1VJZA

Crystal structure of endoglucanase (tm1752) from thermotoga maritima at 2.05 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
IPRWRGFNLLEAFSIKSTGNFKEEDFLWMAQWDFNFVRIPMCHLLWSDRGNPFIIREDFFEKIDRVIFWGEKYGIHICISLHRAPGYSVNKEVEEKTNLWKDETAQEAFIHHWSFIARRYKGISSTHLSFNLINEPPFPDPQIMSVEDHNSLIKRTITEIRKIDPERLIIIDGLGYGNIPVDDLTIENTVQSCRGYIPFSVTHYKAEWVDSKDFPVPEWPNGWHFGEYWNREKLLEHYLTWIKLRQKGIEVFCGEMGAYNKTPHDVVLKWLEDLLEIFKTLNIGFALWNFRGPFGILDSERKDVEYEEWYGHKLDRKMLELLRKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Endoglucanase
molecule keywords endoglucanase
publication title Crystal structure of Endoglucanase (TM1752) from Thermotoga maritima at 2.05 A resolution
rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 117
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1vjzA00
3WDIA 1LL7A 1VBUA 6CGTA 1DHKA 1H41A 3EBVA 1V6XA 2D0HA 1XRVA 4P8XA 3UEQA 1H11A 4JFVA 4R27A 1UKOA 4UNIA 3SCSA 3B9AA 3WMCA 5DEZA 2QPUA 1MWOA 2IXUA 1CXKA 1PEZA 5I3DA 3NDZA 2DSUA 4B3KA 1Q6GA 3VGBA 2W5FA 4Y7EA 3ALFA 1K6AA 5AC4A 1UKPA 2VQUA 4PCSA 1GOMA 4KMQA 4J3UA 3WDPP 3PTKA 1CNVA 3EMQA 3WUGA 3RDKA 4JHOA 2G3JA 1K9EA 1US3A 1NWUA 4HA3A 3PZNA 4DWSB 4J3TA 1W2VA 4H8VA 3L4UA 4PEEA 5DFAA 1MFVA 2WMGA 5JIPA 4MB3A 5GNXA 1E9LA 5D8ZA 1VAHA 4MB1A 1V6YA 4LYRA 1WB0A 3A4WA 1UZ4A 2PBOA 4P7LA 4OJYA 2HVMA 3SUVA 5E70A 1VJSA 2E9LA 1OGSA 9CGTA 2CYGA 1D2KA 1MW3A 1QPKA 2X09A 4WSJA 2OWXA 2XGBA 1JI2A 3HU7A 2WXDM 5I2UA 3CO4A 4AZ5A 1HJXA 2CNCA 2WCSA 1QW9A 2TAAA 8CGTA 2J7HA 3K8MA 2UY5A 2PB1A 3G6LA 3AXXA 4XZBA 5CPQA 2DH2A 4GIAA 1XHGA 1A3HA 3VIJA 3N12A 3W81A 3BH4A 3AROA 2QPSA 1WZKA 2J62A 4B9ZA 1XGZA 1C8XA 3J7HA 7CGTA 2VMFA 2D3NA 3ARWA 4MNLA 1QHOA 5IDIA 3ARYA 2A3EA 3UERA 5HBFA 1CGWA 2G3NA 2PWEA 1CXIA 2VZUA 4W5UA 1UR0A 3W0KA 2VOTA 4U2ZA 5BRPA 5E0FA 4F79A 1SYTA 1UWSA 4P8UA 1JXKA 4CCEA 2E8ZA 2PWGA 2CHOA 4GZIA 3PZUA 1BYDA 3CZ8A 3II1A 3WQ5A 4K68A 2UWFA 1JAEA 3NUKA 1UD3A 1B3ZA 3WBAA 1UG6A 2J4GA 1Q6CA 1HVXA 5E09A 2Y8KA 3A47A 5M3WA 4AMCA 2O9RA 2WC4A 3VGHA 4DWSA 2A3BA 2FGZA 3CLWA 2VTFA 2Z1SA 1J11A 2Q8XA 3GNPA 4Z2GA 1MXDA 1F4AA 4E8CA 2WZEA 1JZ6A 2OWCA 4GKLA 1MQPA 5CLTA 3WF2A 4YHEA 4AXNA 2VCBA 1ISZA 4P7QA 5A8PA 3NJ3A 1W9BM 4W84A 3U7VA 1ITXA 3N17A 3ZR5A 4TOQA 3AFBA 3OGVA 1MW1A 2PWFA 4YHGA 3VD3A 3WKZA 4HMEA 3ZJKA 4QCEA 3ZM8A 2QF8A 1V0KA 2DSVA 1GONA 3OG2A 2ZXDA 5D9NA 1CEOA 4BQ4A 1J0KA 2VZVA 5JUVA 3CUJA 2XPKA 3CUGA 4LGXA 4XUYA 3VD9A 2WBKA 2W62A 4M29A 4ZE5A 1ZBVA 1PAMA 3GH7A 4GPNA 4JFTA 3GXDA 1ISVA 1NWTA 1EHNA 1UKTA 4UFJA 3BAIA 4EKJA 1E5NA 4DM2A 1C8QA 1CGYA 1QI3A 4FLRA 3T2QA 3VIHA 1AQHA 2ZWYA 2OLHA 3TOPA 1DTUA 3OZPA 1JZ2A 3EDKA 4QCFA 1B3VA 5HNNA 1E3XA 1GNXA 1H1NA 3PZIA 2CCRA 5BRQA 2J78A 5A6BD 1IT0A 1UH2A 1MQQA 3DYOA 2DGAA 3AQUA 1E6XM 3ZSSA 2QLYA 3LPFA 1KGUA 4W8AA 1OT1A 1PIFA 2YDRA 1TA3B 2CEQA 1ZJAA 3AJ7A 1BFNA 1UR1A 3AMGA 5A6MA 3N1AA 4FLQA 3OB8A 5I23A 3W6LA 1KFWA 1H0GA 1W3HA 3MKKA 1KBBA 2G4FA 2A3AA 4CU6A 1E4LA 2VCAA 4HZ7A 3UESA 4H04A 4TVCA 3CH9A 2WK2A 2AAAA 1WDRA 5IFPA 2Z1KA 5HDRA 1BVNP 1V3IA 4E8DA 4GQQA 1LWJA 1GOQA 1UD6A 3WL0A 1GJUA 1SMDA 4PTVA 3UG3A 1U30A 4UZUA 3GXFA 1XCWA 1V0MA 4DM1A 2DSZA 3WIJA 3TTYA 2OWWA 1M01A 3D5HA 2E8YA 4IPLA 2BY2A 3EDFA 5A1AA 3VGDA 5M03A 2EO7A 4UQAA 4W88A 2BY3A 1EDGA 1QI4A 3WBEA 3VM7A 1WDPA 3AMLA 1HNYA 1D7FA 2GJXB 4NSBA 3RCNA 2YA0A 3GBEA 1HP5A 4NF7A 2QV4A 2F8QA 1C93A 2O9OA 2XIBA 3MMDA 1J0HA 3SCUA 1V02E 1WZAA 3T0DA 4ZEPA 1QOXA 2PWDA 1TVPA 3WMBA 5FCZA 2UY2A 5C70A 5LYRA 1UD4A 3PTMA 2CBUA 1VBRA 1VJZA 4L4PA 3CIVA 3FY1A 4BQ5A 1GOOA 1TA3A 4UFIA 1W1PA 1B1YA 1CGVA 1B3YA 5FOOA 3RJYA 4MB4A 5ABGA 1OWQA 2ZXAA 5A94A 4UQDA 1LG1A 5GQBA 5FL0A 3BSGA 4D1JA 4OIFA 1JL8A 4PSRA 4EK7A 2PBGA 3TTQA 2B31A 1CXLA 2WANA 3BCDA 2WM0A 3WH7A 3ZT5A 4WKAA 1J0YA 1KR0A 1SMAA 1J9YA 3LPPA 3VMPA 3KL0A 1KCLA 3VNZA 3WFZA 1MXGA 1CGTA 1BHGA 1LL4A 5GPRA 1WDSA 1C90A 2VCCA 1AMYA 3CMJA 3WDRA 1BQCA 1WZLA 3LPOA 1CXHA 3WQWA 1GQLA 4ATWA 5F7UA 5BWFA 4XB3A 5EFFA 1PX8A 1LL6A 1O7AA 1RP8A 4HU0A 2NT0A 1HKIA 4GQRA 2YIHA 2ZX7A 3WUEA 3WH8A 4W7WA 5A95A 5BXTA 3MANA 3WF4A 4HP5A 3CPUA 2W92A 2EXOA 4ZENA 4UQBA 1W9UA 2QMKA 1PZ2A 2GJXA 3THDA 2QMJA 1MQRA 1IZJA 3AMCA 4NI3A 1V6WA 4AD0A 3SEPA 2VR5A 4PMQA 2ZUUA 4WKHA 4UOZA 3WNNA 3N9KA 4V2XA 3WL1A 3QGVA 3GXMA 4J3XA 1CLVA 1RH9A 3CMGA 5I79A 3BXWA 4X9YA 1E6NA 3G6MA 1TG7A 2VQTA 4P7OA 1PX3A 3I3DA 4GXPA 1JG9A 3AIQA 1E6QM 4ML4A 3KL5A 2DT0A 2X2YA 2J8FA 2D22A 3OBAA 1DWGM 4S3KA 3MV01 4W8BA 2WLZA 2XUCA 2E3ZA 3WNPA 4DWSD 3ARUA 2BVTA 1EH9A 4UFKA 2EPMX 3CHEA 4KH2A 1NARA 8A3HA 3PTQA 3IJ7A 4GO8A 4OBRA 4GI8A 3BCFA 5A6AA 1W3JA 5IXEA 2OYKA 2ZX5A 1OGBA 4OOUA 4OBSA 4MADA 5A2CA 4IISA 1HVQA 1JDDA 3L2MA 1B0IA 1E43A 1E73M 4BS0A 3CZLA 1V3JA 2OSXA 1JF6A 2D2OA 2WSPA 3WFLA 1KWKA 3BC9A 2XFRA 3WN6A 3D3AA 2YBTA 3N04A 6A3HA 1MFUA 2O9TA 5JBFA 1LWHA 1VEPA 3L4XA 4LQ1A 3NCOA 2J79A 1V3LA 1DWFM 2Y4SA 3RPMA 2WHJA 3BMVA 1H5VA 5CSUA 2XVGA 4FLOA 3VD5A 2XVNA 4GZJA 1PX4A 2WMKA 5EBAA 1HL8A 3L4TA 2J7BA 3WMSA 1E1FA 4UR9A 4WSKA 1E15A 1C8YA 3HJEA 4F9JA 3UCQA 1NQ6A 4UOQA 2JIEA 4JFWA 1W3KA 1E4MM 1GQJA 1TUXA 2XVKA 3L4ZA 3W25A 3VD4A 3O6AA 2ZX9A 2VNCA 5A6LA 5JBDA 1IZKA 2C8NA 3F5KA 3ARZA 3OLGA 4D6FA 1G01A 5BXSA 2A3HA 1S46A 2X8RA 3A3HA 2WYSA 4TX6A 1XYZA 5ABFB 1HXJA 1JZ4A 3T2OA 4BF7A 2VX6A 3BAJA 2XWEA 3FXYA 3HMCA 4R5EA 1B2YA 1FP8A 2VRQA 1JZ8A 3SUUA 3ZR6A 5GNYA 3VPLA 2D24A 2ZE0A 4KGJA 1GORA 1CZ1A 4MJ4A 2BXYA 1ESWA 1OSEA 1B9ZA 1SFSA 4BQ3A 5M17A 3WH6A 1I1XA 2YL9A 5A6JA 3K4DA 3NSXA 1E40A 2D1ZA 3CZKA 3UG4A 2Y2WA 1Y7VA 2WVSA 3BAYA 5CPSA 2D23A 1NP0A 3L4WA 2BVDA 1UWIA 4M80A 5CQ1A 3B8SA 1HT6A 1V3KA 3W26A 1D3CA 3W53A 3BAKA 1ZS2A 2E40A 4S3JA 3PZVA 3AHVA 2PI6A 1E56A 1JDCA 2J7CA 3CZEA 4CCDA 5C8BB 1PBGA 2YDSA 1EHAA 1W9PA 5AY7A 4WF7A 2J7FA 1UOKA 2OYMA 1BGGA 2JFEX 3SUWA 5D9MA 4DUVA 3BLPX 3RO8A 1H09A 3MSGA 2X05A 5D8WA 2E9BA 1CENA 3WEMA 1BG9A 4M82A 4J3SA 3UETA 1LQ0A 2CITA 5FKYA 5A69A 4FK9A 3PZOA 1LJYA 4C7DA 3MMWA 4U33A 1OINA 1W9XA 4ZXLA 4AZ6A 1HX0A 1OGGA 3W37A 2VO5A 1EO5A 3WH9A 1R87A 3CUHA 2VR4A 1HJWA 4JKKA 3RM8A 3AYRA 2CKSA 2ZUVA 2C0HA 4U2YA 1RD6A 4LXFA 2G3IA 1EIBA 1CIUA 2WNWA 4H41A 2WHKA 4JCMA 4PMXA 3DC0A 1ODZA 2CXGA 2ZX8A 3T0BA 2DT2A 5ABFA 1WE5A 3ZJ6A 2G41A 2FH8A 2WSKA 5E6ZA 3WDHA 2YBUA 1JIBA 4PMNA 2WHLA 2YKKA 4M1RA 1VFUA 3VOCA 3AIBA 1HKKA 3ECQA 3BAWA 1XD0A 2ZXBA 2W4XA 2D0FA 1DP0A 1Q6EA 5AC5A 4AISA 3WD2A 4MAZA 3AZTA 1HJQA 1FP9A 4TXEA 3NIYA 4LX4A 3VD7A 3WENA 2YDQA 1JXJA 1E3ZA 5LA1A 4UQ9A 4X0NA 4JL1A 4JHZA 2JE8A 3K4AA 1GVYA 1FH7A 4E2OA 4CU8A 4PUDA 1KB3A 1E1EA 3PHAA 4RE4A 3AIUA 3IJ9A 4W7VA 2AMGA 1WO2A 2J47A 2ZUWA 3W6MA 4WK9A 3WQVA 2VX4A 1UQYA 1VEOA 2WVTA 3PZQA 1CECA 2GJRA 3AZSA 4Z2IA 1QI5A 4CN4A 6TAAA 1UR8A 1UD2A 3PZGA 4MPKA 2PC8A 4Z2KA 3SCTA 4D6CA 5CG0A 3VDBA 1WP6A 4M81A 4P8VA 2V3FA 2XM1A 3MUZ1 4QAWA 3ARVA 1CBGA 2DSKA 1QHZA 4CD8A 1E6ZA 2WAGA 1V02A 2F2HA 3W29A 3WF1A 1W91A 3AHXA 1HJUA 3AS1A 2ZUSA 3ZJ7A 3GNOA 1E71M 3GNRA 1GOKA 3RM9A 3BMWA 3OIHA 4HMCA 1FH8A 2CESA 3FW6A 3I3BA 3WNMA 1V6UA 1JZ5A 2CBJA 1DEDA 1MYRA 3RJXA 2ZUTA 2WWDA 2V3GA 2WCAA 5I6SA 2D3LA 4XZWA 1VEMA 3EMCA 4CU7A 3VUPA 3IAPA 3AIEA 4J7RA 1EDTA 2WKLA 1M04A 1B3XA 4PN2A 4AD4A 2EPKX 3VIIA 3CUIA 4J27A 5A8QA 4RE2A 3N15A 1E6SM 5DMYA 1R8LA 4U3AA 1J0ZA 1K9DA 4KRUA 1QBBA 3W27A 3L4YA 4AC1X 3OA5A 5DT5A 1OD8A 3I3EA 1MW0A 1C91A 2WC7A 2YA1A 3POHA 4U31A 1LLOA 1G9HA 4MDPA 1DWHM 1TMQA 1Q6DA 3U57A 1JZ7A 1PPIA 4LPCA 2W63A 3KWXA 4TVDA 4W8LA 1KXTA 1PIGA 4RL3A 2WWCA 4TTGA 3AICA 1UKQA 1F4HA 3AOFA 4PMOA 5D4YA 4H8UA 3GYCA 4PYSA 3MV11 1E5JA 3VILA 3CHFA 1C7SA 4HU8A 2XYLA 2J25A 3OLDA 3SCWA 1WPCA 3ARXA 4BA0A 4UQCA 4DUWA 2PF0A 1OCQA 2YA2A 2FH6A 3W4RA 1XH0A 3T2PA 1KBKA 3BSHA 1ZBKA 3HN3A 1KQZA 2J7DA 1BTCA 2RGLA 4HPGA 2VX5A 1I75A 3WSUA 1UUQA 3CHDA 2BV9A 2IUZA 3QOMA 4AZHA 2D20A 3ARSA 4BQ2A 2EBNA 4Z2HA 4W85A 2VZOA 2EEXA 1E4IA 3TTSA 1XYFA 2RGMA 3T08A 3WUBA 5IFTA 1JD7A 1QVBA 3WD0A 2WMIB 1XH1A 1MVYA 1ZJBA 4HA4A 2VL4A 3VNYA 2JIWA 4RE3A 1M03A 5I0DA 1A47A 1YHTA 1BYCA 4J28A 2VURA 1L8NA 2W61A 2YJQA 5A2AA 3VIGA 3VX0A 4P7RA 4OKDA 5A8OA 5HOSA 1FFRA 4HMDA 1OIMA 3RMEA 1GHSA 2CBIA 3GH4A 1J0JA 3M6DA 4AY1A 1C3FA 5KEZA 1XCXA 2YL5A 4C7FA 3AIRA 1TFVA 2W66A 4MB5A 2BXZA 4AIUA 1UA3A 4FLSA 3VDHA 3RILA 3ZOAA 2VI0A 4WLCA 3VIFA 2DT1A 2C7FA 1CWYA 2F61A 2CBVA 5FD0A 4XV0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WDI A;  1LL7 A;  1VBU A;  6CGT A;  1DHK A;  1H41 A;  3EBV A;  1V6X A;  2D0H A;  1XRV A;  4P8X A;  3UEQ A;  1H11 A;  4JFV A;  4R27 A;  1UKO A;  4UNI A;  3SCS A;  3B9A A;  3WMC A;  5DEZ A;  2QPU A;  1MWO A;  2IXU A;  1CXK A;  1PEZ A;  5I3D A;  3NDZ A;  2DSU A;  4B3K A;  1Q6G A;  3VGB A;  2W5F A;  4Y7E A;  3ALF A;  1K6A A;  5AC4 A;  1UKP A;  2VQU A;  4PCS A;  1GOM A;  4KMQ A;  4J3U A;  3WDP P;  3PTK A;  1CNV A;  3EMQ A;  3WUG A;  3RDK A;  4JHO A;  2G3J A;  1K9E A;  1US3 A;  1NWU A;  4HA3 A;  3PZN A;  4DWS B;  4J3T A;  1W2V A;  4H8V A;  3L4U A;  4PEE A;  5DFA A;  1MFV A;  2WMG A;  5JIP A;  4MB3 A;  5GNX A;  1E9L A;  5D8Z A;  1VAH A;  4MB1 A;  1V6Y A;  4LYR A;  1WB0 A;  3A4W A;  1UZ4 A;  2PBO A;  4P7L A;  4OJY A;  2HVM A;  3SUV A;  5E70 A;  1VJS A;  2E9L A;  1OGS A;  9CGT A;  2CYG A;  1D2K A;  1MW3 A;  1QPK A;  2X09 A;  4WSJ A;  2OWX A;  2XGB A;  1JI2 A;  3HU7 A;  2WXD M;  5I2U A;  3CO4 A;  4AZ5 A;  1HJX A;  2CNC A;  2WCS A;  1QW9 A;  2TAA A;  8CGT A;  2J7H A;  3K8M A;  2UY5 A;  2PB1 A;  3G6L A; 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 1MW1 A;  2PWF A;  4YHG A;  3VD3 A;  3WKZ A;  4HME A;  3ZJK A;  4QCE A;  3ZM8 A;  2QF8 A;  1V0K A;  2DSV A;  1GON A;  3OG2 A;  2ZXD A;  5D9N A;  1CEO A;  4BQ4 A;  1J0K A;  2VZV A;  5JUV A;  3CUJ A;  2XPK A;  3CUG A;  4LGX A;  4XUY A;  3VD9 A;  2WBK A;  2W62 A;  4M29 A;  4ZE5 A;  1ZBV A;  1PAM A;  3GH7 A;  4GPN A;  4JFT A;  3GXD A;  1ISV A;  1NWT A;  1EHN A;  1UKT A;  4UFJ A;  3BAI A;  4EKJ A;  1E5N A;  4DM2 A;  1C8Q A;  1CGY A;  1QI3 A;  4FLR A;  3T2Q A;  3VIH A;  1AQH A;  2ZWY A;  2OLH A;  3TOP A;  1DTU A;  3OZP A;  1JZ2 A;  3EDK A;  4QCF A;  1B3V A;  5HNN A;  1E3X A;  1GNX A;  1H1N A;  3PZI A;  2CCR A;  5BRQ A;  2J78 A;  5A6B D;  1IT0 A;  1UH2 A;  1MQQ A;  3DYO A;  2DGA A;  3AQU A;  1E6X M;  3ZSS A;  2QLY A;  3LPF A;  1KGU A;  4W8A A;  1OT1 A;  1PIF A;  2YDR A;  1TA3 B;  2CEQ A;  1ZJA A;  3AJ7 A;  1BFN A;  1UR1 A;  3AMG A;  5A6M A;  3N1A A;  4FLQ A;  3OB8 A;  5I23 A;  3W6L A;  1KFW A;  1H0G A;  1W3H A;  3MKK A;  1KBB A;  2G4F A;  2A3A A;  4CU6 A;  1E4L A;  2VCA A;  4HZ7 A;  3UES A;  4H04 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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