3OHIA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with 3-hydroxy-2-pyridone
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLGGIEQNTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Rational design, synthesis and evaluation of first generation inhibitors of the Giardia lamblia fructose-1,6-biphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 112
structure length 319
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ohiA00
1H7XA 3C56A 1OJXA 1TIMA 3RMJA 3IIOA 3A5FA 1QR7A 3DFPA 3W2NA 3PBVA 2EAWA 3LHVA 3W7JA 3C2FA 1EX5A 1LDCA 2QJGA 4TR9A 1ZNNA 4TU1A 3S1UA 2EPHA 5HWNA 3GX9A 4LT9A 3NM3A 2ZTJA 3CB8A 5L9FA 5K3VA 3FLUA 3OBKA 2R14A 4XBKA 3CIWA 4LNYA 5H91A 2P1FA 2QAFA 1SW7A 3NQFA 1Z48A 1VLWA 1OFEA 2RDTA 5DCBA 3PB2A 5DN1A 1XM3A 4XKYA 2JKAA 2DJLA 3NQVA 1QAPA 3LM7A 3NQ7A 4FEZA 3LTPA 2GQ8A 2Y7FA 2H3BA 1RPXA 4TIMA 1VCVA 1HO4A 1M7PA 5LNUA 4GFSA 3CQ0A 5D2XA 4O14A 5AYZA 4MYAA 3OA3A 3W7MA 3DKJA 2Z1BA 1VPXA 3EWUA 4JGDA 1WDWA 3LTYA 5FI8A 4HHPA 3S8HA 4YMZA 4PODA 1ICSA 5EYWA 3GYEA 3UYCA 4UTMA 4TX9A 3NQGA 3NQ6A 4A2SA 2H8XA 4TMBA 4UFJA 3V75A 2DU2A 1OFQA 2DZPA 3FJLA 3IEBA 3NQ8A 3LCXA 3TW7A 3CT7A 4Z1CA 3IV3A 2NX1A 3LBCA 3B8DA 2Y7DA 3HG2A 1VHNA 3THAA 3W7IA 4DF2A 1K8ZA 3P8JA 4YCPA 2YGYA 1EWEA 1GT8A 3BGJA 5LSMA 3GKFA 1OYAA 2ALDA 2NXHA 2X2GA 3HGRA 2Y61A 1KTCA 4CCDA 3FS2A 1W5QA 1ONRA 5F2GA 2OCZA 5F1VA 1SR9A 2X1UA 1XCFA 1SO5A 1JRCA 1D3GA 2Z6IA 3LCHA 3LERA 1O4UA 3HJZA 3D0CA 1YTDA 4ADTA 4S2BA 3HMJG 3PUOA 4ML9A 3C52A 2W0UA 3EWZA 3B06A 1QCWA 2Q8LA 4PTNA 2JGYA 3I68A 3KX6A 3O07A 2E6YA 2B7NA 3WJZA 4PEKA 2DP3A 1QWGA 3QF0A 3HGSA 4UXDA 4BR1A 2Y88A 3PG8A 1ZCOA 3KXQA 2A6NA 1UUMA 3CPRA 4NNCA 1QDSA 2QDGA 3HIJA 2VEMA 4M19A 1K7EA 1YPIA 3TSBA 4FNTA 3SSJA 4IMCA 3LX9A 5EBUA 1R2TA 2CZ5A 5D2WA 4E38A 5AHLA 1JUBA 1O60A 1T0OA 3UWUA 1QOQA 3EWXA 5G5IA 4XUGA 1FX6A 4EVZA 2BTMA 3M1ZA 1W3TA 1M5WA 1WA3A 4QITA 3O63A 2NX3A 4B5NA 5DCDA 3W73A 5HJLA 4XQ6A 4C1LA 3KVKA 1YXYA 1EP2A 2FLIA 2WNNA 4S2CA 4O1AA 3GB6A 3L68A 3NQ2A 3TX9A 5TQLA 3E49A 2R91A 1VH7A 3ATZA 4BI7A 4TO8A 3WFAA 3U8GA 4JDYA 3UZJA 4DPPA 1S5TA 1EWDA 3G3DA 1S5WA 3CC1A 5A8GA 4MLRA 3W7CA 5K4XA 3PUDA 4H6KA 3M7WA 3TE9A 5I3GA 3KAOA 3QPZA 2J9ZA 2QKFA 3PSVA 1FCQA 2NX9A 1KFEA 1R46A 3HPZA 1PV8A 1ZAJA 3GAYA 3HQ1A 1LYXA 4R33A 5CG7A 1UCWA 4WOQA 3T40A 4CNPA 3HO8A 2J27A 3W76A 5LNWA 1VYPX 2FQIA 3KRZA 5G4WA 3QH2A 4LVFA 2OT1A 3LXBA 4AHOA 4NXSA 4LVAA 3CIXA 5AC8A 4U28A 2TPSA 3R13A 4JTJA 2WPBA 4MKNA 2QCFA 4RK8A 3N2MA 3LCFA 4QIUA 5IBXA 1L9WA 1KFLA 1FWWA 1B4EA 2JKEA 3NDOA 3L0KA 3JRKA 3LCGA 1VJIA 3GAKA 3UQNA 1OYCA 1IXQA 4GE8A 3W7GA 2YXGA 5F2IA 5EA9A 3LB0A 5G2IA 3MBFA 5CSSA 5C2XA 3LV6A 3NQDA 2DZTA 3C4UA 3LI1A 3MI3A 4S1FA 3IIXA 2V81A 2PRHA 4X9SA 3INPA 4JY8A 2A4AA 1KM5A 1LOLA 2R94A 2DZSA 5EMUA 5LGXA 1H63A 4ZZ9A 2RDUA 3NL6A 1PCKA 3G1DA 4FXSA 1H7WA 3LHTA 5T26A 3EB2A 1XUZA 4O1DA 4JTGA 3NM1A 3NOEA 2GQAA 4DO4A 2XFWA 3TXVA 4CNOA 4AAJA 4O50A 3NAVA 3P81A 1ZAHA 1EB3A 1NAL1 3S6DA 1HG3A 2WOQA 1KFCA 4YXGA 4NJJA 4BWLA 1JCXA 2QCHA 3C2VA 3T44A 5K4ZA 2VOMA 4O4VA 2FPVA 1VCGA 1AW2A 3FFSA 3SR7A 4UNLA 4UIOA 1ICPA 5G4EA 3S1VA 3DENA 1YLVA 1FXQA 4N4QA 2B4GA 4WY0B 4Y6GA 3OVRA 3M41A 4ZQNA 3NZ1A 2J24A 1FQ0A 3NQAA 4C1KA 3MP4A 4NJGA 2HMCA 1VYSX 5E0KA 3W86A 1XKYA 3LGEA 3B04A 4NUWA 3LI0A 1W5PA 4NJHA 3K30A 4JIQA 4JY9A 5HNRA 3RF9A 3BG5A 1TB3A 4JS3A 1V7YA 3THQA 1G7UA 3BW3A 3Q58A 1ZENA 3JS3A 4UTTC 2W79A 3TH6A 2JK2A 4UTWC 2QCDA 4AEOA 2Y6ZA 3L9CA 2E1DA 3IVUA 1SO6A 4OV9A 4BF9A 4JXCA 1C8VA 1TPC1 1UJPA 4M5PA 1NF0A 1C9DA 3HF3A 4R7JA 4AXKA 1KTNA 1JCJA 4L4MA 1TPFA 4YL2A 2X30A 3T78A 1MEHA 2H8ZA 5I3IA 5MHBA 3W84A 1YXCA 3ZFHA 2QCLA 5AC6A 1OHLA 3PR2A 1B3OA 3VFLA 1X6UA 3ABQA 3NZRA 1KFJA 1CI1A 1TMHA 2G97A 5KSWA 3TFXA 1T8XA 3O05A 1T99A 3W85A 5CPOA 1DHPA 3IIVA 3BLFA 3W07A 3MI6A 1A5BA 1H7RA 4LVBA 5DY3A 1FDYA 1TRDA 3C6CA 2ZQ0A 3R12A 3WJXA 3G1HA 2ISVA 3G0UA 4OV4A 3UXAA 3BARA 2J88A 3M16A 3S5NA 1NFBA 3NGJA 4LC8A 4RV8A 4EWND 1DQWA 2C15A 1DBTA 4QM1A 1ICQA 4MFEA 4O28A 5LNSA 4IMDA 4LVDA 3NR0A 2ISSA 4PH6A 4ORMA 3B0VC 4K8EA 4UTIA 1WX0A 4HT3A 3NEVA 3RNDA 2ZZ1A 4FNSA 4UMBA 1Q6OA 3E02A 1C29A 1NEYA 4AF0A 5LNVA 1P4CA 3NA8A 4R53A 3GNDA 1U83A 1G4PA 1VGAA 2BLEA 3TIMA 5E1QA 1R30A 2PURA 1I2OA 4O0ZA 3PC0A 1UASA 4Z1DA 5C6MA 1OFPA 1EIXA 1SSGA 2CLMA 4I9AA 3PF3A 3KOFA 1X1ZA 2EHHA 2VFGA 3HG5A 1QFEA 3W1UA 4MJZA 3BK0A 4MJMA 3S42A 1T96A 1WBHA 2CLFA 3G1SA 1SW3A 2OZ0A 5FEPA 2I14A 1BEUA 3LCLA 1YXDA 3GNNA 2V2CA 5I3KA 4FNRA 4JTKA 3L21A 3VCRA 4FO4A 2QCMA 3P7YA 4IXXA 4LTSA 4FHAA 4O57A 4Y9AA 1FCUA 4ADUA 4GRSA 4KFOA 4K7VA 1TQXA 4KWVA 2HSAA 1YDOA 4UFKA 5G2HA 1JULA 3IGUA 4AMAA 2ZTKA 4LS0A 1OF8A 4YCOA 2AQWA 1BWKA 5G2WA 3WK1A 5DBTA 3PAJA 2C19A 3NQCA 3PUEA 3QYQA 1A5CA 2A21A 4GUJA 3PY2A 1XC4A 2Q8ZA 1F73A 5U7SA 3LHWA 1OVDA 3W1TA 3MJYA 1KA9F 3FYPA 2CLEA 4POCA 3P60A 1SZEA 3UWWA 1KTBA 1MO0A 3VI2A 1TTIA 3QQ0A 1TYGA 2VXNA 3PBYA 3W1RA 3QSRA 4WD0A 3GDLA 1KM0A 1G69A 1NSJA 1RQBA 2DORA 3G24A 4HNUA 5AFDA 4Q32A 1GTHA 3LCIA 1MEWA 4M6PA 3BW4A 3LRMA 4JTSA 1KFBA 2RKXA 1OG0A 2QUTA 4O11A 3L67A 4RKAA 3CHVA 1H7PA 5TIMA 1W5OA 2QEZA 1FCBA 2DZVA 3VE7A 4DXVA 1VZWA 2PC4A 3O1NA 1FDZA 3PM6A 2WV8A 1XBYA 2C0AA 1GJPA 1QOPA 3WJWA 2E5BA 2QCNA 3IVSA 3LCWA 3LHUA 5D09A 4NX0A 1A50A 5DELA 4LS1A 4JX4A 5FEWA 4JN6A 2ZA3A 1ALDA 1UUOA 2YFNA 1H1YA 4K39A 1NF7A 4IWWA 4W9TA 5CGQA 5F4WA 2JKPA 1VCFA 2V0TA 4D2JA 3S5OA 1S5VA 5G1YA 4N6FA 3TAKA 3ZWTA 2GOUA 1SZNA 4ZMGA 3IRDA 4MFDA 4K8HA 4RZ5A 5DXYA 3NL3A 4X2RA 3IIZA 5J5DA 3E96A 1OFRA 1WYIA 4M6QA 4N6EA 4MIMA 5D38A 4NNAA 3C8FA 4JR5A 2ZA2A 3TDFA 1R2SA 4TMCA 4IOTA 3CWOX 3C61A 2X16A 3A23A 3NVTA 3FKKA 3TROA 4OBTA 4HSNA 1FBAA 2ZZ5A 5HR7A 4GUHA 2A5HA 3M5VA 3Q2DA 2ISWA 1YTEA 4NJKA 2ZRWA 4AWTA 4M6VA 3SIZA 1J4EA 1FY6A 1TV8A 2FIQA 4R34A 5HWMA 3M5YA 4DPQA 1H51A 1GVOA 4E2BA 3RLVA 1TRIA 3E9AA 3S1WA 2EF9A 3HGJA 4PL2A 1W0MA 1RQEA 4G1KA 1N55A 1W8SA 1M6JA 2ABBA 3TUUA 5FEZA 1HUVA 3B4UA 1DORA 2FPYA 2QJHA 5HUOA 1O95A 4UMCA 1TPWA 4JICA 6ALDA 1VHCA 3N9SA 3UNDA 2XN2A 2Y89A 1PVNA 5LHEA 1I2QA 3SGUA 4N9CA 3G18A 4NT0A 1TJPA 3MP3A 1TJRA 3O6YX 4IPJA 3M43A 3TSDA 1F7BA 3N2XA 4NZFA 3G1YA 2ZZ7A 4DO5A 4O19A 4DO6A 3DU0A 3W2KA 2YFOA 5EPDA 2G95A 3EEGA 3F4NA 3W7NA 1R2RA 3W1MA 1TQJA 3W72A 1FWSA 3TQVA 2ZZ6A 1SFJA 3DH7A 4HPXA 1ZAIA 3DFQA 3EX3A 3TQKA 1LTDA 3QMSA 1VC4A 5CZTA 4GXMA 2ZRYA 3MP5A 3TSMA 4M7SA 1EEPA 3DFOA 1PHQA 2Y63A 3M47A 1SO4A 2VC6A 4Z08A 2VEIA 1ZALA 1P5BA 3KHJA 3W7DA 3PVFA 2VFHA 1WOAA 3HB9A 2WSRA 3CEUA 3TK7A 2J6XA 3IIPA 2YDAA 2G96A 4ZQOA 3HOJA 4UTTA 5AYYA 3TNOA 1I2NA 1LLZA 2ZBTA 1ZJIA 4JX5A 2YZRA 1WOBA 4BI6A 1KLYA 1QO5A 3BGGA 3C2EA 3W7RA 2P10A 3MUXA 4A2RA 1XBXA 4O8RA 1NVMA 1GZGA 2NXGA 3HBLA 3RFAA 4CCEA 3N34A 4ZQCA 2Y7EA 1Q6LA 1MEIA 1IIHA 4A21A 1GYNA 4LVGA 1F6PA 1HO1A 4DBEA 4AVFA 4K38A 1PL9A 3DFTA 3KVJA 2Q3RA 4LU0A 5HINA 4O13A 2FTPA 4MY9A 3I7SA 3W2UA 5CKSA 3EX2A 4E2DA 5I3FA 2VENA 2X1SA 4ONVA 2ATSA 3QFEA 1IGSA 1B9BA 3GK0A 1K8XA 1OFBA 4HKPA 1SQ7A 5AHEA 1JQVA 1KM2A 1DV7A 4ADSA 1O5XA 2Z2UA 4RXGA 1OF6A 2GVGA 3P61A 3UZ5A 2H90A 1PE1A 1J2WA 4RLIA 3W87A 2QR6A 4LUIA 1XUUA 1H61A 3VE9A 1K8YA 3W9ZA 2QCGA 3QEZA 4O17A 5AHMA 4NNBA 3GLCA 5AYXA 2CLHA 5E93A 2ABAA 4O0KA 4H3DA 3R2GA 8TIMA 1ZFJA 3TMQA 1IXPA 3DXIA 2RHGA 1OX4B 4N9EA 3ATYA 1TPB1 3AO0A 3S5ZA 5D2VA 3B0PA 3P67A 3W7LA 1XBVA 2QF7A 4QNWA 1SUXA 4IMEA 1G7VA 1QPRA 3ZR4A 3WJSA 3STGA 5U4NA 3TA6A 4GJ1A 1LRQA 5G1TA 2VFDA 2WNQA 3DHFA 1K02A 2BX7A 4JTUA 4Y8FA 1F74A 2ZCGA 5LNRA 3SI9A 4FIRA 3P74A 4I7UA 4JTFA 2OX1A 1WQ5A 4PL1A 5KZMA 4QSHA 2OJPA 2NUYA 1SO3A 4JD4A 2BZNA 2XN0A 4H4IA 2EKCA 2WSQA 4I7WA 4EF8A 1VQTA 4IJBA 5D37A 3UWQA 1LZOA 3JR2A 5ABTA 1G4TA 4RZ4A 1IXOA 2E6DA 1BWLA 3GR8A 4RXFA 3H54A 3P5ZA 3USBA 5DLCA 1Q6RA 1LROA 2J9XA 5F2LA 3ABRA 3W2JA 4A29A 5C5YA 4UTUA 2GVJA 3IGXA 1PS9A 3W23A 3OIXA 5TBOA 3A24A 1F05A 3W7PA 2NZLA 3KVLA 3LTSA 4IPIA 5FESA 1SZGA 4UR8A 4UFMA 4GC4A 5D32A 4Q33A 3G0SA 5DCEA 1QO2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CGX A;  3BSG A;  3C56 A;  1OJX A;  1TIM A;  4YS1 A;  1H41 A;  3J7H A;  3MS8 A;  5HNN A;  1WZL A;  3ENL A;  2WJD A;  3LHV A;  3UG4 A;  1LDC A;  4E8D A;  4K2S A;  3S1U A;  1ZZM A;  4MNJ A;  2RGL A;  4QGC A;  3CB8 A;  3WNN A;  1TV3 A;  4FXJ A;  2HWG A;  5DF0 A;  3OBK A;  3AXH A;  4MWA E;  1ZJA A;  2XWD A;  3NQF A;  4B5V A;  1VLW A;  2RDT A;  1KGX A;  5DCB A;  1WCG A;  3PB2 A;  5DN1 A;  4MHB A;  4M0X A;  4WSJ A;  1QAP A;  1BRL B;  3LM7 A;  4MB1 A;  2H3B A;  1VCV A;  3GUG A;  4DO7 A;  1M7P A;  3CQ0 A;  5D2X A;  4O14 A;  3W7M A;  3UZX A;  2HK0 A;  4LAK A;  4ECL A;  1WDW A;  3LTY A;  4POD A;  2WB5 A;  2BY0 A;  2H8X A;  2Q71 A;  3KOY A;  4KGJ A;  3TW7 A;  3LCX A;  3LBC A;  3R6I A;  5I23 A;  2HBX A;  4IFK B;  4Q7I A;  1FVP A;  3POH A;  2WCA A;  4Q22 A;  1EFZ A;  4PFH A;  4AC1 X;  3W7I A;  3DEC A;  4YCP A;  3KZS A;  4AD3 A;  1OD0 A;  5LSM A;  3GKF A;  4GVG A;  5MF5 A;  4S3C A;  2DUA A;  3F2D A;  5F2G A;  4C7D A;  3USZ A;  5HQL A;  1XCF A;  1SO5 A;  3LCH A;  1YTD A;  3HMJ G;  3VKA A;  3C52 A;  3B06 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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