3WD1A

Serratia marcescens chitinase b complexed with syn-triazole inhibitor
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd1A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd1A01
1K9EA 3VIKA 2VJXA 4R27A 3W6LA 1E3ZA 3GXDA 1XCXA 4GQRA 2J4GA 4PMOA 2GJXB 1W2VA 3WUBA 4UQAA 5I24A 4MDPA 5D9MA 1VF8A 3CIVA 3CUHA 1CTNA 3WQVA 3GBEA 2WCSA 1CZ1A 4JKLA 1KR1A 1C7TA 2BHYA 3GH4A 3GZAA 1KWKA 3QHOA 3AS1A 1MQRA 2WSPA 1DTUA 4CN6A 2D24A 1HVQA 5LA2A 3CZGA 4MDOA 4W88A 2WKGA 4GQQA 2WVUA 2V3GA 3BMWA 4GINA 2A3BA 1JNEA 4B9ZA 4ZENA 2V3FA 5AYBA 1G94A 4Z2IA 4ZFMA 1UWTA 3WL1A 4EANA 1XC6A 2WC4A 1U2YA 3VU2A 1RP8A 1GZJA 4ZXLA 2XM2A 9CGTA 2FHBA 4PMNA 4ATWA 4EAMA 2O9OA 4F79A 1HKJA 4IM4A 1W3HA 3IJ7A 1V3IA 1KCLA 3OGRA 4D6CA 2PBGA 1IZJA 4UZSA 1FHLA 4AC1X 2EEXA 2EJ1A 2D2OA 2ZE0A 1CGVA 1TA3B 1W1VA 1US3A 3PN8A 3T2OA 1H0GA 1HT6A 2YL8A 4HA1A 2GFTA 2J77A 4RE3A 5I23A 3VDHA 1UKOA 3B8SA 4OUEA 2D22A 5ABEA 5M5DA 1J10A 2XJ7A 1X1NA 2ZUMA 3AS2A 1MW3A 3BAIA 3CUIA 2XYLA 3ARTA 4KH2A 3GNOA 1HP4A 1PX4A 3BAKA 4Z2GA 3VD9A 1CPUA 2NT0A 5BYWA 5CJ5A 3VIFA 4CD8A 2W4XA 3QOKA 5CZKA 1BFNA 2J7HA 5BRQA 3WNMA 2Y5EA 4WSKA 4IISA 3VKKA 2E8ZA 3RJYA 2VR5A 3TA9A 4GO9A 3VNZA 5FL1A 1P6WA 3VMNA 2C8NA 3G6MA 3QHMA 1HJUA 2XVNA 2XM1A 4RE2A 4HP5A 4BZYA 2E40A 3CMJA 3KZSA 2ZWZA 3SUTA 3WQ8A 5CPQA 4HOWA 2ZX5A 3ARQA 3W82A 4U3CA 2MANA 3PTMA 1VJSA 4PMDA 1FP9A 3DYOA 3O6AA 1GORA 4BQ3A 1ED7A 3WH9A 2XFYA 2OLHA 1EDQA 2VVNA 1GONA 1UR9A 2OSXA 2D23A 1TUXA 3K4AA 3HJEA 3RPMA 1XSJA 4FLOA 1QI3A 4MAZA 4MNMA 4MNKA 1K9TA 2CNCA 2X2YA 2JALA 3I3BA 1KGWA 4CCDA 1IZKA 4B15A 8CGTA 3ARZA 5I77A 2YDQA 4M8UA 1U30A 2VZTA 4AZCA 4GI9A 3M07A 3TOPA 1J12A 1CXHA 2QLYA 1RP9A 3DECA 5CGTA 2X0HA 4XZWA 4BS0A 7TAAA 3VDBA 1UYQA 2XVPA 3EMCA 1BPLB 3UR8A 4M1RA 2CCRA 1UD4A 4WKHA 5CXPA 1QNQA 3PTKA 4U31A 3AHXA 2JF7A 4J28A 5I5RA 4AZHA 2E0PA 1S46A 3T0AA 1XRVA 2Y2WA 1E4MM 3RMEA 3VNYA 1WAWA 4W87A 1BG4A 3MU7A 4XB3A 3WD0A 4UOZA 3AS3A 5GNXA 3PZUA 4TVCA 1TVPA 4CD7A 2UY5A 3MUIA 1WZMA 3AIRA 4WSJA 3SUSA 3VGHA 4AWEA 3NSXA 2WZIA 1EQPA 1HF6A 1KFWA 3AZTA 4GI6A 4UFJA 2Y8KA 4CN4A 1OGBA 1U33A 4FF5A 2D0HA 4HOZA 1HX0A 1W1TA 3CO4A 3AICA 3K1DA 2BV9A 4B3LA 1OIMA 3FN9A 2HISA 1ZU8A 2D0GA 3VM7A 2GK1B 1OD0A 1ZL1A 1UZ1A 5HPOA 2VCCA 2J79A 1Q6GA 4J3SA 1CDGA 2XFFA 2OYKA 1DP0A 1EQCA 4QLJA 3ZSSA 4H8UA 3N1AA 3AMLA 3VMOA 1XYFA 3NDZA 3OLDA 3IK2A 1B3YA 1IV8A 3VINA 2ZUWA 4GKLA 2J8FA 1NWTA 4D1JA 1E1EA 2J7GA 4D6IA 5A6LA 4MPKA 3OZPA 5A1AA 5BXPA 3N18A 5BCAA 2VUYA 1V03A 4OIFA 4WK9A 1E6SM 1GCYA 1BGAA 2WSKA 1WE5A 2W91A 3A4AA 4BF7A 3WDHA 3ARYA 4HMDA 3WF0A 5DT7A 2J7BA 1KXVA 1E70M 1GOQA 4UQEA 5ABFA 2CBIA 3GXIA 4P7QA 1YHTA 2DEPA 2J62A 3A3HA 5GNYA 2D49A 3F5KA 1OIFA 3J7HA 1E4NA 1XD1A 3VIPA 4X0NA 3LPOA 2J47A 2FHFA 3VIOA 5BWFA 3UESA 2WWDA 3E1F1 2E3ZA 3A47A 4JL2A 3FY1A 3SEPA 4V2XA 1XH0A 2JE8A 1E0WA 4Z2LA 1VRXA 4M82A 2WMFA 2WLZA 1B0IA 4AZ6A 1E6PA 1UUQA 3JUGA 3UG3A 3NYDA 3SCPA 2XHYA 2F2HA 1M03A 4PTXA 3PZ9A 3MMDA 1DWIM 3KE0A 4AD1A 2VRJA 2FGLA 5FIPA 3WD2A 2VRQA 2DH3A 3L4XA 4PSPA 1CIUA 4W8LA 3D5HA 5IFPA 1ODZA 1E5NA 5IDIA 4TTUA 1BGGA 5I3DA 4H8VA 1DHKA 3K4DA 3T09A 3VD3A 2D0FA 2GVYA 4FLSA 5CPTA 3ALGA 2W67A 1WZLA 1C90A 2EQDA 4AIOA 2FGZA 4OOUA 2G3MA 4PMXA 2G3JA 4M24A 1HKKA 1ESWA 5A6SA 3UCQA 5DF0A 4WF7A 2WC7A 4HMCA 4UFMA 3AISA 4KGLA 3WELA 4QP0A 3MKKA 1BG9A 3N9KA 5M3WA 1B3ZA 2VX5A 4TOQA 1WP6A 2V5CA 3ZJ8A 1H4PA 2Y24A 4L4PA 4AD4A 4W93A 5I78A 3WH5A 3MO4A 4XX6A 2CERA 4EKJA 2PWEA 4JAWA 2WMGA 1E6XM 1V3MA 4MB1A 3G6LA 2BY3A 2EXOA 3CGTA 1O6IA 2BHUA 1V6YA 2ZIDA 1R87A 1LLOA 2O9TA 3K8KA 3I3DA 3F5LA 1XYZA 1ZJAA 1UA3A 2DIJA 2E4TA 1PPIA 1ISYA 2F8QA 3VGDA 5JBFA 1UWSA 3II1A 2VX4A 4AMCA 4QAWA 1JZ7A 3AQUA 1O7AA 1V3KA 5JBEA 1B2YA 1E40A 2EPOA 4M80A 1DWAM 2RGMA 1H1NA 1J0HA 3GTNA 3UG5A 1G01A 3VPLA 3FNDA 1Q6FA 1YQ2A 4CCCA 1W3LA 3W4RA 1CGUA 4UNIA 1W9BM 1GUVA 3AROA 4CU8A 4PEEA 3MUZ1 1UQZA 3UERA 4OZOA 4LQ1A 3CUGA 3BLKA 2WYSA 4C7FA 1CEOA 1B3VA 3N17A 5IHRA 3K8LA 4AD5A 1E9LA 3GYCA 4CD4A 5A8NA 1PJ9A 1QI5A 3OBAA 2J75A 1G1YA 3N13A 2BXYA 4N42A 2UWFA 2YDRA 2ZUUA 3KWXA 3QHNA 3ZMRA 5EFDA 5A2BA 1UKTA 2EPNA 1BTCA 3WQ6A 2G3IA 4AZ5A 3ZJ6A 5FD0A 4D1IA 3M6DA 2ZUNA 3AMCA 5AY7A 3VX0A 1V6XA 2DSZA 3OLIA 2JEQA 4GZIA 4W7UA 3PZTA 3ZQ9A 2V3EA 3W29A 1E4LA 5FL0A 4JHOA 2VC9A 3WENA 1JDCA 1XD0A 2PI6A 2DIEA 1C3FA 1KB3A 5CLWA 2WPGA 2DSKA 3OIHA 4QCFA 3CZ8A 1CECA 3APGA 3N04A 3EDDA 1QW8A 2G8ZA 5C71A 2IXVA 4W86A 2DDXA 4PMVA 3ZR6A 4IPLA 1CGTA 1R86A 1AQ0A 4UFLA 2WB5A 1GJUA 4V28A 3MUY1 4F9DA 2ESCA 1E1FA 3EYPA 2PWFA 3WH7A 4W7WA 5JH8A 1J11A 1E6QM 3SURA 3VDCA 1RPKA 3CPUA 1BF2A 4PSRA 4HPGA 1E72M 1I75A 4HZ6A 1GPFA 1JYNA 4Z2HA 4K68A 2G4FA 2FH8A 2XSAA 3TONA 1BQCA 4B16A 2JIWA 2ZXDA 1FOBA 1WPCA 7A3HA 2C7FA 2NW0A 2DSWA 1JFXA 1MFVA 3KL3A 4Y7EA 1ITXA 1QNRA 4LYPA 2CXGA 4AD0A 4TVDA 1B31A 2BFGA 4CD5A 2VT0A 3WUEA 1ZBCA 4D6GA 2WVVB 5A6MA 4BQ2A 2WXDM 4ZEPA 3TP4A 1GHRA 5D9NA 1D2KA 4P7OA 3K8MA 1VJZA 5CG0A 3WEZA 2ZX7A 3MSGA 3W81A 5FOOA 2WHMA 2YIHA 3DYMA 1JDDA 3A4WA 4JFWA 5KZ6A 2XUCA 4W84A 2XFRA 4QFUA 3WUGA 4HZ8A 3MV01 3WNKA 3OA5A 2Q8XA 3A4XA 1GOIA 2ZUSA 4W8AA 1HL8A 2QPSA 2VNCA 1C8YA 4JKMA 2CITA 1FP8A 1HL9A 5DEZA 1W9VA 2WVTA 2DT2A 4PTVA 1JD7A 4UFKA 1Q6EA 1JZ4A 4D6HA 4P8WA 3PZVA 2VI0A 4D6EA 3N11A 1ECEA 4PN2A 2EPMX 1GOMA 1EH9A 2CBJA 3L4TA 3BGAA 4UOQA 4UFIA 4LYRA 1HJSA 4LPCA 1LL7A 3AMDA 2WNWA 5HDRA 2OYLA 3MMUA 3CHFA 2NT1A 3K46A 4X9YA 3VILA 1SYTA 1EXPA 1NH6A 4LXFA 2VR4A 1Q6DA 4F8XA 1MW2A 2WW5A 5CQ1A 2PWGA 4AEFA 1M04A 4HZ7A 4MJ4A 1UD6A 1V08A 4GXPA 1PIFA 3W27A 1OGGA 4EK7A 5EBAA 4PRWA 4NF7A 4W89A 2WHKA 3BC9A 2WMIB 1LF1A 3SCOA 4AISA 4LYQA 2XIIA 1PZ3A 1WDSA 5HOSA 3BAJA 1PZ2A 3AIWA 1H3GA 4DWSC 1HP5A 2A3CA 1MW1A 1CLXA 1E0VA 1BLIA 3WFLA 1NOWA 4WKFA 2ZUVA 3WF2A 2WWCA 4J3WA 2VX7A 4S3JA 2X1IA 1E0XA 4Q7NA 3L2MA 3VIIA 3FHAA 1DEDA 1V0KA 1UR0A 3IJ9A 4OBRA 3ZIZA 1MXGA 2W61A 2UY4A 5CPSA 5AC5A 5F7UA 5BXSA 2QV4A 2EPLX 5E6ZA 2GUYA 2GSJA 4JFUA 1AVAA 3AYSA 3T08A 3WBEA 2Y8VA 4AY1A 4PTWA 4MJ2A 1JYVA 3KL5A 5TD4A 1CXEA 2FHCA 3QGVA 3F5JA 1N82A 1JYXA 3CUJA 1KXTA 3PTQA 3WEOA 1US2A 5BROA 4AD3A 1W9XA 1AIWA 3WIJA 1GJWA 3N15A 3VVGA 2A3EA 3IAPA 1OD8A 1UOKA 1GVIA 1NARA 1OB0A 1EDGA 4GO8A 4HOXA 1DWGM 1E56A 4JKKA 3TTYA 5A8MA 4GIAA 1UD5A 1E15A 1B30A 2E9LA 3DYPA 1TVNA 1WDPA 3IAQA 2YLLA 2ZXBA 4D72A 4WLCA 1D3CA 3CBWA 1CBGA 1NP0A 3THCA 3WD1A 2CKRA 1E4IA 1HJVA 1TZ7A 2PBOA 4A3YA 1UWIA 3L4YA 3WD3A 4LX4A 4TXEA 2QMKA 1MXDA 3SCVA 6A3HA 4ACZB 1KQYA 4UQBA 4MAVA 1H5VA 4CKQA 2YKKA 4JFTA 4W85A 1XV8A 3CUFA 2W66A 2NSXA 5A94A 4PCTA 4MNLA 3WFZA 3PZOA 1GHSA 5FKYA 5A6AA 3MMWA 5DT5A 1VFFA 1Y7VA 1ZB5A 3BXWA 5C8BB 3W28A 2O92A 1CGXA 3AHTA 1UZ4A 4UQ9A 3L4ZA 3VTRA 4AZ7A 1MQPA 2D3LA 4W5ZA 1JF6A 2WANA 4CGTA 4U5KA 2EBNA 2VCBA 1UR2A 4DUXA 5JIWA 5LA1A 3VD4A 2BVDA 3WDIA 3AFBA 3DC0A 4HTYA 1NQ6A 2AAAA 3DHPA 2RTSA 3BCFA 2XPKA 4FLRA 1ISXA 1M7XA 2A3AA 1E5JA 3U57A 3WH8A 1K6AA 4OOZA 4UR9A 3VUPA 2J7EA 2XWEA 1HJWA 5A95A 1UD8A 2BY0A 4YHGA 1BYBA 1VFMA 4JHZA 1WNOA 1B3XA 3BAWA 3ALFA 2QHAA 1NWRA 3BCDA 4YN5A 1CGYA 4U2YA 4C7GA 1QI2A 1JZ3A 4CU7A 3KEHA 4OBSA 1B9ZA 2YLAA 3W53A 6TAAA 4BQ5A 5ABHA 2VRKA 4AZIA 4P7LA 2WKLA 2WBGA 1GOWA 3PZIA 2X05A 1TE1A 3MUAA 3WUFA 1D7FA 3WQ4A 2CBUA 1BHGA 5ABGA 1V0NA 5A8PA 1MWOA 5HBFA 5EFFA 1EHNA 3GNRA 3GXFA 2XGBA 5EB8A 3VOCA 1KXQA 1HKMA 1J0IA 1NWUA 2VZVA 1UH4A 4AIEA 2WLYA 3M46A 3VX1A 1V6WA 1J0YA 4XZBA 1J0JA 3ZOAA 2C0HA 1ISVA 4NZCA 5CLTA 3MANA 1WZAA 3POCA 4H2CA 1JI2A 5JUVA 1KBKA 4DWSB 3WN6A 3ARVA 2D3NA 4ML4A 1B90A 1EA9C 4GZJA 1LG1A 3LMYA 2OWCA 1EHAA 4P7NA 1BSIA 4TVUA 1QVBA 2WBKA 1CLVA 3OLGA 1BAGA 3LPPA 4PBGA 4L4OA 2BY1A 2CPUA 2J25A 1GQJA 2YA2A 1M53A 3AZSA 3B9DA 1VBUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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