3SCNA

Crystal structure of rice bglu1 e386g mutant
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 194
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scnA00
3WUGA 2D3LA 1GOQA 1FH9A 3ZR5A 1CEOA 3SUVA 3IJ7A 5A6BA 4DWSA 2ZICA 4AZ5A 1ZB5A 5FL0A 1KGWA 3TTSA 1N82A 5CXPA 1GQKA 1C8QA 2E8ZA 1DWAM 2J7CA 4HP5A 4TOQA 2WCSA 4HA1A 1F4AA 3B8SA 3WEOA 1BVZA 4OOZA 3GYCA 3UEQA 2XVKA 1Q4NX 1BG9A 5JIPA 1ZJBA 1JF5A 3U57A 1R8LA 1AQHA 1P6WA 2VX4A 5E0CA 3QHNA 2E8YA 1QHPA 1D3CA 3PZVA 3GNOA 4HMCA 4ACZB 2EPKX 2W63A 3WUEA 3PZOA 3WFZA 1GHRA 4DWSC 3WDQA 1KXQA 1H3GA 3OB8A 3MUAA 3THDA 2XIBA 1MW1A 4KGLA 3DECA 1JGIA 3ARQA 3AMKA 3CZ8A 3QOKA 4M81A 1BSIA 4UTFA 4K68A 4PMYA 5CPSA 4HZ8A 5DT7A 1GW1A 5GNYA 1EDGA 5HPCA 3LPGA 3EDFA 4HA4A 3IAPA 2EEXA 4MNJA 3FNDA 4IM4A 4D6HA 2OSWA 3OGVA 4GXPA 4UQ9A 1EHAA 1AVAA 1W9DM 2WC4A 5A1AA 1NOWA 1OD8A 3GH5A 4UQAA 1KCKA 3UG5A 3T08A 2X0HA 1JFXA 1UKTA 4J7RA 4FF5A 1IV8A 3WL0A 1ZBKA 9CGTA 3UCQA 2XWEA 3VUPA 4A3YA 2E9LA 3ZSTA 1TG7A 2QMKA 4P7NA 2VTFA 4XB3A 3EBVA 3CZGA 2IUZA 5D9MA 2XHYA 1JIBA 1FH7A 3ZT6A 4ACZA 4B9YA 2QV4A 2BVDA 4PCSA 3BMWA 4GO8A 1KQYA 1HT6A 1VJZA 4D6CA 4P8WA 3A4WA 1TUXA 1JDDA 2CYGA 3EDJA 1W1YA 4H7VA 5GPRA 3SCVA 1XCWA 1VFUA 4J3XA 3W26A 3VDHA 2WMKA 4H8VA 4OBRA 4W5ZA 5IDIA 1RP8A 3FXYA 3AIEA 1CXIA 1CGYA 4H8UA 1E3XA 4M80A 4D6IA 3ZT5A 4M82A 3M46A 3ARXA 1JYNA 2VR4A 5D9PA 3SCWA 4WKHA 2YIHA 2Y5EA 1SMAA 2J25A 1XH0A 4UCFA 5A69A 1VFMA 1GOIA 2XIIA 4QCEA 2WLYA 2J7HA 2EQDA 4F66A 2WMIB 5FKYA 1E6SM 4NSBA 4UNIA 3UETA 3W25A 1V0KA 2VJXA 1D7FA 1IZKA 4JKKA 1JZ7A 1VFOA 1XH2A 3FAXA 1J12A 4WLCA 3WNMA 4UOQA 3O6AA 4AD0A 3K8KA 1MW3A 5A94A 5JUVA 3GZAA 3MMDA 1GQLA 1VJSA 2D24A 4J27A 2PWFA 2QPUA 4DUVA 4W87A 3BSGA 1L0PA 3IJ8A 5LYRA 3BAIA 5DT5A 1UWTA 3AICA 1IZJA 3BAJA 3VIFA 1R7AA 3MUIA 2VR5A 2WZHA 1R87A 3WDJA 1E6QM 3UR7A 4U5IA 3BGAA 1UA3A 2YOCA 4MB3A 3CIVA 1K6AA 4OBSA 5CSUA 3VGHA 1J0KA 2O9RA 5HXMA 5M03A 2Y8KA 2WC3A 1HNYA 2Q8XA 5DEZA 5D9NA 5CPTA 2C7FA 2FDMA 3RJXA 1MWOA 2BY1A 3NDZA 1E6XM 1JNEA 1GOMA 2XVLA 3CHDA 3AS3A 3VVGA 1JDAA 3RIKA 1O7AA 1DEDA 1CDGA 4AD3A 4FLRA 4GINA 8CGTA 1JD9A 3U7VA 1H1NA 1UYQA 1KWKA 2WMIA 2VZVA 3WMCA 4PRWA 1TA3B 1HKMA 2A3CA 1O6IA 2C0HA 3AXIA 4PTMA 1U2YA 1V6XA 2NW0A 1GHSA 4PMNA 4AC1X 3CO4A 1H5VA 7CGTA 5CLTA 2WCAA 2F61A 1EQCA 3ARRA 2QHAA 2VCCA 4W88A 2WANA 2ZXBA 4IPNB 4IISA 4BQ3A 2G3IA 3AYRA 1PIGA 1H11A 2WM0A 2WMGA 1SR0A 1GONA 4OJYA 2F8QA 4Y7EA 2GJPA 4F9DA 3WN6A 2D0FA 3WKZA 2WVUA 4QP0A 3DHUA 4D71A 1ZBCA 2YJQA 4ACYA 3AHXA 1UKPA 4JZ5A 2EPOA 1PZ2A 5D9OA 1I1XA 3ZJKA 4EANA 4AIEA 1KFWA 3B9AA 2WLZA 3UERA 5A6AA 3WF3A 1UG6A 2WB5A 3JUGA 1J0ZA 4AD4A 3OGRA 2E9MA 4D6JA 1H0GA 1ZU8A 4JHZA 1C7TA 3GTNA 4CD5A 2WHLA 1XSKA 4W8AA 1W9XA 4IPLA 3VIHA 1CGTA 2XSBA 1X6LA 1XHGA 1C91A 2XM2A 1Q6CA 4PMUA 1QNQA 3AXHA 1K9DA 2XSAA 3ARSA 1UKQA 5A95A 1HVXA 1NWRA 5BRQA 4F9JA 1WZLA 1V6WA 3CTTA 3MUY1 1CLXA 2D22A 4BF7A 4Z2IA 2IXUA 1OB0A 3GXMA 1GUVA 3VD5A 2Y8VA 2VQTA 2DDXA 2VZUA 2Z1KA 5I77A 3ZT7A 1F4HA 2DSUA 4DUWA 3ZOAA 4KGJA 3CUIA 2WPGA 5A2CA 3A47A 1HF6A 3IK2A 6A3HA 3MU7A 4ML4A 4GKLA 2W5FA 4P7OA 5ABGA 3CZJA 4JHOA 3WD0A 1Z32X 1RP9A 3VGDA 1WAWA 4AY1A 2CERA 3KZSA 1NOFA 3ARTA 2JE8A 2VCBA 3J7HA 4P8XA 1OINA 3WBEA 1HJXA 1LLOA 1XSJA 1NARA 2GJXA 3WH7A 8A3HA 2ZUWA 3E1F1 4PMOA 1LL4A 5CSYA 1E6ZA 1BYAA 1ZL1A 2ZXQA 3AIBA 1UUQA 5KEZA 4H8HA 4U2ZA 4UFLA 2UY5A 1CYGA 1MFVA 3EMQA 3AIRA 3L4VA 3W82A 1G9HA 4UFHA 4ZFMA 1W1TA 5JBEA 1JZ6A 1E15A 3OLEA 4AZHA 3MSDA 3W4RA 3AHTA 5DF0A 1E4IA 2DT0A 3MS8A 1BTCA 2D0GA 4OZOA 5BYWA 1QI3A 1B1YA 2G3NA 3WNNA 2YKKA 2D3NA 1E9LA 4CU7A 4JL2A 4PMZA 2BXZA 3ZR6A 4D72A 2EJ1A 3GXDA 2XJ7A 3PZNA 2BY2A 2WCGA 1W3JA 3VMPA 1E6RA 3T0AA 4D6DA 4U33A 1PPIA 4LQ1A 3WNKA 4LXFA 4WKFA 4BQ4A 3G6MA 4CCCA 2G3JA 3ZQ9A 4MDOA 3GH4A 3WH5A 3VGBA 1E5JA 3SIMA 1QI0A 3U5YA 1WP6A 5FIPA 4CCDA 5E0FA 5F7UA 3ZSSA 2WBGA 3TOPA 4MADA 2WC7A 3OA5A 1K9EA 4U3AA 5CPQA 3VGEA 4B3KA 2W62A 4TX6A 1TE1A 5D8WA 3RM9A 4QAWA 4PMVA 4AYSA 4MJ2A 2E0PA 1CECA 4AZ7A 1VENA 3VPLA 3WF0A 5I23A 1JZ5A 3M07A 2PWHA 1H41A 4V28A 1V0LA 3WY1A 5I79A 4JL1A 3NYDA 4P7LA 1J18A 1E73M 6TAAA 3OZPA 3OBAA 2BHYA 2DH2A 1NM9A 2J8FA 3WDPP 1JXKA 3A6OA 3WNLA 1Q6DA 2ZWYA 1AQMA 4EK7A 3VD4A 1Q6FA 4HU0A 1W32A 3OIHA 3WF4A 2DIJA 1DTUA 5A6JA 5CGTA 1V3HA 1US3A 3OLDA 2J7BA 1CXHA 3EDKA 1B90A 4Z2JA 1J10A 2OLHA 3L2MA 5EFFA 1S46A 1KXHA 4V2XA 3ARWA 1E1FA 3WD1A 2XVNA 1HKJA 1HJVA 1V6YA 3GNPA 3NJ3A 3WMBA 4UQBA 1MXDA 2J62A 5BXSA 1PZ3A 2PI6A 3AI0A 3CHCA 4NZCA 4P8VA 4FLSA 2X09A 1UHVA 3PZ9A 4A4AA 1GNXA 1X1NA 5DFAA 2FGZA 3K46A 3WUBA 5C8BB 2Y2WA 3WEZA 2ZUMA 1BAGA 3LPFA 3F5KA 3KL0A 1VEPA 2DGAA 1OD0A 1V3JA 4LGXA 4J28A 5CGMA 5GNZA 2FHFA 1E70M 3VM5A 3HN3A 4W8LA 2XUCA 2CKRA 5IXEA 3MV11 1XSIA 3WD4A 1WZKA 3L4XA 1KCLA 2A3BA 1KBBA 4MAZA 4PTWA 2J4GA 3CBWA 1UD8A 4M24A 5LA2A 5FOOA 1MYRA 1GPFA 4DWSD 1QI4A 2VO5A 1UKOA 1W2VA 2DSWA 3G6LA 1DWFM 4NF7A 2XVPA 4JKMA 2O92A 3BAYA 1DWHM 1V02E 3MSGA 1E40A 3W24A 2YBTA 2Y24A 2YL9A 3ARPA 1MQRA 3AHZA 1GQIA 3VNZA 1HX0A 4Z2LA 3SUWA 2ZUSA 3APGA 3W28A 3WUFA 1E4NA 2ZX7A 2WVVA 1HJSA 3NSNA 3SCRA 3W53A 1JAKA 1NP0A 4NRSA 3AIVA 2XYLA 4PTXA 1E1EA 1CXKA 1VBRA 2VT0A 4HU8A 1DWIM 2J7FA 1QOXA 3WQ4A 3UG3A 4HTYA 2XWDA 3VMNA 3WNPA 3CMGA 2VI0A 4JFSA 4PBGA 2YLAA 4GO9A 1E4MM 4HZ7A 2J75A 2E4TA 1UZ1A 4AD5A 4D1JA 1ISYA 3K8LA 1XRVA 3B9DA 1HVQA 1WDPA 3AIWA 1I75A 3FHAA 4JFTA 5M5DA 4FK9A 4BS0A 1B0IA 1BHGA 4GZIA 2WZIA 2BV9A 3L4ZA 4MAVA 2NT1A 4Q7NA 3TTYA 2YBUA 1XYZA 3D5HA 1DWGM 4MNKA 2ZUTA 1UH3A 2HISA 2CHOA 2QF8A 3AZSA 4GPNA 3NUKA 1M53A 2VX6A 3W6MA 4CD7A 2V5DA 2BHUA 3FW6A 4E4PA 3N15A 1OM0A 1C3FA 1TR1A 4MB5A 4W86A 4ZEPA 3WBAA 3TTOA 4C7GA 3TA9A 1JI2A 4HA3A 2DIEA 5JBFA 1V03A 4LPCA 1RH9A 2YA1A 1HJQA 3WEMA 1EH9A 2XM1A 1C93A 4H41A 1BYDA 3ALGA 4GQQA 1KXTA 3SCSA 5ECUA 3VMOA 2PBOA 2VNCA 4WKAA 3L4WA 4WJXA 5EB8A 2EXOA 4MB1A 2XGIA 2V5CA 2ZUNA 2ZX5A 4M8UA 1E6PA 2C8NA 1UD5A 2ZX8A 3KL5A 1XGZA 2YL8A 4FLOA 3VNYA 4AMCA 3N9KA 1ZBVA 3D3AA 1UR8A 1FFRA 4RE2A 2ZX9A 1ITCA 5AC4A 4URIA 1BPLB 2VZSA 4PMXA 1EOKA 2XFRA 2ZUVA 2GK1B 4W8BA 1UD6A 3F5LA 4J3UA 2XVGA 4YN5A 2GVYA 2BY3A 1BQCA 4GI6A 3VIJA 1JYVA 1E0VA 4XV0A 5I78A 2UWFA 3M6DA 1JXJA 2BXYA 4DUXA 3BC9A 3MANA 4TX8A 1GZJA 4CGTA 1JYXA 2F2HA 2CBVA 3S6TA 1E6NA 4PSRA 4BQ5A 2WHJA 3PZGA 2O9TA 1HJUA 4KRUA 2BVTA 2FHBA 2WK2A 5A2AA 3KWXA 1CXLA 1GORA 2YA0A 3BLKA 1CBGA 3HU7A 2YLLA 3VGGA 3RM4A 3ZIZA 2WBKA 5IFTA 4ZENA 4AEFA 3MV01 3GBEA 3ZO9A 4J3WA 3A3HA 1AQ0A 1OWQA 3AHYA 4J3SA 1FP9A 3AMLA 4OOUA 3VM7A 4WF7A 5EBAA 1MXGA 4N42A 1BF2A 1ECEA 4GZJA 5A8PA 3CH9A 3W6LA 3VIOA 1H49A 1WDRA 4JAWA 4DM2A 3GXIA 4N0RA 5E6YA 1CLVA 2VX5A 1JZ2A 2GK1A 2DSKA 2A3AA 4PTVA 3S2CA 2W92A 1R86A 3NCOA 4P7RA 1BGAA 2CBUA 2O9PA 1UQYA 1ISWA 1C90A 1HP5A 1NWSA 2OWWA 5A6LA 1FA2A 2W91A 1B3WA 3BAKA 3AISA 4TTUA 1W3HA 3WSUA 2GJXB 4ZE5A 1SMDA 1MQPA 3T2QA 2WXDM 3LPPA 2CHNA 5GNXA 2J8GA 1E55A 3WQWA 1MW2A 4KWUA 2PWDA 3VDAA 1VFFA 1WDQA 3AOFA 1UR1A 1QNOA 3PZUA 1GQJA 4PSPA 4GQRA 3QHMA 3ZJ8A 4B9ZA 2DH3A 2BHZA 3HMCA 2DQXA 3DYOA 2YDRA 1W91A 4OIFA 3WQ6A 4Z2KA 1HJWA 3ZJ7A 2WKLA 2DPEA 3SCUA 1LQ0A 3F4VA 5A8OA 1JF6A 1US2A 3BSHA 1W1VA 1W1PA 2EPNA 2NSXA 3AMCA 3KE0A 5I24A 5FCZA 1JD7A 5ABFB 2W66A 4ZE4A 1OT1A 3ECQA 1JYWA 4W7UA 3AFBA 2UY4A 2W61A 4MNLA 3M7SA 4AIUA 5DO8A 2GSJA 3T0BA 2EBNA 3PTMA 1JDCA 3WDRA 4D6EA 2ZUUA 1Y7VA 2B31A 4AZCA 3VX1A 1U30A 3AS2A 1G5AA 2WWDA 3CPUA 1B3YA 1KGXA 4QDMA 1XC6A 1GCYA 3POCA 4QLLA 1ZS2A 5A6SA 1FFQA 4PEEA 1W3LA 3VDBA 1WB0A 1LWHA 1EXPA 1J0JA 2VQUA 3CUJA 3O9NA 4JKLA 1UKSA 4AZIA 4JCLA 1HL9A 1QBAA 4W5UA 2OWCA 1UQZA 2QMJA 2WHKA 1XV8A 4S3KA 4Z2GA 1VBUA 3SUUA 1OT2A 3QR3A 1BGGA 1GVIA 1UWQA 2VMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WUG A;  2D3L A;  1GOQ A;  1FH9 A;  3ZR5 A;  1CEO A;  3SUV A;  3IJ7 A;  5A6B A;  4DWS A;  2ZIC A;  4AZ5 A;  1ZB5 A;  5FL0 A;  1KGW A;  3TTS A;  1N82 A;  5CXP A;  1GQK A;  1C8Q A;  2E8Z A;  1DWA M;  2J7C A;  4HP5 A;  4TOQ A;  2WCS A;  4HA1 A;  1F4A A;  3B8S A;  3WEO A;  1BVZ A;  4OOZ A;  3GYC A;  3UEQ A;  2XVK A;  1Q4N X;  1BG9 A;  5JIP A;  1ZJB A;  1JF5 A;  3U57 A;  1R8L A;  1AQH A;  1P6W A;  2VX4 A;  5E0C A;  3QHN A;  2E8Y A;  1QHP A;  1D3C A;  3PZV A;  3GNO A;  4HMC A;  4ACZ B;  2EPK X;  2W63 A;  3WUE A;  3PZO A;  3WFZ A;  1GHR A;  4DWS C;  3WDQ A;  1KXQ A;  1H3G A;  3OB8 A;  3MUA A;  3THD A;  2XIB A;  1MW1 A;  4KGL A;  3DEC A;  1JGI A;  3ARQ A;  3AMK A;  3CZ8 A;  3QOK A;  4M81 A;  1BSI A;  4UTF A;  4K68 A;  4PMY A;  5CPS A;  4HZ8 A;  5DT7 A;  1GW1 A;  5GNY A;  1EDG A;  5HPC A;  3LPG A;  3EDF A;  4HA4 A;  3IAP A;  2EEX A;  4MNJ A;  3FND A;  4IM4 A;  4D6H A;  2OSW A;  3OGV A;  4GXP A;  4UQ9 A;  1EHA A;  1AVA A;  1W9D M;  2WC4 A;  5A1A A;  1NOW A;  1OD8 A;  3GH5 A;  4UQA A;  1KCK A;  3UG5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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