3SCUA

Crystal structure of rice bglu1 e386g mutant complexed with cellopentaose
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 197
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scuA00
1X6NA 3A47A 4WSKA 1VEOA 2JE8A 1D2KA 2WMFA 4M1RA 1JIBA 1FP8A 1V0LA 3E1F1 4DUXA 4UCFA 3ZOAA 1NWSA 2WANA 2WC3A 3VMNA 5E09A 1LL4A 3OBAA 2WBKA 3AOFA 2YBTA 4M80A 3GXFA 1HKKA 2CNCA 1JYWA 1TA3B 1MQQA 3BMVA 2WCGA 3B8SA 4J7RA 1TVNA 4Z2LA 1B9ZA 3WUBA 1UKQA 1ZBCA 1HP5A 1V3MA 1ZBWA 1WDRA 2V3FA 4H8UA 3VIGA 2YL8A 5IHSA 1NP0A 1WAWA 3OZPA 2O9PA 1RP9A 2WW5A 1GCYA 4F9JA 1V6VA 3FXYA 3W37A 3T09A 1UG6A 2PWGA 1HKIA 2VURA 3MMUA 1J0IA 5CGTA 5CXPA 3TTSA 4CCDA 3CZEA 2O9TA 5JIPA 1MWOA 3FY1A 3AYSA 3RIKA 3VDBA 1PX4A 4XZWA 4BA0A 2ZXQA 4CCEA 4H7VA 1UD6A 5BRQA 2CITA 5A94A 1W9VA 3GNPA 3RILA 2GDUA 3L4VA 1W3JA 3VIOA 2JEPA 5JBEA 5I23A 2NW0A 3EMCA 3AZTA 4HTYA 1DWIM 3FHQA 3OLEA 3N9KA 4PMXA 3I3DA 1UWIA 2DT0A 4D6GA 4AZCA 3WFLA 1U2YA 3VUPA 4RE2A 3CUIA 2VRJA 2VRKA 1E3ZA 3SCOA 1ESWA 1VBRA 1ZJBA 2YIHA 2E9MA 2CBIA 3MMWA 2BY2A 1PZ3A 3VIPA 1UH2A 4JHOA 1MQRA 1FFQA 4U3CA 3AJ7A 4Z2IA 1C93A 1OM0A 2WKLA 5A3HA 1QNPA 1JXKA 3WFZA 3IK2A 4WLCA 1R85A 2HVMA 3UERA 3VO0A 3SCTA 2DT1A 3ZT6A 3EDFA 4TXEA 1G1YA 2W4XA 2J77A 1L8NA 1J0JA 3BCDA 3VGEA 5DO8A 1GOOA 1VENA 1LWJA 3NYDA 1JI1A 3AMDA 3EDDA 3PZIA 4CKQA 3FAWA 5DFAA 1W3HA 1CXIA 4H41A 1QNRA 3IAQA 4DM2A 2VI0A 1DEDA 3WQ5A 2ZICA 3UESA 4ATDA 2XUCA 3WQ6A 3WDHA 1E56A 3VILA 3ZIZA 2GK1A 2BNJA 1Z32X 2JFEX 3WD3A 2B31A 2G4FA 4PMQA 2CYGA 6TAAA 2Z1SA 1CLXA 4PCTA 3THDA 2CETA 1O6IA 1CLVA 2OWXA 1J11A 7TAAA 5A95A 1J0HA 1JNDA 3QHOA 4E4PA 2D3LA 3VOCA 3RCNA 3DHUA 1BLIA 2FHCA 5BWFA 5E9AA 3CHEA 3WF0A 2ZE0A 1TR1A 4CGTA 4DUVA 4AZHA 2VOTA 2CHOA 3MSGA 3VD5A 1ZJAA 1ZU8A 2GJXA 2WMIB 3KE0A 5D8ZA 2DT3A 3WH6A 3D5HA 2WXDM 5AYBA 2JALA 5D4YA 4AD0A 4JCMA 1KGWA 1M03A 1W9BM 4TTGA 5KZ6A 4GI8A 4PTMA 2VX7A 3ZJKA 1QVBA 3BC9A 3LPPA 2E8YA 2BY1A 4TVUA 3W26A 1KGUA 3OGSA 4U2ZA 4W8AA 3ZQ9A 5JBFA 2OWCA 4IUGA 4AWEA 5I77A 2XTKA 3AFBA 4BQ5A 1GONA 1M04A 1J0ZA 1RPKA 2D24A 1DWFM 4GZJA 5A2BA 1JAKA 1CXHA 4M24A 4UQCA 1E4MM 3OA5A 4OBRA 2OLHA 2VCCA 2YL9A 1NWTA 1OBAA 1KBBA 1KGXA 5HDRA 4HPGA 1ZBKA 3GH4A 4CD8A 4D1IA 2QLYA 1QHOA 4C7FA 1H1NA 1K6AA 1LJYA 4V28A 4KGJA 1ISYA 5ECUA 1KFWA 3SURA 5BYWA 3L4ZA 1MW2A 3ARPA 3AMKA 4GXPA 1XCXA 3K8KA 3AS0A 4F79A 1UQYA 4NSBA 3TONA 3SUUA 2FHBA 3L4YA 2PI6A 5I6SA 2WVSA 2OYMA 1CGTA 4TUFA 5A8OA 5BXTA 5BROA 4TX8A 1V6UA 4D6IA 2DSUA 1KCKA 2XM1A 1MQPA 1RH9A 3L4WA 2OSYA 1B3XA 1EQCA 4W7UA 5LA2A 5EB8A 5I0DA 1JG9A 9CGTA 1GOIA 2JIWA 1BSIA 3KEHA 4QFUA 4JCLA 1JF5A 1TCMA 2VZUA 4PUDA 4UTFA 1XHGA 4J3WA 1QI0A 4YPJA 1H0IA 2WKGA 1JI2A 3W81A 3SCPA 5I79A 2BHUA 2WHKA 1XGZA 2J7HA 1Q4NX 1GVYA 1AQMA 1QOXA 2Z1KA 4CU6A 2XYLA 5A6SA 1A47A 1PX8A 3ZO9A 3SCRA 3UG4A 4BQ4A 3NSXA 2WMHA 1ITXA 3M7SA 1F4AA 1QI2A 2DSWA 2J62A 4GI9A 1BHGA 2YKKA 3SCNA 2OSXA 2UY4A 3WUEA 3A6OA 4P7NA 3VMOA 3NCOA 4HA4A 1H4PA 2OYKA 1HF6A 3UETA 4JL1A 1UOKA 2CERA 1CDGA 2QMKA 4H8HA 2V5CA 3N13A 2VR5A 1IZKA 2VCBA 1XH2A 2CXGA 2X8RA 4S3KA 4IPNB 5FKYA 1BTCA 1OT2A 2WCAA 4PMOA 5GNXA 2WK2A 2Y24A 1JF6A 4PYSA 1KXQA 3JUGA 4PSRA 1GNXA 2G3JA 4P7LA 1MFVA 3II1A 2GFTA 3POHA 1LG2A 3PTKA 2AAAA 4JKKA 3WL1A 4W86A 3FN9A 3CZ8A 1R8LA 1E5JA 1WZKA 1BYCA 1EIBA 1SR0A 3APGA 3SUTA 4PCSA 1HJWA 2X09A 3EDJA 4GPNA 3SUSA 3BAWA 4H2CA 4UQDA 3OIHA 4TVDA 3UR7A 1B3ZA 3S6TA 2A3EA 2CKSA 4HOZA 4CVUA 4D6HA 4YHEA 3CH9A 3G6LA 2ESCA 2DSZA 3AS3A 1C8YA 1CXLA 3AISA 4R5EA 2D0HA 7A3HA 4Z2GA 1J0YA 3WF3A 3MUAA 4PTXA 1OINA 5DF0A 1JYXA 1MYRA 1C8QA 1BPLB 2BHYA 4L4PA 1WB0A 2J8GA 1CGVA 3RO8A 1UHVA 3BSGA 1EDTA 3K8MA 3N17A 5ABFA 2O9RA 1QHZA 1J0KA 3VM7A 4GIAA 3KL3A 3U7BA 2VJXA 1UKSA 3VMPA 1N82A 3A3HA 3KZSA 4U31A 5A6LA 5GNYA 3SUVA 4MADA 3W29A 1QBAA 1E4LA 3VX1A 4M82A 3GDBA 3I3EA 2WCSA 4OIFA 1AQ0A 3VDCA 4JZ5A 4TVCA 4KH2A 1C7TA 1AQHA 2XWEA 1C92A 1RP8A 1HT6A 4PTVA 3AZRA 1V3JA 3GBDA 1E5NA 3WDJA 3CZKA 4AD3A 4N42A 2VTFA 3HN3A 1CGWA 4EKJA 4ATLA 3NJ3A 1JDCA 3VGHA 1J10A 1C3FA 5ABEA 2ZX7A 4WJXA 3VD9A 1OSEA 4GKLA 1OD8A 3WMSA 2E9LA 1E4NA 4P8VA 1J01A 1QNQA 2A3CA 4N0RA 3ARTA 4AZ7A 1OB0A 3WH8A 4MNLA 1HL8A 3PZQA 2DIEA 2ZX6A 1VF8A 5ABHA 2PBGA 2D22A 4J3XA 2W61A 3ZM8A 2WWDA 5A2CA 2O92A 2VZTA 3HJEA 1OIMA 1KXTA 1UZ4A 4XZBA 4F8XA 1HJXA 3BAIA 4XB3A 2ZOXA 3TTOA 1XYZA 5GPRA 1E0WA 1WPCA 1ODZA 2WAGA 2XVPA 3I3BA 4MB5A 1US3A 3W53A 2BVYA 2YBUA 4AC1X 4DWSC 2XIIA 4HZ8A 1B3WA 5BCAA 4CVWA 2WPGA 3N04A 3T0BA 2YLAA 3PTQA 3LPFA 1BYDA 4MB4A 3ARZA 4B3LA 2WZIA 1E71M 4TOQA 1V08A 4OJYA 3CLWA 1QI4A 3PHAA 3K46A 3GXMA 5IDIA 2GVYA 4CN4A 1EQPA 2IXUA 1UKTA 2ZUNA 4OKDA 2JIEA 3SUWA 1ZL1A 1CGUA 3ALFA 2DH2A 3WBAA 1R7AA 1WO2A 1HN1A 1EA9C 4OOUA 3ARYA 1W1TA 1H49A 1GJUA 2XFRA 3OZOA 2E8ZA 4ATWA 3VGBA 1EHAA 2E40A 4BZYA 5ABGA 1GQIA 2J25A 2ZIDA 1CXKA 2WSKA 4V27A 4ACZB 1V3IA 1PAMA 2PBOA 4CN6A 4IISA 1B3YA 1PJ9A 1K9EA 1G9HA 3ARQA 3PZ9A 3MU7A 3F5LA 2V3GA 3OG2A 3TTYA 1KCLA 2XJ7A 4FLRA 3W24A 5JBDA 2G3IA 1UZ1A 4LYQA 3AS2A 2DQXA 4UFJA 2QHAA 5BXSA 1WZAA 1VJSA 1XRVA 4PRWA 1H41A 4U5IA 2OWWA 1UR9A 5I3DA 4OUEA 1E0VA 1TMQA 2VUYA 2O9OA 4GO8A 2XM2A 1NQ6A 3T2OA 1EGZA 2YJQA 2VO5A 1UWQA 3CO4A 3T2QA 4B16A 2A3HA 2WZHA 1FH7A 2J78A 3PZUA 5CQ1A 1E15A 4YHGA 1LF1A 3PZGA 2VQTA 3NIYA 3AHTA 3OGVA 1BGAA 3AZSA 2G3NA 5D9NA 1EDGA 3AHXA 4B9ZA 1GZJA 2PWFA 3W28A 4E8CA 3CGTA 3N1AA 3EMZA 2WHJA 5E6YA 1V3LA 4QCFA 1KBKA 3N11A 3QGVA 1MW3A 2EPNA 4LQ1A 3AHYA 1VBUA 2DIJA 3GM8A 3WL0A 1KR1A 5EMYA 1GORA 1DWJM 4ACYA 4W7VA 4D6DA 4X0NA 4P8XA 3WEZA 1H0GA 3RM4A 3WQ4A 4JHZA 1D7FA 3WEMA 4M81A 3VNYA 2FGLA 2XFFA 3L2LA 4CN1A 2BXYA 3CMJA 4AEFA 5DT5A 4CD6A 2WMJA 3HMCA 1BF2A 4LYPA 3A4AA 1QNOA 3T08A 1GOWA 1V3HA 1VEPA 1B90A 2X05A 3LPGA 3BAKA 2UY2A 2WVVB 3WELA 2ZXDA 2WYSA 1VIWA 1DTUA 2WZEA 1FFRA 2WB5A 4GINA 2WNWA 5A8NA 1EHNA 4P7RA 4DWSA 5A6BA 4PMDA 4BS0A 1SMAA 3ECQA 4C7GA 4P8WA 1BG4A 4IM4A 3OGRA 3CZLA 3SCSA 5FOOA 3WNOA 3VGGA 1BQCA 3WD4A 4MPKA 1FHDA 5IXEA 1MFUA 2VMFA 2XGBA 3SCUA 4D1JA 1GHRA 5HXMA 4UQBA 3D3AA 4KRTA 3O2LA 5BRPA 1WDSA 2UY3A 4JL2A 1HJSA 2XSAA 2WLZA 1GOMA 1SYTA 3MS8A 3ZT7A 2WBGA 2ZUTA 1G0CA 2Y2WA 4PMNA 3GH7A 1R86A 3KL5A 3MUZ1 1UD8A 2BFGA 1NWRA 1E6QM 5LA1A 3RM8A 3M07A 1MXGA 2VVSA 5BXRA 4KRUA 5AYIA 2G8ZA 4PMRA 4PEEA 1QNSA 5I78A 3L4TA 4DM1A 1W1VA 3UCQA 5EFFA 2MANA 4URIA 4PUEA 1CGYA 3F5JA 3K4DA 3BAJA 4ZXOA 4BF7A 2J7EA 2EPKX 5TD4A 5I5RA 3VGDA 3DECA 4RL3A 1GJWA 1TFVA 1V6XA 3RMEA 1W3KA 4AIOA 1EOMA 2EQDA 5ABFB 5LA0A 1TA3A 1UD4A 3GNOA 1NOFA 5A1AA 1OIFA 4F66A 5JUVA 1HJQA 4WK9A 3VNZA 3WNNA 3WF2A 1J12A 5C8BB 4M8UA 4QP0A 1XC6A 4ZE4A 1EDQA 1JYVA 4CD4A 2IXVA 3QR3A 1DP0A 5HNNA 8CGTA 1OT1A 3OLDA 2VZVA 4D6CA 4AD4A 4DWSD 1QI5A 2X1IA 3AIBA 4X0VA 1UWRA 1W9PA 1VJZA 1UKPA 3OLIA 4EE9A 1CPUA 1VFMA 1BFNA 1ISZA 1B1YA 1IT0A 3WDPP 2TAAA 4UFLA 2GDVA 1CENA 5A2AA 3A4WA 3OLGA 3GXIA 1US2A 1WKYA 3CHFA 2XPKA 3FW6A 1VEMA 4JKMA 1XCWA 1I75A 3WH9A 2ZWYA 4NZCA 1UR4A 1OGGA 3BXWA 1HKMA 1GVIA 3U5UA 3EBVA 4H8VA 3AQUA 3SCQA 1QPKA 2ZXAA 3EDEA 4M29A 4RE4A 2DGAA 4J28A 3MV01 2J8FA 1ISWA 1V02A 1HVXA 2F61A 3TA9A 1E72M 1EOKA 3MSDA 2ZX8A 2Y8KA 3VDAA 3A4XA 3AMLA 3BCFA 2V3DA 4GQQA 2Q8XA 4Z2HA 3RPMA 1W91A 4PSPA 4A3HA 4UFMA 4QLKA 1XSKA 5CLWA 3IJ7A 4W93A 5M17A 2W91A 2D23A 1PIFA 4GQRA 2FH8A 4C7DA 1W3LA 3HU7A 3ZR5A 2VCAA 4LXFA 2DEPA 1HL9A 3RJYA 3VIMA 3AICA 3FHAA 1QW9A 2JEQA 4HPHA 1QHPA 4ZENA 4BQ3A 3WNKA 3MANA 3WDIA 1CXEA 2J75A 4UR9A 2DT2A 2ZUUA 3MUIA 5CSUA 4FLOA 2W67A 1TE1A 3ARSA 4PBGA 2V38A 1L0PA 1UR1A 3B9AA 4U2YA 2GJRA 4MNMA 2J7GA 1I1WA 3ARWA 3CIVA 2XWDA 3ZSTA 3N18A 3QHMA 1FOBA 2W62A 3L2MA 4WKHA 4MJ4A 1NOWA 4ZXLA 4W87A 1WP6A 1W1YA 2ZUMA 4U5KA 2D1ZA 1VFFA 1HXJA 4UOZA 1PIGA 5FCZA 1F4HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1X6N A;  3A47 A;  4WSK A;  1VEO A;  2JE8 A;  1D2K A;  2WMF A;  4M1R A;  1JIB A;  1FP8 A;  1V0L A;  3E1F 1;  4DUX A;  4UCF A;  3ZOA A;  1NWS A;  2WAN A;  2WC3 A;  3VMN A;  5E09 A;  1LL4 A;  3OBA A;  2WBK A;  3AOF A;  2YBT A;  4M80 A;  3GXF A;  1HKK A;  2CNC A;  1JYW A;  1TA3 B;  1MQQ A;  3BMV A;  2WCG A;  3B8S A;  4J7R A;  1TVN A;  4Z2L A;  1B9Z A;  3WUB A;  1UKQ A;  1ZBC A;  1HP5 A;  1V3M A;  1ZBW A;  1WDR A;  2V3F A;  4H8U A;  3VIG A;  2YL8 A;  5IHS A;  1NP0 A;  1WAW A;  3OZP A;  2O9P A;  1RP9 A;  2WW5 A;  1GCY A;  4F9J A;  1V6V A;  3FXY A;  3W37 A;  3T09 A;  1UG6 A;  2PWG A;  1HKI A;  2VUR A;  3MMU A;  1J0I A;  5CGT A;  5CXP A;  3TTS A;  4CCD A;  3CZE A;  2O9T A;  5JIP A;  1MWO A;  3FY1 A;  3AYS A;  3RIK A;  3VDB A;  1PX4 A;  4XZW A;  4BA0 A;  2ZXQ A;  4CCE A;  4H7V A;  1UD6 A;  5BRQ A;  2CIT A;  5A94 A;  1W9V A;  3GNP A;  3RIL A;  2GDU A;  3L4V A;  1W3J A;  3VIO A;  2JEP A;  5JBE A;  5I23 A;  2NW0 A;  3EMC A;  3AZT A;  4HTY A;  1DWI M;  3FHQ A;  3OLE A;  3N9K A;  4PMX A;  3I3D A;  1UWI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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