3EKZA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
345
structure length
334
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 130
structure length 334
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ekzA00
1JUBA 3C2FA 1OFPA 4OT7A 2GOUA 1ML1A 3TH6A 1GJPA 1I8JA 3O6CA 4QIUA 4CLMA 3EX6A 1WAUA 5LGXA 2J88A 3D0CA 2E5CA 3TSBA 2DU2A 1EA0A 3WK2A 1XM3A 3W87A 3NQFA 1KV8A 2HSAA 1RV8A 4IWWA 3LGEA 3C56A 4XTDA 4HNUA 3OVQA 3B8DA 4OGZA 3NGJA 4MZYA 4AAJA 1OX4A 4TU1A 3EEGA 1TV7A 3R12A 4OV4A 5DCDA 4Z1DA 2QAFA 4IUOA 2ZA2A 2VFEA 4TMBA 4K36A 3QW4B 1A53A 1M7PA 3MUXA 2VFIA 2H90A 4I7UA 4YLWA 3IIPA 1JR1A 5A8GA 1TPB1 3W9ZA 3Q94A 4JS3A 1FXQA 1JRBA 3G0UA 4CQ8A 4UTKA 4LS0A 3TXZA 5K4XA 4UFMA 3O6DA 2F7FA 2Y89A 2Y6ZA 4ICNA 2HS8A 2PURA 3UNDA 2Z6IA 3KRUA 3RMJA 1KFCA 4WY0F 3HG3A 4LUJA 3W1MA 2Z1BA 3UYCA 4YXGA 3LTSA 3M7WA 1MXSA 3KAOA 4EOUA 1Z48A 3NQEA 5I3KA 1B4EA 1FWTA 5HWJA 1TPH1 4FXSA 5BNKA 1G67A 4JTUA 3W76A 2EKCA 4LU0A 3KVJA 1Q45A 1GYNA 1MEWA 4K8HA 3O07A 5EKYA 2P0OA 1TRIA 2ZZ4A 2ATSA 3L5AA 4OBTA 3TFCA 1G69A 4UTIA 5FF7A 1Q6LA 2QDGA 3LV6A 3LB0A 3DI0A 3STGA 2RDWA 4MFDA 3NQ7A 4XUGA 3W22A 1GOXA 4LY8A 3RU6A 3RF9A 4M5PA 4NJKA 3C2VA 3HGSA 1ZJIA 4MZ1A 2V82A 1TPUA 1UBSA 2CFFA 2QAPA 1ZY9A 1DHPA 1LOSA 4JTIA 3W7MA 4HN4A 4O4WA 1D3HA 4S2BA 4LVDA 1RQHA 2VFHA 3THAA 1VCFA 4HSOA 3W7HA 3NO5A 3T44A 2E6DA 5AHFA 1CI1A 2J9YA 1BWKA 3DKJA 5AB3A 2CLEA 1K03A 2QDHA 1R2TA 1ME7A 1OHLA 4K37A 4MJZA 3MP3A 1OFRA 3PB2A 4AVFA 1LOLA 4JY8A 1ZAIA 3TX9A 1BWLA 1LCOA 2CLLA 2Y70A 3S42A 4E2BA 4AH7A 2CZEA 1VLIA 3LI0A 2Y61A 1QOPA 4N4PA 4WZHA 1NSJA 2WSQA 3LV5A 3E0IA 2QCGA 3IVSA 1YTDA 4FNSA 3SIZA 3MHFA 1G7UA 1Z44A 3N34A 3LCGA 3QSTA 1I4NA 2A7RA 4RXGA 1JJKA 3BG5A 4U28A 3TMQA 4A29A 4MVAA 4DF0A 3P74A 3TE9A 3P5ZA 4PFMA 4QQ3A 4GXMA 5BMXA 1XUUA 4P61A 3DFQA 3UY8A 1HO4A 3NL3A 2HTMA 3TW7A 1A5AA 3RFAA 5D32A 4RCXA 4PL2A 3BG9A 1VJIA 2NUWA 1KLYA 2NX3A 1R30A 3SI9A 1QO5A 2X1TA 2H3DA 3K30A 4AWUA 3HOJA 1SO5A 3OIXA 4O57A 3O1NA 4UTUA 1G4SA 5AC7A 4DEFA 1SQ7A 5AOUA 4UTJA 3L9CA 3NAVA 1OFDA 1GVSA 3H54A 4LVBA 3GR8A 3B03A 5FEWA 4HKPA 2GVJA 3LX9A 3R2GA 1IXPA 1YPIA 1NVMA 2RFGA 2J9XA 3GDMA 3WFAA 1FCQA 4FNRA 4Q4KA 4OU1A 1B4KA 3TNOA 4MLJA 4E38A 3QMSA 4D2JA 2FPTA 3ABRA 3BK0A 3W88A 4GUIA 3QFEA 5I3FA 4QISA 1R2SA 2WSRA 3B06A 1TV8A 3R13A 3UXDA 3NM1A 2QKFA 1R2RA 3W1QA 1WX0A 3GZ3A 1TO3A 2J24A 3GDRA 4IPIA 4AHPA 2Y7FA 3SR7A 3W7JA 1QPRA 2A7NA 2A85A 5AC6A 5KZMA 3B4UA 3TAOA 3T40A 4GUFA 2X1RA 3AJXA 4UTWC 1SPQA 3SGUA 3USBA 3TV8A 4NXSA 3SZ8A 1YPFA 4IQLA 3EWWA 7TIMA 2VENA 4ML9A 2Z2UA 5E93A 1FY6A 3NQ6A 3O15A 2YSWA 1H50A 5HINA 3GLCA 2GVLA 2G95A 3H55A 3P67A 2W6RA 5DBTA 2YW4A 1QPNA 3KVMA 3FS2A 2V5LA 4X22A 1Z41A 2WV8A 1I2RA 4PCFA 2R8WA 3G1HA 1JQXA 3GVGA 4FX7A 2P1FA 1H7XA 1RR2A 4IXHA 1YXDA 5CZSA 2H8ZA 1QAPA 3IVUA 1OVDA 2QCMA 1A5SA 1TRDA 1FWSA 1TTJA 3SFKA 3V75A 1VC4A 2E6FA 4X3ZA 4IMDA 1UASA 3HMJG 1MSSA 3L5LA 4O12A 4WX2A 1JCXA 3M5VA 2ZZ7A 3S5NA 4DPQA 3P7YA 3UWVA 1M5WA 3UZJA 1WV2A 2X1UA 3C52A 3GNNA 3W7LA 1JCYA 1UCWA 4N9CA 1TPC1 1DKWA 6ALDA 1SFLA 3C8FA 3LHWA 3LM7A 3SECA 4RR4A 1GG0A 3G18A 4EIVA 3SGZA 4UNLA 1OX4B 2C3ZA 1X7FA 4NX5A 4R7JA 2Y88A 4JTFA 4LC8A 5D33A 3W2NA 3PB0A 5HUPA 3M41A 1PE1A 4IMCA 3LOTA 4RX0A 3DI1A 1QCWA 2G5WA 3IV3A 4K6AA 3S1WA 2FB3A 4KKXA 1H7PA 3UWUA 3N9SA 2TYSA 2NX1A 2XN0A 4FHAA 4ADTA 5SWUA 1R47A 2RH9A 3MMTA 3NQ2A 4N6FA 5F2IA 1T8XA 3SY5A 3S5YA 2ZRVA 5HR7A 1ICSA 2Q8LA 5U4NA 3OVPA 2WKJA 5DXYA 1AG1O 3STFA 3NQVA 4A21A 3C0JA 1OK4A 4O0ZA 2DJLA 3LXAA 2EF9A 1WOAA 1W37A 3QMRA 5CPNA 1GVFA 5KITA 4LRTA 2A6NA 5CG7A 5TQLA 2WNNA 4HPXA 4NU7A 2W0UA 1W0MA 5K9DA 3MJYA 4JTSA 3S1VA 3E96A 1TCDA 1HG3A 3NA8A 3W73A 5LKYA 3UQNA 5FF0A 2NV2A 2VFFA 1WXJA 2Y63A 1W5QA 3MO7A 4JTHA 1BEUA 2C18A 1IXNA 1W3TA 3PY2A 3NPUA 4JX5A 1GVOA 3GDKA 4M6VA 3UPWA 3UWQA 2VKZG 3HJZA 1Y0EA 1VCGA 4DELA 2A6LA 3B04A 3QQ0A 5G1YA 3TXVA 3QRHA 1YYAA 1ZENA 2Y7EA 4HNTA 3W6YA 1LBMA 1IF2A 1ICPA 4NJJA 2GQ8A 4DO6A 1X1OA 1OX5A 4O28A 3S6DA 1O4UA 5FI8A 5F2MA 1SR9A 1KBIA 2TRSA 5CPLA 1G4PA 1QO2A 3F4WA 4MPQA 5F4XA 1QWGA 2HMCA 4O8RA 1KW1A 4GUHA 1K7EA 4L4LA 3E49A 4O13A 4Y8FA 1W3IA 4LT9A 5FF2A 3VE9A 3QQ1A 3PVFA 4GE8A 2ZRYA 3PWAA 4LRSA 3UY7A 4O11A 3UD6A 1IXOA 3UWZA 1UJPA 4BWLC 1U5JA 1NEYA 2PE4A 2NWRA 4WD0A 4N9BA 4RXFA 1GYLA 2WSYA 1OFOA 1P0KA 1EIXA 2IQTA 2WNZA 3EXSA 2E6YA 5DCBA 3S5ZA 1SW7A 2NUYA 4MY9A 3LTYA 3M43A 4IX0A 2E5BA 4DBDA 3NR0A 3B0VC 4NX0A 4DO4A 2CLKA 1F6KA 1OABA 2AQWA 3W7QA 4DF1A 4IJBA 5D2TA 3S5OA 3TMLA 3RNDA 4O54A 2NX9A 4J9JA 4BI5A 3W07A 5KMYA 2A21A 3A5VA 3OVRA 3ZS4A 4TX9A 2BLEA 2ZZ3A 2VELA 1L2UA 4A3UA 2YR1A 3L68A 5LNVA 5AHLA 2YX0A 4M7SA 3W7CA 5D2VA 1KM2A 4GUJA 4Z1BA 4JN6A 4CCCA 1DQWA 1SO4A 2FB2A 1AL8A 1OF6A 3KVLA 4NQ1A 3VNDA 3EWZA 2DORA 3GKFA 1P0NA 3WJYA 3P5YA 3NL6A 6TIMA 1TPWA 3LHVA 3TQVA 1NFBA 3LCFA 1TTPA 2Y85A 3NZ1A 1LBFA 5CZTA 4WQ6A 4S1FA 1FDZA 2I1OA 3IIXA 4N9EA 5FEZA 3A9IA 3MYOA 2X2GA 3NQMA 4AWTA 1HL2A 3BGJA 1W5OA 3GX9A 4PEKA 3W1LA 3ATZA 4IPJA 5D02A 2Q8ZA 2A7PA 2NZLA 3GR7A 4FIRA 3MP4A 5GVJA 4JDYA 1H7RA 2ZDRA 1GWJA 2YYUA 1DV7A 5F1VA 1DOSA 1EUAA 2GJNA 5D38A 1FUYA 3W84A 5KZDA 2DZWA 4EF8A 1JULA 5DXXA 1DJNA 5G2WA 4M6PA 5EY5A 3RLVA 1C9DA 4EF9A 1LORA 4JYDA 4LVGA 3TC7A 4Q33A 3GDTA 3IGSA 3FA5A 1NAL1 3ABSA 2QJGA 4JY9A 2RKXA 1YTEA 2YCEA 2DZTA 5F2GA 1PCKA 3CHVA 1GPWA 5TIMA 4ZL1A 4Z0JA 3U8GA 1TB3A 4ZQNA 4UTWA 1EX5A 2OZ0A 3KXQA 1KA9F 1RQEA 2VXNA 2DJXA 4O19A 3L5MA 5TBOA 1O95A 4AF0A 4O17A 1D9EA 3NXFA 1O60A 3HPSA 1W5NA 1VHCA 3NQ8A 5J5DA 2CZ5A 1N55A 2PRHA 3EXRA 3GXTA 1THFD 1DJQA 3LLDA 1EPXA 2RDTA 1YXCA 1DVJA 1HUVA 5CSRA 3P84A 4M7TA 4MYXA 3W74A 5HULA 2V81A 5KSWA 4MOZA 4I9AA 3MI3A 3W2UA 2UV8G 4Z1CA 4IMEA 1VYRA 3DU0A 4C1KA 2G97A 2YFNA 1DQXA 4X2RA 3TROA 3HQ1A 3P60A 5DY2A 4HT3A 5CGQA 1KM1A 4UXDA 3A22A 1FWRA 1YLVA 2VEKA 5C54A 5LNUA 1VYSX 2WOQA 1TTQA 4LS2A 2A4AA 1ZNNA 1F5ZA 1KM6A 5H91A 4YCOA 5HQEA 2WJZA 3W7OA 3G22A 3L21A 3PBWA 3QW3A 2X1SA 3LBMA 2V2HA 5CSSA 4LVFA 5G2HA 2R14A 3A23A 3GAKA 4UTTC 1EP1A 1K8YA 4O1CA 2CZFA 3KRZA 4NUWA 4OHQA 3PG9A 4UUIA 1S3HA 2XFWA 3G1AA 3STEA 4XKYA 5D09A 3NPVA 1Q6OA 3I7QA 5BMWA 3MBFA 3DXIA 1LYXA 1ME9A 2BTMA 1O5KA 3U6WA 3INPA 5C5YA 4FX8A 3W2LA 3PS7A 1XCFA 4MUZA 1ZHAA 4L4MA 4GWEA 5HR6A 3P80A 3CC1A 3QZEA 4LV4A 5E1QA 1NF0A 5LHFA 3FOKA 3YPIA 2ZQ0A 4MFEA 5IBXC 3FJ6A 3W1RA 1LM1A 1JCMP 3CU2A 1FDJA 2Y7DA 3NZRA 3KOFA 2W79A 3L65A 2WNQA 1JCJA 4NJGA 2P10A 3NL5A 3V1PA 4JGDA 4MLRA 3DZ1A 4NNAA 2B4GA 2C16A 3BW2A 1BTMA 2GQ9A 3EWYA 3W7RA 4QNWA 2Y7GA 2F84A 3TSDA 4AHQA 4BI7A 4KFPA 5DBUA 1YDVA 3DAQA 1H62A 4RJEA 3R8RA 4I7WA 1FDYA 1BKSA 4K38A 5K9XA 1TV5A 1OFBA 2Z6JA 5E0KA 1GEQA 5D03A 1QOQA 4QITA 4U4MA 5FEXA 3FKRA 2ISVA 2VEIA 2C13A 3WK1A 2VFDA 3IIOA 3EKZA 3ZWSA 3L0GA 4Y9AA 5IM51 1TQXA 1KM3A 3DFPA 2B7NA 2WO5A 3S0CA 4XWUA 1RZMA 2YPIA 4AMAA 1LLZA 1W3NA 5DN1A 2D73A 3B05A 1IIGA 4KFNA 1SUXA 1XXXA 2YDAA 4MKNA 3TK7A 1FCUA 1VR6A 3HBLA 1XUZA 2AGKA 3W1PA 5A5WA 2PCQA 2E09A 1G7VA 4FNQA 5H2ZA 5DY3A 1PS9A 1H7NA 1QMLA 3N2MA 4JTKA 3TUUA 1AW5A 4Y90A 1XDLA 5HJLA 1G4TA 5I3JA 4LOCA 3OBKA 2ZRWA 1W31A 4H3DA 2QJIA 3PR2A 1F7BA 1H60A 1Q6RA 3NQCA 4O14A 3MWAA 3L0NA 3STCA 4BWLA 3NPXA 3EWBX 4JR5A 3WJXA 3GK0A 5G1TA 5HWNA 2QR6A 1FCVA 3B0UX 1Q3NA 4JX6A 2OT1A 3KVKA 3MHUA 1OYAA 2JKPA 3DFSA 1RQBA 1W1ZA 4A22A 3G1YA 1FWNA 4UFIA 1CW2A 4O18A 4BFAA 3LHYA 1KTCA 3TQ0A 3LCHA 3L0KA 3BGGA 2QUTA 1H7WA 4JD4A 1L6WA 2A5HA 5G4EA 2QUVA 4R53A 2OMAA 1V5XA 5CZ0A 3HG4A 4XTIA 5G5IA 5KZEA 4JX4A 3G24A 3ZWTA 3QJAA 3JR2A 1T0OA 4C1LA 3QPYA 1EWEA 1K8XA 1SZGA 5HMSA 3BLIA 1HO1A 1GTHA 2VEPA 1M7OA 4NZJA 3N3MA 4CNOA 5FF3A 1TMHA 3W71A 2V30A 1OX6A 2NUXA 1QPQA 2ZRUA 1JUKA 1OFQA 2ZZ1A 3W1UA 2CLFA 2QEZA 3LBCA 1WDWA 2ZA1A 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 2RDU A;  1KFE A;  1QNV A;  5DCE A;  5U7S A;  1PV8 A;  3OA3 A;  4N9D A;  3S1X A;  2ISS A;  1S5V A;  2OCZ A;  3KRS A;  4AB4 A;  4JEQ A;  1WA3 A;  2QF7 A;  2ABA A;  3LHT A;  3C4U A;  2XN2 A;  1ZAL A;  4GUG A;  3GB6 A;  1K7X A;  2CW6 A;  3CIW A;  4K7Y A;  1H5Y A;  4Y96 A;  3TC6 A;  1T96 A;  1B9B A;  3I65 A;  4AXK A;  4IMF A;  4POC A;  1EB3 A;  4MZ8 A;  3I68 A;  4AEO A;  2NXI A;  2QCL A;  4JXC A;  4KWV A;  3WJZ A;  1XL9 A;  2O7S A;  1P4C A;  5AHI A;  2C15 A;  1X6U A;  1TYG A;  1XFB A;  1DL3 A;  3W1X A;  3L67 A;  3TA6 A;  2FDS A;  4G1K A;  2FIQ A;  1VRD A;  3TQK A;  2X30 A;  4CCD A;  2NXH A;  2C0A A;  3E02 A;  5L9F A;  1W54 A;  2DZX A;  4JYF A;  3NOE A;  3L66 A;  4EWN D;  5AHN A;  1SO6 A;  1YDO A;  5D2X A;  4RZ5 A;  1ICQ A;  3T4C A;  3UWY A;  3B0P A;  4CQ9 A;  3EXT A;  4HNN A;  4JYE A;  3CT7 A;  3EWU A;  1N8F A;  3ANY A;  3PSW A;  3CWN A;  3FJL A;  2NLI A;  4OE7 A;  2PRL A;  4WJE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UKQ A;  1G5A A;  2WZI A;  1E1F A;  4DUW A;  1OFP A;  2HVN A;  1ML1 A;  3LZ3 A;  1ECE A;  3CQH A;  3SN4 A;  2EPM X;  3AYS A;  3KBW A;  1EO5 A;  1EYW A;  3ARZ A;  2YBU A;  4NZC A;  3H2C A;  2E5C A;  2F2H A;  3TSB A;  1OCN A;  1L8N A;  4LUY A;  3WK2 A;  4FR6 A;  3W87 A;  1OBA A;  2E9B A;  4LGX A;  4JTQ A;  3KZP A;  3LGE A;  4R3U A;  1QI2 A;  1CXI A;  4XTD A;  1EJW C;  2PZN A;  3MUC A;  3ZVI A;  4IL2 A;  3AQU A;  3ZJ8 A;  1TV7 A;  3R12 A;  1EBH A;  3WSU A;  2P8B A;  2PWD A;  3WDR A;  3SB0 A;  4ICC X;  4XZI A;  1CNV A;  4C6N A;  3N2B A;  1M7P A;  3AXI A;  1E40 A;  4I7U A;  1BG9 A;  3C5Q A;  4G56 A;  4HZ7 A;  4ACZ B;  3MVI A;  5A8G A;  1TPB 1;  3V5O A;  3Q94 A;  1Q7Q A;  4LUS A;  3DFH A;  1FXQ A;  2NT0 A;  3BAX A;  4LS0 A;  1L2Q A;  5K4X A;  3O6D A;  2GGE A;  2Y89 A;  3GQY A;  2HS8 A;  3BIC A;  4X60 A;  2PUR A;  4AD3 A;  4BF5 A;  4DWS B;  3B0Y A;  3UJS A;  4YWS A;  4EOU A;  4U33 A;  1K9T A;  5C9Z A;  3NQE A;  1TWD A;  5HWJ A;  1G67 A;  3AAL A;  1E0U A;  3KVJ A;  1Q45 A;  2PFH A;  5GPR A;  2AKZ A; 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