4A3H | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	PROTEIN (ENDOGLUCANASE)
publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	122
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-07-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4a3hA00

2XG9A 3CZJA 1V3MA 2MANA 1KWGA 2VZOA 3VMOA 4JFWA 1UWUA 1ISVA 1PIFA 2PWDA 5D8ZA 2EBNA 3K1DA 4B3KA 5E09A 5A6AA 1F4HA 1GJUA 1WKYA 3MMDA 3PZIA 1N82A 1W9BM 1UR8A 1X6NA 3LPOA 5E6YA 3EMQA 2OSYA 4RE2A 2CESA 1V3KA 4GIAA 2JALA 2FDMA 3G6MA 3ALFA 1MQRA 1IZKA 4LYRA 4QCEA 3BMWA 2VVNA 3AIUA 2XFRA 4PEEA 2VCCA 1B3ZA 2WVVB 5JBFA 2V3FA 1MYRA 2XM2A 5D9PA 1OB0A 1QPKA 3D5HA 3S6TA 1E5JA 2DQXA 3A4WA 4L4OA 1TCMA 1QVBA 3CHEA 1NH6A 1B31A 1CGYA 2GVYA 1CLVA 2VQTA 3T2PA 4KRTA 5GNZA 4PMZA 3T0BA 1QI2A 2YA0A 4WF7A 3AICA 2VZTA 2DIEA 5HOSA 5CJ5A 1ISYA 1LQ0A 2VR4A 1IT0A 3RJYA 2E3ZA 3LPGA 1EOMA 3EMCA 2J47A 4LYQA 4W93A 1E4LA 4W88A 1R7OA 4PSPA 3AOFA 1JNDA 1GOOA 1QNPA 4UZSA 3SUWA 1EGZA 3F5JA 1OGBA 3WEMA 2CKRA 2RGLA 1QBAA 3L4XA 1QI4A 2WHKA 5AY7A 2WHJA 5CPQA 4AEEA 3AXHA 3VD4A 2QV4A 1OWQA 4GPNA 1WE5A 4EKJA 3WNPA 3E1F1 3GXFA 1AVAA 1ZS2A 3GNOA 1H41A 2BHUA 2CBUA 4ZE4A 3DECA 2XGIA 3BLKA 3QOKA 3BAKA 1D3CA 1D7FA 4CGTA 4UQEA 1TMQA 2GSJA 2EPOA 4CKQA 3WUBA 5BWFA 1RP8A 1E4MM 4V2XA 3THDA 4AIEA 1QNOA 4RE4A 2OWWA 2X8RA 1XCWA 1OCQA 5M03A 3DYMA 3WNNA 4PN2A 3AXXA 3PZOA 1BTCA 2J7GA 2OYMA 2A3HA 4U5IA 1HJUA 1XD0A 1CGVA 2Z1KA 2XSAA 4J3XA 1CGTA 4J3SA 5A8OA 1UG6A 4D1IA 3GXDA 4YHEA 4A3YA 5A6BD 3GZAA 5FOOA 3L2MA 3F5LA 1JAKA 2BY3A 3N1AA 3FW6A 3ARZA 4C7FA 3MS8A 1C8XA 1HKIA 2DT3A 5GNXA 4F79A 1P6WA 1UWQA 2D3LA 4GZEA 2J4GA 2GJRA 1Y7VA 1EOKA 3CPUA 1H11A 3AIQA 3CMJA 4P8VA 3VIIA 3VIHA 4FLQA 2EEXA 3OB8A 4PTWA 1K9EA 1NWRA 5JBEA 3W25A 1TZ7A 3RO8A 3NDYA 1MW1A 2XUCA 4M29A 2E4TA 1FH8A 4S3JA 4LYPA 2CKSA 4CD5A 4DUWA 4GINA 3AMKA 4ACZB 2WMGA 3CBWA 4GZJA 3W81A 3W6MA 4RE3A 3WD3A 2ZICA 1I75A 1B2YA 4H04A 4FLRA 3W24A 1UKPA 2UY4A 3EDEA 1NQ6A 4UQDA 3K4AA 3FAWA 4YPJA 4JCMA 2WM0A 4AC1X 1GOIA 4PCSA 3VGBA 3AS3A 3VU2A 1B3YA 3GBEA 3ZMRA 1DHKA 1EO7A 1ESWA 1U33A 5DF0A 3UG4A 3PZ9A 2PWEA 3WF0A 2DSUA 3CUFA 1WDPA 4D6EA 5E9AA 2ZWYA 3BC9A 4AZIA 1BYDA 1JYWA 2C8NA 2VR5A 5A95A 1V08A 3BMVA 3U5UA 1W1TA 5A6JA 4ZE5A 3AMCA 1WB0A 1KQYA 3CUHA 1ECEA 2PWHA 3FN9A 1MWOA 1H0IA 1HP5A 4U33A 4YHGA 2JIEA 5DFAA 1VF8A 1QW8A 4AXNA 1W9XA 1OGGA 4AD4A 2VMFA 5BRQA 1JAEA 2EPMX 4QLLA 3WQ5A 1V6UA 1VEMA 4P7LA 3SCPA 1HJSA 3PBGA 4XZBA 2W67A 1PX4A 1OBAA 1O7AA 3ARSA 2AAAA 4X0VA 2EPKX 4AD2A 4WKHA 4HMEA 3MV11 1FH9A 5CGTA 5DMYA 2XM1A 1ISWA 3AHZA 7CGTA 2XVGA 1HX0A 4CU7A 5CPSA 1JZ3A 2X09A 1UWSA 2DDXA 3AZTA 1JGIA 2TAAA 3N11A 5D9NA 1EHNA 3PZNA 2DSWA 4JKLA 3MUZ1 4PMNA 2IXUA 1B0IA 3ARPA 2YDSA 4ZXOA 4CD4A 4NSBA 4OIFA 3NSXA 1E0XA 3N17A 3PN8A 2A3CA 3CHDA 3OZOA 2WCAA 4TVDA 3VGHA 5IXEA 3GH4A 2D0FA 5JIPA 3EBVA 1Q6DA 1W9PA 1G01A 1E4IA 1V0KA 3AYRA 4PYSA 1LJYA 2WB5A 5FCZA 1ODZA 1GOQA 4HU0A 2CHNA 3U5YA 4FF5A 1UD2A 1UD3A 3ARQA 1O6IA 2A3BA 9CGTA 2G3NA 1M7XA 2Z1SA 1E6NA 4P8WA 1VFOA 1V02E 3WDQA 4CN6A 5E70A 4MNMA 4A4AA 4OUEA 4PUDA 1JI1A 1OINA 1NWSA 3WD2A 3WH7A 5I2UA 4HZ7A 1JZ7A 3SCUA 1YHTA 1PAMA 4IPNB 5EBAA 3CIVA 4GI6A 1E40A 2BY0A 1TVPA 2GJXA 1C91A 5M17A 4MDPA 1SFSA 4D6FA 1Z32X 1TR1A 1EO5A 3QR3A 2G3JA 2ZUWA 2D20A 1C8YA 1CXIA 1QOXA 3WSUA 3IJ8A 1ITXA 3WNLA 4JIEA 4HOWA 2ZXAA 2ZUSA 2YOCA 4RL3A 2XPKA 4S3KA 3CZEA 1EA9C 3PZMA 3VIMA 2ZUNA 3AIWA 3VIFA 4QLKA 4JHZA 1C7TA 3AIBA 2Y5EA 4KRUA 1K6AA 3EDDA 2CBJA 1JD7A 4U3AA 3WBEA 3VGGA 2PB1A 1VRXA 1CENA 1E5NA 4M82A 3ZR5A 2ZXQA 1GNXA 1V0LA 3W82A 1I1WA 4CU8A 4AIOA 1LG2A 3MMUA 3EDJA 1E9LA 1NARA 1V6WA 4UQCA 4DM2A 2Y8VA 2HVMA 4IUGA 3AZSA 1QHZA 3CHFA 4AEFA 1HVXA 3WELA 1JXKA 3MO4A 2NT0A 3ALGA 3SEPA 4MNKA 1GJWA 1KR1A 4MJ2A 1QI3A 3BSHA 2WC4A 3RM4A 4TX6A 4D6HA 1GQLA 1V0NA 2ZUVA 1VJZA 4OKDA 2IXVA 1CXLA 4FLOA 1FP8A 1EHAA 1BGGA 5A2AA 1DWHM 1ZL1A 1YQ2A 1FHDA 1FH7A 5I79A 3UR8A 1FOBA 1UQZA 2WSKA 3A3HA 3AHTA 5CGMA 1C92A 4AYSA 5ECUA 1W1PA 4P7NA 3CH9A 3VVGA 4HP5A 3KWXA 5HPCA 1CWYA 1HNYA 4E4PA 2GDVA 1HIZA 4W7WA 3ZJ8A 1H0GA 3VX1A 2WCGA 1UR0A 2XWDA 1J0YA 2BNJA 4BQ2A 4DWSA 4U2ZA 3N04A 1KXHA 2J74A 1W3KA 1H2JA 3RMEA 5LYRA 5BXTA 2BXYA 2YA2A 2PBGA 4HOXA 3W4RA 4TVCA 1GORA 4A3HA 3ZR6A 1E72M 2XYLA 4H8VA 4P8UA 4P7RA 4W8AA 2J77A 1CGUA 2QF8A 1UWIA 3L4UA 2BY2A 1G0CA 1RD6A 1GUVA 2WSPA 2UWFA 5JBDA 2ESCA 1QI5A 1B3XA 4GI8A 2VZSA 2ZX7A 2YJQA 4L4PA 2DH3A 4C7DA 3SUVA 1ZBCA 4F9DA 3RDKA 4AZHA 2EPLX 1QI0A 2FHBA 3UG5A 2G8ZA 2XFFA 2IUZA 5DT7A 3BCDA 2Q8XA 4PMOA 8A3HA 3VMNA 3VM7A 1H3GA 1UZ4A 4OOZA 2E8ZA 2XIIA 3ARWA 1CEOA 1BVZA 2CXGA 1OT2A 3IK2A 1BYAA 1U2YA 3WL0A 1KCKA 4PCTA 5A6SA 3WY1A 4URIA 3T08A 5AC5A 5IHSA 1E3ZA 2J75A 1CGWA 2PWFA 5HNNA 3NDZA 5A3HA 3WD1A 5FD0A 1OD0A 3PZVA 1WZAA 2FGZA 4W7UA 3K8LA 3THCA 1L8NA 5A1AA 4LPCA 1B9ZA 1J0ZA 1KFWA 4CVUA 3VPLA 2XTKA 5HBFA 4BQ4A 1HN1A 3RILA 3WDIA 2JE8A 3AROA 5I77A 2CYGA 1CXFA 1WAWA 1E15A 4AZGA 3WDHA 2VX4A 3PZGA 1QHOA 4IM4A 3VGEA 4E8CA 3T2OA 1KBBA 3VUPA 5BYWA 3AS1A 2PI6A 3EYPA 3WN6A 3PHAA 3POCA 3AS2A 3VIPA 4ML4A 1R8LA 2ZX6A 4X0NA 3OGSA 3OLDA 4U5KA 1KQZA 1BQCA 1H09A 2O9TA 1JFXA 1W3HA 2JF7A 1BHGA 4D6IA 2DT2A 1XSKA 1EQCA 6CGTA 4D1JA 1UR9A 2BVTA 2WLZA 4E2OA 2GJXB 1GPFA 5BCAA 3HU7A 1CPUA 3WMSA 4GKLA 1B90A 1GOKA 5M3WA 3NSMA 4PMYA 3T0AA 4D72A 2XVKA 3MV01 1GZJA 5A8MA 3RPMA 1OT1A 5CQ1A 2NSXA 1NOUA 3NIYA 3UEQA 1E6PA 2J7CA 3WENA 4QAWA 2V3DA 4JCLA 5I24A 4TXEA 3PTKA 3W6LA 2QPSA 5I6SA 1XHGA 5ABEA 1PZ2A 1MFUA 1E1EA 2C7FA 4M24A 5BROA 4YN5A 3A4AA 2V38A 3WDJA 3KL0A 4BQ5A 3VX0A 3CZLA 3OGRA 4W89A 3VIJA 2W5FA 4TTUA 2WHLA 2VL4A 1R85A 2VX5A 1DWIM 1ISXA 2QHAA 1BLIA 3MSDA 4BCEA 3BLPX 1DWGM 1OD8A 2D0GA 2WPGA 1KGXA 1CTNA 2XVPA 2D2OA 3MMWA 3VOCA 2VTFA 4GO9A 1U30A 2X0YA 1W9VA 1BAGA 4KWUA 4Z2IA 3QGVA 2CERA 1HF6A 4LXFA 2ZOXA 1KCLA 2CNCA 3RM9A 3A47A 2D1ZA 3VILA 1BG4A 1HT6A 1NWTA 3AJ7A 3ZIZA 3M46A 2J78A 4NF7A 5BXPA 1PX3A 2WANA 4WLCA 2J79A 3MSGA 1WZKA 3ZJ7A 1X6LA 4UOZA 3UR7A 2F61A 4H7VA 1V6YA 2GK1A 3BAYA 3BCFA 3FHAA 3OBAA 5I78A 1XH0A 4CD7A 1A47A 2EJ1A 3RJXA 3ZT5A 2YIHA 1ZB5A 3BAIA 4H41A 1JDDA 1LG1A 1BPLB 1WNOA 5D4YA 3RCNA 3AYSA 1XV8A 1C8QA 4MB1A 3WEOA 3OGVA 5C71A 1E0VA 3KL3A 2WNWA 1RH9A 3GXIA 4UQ9A 1PEZA 3CZKA 4AZCA 1CECA 1E6RA 2W63A 1LWJA 1R86A 3KZSA 5AYIA 1ZBKA 1GVIA 2E8YA 2NW0A 4FLSA 2XVNA 4MNJA 2BHZA 4ZXLA 2XIBA 2OWCA 1XCXA 3ZJKA 3ZQ9A 4NRSA 1WDRA 3HMCA 3WNMA 5BXSA 2G3IA 3SCSA 3NJ3A 2WLYA 3WEZA 1HP4A 1MW0A 5JUVA 2DSKA 2BHYA 2QLYA 3WH5A 1DWJM 4JHOA 3ARRA 5DEZA 4HPGA 7TAAA 1VB9A 3LPPA 1JDAA 3BSGA 2E9MA 4JL2A 2UY2A 4UZUA 4AISA 5IHRA 1AMYA 4XV0A 3W28A 2ZUUA 3WD0A 4F66A 4KH2A 4HMDA 3TTYA 4DWSD 1LL6A 1UQYA 2VUYA 1J0HA 1I1XA 2WMKA 2DSZA 5FL0A 2GJPA 3DHPA 4EE9A 1BG9A 2VZVA 1EXPA 1NOWA 2BV9A 1UKQA 4UQAA 1K9DA 1VFUA 1NOFA 5IDIA 4W5UA 5A2CA 3ARYA 2YLAA 3RIKA 1HL9A 4J28A 3K4DA 1ITCA 6A3HA 2DT1A 1DEDA 3W27A 2V3EA 4GI9A 3VGFA 4UFMA 4DUXA 5M5DA 2G41A 2WK2A 1UH4A 4K68A 1UYQA 1UKSA 3I3DA 1FFQA 5A2BA 3AHVA 3FNDA 4AZBA 2D0HA 3JUGA 1PX8A 1K9FA 1E55A 3WQWA 3AMDA 1G1YA 1AQHA 4JL1A 3WD4A 1VENA 4B16A 4UFJA 4MB5A 3VDBA 5GPRA 2VCAA 1GONA 5KZ6A 1EDGA 4WSJA 1JF6A 3L4WA 3TONA 4FMVA 3W29A 4HU8A 4J27A 8CGTA 3N15A 5CXPA 5KEZA 3F4VA 3WDRA 3DYOA 1QNRA 1GQIA 3SCVA 2O92A 3U57A 3WH8A 4WK9A 1KXTA 3VD3A 4W7VA 4PUEA 1E0WA 2WCSA 1JYVA 3EMZA 2YBTA 4F8XA 1UZ1A 3N12A 5F7UA 4HZ8A 5CSYA 2AMGA 4KGLA 3WMBA 1V6VA 4OZOA 1UH3A 6TAAA 1UUQA 5I5RA 4WSKA 3GDBA 4B15A 4BZYA 3W38A 1JG9A 1W3JA 4PMDA 3IJ9A 4H8UA 5D8WA 3FXYA 2YKKA 4HA3A 1WZMA 4JFVA 3VGDA 3AIEA 2CHOA 4M81A 4XZWA 4UOQA 2AOSA 1LWHA 3CMGA 3VIGA 1MQPA 4CD6A 3ECQA 3TA9A 1LL4A 2WBKA 5A8QA 3ARUA 1US2A 3QHMA 4QCFA 3VIOA 1H49A 2FGLA 2W91A 3PTMA 4C7GA 2J25A 1EDQA 3AQUA 1A3HA 4OOUA 3WKZA 4EANA 2JIWA 5EB8A 2WMJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations