3W1PA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-ethenyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylic acid
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-ethenyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylic acid
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 109
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1pA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1pA01
3UY8A 2ALDA 5AHIA 3GZ3A 3P84A 4ZQRA 2H8ZA 4FEZA 3DXIA 1G7UA 3M6YA 2CLKA 3IIOA 4CCCA 3UWQA 1W3IA 3M41A 1R2SA 2V30A 4CLMA 5LSMA 3SR7A 3ABOA 4Q4KA 4CQ9A 4LRTA 4MFDA 1F73A 4UIOA 1W3TA 3LHUA 3LM7A 3HB9A 4E38A 1H1YA 3ZFHA 1KA9F 2TPSA 1XDLA 5EA9A 3QZEA 1EP2A 1GPWA 1CI1A 4PA8A 1N55A 3UQNA 1PE1A 3F1QA 4X22A 3LGEA 1KBIA 3NQ8A 4FNSA 4IJBA 3M1ZA 1A50A 1ZAHA 5G2HA 1FCUA 3TJXA 1JCNA 3B0UX 3T55A 2YR1A 3GXNA 4HNVA 3W87A 3B05A 5BRBA 2P0OA 1I2PA 3B0VC 1GVFA 1K7XA 1YTDA 2G5WA 3A21A 2QUUA 2HMCA 2NV2A 3DU0A 4O53A 1XUZA 5AYZA 1W3NA 4PEKA 4YL2A 3PBVA 3UD6A 1SZEA 4O28A 1JCXA 4JTIA 1ZNNA 5L6UA 3WJYA 3E96A 4DQWA 3W22A 4AF0B 1W5MA 2V81A 1H7OA 5DBUA 2QAPA 2V5LA 2CZEA 5KZEA 3TNOA 3C0JA 4KFPA 5G4WA 2OJPA 1H7WA 4O19A 3QMSA 3OEXA 1LDCA 1OYCA 4Z1BA 3G0UA 1OK4A 1QMLA 2EKCA 3SZ8A 4JXCA 5AHFA 3DENA 2ABAA 2HSAA 4NJJA 3PAJA 1O4UA 3RU6A 3STFA 3TFXA 5KMYA 1R2TA 1LLWA 3QC3A 2VFDA 3C2RA 3TW7A 3BARA 2QCMA 5FEPA 2WPBA 2VFFA 1IXPA 1YTKA 2B7NA 4IPIA 3FFSA 3EX4A 3H55A 3TAKA 3DKLA 3HG5A 1I2QA 4QISA 1OABA 2ZZ1A 1R30A 4H3DA 3MP5A 5K7JA 1GVOA 3I7SA 3O63A 3S1WA 3KHJA 3RK8A 1THFD 2XN0A 1UBSA 4BFAA 3L5AA 2J6XA 2GQAA 3LHYA 5EL1A 3F03K 2WSYA 3TXVA 5EY5A 4XKYB 2YSWA 5HINA 3LXCA 2YW4A 4UMBA 2Z6IA 1TPC1 1IF2A 2ZRZA 3I7RA 5E1QA 2YPIA 3BLEA 3O8AA 3WK0A 1H50A 4BI5A 3ZWSA 3L66A 2NXHA 3SIZA 1G6CA 1RQHA 4E0CA 3MUXA 3OA3A 2A2IA 4LNYA 2X30A 3V75A 1G69A 1SO5A 5DELA 3U8GA 3W72A 5G4EA 1IIHA 5FF0A 4PODA 4Z0JA 4K7YA 3LRLA 1G4PA 3SJ3A 3EWWA 5C55A 3N3MA 1GT8A 2QUVA 3M44A 4CQAA 4HT3A 4M7TA 3G8RA 2YFOA 5J5RA 4LU0A 1IXNA 3GXPA 1W5QA 4NQ1A 4KKXA 3P60A 5CPOA 2ZTKA 3P67A 4HSNA 3TQ0A 3CM4A 3LHTA 4ZQMA 2J24A 4JX4A 1PCWA 2X1TA 4ADTA 4WQ6A 1FWNA 4K36A 1ICQA 3W3OA 2Z0IA 3KFTA 4XKYA 2VXNA 2O7SA 3GR8A 4ZL1A 1SQ7A 3TA6A 3LXAA 2DZSA 3NM3A 2VFGA 3W1MA 4G1KA 3LBMA 3W7GA 5G1TA 3CLMA 3EWXA 4M6QA 5TBOA 1SPQA 2PRLA 3GVGA 5HNRA 3PSVA 3KOFA 1L6WA 3B04A 3A22A 4NX0A 1FXQA 1HUVA 2QUTA 2ZRUA 4BWLC 4UFMA 4A22A 3MW7A 1ZAIA 5EPDA 3UWWA 1VHCA 3O05A 1DV7A 3CWNA 3KAOA 3TMLA 2FPYA 3GAYA 2Y62A 2YYTA 1XBZA 3GDLA 2CFFA 3UPBA 1X1ZA 5KINA 1M7OA 2YFNA 5KITA 1G4EA 2WKJA 2DP3A 3W1UA 3HIJA 4MYAA 1ZY9A 3VE7A 1LOLA 5D05A 2E5CA 1JCMP 1VCVA 2V2HA 5GVJA 4QNEA 1WOAA 3NVTA 3I6RA 3PB0A 3RLVA 4JX5A 2QF7A 5HUPA 1V7YA 3PULA 3G1FA 4UMAA 2ZA3A 3NEVA 1TPFA 2A6LA 2Z1BA 5D37A 3UPWA 4UTTA 2WJZA 6TIMA 3W1QA 4O14A 1H62A 1ZALA 3OVRA 3NQ7A 3ABSA 3TC6A 4FHAA 1VRDA 2PC4A 1JQVA 3SFKA 3B0PA 3P5YA 4R7JA 4UR8A 3NDOA 3BW2A 4Q32A 2QCCA 5I3FA 4LW7A 3M5YA 1QPOA 1SU5A 4DBDA 3LCGA 1FCVA 1TJRA 2HS8A 5F4SA 1HO1A 3NPUA 1O60A 4AAJA 3BGJA 1WXJA 2EPHA 1GTHA 1C8VA 1WYIA 2CZFA 3GX9A 3PC0A 1ZCOA 3DI1A 4JD4A 2TYSA 3P74A 3GDMA 3F4NA 4JIPA 2UV8G 3W7NA 4UFKA 1W1ZA 4AWUA 1G4SA 4U28A 4YCPA 3LDVA 5CG7A 1HO4A 4O52A 3G0SA 4N9CA 3ZR4A 2A1YA 3DGRA 7TIMA 3NNTA 3ZS4A 3OG3A 4MKNA 3W1NA 1L6SA 3THAA 5HR6A 3M43A 1G4TA 4CNNA 1T0OA 4EWND 3PB2A 3L9CA 3TCEA 4K8EA 2BLEA 3W2MA 1OK6A 1A5BA 3W2UA 3TAOA 4HSOA 3M5VA 1MSSA 5EYWA 2ZZ3A 4LV4A 4O15A 1FX6A 1X8FA 2NUXA 4WY0B 1Y0EA 3VE9A 3QH2A 2VC6A 3RF9A 4S2CA 2NX3A 3PUOA 4FNPA 1XDMA 2NWSA 3ZWTA 3KVLA 5E0KA 2ABBA 4FIQA 3GB6A 4LUJA 2R14A 4YWIA 3QYQA 3B8DA 1SW3A 1D3HA 3MYPA 4FNQA 5D2XA 3S42A 1M5WA 2CZDA 1QDSA 1WA3A 1VCGA 3C2OA 4NJGA 3IGSA 3KXQA 4O1AA 4POCA 1PS9A 2C16A 2FPTA 3NZ1A 2F7FA 1M7PA 1YYAA 1KV5A 3G3MA 2TRSA 4O11A 4NVTA 1EB3A 4MLRA 1DQXA 1FWWA 2ZCGA 4GE8A 1ALDA 1YADA 4JDBA 4ADUA 3LLFA 1SZFA 2NLIA 4MJZA 3T44A 3P7YA 4DPQA 2P10A 3FJ6A 3NOEA 4WD0A 1RD5A 3G1XA 3BLFA 5HQEA 2B7OA 1VQTA 3IIZA 3NZRA 4O0KA 1HFBA 5E93A 1TSIA 4WY0A 4OV4A 1JCYA 2OT1A 1TRDA 1F5ZA 1RQEA 2R94A 3PR2A 3O06A 4IXXA 1SUXA 3W86A 3TW6A 4UUIA 4IX2A 5I3JA 2J88A 1KV8A 3N14A 2WO5A 1MZHA 3C61A 4HN4A 3VKJA 1KM5A 4LS1A 1RZMA 3NQFA 3TSDA 1W5NA 4S2BA 1SZGA 3S1UA 4BI7A 4NT0A 5FF4A 1F74A 4WUIA 1TTJA 2C18A 5IM51 3DH7A 5H2ZA 3EB2A 2Y70A 4KWWA 1JRCA 4K39A 1I2RA 3P8IA 3QW4B 4BI6A 3USBA 3NPVA 3TX9A 1TPB1 3W7KA 1PCKA 1KW1A 5DCBA 2CW6A 2QJHA 5DCDA 3W7OA 4HPXA 2DORA 2V5BA 2ZZ5A 4IOTA 3UWYA 3P61A 5DY3A 3UNDA 4LUIA 4JTKA 1K02A 5EBUA 1PV8A 1KM3A 3TFCA 5U4NA 1QO5A 4O10A 2V8ZA 2W6RA 2LLEA 5HULA 3LX9A 4UTIA 2NV1A 4JIQA 3RMJA 1ME9A 3W7DA 5HWMA 1FCBA 4AWTA 1TJPA 1NVMA 5CKSA 1OFQA 1A5CA 4JDYA 5LKYA 1IGSA 4RZ5A 2ZTJA 2VELA 5DBTA 2ZRXA 2C13A 1XXXA 3TXZA 4OGZA 4CCDA 1JVNA 3JRKA 3UY7A 3O16A 3PVFA 1IXOA 4OQVA 3LOTA 5AB3A 2RDUA 4N9BA 5HJLA 1GG1A 2ZA1A 2VENA 4UC5A 1B4EA 2ZZ6A 4MYXA 5HWJA 4GNJA 2F84A 3K30A 1I4NA 4GXMA 3HPSA 2Z6JA 2QCEA 2E6FA 4U4MA 2X2GA 4FX6M 1QOQA 4D2JA 1CW2A 1LRNA 1XI3A 2QCFA 5HMSA 1K03A 4RX0A 3GKFA 3W23A 2RKXA 3CPRA 3ATYA 3MI2A 3W2LA 2C15A 4FXRA 4M6PA 4K37A 3SSJA 1YXYA 1SZNA 3PG8A 4EF8A 4N9EA 3BK0A 1LBMA 3MI3A 1MO0A 3W76A 3S8HA 3TQKA 4FNTA 3QW3A 1W5PA 3LI1A 2BXVA 4AEOA 4LOCA 1B3OA 3STGA 3B4UA 3NA8A 4P2VA 4TIMA 2VEPA 1QPRA 3W7LA 3EX2A 8TIMA 1NSJA 3IVUA 5D03A 2WSQA 4KFNA 3FYPA 3FKRA 4QIUA 1SSDA 1UB3A 1BWKA 2A4AA 1YXDA 3C6CA 4MVAA 4XZ9A 2FTPA 2YX0A 4Y96A 3W6YA 1DVJA 2PURA 4LV9A 3W73A 1QO2A 5CPMA 1AL8A 3STEA 1KFJA 3GNDA 2WOQA 2HS6A 4ONVA 3NQDA 3DBPA 2YYUA 3OHIA 4M5PA 3G1AA 5K9XA 3E02A 5FESA 1QWGA 1TV7A 5DXXA 1VCFA 3W7PA 3MHFA 1V5XA 2A7PA 2VEMA 3NG3A 1UUMA 2V82A 5AFDA 3OIXA 4FF7A 5D04C 3WFAA 2QCNA 2EGZA 1K7FA 1AK5A 2A0NA 4ZMGA 3NL2A 1ZAJA 2GJLA 1M6JA 4NJKA 4Z08A 3HOJA 4MFEA 5CPNA 1ONRA 3IVSA 3R8RA 4UNLA 1K8YA 3G8EA 2V9DA 3P80A 4M6VA 1TB3A 2RFGA 3BV4A 3L0GA 3CEUA 4OWGA 3GLCA 3TMQA 1KTNA 4ML9A 3JS3A 2Y7EA 3N34A 3CEPA 1GG0A 3P82A 4O57A 4GUIA 2ZRYA 5MHBA 3R12A 1AL7A 5FEZA 2WV8A 4XBKA 4GUGA 5CGQA 4HNUA 1KTCA 2B7PA 3MBFA 1R47A 1T99A 4HNNA 4RKAA 3CT7A 3UYCA 3W07A 3L68A 1W31A 2E6DA 1LYXA 2ZA2A 1F05A 1D9EA 1I2NA 1XC4A 4WOZA 3W84A 3O6YX 1K8XA 2JGQA 4JTTA 1HL2A 1Q3NA 4IWWA 5DLCA 2NZLA 4LWWA 4O54A 3IVTA 3W88A 3P62A 2C0AA 1KM1A 2P1FA 1GYNA 3GXTA 4IUOA 5LZLA 3O15A 3MJYA 1KFCA 4UTLA 4JYEA 3G1SA 4NJIA 3NQCA 1UCWA 1Z44A 5KZMA 3R5EA 3O6CA 2QKFA 2GVLA 5I3IA 4Y9AA 3RNDA 1H63A 2ZZ4A 1VJIA 4ZZ9A 1TMHA 3IV3A 1QAPA 3TC7A 1FWRA 2CLIA 1ADOA 3W7MA 4M19A 1JR1A 5I3HA 1T8XA 4BK9A 1DOSA 1WV2A 4MY8A 3TE9A 1J2WA 2VFEA 3MO7A 3T7VA 2E5BA 4JX6A 4PL2A 4ALDA 1TPH1 1EWDA 2ZYFA 1OFPA 5D2VA 3HO8A 4GRSA 1QR7A 4QJ1A 1XM3A 2EHHA 5CZTA 1AG1O 4JN6A 2GVJA 4FX8A 3JR2A 4DELA 4RLIA 1GYLA 1K3UA 2FLIA 3W2KA 3H53A 4EF9A 1SW0A 3EEGA 5A5WA 3HJZA 5K2ZA 3E9AA 1OF6A 2NX9A 2JKEA 3L5MA 4N4QA 3FLUA 4HNTA 1TYGA 4JNMA 5H91A 1NFBA 4N6FA 1TIMA 4UMCA 2CLMA 3PF3A 4MOZA 2IQTA 3W1LA 2VFHA 5I3KA 3GKAA 3VCRA 5DCEA 5F2IA 2H6RA 3SI9A 1H7XA 2X16A 2H3DA 1OYAA 4XBSA 2Q3RA 4LVBA 3LHZA 3C4UA 4XQ6A 4J9JA 3SW6A 1NF0A 3M9YA 4X9SA 4GUJA 4HPJA 5FEWA 4JTSA 1HG3A 4MZ8A 4UTJA 4QITA 4CQ8A 5AHNA 1PVNA 2YDAA 2DZWA 4JYDA 1XFBA 2ATMA 4DF1A 3CHVA 1OVDA 1TPVA 1RQBA 4UR7A 1LM1A 3TSMA 3B06A 5CZSA 3LV6A 1YDVA 4O0ZA 3LTSA 3NL6A 3TKFA 3M5XA 5I3GA 2Y63A 4OT7A 3L0NA 3RFAA 4K7VA 3NGJA 3W1TA 3NPWA 3AJXA 2E5DA 5DN1A 2NXIA 1B4KA 4C1KA 2GOUA 2JKPA 1YLVA 1AW5A 2EAWA 4Q33A 2FDSA 3NAVA 4QNWA 3GDTA 2HTMA 4C1LA 3EXSA 2PRHA 3E12A 5TIMA 3WJSA 4DEFA 1OJXA 1TPDA 3AO0A 1EUAA 3IEBA 1F6PA 4FB7A 3PY2A 3C2EA 3QM3A 3CQ0A 3W71A 1XCFA 1VS1A 4R53A 1TCDA 4Z1CA 5K9DA 4UTWC 2A5HA 1EX5A 2ZRVA 4UFJA 3GDKA 2H8XA 5CSSA 4IMEA 1NF7A 1XBVA 5K4XA 3TDFA 4L4MA 3NXFA 4TX9A 2QJIA 3FOKA 1MEHA 1TV8A 3BPWA 3LV5A 1OFBA 4A2SA 5LNRA 4MY1A 3W7HA 3KVKA 2CLEA 3TU9A 1C29A 2Q8LA 2YGYA 3IIVA 3S1XA 3M5ZA 3EKZA 4NXKA 3NO5A 1RR2A 4JGDA 4DXVA 4H4IA 2ISVA 3BLIA 1QFEA 1L6YA 4BWLA 3P5ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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