3WJZA

Orotidine 5'-monophosphate decarboxylase d75n mutant from m. thermoautotrophicus complexed with 6-amino-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVANIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wjzA00
1EWDA 1GVSA 1KFEA 4N02A 3NXFA 5H2ZA 1CW2A 5I3FA 3M44A 4ZQRA 4ADUA 1KTCA 1H1ZA 2CW6A 2NUYA 5A5WA 3BW3A 4ORIA 2NLIA 4WJEA 4M6QA 3DFQA 3L0GA 5G2WA 3SW6A 2BXVA 3HGJA 1R47A 3O6YX 2C13A 1VCGA 1MXSA 1WA3A 5FF2A 5J5RA 3QC3A 3THAA 3BG9A 4DO4A 1VHNA 1FCBA 4IMDA 2O7SA 4FNSA 3RLVA 4O53A 1XM3A 3ANYA 5AYXA 3S5YA 4IQLA 4ADTA 3HMJG 1TTQA 1FX6A 3LRKA 1LORA 3W73A 4JYEA 2V0TA 3BO9A 3FA5A 4A29A 5K4XA 5J5DA 4HN4A 3U2OA 4ZQPA 3NOEA 3IGUA 4UTTA 2QAPA 2VENA 3ATYA 2QUTA 4FX7A 4L4LA 3DH7A 2GPTA 4Z08A 3KVKA 3NA8A 4JX4A 1FCVA 4O50A 3S1UA 1S5VA 1TPVA 4GE8A 1A5CA 4CQ9A 4QNEA 1I4NA 1G4SA 5FEWA 2EHHA 1XDMA 3LXAA 2JKPA 4JDYA 1OFEA 2DZSA 3EX3A 3LCIA 4ZL1A 3W7IA 3W83A 1VCVA 2RH9A 4OQVA 1ZJIA 5GVJA 4UTHA 1JCXA 1GG0A 3UY8A 3UYCA 3FJLA 3G1XA 2V30A 2P1FA 2A7PA 3M5ZA 1SO3A 4FEZA 3N3MA 4KFOA 4M5PA 1SW3A 1TJRA 3HG3A 3PBUA 2OJPA 2GOUA 1IXNA 5LKYA 3PULA 1X1ZA 3INPA 3W71A 3HPXA 3S5OA 3NEVA 4FX6M 4XBSA 3MHUA 5F2LA 2C18A 1IF2A 4UFIA 3W1TA 2I14A 1G7UA 4ZMGA 3TFCA 1OF6A 2J24A 3G1HA 3W86A 3EXTA 4CLMA 3HB9A 3FS2A 2QDHA 2RDTA 3W2MA 3W7NA 3W70A 2Y89A 2GQ8A 3E12A 1SSDA 3IRDA 1P0NA 2V9DA 1YDNA 3B06A 3GKAA 1G4TA 3EKLA 2VKZG 1K8XA 1PE1A 4UR7A 2ZZ2A 1LZOA 3HJZA 1G7VA 2R14A 3L66A 2HSAA 5CPOA 2EAWA 5TBOA 1B4EA 1DJQA 1TRIA 3O6CA 2WO5A 1QOQA 3SSJA 5HULA 1JVNA 4UNKA 4QNWA 3SZ8A 4QJ1A 2XN1A 3TE9A 3FKRA 6TIMA 3TQ0A 3HPZA 3DI0A 3LTYA 2FB2A 4NUWA 3MBFA 3QMTA 3FFSA 3TA6A 3NPXA 4JYFA 3TC7A 3W1PA 2I1OA 1GEQA 1JCYA 4LY8A 1TSIA 4KFPA 5EYWA 1MEIA 2CLKA 2TPSA 4IX0A 1TYGA 2QF7A 1WBHA 5CSRA 5HMSA 3WFAA 2VFFA 5K9CA 3PG9A 3T55A 4OHQA 4FIQA 4K7VA 4FXRA 1YDVA 1YXCA 2RFGA 4IJBA 1T99A 1I2PA 1K02A 1HFBA 3GIYA 4ZQMA 4EF9A 1F6PA 1JR1A 2FB3A 1S5WA 1W3TA 3W75A 5DY3A 4JD4A 3B0UX 3P67A 2H3DA 3R8RA 2ALDA 3LCFA 4HPXA 4JTLA 2EPHA 1P4CA 5KZDA 5CZJA 4EOUA 3GXNA 3DFPA 5LGXA 3DFSA 4LVAA 4MYXA 3NZRA 4LVBA 4Y96A 5FF7A 1Z41A 2VFHA 3NL3A 3T44A 3MO7A 3G1FA 3TCEA 4PA8A 3NYZA 3W7GA 3V1PA 1NAL1 3NM1A 5AHEA 4MY9A 3EKZA 3DFTA 4C1LA 3B05A 3LBCA 2Y7FA 4DPPA 2NXIA 1XL9A 3LRLA 4JX6A 1TPFA 3O8AA 2CWNA 1H50A 1K7FA 2PE4A 3RF9A 3TAOA 3CM4A 5U7SA 2C6QA 3B03A 5K9XA 3A24A 2QR6A 3LRMA 3NG3A 3OVQA 5EPDA 2YZRA 3SFKA 2G95A 1RD5A 3GKFA 4WQ6A 5EY5A 3W2LA 3QW3A 5AOUA 2H6RA 3H55A 3DZ1A 2QCCA 4DXVA 3V75A 5BNKA 1DHPA 1R2SA 1GQNA 2Y88A 3TH6A 3O6DA 4LWWA 1LOQA 3EWZA 2CLEA 4O1AA 5DCEA 2YYUA 3MMTA 5LNRA 4LW7A 2FQIA 3TAKA 3PM6A 1W31A 1VYSX 3WK1A 2Y62A 4O11A 3QEZA 2B7NA 4LVFA 4O17A 3LDVA 3W07A 5U4NA 5D30A 3AO0A 2CLLA 4Q4KA 2NX1A 4NJGA 1Q6QA 1IXOA 3QSRA 3TMQA 3E9AA 4JIPA 1KLZA 3W7HA 5BOOA 3DGRA 3N2XA 4LS1A 2TYSA 4IUOA 3UQNA 1NSJA 4PODA 1ZALA 3LCGA 1FCUA 1G69A 5L9FA 1XC4A 5HUPA 1EEPA 5AC7A 5G1TA 3CLMA 3W7RA 4UTMA 1AL7A 5BMXA 3NQ8A 3L5MA 3HPSA 3W7QA 1M5WA 2OZ0A 3CQ0A 2ZRYA 1FDJA 4O4WA 1YDOA 3LX9A 4WY0B 2Q8ZA 2HMCA 4GC4A 4NQ1A 1YPIA 1SR9A 3TXVA 1W5MA 4UFKA 3UNDA 1ZHAA 2QAFA 4LC6A 5DLCA 5D03A 4K7YA 5AHLA 2Z1BA 1S5TA 2ZTKA 4JY9A 3GB6A 3BG3A 1TMHA 3DXIA 2E68A 3WJSA 1VHCA 2P10A 4AB4A 4WY0A 2F7FA 4UTWC 2GJLA 1SPQA 4MUZA 3PSWA 2WSRA 3EX6A 3W1NA 4HIBA 4RX0A 1OK4A 4UFHA 4Z0JA 3LCHA 4UXDA 1VZWA 3LTSA 3GXPA 4IX2A 2CZEA 2NX9A 4E38A 5CKSA 3IIXA 3ABRA 1XXXA 5CPMA 1GVRA 3LV6A 3NQ6A 3C2RA 3UZ5A 4GUJA 3W6YA 2J9XA 1EP2A 4BR1A 2OT0A 1IXPA 3PUEA 1XBXA 1PVNA 3FYPA 2X1RA 2GUUA 1ZFJA 4I7WA 3W1LA 5H91A 1QOPA 3GR7A 3T40A 3S1WA 1C8VA 4AWUA 4MFEA 3KVMA 2WSQA 3IV3A 3QPZA 4JYDA 4Y9AA 1VYPX 4DBDA 1OYBA 2VC6A 3S9YA 3QRHA 1TQJA 1EP3A 3BW2A 4ZQNA 3L5AA 3TUUA 2Q3RA 3M9YA 4CNOA 4LC8A 1OX6A 1BWLA 5DXXA 2GVGA 3T4CA 4FX8A 3GK0A 4QIUA 3M41A 3BW4A 3SECA 4E2BA 4UCGA 1XI3A 1WOBA 2DZUA 3L65A 5FESA 3P60A 1QO5A 3QPYA 3STCA 2DJXA 1GTEA 5FF0A 2R8WA 3SIZA 2YXGA 3W7MA 4ZQOA 1MEWA 1LBFA 1PIIA 2NZLA 2PRHA 2CLMA 4BK9A 2NUWA 1N55A 3MI3A 2ZYFA 3OVRA 3SJ3A 3W9ZA 3PF3A 2C1HA 3EXRA 3N19B 4CQ8A 4YCOA 5G2HA 4UUIA 3CWOX 4JXCA 2JKAA 1AK5A 4IGHA 4EF8A 5IBXC 2DZXA 3QQ1A 1JCJA 1IIHA 2VXNA 2Y61A 4UMAA 3S1XA 1UUOA 2NWRA 4N9EA 2GVLA 1KW1A 1D9EA 4Z1CA 1HO1A 1L6SA 1GWJA 1TPH1 1BTMA 3A9IA 3EWUA 3FEMA 1EA0A 2DJLA 5CG7A 3NM3A 5DELA 5IM51 2DZPA 5LNWA 3STFA 3DHFA 3E0IA 1H51A 3QZEA 1Q45A 3BGJA 1UBSA 5E1QA 3HG4A 4LUJA 4Z0SA 3KRSA 1DVJA 4O1DA 2G97A 1IXQA 5KSWA 4CNNA 4Q32A 1MZHA 1OHLA 1ML1A 4WZHA 4PH6A 3E49A 1X6UA 5HINA 2YFOA 5EBUA 3CC1A 2PURA 3I65A 3P5ZA 1KFKA 2YGYA 4IMFA 1U83A 1O60A 1GVOA 4BF9A 2AAMA 5G5IA 5EMUA 1ZAIA 5CPLA 4K8EA 4RLIA 2WJZA 1N8FA 1WBJA 5AYYA 4ALDA 1H7OA 4NZFA 4JEQA 2IQTA 4L4MA 1VJIA 2QCHA 3KRUA 4O1BA 4BWLA 1X8FA 4RXGA 3UWUA 1W54A 5LNUA 2G96A 2ZQ0A 1W5NA 1RZMA 1I2OA 1O5XA 5F1VA 2X16A 4M6PA 1KM6A 4NZJA 3B8DA 3A21A 2BWGA 1GVFA 3ZR4A 3M47A 4AHQA 3L67A 1VCFA 2X30A 3NPWA 3E96A 1OVDA 5CZ0A 3UPWA 3ZS4A 4JTJA 1MSSA 2DORA 1TTIA 4FO4A 4IMCA 1VR6A 1W37A 1DKWA 3I6RA 2BSLA 4NNBA 1XKYA 2OX1A 3LHYA 3MP5A 1EB3A 3G1SA 1KTBA 3LGEA 5FF4A 4OGZA 3TFXA 1LBMA 5AC6A 2A7NA 3MHGA 1OFOA 1QWGA 2HS6A 1VLWA 4E0CA 4JGDA 1CI1A 1ZNNA 4UMCA 1KM0A 1ME8A 1TB3A 4LRTA 3LXBA 4JTHA 5D09A 3KHJA 1SQ7A 4UTWA 1ZENA 3A22A 3BLEA 2VEPA 4EVZA 3NQVA 2Y85A 3EXSA 3GZ3A 2P0OA 2QUVA 3DHDA 4BFAA 3TU9A 2ABBA 3NQFA 3OG3A 1H60A 1JUKA 1VC4A 2UV8G 2J9YA 2Q8LA 4OU1A 4IWWA 2OCZA 4GXMA 3OHIA 3O06A 2DZWA 4ZZ9A 1T96A 2ZRVA 4WXYA 3CIXA 4HHPA 4NXKA 3EX1A 2BTMA 4OE7A 1EUNA 1MEHA 3R89A 3RK8A 5DY2A 3IVTA 1PCWA 1DQXA 2YFNA 2H3BA 4HNTA 4GUGA 1QR7A 3MYOA 1G4PA 1VRDA 4KWWA 2A6LA 2QKFA 4DF0A 4AHOA 1ONRA 2V81A 2E6AA 3UPBA 1JRCA 4JTFA 1RPXA 5K4ZA 1XBZA 3MBDA 1QPOA 4PTNA 5TQLA 2CZFA 3S42A 4CCDA 3IIZA 4S1FA 3KX6A 1FBAA 3W7JA 2CU0A 2Y6ZA 1TTPA 3W2JA 4Z1BA 4S2CA 1JQVA 1AMKA 1KFBA 3N34A 5KTLA 4JR5A 1OABA 4QITA 1H5YA 5HWNA 3RNDA 4TIMA 4LOCA 1OX4B 1XUZA 3UWWA 4AH7A 1AG1O 5D05A 5CGQA 4NNAA 4AF0B 4TMBA 3SGZA 1F7BA 3FOKA 1LBLA 4MY1A 3TW7A 2D73A 1B4KA 5LNVA 1K8ZA 1K7XA 5EA9A 1TIMA 3EX2A 1T8XA 3IVSA 3FLUA 1F6KA 3TQKA 3ABQA 3UWZA 1OFRA 3M5XA 4HKPA 1OFQA 4MJMA 5LHFA 1OX4A 1ICSA 2GQ9A 5IBXA 1DBTA 3CU2A 2QJHA 3EEGA 5LZLA 5EKYA 4AF0A 1P0KA 3W7CA 5F2IA 3C8FA 2A2IA 2BZNA 2RDWA 3HOJA 1K8YA 5DCBA 1TPUA 3W87A 2NX3A 3LCWA 2E5DA 4JN6A 1H7WA 5LGZA 1W3IA 3N2MA 5MHBA 4BI7A 3BK0A 1KM2A 2V5LA 4RZ5A 4JICA 1LM1A 4KKXA 3SR7A 2OMAA 5AHFA 4AWTA 2WQPA 3SY5A 1KV5A 1YYAA 4XTIA 4NJKA 2GQAA 2ZZ3A 2YR1A 7TIMA 1JJKA 4K36A 1D3GA 3G0SA 1G4EA 1HO4A 4UIOA 5DXYA 4GRSA 2VEKA 3TNOA 2PCQA 4NX0A 4U4MA 3M0ZA 1SZEA 4O19A 3W2KA 5AYZA 4ICNA 3WK3A 1OFDA 5D04C 1QNVA 3W1QA 4UTUA 3TW6A 4QAIA 4XBKA 5F4SA 4O0KA 1TPWA 1J4EA 4MOZA 1QCWA 3TROA 3RMJA 4AAJA 3NQAA 1KM1A 2X1SA 3DKJA 2Q3OA 1JUEA 2ZA2A 4R34A 4FNTA 1M7PA 1LTDA 4K8HA 4I7UA 1JRBA 1F05A 3CWNA 5G4EA 4JTGA 5KITA 3P81A 4S2BA 4ORMA 4RZ4A 5F4WA 3LHTA 5AB3A 3I7RA 3TSDA 1CX9A 1KBIA 2A6NA 3UZJA 3GNNA 1YXYA 3LXCA 1ICQA 2A4AA 2ZZ7A 2WNNA 4K39A 2EF9A 2QDGA 3WJZA 3KVJA 3PSVA 3BPWA 3AJXA 2QEZA 3NQEA 4N2YA 3W88A 4U28A 4WOQA 3Q94A 1VPXA 1SFJA 2J6XA 4MIMA 2ZZ4A 4ML9A 2WSYA 3CHVA 2QUUA 3UWYA 2TSYA 2ZCGA 2V82A 3G1AA 3STEA 1YPFA 1KFCA 3THQA 2EGZA 3M6YA 3TXZA 5D2WA 1SO6A 5HUOA 4TO8A 3P74A 1WYIA 3SGUA 3TV8A 1DOSA 1ZAHA 1HTIA 3W1MA 2CZDA 2C15A 1P1XA 2E6YA 1W5OA 2W79A 3C3NA 3N9SA 3MI6A 3MW7A 5FEPA 1H61A 2QCFA 4LS0A 3FIGA 4QSHA 1R2TA 4FNPA 3G18A 4DF2A 3O05A 1Z42A 2BLEA 2C3ZA 3CEUA 4JDBA 5D2TA 2W0UA 1GYNA 3MUXA 3M5YA 4MZ8A 3S8HA 2VEMA 3NVTA 3A5VA 1EPXA 3OA3A 2Z6IA 2NXHA 1W56A 3C2EA 3QF0A 3W84A 5K3VA 2ATMA 4MVAA 3TSBA 5ABTA 3W1RA 3G8EA 2FTPA 1Q6OA 3LHUA 1LLWA 4LTSA 5AHMA 1O4UA 1PL9A 1HUVA 1OYAA 3O63A 1F5ZA 1TRDA 1JQXA 1AW2A 4O13A 3LHZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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