3SCTA

Crystal structure of rice bglu1 e386g mutant complexed with cellotetraose
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3sctA00
1ISXA 4J28A 4UFHA 1OIMA 3ZM8A 1BAGA 2JE8A 5FKYA 1CXKA 2VZVA 3CMJA 4JIEA 3TOPA 1V03A 4OZOA 2ZWYA 1X1NA 3NDZA 1W2VA 4M82A 2E8ZA 2VRQA 4HU8A 5AC4A 1BYAA 1QI4A 3NSMA 4JKLA 2G8ZA 2XSAA 1OD8A 1FOBA 2BXYA 3MSDA 3ARVA 4NI3A 3WIJA 5D8WA 3FHQA 3JUGA 3POCA 3VGBA 3VIJA 2BY0A 1GPFA 4AD3A 1JF5A 1OB0A 3VIOA 1RD6A 1W9XA 3WH7A 1E4NA 3HJEA 3U7VA 4NF7A 1UD6A 5ABFB 1W9BM 1MFUA 5DT7A 4WKHA 1MXDA 1UQYA 3WUBA 5LA1A 4HPHA 5BXTA 4CCDA 1CGYA 1FH9A 1BQCA 4GINA 2G3JA 5HBFA 1B3WA 1E73M 2JIWA 2WWCA 1EQCA 2J8GA 3MO4A 2ZUWA 2G3IA 4A4AA 4NZCA 1SFSA 3ARUA 3WD4A 3GXFA 3BAXA 1B90A 4LYRA 4PYSA 1PEZA 4XZWA 4E4PA 1LLOA 1W9PA 2GK1A 2Z1KA 5CPSA 1O7AA 4ZE4A 2VOTA 3F5JA 3LMYA 3LPFA 3MSGA 4XZBA 1UH4A 2VTFA 5A95A 3ALFA 4M8UA 3VGEA 3N15A 3VNZA 3N18A 1PJ9A 1TFVA 4FLSA 3VVGA 1JFXA 2F61A 5A6BD 3LPPA 1XD0A 3MMUA 2EPNA 3RMEA 1NOWA 1C8YA 4FMVA 1PIFA 4CCCA 1R87A 1FA2A 4Z2LA 4MNKA 2FDMA 1EHAA 4BQ3A 1Z32X 1LG2A 3KL0A 4B3KA 2ZE0A 3PBGA 4U5IA 4IUGA 1V02E 5JBEA 4UQCA 4W88A 2VX4A 2DSKA 1B3XA 3WH8A 2GSJA 4ZXLA 1GONA 2BVDA 4W84A 1PIGA 2W5FA 3RM4A 2J25A 4MDOA 5E9AA 5TD4A 4QLKA 3MMDA 3S2CA 4C7FA 4B16A 1LL6A 1UOKA 3FHAA 4DWSA 4AMCA 4UQAA 2JF7A 4TUFA 3EDKA 1C91A 1WPCA 5IDIA 5I77A 4AZ6A 3T09A 8CGTA 3FAWA 1KQZA 4R5EA 1TG7A 5A6BA 4FLQA 1ZJBA 4TX6A 3RJYA 3WBEA 1CBGA 4PMRA 4PSPA 4CVUA 5CZKA 2E8YA 4AZCB 2BVYA 2XVKA 5FL1A 4FLRA 3T08A 5A1AA 1J9YA 3UG4A 1CPUA 3WBAA 1OBAA 1QBBA 4UQ9A 1ISVA 3L4UA 2WVVB 1E6QM 3EMCA 3W6LA 2J47A 3AIUA 4CD5A 3RO8A 4OOUA 3BLPX 1XV8A 1GOKA 3QR3A 4P7NA 2VL4A 1J18A 3GH4A 4BQ2A 1CXLA 3IJ9A 1NQ6A 1B1YA 1G94A 1MW1A 2OWWA 1UR8A 1VBUA 1V0LA 3RM9A 3GNRA 1H1NA 2EPMX 2Q8XA 3BAIA 1LG1A 2XUCA 4UCFA 1MXGA 1U30A 3OB8A 1PAMA 2GJPA 4W86A 2XVGA 4Y7EA 1EA9C 4CGTA 1VJZA 4D1IA 1V3KA 2D24A 1UKSA 2X1IA 2E4TA 4F9JA 4KRUA 2JFEX 1LJYA 1G01A 4W87A 2CETA 1PBGA 1KXQA 2IUZA 1VENA 1SMDA 1V0MA 5M5DA 4M80A 1V3MA 1HKMA 1JXKA 1NH6A 5E09A 3W38A 1V0KA 2WKGA 4CD7A 5FL0A 5AYIA 3AS1A 5F7UA 1J0ZA 1CYGA 2WXDM 2V38A 4PTWA 4AW7A 1CGXA 1QW9A 4ACZA 1D3CA 2YL9A 4PCSA 1GQJA 1JYXA 3DECA 1M03A 4P7RA 4ATDA 5I24A 1NOFA 3KWXA 1CLVA 3ZT5A 5A8QA 3M6DA 2DGAA 1DWIM 3I3DA 3OG2A 1HP4A 2OSXA 2YDSA 3ZJ6A 3WFZA 4PMUA 4HU0A 5BRPA 4CN1A 1UR2A 2EJ1A 3DC0A 3GDBA 1G5AA 3GH5A 4MAZA 1DWHM 5KZ6A 3KZSA 2VCBA 5A8NA 1HJSA 1KBKA 1A3HA 3RJXA 1AQHA 1H3GA 1KWKA 2JF6A 4IPLA 4J3UA 4V27A 1MQRA 1V0NA 3VGGA 4WSJA 3FAXA 4H8HA 4CKQA 3AIQA 1K6AA 1MVYA 2YKKA 4MNJA 2E40A 4U5KA 4D72A 2X8RA 3CHCA 3KE0A 1R85A 5EBAA 4WJXA 2WMIA 1VRXA 2QMKA 4ZFMA 4KH2A 1KCKA 2E9BA 2QPSA 1E71M 1QNOA 4WKAA 1BG4A 1HNYA 2FHCA 2J77A 4JL1A 3WD3A 1GOIA 1RP9A 2WCGA 3GBDA 2J75A 3WY1A 2UY3A 1V02A 3DYOA 3PZIA 2A3AA 4PTVA 3AICA 3O6AA 2Y8VA 4BF7A 3VDAA 3WQWA 4MNLA 4P8VA 3CPUA 2Y4SA 4R27A 4M81A 4FLOA 1UH3A 1VAHA 4ZXOA 4F9DA 2OSWA 5A2BA 4U31A 3AMGA 4J7RA 4ZE5A 2O9OA 5A6KA 3GZAA 1E3XA 1QNPA 2XIIA 2WHLA 1Q4NX 3WNLA 4GZEA 3N13A 4MB1A 4DUXA 1KWGA 3ARQA 3OZPA 1V08A 5M03A 4FF5A 4JFVA 2J8FA 3N1AA 1BHGA 3PHAA 4B15A 4UTFA 3ZJ7A 1I75A 2VMFA 4UR9A 3IJ7A 3WH9A 2DIJA 2CERA 4AD1A 5DO8A 3BH4A 1GZJA 3FXYA 3PZVA 3QGVA 2ZUUA 3AS2A 3G6MA 4W8AA 4XB3A 2D0HA 4H41A 1JZ2A 4LPCA 1CLXA 1GOWA 3AHYA 1MWOA 4W8LA 3ZO9A 5DT5A 1KGUA 3CUIA 1WE5A 4U33A 3ARSA 2BVTA 4TVCA 5IFTA 1E0VA 4DUVA 5D9OA 3IAPA 4F8XA 3CZKA 3BAKA 1NP0A 3SURA 4JFTA 3WNNA 3BC9A 3EDEA 3VU2A 1UR9A 4JFUA 5CPQA 3WQ5A 2JEQA 1QPKA 4WIWA 2J7FA 3AHTA 1Q6CA 2XG9A 1EOKA 3PZUA 1UD2A 3PZTA 5CXPA 3W37A 3MANA 3GXIA 1OWQA 5A6SA 3CHFA 1HVQA 3UEQA 2X05A 4AYSA 3MS8A 1OD0A 4TTUA 4YHGA 5HPOA 1F4HA 4HA3A 1MFVA 2QF8A 2XVLA 5I0DA 4PMOA 2EPKX 2E9MA 3BAYA 2W66A 2OWCA 4TX8A 2WZHA 2D0GA 3NDYA 4PEEA 4KWUA 4J27A 4TXEA 1CGVA 5E70A 2ZX8A 1JZ5A 1C8QA 3AQUA 3ARTA 3PTQA 1CEOA 2VI0A 2VC9A 3BSHA 5I78A 1CDGA 1KR0A 3M7SA 1ZBCA 3K8MA 3PTKA 4PCTA 3AS0A 2DSZA 2GVYA 5I6SA 4Z2HA 3D5HA 1RH9A 4RE2A 2XM1A 2D3NA 3N04A 3AMLA 3ARRA 2YL6A 4H2CA 2E9LA 1XSKA 1DWAM 3NCOA 1C92A 1MQQA 1A47A 4UQDA 1VJSA 1K9TA 3DHPA 5E6ZA 1ZB5A 4UZUA 2D2OA 4CCEA 1BF2A 4MB4A 5GNXA 1KXVA 2ZX9A 4MNMA 3CTTA 3B9AA 1W91A 5CLWA 5GNYA 4OBRA 1GVIA 1JFHA 3AJ7A 4OBSA 3TP4A 4ML4A 3W81A 5A3HA 4AZCA 1VB9A 4Z2GA 3WL1A 1J0KA 1BVNP 1HKKA 2DIEA 4U3CA 2IXVA 4GI9A 4KGLA 3SCTA 2V5DA 2W91A 1H41A 3WNPA 3VIMA 1WZLA 4MTVA 1Q6FA 1C93A 1ZS2A 3AIWA 1BVZA 2WVVA 1HJQA 2UY4A 4LXFA 4X9YA 3ZOAA 3MUY1 4V2XA 3WQ4A 2VVNA 1GOOA 1EDGA 2CHNA 4ZENA 3CZ8A 1NOUA 3VIHA 3GXMA 2WNWA 1TUXA 1H11A 3WNOA 3IJ8A 4HOXA 3OIHA 1DWGM 4GZJA 4J3VA 1CGUA 1GOQA 4AD5A 2J7HA 2YDQA 3IK2A 2DT3A 1C7TA 4K68A 3CH9A 4J3TA 1V6VA 3NSXA 2VJXA 5D9MA 4MJ2A 3W82A 4L4PA 1XH1A 3GH7A 5BXRA 2YA0A 3AYSA 3A47A 5I79A 1J0HA 3PZ9A 3WH6A 4S3KA 4AISA 2ZWZA 3WDJA 3L4XA 5EB8A 1H49A 5CSUA 4Z2KA 2X0YA 5GNZA 3PZQA 1OGSA 1W2PA 3MV01 2BHUA 4PRWA 2V3FA 3WF0A 1WDSA 3ZSSA 5A6JA 3MUZ1 4GIAA 4QLJA 3HU7A 2AAAA 2XTKA 1BPLB 2Y8KA 4XUYA 3KL3A 5A8OA 4UFKA 5C71A 2VO5A 1BGGA 3CUJA 5A69A 2ZX6A 4X0VA 4HMEA 5CG0A 3U57A 1HX0A 1PPIA 1O6IA 4PUDA 1ITXA 1B2YA 3RPMA 4URIA 2BV9A 1FFRA 4PMQA 5A2AA 2OYLA 1FHLA 1DWJM 2TAAA 1TZ7A 1GQIA 2J4GA 4P7QA 1CNVA 3CBWA 3WD2A 5A6LA 1W3HA 2CITA 4P7OA 3BXWA 2OWXA 1ZL1A 4F79A 3DYPA 3VO0A 4OJYA 3VDCA 1IT0A 2WVTA 4H7VA 4PTXA 2JEPA 4AZ7A 2DT0A 3AHVA 3VOCA 5C70A 2W92A 1JDDA 4PSRA 3IANA 2VR5A 1JZ4A 1XYFA 2OYKA 2BHYA 2PF0A 3GTNA 2QMJA 1B3ZA 1TVNA 1UQZA 1XC6A 3L4VA 1W9UA 1E4MM 3WMCA 3AROA 1R7AA 1XH0A 1D2KA 1OIFA 2YL5A 1XHGA 1ZJAA 1V3LA 3OLDA 3OLIA 3GYCA 2EQDA 3VMOA 1HKJA 2WMHA 3K8LA 4AIEA 4PTMA 1TR1A 4M1RA 5M17A 2WMKA 2ZX7A 4U2YA 5ABGA 1V3IA 5IHSA 2JIEA 3WQ6A 1JYNA 1QBAA 3AXXA 3AHZA 2GJXB 5BXSA 1HVXA 2CBVA 2CPUA 3VD7A 3SUWA 3WFLA 1UWIA 2XJ7A 2ZXAA 2DQXA 2D1ZA 4GXPA 6TAAA 4MAVA 2A3EA 1S46A 2HISA 3SCOA 5D9NA 2YJQA 1SYTA 3WDPP 2ZXDA 1NWSA 4UOZA 1HJXA 1ECEA 2V3DA 3PZGA 4LYQA 3VD3A 3WMSA 1UWRA 4AZHA 3UERA 1GQLA 1GJWA 4HP5A 1KBBA 3WF2A 3OZOA 1E6NA 2ZUMA 3SCRA 4D6GA 5DMYA 3AZSA 4CN6A 3MU7A 1JNDA 1QW8A 1HJUA 1PZ3A 1XYZA 4MDPA 3CUGA 1UYQA 1UG6A 1B30A 1KB3A 4XX6A 4ZEPA 1B3YA 3L4ZA 3SUTA 1W32A 4W8BA 3CGTA 5BRQA 4M29A 4AZ5A 4NSBA 2WLZA 2RGLA 4N42A 1LQ0A 4PUEA 4AEEA 1CZ1A 1EGZA 2WBKA 2BXZA 2J78A 4LGXA 2QPUA 2VX6A 1VFUA 4QAWA 5LA0A 1MW0A 3PZMA 1HL8A 3POHA 1JD9A 3ARPA 4WSKA 3N17A 4JKKA 1TE1A 3QOMA 1W3LA 2GFTA 3ARZA 1H5VA 2WB5A 3S6TA 1W1YA 4WF7A 1GHSA 3VD4A 3MMWA 3A6OA 4FK9A 2WC7A 1B9ZA 1CWYA 1JXJA 1TA3B 2J7GA 4JFSA 1V3JA 1JI1A 3A3HA 1TCMA 2ZICA 4JHZA 4YN5A 2WMFA 4LX4A 1XCXA 1KCLA 3AXHA 4C7DA 4AWEA 1ZBKA 3GM8A 4P8WA 2WPGA 4LQ1A 1GHRA 3VMNA 1WDRA 3CHDA 2GK1B 3SUUA 4D1JA 1PZ2A 3EBVA 3I3BA 2J7EA 2VZOA 3ALGA 2J7BA 4GQQA 4U3AA 1JD7A 5I5RA 4V28A 2WANA 1E70M 1UZ4A 3PZOA 2GJRA 2CHOA 1UKPA 2CIPA 3THDA 2XFFA 1JIBA 4MJ4A 3WMBA 4HZ8A 3UETA 2WHJA 3UCQA 2WVUA 1JDCA 4UZSA 3VNYA 2ESCA 4LYPA 1K9FA 1CTNA 4QP0A 2IXUA 1AVAA 2WCSA 3GBEA 1K9EA 1EXPA 1WCGA 3G6LA 6A3HA 1E0XA 1E3ZA 1J10A 1E55A 4W7WA 4MB5A 4KMQA 1UR4A 4E8DA 2CBIA 2ZXBA 1U33A 3RIKA 4HOWA 4DM2A 3RM8A 5EFDA 3AI0A 3NUKA 2W62A 2B31A 2XM2A 2VCAA 2A3BA 4DWSB 2WCAA 1OGGA 1GNXA 1BSIA 1GOMA 2XGBA 3VGHA 2DPEA 4JKMA 3VX1A 3HMCA 2W67A 3VD5A 1CECA 1VFOA 3EDDA 1JNEA 1E5JA 3CZJA 4PMVA 2ZUSA 1V3HA 5CGTA 5CGMA 1UA3A 1WDQA 1VFMA 2VQTA 1JZ7A 2EPOA 4M24A 3AOFA 3PN8A 3A4AA 1E6RA 4DUWA 1JAKA 4HA1A 4L4OA 1QOXA 2YA1A 3ARYA 2D3LA 4QFUA 1ZU8A 1BYCA 2XVNA 3U7BA 4MPKA 5AY7A 2YLLA 3F5KA 2ZXQA 3EMQA 1JYVA 3BCFA 4QCFA 3W26A 4HOZA 3N12A 5JBDA 3FNDA 3QHMA 2NT0A 4NRRA 2XWEA 4JZ5A 2ZUVA 1J0IA 1FP9A 1E4LA 2J7DA 3SUSA 1M04A 5A2CA 4NRSA 5ABFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ISX A;  4J28 A;  4UFH A;  1OIM A;  3ZM8 A;  1BAG A;  2JE8 A;  5FKY A;  1CXK A;  2VZV A;  3CMJ A;  4JIE A;  3TOP A;  1V03 A;  4OZO A;  2ZWY A;  1X1N A;  3NDZ A;  1W2V A;  4M82 A;  2E8Z A;  2VRQ A;  4HU8 A;  5AC4 A;  1BYA A;  1QI4 A;  3NSM A;  4JKL A;  2G8Z A;  2XSA A;  1OD8 A;  1FOB A;  2BXY A;  3MSD A;  3ARV A;  4NI3 A;  3WIJ A;  5D8W A;  3FHQ A;  3JUG A;  3POC A;  3VGB A;  3VIJ A;  2BY0 A;  1GPF A;  4AD3 A;  1JF5 A;  1OB0 A;  3VIO A;  1RD6 A;  1W9X A;  3WH7 A;  1E4N A;  3HJE A;  3U7V A;  4NF7 A;  1UD6 A;  5ABF B;  1W9B M;  1MFU A;  5DT7 A;  4WKH A;  1MXD A;  1UQY A;  3WUB A;  5LA1 A;  4HPH A;  5BXT A;  4CCD A;  1CGY A;  1FH9 A;  1BQC A;  4GIN A;  2G3J A;  5HBF A;  1B3W A;  1E73 M;  2JIW A;  2WWC A;  1EQC A;  2J8G A;  3MO4 A;  2ZUW A;  2G3I A;  4A4A A;  4NZC A;  1SFS A;  3ARU A;  3WD4 A;  3GXF A;  3BAX A;  1B90 A;  4LYR A;  4PYS A;  1PEZ A;  4XZW A;  4E4P A;  1LLO A;  1W9P A;  2GK1 A;  2Z1K A;  5CPS A;  1O7A A;  4ZE4 A;  2VOT A;  3F5J A;  3LMY A;  3LPF A;  3MSG A;  4XZB A;  1UH4 A;  2VTF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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