3AIQA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiqA00
3L4YA 2BY0A 1JG9A 5FOOA 1UZ1A 3WQ4A 4TVCA 3CHEA 1PAMA 4PUEA 4B16A 5FL1A 2Y5EA 3OLIA 1GOMA 1PIFA 4UFHA 3WUGA 2O9TA 3WNKA 2EPLX 2HISA 1WZMA 1W3JA 2OSYA 4LGXA 4H8VA 2PF0A 1KQYA 4BQ2A 5HNNA 1JL8A 2D24A 1G94A 5BXRA 3AIEA 2E4TA 3RIKA 4GI8A 1OT2A 4OJYA 4AZ6A 1WP6A 5A6BD 1E1FA 4XUYA 1EGZA 3CHFA 2BVYA 4CD6A 3F5LA 3W38A 3I3BA 3FNDA 3M6DA 3ARVA 5FIPA 3WDPP 3WL1A 2G8ZA 1QI2A 3GH5A 2WKLA 4UFJA 1C8YA 4C7DA 6CGTA 4X0NA 2O9RA 2ZWYA 5A2BA 3VIFA 4GI9A 4QFUA 2PBGA 2EPNA 1L8NA 2UY2A 3A4WA 4JHZA 1LL6A 4RE3A 2YA0A 4JHOA 1KWGA 2WW5A 4H04A 4TTUA 3VNZA 1HJUA 3HU7A 1KB3A 2VZSA 1QNSA 3BAXA 3MS8A 3M07A 4RE4A 3WD1A 5EBAA 3BMVA 1PZ2A 4WKFA 2CBIA 5LA1A 5CPTA 3MMWA 1E6ZA 4CCDA 1OSEA 1R86A 5CPQA 4BQ4A 1VF8A 1ISWA 1PJ9A 4LXFA 2ZUWA 2A3HA 5DF0A 4F9JA 1JYVA 3CMGA 2GFTA 4IPNB 1CZ1A 3ZSSA 1FOBA 1GCYA 2QV4A 1EDGA 2J25A 3BAKA 1M03A 1Q4NX 4HPHA 1CXEA 4CN4A 1RP8A 3MMDA 7TAAA 3A4XA 5HXMA 1V3HA 4AD1A 1W3LA 3AMGA 3NIYA 1UD3A 3ZSTA 2DH3A 3DC0A 4UQDA 3WQ5A 3CZGA 4JKKA 4NZCA 5A6BA 3BGAA 2V3DA 3I3EA 3SIMA 4Z2IA 4E8CA 3N13A 4KMQA 5A2CA 3RO8A 1C8QA 2OYLA 3B9EA 1QI4A 4B3KA 3TONA 2ZXDA 1QI5A 3T2OA 2Y8VA 4JFUA 4D1IA 1H5VA 2FHFA 2W91A 3ZR5A 5ABFA 1N82A 2VX4A 5D9OA 3ARZA 2VURA 1V03A 2Z1SA 4S3JA 5A8NA 1ESWA 5A2AA 2O9OA 1HJVA 3MKKA 3HJEA 1JDCA 1EH9A 3EMCA 1QW9A 1R87A 2CBJA 2GDUA 3WELA 4JIEA 3SCNA 2AAAA 4HOZA 9CGTA 1VJSA 3LPPA 3K8MA 2WVUA 3BSHA 3W26A 1K6AA 1GORA 1HF6A 1VEMA 1UKPA 2CITA 4YN5A 4BQ5A 3SCVA 3KWXA 1UKSA 4PTVA 3CZKA 4M24A 4E2OA 1ZBKA 2X1IA 3MUAA 4C7GA 4CVWA 1ZS2A 3ECQA 3SUTA 2E0PA 4MTVA 5A6SA 3AHTA 1QNRA 1WE5A 3GYCA 4MB1A 3EMQA 3U57A 1XH1A 2J78A 1ZL1A 1R8LA 4PCSA 1IV8A 1TVNA 1C3FA 3GNRA 4J3XA 3HN3A 1CGYA 4GQQA 1J0ZA 4CD4A 5GQBA 3WUBA 4W7VA 1JFXA 1V02A 4BS0A 1WNOA 4AZHA 1EA9C 1VENA 2VMFA 2VQTA 1OIFA 2XVNA 2ZXQA 3AHVA 1ZBCA 1GQIA 1MQRA 4Z2HA 3VIHA 1V08A 4PEEA 4HZ8A 3CZ8A 4H8UA 2OYMA 1EQPA 1H2JA 3AMCA 2ZXAA 4R27A 1W1TA 3PZMA 4WIWA 1NWUA 4KH2A 2J7BA 1B3VA 4JFWA 4D1JA 1JI1A 5A6AA 3WH7A 4N42A 3WNNA 4Z2KA 1E9LA 4W84A 1UZ4A 1EXPA 3POCA 3E1F1 5LA0A 1DTUA 1RH9A 1NARA 3N12A 3ZJKA 4M82A 8CGTA 3AS2A 4W89A 2XG9A 4E8DA 1KGWA 4UFKA 3OBAA 4MNMA 4ATWA 1JZ5A 2GK1B 3RILA 2BNJA 2Y24A 4AIEA 1UH4A 4PCTA 3WD3A 5C71A 3LPFA 4MDPA 3WD4A 1CEOA 1JD9A 4OOZA 1KQZA 2CNCA 2VNCA 3VGHA 4AMCA 4CU8A 2WM0A 1MWOA 8A3HA 1XD0A 2PWHA 1UG6A 1UUQA 3K1DA 1WDQA 3O2LA 3GZAA 2NT0A 2BXYA 1HJQA 1LG1A 2XGBA 3ZQ9A 2DIJA 3W28A 1MXDA 2VUYA 4U5KA 2VZVA 1K9DA 3WN6A 5AYIA 1H0GA 2UY3A 4J3TA 2WMHA 1W3HA 1JYNA 1I1XA 1QHZA 2C7FA 4PMUA 4QLKA 3RCNA 1B30A 3WENA 1CGUA 4XV0A 1QW8A 1E6NA 1OWQA 1OBAA 2WCAA 5I23A 2D0FA 1HL8A 1U33A 1OIMA 5EFFA 5E0FA 1UWIA 1KFWA 3A47A 5JUVA 1UR8A 4L4OA 5E6ZA 4CU7A 2WXDM 4KRUA 5HBFA 3B9DA 2VI0A 3AYSA 1GJWA 4PUDA 2BS9A 5CQ1A 3PZVA 3UESA 1WDSA 1E56A 2D3LA 1ODUA 3AZTA 3CHCA 1JZ2A 3AMDA 3GXDA 3RJXA 4FLOA 4F8XA 5A8PA 5JIPA 5HPCA 1FH7A 4UTFA 2RGMA 3VIPA 1QNOA 3NCOA 2DDXA 3KE0A 4NF7A 4AZ7A 5AC5A 3KEHA 2OYKA 1UHVA 4W7UA 1U2YA 1US3A 1E43A 4MB5A 3WEOA 4D6FA 3AXIA 5IHSA 1E0XA 4M80A 2DH2A 3AFBA 4W85A 1W9UA 2FDMA 2OSWA 1Q6EA 3W6LA 1BYBA 1HJXA 1V3JA 4ATDA 1V0LA 5BWFA 1NOFA 1PX8A 4YPJA 3VD9A 2WSPA 2EPMX 1B1YA 4TOQA 4GI6A 4MAVA 4V27A 3CMJA 1J10A 2VR4A 5D8WA 1M04A 3SCTA 3WNMA 4AIOA 3CPUA 4CKQA 4P8VA 4EK7A 1W2VA 2PI6A 1K9EA 1GUVA 1OINA 5GPRA 3SURA 2J7FA 3ARWA 1ZJBA 2YL9A 1TZ7A 3MSGA 4FK9A 3PZQA 1V02E 1O6IA 1NOWA 3DYMA 3VDBA 4JZ5A 4AW7A 4UQCA 2YL6A 3AXXA 1E40A 1EIBA 3WMSA 3PZUA 1PX4A 1WZAA 3WFZA 4UCFA 1D2KA 5CJ5A 1VBUA 1QHOA 2W5FA 3PBGA 2ZUTA 1V6VA 1HN1A 2WK2A 4U5IA 2J7CA 1RD6A 3CZLA 3VU2A 4HMEA 5EFDA 1NP0A 5I0DA 4JFSA 3KL0A 1J9YA 1NWRA 2OWXA 3VPLA 1HP4A 3IAPA 3UG4A 5E70A 3WUFA 1XGZA 1JZ4A 4PMRA 3ZJ6A 1CXIA 3L4ZA 1XH0A 1JNDA 4AXNA 1F4HA 1MFUA 1ISYA 2YBTA 3ARSA 1QVBA 3FHQA 5I3DA 1GONA 4UFLA 4PBGA 3TP4A 4B9YA 3W81A 4JFTA 3WH6A 1ISXA 2VO5A 3AZSA 4AYSA 1VEPA 3CUGA 2CCRA 3VDHA 3SUUA 4AD2A 4TVUA 6TAAA 3VD5A 2JF7A 1UR0A 3ZT6A 3VM5A 3TOPA 4PMYA 4MJ4A 1EOKA 3GBDA 1MVYA 1KXHA 1GOWA 2YIHA 3RM9A 1GPFA 1W9PA 4AD3A 1ECEA 1M53A 3ZJ7A 1E0WA 1Q6DA 4HMDA 1FFQA 4WLCA 5I24A 3SCPA 1J0YA 4GQRA 3WEZA 2PWDA 4XB3A 2YDQA 4CD7A 2WAGA 3BLKA 4UZSA 2G3NA 3L2LA 2BY1A 2WHJA 4IISA 2YJQA 2IUZA 2EQDA 4YHGA 1BGGA 3ARUA 4ZXOA 3ZOAA 5E6YA 2ZX7A 2YOCA 3K4AA 3WIJA 3M46A 3OLDA 1ZJAA 3EDKA 2FH6A 3VGDA 3WDJA 4BZYA 1MW3A 1ITCA 1HX0A 1WO2A 2CESA 2PB1A 1IT0A 3OIHA 1NWSA 4XZWA 3BCDA 1OGSA 1XYFA 1D3CA 3VX1A 3VM7A 2EJ1A 2GJRA 1BPLB 1E73M 3SCWA 2TAAA 5JBDA 1UR9A 1DWIM 4P8WA 4EANA 3AZRA 3UG5A 2V5DA 1WDRA 2E9MA 1JXKA 4X0VA 1E5NA 4FMVA 1V3IA 2XVLA 2XVPA 1OD0A 2WVTA 2VJXA 1E4LA 4AZCA 3BAIA 2VCAA 1SR0A 4DWSD 3VUPA 3W25A 1OD8A 1V6YA 5BRQA 4HZ6A 1JYXA 3AROA 2ZIDA 3B9AA 3GNOA 3MSDA 3ZT7A 1LG2A 2PC8A 1UD6A 2D20A 3MANA 2UWFA 4X9YA 4V2XA 3G6LA 1LWJA 4D72A 3T2QA 3L4WA 1X6LA 1W32A 4FF5A 4UOQA 3VOCA 2WMIB 4KGLA 3VIMA 3F5KA 3F5JA 3CZJA 4J3WA 4Z2LA 2GVYA 1J0IA 2OLHA 4AD0A 2OWWA 2YA1A 3DHPA 2CIPA 3NYDA 3QR3A 1DHKA 5HPOA 5BXPA 1UA3A 1H49A 1E6QM 3BCFA 1B90A 3KL3A 4PN2A 2UY5A 3SCUA 3IJ9A 3OLEA 3AXHA 5DFAA 5FKYA 4UQ9A 3BAWA 4Q22A 4M29A 1UD5A 2D0HA 2YBUA 3VIKA 1WPCA 2Y8KA 4DWSC 2D22A 4QLLA 4UQEA 3T0DA 1E6SM 4TUFA 1CECA 1V6XA 3BC9A 5CLTA 5LA2A 4LYRA 1W1VA 1KXVA 4W86A 4B15A 1UKQA 1LL4A 4UOZA 3WMBA 4DWSA 3UEQA 2YLLA 1KBBA 3FAXA 4HMCA 2RGLA 1GNXA 2V3GA 2Q8XA 5DEZA 3CUIA 2WSKA 5ABFB 4HPGA 4UR9A 1UA7A 1MXGA 2OSXA 3RMEA 2X09A 1KR0A 4MAZA 5CGMA 5CSUA 2Y2WA 2GJPA 2XFFA 2BHYA 4PTWA 4WF7A 1VIWA 3FAWA 4CCCA 3JUGA 2ZICA 2J4GA 2ZUSA 3WMCA 3QHOA 4BCEA 1WZKA 3O6AA 1H1NA 1HP5A 4U2ZA 1AQ0A 1ZBWA 2QMKA 2VQUA 4MDOA 4CN1A 4U33A 1MQQA 4ZENA 1JAEA 2DIEA 3BAJA 2WC3A 1CGWA 1US2A 2NW0A 4DUVA 4PMDA 4AC1X 4TTGA 2WHKA 2BFGA 1QBAA 2BY2A 3AIVA 1E71M 2DSKA 1JXJA 1TA3A 3GDBA 1JZ7A 3ZJ8A 2GJXA 5FD0A 4CCEA 4CD5A 4JCMA 1H4PA 4MNKA 2AOSA 5IDIA 4C7FA 1V3MA 4HOWA 3SCQA 1UWQA 1CDGA 1UH3A 4MPKA 2WB5A 1CWYA 1HNYA 5I6SA 2XIIA 2WMGA 4AEFA 3U5UA 3CIVA 3MO4A 2CKRA 2G41A 3APGA 3RPMA 3FHAA 5JBEA 5I5RA 4OKDA 2BHUA 2XM2A 5ECUA 2WHLA 3GBEA 3BXWA 1ZBVA 3W24A 3AIUA 2VX7A 1JIBA 2O9PA 5JIWA 3SCSA 5DO8A 4P7RA 1JZ6A 1XSIA 1C7SA 1BG9A 1BYDA 1B9ZA 1BLIA 1OB0A 1MFVA 2EPOA 4WKAA 3N1AA 1B3YA 4GXPA 5GNZA 2AMGA 4W8AA 2JIWA 4P7NA 2VX5A 3THDA 2XM1A 3GH7A 3W27A 3NDZA 3ARQA 1H09A 7A3HA 3WQWA 3AHZA 5IHRA 5BYWA 3N18A 1OM0A 1E70M 3WUEA 3WDIA 1XV8A 5DMYA 4WJXA 1MW1A 1FHLA 3ZR6A 3QOKA 3I3DA 2YL5A 1R7AA 3UERA 2XFYA 2YKKA 4H2CA 1J18A 3CBWA 1P6WA 3VD7A 2WVVB 1HKKA 4BF7A 4PMZA 1TCMA 2W66A 1XC6A 2X2YA 2F61A 3D5HA 2VR5A 3CUJA 5A69A 5ABHA 1EQCA 3S2CA 2J7EA 3VGBA 1VEOA 5A6MA 5TD4A 3W0KA 1DWJM 4KWUA 1WB0A 1JZ8A 3D3AA 3CH9A 5JBFA 2J7HA 1E15A 4OUEA 4GINA 3POHA 1J11A 1TMQA 2FH8A 1V3LA 1JI2A 2JF6A 1V6WA 1CPUA 1KGUA 3RDKA 2X0HA 3A6OA 1Q6GA 4FLQA 2EEXA 1GOOA 4UFIA 1CENA 3VNYA 5CGTA 4D6IA 3DECA 1YQ2A 3AOFA 4WKHA 1BG4A 4TX8A 3K8LA 2WLZA 3NJ3A 3ARRA 3WNLA 3AICA 5F7UA 4UFMA 3VDCA 4IM4A 1HIZA 5I2UA 2BVTA 1DEDA 2XPKA 1Q6CA 3GXMA 3PZGA 4LPCA 1AQHA 2A3EA 2WC4A 5HOSA 1JDDA 1OGBA 1PBGA 4P8UA 2BY3A 1FP8A 3EMZA 1KBKA 3VVGA 4AD5A 1RPKA 4EKJA 5A1AA 2W63A 3WH8A 1LQ0A 4J3UA 4PTXA 3MV01 3VIIA 1QNPA 4H41A 3CO4A 3L4UA 5E09A 4B3LA 3FW6A 3EBVA 3WBAA 4U31A 1BAGA 1PPIA 3WDRA 3ARXA 3FN9A 1DWAM 1W9DM 2YL8A 1C8XA 3QHNA 4PMXA 3WF0A 1DWGM 1GHRA 5E9AA 3TTSA 1CXKA 3PZIA 3VIOA 2WZEA 1NH6A 1HKMA 4OBRA 3SUVA 1QHPA 3T0AA 4ACZA 1E6XM 4GKLA 1OCQA 1JF5A 2PWFA 3AIWA 2ZE0A 1SMAA 4P8XA 2YDSA 1XSKA 2BV9A 1B0IA 4JCLA 2DSZA 4URIA 1J0JA 2QLYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3L4Y A;  2BY0 A;  1JG9 A;  5FOO A;  1UZ1 A;  3WQ4 A;  4TVC A;  3CHE A;  1PAM A;  4PUE A;  4B16 A;  5FL1 A;  2Y5E A;  3OLI A;  1GOM A;  1PIF A;  4UFH A;  3WUG A;  2O9T A;  3WNK A;  2EPL X;  2HIS A;  1WZM A;  1W3J A;  2OSY A;  4LGX A;  4H8V A;  2PF0 A;  1KQY A;  4BQ2 A;  5HNN A;  1JL8 A;  2D24 A;  1G94 A;  5BXR A;  3AIE A;  2E4T A;  3RIK A;  4GI8 A;  1OT2 A;  4OJY A;  4AZ6 A;  1WP6 A;  5A6B D;  1E1F A;  4XUY A;  1EGZ A;  3CHF A;  2BVY A;  4CD6 A;  3F5L A;  3W38 A;  3I3B A;  3FND A;  3M6D A;  3ARV A;  5FIP A;  3WDP P;  3WL1 A;  2G8Z A;  1QI2 A;  3GH5 A;  2WKL A;  4UFJ A;  1C8Y A;  4C7D A;  6CGT A;  4X0N A;  2O9R A;  2ZWY A;  5A2B A;  3VIF A;  4GI9 A;  4QFU A;  2PBG A;  2EPN A;  1L8N A;  2UY2 A;  3A4W A;  4JHZ A;  1LL6 A;  4RE3 A;  2YA0 A;  4JHO A;  1KWG A;  2WW5 A;  4H04 A;  4TTU A;  3VNZ A;  1HJU A;  3HU7 A;  1KB3 A;  2VZS A;  1QNS A;  3BAX A;  3MS8 A;  3M07 A;  4RE4 A;  3WD1 A;  5EBA A;  3BMV A;  1PZ2 A;  4WKF A;  2CBI A;  5LA1 A;  5CPT A;  3MMW A;  1E6Z A;  4CCD A;  1OSE A;  1R86 A;  5CPQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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