3SCVA

Crystal structure of rice bglu1 e386g/s334a mutant complexed with cellotetraose
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYAADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 194
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scvA00
4KRUA 2W63A 3VU2A 3VDBA 1UA7A 3T2QA 2ZXQA 2VR4A 3S2CA 2CBUA 4AEEA 3RJXA 5D9OA 5A6JA 4NF7A 3WENA 2VZSA 1ZL1A 4JIEA 2DSUA 3PHAA 5A8MA 3ALGA 4IPNB 5I79A 2ZE0A 4GPNA 3W28A 2JF6A 4AZIA 1BGGA 1IZKA 3KL5A 1H1NA 1HJQA 1VEOA 2QMKA 1UD4A 1R85A 1WO2A 5FIPA 3U5YA 1E72M 1EO7A 4MNMA 3SURA 3ZMRA 1SR0A 3AICA 4JKLA 3UETA 3TOPA 4U2ZA 4UZSA 5A6MA 1H2JA 3QHOA 2WMJA 1IZJA 4M80A 4U31A 4ML4A 1JIBA 2XVGA 4URIA 2YL5A 1KGXA 4W8LA 4WK9A 3DHPA 2XTKA 3RPMA 4D71A 1BAGA 4BQ5A 1NP0A 1OGSA 2GK1B 1KXQA 3N18A 5E0FA 3U57A 5ABFB 5I0DA 2VX6A 1VBUA 1UR8A 2CNCA 1UWUA 4D6CA 3VGDA 2JEPA 2VZTA 3M46A 4UR9A 1RP9A 2ZUWA 3G6MA 4UFIA 1GOMA 3NUKA 4JCMA 2WM0A 1UKTA 2ZUSA 4H2CA 3A4AA 3BMWA 4M24A 4CUCA 1B3ZA 3MUY1 1CXEA 1UR4A 3GXIA 3WDIA 4MB1A 1TZ7A 3W29A 1EIBA 3PZGA 5A6BA 2X1IA 2GUYA 1JNDA 3PZTA 2OWWA 3PZQA 2PB1A 3IJ7A 5HPOA 4RL3A 3J7HA 2D24A 4HOZA 5A3HA 4QLLA 3CUHA 3AI0A 3TTQA 1MQPA 4OOZA 3OLGA 2PWEA 5DMYA 2DT2A 3U7BA 1PX4A 3BXWA 3EDFA 5BROA 3W37A 3AS3A 4D6EA 1WDRA 2ZUMA 2GJXA 2J75A 3SUSA 1J01A 4BCEA 4DWSD 3ZT7A 5E70A 2VUYA 1TVPA 3CPUA 4AZHA 5M3WA 4JFWA 2VC9A 1W3JA 2CBIA 3TONA 1OD0A 3NSMA 1MFUA 1JYNA 3SIMA 5BYWA 2YJQA 2WLZA 3OLIA 4CKQA 1OIFA 2WK2A 2VNCA 4HA1A 1EO5A 3KEHA 4AD2A 3CMJA 3THDA 3NYDA 4MTVA 4UCFA 2YOCA 3BSGA 1LJYA 4JFSA 3WQ5A 1J10A 1KWGA 4UOQA 4TX8A 2XSBA 1B3YA 5DEZA 4PMYA 4PCTA 2VRJA 1V6UA 3ZT5A 3WD2A 3WH9A 2O9RA 4F8XA 1J0JA 2ZXBA 4JHZA 4J28A 5I6SA 2A3BA 3L4XA 4P7LA 5ABFA 4W89A 2XWEA 3WQWA 1UKPA 4L4OA 1AQ0A 3BAXA 3LPPA 1H3GA 5AC5A 1B9ZA 1DHKA 3N17A 1QNQA 4CN6A 3FHQA 1NARA 3CUJA 2VOTA 1KGWA 1UQZA 5DT5A 2BHUA 3ZSSA 1QNOA 2OYKA 4CD6A 1W3LA 5CSUA 3HU7A 1E1EA 1CNVA 1JDDA 1UD6A 5CGTA 1UH3A 1AQHA 3IANA 3NDYA 3WNKA 3CHCA 3EDJA 4DUWA 2O9PA 4MNJA 3WF0A 4DWSC 1VFUA 3BMVA 2VURA 4QFUA 1UQYA 3WEOA 1B3VA 2EQDA 4HP5A 1KBBA 2XFFA 1NM9A 3ZR5A 4YHEA 3APGA 3RILA 4DM2A 2W61A 4A3YA 2WVVA 2OWCA 5BRQA 2J74A 1GOQA 1LQ0A 4UQDA 1VRXA 2J7EA 1C93A 1E5JA 5AC4A 3WH7A 4AYSA 1HIZA 1Q6GA 2G3NA 3WIJA 1GQJA 1E15A 3DYPA 1UR0A 2MANA 3L4UA 3T0DA 1WCGA 2D20A 2WSPA 3GNOA 4K68A 1BFNA 2PBGA 5EFFA 5DF0A 4NRRA 3SUUA 2FHCA 5BXRA 3OLEA 2VRKA 2FHFA 2PWDA 1X1NA 2CBJA 3WH5A 3DHUA 2BY3A 2QLYA 3L2LA 2J77A 1JAEA 4WSKA 1E5NA 3PZIA 1GHSA 2DT0A 2D2OA 2J25A 4TX6A 1M04A 4E2OA 5JBEA 5A6KA 1RD6A 2UY2A 5A69A 1V02A 1J9YA 1E4LA 4LYQA 3AIUA 2YDRA 3VDAA 2VRQA 2VVNA 1UH4A 4U3CA 4N42A 5HNNA 2NW0A 4QLKA 3W25A 1RH9A 4JFTA 1ZJAA 1QI0A 4OBRA 1NOUA 2J79A 4PN2A 4E8CA 1R7OA 2W66A 1JGIA 5DT7A 3WKZA 3RM4A 1Q6DA 2AOSA 2DT1A 3ZJ7A 3VM5A 4MDPA 1UWIA 4AIEA 1UH2A 3GH5A 3AROA 3WDRA 1QW9A 4KH2A 2WWCA 3GYCA 2V3GA 3MSGA 3T0AA 2OSWA 1KCLA 2DGAA 1QHOA 3MS8A 4W7VA 1W1VA 5IFPA 3CZ8A 5I2UA 4M29A 4CD7A 1E70M 1E0XA 3WUBA 3O6AA 3WD1A 4C7DA 4A3HA 3B9DA 4ZXLA 5CQ1A 3AISA 2PWGA 3FXYA 1C8QA 1BYDA 1SFSA 4AISA 3VGFA 4S3JA 1E4MM 4U5KA 1MW0A 1HKKA 1W9BM 4PTXA 5I3DA 5LA0A 4ZXOA 3IK2A 1FP8A 2XVPA 1DP0A 2RGMA 5A95A 4UQ9A 2J8GA 5F7UA 2G4FA 4BF7A 1BVNP 1W2VA 2CXGA 1QI2A 4W5UA 1VB9A 5C8BB 2W92A 3DC0A 4B16A 1CDGA 5KZ6A 3RMEA 1KXTA 3AOFA 4LYPA 2W4XA 3AIEA 4MB5A 4CU6A 4NRSA 1ISWA 1J0YA 4X9YA 1H4PA 4J3UA 1GQIA 2D0GA 1JL8A 1GVYA 1TR1A 1YQ2A 4EAMA 2OYMA 3W24A 3AZTA 1VBRA 2DSVA 4UFMA 3ARRA 3W82A 5BXTA 2GDUA 1PEZA 1CECA 4S3KA 2J47A 1BPLB 5E9AA 2WHJA 3AMKA 3ARQA 5FL1A 1CGXA 2WSKA 2DH3A 5AYIA 1TVNA 4LPCA 5FKYA 5A8PA 1NWUA 4GZEA 3I3EA 1VENA 3QHNA 2HVMA 1UZ4A 4JL2A 1CGYA 3AXIA 1XSIA 4M1RA 3GBDA 2JF7A 3W38A 4HOXA 3WD0A 1VFOA 2WCGA 4D6IA 4KGLA 2IXUA 4D72A 1FHDA 2E9BA 3ZM8A 4KGJA 1ISZA 3D3AA 1WDQA 4YN5A 2V3EA 3WEMA 1UD8A 3TA9A 1H11A 1V02E 5IHRA 3MMWA 2JFEX 3I3BA 2CYGA 4HA3A 4EE9A 2YL9A 5GPRA 1CIUA 4P7QA 3PTKA 4D1IA 4H7VA 3BAYA 3SCSA 1DTUA 1BG4A 4Z2KA 2EO7A 3AQUA 4H8HA 2X8RA 1W9PA 3UG3A 1HJWA 3AZSA 2BY2A 1G01A 3CO4A 3NDZA 3GXMA 4HMEA 2WANA 2D0FA 4AD5A 3WF1A 1M7XA 3UEQA 3TP4A 1H5VA 1NH6A 1J11A 3FW6A 3S6TA 4W86A 1U33A 3UG4A 3D5HA 4CU7A 3MANA 5E0CA 4CD5A 2D3LA 1OGBA 4GKLA 4FK9A 3W81A 4ZENA 1CXKA 1EHNA 7TAAA 3F5LA 4PMQA 1XH0A 3MUAA 4NI3A 3NIYA 5M17A 1KFWA 1HJUA 3QHMA 3WF4A 4C7GA 2ZUNA 1IT0A 3K8LA 4B9YA 4JZ5A 2V5DA 1CGTA 1GOIA 4JFVA 3U7VA 2ZX6A 3VIOA 1QBBA 1F4HA 2J4GA 2PWFA 3A4XA 1AQMA 4ATLA 4AD0A 2CERA 3GH4A 3BCDA 2EPMX 1TE1A 3PTMA 2UWFA 4QP0A 5M5DA 3M7SA 1G94A 5EFDA 4UFKA 4UOZA 1E71M 3UCQA 4D6GA 3F4VA 4D6HA 1Z32X 1NWSA 4MAZA 1BGAA 2E8YA 1HKMA 3B9AA 1E73M 4V2XA 3VD4A 1C8XA 4PBGA 2D22A 4N0RA 3PZMA 4B3KA 3WH6A 2VO5A 1TMQA 5CJ5A 5GNXA 1UHVA 3VD3A 5FD0A 2VCAA 3BSHA 4FLRA 5A2CA 1B31A 3AS0A 4AWEA 5FCZA 2WVTA 1C3FA 1CTNA 1GW1A 5A8QA 1GQLA 4PTVA 5IFTA 2OLHA 3WQ4A 1GOOA 4HZ6A 1W91A 2CPUA 4GQRA 3CZKA 2CKRA 3EMCA 1LG2A 2W91A 2WMKA 2CEQA 1XSKA 2VX4A 3VMPA 2EPKX 3WUFA 3ZR6A 3NSXA 1EA9C 2WW5A 1KR1A 1MFVA 1ZBCA 3VGEA 3WEZA 1QNRA 4GI9A 1JXKA 3RIKA 1IV8A 3II1A 4TOQA 4ATDA 2OWXA 3BC9A 1J12A 2GJPA 3KL0A 1FHLA 3LPOA 4KMQA 3MV01 3AMGA 1X6LA 3PBGA 3W53A 2EEXA 2FGZA 2Y5EA 1ZJBA 3AIWA 3L4YA 1C90A 1HXJA 5AY7A 3ZJ8A 2DDXA 4AZ7A 3RO8A 3AIRA 3OZPA 1H41A 4JL1A 2WZHA 3SUVA 1QI3A 4J3WA 2A3CA 3BLKA 2WVSA 5JBFA 1GZJA 3PZNA 2XYLA 2D3NA 1EGZA 1OIMA 2XM1A 1P6WA 2EPLX 1NOWA 1JI2A 3OGVA 3RJYA 1NP2A 3W4RA 4PUEA 1GHRA 1FFQA 2PI6A 1XSJA 3OBAA 2WHKA 5GNZA 1WNOA 4P7RA 3WDPP 3WMCA 1BLIA 1PZ2A 1WZMA 3AHZA 3SCRA 2WVVB 4X0VA 1CPUA 1Q6EA 2W67A 1UG6A 3OG2A 5HOSA 3K46A 2PBOA 3NSNA 2VT0A 3BAKA 4PSRA 1KCKA 1GOKA 1ITCA 1XGZA 2AAAA 1BVZA 4FF5A 4IUGA 2FH6A 4LYRA 5I5RA 1KBKA 1FH7A 2O9TA 4HOWA 3ARUA 5I24A 4RE2A 3HJEA 1HN1A 4U33A 1JF5A 4B9ZA 1TA3B 3OIHA 6CGTA 1HF6A 2CHOA 1JF6A 1ISXA 1ECEA 2DSKA 4HTYA 3VOCA 1JZ7A 1MXGA 4FLQA 4GINA 4J27A 3WH8A 4GXPA 1UWSA 3AMCA 2ZWZA 1BYAA 1E56A 3VMNA 2J7CA 1EDGA 1NWRA 1AVAA 3AMLA 3EDEA 4UFHA 3VIIA 1L8NA 2NSXA 4Y7EA 4ACZA 1JFHA 3WQ8A 3TTSA 2QV4A 2V38A 1DWGM 4JFUA 1H09A 3VVGA 1G0CA 1CZ1A 3OLDA 1E0VA 3WFZA 1Q6FA 1YHTA 3CBWA 4PEEA 2WBGA 3VNYA 2J7GA 1M53A 2DQXA 3FAXA 2WCSA 1G5AA 2JIWA 4XUYA 1C91A 4TTGA 3MMUA 4AD1A 1VAHA 1WZKA 2QPUA 4WKHA 2CBVA 4H8UA 1C7TA 1CGWA 3ARYA 4A4AA 2WNWA 2XFRA 3CGTA 1LL6A 1JNEA 1V3HA 4GO8A 1WZAA 3BAIA 1W2PA 1EOMA 1E6XM 4Z2LA 5CPSA 5DO8A 4TVUA 3OB8A 3L4VA 1OT2A 2TAAA 3AJ7A 3KE0A 4E4PA 1VEPA 3SEPA 3HN3A 3VPLA 5A94A 1WZLA 3VX1A 2J7HA 4P8WA 3VGGA 3G6LA 6A3HA 1KXHA 4PUDA 2BNJA 2JE8A 2EBNA 1FOBA 2YA0A 3WDHA 1KB3A 2PC8A 4HA4A 3RDKA 5I77A 2DH2A 3I3DA 1HJSA 1XH1A 2CETA 4HZ8A 2XG9A 1B0IA 2AMGA 3VKKA 2ZX5A 2QF8A 4LXFA 4W93A 1ODZA 3ALFA 4DWSA 2VCCA 1UWRA 4J3SA 1VF8A 1MYRA 2XFYA 1XYFA 1BHGA 2BY1A 2WMGA 5HBFA 1EQPA 3F5KA 3VIPA 1HKJA 1I1WA 1SYTA 2A3EA 4PMVA 2RGLA 5ECUA 4ZFMA 1EQCA 4CD8A 4EK7A 4YHGA 1TA3A 4IISA 3AHTA 2W5FA 1JD9A 3PN8A 1AMYA 4EKJA 1V3LA 1UYQA 2BHZA 2ZIDA 3K8KA 3O2LA 4QLJA 4NSBA 4PMNA 4BS0A 2VTFA 5BRPA 2XSAA 1A3HA 3WQVA 1JG9A 3K8MA 4CCCA 4WIWA 3SCPA 2J7DA 3AMDA 3CZLA 5CGMA 2D23A 1V6VA 2DIJA 4C7FA 1VJZA 4UQAA 1LG1A 1KR0A 3FN9A 1R87A 5A6SA 3ARWA 3AXXA 1FFRA 3WNOA 1QHPA 4AY1A 3WL0A 4OOUA 1XRVA 3BCFA 3GNRA 4CGTA 5D9PA 5DFAA 4RE4A 5CLWA 2VX7A 1HKIA 1W9DM 1XCXA 1KGUA 4UTFA 2C8NA 3MU7A 5EMYA 2OYLA 8A3HA 1LL7A 2CESA 2CITA 1A47A 5CLTA 2F8QA 5GNYA 4MJ4A 4CVUA 1WDSA 2C7FA 3MSDA 4W84A 3NCOA 3VILA 1J0HA 3QGVA 4UQBA 2YL6A 4WSJA 2BV9A 2XM2A 1S46A 1OSEA 3W6LA 5BXSA 1CXHA 5ABHA 2FHBA 3CHEA 5I78A 1V0LA 1XHGA 3F5JA 1UKQA 2YLLA 1GJWA 1V0NA 1OWQA 1CBGA 1GJUA 4Z2JA 2G41A 1UWQA 2CIPA 3POHA 1Q6CA 2VZVA 4L4PA 3ZJ6A 3OZOA 2CKSA 2IXVA 4UQCA 1FP9A 2WZIA 3ZO9A 1RPKA 2ZWYA 4FMVA 4CD4A 1PAMA 1ZU8A 2WKGA 3BAJA 2EXOA 4LQ1A 2WMIB 3DYMA 2V3FA 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1V6XA 1WPCA 1JD7A 4U3AA 3AZRA 3QOMA 5A6BD 3N04A 3T2PA 1JYWA 1G9HA 1LF1A 3K4AA 4M81A 1GPFA 2YDQA 4J3VA 3T08A 3MUZ1 3CUFA 1E3ZA 4W7UA 1WE5A 4HMCA 1HNYA 4HMDA 3UG5A 2X05A 4BQ2A 1OCQA 4WF7A 2XVNA 2BXYA 2WBKA 5ABGA 2WMHA 2ESCA 1EOKA 1RP8A 1H49A 3RCNA 1HX0A 2EPOA 4W85A 4W88A 1R8LA 2G3IA 2YA1A 2JIEA 3VNZA 3WNNA 3LPFA 1MW1A 4TUFA 2XPKA 1K6AA 3AIQA 1V3KA 1CGVA 3UR7A 4D6JA 1HJXA 5HDRA 3WELA 3LPGA 3ARPA 1E3XA 3M07A 4Z2GA 2JALA 3CTTA 3K1DA 3L2MA 1CENA 1DWIM 5FOOA 7A3HA 4ACZB 1H0GA 2VX5A 2VZOA 1J0IA 4AZGA 3WBAA 4AD4A 4AIOA 1HP5A 1XH2A 3CZEA 3WUEA 5A8NA 1JYVA 1ITXA 4AW7A 1B2YA 1C92A 2DSWA 1HVXA 4CVWA 4H04A 1JI1A 1UOKA 2YDSA 9CGTA 2JEQA 4XX6A 1UD2A 1QNPA 2XIIA 1VJSA 2E9MA 3W26A 1VFMA 1G1YA 1CXFA 1K9DA 2UY5A 2OSYA 1X6NA 3ARXA 4MNLA 2YBTA 2XGBA 2ZICA 1V3IA 1QW8A 4XB3A 4IPLA 3GH7A 1B30A 1ISYA 1PIFA 2Z1SA 3PZOA 3WNLA 2YLAA 1OT1A 4Z2IA 4AZ5A 3AS2A 1W32A 3ZOAA 2J8FA 1W9XA 2VL4A 2BVTA 2CHNA 2ZX7A 4GZIA 2XWDA 4ZE4A 5D8WA 2YIHA 1JDAA 3VM7A 2E40A 2XJ7A 2YBUA 5BCAA 1E6QM 4DWSB 2B31A 3VUPA 1QNSA 4V28A 1Y7VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KRU A;  2W63 A;  3VU2 A;  3VDB A;  1UA7 A;  3T2Q A;  2ZXQ A;  2VR4 A;  3S2C A;  2CBU A;  4AEE A;  3RJX A;  5D9O A;  5A6J A;  4NF7 A;  3WEN A;  2VZS A;  1ZL1 A;  4JIE A;  2DSU A;  3PHA A;  5A8M A;  3ALG A;  4IPN B;  5I79 A;  2ZE0 A;  4GPN A;  3W28 A;  2JF6 A;  4AZI A;  1BGG A;  1IZK A;  3KL5 A;  1H1N A;  1HJQ A;  1VEO A;  2QMK A;  1UD4 A;  1R85 A;  1WO2 A;  5FIP A;  3U5Y A;  1E72 M;  1EO7 A;  4MNM A;  3SUR A;  3ZMR A;  1SR0 A;  3AIC A;  4JKL A;  3UET A;  3TOP A;  4U2Z A;  4UZS A;  5A6M A;  1H2J A;  3QHO A;  2WMJ A;  1IZJ A;  4M80 A;  4U31 A;  4ML4 A;  1JIB A;  2XVG A;  4URI A;  2YL5 A;  1KGX A;  4W8L A;  4WK9 A;  3DHP A;  2XTK A;  3RPM A;  4D71 A;  1BAG A;  4BQ5 A;  1NP0 A;  1OGS A;  2GK1 B;  1KXQ A;  3N18 A;  5E0F A;  3U57 A;  5ABF B;  5I0D A;  2VX6 A;  1VBU A;  1UR8 A;  2CNC A;  1UWU A;  4D6C A;  3VGD A;  2JEP A;  2VZT A;  3M46 A;  4UR9 A;  1RP9 A;  2ZUW A;  3G6M A;  4UFI A;  1GOM A;  3NUK A;  4JCM A;  2WM0 A;  1UKT A;  2ZUS A;  4H2C A;  3A4A A;  3BMW A;  4M24 A;  4CUC A;  1B3Z A;  3MUY 1; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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