2FB3A

Structure of moaa in complex with 5'-gtp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
EQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ligand binding protein
molecule keywords Molybdenum cofactor biosynthesis protein A
publication title Binding of 5'-GTP to the C-terminal FeS cluster of the radical S-adenosylmethionine enzyme MoaA provides insights into its mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 106
structure length 327
sequence length 327
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.99.22: GTP 3',8-cyclase.
pdb deposition date 2005-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06463 Mob_synth_C Molybdenum Cofactor Synthesis C
A PF13394 Fer4_14 4Fe-4S single cluster domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fb3A00
3DFPA 2NLIA 1HL2A 1QOPA 5D2VA 3W7LA 1IXPA 2ZYFA 4LS1A 4R53A 5DBTA 1P0KA 2JKPA 2F7FA 3RLVA 1SW3A 5EYWA 3MBDA 5CKSA 1VCFA 5DLCA 4RX0A 1O5XA 3QZEA 1TPFA 5FI8A 4MY8A 1SZNA 1M7PA 4JYDA 1TTPA 4CCDA 3W1UA 3JS3A 1TPC1 4R33A 4WUIA 5HJLA 3W1PA 2P10A 4P2VA 1IGSA 1VR6A 3IVTA 3UYCA 1QR7A 4UFLA 3UNDA 4NT0A 3LCIA 1TPVA 3ZFHA 2NX1A 4EVZA 2JKAA 5CPMA 4OWGA 3OG3A 4LRTA 4BI5A 4XKYA 5K9DA 2A7NA 2E5DA 4MY9A 2B7QA 3LBCA 1QMLA 3S1VA 4ZVJA 3MHGA 1LOQA 3P81A 3F1QA 3LXBA 4RK8A 4OU1A 4HNTA 4IUOA 1QCWA 3W84A 1H7XA 3E9AA 4GUGA 3W74A 3W22A 3S5YA 1JVNA 4L4LA 1EWEA 3LHZA 3QQ1A 1YTKA 3ANYA 3QPYA 6ALDA 3FIGA 1DBTA 1OHLA 3L65A 4O14A 1K7FA 1BWLA 2E68A 4GFSA 5D32A 1GVOA 3CHVA 5F2LA 2Q8ZA 4LVFA 3BVJA 1YADA 1X1ZA 1O95A 3HGOA 1S5WA 4IWWA 3W85A 4JTLA 4O28A 3S42A 4IMFA 3G1XA 5J5RA 2OCZA 2ZCGA 4WOZA 2Y70A 2ALDA 3PM6A 1ZENA 1ZAJA 1JCMP 4PL1A 1KTCA 1VYPX 2QDHA 4M6VA 3NG3A 2E6AA 1B4EA 1K7XA 4MZ8A 2WSQA 3KVMA 3F03K 2FPVA 4O1DA 1KV5A 2C14A 4NX0A 1WAUA 2V8ZA 1FQ0A 3BLFA 3LLDA 2OT1A 3O15A 3QW3A 1WXJA 4KWWA 2X30A 3UWWA 3I65A 1GWJA 4Z0SA 1S5VA 4QM1A 4RLIA 3IGUA 3PB2A 1NFBA 3LX9A 1Z44A 3W7CA 1AG1O 1G4EA 1PHQA 3TXVA 1FY6A 2G97A 2VELA 3G22A 4AHOA 1LRNA 4Y6GA 2Y63A 4N6EA 4RJEA 1O4UA 1FCVA 2CLLA 5AN7A 1R2SA 2RKXA 4GUFA 2YW4A 3DFSA 4JD4A 3EWUA 3SW6A 3HPZA 4KWVA 2BZNA 1TPUA 3ATYA 4HSOA 3WJSA 3KX6A 1DHPA 1RVGA 3N9SA 4NXSA 4IGHA 3C61A 2Q3OA 3QRHA 2ZZ5A 1HTIA 1KTBA 1LOLA 3LB0A 4TIMA 4GNJA 3S1UA 3WJWA 4O18A 3UXAA 2PRLA 3QMSA 3CLMA 1JUKA 3DAQA 5CZJA 1X7FA 2BXVA 3A9IA 1YPIA 3LERA 3PVFA 5L6UA 4GC4A 4LC6A 3BLIA 1X1OA 1VJIA 3TSMA 3UPBA 4BWLA 2FQIA 2I1OA 3G1YA 3F4WA 2PC4A 2D73A 3KFTA 4JTHA 3NNTA 4JX5A 4UTTC 3BARA 2O7QA 1YTEA 3PAJA 1QAPA 3IGSA 1M6JA 2A85A 4XKYB 2ZRZA 1W8SA 3HB9A 5BNKA 1I4NA 4O19A 4ZMGA 5AHNA 1SW0A 2QJHA 5EA9A 4HNNA 3CTLA 4RZ5A 1OFEA 3W23A 4Q4KA 2RFGA 3EX2A 1R46A 3TU9A 2VEMA 5KZEA 1ME8A 4O1CA 1FWNA 2HSAA 4HT3A 4JTFA 4LOCA 1KFEA 3VKJA 2ZTJA 5I3IA 1S5TA 4AWUA 5AB3A 4WOQA 1MSSA 2JGYA 4UTIA 1UUMA 1EWDA 3L68A 2ZQ0A 3A21A 5D37A 4PODA 1CI1A 2V30A 5AYXA 3LCXA 5CZSA 3NXFA 4MVAA 1KFBA 2ZDRA 5CPLA 2VOMA 2DU2A 1IF2A 2DZXA 5ABTA 1QOQA 4FXSA 2NXIA 3C2OA 3HG3A 2H8ZA 1TV5A 3GDRA 5LKYA 2CZEA 3DKLA 2DP3A 2RH9A 1JJKA 2QF7A 1WOBA 4QJ1A 4IPJA 4KFOA 5LSMA 2O7SA 2ABBA 3O06A 4LV9A 4LTSA 3W1AA 1OF8A 2YPIA 2X1UA 3LV5A 1KLYA 1M5WA 4PTNA 3M47A 2NWSA 3G1AA 1G6CA 1XM3A 2NUWA 4C1KA 1G67A 2E6YA 3LLFA 4CCCA 2DORA 4UTMA 2A7RA 3LXAA 5I3GA 3MYOA 4BI7A 1W5NA 1L6SA 2AQWA 3H54A 1H61A 3QF0A 1IXOA 3F4NA 3QEZA 1OX4A 1ZAIA 1JULA 1VS1A 2FLIA 4IX0A 1Z42A 1G7VA 4U28A 3KRSA 3CU2A 4QITA 2A6LA 5E1QA 2FJKA 1VC4A 3GAYA 3GX9A 4HNUA 1DOSA 4E0CA 3MO7A 2YFNA 3FYOA 3C52A 1F6PA 3NM3A 3KVJA 4MPQA 5CZTA 1UB3A 2RDUA 3T40A 1SFJA 3N34A 4EWND 4AWTA 5KITA 1VH7A 2A6NA 2RHGA 1SZFA 3BO9A 3G3DA 5KZDA 3MBFA 2NX3A 4WD0A 3P80A 4H4IA 3HBLA 3M0ZA 2CLMA 2QCMA 3W7NA 3KRUA 3NPXA 3H55A 3DKJA 1XBYA 1K3UA 4G1KA 5F2IA 3SIZA 3NM1A 4GUJA 3E02A 1MEWA 3FJ6A 1GZGA 3UXDA 2V2CA 3FKRA 1WV2A 3C2FA 2XN2A 5G1YA 1GTHA 3O6CA 4MLRA 4JTGA 4LWWA 4O17A 4QISA 3ATZA 5LNRA 3E12A 4R34A 4DQWA 1K8ZA 4DBEA 2NZLA 1JRBA 3PG8A 3FOKA 3NO5A 1XBXA 2ATMA 2NX9A 5AHMA 4IX2A 3CC1A 3DFNA 3I68A 3S6DA 2TPSA 3W07A 4NVTA 3DHFA 1HO4A 2ZZ4A 4QNEA 3S5NA 3PBUA 1OFAA 3TW7A 5HINA 1WOAA 4JEQA 3TMLA 3NQVA 2X2GA 1Q6LA 1K02A 4N4QA 4HHPA 3S5ZA 3LTYA 3YPIA 1KM6A 5AOUA 5LGZA 3P62A 4IQLA 4JNMA 2C1HA 3A22A 2J9ZA 4NNAA 1KBIA 4OE7A 4DBDA 1B4KA 2VXNA 3TMQA 5AC7A 1QPQA 3GZ3A 2ZA1A 4WQ6A 2ZRXA 1OK6A 3W1XA 3M16A 3OA3A 2WV8A 3S1XA 2PURA 4XZ9A 1G7UA 5J5DA 4QIUA 4S2BA 1ML1A 1L6YA 4MZYA 1RD5A 2OT0A 3TE9A 1SFLA 3VE7A 2JBMA 2GJLA 1SSGA 3DBPA 3NL6A 4UTTA 5LGXA 1FDYA 3Q2DA 1H7NA 3TKFA 5KTLA 3W2MA 5K2ZA 2H3BA 4OV9A 2G5WA 2CZDA 4TR9A 3W1TA 3TSBA 3B05A 3C3NA 3GKAA 3W1QA 4O4WA 2WSRA 1PHWA 5C6MA 3DZ1A 5FESA 3AJXA 3P8JA 3ZR4A 3WK0A 3EWWA 2VFIA 3GVGA 3LRMA 2CLHA 3B4UA 1I2NA 1H7RA 3D0CA 3B03A 3A23A 3BV4A 2DJXA 3QYQA 1FCUA 4OQVA 1NVMA 4N9CA 3NEVA 1A5CA 3DENA 2Y7FA 1KM5A 5F4SA 3W73A 1W5QA 1ZCOA 4PL2A 1OX4B 3S8HA 3EKZA 3NL2A 2DZWA 3N2XA 3G0XA 2TSYA 2A7PA 4WZHA 2CZ5A 3ELFA 5F2MA 3WFAA 3W72A 4RCXA 2E6DA 4R7JA 2BWGA 5C55A 2E6FA 1WX0A 1LRQA 1TRDA 3P61A 2PRHA 4JN6A 2CWNA 2GPTA 1LLZA 4GJ1A 2HS6A 4YLWA 4S1FA 4OBTA 4IXXA 1A53A 1IIHA 4CCEA 2Q8LA 2WNZA 3MUXA 1A5BA 3W86A 3SFKA 2JK2A 5AHFA 4FNRA 4DO6A 1F05A 2NWRA 4KFPA 2X1SA 3QFEA 1T8XA 4U4MA 1JCNA 4FNPA 3OEXA 3IIXA 4ZQOA 3O6DA 2ZZ3A 3HGJA 2AAMA 5K9CA 3LHYA 1RV8A 1KM0A 1FXPA 1W3IA 5HWNA 4LW7A 4PH6A 5DY3A 1Y0EA 5F1UA 1F6KA 3SECA 3W2NA 5D03A 3KXQA 5AC6A 3B04A 3WJZA 2GOUA 3HPSA 5G2HA 1NF0A 3L21A 1N55A 3I7RA 2GUUA 5G2IA 4K6AA 1VZWA 4LVAA 1J5TA 3O8AA 4A2SA 2ZA2A 4DPPA 4LS2A 1XDLA 4DEFA 5LHEA 3G1SA 4NJJA 3V1PA 1I2QA 1H7PA 4BF9A 2ISSA 5IBXC 4I7VA 3CEPA 4Y8FA 4N6FA 2QJGA 2QUVA 3TQKA 2B0MA 3SI9A 1P5BA 5F2GA 3GNNA 1QFEA 4XBKA 2EHHA 4JX4A 1SR9A 3W2UA 2NXHA 1FDJA 2H90A 3CB8A 4UTLA 1P4CA 3L67A 2X1RA 6TIMA 3ABSA 3W7EA 4LV4A 3W7GA 1OYAA 4XQ6A 3VFLA 3KAOA 3RNDA 2V81A 1TQJA 4WY0A 1JRCA 2YW3A 3TAOA 4A21A 4AB4A 3VCRA 3PB0A 3ABQA 3LRKA 2DZVA 5KMYA 3W70A 2GVJA 1JQXA 4HN4A 3C6CA 4ONVA 1GYLA 3THAA 2ZRWA 3N2MA 3NA8A 1FCBA 1YDOA 4OT7A 3QW4B 4PC8A 1K03A 1OFRA 3IGXA 3STGA 3FEMA 5C54A 3ZWTA 1L2UA 2V0TA 1TJPA 1VPXA 4UXDA 1GOXA 2YXGA 2VEKA 3EX4A 2PCQA 3CIWA 3HG2A 4UFHA 3EWXA 3L0KA 2PRMA 3TK7A 4YWIA 4LY8A 4TO8A 1W3TA 5KINA 4ORIA 1TCDA 1LRTA 4YMZA 4FNTA 3P5YA 3CPRA 1WA3A 3LCHA 3MP5A 1LBFA 3NQEA 1VLWA 1OYBA 3W88A 3KOFA 3WK2A 2ZFAA 4IJBA 2Z0IA 4I9AA 4PA8A 1BKSA 1H1ZA 2Y7GA 5HMSA 5CG7A 4AHPA 3IVSA 1YYAA 3DH7A 5F4XA 4EOUA 1XFBA 4UTWC 3W87A 1L9WA 4ZQMA 4EF8A 3DFTA 1QNVA 1KM4A 4MYXA 1WDWA 1YXYA 1TB3A 2VENA 2NUYA 1W0MA 4EIVA 1ZAHA 1NSJA 3MJYA 3UWQA 1XKYA 4D2JA 1NEYA 1U83A 4JYFA 4O10A 4FX7A 2B7OA 4K7YA 1YTDA 4BR1A 4M6PA 3BG3A 4A29A 1DL3A 4HKPA 3IIOA 4I7UA 4UTKA 4DPQA 3U8GA 3M6YA 3PBVA 1FUYA 4FNUA 2QCHA 4DXVA 2P0OA 3LOTA 2YDAA 2C18A 4X22A 3GDKA 1MEIA 2DZUA 4GUHA 4GBUA 1IIGA 1O60A 3U2OA 3UWUA 2VFDA 2Y7DA 3GAKA 3HPXA 1ALDA 4LVBA 1P0NA 1C9DA 4RXFA 3BGJA 4NJGA 2GJNA 4X9SA 3WK1A 3B0VC 4GUIA 3BG9A 4JR5A 3W1RA 1AK5A 1ZJIA 2FB2A 4RZ6A 3EXSA 3IIZA 5CGQA 4N02A 4O1AA 4FNSA 3W7JA 3R12A 1AW5A 5CPNA 1BEUA 2Y85A 1FWRA 3GYEA 3NQ2A 3UWZA 1AW2A 5U4NA 3OVQA 4MZ1A 3IRDA 4HSNA 4E2DA 3H53A 4JIQA 4FB7A 2QEZA 3STCA 4N2YA 1GG1A 1VHCA 4WY0B 5DCEA 3TAKA 3S1WA 1KM1A 1UJPA 3GKFA 4ZQNA 3LCWA 1ZALA 3EX1A 4UFJA 3EWBX 4UMBA 2CLEA 2F84A 3L5LA 4N4PA 1FWSA 1Z48A 1QPNA 3R8RA 1PVNA 2JGQA 4B5NA 5AHLA 1D3HA 3S5OA 2C13A 5DCDA 2ZRVA 4BI6A 3W7DA 1SUXA 1TV8A 1SO4A 3C8FA 2QR6A 3NL3A 3FLUA 3W7OA 4MIMA 3T4CA 4Z1BA 3W7RA 3KVKA 3SZ8A 8TIMA 2WO5A 5D30A 5I3FA 3NQ7A 2BX7A 2Y61A 5IBXA 4MLJA 2V2HA 1FCQA 3W6YA 3ZS4A 3GR7A 4FHAA 3PG9A 4Y96A 4TMCA 2G95A 2A2IA 1AW1A 4DF0A 5F1VA 1EP1A 4E38A 1N8FA 1XDMA 2XN1A 3LHUA 1GT8A 3PULA 5BRBA 4A2RA 1Q3NA 4O0KA 1TPH1 4YL2A 4FX8A 4ADSA 5FF0A 1OFDA 3I6RA 4FEZA 3STFA 1W37A 3L0NA 3DFQA 1PV8A 1ZNNA 2QDGA 2Y62A 4X3ZA 1GPWA 4LUJA 5H91A 4HNVA 1I45A 4JDBA 4KKXA 5DCBA 5SWUA 1EX5A 1OFQA 1THFD 2E77A 3W75A 3P7YA 2WSYA 3LRLA 3LHWA 3QPZA 4LT9A 4K7VA 2QCGA 1FX6A 3IV3A 2ZTKA 2R94A 4UFKA 2B4GA 4MFEA 3G0SA 2P1FA 5I3JA 3LCFA 1LP6A 4Z08A 1TPB1 2BLEA 3IIVA 3K30A 1TTQA 2VFEA 2J27A 5F4WA 3INPA 4M5PA 2CFFA 3B0PA 1SU5A 1M7OA 2ZZ1A 3EWZA 3TDFA 2A0NA 1JR1A 2DZSA 4MFDA 3FKKA 3B0UX 2R8WA 2V9DA 4WXZA 4C1LA 2C15A 4XWUA 1XL9A 1IXQA 5A8GA 1W1ZA 3LV6A 2VFHA 4JX6A 3SR7A 1TYGA 1KFKA 3LBMA 3VE9A 4UTWA 3QC3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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