3UWZA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 83
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwzA00
4CCDA 4IMFA 5TQLA 3FA5A 3MP5A 3B06A 1TRDA 3N3MA 1DOSA 1LORA 3M1ZA 3NQGA 5U4NA 3W7OA 3IGXA 2C3ZA 4QM1A 2B7QA 5K4XA 2C15A 1Q6OA 5AYYA 3A23A 4O14A 4Y9AA 4Q4KA 1QOQA 3P8JA 5I3HA 2R14A 3LTSA 2V81A 3DFNA 3TIMA 3NPVA 3TAOA 1JCXA 3C6CA 3S1WA 4MFEA 4AHOA 4O52A 1U83A 2YYUA 1X7FA 4OBTA 2VENA 5EL1A 3W1RA 4ML9A 3EXSA 3HF3A 3WK2A 4HNTA 1YYAA 4PH6A 4YWIA 2E5BA 3W7GA 2Y89A 1VGAA 2X30A 4PC8A 2QCCA 3FJLA 2C1HA 2DZTA 3HGSA 5D02A 3E9AA 3GR7A 1OFOA 3LI0A 4O53A 4N6FA 3RMJA 3T7VA 5HQEA 3TJXA 5BRBA 2Z0IA 3O6DA 2YR1A 4GUHA 2Z6IA 4GBUA 4IJBA 3G8RA 1XI3A 3G1HA 2GVJA 3PWAA 1QCWA 5F4XA 3E12A 3R13A 1LRNA 2NWRA 3NQ2A 5C6MA 2CLMA 4JS3A 2HS6A 3TAKA 2QJIA 2ATSA 1VLWA 2BSLA 1FBAA 3UWYA 4LC6A 1S3HA 2W79A 1HFBA 3IIOA 3RLUA 4GJ1A 1GVRA 1I2RA 1U5JA 5D2XA 3P81A 4WX2A 4E2DA 2PC4A 1EA0A 1XBYA 1XDMA 2PURA 1KM2A 5D38A 4IMDA 2J24A 1O5KA 3CHVA 3STFA 3C2FA 1OFAA 4GWEA 4UNLA 3EWYA 2ZZ5A 1IIGA 1FY6A 2RFGA 3EWZA 3NQ7A 3NM1A 3WJYA 2R91A 1LLZA 3C0JA 2ZZ7A 1UJPA 1W37A 2E6FA 4NXSA 4DELA 4M5PA 5AC7A 5I3GA 3DH7A 3Q94A 4UTMA 4E0CA 5G2WA 1P0KA 3DKJA 3IIZA 5FEWA 2NLIA 1EEPA 4UMAA 4CQ8A 5HR7A 5H91A 1FWTA 5BOOA 3LCWA 3P67A 1G67A 4FXRA 2BTMA 5DCBA 5HMSA 3USBA 3DI0A 2NZLA 1JCNA 4NNAA 2QDGA 3UZJA 3R5EA 4NJKA 1VPXA 4ICNA 2Z1BA 3PBWA 2V5BA 1BEUA 3NO5A 1G4SA 2GQAA 3W7IA 3W7PA 2Q8ZA 5K3VA 4K36A 2ZYFA 3G24A 4UTWC 4JGDA 1SW3A 1VCFA 3GR8A 2YW4A 1IXQA 1GTEA 4FNSA 1VZWA 3EX1A 4R7JA 2A6LA 3PC0A 2FFCA 5KITA 4ORIA 3W76A 1LP6A 3A9IA 5AHNA 1NFBA 1HO1A 4UXDA 3EX6A 3Q2DA 1X8FA 1RQBA 4A22A 3S5OA 4RXGA 2ZTJA 5KSWA 1BTMA 4AH7A 3DXIA 1L6YA 2RKXA 1TPVA 4JTGA 2FLIA 1A5AA 1JCMP 5G4WA 1VQTA 4NZFA 1ML1A 2CZDA 4P61A 2H3DA 4JDBA 1O95A 2GVGA 5LGXA 5F2MA 3HG2A 3CQ0A 1KV8A 3T44A 4Y6GA 2DZSA 3BV4A 5DY3A 3L66A 3EX4A 5AHIA 1TPH1 3W7EA 3ATZA 1DJQA 1WA3A 2E5CA 3W1PA 3S1UA 1DORA 3EKZA 3B05A 3THQA 3FEMA 3TSMA 3PB2A 3V75A 4JYDA 5DBTA 4XTIA 4DO5A 2QCDB 2ZRVA 3UXDA 4HHPA 2ZCGA 1Z42A 2OMAA 3S5YA 1OX5A 3L65A 3S5ZA 2WV8A 3IVSA 4ZVJA 3W7MA 4AF0B 3RF9A 1FX6A 1ZHAA 3E0IA 2QCEA 3C2EA 1GVSA 2X1RA 2QR6A 3TQVA 1VR6A 3QFEA 3L2IA 3NL6A 2I9EA 1TPDA 1JQXA 5HWMA 5D09A 5FF7A 3NPWA 3E49A 3W1XA 1F6PA 3W1TA 5CZJA 4PCFA 1A50A 2CW6A 3UYCA 4DQWA 3LCXA 1W5MA 4CNOA 1QDSA 2ZZ4A 1FQ0A 4HNVA 4TO8A 4IUOA 4IMEA 1JCJA 2G95A 4DBEA 3C52A 3W7RA 3VKJA 4E2BA 5HR6A 1QFEA 1H61A 1YADA 2TRSA 5LGZA 5CSSA 4WY0F 1XUZA 3HGJA 1VS1A 2ZRZA 1YTEA 4FNQA 4FX8A 2YSWA 5CZ0A 4JTTA 2A0NA 5AYZA 1T0OA 2X1TA 4HPJA 3PB0A 1DHPA 3BK0A 5I3KA 2EGZA 1MO0A 3OG3A 2YGYA 3QC3A 5F4SA 1Z44A 3PBYA 1KTBA 1TJRA 2BX7A 3ZWTA 4O0ZA 1ZY9A 2EPHA 2E6DA 2JGYA 3S6DA 2A21A 1HTIA 1K03A 5C54A 1F2JA 4S1FA 3KRZA 1YDNA 4JTEA 2H3BA 3E96A 1KM6A 4LVDA 1LM1A 2WNZA 3MHGA 3NQDA 4O4VA 1I4NA 5E1QA 1CX9A 2QCLA 2ZA3A 1HL2A 1OYBA 2CZFA 5LNUA 1GYNA 3BW2A 3LDVA 1LYXA 2V2CA 4FO4A 4IOTA 4NJGA 1XKYA 3G0SA 2E5DA 4AAJA 4IPJA 3JR2A 4PTNA 1KA9F 2ZBTA 3L67A 3WK3A 2WSQA 5IBXC 3P74A 3F4WA 1E51A 1S5TA 2E68A 3GAKA 1VCVA 1H7PA 4Z1AA 1XC4A 4MKNA 4QNEA 4N9EA 4OT7A 3CB8A 3UD6A 3GDMA 3FIGA 4YL2A 3UNDA 3R8RA 3QSRA 1KM0A 1H5YA 1OHLA 4QJ1A 2YZRA 1FXQA 4K8HA 4UTWA 3W2KA 1OVDA 3W1NA 2WKJA 1SZEA 3CWNA 1H62A 1K7XA 2YFOA 3PM6A 2Y62A 3C4UA 4N02A 4QNWA 1ICSA 3MYOA 4ADSA 3GVGA 1C29A 3MW7A 1OX4B 1EX5A 2W0UA 2GPTA 3TSDA 4XBSA 4JXCA 3CEUA 4JX5A 1TJPA 3TR2A 1H7WA 2UV8G 2Y7DA 2VFDA 4U4MA 3UWUA 2CLEA 1JRBA 4JY8A 3NR0A 5LZLA 1JR1A 3TC7A 4O1CA 1C8VA 3LRMA 4LY8A 1SR9A 4UNKA 3LX9A 2CU0A 3N14A 4AHQA 4UFKA 2YPIA 3PG8A 5HJLA 1F5ZA 5A8GA 2E6YA 3BG5A 2J9YA 4AWUA 2B4GA 5FESA 4MYXA 1P4CA 2Y88A 3W2LA 4MIMA 2C19A 5CG7A 4Y90A 3PVFA 1ZAIA 3BG9A 5EMUA 1LOSA 2BXVA 1I2OA 1OFQA 5AB3A 5FEXA 5CPMA 5FF4A 2J88A 1UASA 4NVTA 3CEPA 1HUVA 1SW0A 4TU1A 3PY2A 5F2LA 3KVMA 3W74A 5I3FA 3O63A 1QO2A 1KLYA 3FJ6A 1T96A 1KFBA 2E6AA 3W84A 2IQTA 1M5WA 1PHWA 4HT3A 1UB3A 3STCA 4MLRA 1K8ZA 1OK4A 2C18A 2VKZG 3JRKA 2PE4A 3C8FA 4N9BA 2RHGA 2HS8A 1N55A 1PS9A 3EWBX 3GXNA 4JD4A 3WJXA 3IVTA 1H51A 3EXRA 1SO6A 3I7SA 2VEPA 3EX2A 3BW4A 3ZS4A 2DZUA 1FWNA 2WQPA 5AHMA 4NNBA 1GJPA 1BWKA 1LBLA 3F03K 1LZOA 3T40A 4CCCA 2GQ9A 5ABTA 3FLUA 4JX4A 3SI9A 3N34A 1A53A 4K6AA 1K02A 4JYFA 4TX9A 1KTCA 3LCHA 2J6XA 4UFIA 3C2RA 1PV8A 4YMZA 4ADUA 4WQ6A 2Q3RA 1K7FA 3D0CA 5J5RA 3L5MA 4C1KA 4ZZ9A 5FEPA 1O4UA 1JUBA 1WAUA 3M16A 2TYSA 4ZQMA 1NSJA 3SFKA 4MJMA 3O06A 4DO4A 4WD0A 3MBFA 4N6EA 1I2PA 3PAJA 1ADOA 2ABBA 1ICPA 4DBDA 1GOXA 3NQFA 2A1YA 2OCZA 2C6QA 1P1XA 4MZ8A 3QMTA 4LT9A 2F7FA 3LV6A 3HGRA 4H3DA 3LRLA 3W07A 1TPC1 5LHFA 3QPZA 1W54A 4KKXA 1AW2A 3S42A 4Q32A 1EWDA 3B0UX 1PVNA 1OF6A 1WXJA 2YYTA 5LNSA 2JKPA 3I7QA 3DFSA 3L0KA 3OHIA 1TPEA 4L4MA 4NZJA 2CLHA 1KLZA 3Q37A 1O94A 2C16A 3VI2A 1DKWA 1OABA 3BPWA 5EKYA 4OU1A 4FEZA 4UFLA 5IBXA 2ZZ3A 4A2RA 3ABRA 3GIYA 3G1XA 3PR2A 3PBUA 3IV3A 1ZENA 3C61A 5FI8A 1I2QA 1SZGA 1I45A 1B4EA 4BK9A 3KXQA 3GNNA 1PIIA 2ZTKA 1C9DA 5HULA 5G1YA 2WOQA 3MHUA 2FB3A 4WOQA 4JEQA 3PG9A 1WYIA 3L0NA 3Q58A 4LNYA 5EYWA 3I6RA 1AK5A 1D3GA 2ZFAA 1FUYA 2A7PA 2Q8LA 3W2JA 4UMBA 1D9EA 3W87A 4UFJA 3S8HA 2ISVA 4UMCA 3U2OA 1YPFA 1ZCOA 3M5ZA 3RK8A 4NX0A 3DHFA 5HUOA 4GUGA 2NXHA 3TQ0A 4XTDA 4UCGA 1SFLA 1KV5A 4JN6A 1WOAA 4ADTA 4YXGA 4O19A 1KM5A 4FNPA 2CZEA 2ATMA 3C3NA 4M6PA 4FNRA 3GNDA 1DVJA 1QWGA 4O1AA 4JIQA 5AOUA 3T78A 1X1OA 4UTHA 4PFMA 3P80A 3W7DA 5HNRA 3RLVA 4QSHA 3HQ1A 2PCQA 3N19B 2JKAA 2ZDRA 4U28A 5L9FA 1OFDA 4FX7A 2VFHA 1IF2A 3FFSA 4ZL1A 4CCEA 1QPRA 4QAIA 3B0VC 3OVQA 2H90A 1S5WA 3M0ZA 4FNUA 4BI6A 3RU6A 1SW7A 3HOJA 3W1QA 1W31A 1TV5A 1A5BA 1PE1A 2CLFA 3YPIA 3W1UA 3DU0A 1Z41A 5SWUA 1QPNA 5AN7A 1RVGA 2CWNA 1OX6A 3W6YA 3B4UA 4HNNA 4XQ6A 1XFBA 1XUUA 2WPBA 4AEOA 2FPVA 4O8RA 3O1NA 4S2BA 1WOBA 2EF9A 2EKCA 3OVPA 1N7KA 4XKYB 3NQ6A 3K30A 2QKFA 3W3OA 3MMTA 3WK0A 4JNMA 4OV4A 4RJEA 1H1ZA 4AMAA 1JQVA 5HINA 4X9SA 1JULA 2CZ5A 3W86A 3SIZA 2Y70A 4UTKA 3IGSA 5K9CA 2JK2A 4Z0JA 4LS2A 4IXXA 1YLVA 4K7YA 1GTHA 1ME9A 2WNNA 3DAQA 3LBMA 3NZRA 3M47A 4Z0SA 2FDSA 2V30A 3MI2A 3W70A 1RD5A 2Y7EA 2NX9A 4LV9A 1TRIA 4POCA 3R89A 1GVQA 4JTHA 2FPTA 4O13A 3WJSA 2VEIA 3LHZA 5LNWA 3LI1A 4HPXA 2WSYA 4K8EA 3CLMA 3O15A 4MY9A 1CW2A 1WQ5A 1YTDA 3ELFA 4LV4A 1H7RA 4OV9A 2CLKA 3DFTA 5KZEA 4QISA 3BLEA 3G0XA 2Z2UA 3TV8A 1NF0A 1NVMA 4IX2A 4EIVA 1R47A 3GXPA 2WNQA 3DGRA 3IIXA 1LBFA 5G1TA 4TIMA 5D2WA 1MEHA 3VE7A 5G5IA 4UR8A 3LRKA 3W2NA 3TJLA 1H7XA 4XZ9A 1GPWA 3KVLA 3GDKA 1VLIA 3M9YA 3LCFA 3QSTA 1K8YA 4XUGA 4O16A 4GFSA 4O4WA 3KRSA 1Q45A 5A5WA 3WJZA 4WOZA 4MVAA 3W9ZA 3DHDA 2V8ZA 4X2RA 3SECA 4MZYA 1G69A 5EPDA 3UZ5A 3UY7A 3PSWA 2DZXA 1KM3A 1LOQA 2A6NA 4FXSA 1KM4A 1TQJA 1TPUA 4J9JA 1TTQA 1TTJA 3TFXA 1ONRA 5DN1A 2NWSA 4DPQA 3JS3A 2DJLA 2WSRA 3TMQA 5AC6A 3BGJA 3LERA 3CU2A 3TE9A 4Z1DA 1SSDA 1YDVA 3ZR4A 4JICA 4IQLA 3S9YA 3MI3A 1K7EA 3G3DA 3PUDA 3A21A 4JTKA 3G1SA 3QMRA 1O5XA 1XBXA 1EP1A 3WFAA 4E38A 1B3OA 4WZHA 3LXAA 5TBOA 4ALDA 1JUKA 5L6UA 1OF8A 3DENA 3LBCA 3W2MA 1SO4A 3S1XA 1RQHA 5DXYA 3BGGA 3P61A 1G4EA 1W0MA 3OA3A 1Q6RA 5LHEA 4EF8A 3BVJA 1SZFA 4GUJA 4A29A 3KFTA 5G2HA 3I68A 2VFEA 4MOZA 5K2ZA 3NPUA 4CQAA 3UWQA 4G1KA 3W1AA 4EVZA 5CGQA 4HN4A 2FPYA 3H53A 4LS1A 1GEQA 4MPQA 2A2IA 3HJZA 1FWRA 3F4NA 4KFPA 3C56A 3SGZA 3UWVA 3BG3A 4WY0B 3SGUA 1K3UA 2V2DA 2NUYA 1GG0A 3DKLA 4BR1A 4XWUA 3MUXA 2XN1A 5KMYA 2WJZA 5LNVA 1XCFA 3W7HA 3KX6A 3S1VA 4UTUA 3QF0A 1EB3A 3UPBA 4RZ6A 3QJAA 3W85A 1XL9A 3TUUA 4OGZA 1SPQA 2NXIA 3HGOA 4OHQA 1MEWA 1OFEA 4A2SA 3U8GA 1FCUA 4GRSA 4RLIA 1OYAA 3W7LA 4BF9A 3W73A 4KWWA 4RV8A 2E1DA 3DZ1A 3ANYA 4NNCA 5E0KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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