3VIIA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with bis-tris
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title High-resolution structures of Neotermes koshunensis beta-glucosidase mutants provide insights into the catalytic mechanism and the synthesis of glucoconjugates
pubmed doi rcsb
source organism Neotermes koshunensis
total genus 200
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3viiA00
2IXUA 1UQZA 5EMYA 4D6JA 1W1YA 3AISA 2O9TA 3UG5A 2Y5EA 3ARWA 4FK9A 7TAAA 3AZTA 4U3AA 1UQYA 3W26A 4UQ9A 3AMLA 1QOXA 4DUXA 3MSDA 2D20A 2WHLA 1EOKA 3MMUA 1LL7A 1E1EA 1W3KA 4AY1A 3CPUA 3UCQA 4AD4A 2VRQA 1LWHA 1PX3A 1V3JA 1CENA 4OIFA 4W5ZA 3PZ9A 1BG9A 2XJ7A 1ITXA 4CU7A 3OGVA 1J0JA 5KZ6A 1CTNA 1JDDA 2XM2A 1R87A 1JNDA 2YL8A 4B15A 4YHGA 4FLSA 2E8ZA 3WH9A 1W2PA 1EA9C 4EANA 2WHMA 3FNDA 2ZWZA 3WD4A 2O9RA 2FHFA 1BGGA 2W63A 4RE4A 3AMCA 3WSUA 2J47A 2GDUA 5BXPA 1W3HA 3WFLA 4P8XA 4TXEA 4HU8A 2D22A 4X9YA 1JXJA 2EPKX 4ACZA 1KGXA 2OWCA 4HOXA 3TTOA 2CHNA 3K4AA 2PWDA 1TG7A 2DDXA 4MNKA 1DHKA 1I1WA 1JD9A 4GI9A 1G0CA 1A3HA 4Q22A 2BXYA 1JYXA 3AIUA 5A1AA 3CUHA 4TVCA 3MS8A 1MFVA 2J4GA 1H0GA 3AS3A 5FD0A 4AEFA 3L4YA 5FIPA 1CXIA 2UY5A 1XCXA 4Z2KA 1UKOA 2WWDA 5IHRA 2JF7A 1E4IA 2FDMA 3ZT7A 3EMCA 3SCQA 2DIEA 1BGAA 4HA4A 2VZVA 4LPCA 4CVWA 4PMUA 3WQWA 3W4RA 1MFUA 2WVVA 2YOCA 3UR8A 3TTSA 3N18A 4TTUA 3ZT6A 1LQ0A 3ECQA 2NW0A 3U5UA 2WK2A 4GIAA 1ZJBA 4CN1A 2XUCA 3N1AA 3OLEA 2GVYA 5IFTA 5CSYA 2PWFA 5D8WA 3SUUA 1UD3A 4UQEA 2ZX7A 2E9LA 4W84A 4V2XA 3ZIZA 3CTTA 1KR0A 1TA3A 3ALGA 1UWQA 3HMCA 2E8YA 4IPLA 1G1YA 4LQ1A 5DO8A 3CIVA 3ARPA 1JF5A 1CLXA 4U3CA 3IANA 1WDQA 1SMDA 3BGAA 1WZMA 4KMQA 3SCUA 1HKIA 3FAXA 4ML4A 2FH6A 5HPCA 1VJZA 1GONA 1X6LA 2WZEA 4PYSA 3L4WA 1SMAA 1JDCA 4PTWA 2V5CA 4UOQA 5CJ5A 4D72A 5A6SA 3ZJ7A 1O6IA 2X0YA 5AYBA 1UKQA 3GZAA 1WDSA 2Y24A 3FHAA 1BFNA 3W81A 3RO8A 4TOQA 2WMJA 5F7UA 1MYRA 3TTQA 3AZRA 2EBNA 5A8OA 4LYRA 3U57A 3GH7A 2BNJA 4V27A 3WL0A 1J0KA 2D0HA 2XVLA 3B9DA 3KZSA 1UUQA 1GUVA 4CN6A 2XFFA 3WH7A 2BXZA 1KCLA 2PF0A 1KGWA 4EAMA 2YA2A 3RMEA 2YBUA 3PBGA 1JNEA 1E55A 1JI1A 4JKLA 4XZWA 1LWJA 1VF8A 4AD1A 5CGTA 3J7HA 1M04A 3AOFA 3RILA 1GCYA 3BSGA 2VURA 4J3VA 4J3WA 2J8FA 1HJWA 4KWUA 1Q6GA 2C7FA 3DECA 1KBBA 1BHGA 5M3WA 4J28A 1VEOA 3W6LA 1OSEA 1BLIA 2CESA 1H4PA 3VDHA 2BVDA 4JZ5A 3WN6A 3VGDA 2DT1A 1QI3A 4J3SA 1E5JA 5D9OA 3N12A 2QPSA 4BF7A 1XH2A 3ZJ8A 1EO5A 3WMSA 3GBDA 4UQAA 2UY4A 1FOBA 5E0CA 1AQHA 1OIMA 1UZ1A 1W9DM 2VQTA 1JZ8A 3M07A 3WF1A 2FHBA 1S46A 4UZUA 1J11A 3NJ3A 5E6YA 1JAKA 3PZQA 4DWSB 2WCSA 3KWXA 3MUZ1 4AIUA 1CGXA 3AIBA 1GQJA 3CH9A 4CD4A 3RM8A 1I1XA 2NT1A 3IAPA 3B9AA 3WF4A 4LYQA 1FP9A 4OBRA 4XV0A 1TFVA 2XSAA 4WLCA 4W7UA 3TA9A 1TZ7A 1JXKA 5HBFA 2JF6A 4HTYA 5ABGA 5JBDA 1IV8A 4DUWA 3WEOA 3AYRA 1DP0A 3ZOAA 2J75A 2J25A 3SCOA 4J3UA 4L4PA 4ZEPA 1UWSA 3CUIA 1V6VA 4XB3A 3WD1A 2J62A 1E9LA 1JAEA 1QVBA 3NCOA 4H04A 5A95A 1HJUA 1V3MA 2VVNA 2W67A 1V6WA 1XD0A 1VBRA 4F79A 4HOWA 1AQ0A 4W93A 1JZ3A 1UD6A 3ALFA 1CYGA 1OT1A 2WWCA 1J12A 4W86A 2OSYA 1E70M 1HP5A 3SCRA 4C7GA 2E9MA 4XZBA 1H1NA 3ZT5A 4HP5A 3A6OA 2EQDA 3PTKA 2PWHA 2X1IA 4AZ5A 3VIIA 1XYFA 3EYPA 1GW1A 1Q6CA 1UKPA 5KEZA 1QPKA 4MDOA 4D6CA 3GNOA 4YN5A 1NOFA 4WSKA 3EDFA 4X0VA 2X05A 5LA2A 4HZ7A 1F4AA 1ISYA 3GNPA 2WM0A 3QOKA 3G6MA 1GOQA 5FKYA 2GJRA 2A3CA 4AZ6A 2CBVA 4P7NA 3AXXA 4KH2A 1EDGA 4PTXA 1ITCA 2ZUMA 4AZCA 3THDA 4PUDA 5CLWA 4P8WA 1W9VA 2DT0A 5BCAA 5JUVA 1HIZA 2W66A 1TE1A 1ZB5A 3ZM8A 1HNYA 2ZUNA 5GQBA 4UR9A 4AIEA 1GJUA 4W8LA 2ZUVA 4IUGA 4P7QA 1JG9A 1RPKA 3RCNA 3VGEA 3WDPP 1LLOA 3K8LA 4GZEA 4WK9A 2CBIA 4OOZA 3VOCA 3HU7A 3OG2A 4U5KA 4ZENA 2ZUTA 4GINA 3A4WA 4M24A 1QNPA 5C71A 1NP0A 3GDBA 1CGWA 1ESWA 1DWAM 5AC4A 5BRPA 3PZMA 2X0HA 3O2LA 3ARSA 2GK1B 1ZL1A 1OM0A 5FL1A 3WD3A 1J0IA 3ARTA 4RL3A 1E71M 2D2OA 1C90A 2DIJA 3WF3A 2VZOA 1QBBA 4H7VA 4X0NA 2OYMA 4NZCA 1SR0A 2XVNA 5EFFA 1CGUA 3KE0A 3WDIA 1QI4A 2CNCA 2EXOA 2ESCA 1KWKA 1C8QA 1H41A 3F5KA 4UTFA 3PTMA 2XPKA 3BAKA 3WNOA 3BH4A 2HVMA 4TX8A 2YIHA 1K6AA 1D3CA 1X6NA 2CPUA 3VO0A 2IUZA 3MKKA 4HPGA 1FP8A 2W5FA 3CGTA 2HISA 1UD2A 1VIWA 2CEQA 3BSHA 1EQCA 3VILA 2UY2A 4UFLA 2WCAA 3I3EA 2A3AA 4MAVA 4JHZA 2RGMA 1JZ2A 1E4LA 1JFXA 1OBAA 4V28A 3WQVA 5IFPA 4BZYA 2CYGA 4PUEA 4HZ6A 2WAGA 1L8NA 3AHYA 2DSUA 2J7GA 3EMZA 3CZKA 3PN8A 3THCA 1JIBA 3VNYA 4HPHA 1EH9A 1EHAA 5I79A 9CGTA 4DM1A 3WUGA 2BY1A 3AJ7A 1V0NA 1V3LA 1CXFA 2XM1A 5AC5A 1ZJAA 1KCKA 2VRKA 5JIPA 4J3XA 3II1A 1HL8A 2VOTA 1V3IA 5A8MA 5A2AA 1NOUA 1UR8A 1VAHA 3UETA 3RJYA 1UZ4A 1B9ZA 5A8PA 3WENA 3W53A 1DWFM 5CGMA 4HMCA 4JFTA 5DF0A 3TONA 3PTQA 3CZEA 4K68A 4J27A 4DWSA 3A4AA 4FF5A 3N13A 3WEMA 4AYSA 1G5AA 1J18A 2XYLA 1B1YA 3W29A 5A69A 1XV8A 4JAWA 1EQPA 4PMYA 1XYZA 3SCWA 1BYBA 3I3BA 5DEZA 2YBTA 1C3FA 1C91A 5CG0A 1Q6EA 4M80A 3SCSA 2ZOXA 4M29A 2WNWA 1WAWA 2WMGA 3VIMA 5A6AA 3S2CA 3DHUA 2WMKA 1NP2A 4GI6A 3W28A 3AQUA 1VRXA 2DH3A 4QLLA 3VGBA 3SCPA 3WNPA 3BAYA 3CHDA 4XX6A 5CXPA 1UH3A 1VJSA 2G41A 7A3HA 4ZE4A 3WIJA 2J77A 3CHCA 1E6QM 3VDAA 2W62A 1TMQA 3N04A 2VX4A 3WNLA 4HA1A 1B3WA 4IM4A 1LG2A 1QHZA 1VEPA 4AIOA 2FH8A 3T09A 1VEMA 3T08A 4W89A 1FH9A 4UQCA 1QNRA 4N42A 4D6EA 4H8UA 1Z32X 2WBGA 5D9NA 3IJ7A 3NYDA 3VPLA 3KL5A 3NIYA 4M82A 3CBWA 2OLHA 1PPIA 2Z1SA 3VMOA 1UYQA 3DYPA 1PX4A 4W87A 1JYVA 1NH6A 3VX0A 4GKLA 3DHPA 2XGBA 1QI0A 2ZE0A 2YL9A 2ZX9A 3TOPA 3D3AA 4URIA 1E73M 2VX5A 3JUGA 3AS2A 4PMVA 5ABFA 2WBKA 2W4XA 2V3DA 2CKSA 4WKAA 3N11A 4D71A 1JF6A 3WNMA 1HXJA 3AHXA 2OWWA 1YHTA 1H09A 3CZ8A 5CPTA 1DTUA 4EK7A 1GNXA 5C70A 1AQMA 2XWDA 4AMCA 1QNOA 3O9NA 5JIWA 2GFTA 4NI3A 2GJXA 4MJ4A 3AYSA 2QHAA 4M56A 3M7SA 2GK1A 2OSXA 2XSBA 5JBEA 3ZJKA 1WZLA 5CPSA 2DPEA 4GPNA 4UZSA 1N82A 1W91A 1J0YA 3O6AA 1CPUA 3K46A 2ZXQA 4KGJA 2XHYA 4MJ2A 2EJ1A 1NWUA 1V3HA 4WKHA 1MW3A 1GPFA 4D1IA 3FAWA 4HMDA 2G8ZA 2EPOA 3PZTA 4DM2A 4F66A 1HJQA 1E0WA 2WXDM 1HP4A 1PEZA 4MADA 8A3HA 2JIWA 3CMGA 1VFOA 2DT3A 2O92A 4E8CA 4CGTA 2PB1A 3L4XA 2WKLA 4DWSD 3VGGA 2J7BA 4WJXA 3SCNA 2WC7A 4CCEA 4PMQA 3VX1A 1R7AA 1QHPA 2G3IA 1GQIA 1TR1A 3WQ6A 3VMNA 3SUVA 4WF7A 1B30A 1GVYA 2ZXBA 4PEEA 1KR1A 3POCA 1KGUA 1PIGA 2RGLA 4PSRA 1QI2A 1MQRA 1WP6A 2VR4A 2VUYA 1W9PA 1UR9A 2MANA 3AMKA 2XVGA 4JFVA 2XIIA 5C8BB 4AD2A 1TVPA 3FHQA 1LL6A 3AIEA 2VJXA 3CZJA 3IJ9A 4D6DA 3TTYA 4PBGA 2BY0A 4LYPA 2DQXA 2XG9A 4TTGA 2PWEA 3KL3A 2ZUSA 1CIUA 4CU6A 1H11A 3VDBA 2PBOA 3AMGA 1ODZA 3BLKA 2D1ZA 1BAGA 3KEHA 2WVTA 3OA5A 1GHSA 4UFHA 2J7HA 3T2PA 1QNSA 2VZTA 3WQ5A 4UNIA 2VC9A 1B90A 1W32A 2ZX8A 3EDKA 2BFGA 3CZGA 1IZJA 2J74A 4D6HA 4HOZA 1KQZA 1DWJM 3RJXA 2BHYA 3U5YA 4AD3A 1MW2A 1TUXA 1BYDA 5BYWA 3WBEA 4GO9A 5I0DA 4BQ2A 3MO4A 1KXTA 1B31A 2FGZA 4WSJA 2V3GA 1UR2A 3NUKA 3BAIA 4B3LA 1TVNA 4A3YA 4AZGA 3BLPX 3PZOA 2DH2A 3OLGA 4QAWA 2WVUA 5BROA 2OYKA 4C7FA 2YA1A 3DYOA 3RPMA 1GOMA 3VIKA 4AZHA 1MVYA 1E3ZA 5E6ZA 3T0DA 2IXVA 3A3HA 5HNNA 3OLIA 4QCEA 2NSXA 3W37A 5D9PA 1LG1A 3AIWA 3CHFA 2PBGA 1H2JA 3FN9A 1HX0A 3VDCA 1NM9A 4TVUA 5A6KA 1E4NA 2XFYA 2E0PA 5E70A 4MNJA 3GXIA 1WB0A 5DT5A 2BHZA 1OCQA 2JE8A 1U30A 2JEQA 3CLWA 3NDZA 4AXNA 5M17A 4LX4A 4Z2IA 1ZBKA 2QLYA 1CXEA 1G94A 3ARUA 4F9DA 1E6RA 3SURA 3GXFA 2VQUA 1HVQA 4ACYA 3VGFA 2WZIA 2VRJA 2XVKA 1HVXA 3HN3A 2C0HA 2G3MA 1LL4A 4RE2A 3AHZA 2J7FA 2VVSA 2V5DA 1EHNA 2W92A 1R86A 3WH6A 4E8DA 5A6LA 2DEPA 2ZICA 3CHEA 1FA2A 4OUEA 3VTRA 1XSKA 2XGIA 3VU2A 4CCDA 1Q6DA 5E09A 3VUPA 4B9YA 2O9PA 4ATLA 3F4VA 3GBEA 1W2VA 4AC1X 4Z2HA 3HJEA 5LA0A 2VCCA 4B9ZA 3VIHA 5AY7A 1V0LA 1Q4NX 2YJQA 4UFJA 1IT0A 1FH8A 4FLOA 4ACZB 2D3LA 3EMQA 3AIVA 4PMNA 1HF6A 1B3VA 4YHEA 1XSJA 4OKDA 1WZAA 3B8SA 2ZUWA 4GZJA 4MDPA 4YPJA 1AMYA 4MB3A 5ECUA 3WMCA 3FXYA 2F2HA 2JEPA 3SUWA 2DSVA 4JCMA 1BPLB 1WDRA 2GDVA 1ECEA 1X1NA 2V38A 3AHVA 4CD8A 1JZ5A 2V3EA 1DEDA 1EDTA 5CZKA 2J7CA 1GQLA 2E40A 2GSJA 3BXWA 1UD4A 4ZFMA 4U5IA 3LPPA 1HT6A 4Z2JA 1GHRA 1HKJA 1P6WA 5DFAA 1DWGM 1UWRA 3K4DA 3VMPA 4TX6A 4KRUA 3WBAA 1E43A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2IXU A;  1UQZ A;  5EMY A;  4D6J A;  1W1Y A;  3AIS A;  2O9T A;  3UG5 A;  2Y5E A;  3ARW A;  4FK9 A;  7TAA A;  3AZT A;  4U3A A;  1UQY A;  3W26 A;  4UQ9 A;  3AML A;  1QOX A;  4DUX A;  3MSD A;  2D20 A;  2WHL A;  1EOK A;  3MMU A;  1LL7 A;  1E1E A;  1W3K A;  4AY1 A;  3CPU A;  3UCQ A;  4AD4 A;  2VRQ A;  1LWH A;  1PX3 A;  1V3J A;  1CEN A;  4OIF A;  4W5Z A;  3PZ9 A;  1BG9 A;  2XJ7 A;  1ITX A;  4CU7 A;  3OGV A;  1J0J A;  5KZ6 A;  1CTN A;  1JDD A;  2XM2 A;  1R87 A;  1JND A;  2YL8 A;  4B15 A;  4YHG A;  4FLS A;  2E8Z A;  3WH9 A;  1W2P A;  1EA9 C;  4EAN A;  2WHM A;  3FND A;  2ZWZ A;  3WD4 A;  2O9R A;  2FHF A;  1BGG A;  2W63 A;  4RE4 A;  3AMC A;  3WSU A;  2J47 A;  2GDU A;  5BXP A;  1W3H A;  3WFL A;  4P8X A;  4TXE A;  4HU8 A;  2D22 A;  4X9Y A;  1JXJ A;  2EPK X;  4ACZ A;  1KGX A;  2OWC A;  4HOX A;  3TTO A;  2CHN A;  3K4A A;  2PWD A;  1TG7 A;  2DDX A;  4MNK A;  1DHK A;  1I1W A;  1JD9 A;  4GI9 A;  1G0C A;  1A3H A;  4Q22 A;  2BXY A;  1JYX A;  3AIU A;  5A1A A;  3CUH A;  4TVC A;  3MS8 A;  1MFV A;  2J4G A;  1H0G A;  3AS3 A;  5FD0 A;  4AEF A;  3L4Y A;  5FIP A;  1CXI A;  2UY5 A;  1XCX A;  4Z2K A;  1UKO A;  2WWD A;  5IHR A;  2JF7 A;  1E4I A;  2FDM A;  3ZT7 A;  3EMC A;  3SCQ A;  2DIE A;  1BGA A;  4HA4 A;  2VZV A;  4LPC A;  4CVW A;  4PMU A;  3WQW A;  3W4R A;  1MFU A;  2WVV A;  2YOC A;  3UR8 A;  3TTS A;  3N18 A;  4TTU A;  3ZT6 A;  1LQ0 A;  3ECQ A;  2NW0 A;  3U5U A;  2WK2 A;  4GIA A;  1ZJB A;  4CN1 A;  2XUC A;  3N1A A;  3OLE A;  2GVY A;  5IFT A;  5CSY A;  2PWF A;  5D8W A;  3SUU A;  1UD3 A;  4UQE A;  2ZX7 A;  2E9L A;  4W84 A;  4V2X A;  3ZIZ A;  3CTT A;  1KR0 A;  1TA3 A;  3ALG A;  1UWQ A;  3HMC A;  2E8Y A;  4IPL A;  1G1Y A;  4LQ1 A;  5DO8 A;  3CIV A;  3ARP A;  1JF5 A;  1CLX A;  4U3C A;  3IAN A;  1WDQ A;  1SMD A;  3BGA A;  1WZM A;  4KMQ A;  3SCU A;  1HKI A;  3FAX A;  4ML4 A;  2FH6 A;  5HPC A;  1VJZ A;  1GON A;  1X6L A;  2WZE A;  4PYS A;  3L4W A;  1SMA A;  1JDC A;  4PTW A;  2V5C A;  4UOQ A;  5CJ5 A;  4D72 A;  5A6S A;  3ZJ7 A;  1O6I A;  2X0Y A;  5AYB A;  1UKQ A;  3GZA A;  1WDS A;  2Y24 A;  3FHA A;  1BFN A;  3W81 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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