3UWWA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 88
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwwA00
4M7TA 5DXYA 2C19A 4Y9AA 1VYRA 1LLWA 5G4EA 1ZENA 4WXYA 3GVGA 4LTSA 1RVGA 3QRHA 1SO5A 2NUWA 3NL5A 1H7XA 4RR4A 3TAKA 1VYSX 1G4TA 1I2PA 4PC8A 3LDVA 1G4PA 4Z0JA 3AO0A 3QM3A 1DJNA 3I7RA 3ABOA 2RH9A 1LDCA 4RZ6A 2B7NA 4YCOA 4LC6A 5BMWA 1TV7A 3STEA 3G1HA 3P67A 1ZALA 3ABSA 4NX0A 2YSWA 2Q8LA 4UR8A 3O63A 1GQNA 1P4CA 3D0CA 2ZRZA 4KFNA 4Z08A 3ATYA 3MBDA 3LCFA 1BWKA 2Y61A 1JVNA 1KV8A 2GJNA 3QF0A 2FLIA 4IJBA 1HUVA 4RZ4A 3W85A 1ONRA 2QCDB 1ME8A 4JTGA 4O28A 1MEIA 4NJJA 4NQ1A 2W0UA 1VJIA 3B4UA 3STCA 4ZZ9A 3ABQA 4LRTA 4O14A 5EBUA 2ZBTA 4HKPA 1VYPX 1Z44A 1FCVA 4GJ1A 3HPZA 1TPH1 5GVJA 2JBMA 3BV4A 2EAWA 4Z0SA 2RKXA 3T4CA 3N34A 3W1XA 4U28A 3M44A 2FFCA 4ADTA 4FNPA 1SR9A 4H3DA 1EPXA 4IX0A 3MWAA 3UWQA 1DQXA 3DH7A 4HSOA 2VFFA 5LNSA 1ADOA 1SZFA 4CQ8A 1R30A 3W9ZA 2V8ZA 2BZNA 1WOAA 3MBFA 4MFDA 3HPXA 3IGUA 2X30A 4MY9A 5D09A 2ZRYA 3IEBA 1GZGA 2Y6ZA 5AFDA 3DU0A 3Q2DA 1GT8A 4BWLC 1B4KA 1WQ5A 3TR2A 1GVOA 3R13A 2E68A 1PV8A 4OBTA 1TYGA 2OJPA 1QO5A 1TPUA 2A6NA 3G1YA 3NNTA 3NZ1A 1K8XA 1AW5A 5DCEA 4G1KA 1KLZA 5D2WA 2C0AA 1W56A 2FIQA 4O19A 4MY1A 2X16A 2A1YA 4WUIA 1LM1A 1SZGA 4BK9A 2B4GA 3CWOX 5AHNA 2XN1A 4JDBA 5FF0A 1KM6A 4A3UA 2J9YA 1R46A 4QJ1A 4XQ6A 4ALDA 3GDMA 4AWSA 3EX2A 2GQ8A 1PCWA 3C2RA 2XFWA 3SGUA 3NGJA 1EUAA 1KLYA 5CPLA 1U83A 3W1PA 1J5TA 3GZ3A 3B04A 5DLCA 5I3JA 3W7GA 3TH6A 1VC4A 4PH6A 1YTEA 1KFBA 3LXCA 5D2XA 3UY7A 4I7UA 1LOLA 4JN6A 1HO1A 4LVGA 2CLHA 1FWWA 4FF7A 3S1XA 5K9DA 1B57A 3FYPA 3QPZA 2CZ5A 3OHIA 3V75A 4LS1A 5F2LA 3MYPA 1TTQA 3LERA 1VHNA 4MLRA 3MYOA 4YCPA 1SZEA 2VFIA 4YWIA 5HJLA 3ZR4A 3I6RA 3GNNA 2YYTA 3G1AA 4MZYA 1OABA 4BFAA 3JR2A 1NFBA 1TJRA 3EXSA 4HNTA 4IXHA 1WV2A 3NYZA 2QCCA 1SU5A 5F1VA 3W2KA 2QCGA 3FYOA 3LHVA 5AHFA 4RV8A 1MO0A 2Y62A 3Q58A 2RFGA 2FTPA 3LOTA 2C18A 4WX2A 3M5YA 4PA8A 1SSGA 1BEUA 4MVAA 3LTPA 1XBXA 1FXQA 3A22A 2H8XA 4BI5A 1TTJA 2AAMA 4DPQA 2ZRUA 3W7IA 1TPDA 1FXPA 1U5JA 3FLUA 3CEUA 4TMCA 3H53A 3HOJA 4GNJA 4UTMA 3KHJA 3THQA 4R7JA 4HNVA 2GOUA 1DV7A 5CPNA 5LHEA 4BI7A 3QMRA 2YDAA 3IVTA 4CCEA 4JNMA 3NZRA 4CNNA 3DGRA 2H8ZA 4WXZA 3GK0A 3G8EA 1GVFA 3O6CA 4N9EA 4HNUA 4O18A 1Z41A 4O4VA 3PB2A 1NF0A 3EB2A 2H3DA 3L0GA 4K38A 4UTLA 1FWTA 3T7VA 1X6UA 1W37A 1O95A 2G97A 2YYUA 1ZCOA 2P10A 2E09A 1FDJA 3EWBX 4N4QA 4M6QA 3WJXA 4ADUA 3WJZA 5HWJA 4O13A 3HO8A 3QH2A 4FNRA 1EWEA 2NUYA 4CQAA 5TBOA 4JTIA 5FI8A 3P62A 3PWAA 3EWUA 2C14A 2EF9A 1GTEA 1EUNA 4AHQA 3L67A 2Z0IA 3G0XA 3CPRA 4FXSA 6ALDA 2Q3RA 2RDTA 4GUHA 1VCVA 1PCKA 3AJXA 2QCLA 2PE4A 2ZYFA 1M7PA 5HWNA 3IRDA 5LGZA 1F2JA 5KZMA 1LOSA 1TV5A 3TKFA 4NXSA 5EPDA 3NL2A 4LVAA 3M0ZA 4GUFA 4PL2A 1L6YA 3MHFA 1P5BA 4WZHA 4YL2A 1RPXA 3VE7A 1I8JA 5LNWA 4Y8FA 3W2LA 3ZWTA 1SQ7A 4JX5A 4LWWA 2D73A 2YFNA 4YXGA 2VC6A 3C8FA 3FJ6A 4QAIA 4EF9A 3E49A 3TMLA 1EEPA 3L65A 4OE7A 1T0OA 3LCLA 4O4WA 4IMGA 4JTKA 3W76A 3W1NA 1XKYA 5AYXA 3P60A 4N02A 2ZCGA 1G69A 1IGSA 1A53A 3MJYA 3W23A 1KM1A 4WOZA 3S1UA 2BXVA 5AHMA 5I3KA 3G8RA 4JICA 4MJZA 4DF0A 1YTKA 3EX1A 4TMBA 3ABRA 4DBEA 4UFJA 3MI3A 3EKLA 5HQEA 4CLMA 4GFSA 5BRBA 5AYZA 3EXTA 4KWWA 3LBMA 3QPYA 3R2GA 1Q6RA 2X1UA 3S6DA 4WY0F 3TXZA 1L6SA 2GVGA 1SW0A 3W84A 4JTHA 3G1XA 3PG9A 1H50A 2WSRA 3G3DA 4O8RA 5LHFA 5DBTA 3B0VC 4LVFA 2IQTA 4A29A 4EIVA 3G0UA 1X8FA 1B3OA 2CFFA 3IIXA 4JTTA 3TJXA 2I1OA 3BLEA 2V5BA 1SFLA 3NQ6A 4GE8A 1OHLA 1XBZA 5AHEA 3F1QA 3EX3A 4LC8A 1Z42A 5FEZA 2WV8A 4NNBA 5D33A 4NXKA 3TX9A 3BW3A 3P7YA 5CZTA 2CW6A 1TSIA 5CZ0A 1SO3A 3WK0A 3P8JA 3OVQA 3TDFA 4GC4A 4UMAA 4KWVA 1I4NA 4Z1CA 5AC6A 4NUWA 3A5VA 1K8ZA 3UY8A 1TMHA 1XFBA 1OFBA 4JTEA 3UXAA 2YW3A 3E9AA 3EKZA 5T26A 5C2XA 3TROA 4JD4A 3W88A 1JUBA 3SY5A 3MHGA 2NLIA 2PRLA 2H3BA 5BNKA 5MHBA 1LORA 3MI6A 3P61A 3NQCA 1W3IA 3KRZA 4WQ6A 2CZFA 1W3NA 1IXOA 2ZZ3A 3S5NA 3GAYA 3LGEA 5FF3A 1K8YA 3O07A 3LB0A 5AOUA 1SW3A 4MUZA 4AAJA 5HUOA 2ZA2A 3CHVA 2J9ZA 4O11A 5EKYA 3WK2A 3GXPA 1W1ZA 3TU9A 5G2IA 3VCRA 4RKAA 4JIPA 5KMYA 3L21A 5L6UA 3C6CA 1HFBA 3CLMA 3M5XA 4AF0A 4DO5A 5G2WA 1JRBA 2FB3A 4NJKA 4AH7A 1QMLA 3NQ8A 1M6JA 4WY0A 2R8WA 4KFPA 3S1VA 5DY3A 4OT7A 1VLIA 1OF8A 2G96A 1OX4B 1LCOA 3CEPA 5G4WA 3U8GA 4CNOA 1DOSA 3P84A 3W7LA 3HIJA 1WBHA 5TIMA 5LGXA 4NVTA 3M7WA 4K37A 3TC7A 3B0PA 6TIMA 3BG3A 3Q94A 5HR6A 4CQ9A 4D2JA 4UXDA 3N2MA 3IIVA 1UUMA 3W3OA 3MW7A 1O5XA 2F84A 2ZZ2A 5HWMA 5EY5A 3O06A 1J4EA 3S9YA 3SI9A 4WJEA 2VEIA 4NNAA 3NM3A 1CI1A 4O1CA 2Z6JA 1OYCA 5KTLA 4ZQPA 2DU2A 4M19A 3THAA 4O0KA 1FY6A 4JTJA 1HTIA 4XZ9A 1QPOA 5D32A 1DORA 3W7NA 3EXRA 4OHQA 3GDRA 1H7WA 1TPFA 1DVJA 4OV9A 3VKJA 2ATMA 1KBJA 1UJPA 4N6FA 2CU0A 1KM0A 2TPSA 3S0CA 4R34A 1F6KA 1H62A 3NPWA 1N7KA 3NAVA 3W83A 2YX0A 1OFEA 4HT3A 3BGGA 1BWLA 3C2VA 1X7FA 4MFEA 1MZHA 3LM7A 2E6DA 1SW7A 3NO5A 1I2RA 2ATSA 3M9YA 4DBDA 4HPJA 1YDNA 1SO4A 5DCDA 4UNLA 4O0ZA 4DQWA 1Y0EA 2Q8ZA 5AHIA 1LP6A 3LHTA 3HG4A 3W2NA 1ICQA 3LX9A 4MOZA 2VFGA 1SFJA 1VCFA 4MY8A 5D02A 2DP3A 1GVRA 3VI2A 3QW4B 4E2DA 1JCMP 3W7EA 1H1YA 2GUUA 4LV9A 3UWYA 3W7JA 4ML9A 3T40A 3WK1A 4MPQA 5AN7A 3PR2A 2HS6A 3U2OA 3L0NA 3P8IA 2DZPA 1XBVA 1IIHA 3NA8A 1QFEA 2V0TA 3CT7A 3I68A 4O16A 5D04C 4P2VA 4FNQA 1LLZA 1N8FA 3G0SA 2JGYA 2YW4A 3B8DA 1H60A 3IIOA 1TV8A 3I65A 4UTWA 1VCGA 5F2GA 1N55A 3P5YA 2UV8G 1AK5A 1H7NA 2V82A 3KOFA 3BW4A 3UWWA 3JRKA 3TJLA 2EHHA 2QJIA 2Y7FA 1ZHAA 5F4XA 2ISSA 1KV5A 4ICNA 4K39A 1F05A 4UFKA 1GJPA 2QUTA 1IXPA 4M6VA 3VFLA 4XTDA 2Y7GA 4BI6A 4K6AA 1TREA 3E96A 3QQ1A 3W1QA 5KZDA 2YZRA 3LBCA 2ZA1A 1FWRA 1GG0A 4Q32A 1XL9A 2QR6A 5CPMA 3OIXA 1I2NA 5J5DA 1EB3A 1X1OA 2JK2A 5LZLA 3W1AA 1TPWA 4PFMA 1IXNA 1I2QA 4WY0B 1KTNA 1V5XA 4ZVJA 3TSMA 1THFD 1AG1O 2QUUA 3F4WA 4TO8A 3M16A 4WD0A 1LYXA 1P0NA 5DELA 4LV4A 2DJLA 1EP1A 2Z2UA 3HJZA 4O12A 4IX2A 3TC6A 4UTHA 2VOMA 2Y88A 1D9EA 1T96A 3ZWSA 3EX6A 4N4PA 4RK8A 3MP4A 2GQ9A 2NX3A 3GKFA 3M5ZA 1GOXA 2Y7DA 3W1UA 1PL9A 1KTBA 3C2EA 2QJHA 4MKNA 3HGJA 4AHPA 1VR6A 4JXCA 3GR7A 4MYXA 1B9BA 1F73A 1TPEA 3W73A 1G4EA 5CZJA 2NV1A 1XC4A 3GXTA 3W6YA 1ZY9A 4RCXA 3S8HA 1OFPA 3TAOA 4AMAA 3TIMA 2V81A 3GX9A 4KFOA 3HGOA 1ZFJA 3ATZA 3STFA 4Q4KA 4ZQMA 3NPVA 2ZQ0A 3IVSA 4O52A 3B06A 2X1TA 1FCQA 1VHCA 2CWNA 3W1MA 3HBLA 4A2SA 4ZL1A 1UBSA 2CLFA 3DENA 3W2JA 3HMJG 3CTLA 3NQ2A 2HS8A 3E0IA 4E0CA 2BSLA 1TTIA 1H51A 2QJGA 1VLWA 1DBTA 4FEZA 1T8XA 1W8SA 5KZEA 5H91A 3VNDA 5AYYA 1S5TA 3QMSA 3GYEA 5K4XA 4JX6A 1O4UA 3PM6A 3BG9A 1A5CA 5AB3A 2OMAA 1UUOA 1LRNA 3TMQA 3TUUA 3CIXA 4JR5A 3C3NA 3NEVA 1C9DA 1ZAHA 4Z1BA 5G1YA 3TNOA 1IIGA 3EWYA 4YLWA 3NL3A 1OVDA 1CW2A 4O54A 2VEPA 2HSAA 1B4EA 4RX0A 4RLIA 2A21A 3SW6A 2QEZA 2JKAA 3PUEA 1Q6LA 1JCLA 4JY9A 2ZZ4A 3F4NA 2V30A 3QMTA 1D3GA 2BX7A 3CU2A 4NZJA 2WNZA 5SWUA 2C6QA 2O7QA 3C61A 1FX6A 2CZDA 1RQBA 1QO2A 3R8RA 3UPBA 3TA6A 4I9AA 3UXDA 4EVZA 3TW6A 1G7UA 4LNYA 4N9DA 3RMJA 4ZMGA 4C1LA 4LT9A 2WJZA 3WJYA 2R94A 3I7QA 3E12A 4L4LA 3W7CA 1XDLA 4S2CA 4KKXA 4O53A 2X1RA 3W1LA 4IMCA 3O6DA 3EWXA 2W79A 1VH7A 1QR7A 1W3TA 2Q3OA 3PSVA 4X22A 1BTMA 3HF3A 3RF9A 5IBXA 1LRTA 2FJKA 4UUIA 3TK7A 3NPXA 2WO5A 4GXMA 5E0KA 1YDVA 3SGZA 3DAQA 1XCFA 3WK3A 3PAJA 1PHWA 1W31A 1JQXA 1DHPA 1EX5A 3NM1A 1D3HA 4YMZA 4S2BA 5CPOA 2ZRVA 4GWEA 1TRDA 1PHQA 2E5DA 1F76A 4JTFA 3DZ1A 3GR8A 4FO4A 1SSDA 4HPXA 4LU0A 1EP3A 4AXKA 3UWVA 3OA3A 4NZFA 3LHUA 3W86A 1YXCA 3DI0A 5KITA 3DHDA 3L2IA 4IMDA 1F5ZA 2FPYA 2DZVA 3R89A 3NQ7A 5KSWA 1OJXA 4JTUA 5LNRA 1TJPA 5D03A 3I7SA 1RQHA 2WNNA 3L5LA 4CCCA 3EWWA 3FA5A 2WNQA 2AQWA 2OCZA 2PCQA 3QC3A 4N6EA 3PBWA 3GDLA 4Z1DA 1GVSA 4J9JA 2B0MA 3T55A 2QCHA 4Y90A 3W74A 3PS7A 3UD6A 2W6RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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