3TU9A

Crystal structure of rabbit muscle aldolase bound with 5-o-methyl mannitol 1,6-phosphate
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Mannitol Bis-phosphate Based Inhibitors of Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 143
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tu9A00
5AHEA 3GXTA 4FHAA 3FYOA 4TIMA 3W7KA 4FIRA 3TUUA 4KKXA 3CWOX 1RPXA 3A21A 3G1AA 5AHIA 2OCZA 2R94A 5HNRA 2QJIA 4LNYA 3SGUA 1HO1A 4LTSA 2PRHA 2V81A 1AMKA 3BGGA 3KRSA 4UIOA 4I7WA 1S5WA 2TYSA 3SZ8A 1T96A 3LDVA 1TPEA 1TV7A 2WNNA 3G24A 2J27A 1GWJA 4QNWA 3NNTA 2VEMA 3TKFA 3GKFA 3RK8A 3INPA 3NQFA 3TC7A 4P61A 4N6FA 4MUZA 2DORA 4G1KA 3BG9A 1B57A 3S6DA 3BLIA 3O6YX 3SECA 1JCJA 2DP3A 3M5VA 1H7XA 2ZZ4A 2JK2A 3NR0A 4LT9A 2YXGA 5I3IA 4ZVJA 2RFGA 1HTIA 3FEMA 4MLJA 2Q8LA 4JIPA 1TREA 4JYDA 1UASA 4DPPA 4I9AA 4JTTA 3BARA 5LKYA 3W7HA 3O07A 3GYEA 3C2FA 1LROA 1YXYA 4H6KA 1KM6A 4M5PA 3MWAA 1KLZA 4NX5A 3LTPA 3QF0A 1TPC1 2FPYA 2V2DA 4UXDA 2W79A 2YYTA 2QAFA 5HJLA 1OHLA 2VEKA 5DN1A 4CQ8A 4O11A 1O5XA 1WYIA 3S0CA 1Z41A 3PUOA 4PTNA 1QPQA 5L6UA 2NZLA 2PURA 3UZ5A 5AFDA 5MHBA 1QPOA 5HR7A 5D32A 4AVFA 5FF7A 4IX2A 3EWZA 5AC6A 4UFLA 2Y63A 3C0JA 4YMZA 3QRHA 2EKCA 1D3HA 3W2NA 2PE4A 1BTMA 3HPZA 4CNNA 1NEYA 1KV5A 3VKJA 5LZLA 4A22A 4JYEA 4GFSA 3TA6A 5F4XA 4UFJA 1IXQA 4LS2A 4GUGA 4MJMA 3SFKA 1HFBA 1A5CA 2P0OA 1X1OA 1F73A 3SY5A 1VYPX 1WBHA 3W7JA 5I3KA 5LHEA 1Q6QA 3G8RA 3DH7A 1KM3A 3FIGA 3RLUA 5IBXC 3W1MA 3VE7A 5K9DA 1ME7A 4UCGA 1TJRA 3MW7A 4GE8A 1DHPA 4PEKA 4FF7A 3M16A 3E9AA 2W0UA 2HS6A 3HBLA 4J9JA 1FCBA 5HUPA 3SJ3A 3CM4A 1XBVA 3UY8A 1UJPA 3L5MA 4WXYA 3UWYA 2V0TA 5A5WA 1YPIA 2GUUA 3M47A 3DKLA 4IMCA 4DF1A 2TRSA 4JR5A 3TW7A 1FWSA 4U28A 4N9DA 1YDVA 3P84A 4LW7A 2J9YA 4K39A 3NGJA 2BZNA 2V2HA 3P62A 4UTKA 3NYZA 3UWVA 1W56A 3LRLA 3B04A 3EX1A 4WJEA 2X1UA 3N9SA 4L4LA 4X22A 2DJXA 1V5XA 4HSNA 5LNRA 3D0CA 3CWNA 1IIHA 3OHIA 4FX6M 3MI6A 1TPUA 3W2UA 1VC4A 3LCLA 1JUBA 3MUXA 3FYPA 2ZRUA 2XN1A 1X1ZA 1QCWA 2B7OA 3LXBA 4UFIA 4C1KA 1VLIA 1W5OA 2ISSA 1TRIA 4JDYA 3L0KA 1PIIA 3HQ1A 1NF0A 1M5WA 1LRNA 3TX9A 1OX4B 1A5BA 1IGSA 3QH2A 3GDMA 1P0NA 4FNUA 2EPHA 4NJJA 1WDWA 3LOTA 4JTLA 4HNVA 2ISVA 5AYYA 4Z0JA 2BLEA 1GVRA 5I3JA 1L6WA 5G1YA 3O1NA 2NXHA 3FJLA 3LB0A 4WQ6A 3B05A 4AWUA 4LVFA 4RZ4A 4NT0A 2YR1A 3WK2A 3LTSA 3ABSA 4KWVA 3WJXA 4FNQA 4O1AA 4XQ6A 4WY0B 3N34A 3G0SA 3MHGA 1OYAA 1F05A 3CHVA 5C2XA 2DZUA 3VFLA 1A5AA 5CZTA 5EKYA 1W8SA 3E49A 3M5YA 1W31A 2CLFA 4JTGA 5DXXA 3HG5A 2Y7DA 2Z1BA 3TJXA 2CLHA 3MYOA 3DFNA 1I2QA 1ME8A 3C52A 3AO0A 4ZQRA 1H63A 4QSHA 5LGZA 5F2IA 1OG0A 1I2OA 1OF8A 2NXGA 3GKAA 1Q3NA 3CPRA 2H3DA 2X1TA 5D30A 4K8EA 3KHJA 3PF3A 3UY7A 1XUUA 1JQXA 1WXJA 2E5CA 4ADUA 5D03A 5G2HA 3NM3A 3M5XA 5DY2A 3CEPA 3S42A 3LLFA 4XUGA 3IIVA 4XBSA 3G1DA 3RFAA 5DXYA 3LI1A 3KRZA 4HNUA 3N2MA 2J9ZA 3S1VA 3BG3A 3PBUA 3WK3A 1DQXA 2QAPA 1JUKA 1R2SA 1A53A 1ONRA 4LUJA 3UD6A 4I7UA 1P1XA 2YSWA 2Z6IA 1X7FA 4WZHA 4JTKA 4H3DA 4NZFA 2ZYFA 2B0MA 4N02A 3FKKA 3HIJA 2C19A 4JTFA 1G4SA 3KVJA 4N6EA 4E38A 5KZDA 3BLFA 1OK6A 3C3NA 2YZRA 1XKYA 2QJGA 3HB9A 3G1YA 3B0PA 4AMAA 1LLZA 2FIQA 1LTDA 3W1NA 1K7XA 2I14A 4LOCA 2EAWA 4UTWA 2Y62A 2QCDA 4Y8FA 2I9EA 3PG9A 1JCNA 3QJAA 3STCA 2X30A 3TFCA 1YTDA 4ZL1A 4MIMA 3IGUA 4DF2A 5G1TA 1SR9A 5LGXA 4NJIA 2X1RA 3TU9A 1LBMA 3LRKA 5SWUA 1KM4A 2ZBTA 4UTHA 4UFHA 2V5BA 3VNDA 1B3OA 4IMFA 4PH6A 4E2BA 1SFLA 3W84A 4TU1A 1DVJA 1H51A 3PC0A 3LCIA 1BKSA 1XM3A 2DJLA 1E51A 5ABTA 3G1VA 3W2MA 3UQNA 2GVGA 3MP4A 2WKJA 1PHWA 1RQHA 2CW6A 1IXOA 1KBIA 5I3GA 1H1YA 1DOSA 3MO7A 5D33A 5KSWA 1N7KA 2E77A 3L0GA 1NAL1 2E1DA 1WOBA 2VFIA 2GJNA 5EMUA 3PM6A 1DQWA 4FO4A 4AWSA 1KFKA 1UBSA 3HGJA 4LU0A 3W7QA 3W6YA 3HMJG 4MYAA 4AAJA 1GOXA 2Q3RA 4N9CA 3W87A 3NEVA 4BI6A 1EB3A 3QSRA 1G4EA 1ZAIA 3EX2A 2QCLA 3BG5A 1O94A 2DU2A 1EPXA 3UPWA 3LI0A 4KFNA 1GVOA 1YDNA 1TJPA 1EWDA 4YL2A 4DF0A 5A8GA 1FWNA 4RJEA 5DBUA 3MBFA 4EIVA 1FCVA 2WPBA 4MJZA 4O17A 1LRTA 3WK0A 4MKNA 1BEUA 1TO3A 1EEPA 1EP1A 2JKEA 4TR9A 4GJ1A 1P4CA 2ZZ7A 3F4WA 3UPBA 3G8EA 1VPXA 2CZEA 3NQ6A 5J5RA 2Z6JA 2GVLA 1RD5A 4WOQA 3RLVA 2C0AA 1CW2A 4O1DA 3W9ZA 3QYQA 2NUWA 2BSLA 2A5HA 4O19A 2RDTA 2UV8G 5CZJA 3P81A 1UUOA 1JR1A 3BV4A 3EWYA 3OEXA 4RK8A 1LOQA 1KW1A 1RQEA 3ATYA 2A1YA 4IMEA 3M5ZA 2ZTJA 1H7OA 4FB7A 1YXDA 4UMBA 3I7QA 2WV8A 3N9RA 3WFAA 1G69A 4XZ9A 2GPTA 1XI3A 2QUTA 3LHWA 4PCFA 3PSWA 4UTJA 4EF8A 3G1XA 1YTEA 3LHVA 3V75A 1OYBA 2CFFA 3N19B 2XN0A 2E5DA 3OVQA 1FXQA 1W5PA 2BTMA 3A5VA 3W83A 3B8DA 2R91A 4NUWA 2CU0A 3EXRA 4BK9A 3NA8A 2ZRXA 1SZFA 3NQ2A 3QM3A 5G4EA 4EF9A 3Q58A 1IIGA 4JEQA 3EWBX 1XBYA 1W37A 1W3IA 4HPXA 3YPIA 3IRDA 1KFEA 3BO9A 1K8ZA 3WJZA 3S1XA 4GUFA 4I7VA 3GDRA 1F5ZA 1K8XA 2FB2A 4E0CA 2A7PA 1WV2A 1PS9A 4DO6A 1K8YA 4WOZA 3NZRA 4JTEA 3W1TA 3EWWA 3HGRA 3IGXA 2J6XA 2WSYA 3TW6A 3WJSA 3NPWA 1C8VA 4XTIA 2F84A 2P1FA 2JGYA 3ABQA 1GQNA 5BMWA 3NL6A 1SSDA 1YYAA 1TV5A 1C9DA 2AGKA 3NPXA 5CSSA 3T40A 3H53A 3C2OA 2GQ9A 2FQIA 3GAKA 4DO4A 2X2GA 2WJZA 3G3DA 2QR6A 5D2VA 1PHQA 3HF3A 4FIQA 4DXVA 1D9EA 3VCRA 3ABOA 3NDOA 3H54A 4O13A 3QMTA 4MLRA 2ZQ0A 1TTQA 4A3UA 4LC8A 4C1LA 3W7LA 1VLWA 4KFPA 3GXPA 1ZALA 2YCEA 3LV6A 3HOJA 3KRUA 4B5NA 2G97A 3L0NA 1FWTA 4RKAA 5CG7A 3E96A 3W1LA 3N73A 2J24A 2QUUA 1VH7A 3HGSA 4MZ1A 3S5OA 4DBEA 2Y70A 3U6WA 4NJKA 3GDKA 5K3VA 8TIMA 1QNVA 2VELA 3ZR4A 2HSAA 5D05A 3QPYA 2QCNA 4S1FA 1FDYA 3LXAA 1O4UA 5HWNA 1HL2A 1I45A 2ALDA 4ZQOA 1DJNA 5CZ0A 2O7QA 1C29A 1ZHAA 2WOQA 3L5AA 4IX0A 1G6CA 4LUIA 5K7JA 3FKRA 1HO4A 4PL2A 3P80A 3TE9A 3N3MA 3O6CA 2C18A 2V2CA 5EL1A 3P8JA 1KTCA 2YYUA 3W1UA 1KM2A 1P5BA 3DI0A 3ELFA 1OFOA 1OFBA 2OMAA 5KZMA 4MVAA 5KINA 3TAOA 2FFCA 1HUVA 1P0KA 7TIMA 4FX8A 5K9XA 4ONVA 1KFLA 3DGRA 4L4MA 3TDFA 5EPDA 4Y96A 4ALDA 1OX6A 1FUYA 4ZZ9A 4AB4A 3STGA 3KXQA 3DHFA 3DFQA 2FJKA 1H5YA 2C14A 2NWRA 2GOUA 1W1ZA 3DFOA 1QR7A 2H8XA 1M7OA 1W0MA 1OVDA 3GZ3A 4QQ3A 3T4CA 3ZS4A 4Z1DA 2WSRA 3NG3A 5C54A 4BWLC 2WSQA 1GZGA 1LBLA 4IXXA 4X9SA 3C2RA 4DEFA 1JCXA 3L68A 4NNBA 4RV8A 3IIPA 4X2RA 3VE9A 3W1RA 3F4NA 3UXAA 2TMDA 3BW3A 3ABRA 1TMHA 2A7RA 3L2IA 1FX6A 4MYXA 4UMCA 3BLEA 1KV8A 2RKXA 3CU2A 3LM7A 1I2PA 4GXMA 5HULA 3QEZA 3P5ZA 3M9YA 5KTLA 1VRDA 2BX7A 1T99A 1W3NA 3A22A 4LS1A 3W85A 5HINA 4JX5A 2VKZG 1NSJA 1XL9A 3EWUA 5D2YA 3SGZA 1AK5A 3C2EA 3TMQA 3SSJA 5GVJA 4O1CA 3GR8A 4GNJA 1N8FA 3K30A 3NL5A 4AWTA 1G67A 1TPDA 3R13A 5F4SA 4O14A 1JJKA 4ZQPA 2EGZA 3W74A 3I6RA 2CLKA 4D2JA 1FDJA 3ZFHA 5HWMA 3GAYA 1QWGA 3EB2A 4DBDA 1G4TA 4LVBA 5U4NA 5EBUA 4JTIA 4FNTA 1RV8A 1LDCA 2AAMA 4OBTA 1TCDA 2NLIA 2WNZA 3LXCA 1ZY9A 5IM51 4O57A 1HG3A 4DPQA 4CLMA 3LX9A 5CPLA 3QQ0A 3DI1A 1FY6A 3L21A 2QF7A 2QCEA 4YCOA 1ICPA 3LCGA 4JTSA 3TROA 1AL8A 3MJYA 4M7TA 4M6PA 2H6RA 1KTBA 3NL3A 3TH6A 1XCFA 2V82A 2P10A 3W88A 1O95A 3HPSA 5BOOA 1JRCA 2R14A 1L6SA 4NJHA 3TQ0A 4DELA 3PUDA 1YADA 3EXSA 1W5NA 3B06A 3V1PA 1QO2A 3W75A 3S9YA 2ZFAA 5D2XA 2CWNA 4NNAA 4OU1A 1QMLA 3T78A 1H60A 1TIMA 2GVJA 3TJLA 2ZRWA 1FCQA 1MZHA 5G2IA 3GIYA 4R33A 4O8RA 1F2JA 3TNOA 2A2IA 1RQBA 2GJLA 2CLOA 1GTHA 4S2BA 4JD4A 4HNNA 3SW6A 3W1AA 3PBWA 1WAUA 1JUEA 3M6YA 2V30A 4FNPA 2Y89A 4LVAA 2VFGA 4YXGA 3Q94A 4N4QA 4Z08A 2ABBA 1TTJA 5AHMA 3USBA 4GUJA 3PB0A 1T8XA 4AF0B 3GB6A 3O8AA 1R2TA 3CLMA 3DFSA 1XBZA 1FCUA 2QJHA 3I68A 4KFOA 5LNUA 1DJQA 2A6LA 2O7SA 1TPB1 1TPWA 3T44A 2E5BA 3L66A 4S2CA 2GQAA 2QCHA 1ZENA 1R46A 1JQVA 3P82A 5CZSA 1FQ0A 3UZJA 2YGYA 1OJXA 3PUEA 1ME9A 3G18A 3DFPA 5TIMA 2E6AA 3S5ZA 4BFAA 3KVKA 4OGZA 2ZZ5A 3I65A 2ABAA 5BNKA 4FXRA 3W72A 4M6QA 3GNNA 3STFA 3PS7A 4OQVA 1PCWA 4O4WA 1ICSA 1SUXA 1AL7A 2Y6ZA 5AC8A 2E68A 4NXSA 4JDBA 4O18A 4FEZA 3AJXA 4POCA 5HMSA 3NQEA 2WNQA 2BXVA 3DKJA 3CQ0A 1KTNA 1G4PA 1OABA 1M6JA 4K6AA 5KMYA 5F2GA 4Q33A 5FEZA 1NFBA 1GT8A 3PULA 2A21A 1MXSA 3CIXA 3LERA 3R5EA 4M6VA 2NUYA 3JR2A 4IXHA 4BI5A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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