3TAOA

Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SRKPLIAGNWKMNLNHYEAIALVQKIAFSLPDKYYDRVDVAVIPPFTDLRSVQTLVDGDKLRLTYGAQDLSPHDSGAYTGDVSGAFLAKLGCSYVVVGHSERRTYHNEDDALVAAKAATALKHGLTPIVCIGEHLDVREAGNHVAHNIEQLRGSLAGLLAEQIGSVVIAYEPVWAIGTGRVASAADAQEVCAAIRKELASLASPRIADTVRVLYGGSVNAKNVGDIVAQDDVDGGLVGGASLDGEHFATLAAIAAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structural and functional characterization of Mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 99
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3taoA00
4UTTC 3W75A 5LNRA 3PS7A 3T7VA 1EX5A 3P84A 1QMLA 4ALDA 3QF0A 1TSIA 4AF0B 3MI6A 4DF2A 4XWUA 4CNNA 5AN7A 2JGQA 3QMRA 4FNPA 1YTDA 4OV4A 5CZTA 3E49A 2VFGA 3NAVA 4HNUA 2CZ5A 3LRLA 1YDVA 3LRKA 5EBUA 3NQDA 1MXSA 3LERA 5G4EA 5D09A 1T96A 2B7PA 3BW2A 1W5NA 5FI8A 3GYEA 5LSMA 5D30A 1I4NA 2CLEA 1IXOA 4X2RA 1L9WA 3LHZA 3TW7A 4ZL1A 3CEUA 2DP3A 3UYCA 2ZRZA 3W1UA 1O94A 4UFJA 2Y6ZA 3KRUA 3W2LA 2BX7A 4WXZA 3QH2A 4ZQNA 1JVNA 1SUXA 2J9ZA 4DO6A 3L2IA 5HR7A 1W56A 1TYGA 3W7HA 2VELA 4CQ9A 1TRIA 1H63A 1ZENA 3IV3A 3IGXA 2VC6A 1AW5A 3W7EA 3LV6A 5AHNA 3LCWA 5I3GA 4K37A 2R91A 1GTEA 2XFWA 3LB0A 5G4WA 1YTEA 4O0KA 3TSMA 2E6YA 2W6RA 2ALDA 1JCMP 5HINA 1K8YA 1K7EA 1G69A 2QUUA 3M16A 2V81A 3NGJA 2GQ9A 4D2JA 2OMAA 1MEHA 3LV5A 4N9DA 1F73A 1YTKA 2C16A 1TPH1 2BTMA 2NUXA 5DCEA 1KFKA 1XXXA 4E2BA 1MEWA 2H8XA 4NX5A 3UWQA 2PRLA 4GWEA 3TUUA 3W76A 2PE4A 3W1TA 1TPFA 5F4XA 4EF8A 3IVTA 1LZOA 3M5ZA 2E6FA 4BI6A 4IPJA 4BF9A 1VYPX 2F84A 4O14A 1ICQA 2BSLA 3SFKA 3G0SA 1VRDA 2YYTA 2Y62A 3NQMA 1ZAHA 1ZALA 2DU2A 3UD6A 4HKPA 1LOQA 1OFQA 3H55A 2OCZA 1OF8A 3LXAA 4DBDA 5D2TA 1UASA 3CIWA 4GUGA 1JQVA 3O6DA 4JXCA 3EWXA 1UUOA 5GVJA 3BARA 3T4CA 5CKSA 1ZAIA 4NJIA 4YXGA 3JS3A 4DPPA 4I7VA 1GYNA 4R34A 3W2MA 4MY1A 1R2TA 1FXPA 2YGYA 5F1VA 1PHWA 3O05A 5CPOA 1O60A 4EWND 5U7SA 2O7SA 1N7KA 3W1XA 2ZRVA 3QW3A 1BTMA 1OHLA 2C3ZA 5K7JA 3FIGA 4AF0A 5C2XA 1F76A 1XFBA 1TCDA 3S9YA 4PA8A 2OZ0A 5DCDA 3EXSA 2NLIA 3EWUA 4IMFA 5EY5A 2Z2UA 1LBFA 4Q4KA 2HSAA 3HG4A 3CIXA 3CLMA 3NVTA 2ZZ2A 4NX0A 3A21A 2ZZ4A 3GXPA 1A53A 2ATSA 3C3NA 5DLCA 3IIZA 4Q32A 1H7OA 3LHUA 4IPIA 1DL3A 4S1FA 2ZYFA 1W8SA 5LNVA 1QWGA 3A5VA 3ABOA 3NQAA 1AG1O 3DBPA 3SY5A 3PBUA 3KAOA 3IRDA 4Z0SA 4NXSA 3DU0A 2X1UA 5CZJA 5C6MA 3VCRA 4GFSA 3W1RA 3P60A 2A2IA 1WBJA 1QNVA 3P5ZA 1U5JA 1X1OA 4GNJA 3E0IA 2FB3A 3TIMA 3W84A 1PL9A 3MUXA 3G0XA 5D2WA 2A21A 3C0JA 3I68A 4FF7A 1JUKA 3TA6A 2ZZ1A 5F2MA 3FA5A 2QCMA 4M5PA 2Z0IA 4BWLC 4UTJA 4FXSA 2C18A 3PUEA 4DO5A 1L6WA 3TU9A 3N14A 5EMUA 3AO0A 3MBFA 1W0MA 3GDRA 2A85A 3L0GA 1I2PA 2R94A 2ABAA 1RVGA 2ZFAA 1RZMA 3RLVA 3TV8A 1TB3A 4AB4A 2YPIA 1SW3A 1ONRA 2NV2A 2ZBTA 3NG3A 5C5YA 3DXIA 1N55A 3EX4A 2ISWA 4RZ5A 3E96A 3F1QA 3MP4A 1YXCA 1TO3A 3NDOA 4O18A 3CU2A 3WK1A 1S5TA 2QCEA 1A50A 1YYAA 3TAOA 3NZRA 2QCLA 1TPEA 4NZFA 4UR7A 1W5PA 3M5XA 2W0UA 4UTUA 1C8VA 2Y7DA 1VYSX 4UMBA 4ZQOA 3MYOA 4KWWA 3EX2A 4IXXA 1LBMA 1WYIA 1O95A 1TV7A 3R12A 1GVSA 4KFOA 1X6UA 1QPNA 3G3DA 3QEZA 4GE8A 4MZ1A 2QJIA 2RDUA 1DV7A 2G5WA 4ZQCA 2WJZA 4K38A 2YW3A 1MZHA 5FEZA 2J9XA 2G95A 3HPZA 4ZQMA 4DF1A 4H6KA 3KVLA 3N34A 3W07A 4HPJA 2CLFA 3W3OA 1LLWA 2QF7A 2J27A 3WK2A 4N6EA 1O5KA 2WKJA 2NV1A 3LX9A 1H50A 1SZNA 1F5ZA 1HG3A 3EEGA 3BW4A 4O54A 3NQ7A 2QAPA 2WNNA 1BWKA 1S3HA 2WOQA 3ZS4A 2A7NA 1QO5A 3W1NA 1R30A 1KA9F 3NOEA 1H7NA 4DPQA 3S5ZA 1KM6A 4UMAA 1K3UA 3KFTA 1OX6A 3Q37A 2KZHA 1KLYA 4CQAA 2GVLA 3G8EA 2J88A 1X7FA 2FFCA 5HWNA 1DBTA 1A5BA 1LORA 1THFD 2FPYA 3V75A 1VR6A 2CW6A 4LT9A 3I7SA 4JTHA 2NUWA 2ZA3A 4XBKA 5C55A 2V0TA 5A8GA 2V5BA 3A9IA 1JCYA 2YFNA 3HB9A 1QPOA 2Z6JA 3W7KA 3STGA 4YCOA 3B0UX 4UTKA 5EL1A 3UWZA 1B4KA 1H7PA 1PHQA 4HHPA 5FF4A 2FB2A 4I7UA 4FNSA 3PR2A 5T26A 3F03K 3LBMA 3DFQA 2JKEA 4Y6GA 4BFAA 3HG5A 5L9FA 3ZR4A 4LNYA 4HSOA 4NUWA 3G1YA 3TQ0A 4MPQA 4LVAA 3G1VA 4WY0F 4QITA 4LS2A 1EWEA 1W5OA 3W88A 3HOJA 2VFIA 1DOSA 1KLZA 1TTPA 2VFEA 1H62A 3W7JA 2I9EA 1GEQA 2NXGA 1GWJA 3EWBX 3KVMA 1VLWA 2Y89A 4DBEA 2Q8LA 3G1SA 2Z6IA 2AGKA 1RQEA 1SQ7A 4MVAA 1F7BA 5DELA 3STFA 3W70A 4A2RA 1TPUA 3DI0A 4OQVA 1K7XA 2Y85A 3IIPA 4LV4A 1VHNA 1SZGA 1H1ZA 1EWDA 2PCQA 4PC8A 3BG9A 4I7WA 5K3VA 5DXXA 1D3HA 2CU0A 5LNWA 1FCUA 2R14A 4WUIA 2QJGA 3GLCA 4RXGA 3LTPA 3TK7A 4JIQA 3MHFA 3S42A 1TTQA 1Q6LA 4MY8A 1OK6A 3W1PA 1LM1A 3LI0A 3KXQA 1FCQA 4K39A 1G67A 5D03A 5EKYA 2C19A 2YX0A 1VS1A 5BMWA 1UBSA 3G18A 3KRSA 4TX9A 4Z1BA 3NQ2A 5MHBA 2Y70A 3N73A 1B3OA 3PB0A 4IQLA 4LW7A 4EVZA 1I2RA 1RV8A 3DZ1A 1TPWA 3L5AA 5F2GA 3FJ6A 1GVFA 4LUIA 1YXYA 3WJWA 1DVJA 3TDFA 3KOFA 4JEQA 1GG1A 1UCWA 2VFHA 4UXDA 2ZA2A 1IXNA 2FPVA 1UJPA 3C2VA 1KM1A 3NQEA 2P10A 2WSQA 1HTIA 1TTIA 1VCVA 4CCCA 1PS9A 3W7OA 2NXHA 3CEPA 2GJLA 4M19A 1I2OA 5F1UA 2BLEA 1BEUA 2X30A 1LTDA 1JUBA 2WV8A 4JYFA 3PBVA 4Y8FA 3L5LA 4E2DA 3CC1A 1VZWA 1XBYA 2A6NA 1EP3A 4K6AA 4LRTA 1KM0A 5CPMA 3HIJA 3M43A 3LXBA 5FF7A 4UTHA 3W73A 4JTSA 3P8IA 3P81A 1CW2A 2ZTJA 1K03A 2A7PA 3EX6A 3NPVA 4LVFA 4EF9A 5CG7A 4DXVA 4WQ6A 3WJZA 4O0ZA 1G4EA 3BG5A 4WX2A 3N9RA 1YXDA 3OA3A 2DJLA 2Y7GA 1TQXA 2VKZG 3SJ3A 3OBKA 4CNPA 3VE9A 4N4QA 4NNBA 5FEPA 1JRBA 3W7IA 1G7UA 1OFAA 5CPLA 1PVNA 2W79A 3CWOX 4WD0A 5DBUA 3UNDA 5AHFA 3I7RA 5EA9A 2D73A 4BI5A 5U4NA 3M5YA 3IVUA 3SECA 3C2RA 3O8AA 4MYAA 2QCCA 4M6QA 3L66A 2DZUA 2ZZ5A 3C2FA 5H2ZA 4FNRA 4CQ8A 5KTLA 1DKWA 1OYCA 1FWSA 3LXCA 3SW6A 3FJLA 1VH7A 3S5OA 5G2IA 3W7LA 4M7TA 3C6CA 1OVDA 3C8FA 2QCNA 3G0UA 1I8JA 4UTWA 4FIQA 4UR8A 5AC6A 4MKNA 1H5YA 4IOTA 5G1YA 3TAKA 1OG0A 2A0NA 1JJKA 3W2KA 3E12A 4IMGA 1VC4A 3MI3A 4LU0A 3F4WA 4JX5A 2ZRWA 3T78A 4AXKA 2YCEA 8TIMA 1ALDA 4FNQA 2ZDRA 1XI3A 3ABRA 2HMCA 1GG0A 5BRBA 3O16A 3UPBA 2FTPA 3KRZA 3GXNA 3EB2A 4UC5A 2Y61A 3V1PA 1LYXA 2FLIA 3TSDA 4CCDA 3DFNA 1LRNA 4IMCA 4AVFA 4BR1A 3TKFA 1EA0A 1EPXA 2HS8A 1AW2A 2CWNA 3NQVA 1M6JA 3C56A 3W74A 4TO8A 3W1AA 1G7VA 3K30A 4DEFA 4PCFA 3NQGA 1NSJA 4TIMA 1HO4A 3W1QA 2RDWA 3SGZA 4N02A 5BMXA 1AMKA 3EKLA 4S2BA 2RH9A 1OYBA 1GVRA 1W3NA 2A5HA 1Y0EA 2ZRXA 5A5WA 3H54A 5DBTA 1WXJA 1WAUA 4P61A 3NL2A 4UFHA 1OFOA 3TFXA 3RFAA 4MLJA 2B7QA 2JKPA 5K4ZA 3LHVA 4A22A 1IXQA 5K2ZA 3W83A 4A29A 4GBUA 1KFEA 4QAIA 1BKSA 3GAKA 3A22A 3W7MA 1M7PA 5HR6A 1OFPA 5CPNA 1SR9A 4OE7A 1OFDA 4OGZA 5ABTA 3W1LA 4Y9AA 1ZY9A 2DZXA 1WOAA 1KBIA 3L65A 3OHIA 4Z08A 1RD5A 3M7WA 2JBMA 1VCFA 3DHFA 3OVPA 4JICA 1ADOA 4FHAA 4RJEA 3U2OA 4O1BA 3GKAA 2QJHA 1QOQA 5AYZA 3P74A 3TE9A 5FEXA 1OK4A 1XC4A 2G96A 5AHLA 1A5SA 2JK2A 1KM4A 1ZAJA 3UY7A 2GPTA 5HNRA 4P2VA 2PRMA 3NR0A 4CLMA 1EUAA 1TPDA 3TQVA 3CPRA 4X22A 1I45A 4R33A 1B57A 4YLWA 1F05A 1UUMA 2AAMA 1O4UA 1KV8A 4BK9A 2G97A 3TC6A 5D32A 1IXPA 1P4CA 4WOZA 1KM3A 2GVJA 1IF2A 4O16A 4UTIA 1SO6A 5J5RA 5KSWA 4AHQA 5KZMA 3O6YX 3S5YA 1GZGA 4LC8A 5CZSA 3PBWA 4WY0A 5CSSA 3W71A 4JTKA 2TMDA 1WOBA 3EKZA 3A24A 4QNEA 2VEPA 3P8JA 3I6RA 3PSVA 5HWMA 5HUOA 5CGQA 4RV8A 2H6RA 3LTYA 2UV8G 1AL8A 3T44A 1B4EA 3W86A 4W9TA 1YADA 1FWRA 2Q3RA 3TROA 1L6YA 1W5MA 2IQTA 2QR6A 3HO8A 4UUIA 1MO0A 4MJZA 4O1DA 2WQPA 4TU1A 3R2GA 1SZFA 4HPXA 3KX6A 4M6VA 2CLHA 3LCHA 3SR7A 1NFBA 3WJSA 2ZCGA 2NX9A 3MP3A 3PAJA 3TCEA 3QSRA 4XQ6A 2NX1A 1O5XA 3CHVA 3P61A 1ML1A 4ADUA 3EX3A 1KTCA 1OX4B 5D37A 1QPRA 1SW0A 3W23A 1KFCA 2C13A 4RXFA 3LLDA 1S5WA 4RLIA 1TREA 1VHCA 3BGGA 4PL2A 4G1KA 3BGJA 1K8ZA 1VPXA 3LOTA 4GC4A 3W72A 1CI1A 4O1AA 5K9CA 3F4NA 5G1TA 4ONVA 2BWGA 4YCPA 2WNZA 4OU1A 4ML9A 4NJGA 3PM6A 1LLZA 3B05A 4RK8A 2A4AA 2B4GA 1SPQA 4K36A 1I2NA 3TSBA 1P0NA 3M5VA 1FXQA 3NO5A 5HQEA 2PC4A 1U83A 2X1TA 2TYSA 5DY3A 3LHTA 4BI7A 5AB3A 3LHYA 4LVGA 4GUJA 4X3ZA 1C9DA 3W9ZA 1Q6OA 1MSSA 1KM2A 4O15A 1XUUA 4UTWC 4NJJA 1KFLA 2EF9A 5KZDA 3ZFHA 3BVJA 1P1XA 3PWAA 1LRQA 3QZEA 3VNDA 1QFEA 1RPXA 4JY8A 3ATZA 3NPUA 4Z1CA 4QSHA 5BW6A 2Q8ZA 2V2DA 4QQ3A 1R47A 1KTBA 1I2QA 2F7FA 1H7XA 3W6YA 1F74A 1SSDA 5DN1A 3M9YA 3S6DA 4QISA 1F6PA 4GUHA 4LRSA 4JTEA 2Y63A 2I14A 3KHJA 1EIXA 1Q3NA 3MO7A 1QCWA 2Y7EA 3WK0A 5G2HA 3EWWA 4MJMA 5KITA 2X1SA 4IJBA 5D2YA 3DHDA 1OFRA 1GQNA 3FYPA 4JDYA 3CT7A 1RR2A 1EP1A 4NU7A 1UB3A 3PG8A 1PE1A 5LNSA 3B8DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JCL A;  1ZBW A;  3HPF A;  1EGZ A;  3PZO A;  4AF0 B;  3MI6 A;  1NIU A;  5AC5 A;  4LGX A;  3TN3 A;  4IIE A;  3AYT A;  3NAV A;  2CZ5 A;  1K9F A;  5EBU A;  3NQD A;  3LER A;  4GQB A;  3BW2 A;  1EYE A;  3DX5 A;  1V03 A;  4IID A;  5D30 A;  1I4N A;  2CLE A;  3VD4 A;  1VBJ A;  1IXO A;  4X2R A;  4ZXO A;  4ZA0 A;  3LHZ A;  5HPC A;  1UC5 A;  4ZL1 A;  1CEO A;  2X09 A;  4Q8T A;  3E6E A;  4AIO A;  4E5T A;  4Z17 A;  3CEU A;  4H9M A;  2PP1 A;  2BX7 A;  3MZN A;  3QKE A;  4D6I A;  1SUX A;  4KIE A;  5HR7 A;  3W7H A;  1ZEN A;  4BKN A;  3UZW A;  2VC6 A;  2PD5 A;  5DAN A;  2WMF A;  3W7E A;  3LV6 A;  2DPE A;  1GTE A;  4I8Y A;  3GVQ A;  4XZM X;  1UWT A;  1ZZM A;  3VD9 A;  2WWD A;  2DH3 A;  1E1F A;  1NTH A;  2GQ9 A;  2XHY A;  3A64 A;  1MEH A;  4N9D A;  2JAL A;  2C16 A;  2PDL A;  3LSB A;  2BTM A;  3TYZ A;  3I3E A;  1MEW A;  3IAN A;  4K8G A;  3UWQ A;  2WMJ A;  2HK1 A;  2VX7 A;  3CPU A;  5XIN A;  4CD8 A;  5MKG B;  5FJP A;  4A05 A;  3RCM A;  2INE A;  4O14 A;  3WZ0 E;  1TV3 A;  1E0X A;  1PBG A;  3G0S A;  3VKA A;  2DU2 A; 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