1OK6 | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	254
structure length	254
Chain Sequence	ANLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVYGGK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
publication title	Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins. pubmed doi rcsb
source organism	Thermoproteus tenax
total genus	88
structure length	254
sequence length	254
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2003-07-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01791	DeoC	DeoC/LacD family aldolase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ok6A00

5DBUA 3EB2A 5J5RA 4KWVA 2Y6ZA 3O6YX 1H7NA 3NQVA 5D2WA 1W3TA 1KFJA 3STCA 3WJWA 2YZRA 4H6KA 2XN2A 1FX6A 5D02A 2Z1BA 3USBA 5LGZA 1JRCA 2C3ZA 3F4NA 3NXFA 3O06A 3HIJA 1SZNA 5AYYA 1PS9A 4CNNA 1GVSA 1UASA 2PE4A 3THAA 1W5OA 4TMBA 2P0OA 1EUAA 5EYWA 3TSDA 1M7PA 3B0PA 3UNDA 2Y62A 1PHWA 3W70A 4WJEA 4CQ9A 3HPZA 1YTDA 2C1HA 3HOJA 4N9BA 4MLRA 3EWXA 3IVTA 2QCFA 3L67A 3CT7A 3LCLA 2UV8G 1TO3A 3SIZA 1UBSA 4AWUA 1J4EA 4ZQOA 2Y70A 4WOZA 4LVFA 4XTDA 1S3HA 3W2UA 4NZJA 3PS7A 4OWGA 1VC4A 1B4KA 4UTUA 4ZZ9A 1TTJA 4WD0A 3U2OA 3W7NA 3KVJA 1NEYA 4UXDA 2ZYFA 3INPA 4AF0B 4K8EA 2QCDB 5F4WA 2WJZA 3NQ7A 3PR2A 4XKYB 3HG4A 3UWUA 3P67A 1QOPA 1ZALA 3W1AA 2WQPA 4JYDA 1ALDA 4S2CA 2CLKA 4H4IA 4Z1AA 3HMJG 5K4ZA 4GE8A 3BV4A 2VFDA 1H50A 3Q37A 4MOZA 3EWYA 4N4QA 4OE7A 5H2ZA 5KZEA 5G2IA 3BGGA 5KZDA 5HQEA 5AHFA 4AVFA 4M7SA 3S5NA 3L5LA 3BPWA 3UPBA 1X7FA 1SW7A 3NL3A 4P2VA 3N19B 5MHBA 4JY8A 3EWBX 3FA5A 2ZRYA 2X1UA 3PBWA 4ZVJA 4UNLA 3TR2A 3W2MA 2O7SA 1TPVA 1X1ZA 3QH2A 3RMJA 1WA3A 3Q94A 1ZAHA 3P84A 3PWAA 4JNMA 1FDYA 2W6RA 3PVFA 3OIXA 2FDSA 3FKRA 5G4EA 3NPVA 3TV8A 2HSAA 3ATYA 3MI2A 4MVAA 1L9WA 1MEIA 1W5NA 2ZQ0A 2JK2A 3M47A 4IJBA 2CZDA 1G4PA 1UB3A 3E96A 2J9YA 3HGRA 4QM1A 3UZ5A 2QAPA 1S5WA 2J24A 3C8FA 3G1FA 3KOFA 3PY2A 2A85A 4R33A 2A0NA 2QCLA 3A22A 3NGJA 3VNDA 4NJKA 5I3IA 1SO6A 2A6LA 3FOKA 3S5YA 3W2KA 1YDNA 3WJSA 1H1ZA 4XBSA 4RV8A 1ONRA 4LRSA 3S1XA 3TW7A 2NXHA 2B0MA 2ZTJA 4FNTA 1W3IA 4LV4A 4E2DA 2E68A 3SW6A 2H90A 6TIMA 1V7YA 5I3JA 1K03A 3LDVA 3NQEA 3QW4B 1X8FA 3W74A 3LV5A 2E6YA 2Q3RA 1QPQA 3D0CA 1F6KA 3GXNA 3KRSA 5CZ0A 5G1TA 2A6NA 3W7KA 3R12A 3P60A 4IOTA 5AYZA 4ZQRA 5KZMA 3OVPA 3JR2A 4CQAA 4HNUA 1YXCA 1XXXA 3LGEA 4LW7A 5D2XA 4LC8A 4MY8A 1Z48A 1YXYA 3G1VA 5K2ZA 4FNUA 4MUZA 1R2TA 2B7PA 3TAOA 2FFCA 1N7KA 2RDTA 3A5VA 4MYAA 4KKXA 1LORA 3MI3A 2WNZA 4Z1CA 1MEHA 1XBZA 4A2RA 4IMCA 1B9BA 4WUIA 4ONVA 4N2YA 5CG7A 4GUJA 3HGJA 2QJGA 1JUEA 3EKLA 1L6SA 2A2IA 2DZVA 3CWNA 2C15A 3G1YA 4U4MA 4UMCA 3VE7A 1RD5A 2VEKA 3CQ0A 3I7QA 4O12A 4Q33A 2DZTA 2J88A 4NZFA 3R89A 3CEUA 3EX6A 3M5VA 2TMDA 4XWUA 1FXQA 4ZQMA 2XN0A 3CHVA 5K4XA 2QCHA 1PVNA 3TU9A 3EWWA 2V8ZA 3VFLA 4QQ3A 5FESA 3W86A 4AWSA 1DKWA 1KFBA 5D38A 4OQVA 2E09A 3GDLA 2VELA 2DZWA 4HNTA 5EL1A 1VH7A 1N55A 4U28A 4PFMA 4TMCA 3NPUA 4YXGA 4QAIA 5BRBA 3KVKA 3B8DA 4BWLC 5E0KA 1PCKA 4A2SA 5AHEA 3NQCA 1TQXA 4PL1A 1XUZA 3V75A 2HS6A 2CZ5A 2NUXA 2ABAA 4Y8FA 2C19A 1VCFA 3LRKA 4RZ4A 3P62A 4IPIA 5TQLA 2Z2UA 2H3BA 5FEWA 2X1TA 4JTLA 4UMAA 2QCMA 1JCMP 1ZHAA 4O52A 1QO5A 1O95A 3ABQA 4NNCA 1ZJIA 4GUHA 2NWRA 3TNOA 1LP6A 3E0IA 3HG3A 2VFGA 1XBVA 2DORA 2ZZ1A 4GBUA 1BTMA 3BG5A 4GRSA 3IV3A 2A21A 3VI2A 1KM5A 1LOSA 1LBFA 3IIVA 5AOUA 3TXVA 3W23A 3W2NA 1UUMA 4K39A 2BSLA 4ML9A 3C2EA 2H6RA 4X9SA 1VLIA 1KW1A 3L65A 2F7FA 2BWGA 5F4SA 1G7UA 1H63A 4AHOA 3IGUA 1W37A 1ZENA 2B7QA 5DELA 2OCZA 4M5PA 3I65A 2YGYA 4BI7A 1WOBA 3LCFA 3DU0A 3O6DA 1QMLA 1FXPA 3TC6A 3W76A 4ADUA 5LNSA 1K8ZA 2HMCA 1EA0A 2TYSA 2B7OA 4UTIA 3BK0A 2GVGA 3GX9A 4BI5A 4QISA 1KTNA 3TC7A 3EXSA 2QJIA 5J5DA 4JDYA 2GJNA 2NV2A 3TFCA 5AHLA 3BLEA 3L0NA 3PBUA 1GJPA 1ICQA 3M43A 3W73A 3DFNA 3G1AA 1O5KA 4UTTA 2HTMA 1T96A 3N14A 3L5MA 1PE1A 4NJIA 3W7DA 3HGSA 4LTSA 3M0ZA 1THFD 1YPIA 3IEBA 5F2MA 4AF0A 5HULA 4HSOA 1A5SA 2QCDA 2ZA3A 3R2GA 3L21A 2GQAA 3DFQA 2ZBTA 4XKYA 2PC4A 1OFBA 1SQ7A 5A5WA 3FLUA 3UWQA 1JCLA 4FX7A 1DJQA 2YX0A 4MIMA 2CZEA 3LX9A 5K9DA 1VR6A 3G24A 3GDMA 1H1YA 4WZHA 3W1PA 3W2JA 3KAOA 3IIPA 3IVSA 4GJ1A 4HN4A 1OJXA 1EB3A 1I45A 1WBJA 5IM51 4PC8A 3NZRA 1FDZA 2V0TA 3DZ1A 4K8HA 1GWJA 1LDCA 3MWAA 5AC8A 1KLZA 2NV1A 4LV9A 4JTIA 4ADTA 3RLVA 4LVGA 1OFRA 5HWNA 4CNOA 4HIBA 4YMZA 1SFLA 3GK0A 2JKAA 4M19A 1QPNA 3CTLA 5G4WA 3OVQA 2PURA 4N9EA 1H62A 5D09A 3PUEA 3UQNA 1G7VA 1LOQA 3BG3A 3MMTA 2ZZ5A 2WOQA 5FF2A 4JTUA 3M44A 1VYSX 5LNVA 1G67A 3I68A 3LTPA 4UFMA 4OGZA 2FB2A 3NQDA 3W7PA 3L0KA 3EXRA 3LBMA 5KSWA 3GB6A 4RK8A 3HGOA 4LY8A 3NA8A 2EHHA 1U83A 3S1VA 1BWLA 1XCFA 4IMDA 1VRDA 5C54A 3GLCA 3NZ1A 4L4MA 1RPXA 3QPYA 5DLCA 4WY0B 1C29A 3TQVA 1N8FA 4JDBA 3G1HA 5BMWA 1I2PA 1HO4A 3QZEA 4IWWA 2Y7FA 2RFGA 3P7YA 3WK3A 1IF2A 5DCBA 3W7OA 1XDLA 1R30A 5AYXA 3PUDA 4ZL1A 3MUXA 5FF4A 2ZRZA 2PRLA 3F1QA 3KVMA 4FIRA 3W75A 3HB9A 2EKCA 1TPUA 1H51A 3TKFA 4K36A 4AAJA 4IMGA 4O57A 5AHMA 4UNKA 3FYOA 3S1UA 1XM3A 1K02A 3K30A 3O05A 4DEFA 1KM4A 4UFIA 5CGQA 3G22A 4UFJA 4Z1BA 1KBJA 2FJKA 3P8JA 3M1ZA 4O28A 3MHFA 3SI9A 2YFOA 3GXTA 2BX7A 4MZYA 1KFEA 4I7WA 2FQIA 5LSMA 4FXSA 1O60A 3F03K 3EX3A 2VEPA 3EWZA 4ORIA 3N2MA 3MYPA 4QIUA 3PSVA 1VPXA 3MW7A 1WQ5A 1R46A 1WBHA 5D32A 2C18A 2CWNA 3QFEA 3YPIA 3W1XA 3CIXA 1P4CA 1TB3A 3QF0A 4GUIA 1FCBA 3UWZA 1R2SA 4HSNA 3NQ6A 1L6YA 2PRMA 3TJXA 3TQKA 1WYIA 4Z08A 4G1KA 3PF3A 3PSWA 4EVZA 3RU6A 1YTEA 2DU2A 3GIYA 3EWUA 5LNUA 2Y85A 3S8HA 3GDKA 1DOSA 1FY6A 4JIQA 3W88A 1C8VA 1H7PA 1P5BA 4LU0A 1EX5A 4FF7A 3LOTA 2OZ0A 4KFNA 1UJPA 1I2NA 4K6AA 3LRLA 4DBDA 1ICPA 1GYLA 1H7OA 3FEMA 3IGSA 5EY5A 1XL9A 5AB3A 2YSWA 3B05A 4TO8A 2CLIA 1W1ZA 3ELFA 3MJYA 3WK1A 2QF7A 4NVTA 2ZRWA 4XTIA 3BG9A 3S6DA 3KRZA 2TRSA 3NQGA 5BMXA 1F6PA 3GVGA 3GR8A 5IBXA 2JGQA 3PB2A 4JTTA 5F1VA 2C0AA 4Q32A 1LLZA 4DF0A 4FHAA 2VOMA 1T99A 4FX6M 1TPEA 1VYPX 1AMKA 3CEPA 2E6AA 3TA6A 5F1UA 4IXXA 1LM1A 4LT9A 1EWDA 4FEZA 4A21A 4UTHA 1XFBA 3UWYA 1ICSA 2QUUA 3UPWA 1OHLA 4N9DA 2FLIA 5G5IA 2FB3A 4N02A 3SGZA 1TJRA 1AW5A 3STGA 1GVRA 1OX5A 4O1BA 4TIMA 1EP2A 3TMQA 3NQ8A 3P5ZA 3W85A 2E6FA 4Z0SA 1IIGA 5EA9A 1SUXA 2O7QA 3W1NA 3G3MA 3AO0A 1I2RA 3DKLA 5FEZA 4FIQA 1KBIA 3W83A 4HKPA 4TX9A 3LHYA 3PM6A 4KFOA 1NAL1 3N9RA 1TYGA 3S42A 4YWIA 3NR0A 1TREA 4K7VA 3LRMA 1DQWA 3T44A 2ZZ2A 4JR5A 4OV4A 5A8GA 3O07A 4QJ1A 3MP4A 2ZZ3A 4WX2A 2RKXA 4O4VA 1MZHA 5TIMA 4E38A 3CWOX 3O6CA 1BKSA 1IXOA 5AHNA 2E1DA 3W6YA 3GDTA 4GWEA 2RH9A 4FNQA 5HUOA 1GVOA 3TH6A 1G4EA 4QSHA 3TJLA 3EX1A 2ISVA 1MEWA 3M5ZA 4X3ZA 5C5YA 1YDVA 1HUVA 3NQFA 3W7EA 4ZQPA 5HJLA 4IGHA 1IXPA 2XFWA 4MZ1A 4CLMA 1O5XA 3W7QA 4S2BA 2DJXA 2FPTA 2QKFA 3JRKA 2E5BA 2VEMA 1H7XA 1XBYA 3S5OA 2Y7GA 2YW4A 2YFNA 3ZWSA 4HPXA 4GUGA 4A22A 2G97A 3IIOA 3P81A 2ISSA 3ANYA 4JX5A 1P0KA 1I2QA 4UFLA 4N6EA 3BARA 3MBDA 5H91A 4LRTA 5F2IA 2GUUA 7TIMA 4IMFA 1A50A 1OG0A 3FYPA 4Q4KA 3TUUA 2NUYA 2JBMA 4QNEA 5D37A 1F73A 3DENA 3ZR4A 3IRDA 3R5EA 3MHUA 1RQHA 2B7NA 2ZTKA 3L68A 3LB0A 3R8RA 2A7NA 5DCDA 3NL2A 2NX3A 3MP5A 1IGSA 1VQTA 3PULA 5U4NA 2JKPA 1FQ0A 3OBKA 4HT3A 1OABA 5D30A 2R91A 2QCGA 4O0KA 3SGUA 2IQTA 3QMRA 4AB4A 4NNBA 5I3GA 4DELA 2Y63A 4O13A 1JJKA 3UZJA 4WY0A 2WKJA 3Q58A 4FO4A 4TU1A 3QQ1A 4O11A 4AWTA 2CU0A 1B57A 1JR1A 3QEZA 1LRNA 3TIMA 4PL2A 1F05A 4JX6A 4B5NA 1IXNA 5LHFA 1OF8A 1VHCA 3BW3A 1XUUA 1RZMA 3O15A 1VGAA 1Q6QA 1RQEA 4UTMA 3WJYA 5D05A 2GQ9A 1PHQA 2GVJA 3HPXA 4RJEA 2AAMA 2QUTA 2VENA 3GR7A 3GXPA 4EWND 3B0VC 1I8JA 1D9EA 4O1CA 2WV8A 3CLMA 1WAUA 4RKAA 4LUJA 2V5BA 4QITA 4DO4A 4HPJA 1J5TA 1GOXA 3T7VA 1T8XA 3N9SA 3GKFA 3F4WA 2YDAA 1TPB1 4OHQA 1KFCA 1Z42A 3W7JA 3QSTA 3LLFA 1TPFA 4E0CA 3HBLA 4JIPA 1TJPA 1SO4A 1VS1A 3QW3A 1UUOA 5HNRA 3HG5A 1IXQA 2A7RA 1SU5A 1H61A 2DP3A 1HFBA 3TSBA 4M6PA 5EKYA 4S1FA 5K9CA 4MLJA 3FS2A 2E5CA 3PBYA 1OX4B 4WQ6A 1FCVA 3GAKA 3TXZA 3LTSA 5BW6A 3NYZA 1AL7A 3GNNA 1QNVA 3L5AA 5G2HA 1GEQA 2J6XA 1W0MA 2YCEA 1OFEA 3MP3A 1H7RA 3M5XA 5CPNA 3LHZA 5DY3A 1J2WA 5L6UA 3DFOA 5AN7A 4C1LA 1QCWA 4GC4A 3I6RA 5CPOA 2DZXA 1OVDA 1Q3NA 1F2JA 4NUWA 4M6QA 4O18A 4JTSA 4K38A 1KM6A 2ALDA 4JEQA 1CW2A 4Y9AA 1S5VA 4O8RA 4ORMA 4Y90A 4UTWA 1D3GA 3UYCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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