA 3UERA 3GBEA 1NOFA 5CPTA 4UFLA 4E8DA 3AICA 3L4XA 4QP0A 5C71A 1VFUA 2VX4A 2CBVA 1JDDA 3JUGA 3A47A 4PMZA 1W3HA 4EKJA 1H0GA 1KGWA 4PMOA 4GO8A 4W5ZA 1WB0A 3WDQA 3RMEA 4PMVA 4PTWA 5JBEA 1G94A 5F7UA 2VL4A 4CN6A 1C8YA 2CHOA 2BXZA 2WBKA 4MDPA 3E1F1 4OUEA 4UZUA 1UWTA 1KBBA 2YDSA 2VVNA 4E4PA 3SCNA 2J7CA 1EHNA 1W2VA 4ACZB 5A94A 3EDFA 1JXKA 1TE1A 3BC9A 4GO9A 5LA0A 2GJRA 1CGXA 3RIKA 1QBAA 4HP5A 4MB5A 2CERA 4GI9A 2Y5EA 4GQQA 1TMQA 2XM1A 4MPKA 4E2OA 3BAKA 4WF7A 1C90A 3SCWA 2PF0A 1W9BM 5A6AA 2CBIA 1BFNA 1NP0A 4U3AA 4DUXA 1JD9A 3VVGA 4TX6A 5A6MA 3F5KA 1BVNP 1HJXA 4LQ1A 1XD0A 1D3CA 2A3EA 3UETA 4HZ7A 4XZWA 2DT3A 2WXDM 2PWHA 4HOXA 3EDDA 3TTSA 1UR8A 1BVZA 3O9NA 1V02A 5DFAA 4FMVA 2ZUNA 4UOZA 2WHJA 1BQCA 1B1YA 1QHZA 1OIFA 4BQ2A 4XV0A 1XC6A 3WMBA 3VX1A 3L2LA 3W53A 1PZ3A 1E4MM 1LL4A 1UD4A 1BYCA 1UKPA 4R27A 3VIMA 4PUDA 1VIWA 4EAMA 3W81A 2YKKA 3UESA 3N04A 2E9BA 3WL1A 1WDSA 3CH9A 3AMKA 3ARRA 4IPLA 4NF7A 3QR3A 4P8VA 2ZUMA 1V6YA 1KFWA 1AQMA 3W37A 1GOQA 1M04A 1K9DA 1Q6DA 3WNMA 1LL6A 1B3WA 3EBVA 4KH2A 1TFVA 1H41A 2ZE0A 1Q4NX 1A3HA 4MB4A 1G01A 1HXJA 2JIEA 2CPUA 2J78A 2OWXA 2G41A 3HN3A 3MU7A 2W62A 2GDUA 4FLRA 1KXTA 3ALGA 4OZOA 3WEMA 4HOZA 2C0HA 1KQYA 2WC3A 4PMNA 4B3KA 2WM0A 1R7OA 2BFGA 1NARA 3OZOA 4D6FA 2VCBA 3A4AA 1QI5A 1UZ4A 4TXEA 2CEQA 1MQPA 1MW2A 4AZGA 4E8CA 1MW1A 4CU8A 2AOSA 3ARZA 5LA2A 2UWFA 1KXHA 2PB1A 2A3BA 4KWUA 4TVCA 4CCEA 3AMGA 4P8XA 4W5UA 1WZMA 3CUFA 2DT2A 1B90A 2W4XA 3HU7A 5I23A 3CGTA 1E6SM 3L4ZA 4P7RA 2D0HA 3VDAA 4TX8A 4Q22A 1HIZA 3SIMA 1W2PA 1TUXA 3WDIA 4TTGA 2WNWA 5BRQA 1EQCA 3QGVA 4UFKA 1UR2A 3ZIZA 4H8HA 3WUGA 2OLHA 1VAHA 1HVQA 3BLKA 1SMDA 3M7SA 1JNEA 5I77A 5I2UA 3APGA 2WWDA 3GNPA 4J28A 3OLGA 4U5IA 3F5LA 1JZ4A 4W8BA 2YLLA 1HX0A 3VIHA 1KB3A 2WLZA 8CGTA 3VIGA 1XV8A 2XFRA 4JL2A 4UQ9A 1V03A 4QAWA 4N0RA 4BQ3A 1OB0A 3SCSA 2VURA 2HVMA 3A3HA 2UY4A 3J7HA 5CGTA 2ZUTA 4MB3A 2EPKX 3WD2A 2G3NA 1CENA 5BXTA 2WCSA 4J3XA 2YBUA 4AMCA 2WVSA 1C91A 3AS2A 1EXPA 3WL0A 3L4TA 1W3KA 3AJ7A 3WD3A 1XSJA 4D72A 4J3TA 2VZOA 3O6AA 2WMIA 1QNOA 5EFFA 2ZX5A 2ZWYA 4YN5A 5HBFA 1UD8A 1B30A 3OB8A 3MMUA 3VILA 4J3VA 3QOKA 2X2YA 1E5NA 3MKKA 3WQ6A 3QHOA 1ZJAA 2BY1A 3FXYA 1UD2A 2CHNA 2D23A 1FFQA 1ISZA 1G1YA 2DH3A 5CPSA 3NDZA 2GJXB 4M80A 3WIJA 4KRUA 3BAIA 4MAVA 1FH7A 1WZLA 4BF7A 4V28A 1FH8A 1E6ZA 1E9LA 4B9ZA 4ZE4A 3EDJA 1E3ZA 3B9AA 3PZQA 1AVAA 3W6LA 1MQRA 3ZSSA 5I24A 2VX7A 1SFSA 3ARVA 1BG4A 3EDEA 4C7FA 3PZNA 4HPGA 4KGLA 4GPNA 1UWIA 3WUFA 1ZU8A 1VJSA 2VUYA 3WQWA 4NZCA 1CGYA 1CLXA 2PWEA 4OOZA 2GVYA 1V0KA 3WF4A 1U2YA 1EGZA 2G3IA 4UFHA 1GQLA 1E0VA 4P7NA 1CDGA 2IXUA 2VZTA 1SR0A 3VTRA 5BXPA 3IK2A 2ZXQA 5A6BA 5EB8A 1NH6A 1G5AA 3FHQA 2WMHA 3GNRA 2B31A 8A3HA 2DEPA 1VF8A 1CGVA 4UCFA 4HZ6A 1NWRA 1HT6A 4W88A 3GNOA 4D1JA 5I0DA 1C8XA 2OYKA 4AYSA 2YL8A 7TAAA 4ATWA 5E6YA 3THCA 3VGBA 1JI2A 4PCTA 1CXFA 3WEOA 1W9UA 2CETA 3S6TA 1QHPA 2D24A 2QPUA 2XPKA 1E6NA 3TA9A 3T2QA 2ZUVA 4HMDA 4QFUA 3CO4A 5M17A 1H2JA 1ECEA 3OIHA 1JZ7A 1CGWA 5BROA 2WAGA 3SUUA 1PIGA 5HPOA 4K68A 4ACYA 3K8MA 5IFTA 3VUPA 4AZBA 2V3EA 2VO5A 5A6KA 2BV9A 3CZLA 5GNZA 3K1DA 4U33A 3RCNA 2PBGA 1E15A 4HA4A 1KGUA 3WNNA 3RPMA 5TD4A 1KR0A 1HKMA 2VT0A 3RM9A 3VD9A 1MW3A 1K9FA 1UWUA 4M24A 4NRSA 4UQAA 2XVKA 4AIOA 3SCPA 2PWDA 3W27A 3CZKA 1GORA 2XSBA 1OWQA 1H4PA 4NSBA 2V3DA 2ESCA 2JALA 1EQPA 1JFHA 2GK1B 3OGRA 1K9EA 1IZKA 5IXEA 4JCMA 1WDQA 2NT0A 3BSGA 3GXMA 5BRPA 1EIBA 5A69A 4MTVA 3F5JA 3WQ8A 1JNDA 1GQKA 1A47A 3N1AA 2WWCA 3F4VA 4D71A 2EQDA 2VNCA 1IV8A 3VM7A 1E4IA 4MNLA 3G6MA 3U5YA 1W1TA 3L4WA 1HKJA 3BMWA 3RDKA 3K46A 1UH2A 1GVYA 4UFIA 2CYGA 1PBGA 1UWQA 1JF5A 1C7SA 1M53A 2XWEA 3WQ4A 1JYVA 3CHDA 3K4DA 3MUY1 4MNMA 3T0BA 1E4LA 4XB3A 3ZT5A 3FAXA 1NM9A 2YLAA 4PMRA 3CZ8A 4R5EA 1DWAM 5ABFA 1JGIA 1FH9A 3BAXA 2D20A 1BSIA 3UEQA 2PWFA 2O9PA 4PTVA 1WAWA 1W3LA 3ARWA 2MANA 2J74A 1W1PA 1CECA 3AYRA 4HMEA 1FOBA 1H3GA 4JKMA 3KEHA 4JFUA 4DUVA 2WANA 5I79A 5A8PA 1HNYA 1PX3A 3DHUA 2V38A 2WHKA 2X09A 4F9JA 3AYSA 4LYPA 4DM2A 2EXOA 5IHRA 4U2ZA 4WSKA 1ZJBA 2XM2A 1ODUA 3OLEA 5JIPA 3BAWA 1H09A 2C8NA 2TAAA 5D8WA 4U2YA 4ZXOA 2V3FA 1JL8A 1KXQA 3VX0A 1OD0A 2J79A 4J3SA 2G3JA 4FLOA 1W32A 3VMPA 1V0LA 1KBKA 2E8YA 5A2BA 1J10A 1V0NA 3ARQA 5I5RA 3ZR5A 3PZGA 4YPJA 5ABEA 1R85A 1PEZA 4PCSA 5CXPA 2EBNA 1SMAA 1LF1A 2OSWA 2WMFA 1UOKA 3U7BA 1EA9C 2O9RA 3WH5A 3MUIA 4B3LA 1WNOA 1JG9A 2WSPA 4PBGA 1QI2A 1P6WA 1LL7A 5M5DA 1QNRA 1WKYA 3BGAA 1TA3B 4PMQA 2E0PA 4D6HA 2UY5A 1YQ2A 5IDIA 1W3JA 1C93A 1TR1A 1M7XA 1UZ1A 4DWSC 3ARSA 1UQYA 1K9TA 1CBGA 1JZ6A 5FIPA 2WC7A 1J0IA 4W86A 4CKQA 4AC1X 5JUVA 1QPKA 3I3DA 1J11A 4ML4A 4LYRA 1OCQA 1OIMA 2W91A 3AHVA 4V27A 1N82A 4ACZA 4GXPA 4H04A 2E9LA 1O6IA 4QCFA 1E1FA 3WH7A 2E4TA 2QF8A 3UR7A 2UY3A 1XHGA 3WF0A 1J12A 1UG6A 3MO4A 2HISA 1LG2A 3VGEA 2FH8A 4PSPA 4UOJA 3ZJ6A 4H2CA 2W63A 3WD4A 1I1WA 3NSNA 1WP6A 3TTQA 4GI8A 3WH8A 3ARYA 1HJVA 3SUWA 1JF6A 4H8VA 4ATLA 1DWJM 1HP4A 3PZUA 2F2HA 2DSUA 1H0IA 1CGUA 2VOTA 1V3IA 2VX6A 3DYOA 3WNLA 2ZX9A 1Q6FA 2J47A 1GJWA 1DEDA 3OG2A 3RO8A 3ZT7A 9CGTA 4W7UA 3VD4A 2BS9A 4PMDA 1BG9A 4B15A 2J8FA 5C70A 3WSUA 1WDRA 3AS0A 4FLSA 4AZCA 2CIPA 2YL5A 4Z2JA 1BYDA 4W8LA 3EMCA 5DO8A 7CGTA 1NOUA 4XUYA 4W84A 1Q6CA 1GOIA 5GQBA 3VDCA 1BGAA 1GCYA 2D3NA 5BWFA 1OD8A 5HPCA 1H49A 3VDHA 3K8KA 5KZ6A 4NRRA 4M56A 1XRVA 1RD6A 4FK9A 1DWFM 2GJPA 4B16A 1NP2A 4OIFA 5HXMA 1D2KA 1WE5A 3GBDA 3N11A 3WY1A 1VBUA 4LGXA 1DHKA 2CBJA 3GXDA 3LMYA 1E1EA 4UZSA 2YIHA 1U33A 2CNCA 1CXKA 3NCOA 3AHZA 3AIUA 4KMQA 2JFEX 2ZUUA 2YDQA 3IJ9A 1I1XA 3ALFA 4WLCA 5FD0A 3TP4A 5JBDA 2VRQA 1XGZA 5IHSA 2WC4A 3PTQA 3UR8A 2VMFA 3MV01 2BXYA 3RJXA 1UWSA 3SCTA 1C92A 3GDBA 2WMKA 2VRJA 1JZ2A 1CTNA 3ZJKA 3EMQA 3WDJA 5GNXA 2EO7A 1Q6EA 1H5VA 1TCMA 2ZXAA 1HF6A 4AD0A 1GJUA 5BYWA 2G8ZA 1EO7A 4LYQA 5JIWA 3WF3A 2J7EA 2VCCA 5BXRA 4CCDA 2XVLA 4A3YA 3AZRA 5AY7A 4GQRA 3OGVA 1O7AA 1EH9A 3ZJ8A 3GXFA 2QHAA 2PI6A 1Q6GA 2J7DA 1MFVA 4J3UA 1V3KA 2Y8VA 1GONA 1LG1A 1BYBA 4MNKA 1S46A 3WDHA 4LPCA 6TAAA 2ZOXA 2ZXDA 1BAGA 4M29A 1LWJA 1BTCA 2XWDA 2PC8A 2XHYA 5A6JA 1GQJA 4XZBA 5ECUA 2JF7A 3LPOA 1GVIA 1ZBWA 1XYZA 2VX5A 3MV11 1RH9A 3POCA 1C3FA 3OBAA 1CXLA 2VZUA 1GOOA 4CD7A 3L4UA 5A3HA 3ZQ9A 4A3HA 1FFRA 3WN6A 3VNZA 4CU6A 1NWSA 1OT1A 2D22A 3WENA 1ISVA 1KXVA 1WO2A 5D9OA 3A4XA 3U5UA 5D4YA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1E56 A;  3AS3 A;  3AOF A;  2WMJ A;  4A4A A;  2BVT A;  5CQ1 A;  4PUE A;  3FN9 A;  2E8Z A;  1E6Q M;  1ESW A;  1NWU A;  1X6N A;  5AC4 A;  2XIB A;  2W92 A;  4X9Y A;  1BLI A;  1CPU A;  2D0F A;  2BHY A;  4ZFM A;  4AZ5 A;  1OSE A;  3POH A;  1VFO A;  4XX6 A;  3T09 A;  3TOP A;  2IUZ A;  2XFF A;  1R87 A;  4MAZ A;  4D6E A;  2QPS A;  3OLI A;  1CIU A;  4WJX A;  2XII A;  4N42 A;  4LX4 A;  1V02 E;  3CZG A;  4PRW A;  1UR4 A;  2J7F A;  4QLJ A;  1J9Y A;  2JIW A;  2J62 A;  3SCQ A;  4JIE A;  2J7G A;  2BNJ A;  3VMN A;  2X8R A;  1OGB A;  1OIN A;  2FHC A;  3PZM A;  1UR0 A;  3W82 A;  2DIJ A;  2OWC A;  1AMY A;  2J4G A;  3VOC A;  3NJ3 A;  3PZI A;  1UKO A;  1JDC A;  4PN2 A;  4AD2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2CYGA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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