3QEZA

Crystal structure of the mutant t159v,v182a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
MDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSVRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 83
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qezA00
4QQ3A 4FX7A 1XBVA 2BTMA 1GJPA 2R14A 4RKAA 4MY1A 3G1AA 4GRSA 4AB4A 3OHIA 2C16A 1W5MA 5BRBA 3TSBA 5AC6A 3GNDA 4LVFA 4TMCA 4DEFA 4HNUA 3HPSA 4O10A 3P81A 1S3HA 3LM7A 4K37A 2WOQA 3TAKA 4U28A 3SW6A 2V2DA 3W86A 5AHMA 4JDYA 3PSWA 4NZJA 3W83A 4CLMA 3QEZA 3PUEA 2PRMA 1EIXA 4AVFA 1H50A 4N9BA 3HGRA 2QCGA 3GKFA 5G2HA 4JTJA 2FFCA 1QPOA 2DZUA 3LCIA 1H7RA 4R7JA 3FA5A 1SSGA 5AC8A 2WV8A 2VKZG 2R8WA 1U83A 3NAVA 1R2TA 2NLIA 1H7WA 1VHNA 2YXGA 4MPQA 3L66A 4Z08A 4QIUA 3OVPA 2V5LA 4RJEA 1T8XA 5FF7A 5KTLA 3UYCA 1TV8A 3S5OA 4K38A 3S1WA 1SFJA 1GVQA 3EWYA 2ZA2A 1OX4A 3TR2A 1GG0A 3P8IA 3WJYA 1RQHA 3FIGA 4K6AA 2XFWA 5KZMA 1ICQA 4DF1A 3G0SA 5I3IA 2D73A 1WXJA 3CLMA 3G1XA 4JTUA 4RZ4A 1KFKA 4OV9A 3GDMA 4POCA 4ML9A 4HN4A 3ABSA 3IVSA 4Z1BA 2YCEA 4CCCA 2GVJA 1I2OA 1GPWA 4IMCA 1L2UA 4WX2A 2H8XA 2ZQ0A 4BF9A 2VOMA 4NQ1A 3CWNA 2RHGA 4K8EA 4ADUA 2XN1A 3KVKA 3O16A 4UTTC 5CPLA 4FNPA 2BXVA 3BK0A 1KM0A 1LZOA 1Z41A 5I3JA 3TUUA 1UUOA 3Q94A 4GWEA 5AOUA 3EWUA 2QCDB 3SI9A 1XBXA 3L9CA 3N19B 2ZTKA 4RXGA 1LLWA 1YXYA 3W1LA 4GUFA 3LB0A 3EX2A 3UQNA 4BWLC 2ZA1A 2Z6JA 1AK5A 1RD5A 1G7VA 3RF9A 4M6VA 4PODA 1TPB1 3TXVA 4AHQA 3TROA 3UY8A 2DZWA 1J2WA 2FB2A 2QCLA 1QPRA 2Y88A 4JNMA 2XN2A 2ZZ5A 1XBYA 3HGJA 3UWUA 1SSDA 3TC7A 1LP6A 1OVDA 3R5EA 4DO6A 2YSWA 3GKAA 1SZEA 5K2ZA 3SR7A 1G69A 1GVOA 3RMJA 3LHYA 4QAIA 4AH7A 5LNVA 2Y62A 3TSDA 3IGUA 1F6KA 4UFKA 1ZCOA 2A6NA 4FNRA 1JCNA 3RFAA 3NQ8A 1FY6A 4M6QA 2GQ8A 4JTIA 4LVBA 3CIXA 1ONRA 2YYUA 3SJ3A 1AW2A 2FLIA 1JVNA 3MBDA 4MZ1A 3R89A 1KFJA 1GT8A 1XDLA 2ZRWA 1JCYA 4JY9A 2V9DA 3MHFA 1G4TA 3W1NA 3NNTA 1AL7A 3R8RA 2J9YA 1BTMA 3O06A 2V81A 4IPJA 4ICNA 2W6RA 2QKFA 1L6SA 2YFNA 3M5XA 2BX7A 3UWWA 2G5WA 5DXXA 1P0NA 4IMEA 2ZDRA 1HUVA 3G8EA 1AW1A 3M5ZA 5K9DA 3T7VA 3GXTA 1OYCA 5L6UA 5FEPA 4LRTA 3DHDA 2Y7GA 3ZS4A 3LERA 4P2VA 2EKCA 2QCHA 4JTHA 3W74A 1B4EA 2P1FA 1VCVA 3B05A 3TQKA 4H6KA 2CLFA 4C1LA 4XKYB 2TYSA 3QMRA 3EWBX 3OA3A 3S0CA 5ABTA 2RFGA 3NG3A 3W2LA 3C6CA 3VCRA 3W3OA 1B57A 1JUEA 3P82A 3QPYA 4AF0B 3A22A 2E1DA 5EMUA 3NGJA 1R46A 1TPWA 2A7PA 3G0XA 5I3FA 5D2TA 2C18A 4EF8A 2C19A 1SZFA 4Z1CA 1DL3A 3CEUA 2PURA 3O05A 4JTLA 3QQ0A 4YLWA 2Y6ZA 1KTCA 1QOQA 1VLIA 2ABBA 5CSSA 1KBIA 2FB3A 3G18A 1H63A 3R12A 3UXAA 3DBPA 1YDVA 5LKYA 2VFDA 4Z1DA 4WY0B 2JGYA 1I8JA 1M6JA 3TJLA 2H6RA 1KFBA 1ZAHA 2B7OA 3YPIA 4Y90A 3NQ7A 2PC4A 1FCQA 1X7FA 3MMTA 4UXDA 5CPMA 4IMGA 5H91A 5HULA 1QO2A 2Z0IA 1F7BA 4O15A 2GJNA 4BWLA 1LLZA 2Y7DA 2ISSA 5HWNA 2QEZA 3UD6A 4O16A 3QYQA 4A2RA 2NWSA 4QNEA 1OG0A 3GR7A 1PL9A 2OJPA 3P8JA 3VNDA 2V82A 1LRQA 3S9YA 5LNWA 1RZMA 1K02A 5K9XA 4DELA 4A29A 1HL2A 1O60A 3OG3A 3QF0A 3W7CA 2ZZ2A 1ADOA 4O54A 1GTEA 4JTEA 3QZEA 3W7KA 4I7WA 1U5JA 3MI6A 3NA8A 3A24A 1VQTA 1YXDA 5KITA 3QSRA 3L0NA 5D2XA 4QJ1A 4BI5A 1FQ0A 3PBUA 3E49A 5G1YA 2HTMA 5HR6A 3S5NA 1XBZA 1F2JA 3NPXA 1Q6LA 3FS2A 2VXNA 2A4AA 3NM3A 3F03K 2C3ZA 4XUGA 3RLVA 1XI3A 1PV8A 2YX0A 1FCUA 3BLIA 2O7QA 1NF0A 1PE1A 1M5WA 4NNCA 3B4UA 4O11A 2WQPA 5C55A 3PULA 4GUIA 1EUNA 3W85A 2Y70A 1A5SA 2H90A 1GVRA 1FXPA 3BW4A 3FYPA 1QPQA 3HGSA 4JGDA 3TX9A 4A21A 2GVGA 4LUIA 1FDJA 1UASA 3SGUA 6ALDA 3BV4A 4O0KA 2CZFA 4RCXA 3F4NA 2E6AA 4NXSA 4QISA 3DHFA 1ICSA 4MY9A 1IIHA 1C8VA 4IX2A 2V30A 5D33A 4JS3A 1KW1A 2C0AA 3W75A 4DQWA 2QUUA 5G4EA 3DFNA 2A21A 2X16A 3LOTA 4YWIA 3QH2A 4CQAA 4OU1A 2Y89A 5D2VA 4ADSA 3UWVA 4O50A 3LV5A 3E96A 4HSNA 3WJZA 4JX6A 2F7FA 3VFLA 4J9JA 2BSLA 3UWYA 4O0ZA 1F73A 1DQXA 1H5YA 1XUZA 3D0CA 5G2WA 4EIVA 5HUPA 4FO4A 2NX9A 3GXNA 1YTKA 3QPZA 3PWAA 2QUVA 2VFHA 3OIXA 4JIPA 2CLKA 3GR8A 4O4WA 1GEQA 4I9AA 3NPWA 4IGHA 3EWZA 4NJJA 4UMAA 3MI2A 5C54A 3OVRA 5BMXA 3PSVA 2A6LA 3DFPA 1JCLA 3QW4B 3B8DA 1W5QA 4LRSA 3KRSA 4GFSA 3GVGA 3S6DA 5HJLA 1OHLA 4IUOA 2ZTJA 4RV8A 1TTIA 3TAOA 3W71A 4ZQMA 2FQIA 1J5TA 1WBJA 1SU5A 3PR2A 3GIYA 2ISVA 3W22A 1WQ5A 3P74A 1Q6OA 3NVTA 1X1OA 1O95A 3C56A 1KM2A 4AHPA 1I2NA 2E6YA 2YW3A 4O12A 5D2WA 3M47A 3NEVA 3M43A 4X9SA 4PL2A 4O8RA 1ME9A 3P67A 3PBYA 3DFTA 2Y7EA 4XTDA 4YL2A 5FF0A 3L0GA 3CWOX 4WUIA 3O6YX 5LGXA 2J24A 3W07A 2W0UA 4LTSA 4D2JA 1QNVA 2EPHA 3I7SA 1FX6A 5AHLA 1I45A 1DV7A 1JR1A 3HJZA 3HBLA 3Q37A 1KV5A 5GVJA 4HNTA 3NOEA 4HNVA 4NUWA 1JCMP 5DBUA 4JTFA 3HPZA 5J5DA 1N55A 4UNKA 3LHUA 1TQXA 1O5XA 1R2SA 5D05A 2IQTA 4E2BA 3CT7A 5AN7A 3FYOA 3QMTA 3W6YA 1OFAA 2RDUA 1L9WA 1P1XA 2QCMA 4LVGA 5K7JA 4PA8A 1S5WA 1OFDA 4MY8A 1JQVA 3IIVA 4HIBA 5EYWA 1TV7A 4XZ9A 3L5MA 1K8XA 3E02A 3NQMA 5AFDA 3NL6A 4O52A 1P5BA 3KAOA 4LVDA 2NUWA 4TU1A 3QRHA 4WJEA 5CPNA 1M7OA 1NSJA 4O1AA 4JX5A 3UPBA 1B4KA 3N2XA 5I3GA 3TNOA 4XQ6A 1YTEA 1MEHA 4OHQA 2CFFA 5FF2A 1HO1A 4M5PA 4WXYA 1DQWA 3CC1A 4RXFA 4HSOA 1T99A 2ZZ7A 4JN6A 1KM1A 2V5BA 3MO7A 3E9AA 4ORMA 4U4MA 4NJHA 4CQ8A 1SUXA 4M7SA 1HG3A 4XTIA 3GAKA 2QR6A 2UV8G 3F4WA 1LOQA 3B0VC 3HG3A 3TC6A 1OYBA 1VCGA 3PS7A 4OV4A 3LRKA 3O6DA 3N34A 3P5ZA 1K3UA 3C61A 2E6FA 2ZRVA 4FXRA 3SSJA 4ALDA 5KINA 5LHEA 1OYAA 1WV2A 5DY2A 3P62A 4FXSA 4DXVA 3DFSA 4UR7A 1F5ZA 1VCFA 5TBOA 3TIMA 3UWQA 4AAJA 4O1BA 3WK3A 2ZA3A 3CIWA 3MW7A 2J88A 2HS8A 1UUMA 4O1DA 3INPA 3JRKA 4JTTA 4JEQA 1QPNA 5F1VA 5K3VA 1LCOA 4JYDA 3SGZA 3FJLA 3T4CA 4LW7A 3DI0A 4K36A 1KFEA 4PC8A 1H51A 1TPEA 4KKXA 1VRDA 3W7IA 5FF3A 1VYRA 4DPPA 1KM3A 2Z1BA 4JTSA 1OF6A 4UFJA 4JTKA 1C9DA 2DU2A 1IXNA 1H7XA 2B7PA 3NQDA 5HWJA 4YMZA 1BKSA 2I14A 5DN1A 4MVAA 2NXHA 2YZRA 4WD0A 5D38A 2WNNA 4UTMA 1T96A 4O17A 4ZQRA 4CNPA 4TR9A 3BW3A 3RK8A 3NZRA 4ZQPA 4IPIA 5CGQA 3CPRA 3LXCA 3W7EA 2QAFA 1P4CA 2CZDA 3H54A 2X1SA 1Q3NA 3SY5A 3PF3A 3BLEA 4EOUA 3GAYA 1XUUA 3LI1A 3ELFA 3G1SA 2YYTA 4FNQA 4JICA 3TDFA 3IV3A 3NQ2A 1JRCA 3C3NA 3EKZA 1RPXA 5F2IA 4FNUA 3UZ5A 1YTDA 3B0PA 3C2OA 1NAL1 2YW4A 2WJZA 3A23A 3K30A 1PCKA 2NV1A 3GLCA 4YCOA 4MYAA 3W7PA 1L6YA 3NL3A 2G97A 3MHGA 3EX3A 4HKPA 1VHCA 1VPXA 2EHHA 3AJXA 4BFAA 1G7UA 3W7LA 3SECA 1SW7A 5CZSA 1D3HA 3TFXA 3M6YA 4LVAA 1WOAA 3THQA 2NX3A 2PE4A 5IBXC 3W1MA 5D32A 1RR2A 1L6WA 2RKXA 2W79A 3ABQA 4G1KA 3W7DA 3VE9A 4NX0A 1GWJA 3KRZA 2A85A 1IF2A 2X30A 5DY3A 1DOSA 1Q6QA 3W2JA 5KZEA 4PH6A 3STEA 4AEOA 4GUGA 4LU0A 4K7VA 2JGQA 3S8HA 2NUYA 1O5KA 3F1QA 4Y8FA 1O94A 3IGSA 2O7SA 2TSYA 5HUOA 3W7OA 1EB3A 3SZ8A 4A22A 2JKEA 5D03A 3CEPA 3MBFA 2QCDA 1TO3A 2V0TA 3O63A 1Z44A 4TIMA 1FDYA 3W7NA 5D2YA 3E0IA 1LOLA 3LCLA 1TIMA 5K4ZA 2E68A 3W88A 1GZGA 1MXSA 1K7XA 1QWGA 4IX0A 4PCFA 5DLCA 4E2DA 5C5YA 3BPWA 4N9DA 3W1QA 2HS6A 3W2NA 4NT0A 3NL2A 3T44A 3KVJA 5E1QA 1PCWA 2TMDA 4JR5A 4O14A 3GYEA 4BI7A 1D3GA 2FIQA 5D09A 1GYNA 6TIMA 3LTSA 1UJPA 4OGZA 5T26A 4NU7A 2LLEA 3LBMA 5FF4A 1VGAA 2F84A 1LOSA 3TJXA 4LS2A 3LCHA 3LCWA 3BLFA 5BOOA 4TMBA 1R30A 1RQEA 1MSSA 4H4IA 3M0ZA 1XDMA 2YGYA 3W2KA 1TMHA 3JS3A 4I7UA 3IIOA 1LRNA 1R47A 3O07A 5LGZA 4HT3A 5AYYA 3PBWA 4DBEA 4UTTA 1TREA 1N7KA 4GJ1A 2WSQA 4WY0F 2B7QA 2NXIA 3M41A 1TYGA 5CZJA 5CG7A 3T40A 1P0KA 4MLJA 3AO0A 3MJYA 2WNQA 5EBUA 3MUXA 5HINA 1XKYA 3LRMA 5F2GA 5KMYA 5K4XA 1MEWA 2ZFAA 3TFCA 1VS1A 1IXQA 1YDOA 3G0UA 4DF2A 1RQBA 3KRUA 3M44A 3EXSA 2P10A 3H55A 4HNNA 1IIGA 3C8FA 4FIQA 3EEGA 4UC5A 3W7RA 2GOUA 1SPQA 3TCEA 3IVTA 1TPVA 4ZL1A 2EGZA 2WSRA 3A21A 1Y0EA 1JUKA 2A5HA 2I9EA 4N02A 4UTKA 4XWUA 1XC4A 3BG9A 4WZHA 3DI1A 4H3DA 5HWMA 1K8ZA 4CNNA 4JX4A 3W9ZA 5CPOA 3HG2A 3NM1A 1KFLA 3LX9A 4Q4KA 3LBCA 3L2IA 2FPYA 3DGRA 2GPTA 3GX9A 4HPJA 4XKYA 1WBHA 3S5YA 1OK6A 4DO5A 4OBTA 1H7OA 3THAA 1TJRA 1AMKA 1PIIA 1ME7A 3GDKA 4S1FA 1NFBA 3KXQA 5SWUA 1AL8A 3PM6A 5KZDA 2JKPA 1LORA 5AHNA 1JUBA 3MP5A 1W3NA 4O1CA 3SIZA 5MHBA 4AF0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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