1DOSA

Structure of fructose-bisphosphate aldolase
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
358
structure length
343
Chain Sequence
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEGCTGGEEDGVDNSHMDASALYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVYKAGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAIDVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOLASE CLASS II
publication title Novel active site in Escherichia coli fructose 1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 131
structure length 343
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1996-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1dosA00
3W74A 4HNUA 1J4EA 2I1OA 5DBTA 1Q45A 3W70A 3TMLA 3P5YA 3W86A 3ABQA 4K6AA 4NVTA 5U4NA 5HJLA 3E49A 1LLWA 2OX1A 3ZS4A 4XWUA 1QO2A 1EWEA 4C1LA 2HS8A 4GC4A 4KKXA 2A1YA 1G7VA 3W7LA 3HGOA 3L0GA 1TQXA 1WBHA 3N9RA 4NUWA 7TIMA 4N9BA 2A2IA 3GXPA 5AN7A 1SW0A 5HWJA 2J9YA 3GIYA 5FEZA 2FPYA 4AHOA 1KTNA 2RDWA 4H3DA 2QF7A 3TQ0A 2X1TA 2OJPA 3LCWA 1QAPA 1RZMA 4LS1A 4ZQRA 2QDHA 2XN0A 3IVSA 2A6NA 2V81A 4NJJA 3M1ZA 1I45A 2DZUA 3SIZA 4JYEA 2ZRYA 1OK4A 2QCDA 3L21A 1K7FA 4JTIA 4N4PA 3TFCA 1XL9A 4XBKA 2NV2A 3UQNA 3STGA 1LM1A 3TFXA 3M43A 4HKPA 5KINA 1R2RA 2GQAA 3FJ6A 3FYOA 2C6QA 1NFBA 3MBDA 4X2RA 5K4ZA 4C1KA 1VPXA 1VYSX 1P1XA 3QMSA 3MI6A 4K38A 1YADA 5LNRA 4ZQOA 2QUVA 4Z08A 4X22A 4IMCA 1I2QA 5E93A 3PS7A 3OA3A 1RQEA 1J2WA 3C0JA 2XN2A 3G1VA 3GB6A 4R7JA 4JX6A 4UFIA 5FF3A 3M47A 1KTBA 3CEPA 3S9YA 1TPH1 3TK7A 1OVDA 1QCWA 1XBVA 3W7DA 1Q3NA 4XTIA 2YX0A 3DZ1A 4I9AA 3MMTA 1ZFJA 1ME8A 3G1AA 3WK0A 3KX6A 1JRBA 2VFIA 3M7WA 2QUUA 1LOLA 1O94A 1F2JA 3CHVA 3USBA 2QCFA 1OABA 5AC6A 3LI0A 2X2GA 3CWOX 4LU0A 3LCGA 1FQ0A 4IMGA 1M6JA 4KWWA 1GVSA 2Q3RA 3UNDA 4S2CA 5K9CA 1JUEA 1N7KA 1AL8A 3EWUA 3SSJA 4Z1BA 2DZVA 3N2MA 1B4EA 1EP2A 3TNOA 4H4IA 3R89A 3W1XA 1T8XA 2VC6A 3TSDA 2C19A 3W84A 2JGYA 4YWIA 2FFCA 1LBLA 4RLIA 1S5WA 3QEZA 1M5WA 3W1LA 4DO4A 5D02A 4S1FA 2GVJA 3HPZA 1ADOA 3FA5A 4O1CA 2W79A 1DQXA 1SSDA 3NNTA 4DXVA 3DFSA 2J6XA 5HWNA 1GQNA 1TPB1 3WJWA 2ISSA 1H1ZA 4MY8A 4XZ9A 3E12A 3PBVA 3NQFA 3A22A 2PRMA 3B0UX 1PV8A 2GJLA 1VYRA 5EYWA 1FCBA 1JUKA 4O19A 1R2TA 4AWUA 3HO8A 2NX9A 4PL1A 3VE9A 1KM2A 2WKJA 3G8EA 3PBYA 4MZ8A 3ZWTA 4NNBA 5FI8A 3VFLA 1JCNA 2O7QA 3LCHA 1GJPA 4IMEA 3LLDA 3PG8A 3DFNA 4NX5A 1EPXA 1M7PA 2ZA1A 3UWQA 4OE7A 5G1TA 4G1KA 3H55A 2NLIA 4MFEA 1SO3A 3GKFA 4HHPA 1QOPA 3FS2A 2IQTA 1DBTA 2ZZ5A 5DXYA 3QQ1A 1JVNA 3LCIA 2UV8G 4QAIA 4O1BA 4EF9A 1G7UA 3C8FA 1FDZA 3M5YA 3MYOA 4MPQA 2Y63A 1KM5A 1OX6A 3TQKA 3LLFA 3W83A 2FPTA 4WUIA 2C18A 2Y62A 3DHDA 4O1DA 1IF2A 3R13A 2YFOA 3SY5A 1W3TA 1BKSA 4ZL1A 1LDCA 3L67A 3AO0A 1LBMA 1B4KA 4UC5A 2GVLA 2YYUA 2FLIA 5L9FA 1SPQA 4P2VA 3RMJA 3TW7A 5LNWA 3BO9A 3ABOA 3EX2A 3OVQA 5DY2A 3DFTA 1H5YA 5DLCA 5AHMA 4RZ4A 3LX9A 3NQ2A 3GDRA 2ZZ6A 4L4LA 3R2GA 5A5WA 4RV8A 1IIHA 1YTEA 3VE7A 3Q94A 1JRCA 3A9IA 4O0ZA 1TPWA 3G1DA 3TH6A 3W1MA 2E09A 1B9BA 3FIGA 4CCCA 4KFPA 1LRNA 3G22A 3ELFA 1IXQA 3PR2A 2C15A 2QCCA 1RV8A 1GVQA 3TJXA 3Q58A 2ZA2A 2J88A 1H51A 3IGUA 2WV8A 5FEWA 5F4SA 2R14A 3MYPA 1DJQA 3UWVA 1GG1A 4HSNA 4HNNA 2XN1A 3NM1A 2ZYFA 3LCXA 1OG0A 1W3NA 2F7FA 2A7RA 1Z41A 3QF0A 1RR2A 1DJNA 1K8ZA 1P0NA 1FUYA 4JYDA 4LOCA 3UWUA 2FJKA 2PC4A 2ZRXA 2PCQA 3TC6A 1H61A 5I3IA 2P1FA 3MP3A 1T0OA 5D32A 3DGRA 2TMDA 3LB0A 1WXJA 3EX4A 1TV7A 4TO8A 3NQDA 1KM3A 1YXCA 3TC7A 4OV4A 3W85A 4XKYA 2D73A 2X1UA 1I2PA 4GRSA 3SGUA 1TPUA 4K8HA 2ATSA 3QMTA 2CWNA 4LVDA 3TE9A 2I14A 4W9TA 6TIMA 3I7RA 3P81A 1FX6A 2R94A 5D2XA 2YXGA 2VEPA 2E1DA 2FB2A 3HIJA 5F2IA 2FQIA 2BSLA 2JKPA 3NQ8A 4UTUA 3GAYA 3RLVA 3ZFHA 4DQWA 1HO4A 1QMLA 4ADUA 4WQ6A 3CEUA 4Z0JA 3B0PA 2A4AA 2RFGA 1K7EA 3BPWA 2X1RA 3N19B 4E2BA 3INPA 3QSTA 2E77A 1H7OA 4XKYB 4L4MA 5L6UA 3W1QA 1SFJA 2B7NA 1KM6A 2ISWA 1TO3A 3HGJA 2QKFA 3DXIA 1F05A 3FKRA 3UPBA 8TIMA 1OHLA 3TW6A 3G18A 1JCYA 1MXSA 3WJXA 2VELA 2W6RA 1WYIA 1OF6A 3NM3A 4NZJA 3TX9A 4Q33A 4YLWA 3KRSA 3M5ZA 1XXXA 3QPZA 1OF8A 4I7UA 4GJ1A 4JIPA 3NQCA 5DCBA 3QPYA 4IPIA 4O17A 5LHEA 1WQ5A 3TV8A 1KM0A 3EKLA 3HGSA 3WK2A 1DKWA 5G4EA 3UWWA 4IPJA 4QSHA 1KFLA 5EA9A 5AHFA 3NQ6A 1VQTA 3S1UA 2H8XA 1HUVA 3NQAA 4POCA 5CZSA 5H2ZA 2Q3OA 4JXCA 3W9ZA 4FX7A 3IIXA 3O16A 4P61A 5A8GA 5K3VA 2DJLA 2QR6A 5G2WA 4JDBA 3W7EA 3R12A 3W75A 4WX2A 2YFNA 2QJHA 1OFBA 4MVAA 4O16A 2HSAA 3L68A 3NOEA 3IVTA 1SFLA 4BI5A 3FKKA 1N8FA 1VYPX 1TTQA 1G67A 3IIOA 3CIXA 3JR2A 1UJPA 3PF3A 3C56A 4KFNA 2QCMA 4LY8A 2Y89A 2FIQA 1YDVA 4JR5A 1W5NA 3W87A 2QCHA 4LRTA 1NSJA 1GVOA 4UFKA 1TPEA 5EKYA 3W7PA 3GXTA 2OT0A 3NQVA 1MEIA 5G2IA 4A2SA 2WO5A 3SECA 2ZDRA 3NYZA 1N55A 3O06A 4JNMA 1WOAA 1AK5A 2DORA 2YPIA 1KM4A 3LHTA 2R91A 5F2GA 1WA3A 3OBKA 1PHWA 3JS3A 3S6DA 4ALDA 3TMQA 4OHQA 4UTHA 1VCVA 3L0KA 1XI3A 2JKAA 3B05A 4AHPA 1W54A 3H54A 2RKXA 5HR7A 2DU2A 3NPWA 4UFHA 5KITA 5AHIA 4LC6A 4RJEA 1OX5A 1SZFA 3QW3A 5J5DA 5TIMA 3PBUA 4ZQCA 2A5HA 2A85A 5LNSA 4BFAA 3C2EA 1IXOA 2RDTA 1ICPA 3ABRA 3S8HA 2CLHA 5CG7A 3T40A 3KVMA 1UCWA 5F1UA 1QOQA 3NDOA 4ZZ9A 3P67A 3LHWA 2NZLA 3GZ3A 1GOXA 1VC4A 1YPIA 4FF7A 2VFEA 1XBYA 3I7SA 3UWYA 4EVZA 2VOMA 1KFEA 3KOFA 1ML1A 3W7IA 1KFKA 4O52A 3THQA 2CU0A 1PVNA 4CCEA 1SW7A 3A21A 5D03A 3LI1A 4UXDA 3MW7A 1YXDA 2DZTA 5CPNA 3PULA 1QO5A 2ZZ4A 3G1HA 2Z2UA 4E0CA 3KRZA 3C61A 5AHNA 3CC1A 2TSYA 4K7VA 3S5ZA 3OHIA 3PY2A 4M7TA 1KFCA 1RD5A 1LYXA 3KAOA 5LHFA 2ISVA 1XBXA 1W5QA 3IVUA 1IIGA 4PL2A 1G4TA 5CPMA 4XUGA 1XFBA 3BGGA 1ZHAA 1TCDA 3MHGA 1QPOA 1EIXA 3NPUA 2G5WA 2WOQA 4O14A 1OFOA 1LORA 1QDSA 2NWSA 5C54A 5BNKA 3RF9A 1VH7A 3EXRA 1BEUA 2YGYA 3LV6A 3W7JA 3QH2A 1TPDA 2BTMA 3W7RA 3W72A 3L9CA 1ICSA 3SJ3A 2CLMA 4NJIA 4X3ZA 3NGJA 3NVTA 4BI6A 4E2DA 2NX3A 1XM3A 3MHUA 4IQLA 4JTGA 1XUZA 1TJRA 3B8DA 4I7WA 3P61A 4O54A 3TCEA 4Y6GA 4CQAA 2JKEA 4MYXA 1NF7A 5CKSA 1PHQA 1OYBA 5BMWA 4JS3A 4FB7A 3NL2A 3NO5A 1YLVA 3R5EA 2ZTKA 4NZFA 4BR1A 1A5SA 4JN6A 3DKLA 3DBPA 4U28A 5DELA 5MHBA 2BX7A 1DORA 1UB3A 4WY0B 2YW3A 2NXIA 2TYSA 1R46A 1A5AA 1BTMA 3S5OA 3HF3A 5T26A 3TSBA 4LW7A 5D2VA 1SSGA 2YW4A 3C52A 5EL1A 1KW1A 2P0OA 4JX4A 2J24A 5H91A 4AHQA 1UUMA 5D33A 4ZQNA 1V7YA 4BWLA 3W88A 1TV5A 3L66A 1DQWA 1PL9A 3G3MA 5LGXA 1OK6A 2V2CA 2PRLA 3F03K 3HPXA 3O07A 5LKYA 4S2BA 3NQ7A 3HJZA 4RKAA 2PE4A 4QJ1A 4JGDA 5LGZA 3G1YA 2DP3A 3HPSA 4QITA 1XBZA 1WAUA 1FWNA 5D37A 1ICQA 4QNWA 1W3IA 1QWGA 3DENA 5CPOA 1OFPA 2ZRVA 3IIPA 5CSSA 1D3HA 3M5VA 1SO4A 5AB3A 1ZENA 4GNJA 4OU1A 1H7XA 2ZZ7A 2O7SA 4LVFA 1ZAHA 3T44A 4BF9A 1C9DA 1FBAA 4MOZA 3HGRA 5C5YA 1VHNA 1AMKA 5G4WA 3A24A 1GYLA 3NXFA 1X1ZA 1SZGA 1K8YA 4BI7A 2GQ9A 3BW4A 3P80A 3NPVA 3STEA 2JBMA 2Y7EA 3P84A 1SQ7A 1BWKA 2Z0IA 3KRUA 3NA8A 2JK2A 3W3OA 1OFDA 4O10A 1WOBA 1YDNA 3OVPA 3PAJA 4K37A 2FDSA 3NZRA 4LWWA 1HL2A 4RCXA 2E6DA 2YSWA 4UFJA 1H62A 2OZ0A 3PM6A 4JDYA 4OT7A 6ALDA 4DO6A 1GYNA 3LHYA 3GDTA 5F1VA 3KHJA 3TR2A 3C3NA 1JCJA 1KFJA 1P0KA 5KZEA 1T99A 3LDVA 3LRMA 1SU5A 2OCZA 5E0KA 1D9EA 3G3DA 1XDMA 1DOSA 3BG3A 5CGQA 3RLUA 4M5PA 5F2MA 3GR7A 3V1PA 1XC4A 1Y0EA 4MFDA 4UTTA 2GVGA 3O63A 4Z1CA 2BZNA 4O12A 1IXPA 4NNCA 4DO5A 1FXPA 4UTJA 4NXKA 3PUOA 4GXMA 4TMBA 3W07A 2ZA3A 3BLEA 1CX9A 3B04A 5IBXA 1LP6A 3LTYA 1TRDA 4MJMA 4OQVA 3W7MA 1W37A 2Y70A 3ABSA 1OFEA 4O11A 3W1NA 4A2RA 1VHCA 2PURA 4O28A 1VZWA 2H6RA 5AOUA 3W23A 1LTDA 1A50A 4NT0A 5AC8A 1AW2A 4N6FA 3GDMA 2QAFA 2PRHA 2CLIA 4ML9A 1EP3A 4Y9AA 3NQMA 1L6YA 2Y85A 3CM4A 1MSSA 3S1VA 4M6QA 5AC7A 1EP1A 1VJIA 2CZFA 3VKJA 2NUXA 2QJGA 3GX9A 1LRQA 4LT9A 2Z6JA 3I6RA 3NZ1A 3BLIA 2ZZ2A 4Y96A 3KVKA 2CLOA 3P60A 1TJPA 3A23A 4IUOA 4R34A 4RXFA 1YTDA 1EUAA 3PSWA 3TSMA 5FF0A 3BW2A 2C13A 1GEQA 1FY6A 2Y88A 4R53A 1OX4B 5FESA 3LV5A 2J9ZA 3W7QA 3PWAA 4LTSA 2V30A 4UTKA 1KA9F 1FWSA 3F4WA 3S5NA 5IM51 3CTLA 4B5NA 1H63A 2KZHA 5BRBA 2Z1BA 1PCWA 1I2RA 4LVGA 1THFD 2EF9A 3VNDA 1HO1A 3BG5A 5FEXA 4JTJA 2DZXA 3QM3A 4AWTA 2X16A 4ICNA 4UR7A 4TR9A 1QNVA 5HINA 1LZOA 2FTPA 2H90A 4O50A 3C2VA 3NR0A 4HPXA 4UTIA 4AH7A 3YPIA 1ZY9A 3ZR4A 3MI2A 2G97A 3TDFA 4ONVA 3UZ5A 4AEOA 1TSIA 1H7WA 3U2OA 5ABTA 3W1UA 3DU0A 3T55A 3UXDA 1ALDA 4JTTA 4IWWA 1O5XA 2RH9A 4PTNA 3W73A 3EWZA 4JTHA 4IX2A 4KWVA 2B0MA 3EXSA 4FXRA 3QMRA 5F4XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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