3GAYA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with tagatose-1,6-biphosphate
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARGVSVEAELGTLGGIEQNTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural insights into the substrate binding and stereoselectivity of giardia fructose-1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 115
structure length 319
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gayA00
4O16A 4M6QA 4QNWA 3UD6A 2YYUA 4BK9A 1UBSA 1MEHA 4Z1CA 4MLRA 3B06A 2X1TA 1ZENA 1ICQA 5H91A 3W1TA 4O52A 1A5BA 1PL9A 5C2XA 3W1NA 3PG9A 1KFKA 2CLKA 1ICSA 3A23A 1SO3A 1QR7A 3WK0A 4LRTA 1LBMA 1EUAA 2ZZ4A 5E1QA 1I2PA 2B7OA 1LZOA 2PC4A 3NL2A 1BWKA 3PSVA 2QR6A 2Z1BA 4N4QA 5CPMA 3P62A 2VEMA 1NEYA 4GNJA 1JUKA 2A0NA 5K9XA 1VHCA 3QZEA 2P1FA 4NXSA 4HSOA 3G22A 4PEKA 3I7SA 1AW5A 1K7XA 2FQIA 2QUTA 2HS8A 3C61A 3G1SA 5CGQA 2E6AA 2ISVA 3NL6A 4XQ6A 3W86A 1NAL1 1KFCA 1TPH1 2CZFA 5DCBA 2NV2A 3LI1A 5I3JA 2DP3A 3ABOA 1KTNA 1TTPA 2J24A 4EIVA 1GG1A 3MP4A 4JIPA 2FJKA 1UUOA 4O12A 5G2WA 2ZRXA 3FKRA 3GR7A 3MI6A 5KSWA 1OX5A 5BMWA 4A22A 4LC8A 4IMGA 4Q32A 2ZCGA 5FEPA 4AHPA 2QCGA 3QF0A 3O6DA 1SUXA 2RH9A 4RXGA 4FHAA 1TPVA 3O63A 1W5PA 2TPSA 1WX0A 2DZUA 2NUXA 1SR9A 3NL5A 1DJNA 1P1XA 1LLZA 1DQWA 1T96A 4JXCA 4UTUA 4K7VA 3TQVA 5BNKA 1A5AA 3Q58A 3G8RA 4LNYA 2C0AA 3EWBX 2ZRWA 1W3NA 1YPIA 4DQWA 1ONRA 1SQ7A 3RU6A 3GIYA 5DELA 3BLIA 3DH7A 4LUIA 2C6QA 1KV5A 2YGYA 3IIXA 4E0CA 3SFKA 3NQ7A 1FDJA 4UTIA 4YXGA 4PC8A 5LGZA 4OE7A 3A24A 3S5YA 3LRKA 3CLMA 4JYDA 4XZ9A 1ALDA 2W79A 1RPXA 1H7XA 2CLEA 1L6SA 3P61A 3NOEA 4L4MA 5HR7A 4QAIA 2AAMA 3MO7A 3QC3A 4TMBA 4Z1DA 5AHEA 4GBUA 4ZMGA 1A53A 3W7RA 2I14A 3EX2A 4TU1A 4LOCA 3LDVA 4UTWC 4RR4A 2QCDA 1XFBA 4IUOA 3W7HA 3W70A 3O6CA 1EP1A 3NR0A 5AOUA 5TIMA 2QUVA 3TW6A 4ONVA 1I2OA 4A2SA 3QQ0A 2C14A 1BTMA 3T78A 3HQ1A 1W3IA 4CCCA 5EL1A 1GVOA 1DORA 2YZRA 4MY8A 4UTKA 3IIVA 2I1OA 4QQ3A 4TMCA 4YCOA 4QM1A 1H7WA 1VCVA 4DELA 4P61A 3CWOX 2J9ZA 2ZA2A 1DQXA 3MW7A 5HWJA 1XL9A 5F2MA 4JY9A 4BWLC 1G7VA 1G67A 1A5CA 1KA9F 3FJLA 4ZQOA 5D37A 4YMZA 1OFAA 4PH6A 3GB6A 4WXYA 4LS1A 2DZTA 5L6UA 3ATZA 3H54A 1KV8A 3EEGA 3TSMA 5G4WA 5CPLA 2ZRUA 3VKJA 4ZZ9A 2A85A 1MEIA 5F1UA 4I7VA 1W3TA 1TPC1 2IQTA 3MMTA 5I3GA 3M5ZA 3TUUA 5LNRA 4FNTA 3GLCA 2WNQA 5K2ZA 1L6YA 5F1VA 1VHNA 4NVTA 4LVBA 4UNKA 1FX6A 3S1WA 2GVLA 2QCDB 3RFAA 1TPEA 5HWMA 2PURA 3ZR4A 3EB2A 4Y9AA 1QO5A 5DCEA 5K3VA 1I2RA 1QO2A 2BXVA 1WOAA 2X1RA 3IEBA 5K4XA 2V81A 1JQVA 3BW2A 3NQMA 3O05A 4YCPA 4W9TA 2TSYA 3S5OA 2ZZ6A 1QPQA 2OZ0A 2ZYFA 1H7OA 4GWEA 2DZXA 3C2RA 3EXSA 5J5RA 3PBWA 3PVFA 4UFIA 2WNNA 3G1DA 2YCEA 1S3HA 3USBA 3G1AA 1X1OA 4BFAA 4N6FA 3WFAA 1WOBA 3T4CA 2A1YA 3BG9A 3P5YA 2AGKA 1TV7A 3CIWA 4MPQA 3IGSA 1EWEA 1ZAJA 3EWXA 5DLCA 2WJZA 3SZ8A 4MJZA 1ML1A 5GVJA 4UNLA 3GKFA 3U2OA 3P7YA 3TJXA 2A2IA 4GUHA 2CU0A 1RR2A 3F03K 3ZWSA 4GXMA 5IBXA 3KX6A 1DBTA 4U4MA 1QCWA 3LV5A 3I65A 3W1QA 3A9IA 3FS2A 2TMDA 1JUBA 2BX7A 4A2RA 1W31A 3L0KA 2FPTA 4O4WA 3OVRA 2GQ9A 1B3OA 2XN0A 7TIMA 2QAFA 3LI0A 1P4CA 4O13A 2DZSA 2TYSA 3M6YA 3RF9A 1LP6A 5E0KA 1ZY9A 2CW6A 3NM3A 3N9RA 2E5CA 1YTEA 3H53A 3NPWA 1LORA 2BLEA 4I9AA 4EF9A 5F4XA 1N55A 2B7PA 1M6JA 2NX1A 4HSNA 3N19B 2ZBTA 1W0MA 4GE8A 1VR6A 4AMAA 1ADOA 3Q37A 1W8SA 2VEIA 3QH2A 3L2IA 3UXDA 4DF1A 5G2IA 4ICNA 2FLIA 3GNDA 4MYXA 4ADSA 2Q8ZA 3W7DA 3B4UA 1YPFA 3O16A 2E68A 2B7NA 4K8EA 3BK0A 4ORIA 1YDOA 3G1HA 3LHWA 3NQVA 4O0ZA 3MYPA 2LLEA 2CLHA 3W1RA 3B0VC 1EB3A 1AW2A 3ANYA 5D2WA 5FF7A 3V1PA 3FOKA 4X3ZA 1VRDA 1FXPA 2Z2UA 2Y85A 3D0CA 2F84A 4R7JA 4QSHA 3SIZA 2H3DA 3BO9A 3EWZA 4O0KA 2A6LA 3R5EA 1V5XA 4Z0SA 1X8FA 2J9XA 4AB4A 2Y89A 5I3IA 5KMYA 1HG3A 3LXAA 3L67A 3SW6A 3L65A 3NQ6A 4RKAA 1BKSA 2PCQA 1I2NA 4JNMA 4ZVJA 4QITA 3EWUA 3W23A 3LX9A 1FWNA 4WOZA 3PF3A 1CW2A 4O14A 4DPPA 3ZS4A 2NWRA 5D38A 3R8RA 2Z6IA 3A21A 1WV2A 4A21A 1F73A 1RVGA 4XTDA 3G3MA 4RCXA 2Z0IA 3TXZA 4Y6GA 3DFPA 1YXDA 2Y7EA 3IV3A 1FWSA 3B0PA 4HT3A 4IXXA 2JK2A 1O5XA 3QYQA 4JS3A 2JBMA 1O95A 4WY0F 1EWDA 5EYWA 2J6XA 3EXRA 3IVSA 1VH7A 1K03A 2R8WA 2YXGA 5HMSA 1GTEA 4KWVA 1XDMA 1BWLA 4H3DA 1L2UA 1R2RA 1PCKA 1I45A 3W1XA 3LOTA 5FF4A 3SGUA 5KZMA 3S8HA 1EEPA 1M7OA 5J5DA 3LXBA 4PL2A 2EKCA 3EX4A 3EX1A 3PSWA 1E51A 3AJXA 3PC0A 4UMAA 1VC4A 2R14A 2DJXA 1LOSA 3OG3A 5LGXA 3MWAA 2W6RA 3LCHA 4LS0A 1Q6OA 4NZJA 1QPOA 3B04A 3M7WA 4AWSA 3UYCA 2VEPA 4NZFA 3QMTA 2B0MA 1TTQA 2QCCA 1AMKA 1KFJA 1UB3A 1R2TA 5AC7A 4MVAA 4IPJA 1OFEA 3W6YA 1ZCOA 2QCLA 3S0CA 1F7BA 3IGXA 2EPHA 2GJLA 4X2RA 3L68A 3UPWA 4JX6A 1W5NA 2E5DA 4UC5A 5F4SA 2G5WA 4WJEA 3BW4A 4KWWA 5D2VA 3KRSA 4HNVA 3FA5A 3G8EA 1H60A 4OQVA 4UR7A 3W2MA 5DY3A 1X1ZA 3TMLA 1TSIA 1GYLA 1YDVA 2ZA1A 2ZRVA 4NX5A 4LV4A 1O94A 3LTPA 3P81A 3E02A 3M1ZA 1ZHAA 4JEQA 3L21A 3W1UA 1IIHA 3QMSA 2Y7DA 4IQLA 3B0UX 3LHTA 1Q6RA 3I7RA 4QJ1A 3P67A 5FESA 1K8XA 1P0KA 1C9DA 3LRMA 1SW3A 1AW1A 4QIUA 3UNDA 3W83A 1W5OA 3FYOA 3S42A 1TQJA 3K30A 2Y62A 4NQ1A 1VZWA 4M7TA 4UTJA 3DZ1A 5KINA 3QM3A 3GZ3A 3ABQA 4LTSA 1WQ5A 2X30A 4R34A 1XBYA 4FIRA 4FB7A 3DGRA 1Q3NA 3O15A 5DXXA 2O7QA 3HG3A 2OX1A 2RDTA 1DKWA 3QFEA 1GVQA 3C2FA 2GQAA 3LHZA 1OYBA 3NA8A 3NQDA 1JCJA 1VS1A 3LCGA 3HB9A 3TH6A 4HNUA 2C3ZA 1QMLA 3W74A 2I9EA 1W54A 4R33A 4LV9A 4GRSA 4NXKA 1SW7A 4DBDA 3IRDA 3KXQA 2CZ5A 2YSWA 3ATYA 4FF7A 1ZAHA 3A5VA 2D73A 3T40A 3QQ1A 2ZRZA 5HINA 2GJNA 2V5LA 3DFNA 3N2MA 1JCNA 5CSRA 1OABA 5KTLA 1LRNA 2WV8A 3M47A 3M5YA 5A5WA 1VQTA 3QPZA 1M5WA 3RLVA 4PCFA 3PG8A 1F74A 3L0GA 3AO0A 3TC6A 4LVDA 4UFJA 1J2WA 3NVTA 3TFXA 1J4EA 2G97A 4RK8A 1OFQA 1H50A 2VXNA 4S2CA 5D03A 5AYZA 1QWGA 2NXGA 2OJPA 4N4PA 2VC6A 2ISSA 1FCBA 5BW6A 1ZNNA 1TPDA 3W7IA 4JTUA 1S5TA 1PE1A 1GWJA 1ME8A 3MP5A 2FDSA 3W2NA 3W84A 4IX0A 2VFFA 3TK7A 1FUYA 1VCFA 3M44A 3W75A 5HJLA 4FEZA 3DAQA 2FPYA 1H62A 4NJHA 4GUGA 1WAUA 1TQXA 1YDNA 4CLMA 1MSSA 3MI2A 5TQLA 3W9ZA 2ZTJA 3DFTA 1TJRA 2X1SA 3MI3A 1F6KA 4WUIA 4WX2A 5D2XA 2CZDA 3LHVA 3M0ZA 1TIMA 3NG3A 2ZRYA 2V8ZA 2E6FA 3CHVA 3OVPA 1IXPA 3W7PA 4FNQA 4UCGA 3CTLA 1O60A 4UFMA 5KZDA 5F2GA 2QJIA 3KHJA 1H61A 1WBHA 4Y90A 1G7UA 4O18A 2YW4A 2OCZA 1W37A 2A4AA 2XN2A 2NUWA 4O50A 3WJWA 3G1YA 3A22A 4A3UA 4J9JA 3GXPA 4HPJA 5AHIA 2DZWA 4YWIA 2QF7A 5CG7A 4NJKA 1V7YA 5HUPA 4RX0A 3GKAA 1UJPA 1FWWA 3DI1A 3B8DA 3TU9A 3QW3A 1Q6QA 1K8YA 1SZGA 2EAWA 2H90A 3DXIA 4NJGA 4S2BA 3LCLA 4BI6A 4RLIA 1LOQA 2YW3A 2R94A 4M19A 4X9SA 3KVKA 3S5NA 3G0UA 1TV8A 4GUFA 1DL3A 3IIZA 5LNSA 4OT7A 2VFHA 3UWVA 1JR1A 1NF0A 3DI0A 2ZZ3A 3FEMA 3W7KA 3GDMA 1LROA 2QKFA 4TO8A 1JCMP 2V82A 5D30A 1ZALA 2X2GA 3PUEA 1YXCA 2EGZA 3WJZA 2WQPA 3HGRA 4Q4KA 4DO5A 4GC4A 2QDHA 4JY8A 3T7VA 4ADUA 3W2LA 8TIMA 1IXQA 3VCRA 2F7FA 1QPNA 4EVZA 1XUUA 4O1CA 4G1KA 2G96A 1CX9A 3QPYA 2DJLA 4LS2A 3R12A 1LRTA 2NXIA 1ZFJA 1YADA 3THAA 3HGOA 4LVAA 4NNAA 3THQA 2FB2A 3G3DA 4IMFA 1VPXA 1D3HA 2NX9A 3O07A 4UIOA 1S5WA 5HWNA 4IGHA 4JX5A 3UXAA 4BR1A 1FDZA 3LB0A 2A7NA 5G1YA 1FDYA 5G1TA 3GXTA 1LM1A 1NVMA 3KRUA 3PBUA 2QCHA 3TAKA 6TIMA 3C2EA 3WK2A 3DBPA 3LTSA 1NF7A 3PAJA 4XUGA 1QAPA 4FNRA 2Y7GA 4UTTA 1LDCA 3P80A 5AHLA 2B4GA 2QCEA 4JTKA 5F2LA 3BGJA 4Z08A 3UWQA 1LCOA 5KZEA 3W7EA 4UR8A 3W2KA 2BWGA 3BW3A 3VE9A 1IXNA 3YPIA 1SO4A 4OV4A 3BV4A 2C1HA 3N9SA 2WOQA 5FF0A 4GJ1A 1C29A 3P8JA 3VFLA 1FQ0A 3SECA 4CNNA 3QJAA 1LTDA 3LBCA 3TROA 3N34A 5K7JA 3S6DA 3LGEA 2RDWA 5TBOA 5LHFA 3M16A 1OX4A 1LBLA 4XBSA 1H7PA 1SZFA 3WK3A 2PE4A 1H7RA 2BZNA 3W76A 4ZL1A 3W1AA 4TR9A 3GK0A 2YFNA 2ZA3A 2H8ZA 3C4UA 4NUWA 4OWGA 3QSTA 2P10A 1FCQA 4B5NA 2RFGA 1WBJA 3C52A 1OVDA 4FX8A 4P2VA 2A6NA 4GFSA 4HN4A 3M5XA 1H63A 1QNVA 1G4TA 1TRDA 3UY8A 4JN6A 2OT0A 5AB3A 2A7PA 4IXHA 3TKFA 4KKXA 1T0OA 2TRSA 2NX3A 1LBFA 4CNPA 4K39A 2O7SA 4CCEA 5CSSA 4UXDA 3W7CA 3EX3A 3N2XA 5K4ZA 1TMHA 3W71A 1YXYA 4M5PA 4N9BA 4R53A 2ZFAA 3M9YA 3WK1A 1TPWA 3HG2A 1KM1A 1SU5A 3C56A 3BPWA 3H55A 4NX0A 3HOJA 5MHBA 2GOUA 1U83A 1D3GA 3UQNA 3W85A 4FNUA 1KFBA 2ATSA 2XFWA 4HIBA 4ZQRA 3GDLA 4HNNA 1F2JA 6ALDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E3T A;  4M6Q A;  2YYU A;  2XM2 A;  1F3W A;  4BK9 A;  3SIM A;  3FGC B;  2FGZ A;  4MLR A;  3B06 A;  2X1T A;  4UNI A;  1MW0 A;  4EXA A;  5D9N A;  1ICS A;  2D2G A;  1NAR A;  2E9L A;  3BQ5 A;  1LBM A;  3WQ4 A;  1FOB A;  3NL2 A;  5JBE A;  3PSV A;  1K1D A;  3P62 A;  1JUK A;  2BVD A;  2I5Q A;  2A0N A;  1F6Y A;  5K9X A;  4GD0 A;  1CPU A;  4NXS A;  4HSO A;  3ZT7 A;  1W91 A;  3I7S A;  3T0D A;  2FQI A;  2HS8 A;  2Q01 A;  2HVN A;  1EX1 A;  3W27 A;  3NL6 A;  4XQ6 A;  1NAL 1;  3LI1 A;  1JI1 A;  4DZH A;  5I3J A;  2DP3 A;  4EIV A;  4JN7 A;  5EBA A;  3MP4 A;  2P3E A;  4MDO A;  1B3Y A;  3MI6 A;  4JFS A;  1OX5 A;  4H00 A;  4LC8 A;  4CNT A;  4PFH A;  2EG8 A;  3WEZ A;  2ZCG A;  3V0U A;  4HHH A;  3G6M A;  2DSZ A;  3Q4D A;  1JNE A;  1I60 A;  3FW6 A;  4FLO A;  4FHA A;  4RPQ A;  3CPU A;  3UZZ A;  5CAK A;  3GVV A;  1UZ1 A;  1BRL A;  2OO6 A;  4ECL A;  4HPH A;  3R11 A;  1U2Y A;  4UTU A;  1A5A A;  3G8R A;  3I3B A;  3VOG A;  1CNV A;  4ZE5 A;  2OYK A;  4R9X A;  2ONE A;  1W3N A;  1YPI A;  4DQW A;  1XJB A;  4Q8M A;  3CNY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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