2CEQA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with glucoimidazole
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 203
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ceqA00
2A3EA 1HJWA 3GXMA 4V28A 1Z32X 3QHOA 1XSIA 1LL6A 1GW1A 5D9PA 3WNPA 2JF7A 2WXDM 4A3HA 3WSUA 2YDRA 3PTQA 4MTVA 4WKAA 3G6MA 4HMDA 1B3WA 2DSUA 2QHAA 2QLYA 4GPNA 1L8NA 1D7FA 5D4YA 4ATLA 2D24A 3SCVA 2J74A 3FW6A 4UQ9A 1E55A 2OYLA 4HZ6A 1VB9A 3KWXA 4MB1A 3QR3A 7A3HA 2WC7A 5A8QA 2O9TA 3N11A 4W7VA 4D6CA 4OBRA 1QI3A 1ESWA 2NT0A 3AS3A 1CXFA 3AHZA 3WH6A 1UH2A 1H4PA 3BLKA 3O6AA 2Y5EA 4J3SA 4AD2A 3B9DA 3PZIA 1US3A 2Y2WA 2W4XA 1UYQA 5I2UA 3M46A 3VD7A 4M8UA 5E70A 4UTFA 5ABHA 3AHXA 2QF8A 4GI8A 1KR1A 4ATWA 5CSYA 1GOKA 2W63A 4Q7NA 5JIWA 3WD0A 3AIUA 2ZWZA 4P8VA 5FIPA 5FOOA 1NOWA 2J4GA 1KXTA 2ZX7A 1QHPA 4OBSA 2WK2A 2Y8VA 4KGJA 4AIUA 4J3VA 1UOKA 3RDKA 1E4LA 1AQHA 2DT1A 2YA1A 1E3ZA 1XCWA 3CO4A 1CGVA 1VBRA 3PZOA 4H8HA 3GTNA 1W9DM 3U5UA 4IPNB 2BVDA 2V38A 2BNJA 1E5NA 4KH2A 4LYPA 3EBVA 1QI4A 3FXYA 1VEMA 4AIEA 3K8KA 3CZKA 3TP4A 1FHLA 3ZIZA 1GOOA 3POHA 2G3JA 2DH3A 1UKOA 2J7BA 3KE0A 3FN9A 1QI2A 1E6PA 4Z2KA 4J27A 3VGEA 2YL5A 2GJXB 1ISVA 2BXYA 1HP4A 2GVYA 4B9ZA 4J28A 3ZJKA 2VVSA 4C7DA 1UZ1A 1XC6A 4PRWA 4UQCA 3CH9A 4TOQA 3ZMRA 1BGAA 4UFLA 2FDMA 3AYSA 1K9TA 2ZUUA 3OB8A 2GJXA 5JBEA 5DEZA 2OSXA 5CSUA 2CHNA 1XD1A 4JAWA 4MAZA 4OOZA 3APGA 2EPNA 1CGYA 2D2OA 4UQAA 4DM2A 2VX5A 1J0JA 2WM0A 3VGBA 2VI0A 1JAEA 2VURA 1GVYA 1HJUA 2J7GA 2EPMX 3LPPA 4U33A 2W5FA 2VO5A 4HU8A 4D6FA 1BYAA 3VUPA 2WCAA 2WHKA 1DP0A 2VZOA 3BMVA 2J8FA 3RILA 2YIHA 3CUIA 3BGAA 3WFZA 5DF0A 3K4DA 2XM2A 3CZEA 1PZ3A 1EOKA 1KBKA 2EXOA 1V3LA 2CKRA 3WN6A 3FHQA 3ARTA 3MSGA 1BAGA 1HKIA 3AIBA 2EQDA 4HPHA 1JNDA 1HX0A 2E3ZA 1QNPA 4TXEA 2XWDA 4CVUA 3K8LA 3WD3A 4J7RA 1JDCA 5JIPA 2DSKA 1V0KA 3CUGA 1RD6A 3THDA 1PZ2A 1W9XA 4MNKA 3WUEA 3ZR6A 3ZJ8A 2J7DA 1XSJA 4PTMA 3CZGA 1KXQA 4PTXA 3BAIA 1V3JA 1TCMA 1ZJBA 2DQXA 1W2PA 3BCDA 3NDZA 2WMHA 4XX6A 2Y8KA 1ZJAA 4UOQA 3NIYA 4W86A 3RIKA 2VL4A 4PUDA 1OIFA 3RMEA 1ZBKA 4ACZB 3ECQA 1LG1A 3OLGA 4CCCA 2JFEX 1DWFM 1JD9A 1NP0A 2XPKA 3UESA 3VDAA 1QPKA 1F4AA 3BC9A 1Q6EA 4W87A 3VMNA 3BCFA 2ZWYA 4AZIA 3HU7A 4E2OA 5IFPA 4AZ5A 1MW2A 2NSXA 4ACZA 4PMQA 4NRSA 2ZOXA 5GQBA 2GDVA 1CIUA 1I75A 1GOWA 1VAHA 2J25A 2GJRA 4PSRA 1QOXA 1FA2A 3CUHA 4PMNA 5A2BA 5A3HA 2DSVA 1CTNA 4XZBA 1UD5A 1VJZA 1CXKA 4BA0A 2VZUA 2J62A 3PN8A 2A3AA 2Q8XA 3N1AA 4MNLA 4PN2A 4GXPA 2HVMA 3D5HA 2VOTA 2XFFA 2BY0A 2Z1KA 3WH7A 2VRQA 1X6LA 4RE2A 4A4AA 2EBNA 4K68A 2DT2A 4U5KA 2CNCA 3MU7A 1JZ5A 4J3XA 4QDMA 1FH7A 3VTRA 2J75A 2PWDA 1W9BM 4CUCA 1CEOA 3F5LA 5HBFA 1XYFA 3T0AA 1XH1A 1OIMA 2CBVA 3ZT5A 2OSYA 5BXTA 5EB8A 4CD7A 2J78A 4PMUA 1LL7A 4KGLA 1JGIA 3ZO9A 3VU2A 3ARUA 5I24A 2AAAA 3MUAA 3WIJA 1UR8A 1MFUA 1EA9C 2PBOA 4CD5A 3N9KA 1XHGA 4BQ5A 1B2YA 2J7EA 1B0IA 4JHOA 2FHCA 1G01A 5ABFB 1U2YA 1UWTA 3MKKA 5C71A 5A6SA 1TVPA 1V03A 3I3BA 1H1NA 2XHYA 5GNYA 4NRRA 3VIGA 1J9YA 1UA3A 4AW7A 1EHAA 3N04A 3D3AA 5ABFA 5BXRA 4JL1A 4PMOA 4X9YA 5DFAA 3CZ8A 2V5DA 2D23A 4TUFA 3A4WA 2D1ZA 3GYCA 9CGTA 4AIOA 4AZ6A 1UH3A 2VX4A 4GQQA 1OGSA 1W91A 2XSBA 4URIA 1EDQA 2F2HA 2ZUMA 3HMCA 5E6YA 3WY1A 3F5JA 4ZE4A 2XJ7A 1E6SM 1G0CA 3PZ9A 4GI6A 6CGTA 4YHGA 1J0YA 1EQPA 1WP6A 1TR1A 3BSGA 3O2LA 5A8MA 3WDIA 1P6WA 2V5CA 2AMGA 4WSJA 4L4OA 3RCNA 4EE9A 1GVIA 2UY3A 3UCQA 3MS8A 5A6LA 3MMDA 3M6DA 4ML4A 4AEEA 1AQ0A 3ARQA 3N15A 4U3CA 4UCFA 1E9LA 1LJYA 4E8DA 3WQ8A 3WNKA 4DUWA 2G4FA 3SCUA 4AD3A 1SR0A 3AZSA 1C7TA 4WK9A 3DC0A 1C8XA 5M3WA 3CHCA 1PPIA 3PZGA 4MB4A 1J01A 4NI3A 3L4XA 1HKKA 3PZVA 2WWDA 3GNPA 1ISZA 2W66A 1MWOA 3ARXA 5F7UA 4FMVA 4LGXA 4AWEA 5D9MA 1QNQA 4TX8A 5EMYA 1GJUA 2CESA 1RP8A 2V3FA 1E40A 3ARPA 3MV11 1QI5A 1VRXA 3QOMA 3KL5A 4YHEA 1UKPA 2WMIB 3VPLA 5E6ZA 4QCFA 3ZT6A 4CCDA 2CERA 2YDSA 2EPOA 2ZX8A 1MXGA 2YA2A 3W25A 2D3NA 3EDJA 5E0CA 1CXIA 1C7SA 1LF1A 1M7XA 2A3CA 2DEPA 2VR4A 1PAMA 1E6NA 3PZTA 1R86A 3WL1A 1V02A 1JF5A 2XGIA 4EK7A 3N17A 1G1YA 1PX3A 2VCCA 3EMCA 3OLIA 1TUXA 3U5YA 3L4ZA 3M7SA 2D3LA 4U5IA 1CWYA 2VQTA 2XVLA 2UWFA 4BQ3A 2NW0A 4F9DA 2YL6A 4PTWA 1B1YA 2DH2A 3GZAA 4UQBA 5ECUA 2BS9A 2VZSA 3VINA 1E71M 2QV4A 4HZ7A 3KL0A 3TTYA 3AMGA 4B15A 4JFSA 1BVNP 2YL8A 3IJ8A 3AISA 3WMCA 2CBIA 5JBDA 4DM1A 4GINA 1LWHA 1W9PA 2ZUWA 1V6YA 5A94A 4IM4A 3EYPA 4ZENA 4JHZA 3UG3A 4HOZA 1BYDA 2WSKA 5DO8A 1O7AA 1UD4A 5TD4A 1UG6A 1WZLA 2O9RA 1TZ7A 3CIVA 2VQUA 2CCRA 4JCMA 1VIWA 5LA0A 3GNRA 3OGRA 5D8WA 6TAAA 5LA2A 1EIBA 1JZ2A 4ZEPA 1GNXA 1A3HA 5A1AA 3CHEA 3WL0A 4GO9A 3SUWA 4OJYA 1DWAM 4FLOA 3ZJ7A 3WMBA 3ZT7A 4CN6A 1OB0A 2VZTA 4LYRA 4TTUA 1CDGA 1NP2A 3W28A 2YDQA 4DUVA 1W3KA 2G8ZA 3WDRA 2FH6A 3WF2A 5JBFA 3MUY1 2WVUA 1UKQA 5E09A 4DUXA 2X2YA 2YLAA 4XB3A 1EO7A 4KMQA 1PBGA 2FHFA 3NSNA 2X0YA 4PMVA 1J18A 1E1EA 3UEQA 1E4MM 3AIVA 3WUGA 1KCKA 4LPCA 2WC3A 3OLDA 1GOMA 3PZMA 1BQCA 4W5ZA 3E1F1 4H41A 3WH5A 3CGTA 3CZJA 4IPLA 2CEQA 6A3HA 1W32A 4HP5A 2DIJA 3MMUA 5HNNA 3K8MA 8CGTA 1C90A 3WQ5A 1FP9A 5A8NA 1BG4A 4MB3A 4GZIA 3VDHA 2BHZA 3AI0A 3KEHA 1QW8A 1KB3A 1BLIA 2IUZA 3N13A 3CZLA 5E9AA 3AOFA 1H49A 4F66A 2X0HA 1EH9A 3RPMA 2XFRA 5M03A 3AIQA 2VT0A 1QVBA 1HJQA 5BWFA 2JIWA 4D6HA 1QW9A 1W9VA 1WDSA 2FGLA 3IK2A 3AHYA 1PIFA 3FHAA 1A47A 1OD8A 1Q4NX 4GKLA 1HXJA 3WNOA 4YN5A 1E43A 2XSAA 4QLLA 3AS2A 2WW5A 4AZCB 3WEOA 2WHMA 5CG0A 3BAXA 1OT1A 4BQ2A 2ZX6A 1V3IA 1UZ4A 2E9LA 3WH8A 1UWUA 2JE8A 5BROA 1HJXA 4P8UA 1XRVA 5FKYA 4W88A 3VGGA 4MNJA 5EBAA 1ISXA 4AZCA 1VFOA 2WCGA 4KRUA 2PF0A 4QFUA 3AMCA 1FH9A 1V6UA 4S3KA 4TVDA 2FGZA 3EDDA 5A6BD 4AZHA 2ZICA 4UNIA 1HL8A 3TONA 1MYRA 2XGBA 2B31A 4TX6A 3CHDA 1BF2A 1DTUA 5C70A 4CD8A 3EMQA 4AC1X 4H2CA 1D3CA 1M03A 1J10A 1FFRA 1W1TA 2J79A 4DWSC 1LLOA 3DECA 1OM0A 2J7CA 3VGDA 4W8BA 3THCA 3VDBA 3OA5A 1OINA 2ZE0A 5CLTA 2BY1A 4R27A 1OGGA 1B31A 4J3UA 3T08A 3HN3A 2VCBA 3VIPA 1OSEA 4FK9A 4V27A 2OWCA 3KZSA 3VIMA 2VNCA 4AZ7A 4X0NA 1B3YA 1HJVA 2CKSA 1K6AA 1W3HA 5KZ6A 4BZYA 1J0HA 4HMEA 4P8WA 1C93A 3U7VA 3UG5A 4GZJA 5BXPA 4IUGA 3AIRA 4UR9A 2CBUA 2EJ1A 1FOBA 2WCSA 3VD3A 1W1VA 4C7FA 3VNZA 4W7WA 3ALFA 1H11A 4P7RA 2WHJA 1JL8A 1MQQA 4UOZA 4U2ZA 4YPJA 4AD5A 4V2XA 4CCEA 3NSMA 1J0KA 5ABEA 5I6SA 5CLWA 2VMFA 1E70M 2WZEA 1UR2A 2JIEA 3S6TA 2DSWA 4WKFA 1CYGA 4BS0A 1NOFA 1IZKA 2VJXA 3VMOA 3VIKA 2XM1A 1JZ3A 1EO5A 5IXEA 4MJ2A 4OIFA 3BAKA 2ZUVA 1B9ZA 1L0PA 4P7NA 4M1RA 3W53A 4PMRA 4OZOA 2J7FA 4IISA 1PEZA 5HDRA 1VENA 2JALA 3AIWA 3MO4A 1IZJA 1OT2A 3WQVA 2YA0A 1HKJA 5I78A 3SUVA 4F8XA 2EO7A 3RJYA 5AC4A 1C92A 1V0NA 3W24A 2ZIDA 1PJ9A 2OWWA 3WMSA 1BGGA 3WBEA 5LYRA 2QMKA 2XVNA 2CBJA 3U57A 2BHYA 3A4AA 3CMGA 1CECA 4LX4A 2QMJA 1D2KA 3SIMA 3AXHA 2PB1A 1YHTA 1PX4A 2DIEA 3VVGA 2ESCA 1TFVA 3WENA 3SCSA 3WF0A 3UG4A 4Z2LA 2BY3A 3IJ9A 1RH9A 2GK1B 1K9DA 3AMDA 4F9JA 1B3VA 3VIIA 4ZFMA 4D6IA 1JZ7A 3L2LA 4MB5A 3W27A 2CPUA 4PSPA 1K9EA 1MQRA 3VIHA 3T09A 1HIZA 1JZ6A 2VTFA 1VJSA 1XCXA 3W0KA 1UUQA 3T0BA 1EGZA 4QP0A 2GK1A 3OGSA 3WKZA 3CLWA 4JFWA 3AFBA 3WDHA 4AYSA 3J7HA 4UQEA 3W37A 3WNNA 4PMZA 3W6LA 1BHGA 1CPUA 4W8AA 3TTQA 4D6GA 1Q6GA 2XVKA 1CXLA 1QHZA 3CBWA 2VZVA 1R85A 3I3EA 1HF6A 4D6JA 2Z1SA 2O92A 4RL3A 4GQRA 1DWGM 4N0RA 1Y7VA 1KXVA 5I5RA 1CLXA 5CJ5A 3WF1A 1ECEA 2EEXA 2GDUA 1R7AA 4ZXOA 1VBUA 1Q6CA 3K46A 4OUEA 3ZR5A 2D0FA 1CGWA 1H0GA 4GIAA 2E4TA 4LXFA 3O9NA 4BF7A 7TAAA 1E72M 2BV9A 4M82A 1LWJA 2JEQA 2UY2A 2DPEA 3WF3A 7CGTA 4WF7A 5DT5A 1B3ZA 3EDFA 1LL4A 3VD4A 3L4YA 4D1IA 3KL3A 4RE4A 2WZIA 3VMPA 2IXVA 4S3JA 2VR5A 1JDAA 3POCA 1DHKA 1GOQA 3ZSTA 1ISYA 2PI6A 2O9OA 1J11A 3DYPA 3W29A 3WDPP 1U33A 4JKKA 4H04A 4AZBA 2E0PA 2UY4A 1GONA 5D8ZA 3MUIA 3MV01 1UKSA 1VFUA 4HOXA 1SMDA 1WDPA 1KWGA 2BVTA 4WSKA 1GQKA 5A69A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2A3E A;  1HJW A;  3GXM A;  4V28 A;  1Z32 X;  3QHO A;  1XSI A;  1LL6 A;  1GW1 A;  5D9P A;  3WNP A;  2JF7 A;  2WXD M;  4A3H A;  3WSU A;  2YDR A;  3PTQ A;  4MTV A;  4WKA A;  3G6M A;  4HMD A;  1B3W A;  2DSU A;  2QHA A;  2QLY A;  4GPN A;  1L8N A;  1D7F A;  5D4Y A;  4ATL A;  2D24 A;  3SCV A;  2J74 A;  3FW6 A;  4UQ9 A;  1E55 A;  2OYL A;  4HZ6 A;  1VB9 A;  3KWX A;  4MB1 A;  3QR3 A;  7A3H A;  2WC7 A;  5A8Q A;  2O9T A;  3N11 A;  4W7V A;  4D6C A;  4OBR A;  1QI3 A;  1ESW A;  2NT0 A;  3AS3 A;  1CXF A;  3AHZ A;  3WH6 A;  1UH2 A;  1H4P A;  3BLK A;  3O6A A;  2Y5E A;  4J3S A;  4AD2 A;  3B9D A;  3PZI A;  1US3 A;  2Y2W A;  2W4X A;  1UYQ A;  5I2U A;  3M46 A;  3VD7 A;  4M8U A;  5E70 A;  4UTF A;  5ABH A;  3AHX A;  2QF8 A;  4GI8 A;  1KR1 A;  4ATW A;  5CSY A;  1GOK A;  2W63 A;  4Q7N A;  5JIW A;  3WD0 A;  3AIU A;  2ZWZ A;  4P8V A;  5FIP A;  5FOO A;  1NOW A;  2J4G A;  1KXT A;  2ZX7 A;  1QHP A;  4OBS A;  2WK2 A;  2Y8V A;  4KGJ A;  4AIU A;  4J3V A;  1UOK A;  3RDK A;  1E4L A;  1AQH A;  2DT1 A;  2YA1 A;  1E3Z A;  1XCW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2A3E A;  1HJW A;  3GXM A;  4V28 A;  1Z32 X;  3QHO A;  1XSI A;  1LL6 A;  1GW1 A;  5D9P A;  3WNP A;  2JF7 A;  2WXD M;  4A3H A;  3WSU A;  2YDR A;  3PTQ A;  4MTV A;  4WKA A;  3G6M A;  4HMD A;  1B3W A;  2DSU A;  2QHA A;  2QLY A;  4GPN A;  1L8N A;  1D7F A;  5D4Y A;  4ATL A;  2D24 A;  3SCV A;  2J74 A;  3FW6 A;  4UQ9 A;  1E55 A;  2OYL A;  4HZ6 A;  1VB9 A;  3KWX A;  4MB1 A;  3QR3 A;  7A3H A;  2WC7 A;  5A8Q A;  2O9T A;  3N11 A;  4W7V A;  4D6C A;  4OBR A;  1QI3 A;  1ESW A;  2NT0 A;  3AS3 A;  1CXF A;  3AHZ A;  3WH6 A;  1UH2 A;  1H4P A;  3BLK A;  3O6A A;  2Y5E A;  4J3S A;  4AD2 A;  3B9D A;  3PZI A;  1US3 A;  2Y2W A;  2W4X A;  1UYQ A;  5I2U A;  3M46 A;  3VD7 A;  4M8U A;  5E70 A;  4UTF A;  5ABH A;  3AHX A;  2QF8 A;  4GI8 A;  1KR1 A;  4ATW A;  5CSY A;  1GOK A;  2W63 A;  4Q7N A;  5JIW A;  3WD0 A;  3AIU A;  2ZWZ A;  4P8V A;  5FIP A;  5FOO A;  1NOW A;  2J4G A;  1KXT A;  2ZX7 A;  1QHP A;  4OBS A;  2WK2 A;  2Y8V A;  4KGJ A;  4AIU A;  4J3V A;  1UOK A;  3RDK A;  1E4L A;  1AQH A;  2DT1 A;  2YA1 A;  1E3Z A;  1XCW A; 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