3M7WA

Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
KTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Insights into the mechanism of type I dehydroquinate dehydratases from structures of reaction intermediates.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 92
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3m7wA00
4MOZA 2AGKA 1G69A 4UTMA 3OVQA 1NF0A 2NX1A 5J5RA 3UYCA 4AAJA 2VEPA 2CLKA 3DKLA 2JKEA 1AW1A 2X2GA 2WPBA 4JR5A 3BGGA 1I2PA 1OABA 2JKPA 3A23A 4POCA 4R53A 3TW6A 4DBDA 4FX8A 4JX6A 3O06A 4HIBA 1XDLA 2FPYA 2VEIA 1FY6A 4KFPA 3BGJA 3T44A 2QJHA 2PE4A 3HPXA 1QWGA 1TJPA 4WXYA 2OX1A 2QUVA 2C15A 3USBA 4MYXA 4JTLA 2FDSA 3N14A 4AWSA 4UUIA 4IPIA 2I14A 4O4WA 3FYOA 2TPSA 1QO2A 4UFHA 4D2JA 4K39A 2ZTKA 2X30A 1W1ZA 1G4EA 3WK3A 3W7GA 5HJLA 4DO5A 3ZR4A 4MVAA 3QQ0A 1O4UA 5EBUA 3S5NA 2QJIA 3TQ0A 3GIYA 3TV8A 1M6JA 3UXAA 1VYRA 2ATSA 2Z1BA 4JX4A 2E1DA 1K8ZA 1TSIA 1TB3A 5G2WA 1KFCA 2DZXA 5LZLA 4UIOA 3QMSA 1KFJA 1GG1A 2WSRA 3LLFA 3TQVA 1A5BA 4N9EA 3BPWA 1R46A 2BSLA 4O17A 2QAPA 5IBXC 3NQCA 3HG2A 3SIZA 1KV8A 2QDHA 3W1XA 4EIVA 3FYPA 5CZSA 1WDWA 3F4NA 4MPQA 5KTLA 2QDGA 5EYWA 3TUUA 1B4EA 3GX9A 1SUXA 2OCZA 1FWWA 3W7JA 3PF3A 2ZA3A 1JUEA 3W1LA 1R30A 4LRSA 3P7YA 3PAJA 2JGYA 2E09A 5F2LA 4PA8A 3S8HA 3DHFA 3MHUA 3G8RA 2FB2A 5K4XA 3C61A 4EVZA 1Q6LA 3P80A 1VCGA 2V2HA 4UTWC 1XDMA 3QC3A 3CEPA 4UMAA 3UZJA 3EX2A 4O18A 5J5DA 4DO4A 1XUZA 3CB8A 1KM0A 4A2SA 1GVSA 4JTHA 5D33A 4LS2A 3LCLA 3BG9A 3CPRA 1KM6A 4I9AA 1VYPX 2ISWA 5AN7A 2E5CA 3IV3A 2QCFA 1H7NA 4XWUA 4LT9A 1TO3A 1VHNA 3QZEA 4NZFA 2A6LA 4UTTA 3CC1A 1R2RA 5F4SA 1JVNA 5G4EA 3WJYA 3A9IA 3P67A 4MLRA 4HKPA 1YTEA 1GEQA 3A21A 4LW7A 4RZ5A 1H62A 2BLEA 4K7YA 1OYBA 3HBLA 4JDYA 4BWLA 3T4CA 1WV2A 4JDBA 2TSYA 1D3GA 5HR6A 3SW6A 3W23A 3GXTA 3PUEA 3MI6A 3LRKA 5K9CA 4P61A 3RLUA 1Z44A 3EEGA 3EXSA 1XKYA 3LHVA 3ZWSA 5ABTA 3LXAA 1XL9A 2CZDA 4UMBA 1XM3A 3LBCA 1FXPA 3IIXA 2FLIA 1TTJA 4QM1A 1T99A 1RQBA 1ICSA 4QSHA 5A5WA 3SJ3A 5FEZA 3MHFA 3ZS4A 1ZFJA 5T26A 4AF0B 5AFDA 1B9BA 1W3TA 4JIPA 2Y89A 4LWWA 3PM6A 4PH6A 1OFDA 3O6YX 5U7SA 3PY2A 5CSRA 2A7RA 3FEMA 4AF0A 5AC6A 2Y88A 3BG3A 4U28A 5TQLA 2Z0IA 1GJPA 1RV8A 3GR8A 4EF9A 1TPDA 2NV2A 5E1QA 2V2DA 3Q2DA 3KFTA 3SY5A 3EWWA 4DELA 3LXBA 1M7OA 1Z41A 4WOZA 1OVDA 4NU7A 3DI1A 1FBAA 2ISVA 2QCHA 4PODA 4CCDA 1F6KA 4AMAA 1TPC1 2GVLA 3W70A 5D03A 4UFMA 4K38A 1XCFA 4OWGA 1Y0EA 3L0GA 3NPWA 4HSNA 1FCVA 4IGHA 1GVOA 5D2TA 3QPZA 2ZBTA 1V7YA 1YLVA 3MBFA 5FEPA 1PV8A 4NZJA 2VFFA 8TIMA 1XBYA 1S5TA 3LCFA 1PIIA 3HOJA 2ZDRA 3VCRA 4XTDA 4YL2A 4AWTA 1OF8A 3BG5A 2YX0A 3BLFA 1MEHA 2EGZA 1JQXA 3LB0A 1KFKA 1W31A 4MZ8A 1EUNA 3MJYA 2E6DA 4O52A 3U8GA 1GZGA 4JEQA 4N6EA 2DZWA 1JCXA 4LOCA 4EF8A 1F05A 1LRQA 3NXFA 3PWAA 2X16A 1XUUA 1TPH1 4JICA 1LBFA 1XC4A 5FF2A 1B3OA 3R89A 4UFJA 4C1KA 2B7NA 2QAFA 4PTNA 4A3UA 5L9FA 3N2XA 1KA9F 1W5MA 4QNWA 5I3GA 5HR7A 4UCGA 3W7NA 3BO9A 4FIQA 1C8VA 3N73A 3ZFHA 4Z1BA 3SSJA 1VGAA 4NQ1A 1XI3A 3PB2A 4PC8A 3SR7A 3EXRA 4ADSA 1KLYA 5CKSA 1YPIA 2RH9A 2NWRA 3LV5A 1PE1A 4OBTA 5DY2A 3IRDA 1SZFA 5BW6A 3L21A 2NX3A 1LZOA 3OVPA 2JKAA 1FCBA 1OX4B 2FB3A 3EWBX 1DJNA 3G8EA 1VC4A 4JTEA 3O16A 1JR1A 4O1BA 2YGYA 2I9EA 4XQ6A 4FEZA 1GTEA 1E51A 3P74A 2A1YA 3FLUA 2J9XA 1I8JA 3TXVA 3L2IA 3HG3A 1EP2A 1SSGA 4Q33A 4WQ6A 1NEYA 4DF1A 2VXNA 3P8JA 1RPXA 3DFNA 2W6RA 3L9CA 3LXCA 1UBSA 3FA5A 1G4TA 4L4MA 3HO8A 4NXSA 3TH6A 2ZZ3A 4FNSA 4U4MA 1SW0A 4ICNA 4LC8A 1LBLA 2A85A 3NQ8A 1VRDA 1I2NA 2ZZ1A 3W83A 4K6AA 4CLMA 3GNDA 3PBVA 3VKJA 3W7CA 1KTCA 2WQPA 3U6WA 4LVAA 5L6UA 3K30A 4LRTA 5D2WA 1YDNA 1TQJA 1W56A 5CZTA 3G0XA 3M9YA 4IWWA 1W37A 1L2UA 3TSDA 3DZ1A 3BW2A 1VYSX 4XTIA 4WY0B 1U83A 5BMWA 3AJXA 5KITA 1QAPA 2BZNA 3FS2A 3W2KA 4IMGA 4GJ1A 5E93A 5G2HA 1F7BA 4HNNA 4ZZ9A 5CSSA 4AH7A 3ABSA 1UCWA 4WY0A 4TO8A 1DJQA 2CLHA 4I7WA 2JK2A 1G7VA 1Q6QA 4RJEA 2C14A 3UWQA 3KXQA 3Q94A 4AHPA 4K8EA 3O1NA 3W1NA 3W86A 3MUXA 4HNVA 3G1DA 4M5PA 3W2LA 4CCCA 1EEPA 5DCBA 3W7HA 1G7UA 3L5MA 1QMLA 3GKAA 4JY8A 2J27A 4TR9A 2G5WA 4LVBA 3S9YA 2R14A 1FCQA 3TNOA 2GQ9A 1T8XA 3G3MA 3GNNA 3P5ZA 2YXGA 3NNTA 3W3OA 2B7QA 1WOAA 1NAL1 1XBXA 3SECA 5U4NA 1TPEA 3S1VA 3QM3A 2C3ZA 4N6FA 5F2GA 3IGXA 4OU1A 3W1RA 2A21A 3M16A 3QSRA 4YCOA 5LGZA 5F1UA 3CWNA 4NJIA 3LV6A 4CNNA 3PUOA 1TJRA 4BI7A 1SZEA 2QCCA 1F73A 3W84A 4GFSA 1PCWA 2A7NA 3THQA 3EKZA 1FUYA 1H7WA 1PVNA 5D05A 3RF9A 1GVRA 3SFKA 1TRIA 3LHYA 1DBTA 3NQMA 3L66A 5AYXA 1HO4A 1I45A 1KM4A 1QNVA 3N2MA 3CHVA 3CEUA 3LCIA 1WX0A 2ZCGA 3V75A 1DQXA 1H1ZA 3MBDA 4Z0JA 4JTJA 4N9DA 2C16A 4NT0A 2YDAA 4UXDA 3E12A 2KZHA 5EL1A 3LI0A 2FQIA 4I7UA 3MP5A 3TX9A 1J4EA 1VH7A 1W5PA 1SPQA 2C1HA 4IMFA 2J24A 3QJAA 3WK2A 2DZVA 2EKCA 4DF2A 1NSJA 4UNLA 3SGUA 5D2XA 5AHFA 5HUPA 4NNCA 3HGOA 3NGJA 4UTKA 1ALDA 3HG4A 4LVGA 1C29A 1BWKA 3TU9A 3BLIA 2GQAA 1ZHAA 4QISA 4GWEA 2DU2A 3EX1A 2V82A 3SGZA 5HULA 3INPA 1L6YA 2V81A 1QDSA 4ZQPA 2QCEA 1YADA 2NX9A 4O13A 3PS7A 4M7SA 1HO1A 1K7XA 1ZJIA 2TYSA 3UWWA 2ZZ2A 5KZMA 3W7KA 1TTQA 3T78A 4JYDA 2ZYFA 1J5TA 1YDOA 3HPZA 3W7OA 3NM1A 4JTFA 1JCNA 1K7FA 2V0TA 2O7SA 3OHIA 1CW2A 3G18A 4DEFA 4UTUA 3W07A 1XBVA 3P60A 1C9DA 1L9WA 2Y61A 1S5WA 3LGEA 2G97A 1GTHA 3NPXA 1JCMP 3KVJA 3C6CA 1TTIA 1I2RA 3C0JA 1N55A 2G96A 4Z1DA 1VCFA 2ZRZA 5FF4A 1SR9A 4ZMGA 3TROA 5K9XA 5LKYA 1K03A 3KOFA 4JTGA 4CNPA 3QW3A 4H6KA 4B5NA 3TKFA 2DP3A 1VLWA 3C2VA 5LHFA 3LRMA 1WQ5A 3KRUA 3QMTA 4MLJA 1VR6A 3L67A 3NQDA 3EWYA 3NO5A 4ZVJA 1VLIA 3LLDA 2C13A 3G1HA 3W74A 4JTTA 5AYYA 3WJXA 4O0KA 4FHAA 1NF7A 3QMRA 3W7DA 1X6UA 2DZTA 4KWVA 3S0CA 3W7RA 1VZWA 1T96A 4JNMA 4ZQRA 3L68A 3P84A 3TJXA 5DBTA 2CFFA 2WNZA 3TAOA 1RD5A 2AAMA 3NQEA 1BEUA 4FNQA 4IX0A 1Q3NA 3MI2A 3ELFA 3CIXA 4NX5A 4MY8A 4O1DA 2F7FA 3LHWA 4UTHA 1VPXA 3G1VA 1GVFA 2NUYA 1IF2A 4C1LA 3TSBA 2E5DA 4OE7A 1GYNA 3W7QA 4AWUA 4IXXA 4FX6M 1H61A 3C2EA 3KVKA 1H7OA 1P0KA 1O95A 2YFNA 3STCA 4HT3A 3VE9A 4R33A 4A21A 1F6PA 1YPFA 1M7PA 3I7QA 3IEBA 5FI8A 2JGQA 1KBIA 2FFCA 3P81A 2GUUA 4N9BA 3HJZA 1LRTA 1RVGA 4LC6A 3W1AA 1TRDA 4IQLA 2DZPA 4LV4A 3WK0A 2H3BA 5I3IA 1LOQA 2HSAA 2QUTA 2NV1A 4UTTC 3IIOA 4YLWA 3GLCA 4RR4A 5D04C 2DJXA 5SWUA 3M5YA 3RNDA 3E02A 1OFBA 4BWLC 1P5BA 4O19A 3DFQA 3YPIA 2YW4A 3LCWA 2VELA 1OFEA 1VCVA 3P61A 3G0UA 1QOQA 1PL9A 2Y7EA 4JGDA 1KTNA 4UC5A 3A24A 2OMAA 2GOUA 1JCJA 1HFBA 3KAOA 2PRHA 3C2FA 2Y85A 3OEXA 2J9ZA 2HS6A 3RFAA 4Y9AA 3QRHA 4QQ3A 1GWJA 2CWNA 3QW4B 3W1UA 1H7XA 1RQHA 4NJGA 5DCDA 4PL1A 3DFPA 1KFBA 3UY8A 4RK8A 1DVJA 1GPWA 2B0MA 1G4PA 3WJWA 3JR2A 1H63A 1KV5A 3GDKA 5HWNA 2WNQA 3JS3A 3NZRA 3NYZA 3GXPA 2QF7A 3HGJA 4JXCA 4HHPA 5DELA 4CQ9A 5CPMA 2ZZ4A 3H53A 4FO4A 5BMXA 1LOSA 5DXYA 4ADTA 1TPWA 1LLZA 2P0OA 1QPRA 1ZAJA 5A8GA 1OFPA 1JULA 3TDFA 3U2OA 3TMLA 3IVUA 1DQWA 3R2GA 1YYAA 5D38A 1KM5A 1FDYA 1W5OA 3GK0A 2CLEA 2NUXA 1EIXA 3C4UA 4MFDA 1TTPA 4OT7A 1QO5A 3N3MA 3DENA 3PG9A 5G2IA 1YDVA 1D9EA 2C19A 1DKWA 3M6YA 3RU6A 3EKLA 4N02A 2PRMA 4NNBA 1FDJA 4UTIA 5HINA 5FF0A 2CLIA 3OBKA 4TU1A 4FB7A 1Z42A 4WY0F 3MO7A 1OX6A 1IIGA 1FCUA 1P0NA 2WNNA 1JRCA 2YYTA 1CX9A 3LERA 2E5BA 2ZQ0A 3G24A 1TREA 4LVDA 1OFQA 4WJEA 1SSDA 1W8SA 3P62A 4MZYA 5LNRA 3TIMA 1LORA 2VEMA 1SO5A 2CW6A 4ZQOA 5FF7A 4CCEA 4ADUA 2Y7DA 4UFKA 1KBJA 1T0OA 1N7KA 3KX6A 4Y8FA 3DGRA 3PBUA 1A53A 2ABBA 3G22A 1KM3A 5EKYA 4NNAA 4RCXA 3QFEA 1YXYA 3TCEA 5TIMA 4LS1A 2FJKA 1BKSA 4Q32A 4OQVA 4RZ6A 4BR1A 2ISSA 3S5ZA 3W1QA 3TQKA 2Q3RA 3IGSA 4GXMA 2Y7FA 1DOSA 1O5KA 3UPWA 6ALDA 1FWRA 4Z1CA 3DAQA 3G3DA 3IVSA 2NUWA 3KHJA 3NOEA 1ME8A 2I1OA 3NG3A 1SQ7A 3DH7A 4MUZA 4UTLA 4XKYB 4IXHA 1U5JA 3NL3A 2EF9A 4FXSA 1YXDA 3MYPA 4RXFA 1AMKA 2OZ0A 3VE7A 3B03A 3S1XA 2Y63A 5LHEA 3UQNA 5CGQA 3DKJA 2QCGA 4O57A 1LLWA 4WD0A 3IIZA 2O7QA 4LNYA 1B4KA 3TR2A 1XBZA 1AG1O 1FWNA 1OX4A 3NAVA 4FX7A 3UPBA 1JUBA 2NXHA 1LOLA 3M44A 4K37A 2VEKA 2FPVA 1QFEA 3B05A 3L0KA 1A5AA 1I2QA 2WV8A 1FWSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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