2ISWA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
321
structure length
307
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 114
structure length 307
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iswA00
3MYPA 5F2IA 3A21A 4K8HA 2FFCA 4OBTA 1Z42A 3RFAA 2JGYA 1OYCA 2P1FA 4QNWA 1P0KA 3T55A 4TR9A 1MZHA 5CGQA 1FXPA 3S1UA 3S1XA 2ATMA 3KXQA 4UR7A 3LV5A 4EWND 2DZXA 3HGJA 1B3OA 5LNVA 3G1AA 1XBZA 1X1ZA 1G4TA 4QISA 1OVDA 1GTHA 2GVLA 3LRLA 3GAKA 1H60A 1VCGA 4ZQOA 1TV8A 1KM5A 5KZMA 1F5ZA 3VE9A 3CT7A 1I8JA 4UTUA 5BW6A 1C8VA 2VENA 1KM4A 3TMLA 2NX3A 3GDLA 2EPHA 1IXQA 1SZNA 3LGEA 4LS2A 3W3OA 5K9DA 4DO5A 1UCWA 3KAOA 1I2PA 1ME8A 4WOQA 5DBTA 1QPOA 4IX2A 4Z08A 1F76A 4MZYA 4QJ1A 3SSJA 1OFEA 3TU9A 3VFLA 3L5LA 3ZWSA 1TB3A 1TO3A 2C3ZA 5E0KA 1F74A 3B05A 1OX4B 3S5YA 3L21A 4X22A 2J6XA 3P8JA 1DOSA 1JCJA 5G2IA 3TSBA 2QF7A 1DQWA 4PODA 4MYAA 3ABOA 3GXPA 1JJKA 2CLFA 3GK0A 3MHUA 5FF7A 5K3VA 4NJKA 1RQHA 1N7KA 5BMWA 1QPRA 1S5TA 1OFAA 1DBTA 2D73A 2VFFA 1KM6A 2RKXA 1WQ5A 3QF0A 2V82A 1ZAJA 3ABRA 3LCFA 2A7NA 5TBOA 1VYRA 1G6CA 4HNVA 2VFEA 1G7VA 3W1MA 1IGSA 1QMLA 3VKJA 3QQ0A 4H4IA 3W75A 4ZQPA 1T99A 4PEKA 2ISWA 3C56A 1EWDA 4ZVJA 3NPUA 2A0NA 3HGSA 3M6YA 3G8EA 2OX1A 4LVGA 3HG2A 2QJIA 2Z0IA 2DU2A 3NQEA 2JKAA 2WJZA 4UFJA 3W83A 4EF9A 2NX9A 3UWZA 3E9AA 1LOSA 3CB8A 4I7WA 1LM1A 3OVQA 2X2GA 2H8ZA 2AAMA 1VCFA 3NL3A 3C0JA 4LRTA 2KZHA 3UPBA 4ZQRA 4E38A 2LLEA 4JTKA 3L66A 3TJLA 1K7FA 3RF9A 4A2SA 4LC6A 1TREA 2ZZ3A 3E0IA 4O53A 1K7XA 3GZ3A 3W74A 3G0UA 3QW3A 4O19A 4JX4A 1THFD 3HBLA 1KTCA 3UZJA 3E02A 3EWXA 1UASA 2GUUA 2VEIA 3BW2A 1B57A 2V30A 3L68A 4UTWC 1W8SA 1HTIA 1YPFA 3B8DA 3I7QA 1R2SA 5GVJA 1H61A 4OQVA 2JGQA 2RHGA 4FF7A 1GZGA 3CPRA 3K30A 4PTNA 5EY5A 2NX1A 4O28A 2OZ0A 2Q8ZA 4NJGA 2ZRUA 5EMUA 1K7EA 2Y6ZA 3MI2A 1MEWA 2Y61A 3M5ZA 3HQ1A 3LHYA 4OE7A 1KFEA 1S5WA 4JR5A 1KFKA 3GNNA 3Q37A 5FI8A 2YCEA 3G1FA 2ZZ4A 4I9AA 3O6DA 3P61A 4O1AA 3SGZA 2ZBTA 3TK7A 3IGXA 5D33A 2FPTA 3N9SA 3THQA 3DI0A 4NNCA 2OT1A 3WK2A 4JTFA 3MI3A 4GUIA 1L6SA 2WNQA 3PUDA 3HF3A 3QC3A 1H1ZA 2XFWA 3W1PA 5D03A 4UTHA 1H7PA 1SUXA 3GNDA 5U7SA 4JTLA 3W85A 4N9BA 2CZEA 1WDWA 3EWUA 4NJIA 4E0CA 1OK6A 2C13A 3THAA 3TH6A 1TTQA 1HUVA 3IGUA 2A85A 2QCEA 2QAFA 2HMCA 3NOEA 4YXGA 4NX5A 4M5PA 4DELA 2CW6A 1LLZA 1EPXA 4R33A 4RK8A 1CX9A 1RPXA 4L4MA 3EWBX 3FS2A 4DF0A 2ABAA 3GLCA 3MP5A 2ZCGA 3A23A 3E96A 3HG3A 4UTKA 3CIWA 5AHMA 4A3UA 4MVAA 5D04C 3EWYA 3SECA 1VQTA 1DVJA 2YW4A 4O11A 4WX2A 3G1VA 3L2IA 2VFHA 4IPIA 1GYNA 4MIMA 1KV8A 5KINA 3USBA 3B0VC 4POCA 2NV2A 1FWRA 5C55A 1SZGA 3E49A 1TCDA 2QJHA 1IXNA 3WK3A 3YPIA 1W3IA 4LT9A 4AF0A 4RLIA 4R7JA 1SZFA 5I3IA 5CZSA 3ELFA 4XTIA 1F6KA 2CZ5A 2RFGA 2FIQA 2PURA 1TSIA 4M7SA 3H55A 4FEZA 4CNOA 2NLIA 3PBYA 4DPQA 3OBKA 5CKSA 3NZRA 4LOCA 3VCRA 4ADUA 1EA0A 2BTMA 5FF4A 4Y8FA 3LCLA 1TPB1 3KVKA 3L67A 1DV7A 4JYDA 1OG0A 3NQ6A 3FYPA 5HUOA 4ZQCA 2ATSA 4JIQA 3GVGA 3GR8A 3L5MA 4LUIA 3EXRA 3PBUA 3NM1A 2QCNA 1OF6A 2HS8A 1RQBA 4IUOA 1W37A 5F4XA 3UPWA 4YL2A 4JTEA 4O15A 2H90A 1WYIA 3R12A 1MEHA 4LW7A 4WXZA 1W5QA 1D9EA 3W7EA 4JEQA 3W7OA 4U28A 5I3FA 2E6AA 3W07A 3IRDA 1OFDA 4UTLA 3N3MA 3DU0A 2RH9A 3Q2DA 4JYEA 1J2WA 2Z1BA 1JCMP 4IXXA 1F2JA 4FHAA 5EKYA 1A5BA 1NF0A 3FOKA 5G5IA 3KX6A 1VYSX 4AWSA 1LBLA 5HUPA 3P5YA 4MY9A 1QWGA 1G4SA 1FY6A 3W1AA 2DZSA 3NL5A 4FIRA 1KM2A 1LROA 3W7QA 1LORA 4ICNA 1EX5A 3PF3A 4FX6M 2ABBA 4O0KA 4IMFA 1QAPA 3F4WA 1VZWA 1KW1A 1FWNA 3I68A 3W2LA 1JCNA 1VGAA 3LTYA 4K38A 2I9EA 4PL1A 1H1YA 1SR9A 3TNOA 2VXNA 2R8WA 1H5YA 1OX5A 3NQGA 1DL3A 4GBUA 3PVFA 4DF2A 4AMAA 3M9YA 4Z0SA 5H2ZA 2DZUA 1TTJA 2WV8A 3HJZA 4GFSA 3W9ZA 3B04A 3HGOA 3NQVA 3LHZA 2GJNA 4JTGA 4QM1A 4FXSA 1O94A 3AO0A 4Z1BA 3G18A 1ZAHA 5DLCA 2GQ9A 1X6UA 3W1TA 3P67A 3G1SA 4P61A 2ALDA 3DXIA 4UCGA 3V1PA 1AK5A 3VNDA 1A53A 4O12A 4ORIA 4JTSA 2VC6A 4FNRA 3DFTA 1KLZA 1MXSA 1LYXA 1PS9A 1NF7A 3BLIA 1Y0EA 3MO7A 1BWLA 3FJLA 3QZEA 5LNWA 4KFOA 3NQMA 3BGGA 1EUAA 3MBDA 1X7FA 3GDKA 1BEUA 3NA8A 4E2BA 1XL9A 1VJIA 3EXSA 5TIMA 3QMSA 2C6QA 1LZOA 2YYTA 2CZFA 1GTEA 3MHGA 3EX2A 1YTEA 4RX0A 1O5KA 2ZRXA 2BSLA 1FCUA 5LNSA 2CZDA 2J88A 2E77A 4WZHA 4GJ1A 1JCLA 5G2HA 4UTTC 4Z1AA 5DBUA 5KMYA 4WJEA 1BTMA 3UWWA 2GPTA 3W7RA 5D30A 1EUNA 3LHVA 1K8YA 2CU0A 2BLEA 4Y9AA 1GWJA 4BWLC 3W7PA 4JTUA 3QM3A 3KVLA 4UMBA 1GJPA 4UFMA 1ZHAA 2ZRWA 3L0NA 3ZR4A 3O06A 2YGYA 4O0ZA 1Z44A 4MY8A 5AC7A 1QO2A 3IVTA 3TAOA 1B9BA 4GUFA 3M47A 4RV8A 4EIVA 3FLUA 3PUEA 4BF9A 3FKKA 3SI9A 4O1BA 3UWUA 4JN6A 4O8RA 4XBKA 5I3GA 1H7XA 2QKFA 4FNSA 4QIUA 1FWTA 2JKEA 4U4MA 2RDTA 4FNTA 2DP3A 4LV4A 1GVRA 4YCOA 2EAWA 1WA3A 1GG1A 4NU7A 1TV7A 5LKYA 3OA3A 2Y88A 3FKRA 4S2BA 1TRDA 4JDBA 4TMBA 3STCA 1OFBA 3O1NA 2E68A 3DBPA 3W73A 2GOUA 4NJHA 4AHOA 1ICQA 3W86A 2WNNA 1Q6OA 1W1ZA 2PC4A 4LVAA 3W6YA 4AXKA 2DZWA 3LTPA 2J9YA 2HS6A 4C1KA 1RV8A 1PL9A 5HR6A 4XKYA 2ZA3A 1TV5A 3DFSA 5L9FA 2PE4A 1CI1A 2OT0A 3PC0A 4IX0A 5CSRA 1GVQA 1X8FA 2WSYA 2RDWA 2PRHA 1FCVA 1KA9F 5D38A 3EWZA 3GIYA 3PWAA 3KHJA 3BLEA 4O1DA 4A22A 4ALDA 3M5XA 3T44A 3S5OA 1L6YA 1K8XA 4X2RA 3O63A 4CNPA 2Y62A 5CG7A 2RDUA 5FF3A 1AW5A 4K36A 3TCEA 3QJAA 3C4UA 3W1LA 3UYCA 2VOMA 3LBMA 1PE1A 5CZJA 3G1XA 4JY9A 1EP3A 3O8AA 3O16A 2F7FA 5LZLA 4O50A 4OU1A 1OX6A 4O57A 3EKLA 1W5MA 4DO6A 3LCIA 1W54A 3OIXA 3LXAA 1OJXA 2O7SA 8TIMA 2X1TA 2V5BA 1R47A 3TSMA 3R2GA 5D05A 2B7PA 4QQ3A 3P7YA 2ZZ5A 4WUIA 1ZFJA 2DORA 2F84A 3DI1A 2QAPA 1O4UA 4M6PA 3PSWA 3B0UX 3IIXA 2OCZA 2GVGA 4H3DA 1ME7A 1WBJA 3CEPA 4NXSA 3IIPA 3PUOA 5D37A 1OFPA 4N4QA 2FLIA 1PHQA 1XFBA 4IMDA 1F05A 3W7MA 3W1XA 1SSDA 3L5AA 5LNUA 1OX4A 1HL2A 1PCWA 3HB9A 5LGZA 5ABTA 5L6UA 1VRDA 2P0OA 5AHNA 4UNLA 1EP2A 1ICSA 4MOZA 2V9DA 2YZRA 4JTJA 4O18A 1WX0A 1KLYA 1TPH1 2YX0A 5EPDA 3OVPA 4HHPA 4M6QA 3MYOA 3F4NA 4DBEA 2V2HA 4KKXA 4MZ8A 1JQXA 5F2LA 1GVSA 4O4VA 2CLKA 1LCOA 3GB6A 3LTSA 1K03A 4UC5A 3QSTA 1G4EA 1NFBA 3IVSA 4RR4A 3EXTA 3R8RA 3CU2A 3NL6A 1QCWA 3EB2A 3DKJA 1F6PA 4K7VA 5D2XA 3W88A 3M16A 4M19A 3LBCA 2VKZG 3NG3A 3TE9A 5HWNA 2YXGA 1TPC1 1JCXA 4O52A 3R13A 3RLVA 3O6YX 2E5BA 3I7SA 3CWNA 5DELA 4QAIA 1FXQA 1CW2A 3EEGA 3G1DA 3LB0A 4XTDA 1KBJA 5DXXA 1AL7A 4N02A 1JVNA 1JR1A 3RLUA 4JY8A 1XCFA 1YLVA 2V81A 3LHUA 3TFCA 2YFNA 5HJLA 2FJKA 2DZTA 1W5PA 2VEMA 3BGJA 4GWEA 3W1NA 4Q32A 4HNUA 4UR8A 3S5NA 1G4PA 4O13A 4HNTA 2WNZA 1XBVA 1TPVA 1W5NA 3B03A 2DJLA 2YSWA 2W79A 4Y90A 1ICPA 4JICA 2E09A 4O14A 2Y63A 4WD0A 5HINA 1HO4A 2ZZ7A 1SO4A 1TYGA 4XQ6A 5BOOA 3MMTA 1FDJA 1GT8A 4JDYA 3DFQA 3BARA 3LI0A 1OABA 4UFIA 1VLIA 5FEZA 3LDVA 3G8RA 1GPWA 2Q3RA 1M7PA 3UZ5A 2A2IA 4NNAA 1KM3A 2FB3A 5K2ZA 4WY0B 1JUKA 3TXZA 5F4WA 1FWWA 3C2RA 4BI5A 3I6RA 2X16A 5G4EA 1IXOA 4CCCA 3U6WA 1H51A 3LXCA 4WY0A 2HTMA 2WPBA 5I3HA 1W31A 3BV4A 2A7PA 2V2CA 3HIJA 2AGKA 2QUTA 3OHIA 4BR1A 1GQNA 5A8GA 5CPOA 1P0NA 4UTMA 2EF9A 3DFOA 1D3GA 3QMRA 4N2YA 3IVUA 2EHHA 1Z48A 5CZ0A 2QUVA 2FQIA 3M44A 3MBFA 3I7RA 4LVFA 3IIVA 2XN2A 2FDSA 3O15A 5G2WA 1SW0A 5F2MA 3LCWA 3UXDA 5HMSA 3DHDA 4GNJA 3TJXA 3QSRA 3GKFA 1BKSA 3RMJA 1V7YA 4MFEA 2DZVA 3N73A 3T7VA 1VC4A 5EA9A 1TQXA 2HSAA 1U5JA 1YPIA 1WOAA 1ZAIA 4UUIA 4GC4A 4LS0A 4I7UA 5G1TA 1SO5A 3O07A 4HSNA 5D32A 1F73A 3TKFA 1RQEA 4IQLA 4YMZA 1TPEA 4I7VA 3HG5A 1HFBA 4LUJA 1TTIA 2NV1A 2GJLA 3B06A 5E93A 2G97A 2NUYA 2CLIA 2WSQA 3C52A 1IF2A 1OFQA 3ATZA 4TIMA 1OFRA 1SW3A 3N19B 5U4NA 2IQTA 4J9JA 4YLWA 3M41A 3LXBA 3HPZA 3NQ7A 4EF8A 4FX7A 1WXJA 3GKAA 1GOXA 3NQ8A 3OVRA 2VEKA 3CLMA 5HNRA 4E2DA 2QCGA 1M5WA 1UBSA 4CQ8A 4M6VA 1V5XA 1VH7A 5DY2A 4JS3A 1S5VA 4CNNA 2VFIA 2G95A 5LNRA 5AC6A 3OG3A 2V5LA 3P82A 1TPDA 3PSVA 4LTSA 3HG4A 2C19A 3L9CA 3TROA 2AQWA 4OGZA 1ZJIA 5I3JA 1ML1A 2BWGA 4K6AA 1VYPX 3BG3A 3UNDA 4YCPA 1GYLA 1LLWA 5H91A 4UMCA 1NAL1 4HKPA 2G96A 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 1KFC A;  2Z2U A;  4IJB A;  3TQ0 A;  1FQ0 A;  4QSH A;  2G5W A;  1J5T A;  2TPS A;  4D2J A;  3W7G A;  3LCH A;  4H6K A;  4N9D A;  3TR2 A;  2NUX A;  1OHL A;  1UJP A;  1OK4 A;  3R5E A;  4BI6 A;  1EEP A;  2ZDR A;  4TX9 A;  4AH7 A;  4LVD A;  2FPY A;  2A4A A;  1EB3 A;  2R14 A;  5AYZ A;  1LRT A;  1VPX A;  1W3N A;  3SIZ A;  1GVO A;  4RZ5 A;  4JIP A;  2C18 A;  4CQA A;  1P5B A;  3GDT A;  5AYX A;  3G1H A;  4XWU A;  1YDO A;  2BX7 A;  4UFK A;  3W2M A;  5I3K A;  3FJ6 A;  1T8X A;  1L6W A;  4LWW A;  4ZQM A;  2TMD A;  4A21 A;  2QUU A;  3KOF A;  1R46 A;  4IMG A;  5D2V A;  1MSS A;  4MFD A;  3S1W A;  4DEF A;  2W6R A;  1IIH A;  1B4E A;  3EWW A;  7TIM A;  3MWA A;  3UXA A;  3GYE A;  4XKY B;  4JYF A;  4OV9 A;  3LV6 A;  4EVZ A;  2J9Z A;  3BW3 A;  1T96 A;  3C2O A;  1SPQ A;  2I1O A;  1XDM A;  4K39 A;  3TA6 A;  3NQC A;  1XUZ A;  3P81 A;  1TJP A;  4UTW A;  1ZY9 A;  3N34 A;  3TQV A;  4MY1 A;  3TUU A;  1W5O A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KTX A;  5F2I A;  3RR1 A;  5HDR A;  2FFC A;  4U3C A;  1OYC A;  2PZ0 A;  3NTY A;  2PDB A;  5HXM A;  3O7U A;  3UXI A;  3T55 A;  1YQ2 A;  1RCQ A;  4W84 A;  5FD0 A;  2HXU A;  4MWA D;  3KOX A;  1QNS A;  5PTD A;  1B3O A;  1G4T A;  1EL3 A;  1OVD A;  1YRR A;  2GVL A;  4I5X A;  1VCG A;  1KM5 A;  2J8G A;  3ES7 A;  3CT7 A;  4UTU A;  5BW6 A;  2OGJ A;  5MKG A;  2X7V A;  3IJL A;  1IXQ A;  2O4Q A;  2HWG A;  3VUS A;  3SJN A;  3SCQ A;  4DO5 A;  3PP7 A;  3MDU A;  3WD2 A;  1LG2 A;  1ME8 A;  4WOQ A;  1QPO A;  4F0M A;  3T6C A;  1UPM B;  1HW6 A;  4GIS A;  1WDP A;  1JPH A;  4KS0 A;  5E0K A;  1F74 A;  4WLC A;  3VU2 A;  2ZWY A;  3VNJ A;  4ZXO A;  1DOS A;  5G2I A;  3ABO A;  3GXP A;  3SUU A;  2CLF A;  3GK0 A;  5K3V A;  5BMW A;  2RAG A;  3EOO A;  3IAR A;  3RJY A;  4IP7 A;  1OFA A;  1DBT A;  5KEZ A;  2VFF A;  1RAK A;  2G0W A;  1KBK A;  1KM6 A;  2RKX A;  1WQ5 A;  2V82 A;  3AWO A;  4JFU A;  3QHO A;  1ZAJ A;  1XLB A;  4AY8 A;  3LCF A;  2A7N A;  4P8V A;  4A3Q A;  3UW6 A;  4DI8 A;  2AL1 A;  2HCV A;  1KKO A;  3W75 A;  4ZQP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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